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黒毛和種におけるウシClaudin‐16(CL‐16)欠損症遺伝子型と産肉成績との間のアソシエーション解析

小林直彦, 平野貴, 揖斐隆之, 大谷健, 杉本喜憲

Animal Science Journal 73 ( 1 ) 19 - 23 2002年2月

記述言語：日本語出版者・発行元：公益社団法人日本畜産学会

黒毛和種の常染色体性劣性遺伝性疾患であるClaudin-16 (CL-16 ) 欠損症の原因となる変異遺伝子 (原因遺伝子d ) と産肉成績との関連性についてアソシエーション解析を行った. 原因遺伝子d キャリア種雄牛3頭 (Sire-1～-3) の産子である肥育牛464頭とSire-1の産子である繁殖雌牛140頭のCL-16 遺伝子型を検査した結果, 肥育牛では正常遺伝子ホモ型 (DD ) 234頭およびキャリア (Dd ) 230頭であった. 繁殖雌牛では正常遺伝子ホモ型 (DD ) 60頭およびキャリア (Dd ) 80頭であった. 3頭のキャリア種雄牛は共通した祖先を持ち, その共通祖先牛はキャリア牛であることが確認されている. CL-16 遺伝子型と産肉成績との関連性を調べるため, CL-16 遺伝子型を要因として, 産肉成績について最小二乗分散分析を行った. 種雄牛間の変動は皮下脂肪厚を除いてすべての形質で有意であった. 性の影響は枝肉重量で, 農家についてはBMSナンバー, 枝肉重量及びバラの厚さで有意差が認められた. このように産肉成績に関与する環境要因を取り除いてもCL-16 遺伝子型の産肉成績には有意差は見られなかった. 繁殖雌牛のSire-1産子140頭の産肉形質に関する予測育種価も, 原因遺伝子d と有意に関連する結果は得られなかった (P>0.05). また, 136頭で構成されるSire-1の父方半兄弟家系を用いて連鎖解析を行ったが, CL-16 遺伝子座領域 (約30cM) は上記の形質に関する有意な連鎖は認められなかった (P>0.05). したがって, CL-16 欠損症の発症を避けるため原因遺伝子d を集団から排除しても産肉成績に影響する危険性は少ないと考えられる.

DOI： 10.2508/chikusan.73.19

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遺伝子発現量の多サンプル間での比較のためのディファレンシャルディスプレイ法に関する検討

永田幸洋, 揖斐隆之, 谷口幸雄, 山田宜永, 佐々木義之

動物遺伝育種研究 30 ( 1 ) 11 - 18 2002年

記述言語：日本語出版者・発行元：動物遺伝育種研究

ディファレンシャルディスプレイ (DD) 法が遺伝子発現量を多サンプル間で比較するために使われるには、得られたPCR産物の鎖長 (BP) のデータに再現性があること、並びに発現量が定量的に捉えられることが必要である。 まず、PCR産物のBPと遺伝子発現量に相当するその産物の生成量 (IOD) についての電気泳動像の画像解析による最適な数値化の方法を検討した。BPについては、PCR産物の移動度とゲル両端と中央の3つのレーンで泳動した分子量マーカーの移動度の情報を用いて計算するBP (A) が最適な数値化の方法であり、IODについては、PCR産物のバンドにおけるシグナル強度の測定値をそのまま用いるIOD (A) およびその測定値を同一レーン上にある全てのバンドのシグナル強度の和で割るIOD (P) がそれぞれ準最適および最適とされた。次に、BP (A) 、IOD (A) およびIOD (P) について、ゲル間、泳動レーン間およびRT-PCR反応間の変動を検討した結果、BP (A) についてはゲル間と泳動レーン間において有意な変動が検出されたが、RT-PCR反応間では有意な変動は検出されなかった。一方、IOD (A) とIOD (P) については泳動レーン間では有意な変動は検出されなかったが、ゲル間とRT-PCR反応間で有意な変動が検出された。これら分散分析の結果から各要因の分散成分を推定した。最後に、それらの結果を受けて、4通りの反復パターンで得られたBPおよびIODの測定値の変動係数から、大規模遺伝子発現プロファイリング作成に最適な反復回数について考察した。

DOI： 10.5924/abgri2000.30.11

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黒毛和種におけるウシClaudin-16 (CL-16) 欠損症遺伝子型と産肉成績との間のアソシエーション解析

小林直彦, 平野貴, 揖斐隆之, 大谷健, 杉本喜憲

日本畜産学会報 73 ( 1 ) 19 - 23 2002年

記述言語：日本語出版者・発行元：公益社団法人日本畜産学会

黒毛和種の常染色体性劣性遺伝性疾患であるClaudin-16 (CL-16 ) 欠損症の原因となる変異遺伝子 (原因遺伝子d ) と産肉成績との関連性についてアソシエーション解析を行った. 原因遺伝子d キャリア種雄牛3頭 (Sire-1～-3) の産子である肥育牛464頭とSire-1の産子である繁殖雌牛140頭のCL-16 遺伝子型を検査した結果, 肥育牛では正常遺伝子ホモ型 (DD ) 234頭およびキャリア (Dd ) 230頭であった. 繁殖雌牛では正常遺伝子ホモ型 (DD ) 60頭およびキャリア (Dd ) 80頭であった. 3頭のキャリア種雄牛は共通した祖先を持ち, その共通祖先牛はキャリア牛であることが確認されている. CL-16 遺伝子型と産肉成績との関連性を調べるため, CL-16 遺伝子型を要因として, 産肉成績について最小二乗分散分析を行った. 種雄牛間の変動は皮下脂肪厚を除いてすべての形質で有意であった. 性の影響は枝肉重量で, 農家についてはBMSナンバー, 枝肉重量及びバラの厚さで有意差が認められた. このように産肉成績に関与する環境要因を取り除いてもCL-16 遺伝子型の産肉成績には有意差は見られなかった. 繁殖雌牛のSire-1産子140頭の産肉形質に関する予測育種価も, 原因遺伝子d と有意に関連する結果は得られなかった (P>0.05). また, 136頭で構成されるSire-1の父方半兄弟家系を用いて連鎖解析を行ったが, CL-16 遺伝子座領域 (約30cM) は上記の形質に関する有意な連鎖は認められなかった (P>0.05). したがって, CL-16 欠損症の発症を避けるため原因遺伝子d を集団から排除しても産肉成績に影響する危険性は少ないと考えられる.

DOI： 10.2508/chikusan.73.19

DOI： 10.1292/jvms.68.319_references_DOI_3Tfx6jEYktXsr2H9WH83lLPf6qK

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その他リンク： https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I6266493

多サンプル間での遺伝子発現量の比較に適用可能な半定量的デイファレンシャルディスプレイ法の確立

永田幸洋, 揖斐隆之, 谷口幸雄, 山田宜永, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 99th 46 2001年8月

Gibbs Samplingによる競走馬における上部気道疾患の遺伝率の推定

揖斐隆之, 三宅武, 楠瀬良, 帆保誠二, 沖博憲, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 99th 45 2001年8月

近交係数の上昇を抑え遺伝的改良を最大にする育種計画

揖斐隆之, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 98th 93 2001年3月

ラット最長筋内脂肪量の組織化学的測定法の確立ならびにOLETF,F344およびそれらのF1間の比較

田之村秀樹, 三宅武, 谷口幸雄, 揖斐隆之, 真鍋昇, 山田宜永, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 97th 61 2000年3月

近交係数の上昇を抑え遺伝的改良を最大にする育種システム

揖斐隆之, 守田智, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 96th 67 1999年9月

熊本系褐毛和種における遺伝的評価システムの構築に伴なう集団の変遷

揖斐隆之, 守田智, 守屋和幸, 佐々木義之

肉用牛研究会報 66 ( 66 ) 8 - 9 1998年12月

肉牛育種システムの構築 2. 近交係数の上昇を抑え遺伝的改良を最大にする交配システム

揖斐隆之, 守田智, 守屋和幸, 佐々木義之

システム農学会シンポジウム要旨集 1998 44 - 45 1998年11月

肉牛育種システムの構築 1. 遺伝的評価システムの構築に伴なう集団の変遷

佐々木義之, 揖斐隆之, 守田智, 守屋和幸

システム農学会シンポジウム要旨集 1998 42 - 43 1998年11月

代表的な始祖種雄牛の遺伝的寄与率を用いた熊本県褐毛和種集団の集団構造の解明

揖斐隆之, 守屋和幸, 松本道夫, 木場俊太郎, 佐々木義之

日本畜産学会大会講演要旨 91st 175 1996年3月

熊本県褐毛和種集団の集団構造の変化ならびに産地間の遺伝的関連性

佐々木義之, 揖斐隆之, 守屋和幸, 高柳誠二, 松本道夫, 木場俊太郎

日本畜産学会大会講演要旨 90th 144 1995年3月

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