2026/01/06 更新

写真a

ニシムラ　カズサ
西村　和紗
Nishimura Kazusa
所属
環境生命自然科学学域 助教
職名
助教
プロフィール

多様な作物の遺伝解析(QTL解析、GWAS、多様性の評価)を進めています。

 

 

特に、パンコムギの祖先種の四倍体コムギを材料に、コムギ育種に有用な遺伝子の同定、単離を進めております。

また、イネ、ムギ、ダイズを材料に、遺伝子型情報を用いた作物発育予測モデルの改良を進めています。

2023年4月からは岡山大学でオオムギの育種上有用な遺伝子の単離を進めております。

 

育種の現場に実装することを目指して

 NGSライブラリー構築法の開発・改良や

系統選抜の効率化に関するプロトコルの開発を進めています。

 

 

MIG-seq(Suyama et al. 2022, Nishimura et al. 2022)、

dpMIG-seq(Nishimura et al. 2024)を用いた共同研究、技術移転のご相談は

 

knishimura[a]okayama-u.ac.jpまでご連絡をください([a]を@に変えて下さい)。

 

品質がそれほど良くないDNAからでもddRAD-seqのような多型検出が可能です。

高価なKITなどを使う必要がないので、DNA抽出のコストを抑えることができます。

親の遺伝的な距離にも依存しますが、QTL解析に十分な多型を検出できます。

 

 

外部リンク

学位

  • 博士(農学) （ 2022年11月   京都大学 ）

研究キーワード

  • 四倍体コムギ

  • 合成六倍体コムギ

  • MIG-seq

  • GBS

  • カンキツ

  • コムギ

  • 作物発育モデル

  • 育種学

  • QTL解析

  • 品種識別法

  • オオムギ

研究分野

  • 環境・農学 / 遺伝育種科学

  • 環境・農学 / 作物生産科学

  • 環境・農学 / 遺伝育種科学  / 育種学

 

論文

  • Agricultural activities maintain vigor and plant-based protein intake in older adults with type 2 diabetes: A feasibility study 査読

    Sachiko Tsukamoto-Kawashima, Kaori Ikeda, Fumika Mano-Usui, Emi Okamura, Aki Kondo, Erina Joo, Eri Maai, Kazusa Nishimura, Tomoyuki Nabeshima, Rihito Takisawa, Yasuki Matsumura, Akira Kitajima, Tohru Tominaga, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki, Daisuke Yabe, Nobuya Inagaki

    The Journal of Aging Research & Lifestyle   15   100055 - 100055   2026年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.jarlif.2025.100055

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  • Discovery of a novel CYP76AD1–DODA1 gene cluster associated with betalain pigmentation in quinoa 査読

    Sayako Kushino, Nobuyuki Mizuno, Kenta Shirasawa, Yasufumi Kobayashi, Yasunari Fujita, Kazusa Nishimura, Mariko Ueno, Naoko Takeuchi, Hiroki Saito, Shunsuke Adachi, Keisuke Katsura, Hideki Hirakawa, Yasuo Yasui

    CYTOLOGIA   90 ( 4 )   227 - 238   2025年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：International Society of Cytology  

    DOI： 10.1508/cytologia.90.227

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  • Identification and characterization of QTL for fruit size in seedless chili pepper (Capsicum annuum) 査読

    Takahiro Maki, Kazusa Nishimura, Sho Ohno, Ryohei Nakano, Yoshiyuki Tanaka

    The Horticulture Journal   accepted   2025年12月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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  • Identification of a novel quantitative trait locus improving fruit set in chili pepper (Capsicum annuum) under high-temperature greenhouse conditions 査読

    Akira Yamazaki, Tatsuya Kitade, Ao Takezawa, Kazusa Nishimura, Takahiro Maki, Ryohei Nakano, Munetaka Hosokawa

    Scientia Horticulturae   353   114471 - 114471   2025年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.scienta.2025.114471

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  • Molecular polymorphisms of the nuclear and chloroplast genomes among African melon germplasms reveal abundant and unique genetic diversity, especially in Sudan. 査読 国際誌

    Odirichi Nnennaya Imoh, Gentaro Shigita, Mitsuhiro Sugiyama, Tran Phuong Dung, Katsunori Tanaka, Mami Takahashi, Kazusa Nishimura, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Mashaer Goda, Michel Pitrat, Kenji Kato

    Annals of botany   2025年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    BACKGROUND AND AIMS: Africa is rich in wild species of Cucumis and is considered one of the origins of melon. However, our knowledge of African melon is limited, and genetic studies using melon germplasms with wide geographical coverage are required. Here, we analyzed the genetic structure of African melons, with emphasis on Sudan. METHODS: Ninety-seven accessions of African melon were examined along with 77 reference accessions representing Asian melon and major horticultural groups. Molecular polymorphisms in the nuclear and chloroplast genomes were investigated using 12 RAPD, 7 SSR, and 3 SNP markers. Horticultural traits, including seed size, were measured for 46 accessions, mainly from Sudan. KEY RESULTS: African melons were divided into large and small seed-types based on seed length: large seed-type from Northern Africa and small seed-type from Western and Southern Africa. Both seed types are common in Sudan. Molecular genetic diversity in these geographical populations was as high as in India, the Asian center of melon domestication. Large seed-type from Northern Africa were assigned to Pop4 by structure analysis and had Ib cytoplasm in common with Cantalupensis, Inodorus, and Flexuosus. Small seed-types were highly diversified and geographically differentiated; specifically, Pop1 with Ia cytoplasm in Southern Africa and South Asia, Pop2 with Ia in East Asia, including Conomon and Makuwa, and Pop3 with Ia or Ic in Africa. Sudanese small seed-types were grouped in Pop3, while their cytoplasm type was the mixture of Ia and Ic. Sudanese Tibish had Ic cytoplasm that was unique in Africa, common in Western Africa and Sudan, and also found in wild or feral types. CONCLUSIONS: Melon of Ic lineage, including Tibish, originated from wild melon in the "western Sudan region," and independently of melon with Ia or Ib cytoplasm that originated in Asia. This clearly indicates the polyphyletic origin of melon.

    DOI： 10.1093/aob/mcaf028

    PubMed

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  • Anekomochi glutinous rice provides low postprandial glycemic response by enhanced insulin action via GLP-1 release and vagal afferents activation 査読

    Kento Ohbayashi, Yudai Sugiyama, Taichi Nohmi, Kazusa Nishimura, Tetsuya Nakazaki, Yo-Ichiro Sato, Takehiro Masumura, Yusaku Iwasaki

    The Journal of Physiological Sciences   74   47   2024年9月

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    記述言語：英語  

    DOI： 10.1186/s12576-024-00940-5

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  • A low-cost dpMIG-seq method for elucidating complex inheritance in polysomic crops: A case study in tetraploid blueberry 査読

    Kyoka Nagasaka, Kazusa Nishimura, Ko Motoki, Keigo Yamagata, Soichiro Nishiyama, Hisayo Yamane, Ryutaro Tao, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    Horticulture Research   uhae248   2024年9月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)  

    Abstract

    Next-generation sequencing (NGS) library construction often requires high-quality DNA extraction, precise adjustment of DNA concentration, and restriction enzyme digestion to reduce genome complexity, which results in increased time and cost in sample preparation and processing. To address these challenges, a PCR-based method for rapid NGS library preparation, named dpMIG-seq, has been developed and proven effective for high-throughput genotyping. However, the application of dpMIG-seq has been limited to diploid and polyploid species with disomic inheritance. In this study, we obtained genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) markers for tetraploid blueberry to evaluate genotyping and downstream analysis outcomes. Comparison of genotyping qualities inferred across samples with different DNA concentrations and multiple bioinformatics approaches revealed high accuracy and reproducibility of dpMIG-seq-based genotyping, with Pearson’s correlation coefficients between replicates in the range of 0.91 to 0.98. Furthermore, we demonstrated that dpMIG-seq enables accurate genotyping of samples with low DNA concentrations. Subsequently, we applied dpMIG-seq to a tetraploid F1 population to examine the inheritance probability of parental alleles. Pairing configuration analysis supported the random meiotic pairing of homologous chromosomes on a genome-wide level. On the other hand, preferential pairing was observed on chr-11, suggesting that there may be an exception to the random pairing. Genotypic data suggested quadrivalent formation within the population, although the frequency of quadrivalent formation varied by chromosome and cultivar. Collectively, the results confirmed applicability of dpMIG-seq for allele dosage genotyping and are expected to catalyze the adoption of this cost-effective and rapid genotyping technology in polyploid studies.

    DOI： 10.1093/hr/uhae248

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  • Chromosome-level genome assemblies for two quinoa inbred lines from northern and southern highlands of Altiplano where quinoa originated 査読

    Yasufumi Kobayashi, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Kazusa Nishimura, Kenichiro Fujii, Rolando Oros, Giovanna R. Almanza, Yukari Nagatoshi, Yasuo Yasui, Yasunari Fujita

    Frontiers in Plant Science   15   2024年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Frontiers Media SA  

    Quinoa is emerging as a key seed crop for global food security due to its ability to grow in marginal environments and its excellent nutritional properties. Because quinoa is partially allogamous, we have developed quinoa inbred lines necessary for molecular genetic analysis. Our comprehensive genomic analysis showed that the quinoa inbred lines fall into three genetic subpopulations: northern highland, southern highland, and lowland. Lowland and highland quinoa are the same species, but have very different genotypes and phenotypes. Lowland quinoa has relatively small grains and a darker grain color, and is widely tested and grown around the world. In contrast, the white, large-grained highland quinoa is grown in the Andean highlands, including the region where quinoa originated, and is exported worldwide as high-quality quinoa. Recently, we have shown that viral vectors can be used to regulate endogenous genes in quinoa, paving the way for functional genomics to reveal the diversity of quinoa. However, although a high-quality assembly has recently been reported for a lowland quinoa line, genomic resources of the quality required for functional genomics are not available for highland quinoa lines. Here we present high-quality chromosome-level genome assemblies for two highland inbred quinoa lines, J075 representing the northern highland line and J100 representing the southern highland line, using PacBio HiFi sequencing and dpMIG-seq. In addition, we demonstrate the importance of verifying and correcting reference-based scaffold assembly with other approaches such as linkage maps. The assembled genome sizes of J075 and J100 are 1.29 and 1.32 Gb, with contigs N50 of 66.3 and 12.6 Mb, and scaffold N50 of 71.2 and 70.6 Mb, respectively, comprising 18 pseudochromosomes. The repetitive sequences of J075 and J100 represent 72.6% and 71.5% of the genome, the majority of which are long terminal repeats, representing 44.0% and 42.7% of the genome, respectively. The de novo assembled genomes of J075 and J100 were predicted to contain 65,303 and 64,945 protein-coding genes, respectively. The high quality genomes of these highland quinoa lines will facilitate quinoa functional genomics research on quinoa and contribute to the identification of key genes involved in environmental adaptation and quinoa domestication.

    DOI： 10.3389/fpls.2024.1434388

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  • Workflow for development of CAPS markers with one type of restriction enzyme to identify citrus cultivars 査読

    Kazusa Nishimura, Maho Okuma, Junko Kaneyoshi, Atsu Yamasaki, Kyoka Nagasaka, Kazuki Murata, Yuki Monden, Kenji Kato, Hidetaka Nishida, Tetsuya Nakazaki, Ryohei Nakano

    Tree Genetics & Genomes   20 ( 5 )   2024年8月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Given the ease of propagating fruit tree species through cloning, the economic viability of their breeding programs hinges on protecting breeders' rights. This necessitates the development of highly accurate DNA markers for cultivar identification. Here, we present a methodology for the rapid design of cleaved amplified polymorphic sequence (CAPS) markers to discriminate newly bred Japanese citrus cultivars from genetically related cultivars. We first compared the performance of ddRAD-seq and MIG-seq in citrus germplasm. The ddRAD-seq libraries generated using EcoRI and HindIII restriction enzymes yielded the highest number of polymorphisms. Subsequently, ddRAD-seq with EcoRI and HindIII was employed to analyze 29 citrus cultivars and thus identify 331,801 genome-wide polymorphisms. A semi-automated bioinformatics pipeline was then utilized to identify candidate CAPS markers, resulting in the discovery of 14,072 potential markers. Of these candidates, 52 were chosen for validation based on their recognition by the PstI restriction enzyme. This evaluation resulted in the development of 11 highly discriminative CAPS markers. Remarkably, a combination of only six such markers was sufficient to differentiate newly bred cultivars from their genetically related parents. The single restriction enzyme employed for these markers facilitates straightforward multiplexing. Finally, a combination of one multiplex marker testing two loci and four singleplex markers was successfully selected that completely discriminated the cultivars other than the bud sports used in this study. The pipeline established here extends beyond citrus and has the potential to simplify marker development and cultivar protection in various plant species.

    DOI： 10.1007/s11295-024-01661-x

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    その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1007/s11295-024-01661-x/fulltext.html

  • Degenerate oligonucleotide primer MIG‐seq: an effective PCR‐based method for high‐throughput genotyping 査読

    Kazusa Nishimura, Hiroyuki Kokaji, Ko Motoki, Akira Yamazaki, Kyoka Nagasaka, Takashi Mori, Rihito Takisawa, Yasuo Yasui, Takashi Kawai, Koichiro Ushijima, Masanori Yamasaki, Hiroki Saito, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    The Plant Journal   2024年3月

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    担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Wiley  

    SUMMARY

    Next‐generation sequencing (NGS) library construction often involves using restriction enzymes to decrease genome complexity, enabling versatile polymorphism detection in plants. However, plant leaves frequently contain impurities, such as polyphenols, necessitating DNA purification before enzymatic reactions. To overcome this problem, we developed a PCR‐based method for expeditious NGS library preparation, offering flexibility in number of detected polymorphisms. By substituting a segment of the simple sequence repeat sequence in the MIG‐seq primer set (MIG‐seq being a PCR method enabling library construction with low‐quality DNA) with degenerate oligonucleotides, we introduced variability in detectable polymorphisms across various crops. This innovation, named degenerate oligonucleotide primer MIG‐seq (dpMIG‐seq), enabled a streamlined protocol for constructing dpMIG‐seq libraries from unpurified DNA, which was implemented stably in several crop species, including fruit trees. Furthermore, dpMIG‐seq facilitated efficient lineage selection in wheat and enabled linkage map construction and quantitative trait loci analysis in tomato, rice, and soybean without necessitating DNA concentration adjustments. These findings underscore the potential of the dpMIG‐seq protocol for advancing genetic analyses across diverse plant species.

    DOI： 10.1111/tpj.16708

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  • Introduction of a diverse genetic background of Pyrus into Malus through intergeneric hybridization. 査読

    Takuya Morimoto, Ryuya Narazaki, Hiroaki Okabe, Lumin Zhang, Kazusa Nishimura, Akihiro Itai

    Molecular Genetics and Genomics   299   21   2024年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1007/s00438-024-02131-8

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  • Pollen Dispersion is a Key Factor for Autonomous Fruit Set Under High Temperatures in the Capsicum annuum ‘Takanotsume’ 査読

    Akira Yamazaki, Ao Takezawa, Kazusa Nishimura, Ko Motoki, Kyoka Nagasaka, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki, Munetaka Hosokawa

    The Horticulture Journal   QH-094   2023年10月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Japanese Society for Horticultural Science  

    DOI： 10.2503/hortj.QH-094

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  • Genome sequencing reveals the genetic architecture of heterostyly and domestication history of common buckwheat. 査読 国際誌

    Jeffrey A Fawcett, Ryoma Takeshima, Shinji Kikuchi, Euki Yazaki, Tomoyuki Katsube-Tanaka, Yumei Dong, Meifang Li, Harriet V Hunt, Martin K Jones, Diane L Lister, Takanori Ohsako, Eri Ogiso-Tanaka, Kenichiro Fujii, Takashi Hara, Katsuhiro Matsui, Nobuyuki Mizuno, Kazusa Nishimura, Tetsuya Nakazaki, Hiroki Saito, Naoko Takeuchi, Mariko Ueno, Daiki Matsumoto, Miyu Norizuki, Kenta Shirasawa, Chengyun Li, Hideki Hirakawa, Tatsuya Ota, Yasuo Yasui

    Nature plants   2023年8月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Common buckwheat, Fagopyrum esculentum, is an orphan crop domesticated in southwest China that exhibits heterostylous self-incompatibility. Here we present chromosome-scale assemblies of a self-compatible F. esculentum accession and a self-compatible wild relative, Fagopyrum homotropicum, together with the resequencing of 104 wild and cultivated F. esculentum accessions. Using these genomic data, we report the roles of transposable elements and whole-genome duplications in the evolution of Fagopyrum. In addition, we show that (1) the breakdown of heterostyly occurs through the disruption of a hemizygous gene jointly regulating the style length and female compatibility and (2) southeast Tibet was involved in common buckwheat domestication. Moreover, we obtained mutants conferring the waxy phenotype for the first time in buckwheat. These findings demonstrate the utility of our F. esculentum assembly as a reference genome and promise to accelerate buckwheat research and breeding.

    DOI： 10.1038/s41477-023-01474-1

    PubMed

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  • A simple method for measuring pollen germination rate using machine learning 査読

    Akira Yamazaki, Ao Takezawa, Kyoka Nagasaka, Ko Motoki, Kazusa Nishimura, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    Plant Reproduction   36 ( 4 )   355 - 364   2023年6月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC  

    DOI： 10.1007/s00497-023-00472-9

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    その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1007/s00497-023-00472-9/fulltext.html

  • Indicator Candidate Traits for Autonomous Fruit Set Ability Under High Temperatures in Capsicum 査読

    Akira Yamazaki, Ao Takezawa, Ryohei Nakano, Kazusa Nishimura, Ko Motoki, Munetaka Hosokawa, Tetsuya Nakazaki

    Journal of Horticultural Research   30 ( 2 )   105 - 116   2023年1月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Walter de Gruyter GmbH  

    Abstract

    “Autonomous fruit set” refers to self-pollination and fruit set without pollen vectors such as vibration or insects. Autonomous fruit set under high-temperature stress is an important breeding goal as climate change can reduce fruit yields in Capsicum. We screened Capsicum cultivars for autonomous fruit set ability in a greenhouse environment and investigated pollen germination, viability, pollen grains number, chlorophyll fluorescence (Fv/Fm), style length, anther cone length, and anthesis stage under high temperatures in order to identify indicator traits for screening more genotypes with autonomous fruit set ability. The fruit set of the ‘Takanotsume’ (57.7 ± 20.6%) and ‘Goshiki Kyokko’ (52.2 ± 14.2%) cultivars (both C. annuum) were higher than those of other cultivars. Correlation analysis showed that pollen germination had the highest correlation with fruit set in C. annuum cultivars (r = 0.63). These results indicate that ‘Takanotsume’ and ‘Goshiki Kyokko’ are useful cultivars for novel breeding programs focusing on autonomous fruit sets under high temperatures, and pollen germination in C. annuum was a convincing candidate for an indicator trait of autonomous fruit set ability under high temperatures.

    DOI： 10.2478/johr-2022-0017

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  • Analysis of mechanism regulating high total soluble solid content in the parthenocarpic tomato fruit induced by pat-k gene 査読

    Chiaki Fukudome, Rihito Takisawa, Ryohei Nakano, Miyako Kusano, Makoto Kobayashi, Ko Motoki, Kazusa Nishimura, Tetsuya Nakazaki

    Scientia Horticulturae   301   111070 - 111070   2022年7月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.scienta.2022.111070

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  • MIG-seq is an effective method for high-throughput genotyping in wheat (Triticum spp.) 査読 国際誌

    Kazusa Nishimura, Ko Motoki, Akira Yamazaki, Rihito Takisawa, Yasuo Yasui, Takashi Kawai, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    DNA Research   29 ( 2 )   2022年4月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)  

    Abstract

    MIG-seq (Multiplexed inter-simple sequence repeats genotyping by sequencing) has been developed as a low cost genotyping technology, although the number of polymorphisms obtained is assumed to be minimal, resulting in the low application of this technique to analyses of agricultural plants. We applied MIG-seq to 12 plant species that include various crops and investigated the relationship between genome size and the number of bases that can be stably sequenced. The genome size and the number of loci, which can be sequenced by MIG-seq, are positively correlated. This is due to the linkage between genome size and the number of simple sequence repeats (SSRs) through the genome. The applicability of MIG-seq to population structure analysis, linkage mapping, and quantitative trait loci (QTL) analysis in wheat, which has a relatively large genome, was further evaluated. The results of population structure analysis for tetraploid wheat showed the differences among collection sites and subspecies, which agreed with previous findings. Additionally, in wheat biparental mapping populations, over 3,000 SNPs/indels with low deficiency were detected using MIG-seq, and the QTL analysis was able to detect recognized flowering-related genes. These results revealed the effectiveness of MIG-seq for genomic analysis of agricultural plants with large genomes, including wheat.

    DOI： 10.1093/dnares/dsac011

    PubMed

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    その他リンク： https://academic.oup.com/dnaresearch/article-pdf/29/2/dsac011/43439343/dsac011.pdf

  • Geographical distribution and adaptive variation of VRN-A3 alleles in worldwide polyploid wheat (Triticum spp.) species collection 査読 国際誌

    Nishimura, K, H. Handa, N. Mori, K. Kawaura, A. Kitajima, T, Nakazaki

    Planta   256 ( 6 )   132 - 132   2021年5月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    MAIN CONCLUSION: The distribution of early flowering alleles of VRN-A3 was found to be biased to low latitudes, and these alleles may contribute to environmental adaptability to low latitudes in cultivated emmer wheat. In wheat (Triticum spp.), the flowering time is an important trait for successful seed production and yield by adapting to the regional environment. An early flowering allele of VRN-A3 with 7- and 25-bp insertions in the promoter region (Vrn-A3a-h1) has recently been reported from the analysis of an emmer wheat (Triticum turgidum L. ssp. dicoccum) accession, TN26. This early flowering allele of VRN-A3 might be associated with the regional adaptation of wheat. In this study, we elucidated its geographic distribution to assess the importance of the early flowering allele of VRN-A3 in worldwide wheat collection. From sequence analysis, we identified six VRN-A3 alleles with the 7- and 25-bp insertions, namely, Vrn-A3a-h2, Vrn-A3a-h3, Vrn-A3a-h4, Vrn-A3a-h5, Vrn-A3a-h6, and Vrn-A3c-h2 from wild emmer wheat, while we identified two VRN-A3 alleles with these insertions, Vrn-A3a-h2 and Vrn-A3c-h1 from cultivated tetraploid and hexaploid wheat species in addition to Vrn-A3a-h1. Among VRN-A3 alleles distributed in cultivated wheat, we found that Vrn-A3a-h2 promoted early heading, whereas Vrn-A3c-h1 did not affect heading time. Our analysis showed that the distribution of early flowering alleles of VRN-A3 dominated in cultivated emmer wheat in Ethiopia and India, which actually showed an early flowering phenotype. This implied that the early flowering alleles of VRN-A3 contribute to adaptability to a low-latitude environment in cultivated emmer wheat. We could not find durum (T. turgidum L. ssp. durum) and bread wheat (T. aestivum L. ssp. aestivum) accessions with these early flowering alleles. Our findings indicated that Vrn-A3a-h1 and Vrn-A3a-h2 were useful for breeding of early flowering cultivars in durum and bread wheat varieties.

    DOI： 10.1007/s00425-021-03646-9

    PubMed

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  • De Novo Genome Assembly of the Japanese Wheat Cultivar Norin 61 Highlights Functional Variation in Flowering Time and Fusarium-Resistant Genes in East Asian Genotypes. 査読

    Kentaro K Shimizu, Dario Copetti, Moeko Okada, Thomas Wicker, Toshiaki Tameshige, Masaomi Hatakeyama, Rie Shimizu-Inatsugi, Catharine Aquino, Kazusa Nishimura, Fuminori Kobayashi, Kazuki Murata, Tony Kuo, Emily Delorean, Jesse Poland, Georg Haberer, Manuel Spannagl, Klaus F X Mayer, Juan Gutierrez-Gonzalez, Gary J Muehlbauer, Cecile Monat, Axel Himmelbach, Sudharsan Padmarasu, Martin Mascher, Sean Walkowiak, Tetsuya Nakazaki, Tomohiro Ban, Kanako Kawaura, Hiroyuki Tsuji, Curtis Pozniak, Nils Stein, Jun Sese, Shuhei Nasuda, Hirokazu Handa

    Plant & cell physiology   62 ( 1 )   8 - 27   2021年3月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    Bread wheat is a major crop that has long been the focus of basic and breeding research. Assembly of its genome has been difficult because of its large size and allohexaploid nature (AABBDD genome). Following the first reported assembly of the genome of the experimental strain Chinese Spring (CS), the 10+ Wheat Genomes Project was launched to produce multiple assemblies of worldwide modern cultivars. The only Asian cultivar in the project is Norin 61, a representative Japanese cultivar adapted to grow across a broad latitudinal range, mostly characterized by a wet climate and a short growing season. Here, we characterize the key aspects of its chromosome-scale genome assembly spanning 15 Gb with a raw scaffold N50 of 22 Mb. Analysis of the repetitive elements identified chromosomal regions unique to Norin 61 that encompass a tandem array of the pathogenesis-related 13 family. We report novel copy-number variations in the B homeolog of the florigen gene FT1/VRN3, pseudogenization of its D homeolog and the association of its A homeologous alleles with the spring/winter growth habit. Furthermore, the Norin 61 genome carries typical East Asian functional variants different from CS, ranging from a single nucleotide to multi-Mb scale. Examples of such variation are the Fhb1 locus, which confers Fusarium head-blight resistance, Ppd-D1a, which confers early flowering, Glu-D1f for Asian noodle quality and Rht-D1b, which introduced semi-dwarfism during the green revolution. The adoption of Norin 61 as a reference assembly for functional and evolutionary studies will enable comprehensive characterization of the underexploited Asian bread wheat diversity.

    DOI： 10.1093/pcp/pcaa152

    PubMed

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  • Characterization of Parthenocarpic Fruit of 'Miyazaki-wase No. 1', a Tropical Squash (Cucurbita moschata L.) Cultivar 査読

    Rihito Takisawa, Megumi Ogawa, Eri Maai, Kazusa Nishimura, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    HORTICULTURE JOURNAL   90 ( 1 )   68 - 74   2021年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.2503/hortj.UTD-219

    Web of Science

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  • Identification of Genetic Factors Affecting Fruit Weight in the Tomato (Solanum lycopersicum L.) Cultivar 'Micro-Tom' 査読

    Rihito Takisawa, Atsushi Nishida, Eri Maai, Kazusa Nishimura, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

    HORTICULTURE JOURNAL   90 ( 2 )   209 - 214   2021年

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.2503/hortj.UTD-252

    Web of Science

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  • Diurnal changes in chloroplast positioning and photosynthetic traits of C-4 grass finger millet 査読

    Eri Maai, Kazusa Nishimura, Rihito Takisawa, Tetsuya Nakazaki

    PLANT PRODUCTION SCIENCE   23 ( 4 )   477 - 489   2020年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1080/1343943X.2020.1758171

    Web of Science

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  • Light stress-induced chloroplast movement and midday depression of photosynthesis in sorghum leaves 査読

    Eri Maai, Kazusa Nishimura, Rihito Takisawa, Tetsuya Nakazaki

    PLANT PRODUCTION SCIENCE   23 ( 2 )   172 - 181   2020年4月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

    DOI： 10.1080/1343943X.2019.1673666

    Web of Science

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  • The early flowering trait of an emmer wheat accession (Triticum turgidum L. ssp. dicoccum) is associated with the cis-element of the Vrn-A3 locus 査読

    K. Nishimura, R. Moriyama, K. Katsura, H. Saito, R. Takisawa, A. Kitajima, T. Nakazaki

    Theoretical and Applied Genetics   131 ( 10 )   2037 - 2053   2018年10月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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MISC

  • ダイコンのフロリゲン高発現能に寄与する遺伝子の同定

    元木航, 西村和紗, 鹿島誠, 中崎鉄也, 中野龍平, 細川宗孝, 細川宗孝

    育種学研究   26   2024年

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  • キヌアの1B染色体に新規発見された赤色色素合成関連遺伝子座

    久篠沙耶子, 西村和紗, 水野信之, 上野まりこ, 竹内直子, 中野龍平, 岩橋優, 小林安文, 藤田泰成, 白澤健太, 平川英樹, 安井康夫, 桂圭佑

    日本作物学会講演会要旨集   258th   2024年

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  • ダイズにおける遺伝子情報を用いた発育予測モデルの汎用性及び精度にモデル構築に用いる品種群,遺伝子セットと回帰手法の違いが及ぼす影響

    森崇, 西村和紗, 中野聡史, 小梶裕之, 元木航, 熊谷悦史, 加賀秋人, 岩田洋佳, 岩橋優, 長坂京香, 村田和樹, 木下有羽, 牧隆宏, 井上博茂, 中野龍平, 中川博視, 中崎鉄也

    育種学研究   26   2024年

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  • キヌア起源地の南米アルティプラノ北部および南部高地型キヌア自殖系統のゲノム解析

    小林安文, 平川英樹, 白澤健太, 西村和紗, 藤井健一朗, OROS Rolando, ALMANZA Giovanna, 永利友佳理, 安井康夫, 藤田泰成, 藤田泰成

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   47th   2024年

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  • 六倍体栽培ガキ品種群における集団構造解析および果実形状GWAS

    堀内綾乃, 堀内綾乃, 尾上典之, 松崎隆介, 南川舞, 西村和紗, 白澤健太, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

    育種学研究   26   2024年

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  • P6-1-10 新規造成水田における初期土壌生成プロセスの解明−京都大学附属農場の事例−（6-1 水田土壌肥沃度 2023年度愛媛大会）

    保科 萌, 松岡 かおり, 岩橋 優, 西村 和紗, 中﨑 鉄也, 森塚 直樹

    日本土壌肥料学会講演要旨集   69   94 - 94   2023年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人 日本土壌肥料学会  

    DOI： 10.20710/dohikouen.69.0_94_3

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  • 四倍体ブルーベリーにおける高密度連鎖地図を用いた遺伝様式の検討

    長坂京香, 西村和紗, 元木航, 山形啓悟, 西山総一郎, 山根久代, 田尾龍太郎, 中野龍平, 中崎鉄也

    園芸学研究 別冊   22 ( 1 )   2023年

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  • AuAuBBAmAm合成六倍体コムギとパンコムギの間でみられる雑種ネクローシス原因遺伝子座領域の同定

    與田悠人, 野口微風子, 古村翔也, 村田和樹, 岡田萌子, 岡田萌子, 岡田萌子, 水野信之, 小林史典, 西村和紗, 井上喜博, 那須田周平, 松岡由浩, 吉田健太郎

    育種学研究   25   2023年

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  • Pairing homoeologous 2次失変異体を利用したパンコムギへの異種染色体断片導入

    田渕雅啓, 岡田萌子, 岡田萌子, 岡田萌子, 道川麻美, 井上喜博, 西村和紗, 水野信之, 清水健太郎, 清水健太郎, 小林史典, 宅見薫雄, 吉田健太郎

    育種学研究   25   2023年

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  • NGS-TILLINGを利用したモチ性フツウソバの開発

    安井康夫, FAWCETT J., 田中朋之, 西村和紗, 西村和紗, 中崎鉄也, 岩橋優, 齊藤大樹, 竹内直子, 上野まりこ, 上野まりこ, 白澤健太, 平川英樹, 大田竜也

    育種学研究   25   2023年

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  • キヌアのベタレイン生産性を制御するCqCYP76AD1とCqDODA1の遺伝子クラスター

    久篠沙耶子, 水野信之, 西村和紗, 上野まりこ, 中崎鉄也, 小林安文, 藤田泰成, 白澤健太, 平川英樹, 安井康夫, 桂圭佑

    日本作物学会講演会要旨集   256th   2023年

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  • ダイズにおける開花関連遺伝子の探索とそれら遺伝子情報に基づいた発育予測モデルの構築

    森崇, 西村和紗, 中野聡史, 小梶裕之, 元木航, 熊谷悦史, 加賀秋人, 岩田洋佳, 岩橋優, 長坂京香, 村田和樹, 木下有羽, 牧隆宏, 井上博茂, 中野龍平, 中川博視, 中崎鉄也

    育種学研究   25   2023年

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  • De novoアセンブリとbulked segregant 解析を用いたキヌア本葉の赤色色素生産に関わる遺伝子の同定

    久篠 沙耶子, 水野 信之, 西村 和紗, 上野 まりこ, 中崎 鉄矢, 小林 安文, 藤田 泰成, 白澤 健太, 平川 英樹, 安井 康夫, 桂 圭佑

    日本作物学会講演会要旨集   254   70 - 70   2022年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本作物学会  

    DOI： 10.14829/jcsproc.254.0_70

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  • 15 新規造成水田における作土の色の時空間変動−京都大学附属農場の事例（関西支部講演会 2020年度支部講演会）

    森塚 直樹, 西村 和紗, 中﨑 鉄也

    日本土壌肥料学会講演要旨集   67   222 - 222   2021年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人 日本土壌肥料学会  

    DOI： 10.20710/dohikouen.67.0_222_3

    CiNii Article

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  • イネ出穂・開花関連遺伝子の遺伝子型情報を活用した発育予測モデル

    西村 和紗, 小梶 裕之, 齊藤 大樹, 山崎 将紀, 吉田 ひろえ, 清水 顕史, 永野 惇, 中川 博視, 中﨑 鉄也

    日本作物学会講演会要旨集   251   91 - 91   2021年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本作物学会  

    DOI： 10.14829/jcsproc.251.0_91

    CiNii Article

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  • 遺伝子情報と作物生育モデルを組み合わせた水稲の生育・収量予測シミュレーター開発

    矢部 志央理, 鐘ヶ江 弘美, 齊藤 大樹, 中﨑 鉄也, 青木 直大, 山崎 将紀, 中川 博視, 澤田 寛子, 吉田 ひろえ, 西村 和紗, 小梶 裕之, 森田 隆太郎, 岡村 昌樹, 後藤 明俊, 江花 薫子

    日本作物学会講演会要旨集   251   93 - 93   2021年

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本作物学会  

    DOI： 10.14829/jcsproc.251.0_93

    CiNii Article

    J-GLOBAL

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  • イネ品種台中65号の出穂日はBVPにおける日長条件によって変化する

    安部学, 小梶裕之, 齋藤大樹, 西村和紗, 清水顕史, 中川博視, 矢部志央理, 中野龍平, 間合絵里, 元木航, 永野惇, 中崎鉄也

    育種学研究   22   2020年

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  • ソバにおける異型花型自家不和合性遺伝子座のゲノム解析

    大田竜也, 相井城太郎, 上野まりこ, 大澤良, 齊藤大樹, 白澤健太, 竹島亮馬, 中崎鉄也, 西村和紗, 原尚資, 平川英樹, FAWCETT J, 松井勝弘, 水野信之, 安井康夫

    育種学研究   21   2019年

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講演・口頭発表等

  • サツマイモ低温糊化系統簡易選抜のためのアレルdosage推定法の探索と検証

    中原貴臣, 田中勝, 小林晃, 川田ゆかり, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    開催年月日： 2025年3月20日 - 2025年3月21日

    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • デュラムコムギにおける出穂期関連遺伝子の発現解析による相互作用メカニズムの解析

    藤岡 明雅, 門田 有希, 西村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司

    日本育種学会第144回講演会  2023年9月17日 

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    開催年月日： 2023年9月16日 - 2023年9月17日

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  • メロンにおけるワタアブラムシ抵抗性遺伝子座周辺配列の比較解析および選抜マーカーの開発

    十河奈々, 大熊眞歩, Odirichi Nnennaya IMOH, 長井朋美, 鴫田玄太, 田中克典, 西村和紗, 清古貴, 武藤千秋, 内藤健, 門田有希, 杉山充啓, 西田英隆, 川頭洋一, 友岡憲彦, 加藤鎌司

    日本育種学会第144回講演会  2023年9月16日 

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    開催年月日： 2023年9月16日 - 2023年9月17日

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  • 三倍体コムギのゲノム倍加能を活用したNAM集団構築法の開発

    西村 和紗, 中野 龍平, 中﨑 鉄也

    日本育種学会第143回講演会  2023年3月17日 

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    開催年月日： 2023年3月16日 - 2023年3月18日

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  • 単為結果性カボチャ品種‘宮崎早生1号’の果実特性

    小川 萌, 滝澤理仁, 間合絵里, 西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄也

    近畿作物育種研究会第189回講演会  2020年12月12日 

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    開催年月日： 2020年12月12日

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  • トマトの単為結果性遺伝子pat-kが果実内の糖代謝へ及ぼす影響

    福留千映, 滝澤理仁, 間合絵里, 元木航, 西村和紗, 中野龍平, 中崎鉄也

    日本育種学会第138回講演会  2020年10月 

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    開催年月日： 2020年10月10日 - 2020年10月11日

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  • イネ品種台中65号の出穂日はBVPにおける日長条件によって変化する

    安部学, 小梶裕之, 齋藤大樹, 西村和紗, 清水顕史, 中川博視, 矢部志央理, 中野龍平, 間合絵里, 元木航, 永野惇, 中﨑鉄也

    日本育種学会第138回講演会  2020年10月 

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    開催年月日： 2020年10月10日 - 2020年10月11日

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  • 合成六倍体コムギ集団で分離した生育不全形質の遺伝解析とその量的評価法の確立に向けて

    中西爽太朗, 西村和紗, 中﨑鉄也, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第20回麦類研究会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • キクタニギク白花粉変異体wpo1の原因遺伝子探索と機能解析

    夏目弘樹, 西村和紗, 森脇幸太, 豊倉浩一, 谷口研至, 草場信

    第17 回 中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • ナノポアシーケンスを用いた同質六倍体サツマイモのゲノムアセンブリと構造変異アレルの解析

    中原貴臣, 志茂暉月, 多田健太郎, 片岡育哉, 田中勝, 内藤健, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • オオムギ出穂期突然変異系統における原因遺伝子HvHY2の同定と表現型解析

    大熊眞歩, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • アグロインフィルトレーション法によるサツマイモの根における一過性発現系の確立

    泉谷真, 田中沙英, 松井英譲, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • サツマイモ栽培品種における肥大カルス率と胚性カルス形成率の調査・比較

    曽我部未夢, 小林ひなた, Yoseph Haile, 泉谷真, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • サツマイモ塊根へのカロテノイド蓄積を制御する遺伝子の機能型アレルの探索

    関口エリカ, 堀田望未, 中原貴臣, 西村和紗, 牛島幸一郎, 岡田吉弘, 神崎浩, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • サツマイモの開花制御の解明に向けたIpomoea属におけるFT遺伝子の配列解析

    水島世史佳, 中原貴臣, 元木航, 田中勝, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • サツマイモの葉におけるアグロインフィルトレーション法を利用した一過性発現系の確立に向けて

    田中沙英, 泉谷真, 黒江香那, 松井英譲, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • エンマーコムギにおけるFT-A1のコピー数変異

    西村和紗, 牛島幸一郎, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • コムギ雑種生育不全個体における複数条件間での防御応答遺伝子の発現変動の比較

    中西爽太朗, 西村和紗, 岡田萌子, 門田有希, 加藤鎌司, 豊田敦, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • オオムギ突然変異系統15S-468に見出した4H QTLが出穂期、稈長、および穂長に及ぼす多面的効果

    堀内いずみ, 武田尚馬, 大熊眞歩, Ajmal Mandozai, 西村和紗, 牛島幸一郎, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • イスラエル由来の野生エンマーコムギにおけるFT-B1座の構造変異の解析

    高野仁菜, 西村和紗, 大熊眞歩, 加藤鎌司, 門田有希, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • PCL1が機能欠損したコムギRIL集団における出穂期関連遺伝子の探索

    松田泰征, 西村和紗, 村田和樹, 藤岡明雅, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • オオムギ4HQTL領域中の2領域が出穂期に及ぼす効果

    平山陽菜, 大熊眞歩, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • オオムギPROG1オルソログ上流の染色体領域が匍匐性に及ぼす効果の量的遺伝解析

    吉川大智, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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  • アワとエノコログサ間の組換え近交系を用いた栽培化などに関する形質のQTL解析

    黒木滉貴, 吉良明音, 吉木陸駆, 渡邊いぶき, 中原貴臣, 中村千里, 西村和紗, 門田有希, 福永健二

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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    記述言語：日本語  

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  • 圃場栽培におけるオオムギ遺伝子発現の消長：出穂期関連遺伝子HvPhyCアレルの違いが遺伝子発現に及ぼす影響

    中谷 勇, 鹿島 誠, 大熊 眞歩, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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  • 圃場栽培におけるオオムギ遺伝子発現の消長：出穂期関連遺伝子Vrn-H1アレルの違いが遺伝子発現に及ぼす影響

    越智 逸美, 中谷 勇, 鹿島 誠, 大熊 眞歩, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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  • オオムギ晩生突然変異系統のHvPHYBに生じた点変異と圃場出穂期の連鎖解析

    武田尚馬, 大熊眞歩, Ajmal Mandozai, 西村和紗, 牛島幸一郎, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第17回中国地域育種談話会  2025年11月 

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  • 合成六倍体コムギの自殖第1世代で観察された生育不全形質の遺伝解析

    中西 爽太朗, 西村 和紗, 中﨑 鉄也, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • F₂ 集団の反復 QTL 解析による野生エンマーコムギが保有する早生遺伝子の探索

    高野仁菜, 西村和紗, 張芸瑄, 大熊真歩, 村田和樹, 中野龍平, 中崎鉄也, 加藤鎌司, 門田有希, 西田英隆

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • ナノポアシーケンスによる野生エンマーコムギの de novoゲノムアセンブル

    西村和紗, 牛島幸一郎, 安井康夫, 高野仁菜, 中野龍平, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • アレル特異的k-merを利用したNanoporeシーケンシングによる同質倍数体サツマイモにおけるアレル同定の新戦略

    中原貴臣, 田中勝, 牛島幸一郎, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • サツマイモ品種「ジェイレッド」の形質転換体作出へ向けた培養条件の検討・確立

    小林ひなた, 大谷基泰, 松井英讓, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • 突然変異系統のQTLマッピングにおけるターゲットシーケンスの有用性：オオムギ出穂期関連QTLの解析事例

    武田 尚馬, 大熊 眞歩, Mandozai Ajmal, 西村 和紗, 牛島 幸一郎, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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    記述言語：日本語  

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  • パンコムギ6A染色体における光合成と収量性に関するQTLの同定とその周辺遺伝子の解明

    日名 弘貴, 石井 孝佳, 西村 和紗, 松岡 由浩, 辻本 壽, 妻鹿 良 亮

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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    記述言語：日本語  

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  • タバコ属種間雑種における染色体突然変異の発生頻度に関与する候補遺伝子座の同定

    中田 康貴, 西村 和紗, 永井 翔大, 手塚 孝弘, 山田 哲也

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • オオムギ茎葉空間配置の3Dイメージングによる定量化とその遺伝解析への利用

    吉川 大智, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • カキ品種群における果実形質のゲ ノム育種研究

    堀内 綾乃, 尾上 典之, 松﨑 隆介, 西村 和紗, 白澤 健太, 久保 康隆, 牛島 幸一郎, 赤木 剛士, 南川 舞

    日本育種学会第148回講演会  2025年9月 

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  • モモのde novo ゲノムアセンブリにおけるスキャフォールディング手法の比較検討

    西村和紗, 牛島幸一郎, 雨森大, 中西爽太郎, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆, 福田文夫, 中野龍平

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • 画像解析を活用したサツマイモの様々な農業形質に関する遺伝解析の試み

    田中沙英, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • GRAS-DiとdpMIG-seqを利用したサツマイモ塊根へのカロテノイド蓄積に関する比較解析と遺伝子座の同定 招待

    堀田望未, 岡田吉弘, 神崎浩, 栗原未結, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • 合成六倍体コムギにおける Grass-clump dwarfを制御する遺伝子の探索

    中西爽太朗, 西村和紗, 岡田萌子, 中﨑鉄也, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • バルク分離分析を利用したサツマイモネコブセンチュウレースSP6-2への抵抗性を制御するQTLsの同定とその効果の検証

    土屋駿太, 栗原未結, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • MutMap法を利用したオオムギの新規出穂期関連遺伝子HvHY2の同定

    大熊眞歩, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • dpMIG-seqを用いた、アワのサルデ遺伝子のマッピング

    福永 健二, 佐谷 祐樹, 西村 和紗

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • 水ナスを中心とした東アジアナス遺伝資源の果実形質調査と集団構造解析

    瀬上修平, 西村和紗

    日本育種学会第147回講演会  2025年3月 

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    記述言語：日本語  

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  • 改良版 MIG-seq 法によるムギ類の遺伝解析の加速化 招待

    西村和紗

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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  • GRAS-Di を用いたアワとエノコログサ間の栽培化関連形質のQTL解析

    吉木陸駆, 渡邊いぶき, 原貴臣, 中村千里, 西村和紗, 門田有希, 福永健二

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • パンコムギRIL 集団を利用した節水型耐乾性に寄与するQTLの探索

    日名弘貴, 石井孝佳, 西村和紗, 松岡由浩, 辻本壽, 妻鹿良亮

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • オオムギの 4H 染色体に座乗する新規出穂期関連 QTLの絞り込みと原因遺伝子の探索

    大熊眞歩, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • キクタニギクstrawberry flowering 1変異体の原因遺伝子の探索および機能解析

    青木孝司郎, 夏目弘樹, 西村和紗, 谷口研至, 草場信

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • オオムギ5H染色体に座乗する早生化効果の小さい新規出穂期関連QTLの遺伝解析

    栂井明日香, 大熊 眞歩, 阿辻佳人, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • オオムギ出穂期関連遺伝子が節間伸長および幼穂形成に及ぼす効果

    中田 知里, 中谷 勇, 岡拓海, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • サツマイモ主要品種を用いた収量に関するGxE解析および光合成活性の調査

    泉谷真, 田口和憲, 石黒浩二, 中佑, 西中未央, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • PCL1が機能欠損したパンコムギ大規模分離集団における出穂期に関するゲノミック予測

    田村朋子, 西村和紗, 栂井明日香, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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  • Nanopore ロングリードのアンプリコンシーケンスによるサツマイモ澱粉に低温糊化性をもたらす SSII 遺伝子の新規変異型アレルの探索

    中原貴臣, 田中勝, 泉谷真, 牛島幸一郎, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 次世代シーケンスを活用したオオムギ出穂期突然変異遺伝子のマッピング

    武田尚馬, 大熊眞歩, Ajmal Mandozai, 西村和紗, 門田有希, 牛島幸一郎, 加藤鎌司, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 遺伝子発現情報を利用した二粒系コムギが保有する雑種生育不全遺伝子のファインマッピング

    中西爽太朗, 西村和紗, 大熊眞歩, 中﨑鉄也, 加藤鎌司, 門田有希, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • Fine mapping を利用したサツマイモネコブセンチュウレース SP1抵抗性遺伝子の絞り込み

    田中沙英, 栗原未結, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • CoSSA 解析を利用したサツマイモネコブセンチュウレース SP6-2への抵抗性を制御する遺伝子座の同定とその効果の検証

    土屋駿太, 栗原未結, 田淵宏朗, 西村和紗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 3Dモデリングを用いたオオムギ匍匐性QTLの遺伝的定量解析

    吉川大智, 西村和紗, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 複数環境データを用いた野生エンマーコムギ系統 KU-195が保有する早生遺伝子の遺伝解析

    高野仁菜, 西村和紗, 張 芸瑄, 熊眞歩, 中﨑鉄也, 加藤鎌司, 門田有希, 西田英隆

    第16回中国地域育種談話会  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 植物育種学研究におけるMIG-seq法の利用と最適化 招待

    西村和紗

    第56回種生物学シンポジウム  2024年12月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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  • Improvement of an NGS library construction method from unpurified DNA to accelerate analysis of plant genetic resources

    Kazusa Nishimura

    IPSR International Forum on Plant Stress Sciences by/for Junior Researchers 2024  2024年12月 

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    記述言語：英語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • MAPPING OF HYBRID INCOMPATIBILITY GENE LOCATED ON CHROMOSOME 2B IN TETRAPLOID WHEAT

    Sotaro Nakanishi, Kazusa Nishimura, Maho Okuma, Tetsuya Nakazaki, Yuki Monden, Kenji Kato, Hidetaka Nishida

    3rd International Wheat Congress  2024年9月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • GENETIC ANALYSIS FOR HEADING DATE OF DURUM WHEAT WITH LOSS-OF-FUNCTION IN TWO HOMOEOLOGOUS PCL1

    Kazusa Nishimura, Akimasa Fujioka, Maho Okuma, Yuki Monden, Kenji Kato, Hidetaka Nishida

    3rd International Wheat Congress  2024年9月 

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    記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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  • 六倍体栽培ガキ品種群における集団構造解析および果実形状GWAS

    堀内 綾乃, 尾上 典之, 松崎 隆介, 南川 舞, 西村 和紗, 白澤 健太, 久保 康隆, 牛島 幸一郎, 赤木 剛士

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • dpMIG-seq 法を用いた四倍体ブルーベリーにおける連鎖地図構築

    長坂 京香, 西村 和紗, 山形 啓悟, 西山 総一, 郎, 山根 久代, 中野 龍平, 中﨑 鉄也

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • ダイコンのフロリゲン高発現能に寄与する遺伝子の同定

    元木 航, 西村 和紗, 鹿島 誠, 中﨑 鉄也, 中野 龍平, 細川 宗孝

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • ゲノムワイドジェノタイピングのための迅速なNGSライブラリー構築法の開発と技術移転

    西村 和紗

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（公募）  

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  • ボリビアと日本におけるキヌアの早生系統の育成に向けた取り組み

    永利 友佳理, 安井 康夫, 西村 和紗, 藤井 健一朗, 田中 ファン, 小賀田 拓也, 小林 安文, Meseret Gutema, 西原 英治, 坪 充, Alejandro Bonifacio, 藤田 泰成

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • オオムギ5H 染色体上に見出した早生化効果の小さい新規出穂期関連 QTLのマッピング

    栂井 明日香, 阿辻 佳人, 大熊 眞歩, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • PCL1が機能欠損したパンコムギ大規模分離集団における出穂期変異の遺伝解析

    田村 朋子, 西村 和紗, 栂井 明日香, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • パンコムギRIL集団を利用した節水型耐乾性に寄与するQTLの探索

    日名 弘貴, 石井 孝佳, 西村 和紗, 松岡 由浩, 辻本 壽, 妻鹿 良亮

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • サツマイモ主要品種の広域適応性に関するGxE解析および光合成活性の調査

    泉谷 真, 田口 和憲, 石黒 浩二, 田中 佑, 西中 未央, 西村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 門田 有希

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • イスラエル由来の野生エンマーコムギの遺伝的分化と出穂期多様性の解析

    張 芸瑄, 西村 和紗, 角坂 麻衣, 村田 和樹, 田村 朋子, 岩橋 優, 元木 航, 長坂 京香, 牧 隆宏, 木下 有羽, 中野 龍平, 井上 博茂, 門田 有希, 川浦 香奈子, 森 直樹, Eviatar Nevo, 加藤 鎌司, 西田 英隆, 中﨑 鉄也

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • キクタニギク白花粉変異体 wpo1の解析と原因遺伝子のマッピング

    秦 東, 西村 和紗, 森脇 幸太, 谷口 研至, 草場 信

    日本育種学会第146回講演会  2024年9月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 六倍体サツマイモにおける GWAS・QTL mapping・k-mer ベースのバルク分離分析による線虫抵抗性遺伝子座の探索と比較解析

    栗原 未結, 田淵 宏朗, 西村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 門田 有希

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • サツマイモ品種「ジェイレッド」のゲノム編集に向けた形質転換法の確立と培養条件の検討

    中村 千里, 泉谷 真, 大谷 基泰, 松井 英譲, 田淵 宏朗, 西村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 門田 有希

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • サツマイモにおいて未だ発見されていないネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の機能証明に向けた形質転換体の作出

    泉谷 真, 大谷 基泰, 中谷内 修, 田淵 宏朗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 西村 和紗, 門田 有希

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • オオムギ突然変異系統のエキソーム解析による出穂期関連突然変異遺伝子の探索

    武田 尚馬, 大熊 眞歩, 伊吹 千尋, Ajmal Mandozai, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌 司, 西田 英隆

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • オオムギRIL集団における出穂期関連遺伝子型と出穂期不安定性の関連

    大熊 眞歩, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 高密度連鎖地図を用いたオオムギ匍匐性を制御する遺伝子のマッピング

    西村 和紗, 大熊 眞歩, 福嶋 七海, 門田 有希, 西田 英隆, 加藤 鎌司

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    会議種別：口頭発表（一般）  

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  • サツマイモ塊根へのアントシアニン蓄積に関わる遺伝子座の同定と候補遺伝子の配列解析

    堀田 望未, 岡田 吉弘, 神崎 浩, 栗原 未結, 西村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 門田 有希

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • NanoporeロングリードのWGSにより明らかとなったサツマイモ澱粉に低温糊化性をもたらす SSII遺伝子の変異型アレル

    中原 貴臣, 片岡 育哉, 志茂 暉月, 多田 健太, 田中 勝, 小林 晃, 泉谷 真, 内藤 健, 西 村 和紗, 西田 英隆, 加藤 鎌司, 門田 有希

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • 赤米在来品種「神丹穂」の籾着色に関与する新規 QTLの同定

    水谷 円, 池田 実花, 西村 和紗, 種坂 英次, 築山 拓司

    日本育種学会第146回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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  • ダイズにおける遺伝子情報を用いた発育予測モデルの汎用性及び精度にモデル構築に用いる品種群 , 遺伝子セットと回帰手法の違いが及ぼす影響

    森 崇, 西村 和紗, 中野 聡史, 小梶 裕之, 元木 航, 熊谷 悦史, 加賀 秋人, 岩田 洋佳, 岩橋 優, 長坂 京香, 村田 和樹, 木下 有羽, 牧 隆宏, 井上 博茂, 中野 龍平, 中川 博視, 中﨑 鉄也

    日本育種学会第145回講演会  2024年3月 

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    記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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  • 未精製DNAを用いた迅速・簡便なMIG-seqライブラリー構築法の開発

    西村 和紗, 元木 航, 長坂 京香, 滝澤 理仁, 張 芸瑄, 森 崇, 中野 龍平, 中﨑 鉄也

    日本育種学会第144回講演会  2023年9月17日 

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  • 通常経費で実現できるNGSを使った育種事業 招待

    西村和紗

    近畿作物育種現地検討会  2023年9月 

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    記述言語：日本語  

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  • トウガラシ‘タカノツメ’が有する高温期の自動着果性の遺伝解析

    山崎 彬, 武澤亜緒, 西村和紗, 長坂京香, 岩橋 優, 井上博茂, 元木 航, 中野龍平, 細川宗孝, 中﨑鉄也

    園芸学会令和５年度春季大会  2023年3月19日 

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  • 四倍体コムギが保有する種間雑種生育不全に関する遺伝子の解析

    西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄也

    第17 回 ムギ類研究会  2022年12月17日 

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    会議種別：ポスター発表  

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  • MIG-seqの改良法 “degenerate oligonucleotide primer MIG-seq” の開発と作物の遺伝解析に対する応用

    西村和紗, 小梶裕之, 元木航, 山崎彬, 長坂京香, 滝澤理仁, 安井康夫, 河井崇, 牛島耕一郎, 山崎将紀, 齊藤大樹, 中野龍平, 中﨑鉄也

    日本育種学会第142回講演会  2022年9月24日 

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    記述言語：日本語  

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  • 迅速、簡単なNGSライブラリー構築 作物学研究におけるMIG-seqの可能性 招待

    西村和紗

    日本作物学会第254回講演会 若手の会企画による小集会(31)  2022年9月20日 

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  • De novoアセンブリとbulked segregant 解析を用いたキヌア本葉の赤色色素生産に関わる遺伝子の同定

    久篠 沙耶子, 水野 信之, 西村 和紗, 上野 まりこ, 中崎 鉄矢, 小林 安文, 藤田 泰成, 白澤 健太, 平川 英樹, 安井 康夫, 桂 圭佑

    日本作物学会第254回講演会  2022年9月18日 

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  • コムギの異質倍数性を活用した効率的遺伝解析手法の開発

    西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄也

    高次倍数体をどうにかする会2022夏  2022年8月26日 

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  • 無核性カンキツ新品種「瑞季」の品種識別CAPSマーカーのNGSを用いた迅速な開発

    西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄矢

    日本育種学会第141回講演会  2022年3月 

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  • 三倍体コムギを活用して三度の採種によってNAM集団を構築する手法の開発

    西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄也

    第16 回 ムギ類研究会  2021年12月 

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    会議種別：ポスター発表  

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  • ‘紅博桃’の新規枝変わりの第４染色体に検出された大規模なヘテロ接合性の消失

    谷口裕起, 牛島幸一郎, 河井 崇, 田村尚之, 福田文夫, 髙田大輔, 佐藤 守, 西村和紗, 間合絵里, 元木 航, 山崎 彬, 中﨑鉄也, 中野龍平

    園芸学会令和3年度秋季大会  2021年9月11日 

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  • MIG-seqの作物ゲノムへの応用;コムギのハイスループットジェノタイピングはMIG-seqによって実現する

    西村和紗, 元木航, 山崎彬, 安井康夫, 滝澤理仁, 河井崇, 牛島幸一郎, 中野龍平, 中﨑鉄也

    日本育種学会第140回講演会  2021年9月 

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  • トマトの単為結果性遺伝⼦pat-kによる高糖度化の機構解明に向けたメタボローム解析

    福留千映, 滝澤理仁, 草野都, 小林誠, 斎藤和季, 間合絵里, 元木航, 西村和紗, 山崎彬, 中野龍平, 中﨑鉄也

    園芸学会令和 3 年度春季大会  2021年3月 

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  • 変動光環境におけるシコクビエの葉緑体配置および光合成動態

    間合絵里, 西村和紗, 滝澤理仁, 中﨑鉄也

    第251回日本作物学会講演会  2021年3月 

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  • 単為結果性ニホンカボチャ‘OM1-P’の果実形成に関するオミックス解析

    小川萌, 滝澤理仁, 永野惇, 小嶋美紀子, 竹林裕美子, 榊原均, 元木航, 間合絵里, 西村和紗, 山崎彬, 中野龍平, 中﨑鉄也

    園芸学会令和 3 年度春季大会  2021年3月 

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  • イネ出穂開花関連遺伝子の遺伝子型情報を活用した発育予測モデルの構築

    西村和紗, 小梶裕之, 斎藤大樹, 清水顕史, 矢部志央, 山崎将紀, 後藤明俊, 永野惇, 中川博視, 中崎鉄也

    第251回日本作物学会講演会  2021年3月 

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  • 野⽣エンマーコムギにおけるVRN-A3座の変異と栽培コムギにおける分布

    ⻄村和紗, 森 直樹, 半⽥ 裕⼀, 川浦 ⾹奈⼦, 北島 宣, 中﨑 鉄也

    第139回日本育種学会講演会  2021年3月 

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  • トマト品種‘Micro-Tom’の果実重を制御するQTLの同定

    西田 敦, 滝澤理仁, 間合絵里, 西村和紗, 中野龍平, 中﨑鉄也

    近畿作物育種研究会第189回講演会  2020年12月12日 

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  • 同祖性を考慮したGenotyping-by-Sequencing法によるデュラムコムギの早生QTLの同定

    平尾友識, 西村和紗, 永野惇, 滝澤理仁, 間合絵里, 中野龍平, 中﨑鉄也

    日本育種学会第136回講演会  2019年9月 

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  • Distribution of a Vrn-A3 allele with an insertion in the promoter region in wheat and its potential to apply for wheat breeding

    Kazusa Nishimura, Hirokazu Handa, Naoki Mori, Kanako Kawaura, Tetsuya Nakazaki

    1st International Wheat Congress  2019年9月 

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  • 栽培エンマーコムギ(Triticum turgidum L. ssp. dicoccum)におけるVrn-A3ハプロタイプの地理的偏り

    西村和紗, 滝澤理仁, 鍋島朋之, 間合絵里, 中﨑鉄也

    日本育種学会第135回春季大会  2019年3月 

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  • デュラムコムギが保有するPpd-A1aの早生効果を超える開花期遺伝子の探索

    平尾友識, 西村和紗, 中野龍平, 鍋島朋之, 滝澤理仁, 間合絵里, 中崎鉄也

    第13回ムギ類研究会  2018年11月 

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  • 四倍体コムギ系統TN26が保有する3座の早生QTLの集積効果は不感光性Ppd-A1aの早生効果に匹敵する

    西村和紗, 平尾友識, 滝澤理仁, 鍋島朋之, 間合絵里, 中崎鉄也

    日本育種学会第134回秋季大会  2018年9月 

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  • スペルトコムギ(Triticum aestivum L. ssp. spelta) 系統KT19-1 が保有する新規Vrn-A3座アレルの早生化効果

    西村和紗, 齊藤隆成, 半田裕一, 森直樹, 川浦香奈子, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第133回講演会  2018年3月 

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  • 六倍体コムギ系統(Triticum aestivum L.)におけるTN26型Vrn-A3早生アレルの分布.

    西村和紗, 齊藤隆成, 森直樹, 半田裕一, 北島宣, 中﨑鉄也

    第12回ムギ類研究会  2017年12月 

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  • 四倍体コムギの純粋早晩性QTL qEpse3が開花まで日数におよぼす効果

    齊藤隆成, 西村和紗, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第131回講演会  2017年4月 

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  • Identification of novel QTL for early flowering in a variety of “Emmer” wheat.

    13th International Wheat Genetics Symposium  2017年4月 

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    記述言語：英語  

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  • 四倍体コムギにおけるVrn-A3上流域の欠失がVrn3の発現に与える影響

    西村和紗, 齊藤隆成, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第131回講演会  2017年4月 

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  • 止葉展開から出穂までの期間を短縮する四倍体コムギの純粋早晩性遺伝子

    齊藤隆成, 西村和紗, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第130回講演会  2016年9月 

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  • Vrn-A3座上流域に存在する挿入配列の四倍体コムギにおける分布

    西村和紗, 桂圭佑, 齊藤大樹, 北島宣, 河原太八, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第129回講演会  2016年3月 

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  • 四倍体コムギ7A染色体に座乗する感光性QTLはPpd-A1と相互作用を示す

    西村和紗, 桂圭佑, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第128回講演会  2015年9月 

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  • ・中_鉄也 (2015) 四倍体コムギ7A染色体に座乗する感光性遺伝子

    西村和紗, 桂圭佑, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    近畿作物・育種研究会第 179回例会  2015年5月 

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  • 不感光性Ppd-A1アレルの早生化作用を超える四倍体コムギの早生遺伝子

    西村和紗, 桂圭佑, 齊藤大樹, 北島宣, 中﨑鉄也

    日本育種学会 第126回講演会  2014年9月 

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  • 四倍体コムギにおける出穂開花関連遺伝子の探索

    西村和紗, 桂圭佑, 齊藤大樹, 北島宣, 河原太八, 中﨑鉄也

    近畿作物・育種研究会 第177回例会  2014年7月 

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  • 簡単、安価な新規多型検出法“dpMIG-seq”の多様な作物の遺伝解析への応⽤

    西村和紗, 滝澤理仁, 中野龍平, 中﨑鉄也

    近畿作物・育種研究会 第193回例会講演 

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  • オオムギ出穂期突然変異体のエキソーム解析による原因遺伝子の探索及び遺伝解析

    大熊 眞歩, 西村 和紗, 門田 有希, 加藤 鎌司, 西田 英隆

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受賞

  • 第144回講演会日本育種学会優秀発表賞

    2023年9月   日本育種学会   未精製DNAを用いた迅速・簡便なMIG-seqライブラリー構築法の開発

    西村 和紗, 元木 航, 長坂 京香, 滝澤 理仁, 張 芸瑄, 森 崇, 中野 龍平, 中﨑 鉄也

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  • 第12回ムギ類研究会若手ポスター賞,

    2017年12月   ムギ類研究会   六倍体コムギ系統(Triticum aestivum L.)におけるTN26型Vrn-A3早生アレルの分布

    西村和紗, 齊藤隆成, 森直樹, 半田裕一, 北島宣, 中﨑鉄也

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 階層性学習を可能にする生物学的基盤の解明

    研究課題/領域番号：25H00997  2025年04月 - 2030年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    和多 和宏, 西村 和紗

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    配分額：45890000円 （ 直接経費：35300000円 、 間接経費：10590000円 ）

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  • F1およびF2後代を用いたモモの極晩生成熟期と遅軟化特性の遺伝解析

    研究課題/領域番号：25K09107  2025年04月 - 2028年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    河井 崇, 西村 和紗, 福田 文夫

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    配分額：4810000円 （ 直接経費：3700000円 、 間接経費：1110000円 ）

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  • 減数分裂時乗換えメカニズムを利用した育種素材開発のための基盤研究

    研究課題/領域番号：24K01732  2024年04月 - 2029年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    牛島 智一, 奥本 裕, 吉川 貴徳, 西村 和紗

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    配分額：18330000円 （ 直接経費：14100000円 、 間接経費：4230000円 ）

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  • キク属モデル系統と種間交雑を基軸としたキク属重要形質の分子遺伝学的解剖

    研究課題/領域番号：24H00513  2024年04月 - 2029年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    草場 信, 樋口 洋平, 山谷 浩史, 中野 道治, 豊倉 浩一, 西村 和紗

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    配分額：47450000円 （ 直接経費：36500000円 、 間接経費：10950000円 ）

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  • サトイモの交雑育種技術の開発

    研究課題/領域番号：24K01751  2024年04月 - 2028年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    西島 隆明, 西村 和紗

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    配分額：18460000円 （ 直接経費：14200000円 、 間接経費：4260000円 ）

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  • ボリビア・アンデスにおける南部高地型キヌアの栽培化過程の解明

    研究課題/領域番号：23KK0113  2023年09月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  国際共同研究加速基金(海外連携研究)

    安井 康夫, 藤田 泰成, 桂 圭佑, 西村 和紗

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    配分額：20670000円 （ 直接経費：15900000円 、 間接経費：4770000円 ）

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  • 未利用遺伝資源と数理モデリングの活用によるコムギ出穂期の自在制御法の開発

    研究課題/領域番号：23K13929  2023年04月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

    西村 和紗

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    配分額：4680000円 （ 直接経費：3600000円 、 間接経費：1080000円 ）

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  • 新規に発見したブドウ枝変わりを利用した樹体内遠隔制御による果実成熟開始機構の検証

    研究課題/領域番号：22K19180  2022年06月 - 2025年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的研究(萌芽)

    中野 龍平, 長坂 京香, 西村 和紗

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    配分額：6370000円 （ 直接経費：4900000円 、 間接経費：1470000円 ）

    本研究では、ブドウの熟期に関連するベレゾン期の開始を制御する機構の解明に向けて、研究グループらが新規に発見した四倍体ブドウ‘ピオーネ’の熟期の異なる変異した枝（枝変わり）とその同一親株上の変異前（熟期が通常）の枝を利用した研究を展開しており、以下のような成果が得られた。
    （次世代シークエンス解析）より正確に枝変わりと変異前の枝の間のゲノム比較のために、 ‘ピオーネ’のゲノム配列についてnanoporeによりロングリードを解読し、 de novo assemblyによりドラフトゲノムを作成した結果、参照ゲノムとして利用するには、さらに精度の高いドラフトゲノムの作成の必要性が示された。ベレゾン前後の枝変わりの枝および変異前の枝から果粒や葉などの器官をサンプリングし、RNA-seq解析を実施したところ、いくつかの発現変動遺伝子がみつかった。上述のより精度の高い参照ゲノムが作成され次第、第２染色体上の候補領域への座乗や器官特異性（果実ではなく他の器官での発現による制御なども含む）、および、配列情報を元にした機能の推定が実施できる環境を整った。
    （非破壊的植物センシング）枝変わりの枝および変異前の形質を示す隣の枝について、ベレゾン前後の蒸散や光合成に関わる葉温の変化のサーモグラフィーによるモニタリングおよび蛍光画像の取得による光合成活性能・ストレス状態の検出などのセンシングに成功した。枝変わりの枝および変異前の形質を示す隣の枝の間にも明確な差は見出せず、これらのセンシング手法では検知できない生理的な変化が起こっておいると考えられた。
    （挿し木個体の育成）
    枝変わりの枝および変異前の形質を示す隣の枝いずれからも、挿し木による個体の増殖とその育成に成功している。これらの個体は、枝変わりの形質が安定的に現れるか（ゲノムレベルの変化か）の検証や原因候補遺伝子の発現操作試験に利用できる。

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  • モモのPan-genomeの構築とその利用による主要形質の制御遺伝子の特定

    研究課題/領域番号：22H00368  2022年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    中野 龍平, 牛島 幸一郎, 山本 幹博, 福田 文夫, 西村 和紗, 高田 大輔, 鵜木 悠治郎, 森本 拓也, 小田 賢司

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    配分額：41860000円 （ 直接経費：32200000円 、 間接経費：9660000円 ）

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  • カンキツの起源と分類の再構築‐田中長三郎のさく葉標本と研究ノートの解析‐

    研究課題/領域番号：20H02980  2020年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    北島 宣, 山本 雅史, 伊藤 謙, 深尾 葉子, 中村 彰宏, 田中 圭子, 中野 道治, 西村 和紗, 福田 智子, 清水 徳朗

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    配分額：17420000円 （ 直接経費：13400000円 、 間接経費：4020000円 ）

    東アジアの在来カンキツのDNA解析では、359個体について131のSSRマーカーについての調査が終了し、これまでほとんど研究が行われていなかったライム、リモニア、イーチャンパペダ、カシーパペダ、シキキツについて、その分布や類縁関係について考察することができた。また、田中の分類はゲノム分析においてそれらの密接な類縁関係が示されており、新たな分類体系を構築する際に、田中の分類は重要な基盤になることが示唆された。一方、田中が作製した標本数の経年的変化と国立台湾大学における田中の著作の調査により、田中のカンキツ分類研究の概要を把握することができた。また、和歌山の橘本神社に開設されたカンキツ博物館である「常世館」に保存されている橘本神社所有の田中資料の調査により、その文化的価値を広く一般にアピールし、世界農業遺産認定に向けた取り組みを行った。これらの成果は、2022年3月21日の園芸学会春季大会テーマセッションにおいて口頭発表した。
    田中のスケッチブックは11冊、940ページあり、各ページにカンキツ種のスケッチと手書きの英文によって説明文が記述されている。この手書き英文の活字化を行うとともに、英文の和訳を行い、現在、４冊目の172ページ分まで進捗している。国内の在来ユズの調査では、京都、兵庫、福井、石川の日本海沿岸地域とユズの主要産地である高知の古木調査を行い、48個体を調査して推定樹齢100年以上の４個体を発見した。そのうち、高知県北川村には樹齢300年といわれている古木が存在した。クローンであるユズの多型マーカー解析では、ddRAD-seq法に基づき100種類のCAPsマーカー候補を作成した。これらのマーカーについて、再現性を確認中である。一方、古文におけるユズ記載の調査では、平安時代に京都にユズが存在しており、貴族の酒宴の席での話や室町時代の料理書などに記載されてた。

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  • 異質倍数性を逆手に取る:コムギNAM集団の効率的作出による有用遺伝子の網羅的探索

    研究課題/領域番号：20K15502  2020年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究

    西村 和紗

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    配分額：4290000円 （ 直接経費：3300000円 、 間接経費：990000円 ）

    令和3年度の春に19系統の四倍体コムギとLangdonとのF1個体を種子親、タルホコムギ系統KU-2098を花粉親として交配を行った。8328小花を交配した結果、1594粒の三倍体種子を得ることができた。四倍体コムギの系統間にはタルホコムギとの交配の成功率に差が認められることが知られているが、本研究では、どの組み合わせにおいても三倍体種子を得ることができた。一方で、これらの種子を発芽させた結果、1594粒中、503粒しか発芽しなかった。そのため、当初はファイトトロン内で三倍体を育てて合成六倍体を得ることを計画していたが、できる限り分げつ数を増やして、各三倍体個体から確実に合成六倍体を得るために、ハウス内に三倍体を移植した。三倍体個体は健全に生育しているが、一部の個体に異常分げつ矮性と見られる雑種生育不全が認められた。今後は、これらの雑種生育不全に関わる遺伝子座およびその原因遺伝子の同定も、NAM集団の作出と並行して試みる予定である。
    また、ゲノム中の限られた領域を効率良く次世代シーケンサーでシーケンスする手法の一つである、MIG-seq(Suyama and Matsuki 2015)はddRAD-seqなどの手法と比較して得られる多型数が少ないと報告されているが、コムギにおいては比較的低コストで、QTL解析やアソシーエーション解析に十分な多型が得られることを令和2年度に明らかにした。令和3年度には、この成果に加えて、MIG-seqでは1stPCRに用いるDNAの濃度を揃えずとも欠損データの少ないジェノタイピングができることを明らかにした。これらの成果について論文に取りまとめ、DNA research誌に投稿し、審査中である。

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