論文 - 須藤　雄気

Temperature Independence of Ultrafast Photoisomerization in Thermophilic Rhodopsin: Assessment versus Other Microbial Proton Pumps 査読

E. Siva Subramaniam Iyer, Ramprasad Misra, Arnab Maity, Oleg Liubashevski, Yuki Sudo, Mordechai Sheves, Sanford Ruhman

Journal of the American Chemical Society   138 ( 38 )   12401 - 12407   2016年9月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/jacs.6b05002

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Live-cell single-molecule imaging of the cytokine receptor MPL for analysis of dynamic dimerization 査読

Akihiko Sakamoto, Takashi Tsukamoto, Yuji Furutani, Yuki Sudo, Kazuyuki Shimada, Akihiro Tomita, Hitoshi Kiyoi, Takashi Kato, Takashi Funatsu

Journal of Molecular Cell Biology   8 ( 6 )   553 - 555   2016年6月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1093/jmcb/mjw027

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X-ray Crystallographic Structure of Thermophilic Rhodopsin 査読

Takashi Tsukamoto, Kenji Mizutani, Taisuke Hasegawa, Megumi Takahashi, Naoya Honda, Naoki Hashimoto, Kazumi Shimono, Keitaro Yamashita, Masaki Yamamoto, Seiji Miyauchi, Shin Takagi, Shigehiko Hayashi, Takeshi Murata, Yuki Sudo

Journal of Biological Chemistry   291 ( 23 )   12223 - 12232   2016年6月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1074/jbc.m116.719815

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Functional and Photochemical Characterization of a Light‐Driven Proton Pump from the Gammaproteobacterium Pantoea vagans 査読

Yuki Sudo, Susumu Yoshizawa

Photochemistry and Photobiology   92 ( 3 )   420 - 427   2016年3月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1111/php.12585

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Structural and functional roles of the N- and C-terminal extended modules in channelrhodopsin-1 査読

Satoko Doi, Arisa Mori, Takashi Tsukamoto, Louisa Reissig, Kunio Ihara, Yuki Sudo

Photochemical and Photobiological Sciences   14 ( 9 )   1628 - 1636   2015年9月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1039/c5pp00213c

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その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1039/c5pp00213c/fulltext.html

Atomistic design of microbial opsin-based blue-shifted optogenetics tools 査読

Hideaki E. Kato, Motoshi Kamiya, Seiya Sugo, Jumpei Ito, Reiya Taniguchi, Ayaka Orito, Kunio Hirata, Ayumu Inutsuka, Akihiro Yamanaka, Andrés D. Maturana, Ryuichiro Ishitani, Yuki Sudo, Shigehiko Hayashi, Osamu Nureki

Nature Communications   6 ( 1 )   7177   2015年5月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1038/ncomms8177

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その他リンク： https://www.nature.com/articles/ncomms8177

Factors Affecting the Stability and Performance of Ionic Liquid-Based Planar Transient Photodetectors 査読

Simon Dalgleish, Louisa Reissig, Laigui Hu, Michio M. Matsushita, Yuki Sudo, Kunio Awaga

Langmuir   31 ( 18 )   5235 - 5243   2015年4月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/la504972q

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Converting a Light-Driven Proton Pump into a Light-Gated Proton Channel 査読

Keiichi Inoue, Takashi Tsukamoto, Kazumi Shimono, Yuto Suzuki, Seiji Miyauchi, Shigehiko Hayashi, Hideki Kandori, Yuki Sudo

Journal of the American Chemical Society   137 ( 9 )   3291 - 3299   2015年2月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/ja511788f

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On-tip photodetection: a simple and universal platform for optoelectronic screening 査読

S. Dalgleish, L. Reissig, Y. Sudo, K. Awaga

Chemical Communications   51 ( 91 )   16401 - 16404   2015年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1039/c5cc06237c

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Irreversible Trimer to Monomer Transition of Thermophilic Rhodopsin upon Thermal Stimulation 査読

Takashi Tsukamoto, Makoto Demura, Yuki Sudo

The Journal of Physical Chemistry B   118 ( 43 )   12383 - 12394   2014年10月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/jp507374q

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Color‐Discriminating Retinal Configurations of Sensory Rhodopsin I by Photo‐Irradiation Solid‐State NMR Spectroscopy 査読

Hiroki Yomoda, Yoshiteru Makino, Yuya Tomonaga, Tetsurou Hidaka, Izuru Kawamura, Takashi Okitsu, Akimori Wada, Yuki Sudo, Akira Naito

Angewandte Chemie International Edition   53 ( 27 )   6960 - 6964   2014年5月

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担当区分：責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1002/anie.201309258

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The Early Steps in the Photocycle of a Photosensor Protein Sensory Rhodopsin I from Salinibacter ruber 査読

Yuki Sudo, Misao Mizuno, Zhengrong Wei, Satoshi Takeuchi, Tahei Tahara, Yasuhisa Mizutani

The Journal of Physical Chemistry B   118 ( 6 )   1510 - 1518   2014年1月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/jp4112662

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A Blue-shifted Light-driven Proton Pump for Neural Silencing 査読

Yuki Sudo, Ayako Okazaki, Hikaru Ono, Jin Yagasaki, Seiya Sugo, Motoshi Kamiya, Louisa Reissig, Keiichi Inoue, Kunio Ihara, Hideki Kandori, Shin Takagi, Shigehiko Hayashi

Journal of Biological Chemistry   288 ( 28 )   20624 - 20632   2013年7月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

DOI： 10.1074/jbc.m113.475533

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PubMed

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Thermal and Spectroscopic Characterization of a Proton Pumping Rhodopsin from an Extreme Thermophile 査読

Takashi Tsukamoto, Keiichi Inoue, Hideki Kandori, Yuki Sudo

Journal of Biological Chemistry   288 ( 30 )   21581 - 21592   2013年7月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

DOI： 10.1074/jbc.m113.479394

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PubMed

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Investigation of the chromophore binding cavity in the 11-cis acceptable microbial rhodopsin MR 査読

Arisa Mori, Jin Yagasaki, Michio Homma, Louisa Reissig, Yuki Sudo

Chemical Physics   419   23 - 29   2013年6月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

DOI： 10.1016/j.chemphys.2012.11.020

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Large Spectral Change due to Amide Modes of a β-Sheet upon the Formation of an Early Photointermediate of Middle Rhodopsin 査読

Yuji Furutani, Takashi Okitsu, Louisa Reissig, Misao Mizuno, Michio Homma, Akimori Wada, Yasuhisa Mizutani, Yuki Sudo

The Journal of Physical Chemistry B   117 ( 13 )   3449 - 3458   2013年3月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society (ACS)  

DOI： 10.1021/jp308765t

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Expression, purification and biochemical characterization of the cytoplasmic loop of PomA, a stator component of the Na<sup>+</sup> driven flagellar motor 査読

Rei Abe Yoshizumi, Shiori Kobayashi, Mizuki Gohara, Kokoro Hayashi, Chojiro Kojima, Seiji Kojima, Yuki Sudo, Yasuo Asami, Michio Homma

Biophysics   9   21 - 29   2013年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Biophysical Society of Japan  

DOI： 10.2142/biophysics.9.21

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Influence of Halide Binding on the Hydrogen Bonding Network in the Active Site of Salinibacter Sensory Rhodopsin I 査読

Louisa Reissig, Tatsuya Iwata, Takashi Kikukawa, Makoto Demura, Naoki Kamo, Hideki Kandori, Yuki Sudo

Biochemistry   51 ( 44 )   8802 - 8813   2012年10月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

DOI： 10.1021/bi3009592

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Photo-induced Regulation of the Chromatic Adaptive Gene Expression by Anabaena Sensory Rhodopsin 査読

Hiroki Irieda, Teppei Morita, Kimika Maki, Michio Homma, Hiroji Aiba, Yuki Sudo

Journal of Biological Chemistry   287 ( 39 )   32485 - 32493   2012年9月

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担当区分：最終著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

DOI： 10.1074/jbc.m112.390864

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Optical Silencing of C. elegans Cells with Arch Proton Pump 査読

Ayako Okazaki, Yuki Sudo, Shin Takagi

PLoS ONE   7 ( 5 )   e35370 - e35370   2012年5月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Public Library of Science (PLoS)  

DOI： 10.1371/journal.pone.0035370

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