2024/11/10 更新

写真a

タケベ　カツキ
武部　克希
Takebe Katsuki
所属
医歯薬学域 助教
職名
助教
外部リンク

研究キーワード

  • 構造活性相関

  • 口腔外科

  • 微生物学

  • X線結晶構造解析

  • 量子化学

  • 構造生物学

研究分野

  • ライフサイエンス / 外科系歯学

  • ライフサイエンス / 構造生物化学

  • ライフサイエンス / 細菌学

経歴

  • 岡山大学   学術研究院医歯薬学域 歯科薬理学分野   助教

    2024年4月 - 現在

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  • 大阪大学   大学院歯学研究科顎口腔腫瘍学講座   院生医員

    2020年4月 - 2024年3月

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所属学協会

  • 口腔科学会

    2023年1月 - 現在

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  • 日本薬学会

    2021年11月 - 現在

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  • 日本口腔外科学会

    2019年8月 - 現在

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  • 歯科基礎医学会

    2018年5月 - 現在

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  • 日本結晶学会

    2015年8月 - 現在

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論文

  • Herbal medicine Ninjinyoeito inhibits RANKL-induced osteoclast differentiation and bone resorption activity by regulating NF-kB and MAPK pathway 査読

    Kaung Htike, Kunihiro Yoshida, Takanori Eguchi, Katsuki Takebe, Xueming Li, Yaxin Qu, Eiko Sakai, Takayuki Tsukuba, Kuniaki Okamoto

    Journal of Oral Biosciences   2024年10月

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    記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.job.2024.09.007

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  • New Catalytic Residues and Catalytic Mechanism of the RNase T1 Family 査読

    Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Yumiko Hara, Takuya Katsutani, Naomi Motoyoshi, Tadashi Itagaki, Shuhei Miyakawa, Kuniaki Okamoto, Kaori Fukuzawa, Hiroko Kobayashi

    ACS Bio & Med Chem Au   2024年9月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society (ACS)  

    DOI： 10.1021/acsbiomedchemau.4c00046

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  • Identification of the Acidification Mechanism of the Optimal pH for RNase He1 査読

    Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takeshi Sangawa, Naomi Motoyoshi, Tadashi Itagaki, Kana Kashima, Narikazu Uzawa, Hiroko Kobayashi

    Biological and Pharmaceutical Bulletin   46 ( 12 )   1778 - 1786   2023年12月

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    担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Pharmaceutical Society of Japan  

    DOI： 10.1248/bpb.b23-00511

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  • Analysis of FctB3 crystal structure and insight into its structural stabilization and pilin linkage mechanisms 査読

    Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takeshi Sangawa, Bernd Kreikemeyer, Masaya Yamaguchi, Narikazu Uzawa, Tomoko Sumitomo, Shigetada Kawabata, Masanobu Nakata

    Archives of Microbiology   206 ( 1 )   2023年11月

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC  

    DOI： 10.1007/s00203-023-03727-1

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    その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1007/s00203-023-03727-1/fulltext.html

  • Reconstruction of the lower lip after resection of its venous malformation using a labial mucosal advancement flap – A case report- 査読

    Yoshio Ueno, Kazuhide Matsunaga, Akinori Takeshita, Akari Teramoto, Katsuki Takebe, Hitomi Kajikawa, Yoshihiro Morita, Narikazu Uzawa

    Journal of Oral and Maxillofacial Surgery, Medicine, and Pathology   35 ( 6 )   513 - 517   2023年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.ajoms.2023.03.004

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  • Structural and Computational Analyses of the Unique Interactions of Opicapone in the Binding Pocket of Catechol O-Methyltransferase: A Crystallographic Study and Fragment Molecular Orbital Analyses 査読

    Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Takao Kuwada-Kusunose, Satoko Shirai, Kaori Fukuzawa, Tomoko Takamiya, Narikazu Uzawa, Hiroshi Iijima

    Journal of Chemical Information and Modeling   63 ( 14 )   4468 - 4476   2023年7月

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：American Chemical Society (ACS)  

    DOI： 10.1021/acs.jcim.3c00331

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  • Deep learning model for the automated evaluation of contact between the lower third molar and inferior alveolar nerve on panoramic radiography 査読

    Katsuki Takebe, Tomoaki Imai, Seiko Kubota, Ayano Nishimoto, Shigeki Amekawa, Narikazu Uzawa

    Journal of Dental Sciences   18 ( 3 )   991 - 996   2023年7月

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    担当区分：筆頭著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.jds.2022.12.008

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  • GATA6 regulates expression of annexin A10 (ANXA10) associated with epithelial–mesenchymal transition of oral squamous cell carcinoma 査読

    Shun Takayama, Yoshihiro Morita, Ayano Nishimoto, Junya Nishimura, Katsuki Takebe, Satoko Kishimoto, Yuka Matsumiya-Matsumoto, Kazuhide Matsunaga, Tomoaki Imai, Narikazu Uzawa

    Archives of Oral Biology   144   105569 - 105569   2022年12月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Elsevier BV  

    DOI： 10.1016/j.archoralbio.2022.105569

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  • Novel Functional Peptide for Next-Generation Vital Pulp Therapy 査読

    M. Watanabe, M. Okamoto, S. Komichi, H. Huang, S. Matsumoto, K. Moriyama, J. Ohshima, S. Abe, M. Morita, M. Ali, K. Takebe, I. Kozaki, A. Fujimoto, K. Kanie, R. Kato, K. Uto, M. Ebara, A. Yamawaki-Ogata, Y. Narita, Y. Takahashi, M. Hayashi

    Journal of Dental Research   102 ( 3 )   322 - 330   2022年11月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：SAGE Publications  

    Although vital pulp therapy should be performed by promoting the wound-healing capacity of dental pulp, existing pulp-capping materials were not developed with a focus on the pulpal repair process. In previous investigations of wound healing in dental pulp, we found that organic dentin matrix components (DMCs) were degraded by matrix metalloproteinase-20, and DMC degradation products containing protein S100A7 (S100A7) and protein S100A8 (S100A8) promoted the pulpal wound-healing process. However, the direct use of recombinant proteins as pulp-capping materials may cause clinical problems or lead to high medical costs. Thus, we hypothesized that functional peptides derived from recombinant proteins could solve the problems associated with direct use of such proteins. In this study, we identified functional peptides derived from the protein S100 family and investigated their effects on dental pulp tissue. We first performed amino acid sequence alignments of protein S100 family members from several mammalian sources, then identified candidate peptides. Next, we used a peptide array method that involved human dental pulp stem cells (hDPSCs) to evaluate the mineralization-inducing ability of each peptide. Our results supported the selection of 4 candidate functional peptides derived from proteins S100A8 and S100A9. Direct pulp-capping experiments in a rat model demonstrated that 1 S100A8-derived peptide induced greater tertiary dentin formation compared with the other peptides. To investigate the mechanism underlying this induction effect, we performed liquid chromatography–tandem mass spectrometry analysis using hDPSCs and the S100A8-derived peptide; the results suggested that this peptide promotes tertiary dentin formation by inhibiting inflammatory responses. In addition, this peptide was located in a hairpin region on the surface of S100A8 and could function by direct interaction with other molecules. In summary, this study demonstrated that a S100A8-derived functional peptide promoted wound healing in dental pulp; our findings provide insights for the development of next-generation biological vital pulp therapies.

    DOI： 10.1177/00220345221135766

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    その他リンク： http://journals.sagepub.com/doi/full-xml/10.1177/00220345221135766

  • Biofilm Spreading by the Adhesin-Dependent Gliding Motility of Flavobacterium johnsoniae: 2. Role of Filamentous Extracellular Network and Cell-to-Cell Connections at the Biofilm Surface 査読

    Keiko Sato, Masami Naya, Yuri Hatano, Naoki Kasahata, Yoshio Kondo, Mari Sato, Katsuki Takebe, Mariko Naito, Chikara Sato

    International Journal of Molecular Sciences   22 ( 13 )   6911 - 6911   2021年6月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：MDPI AG  

    Flavobacterium johnsoniae forms a thin spreading colony on nutrient-poor agar using gliding motility. As reported in the first paper, WT cells in the colony were sparsely embedded in self-produced extracellular polymeric matrix (EPM), while sprB cells were densely packed in immature biofilm with less matrix. The colony surface is critical for antibiotic resistance and cell survival. We have now developed the Grid Stamp-Peel method whereby the colony surface is attached to a TEM grid for negative-staining microscopy. The images showed that the top of the spreading convex WT colonies was covered by EPM with few interspersed cells. Cells exposed near the colony edge made head-to-tail and/or side-to-side contact and sometimes connected via thin filaments. Nonspreading sprB and gldG and gldK colonies had a more uniform upper surface covered by different EPMs including vesicles and filaments. The EPM of sprB, gldG, and WT colonies contained filaments ~2 nm and ~5 nm in diameter; gldK colonies did not include the latter. Every cell near the edge of WT colonies had one or two dark spots, while cells inside WT colonies and cells in SprB-, GldG-, or GldK-deficient colonies did not. Together, our results suggest that the colony surface structure depends on the capability to expand biofilm.

    DOI： 10.3390/ijms22136911

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  • Crystal structure of the C-terminal domain of envelope protein VP37 from white spot syndrome virus reveals sulphate binding sites responsible for heparin binding 査読

    Wasusit Somsoros, Takeshi Sangawa, Katsuki Takebe, Jakrada Attarataya, Kanokpan Wongprasert, Saengchan Senapin, Triwit Rattanarojpong, Mamoru Suzuki, Pongsak Khunrae

    Journal of General Virology   102 ( 6 )   2021年6月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Microbiology Society  

    White spot syndrome virus (WSSV) is the most virulent pathogen causing high mortality and economic loss in shrimp aquaculture and various crustaceans. Therefore, the understanding of molecular mechanisms of WSSV infection is important to develop effective therapeutics to control the spread of this viral disease. In a previous study, we found that VP37 could bind with shrimp haemocytes through the interaction between its C-terminal domain and heparin-like molecules on the shrimp cells, and this interaction can also be inhibited by sulphated galactan. In this study, we present the crystal structure of C-terminal domain of VP37 from WSSV at a resolution of 2.51 Å. The crystal structure contains an eight-stranded β-barrel fold with an antiparallel arrangement and reveals a trimeric assembly. Moreover, there are two sulphate binding sites found in the position corresponding to R213 and K257. In order to determine whether these sulphate binding sites are involved in binding of VP37 to heparin, mutagenesis was performed to replace these residues with alanine (R213A and K257A), and the Surface Plasmon Resonance (SPR) system was used to study the interaction of each mutated VP37 with heparin. The results showed that mutants R213A and K257A exhibited a significant loss in heparin binding activity. These findings indicated that the sites of R213 and K257 on the C-terminal domain of envelope protein VP37 are essential for binding to sulphate molecules of heparin. This study provides further insight into the structure of C-terminal domain of VP37 and it is anticipated that the structure of VP37 might be used as a guideline for development of antivirus agent targeting on the VP37 protein.

    DOI： 10.1099/jgv.0.001611

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  • Crystal Structure of Catechol -O-Methyltransferase Complexed with Nitecapone 査読

    Hiroshi Iijima, Katsuki Takebe, Mamoru Suzuki, Hiroko Kobayashi, Tomoko Takamiya, Hiroaki Saito, Norio Niwa, Takao Kuwada-Kusunose

    Chemical and Pharmaceutical Bulletin   68 ( 5 )   447 - 451   2020年5月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Pharmaceutical Society of Japan  

    DOI： 10.1248/cpb.c20-00011

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  • X-Ray Crystallographic Structure of Hericium erinaceus Ribonuclease, RNase He1 in Complex with Zinc 査読

    Hiroko Kobayashi, Takeshi Sangawa, Katsuki Takebe, Naomi Motoyoshi, Tadashi Itagaki, Mamoru Suzuki

    Biological and Pharmaceutical Bulletin   42 ( 12 )   2054 - 2061   2019年12月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Pharmaceutical Society of Japan  

    DOI： 10.1248/bpb.b19-00532

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  • Immunoglobulin‐like domains of the cargo proteins are essential for protein stability during secretion by the type IX secretion system 査読

    Keiko Sato, Shinji Kakuda, Hideharu Yukitake, Yoshio Kondo, Mikio Shoji, Katsuki Takebe, Yuka Narita, Mariko Naito, Daisuke Nakane, Yoshimitsu Abiko, Koichi Hiratsuka, Mamoru Suzuki, Koji Nakayama

    Molecular Microbiology   110 ( 1 )   64 - 81   2018年10月

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    掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Wiley  

    Summary

    The periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis secretes many potent virulence factors using the type IX secretion system (T9SS). T9SS cargo proteins that have been structurally determined by X‐ray crystallography are composed of a signal peptide, functional domain(s), an immunoglobulin (Ig)‐like domain and a C‐terminal domain. Role of the Ig‐like domains of cargo proteins in the T9SS has not been elucidated. Gingipain proteases, which are cargo proteins of the T9SS, were degraded when their Ig‐like domains were lacking or truncated. The degradation was dependent on the activity of a quality control factor, HtrA protease. Another T9SS cargo protein, HBP35, which has a thioredoxin domain as a functional domain, was analyzed by X‐ray crystallography, revealing that HBP35 has an Ig‐like domain after the thioredoxin domain and that the hydrophobic regions of the thioredoxin domain and the Ig‐like domain face each other. HBP35 with substitution of hydrophobic amino acids in the Ig‐like domain was degraded depending on HtrA. These results suggest that the Ig‐like domain mediates stability of the cargo proteins in the T9SS.

    DOI： 10.1111/mmi.14083

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    その他リンク： https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/mmi.14083

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MISC

  • Structural analysis of inactive hyaluronidase of Streptococcus pyogenes

    山口 雅也, 東 孝太郎, 武部 克希, 中田 匡宣, 住友 倫子, 川端 重忠

    日本細菌学雑誌   79 ( 2 )   268 - 268   2024年7月

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    記述言語：英語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • ヤマブシタケ由来RNase He1の12残基改変体の構造と抗腫瘍活性

    小林弘子, 武部克希, 千田正, 元吉尚美, 板垣正, 鵜澤成一, 鈴木守

    日本薬学会年会要旨集(Web)   144th   2024年

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  • COMTの反応機構と賦活化物質による立体構造変化

    武部克希, 桑田(楠瀬)隆生, 鈴木守, 飯島洋, 飯島洋

    日本薬学会年会要旨集(Web)   144th   2024年

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  • 立体構造と量子化学計算に基づくCOMT-リガンド分子間相互作用新規リガンド骨格を目指して

    福澤薫, 白井智子, 武部克希, 高谷大輔, 飯島洋, 飯島洋

    日本薬学会年会要旨集(Web)   144th   2024年

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  • パノラマX線画像における下顎智歯-下歯槽管頬舌的位置関係の自動判定深層学習モデル構築の試み

    桂 尚[渕端], 武部 克希, 窪田 星子, 西元 彩乃, 今井 智章, 鵜澤 成一

    日本口腔科学会雑誌   72 ( 2 )   89 - 89   2023年7月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(NPO)日本口腔科学会  

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  • ヤマブシタケ由来RNase He1の至適pHに関与するアミノ酸残基の検討

    小林弘子, 武部克希, 元吉尚美, 板垣正, 鵜澤成一, 鈴木守

    日本薬学会年会要旨集(Web)   143rd   2023年

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  • カテコールO-メチル転移酵素の配座構造の変化

    飯島洋, 武部克希, 鈴木守, 桑田(楠瀬)隆生, 高宮知子, 鵜澤成一

    日本薬学会年会要旨集(Web)   143rd   2023年

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  • ヤマブシタケ由来RNase He1改変体のX線構造解析と抗腫瘍活性

    武部克希, 千田正, 森田祥弘, 西村遵也, 西元彩乃, 鵜澤成一, 小林弘子

    日本口腔科学会学術集会プログラム・抄録集   77th   2023年

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  • 切除可能口腔癌に対する術前PCE療法の効果についての検討

    竹下彰範, 松永和秀, 森田祥弘, 松宮由香, 梶川ひとみ, 西元彩乃, 武部克希, 千田正, 柏木孝文, 加島佳奈, 紀之定紘子, 芝原巧, 菊池菫, 鵜澤成一

    日本口腔腫瘍学会総会・学術大会プログラム・抄録集   41st   2023年

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  • Labial mucosal advancement flapを用いて口唇再建を行った下唇血管腫の1例

    寺本 朱里, 上野 祥夫, 松永 和秀, 竹下 彰範, 武部 克希, 梶川 ひとみ, 鵜澤 成一

    日本口腔科学会雑誌   71 ( 2 )   100 - 101   2022年7月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(NPO)日本口腔科学会  

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  • ヤマブシタケ由来RNase He1のグアノシン複合体のX線結晶構造解析

    小林 弘子, 寒川 剛, 武部 克希, 元吉 尚美, 板垣 正, 鵜澤 成一, 鈴木 守

    日本薬学会年会要旨集   142年会   28PO5 - 01   2022年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本薬学会  

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  • パノラマX線画像における下顎智歯と下歯槽管接触の自動判定深層学習モデルの構築

    武部克希, 今井智章, 窪田星子, 窪田星子, 西元彩乃, 鵜澤成一

    日本口腔科学会雑誌(Web)   71 ( 1 )   2022年

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  • COMT(カテコールO-メチル基転移酵素)-新規阻害剤の複合体の構造解析:Opicaponeは基質(SAM),生成物(SAH)とも安定な複合体を形成する

    武部克希, 桑田(楠瀬)隆夫, 鈴木守, 高宮知子, 鵜澤成一, 飯島洋

    日本薬学会年会要旨集(Web)   142nd   2022年

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  • 当科における術後再発転移高リスク症例への対応の実際

    竹下彰範, 松永和秀, 加藤逸郎, 今井智章, 森田祥弘, 松宮由香, 千田正, 梶川ひとみ, 武部克希, 鵜澤成一

    日本口腔腫瘍学会総会・学術大会プログラム・抄録集   40th   2022年

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  • 賦活化化合物によるCOMTの生成物阻害の解除機構:結晶構造解析による検討

    飯島洋, 武部克希, 桑田(楠瀬)隆生, 鈴木守, 高宮知子, 鵜澤成一

    日本薬学会年会要旨集(Web)   142nd   2022年

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  • 化膿レンサ球菌の不活性型ヒアルロン酸分解酵素の結晶構造解析と活性型変異体の構造予測(Structural analysis of Streptococcus pyogenes hyaluronidase and in silico analysis based on structural models)

    東 孝太郎, 山口 雅也, 中田 匡宣, 武部 克希, 住友 倫子, 鈴木 守, 川端 重忠

    Journal of Oral Biosciences Supplement   2021   181 - 181   2021年10月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)歯科基礎医学会  

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  • 口腔癌の術前末梢血単核細胞を用いた腫瘍浸潤リンパ球のフェノタイプ予測

    梶川 ひとみ, 武部 克希, 松永 和秀, 鵜澤 成一

    日本口腔科学会雑誌   70 ( 2 )   145 - 145   2021年7月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(NPO)日本口腔科学会  

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  • 口腔扁平上皮癌における腫瘍内T細胞と腫瘍浸潤様式の関連性

    梶川 ひとみ, 武部 克希, 松永 和秀, 鵜澤 成一

    頭頸部癌   47 ( 2 )   227 - 227   2021年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)日本頭頸部癌学会  

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  • 口腔扁平上皮癌における腫瘍浸潤様式と腫瘍免疫学的因子の関連性の検討

    梶川 ひとみ, 武部 克希, 松永 和秀, 鵜澤 成一, 和田 尚

    日本がん免疫学会総会プログラム・抄録集   25回   111 - 111   2021年5月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本がん免疫学会  

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  • 抗菌薬標的タンパク質の生化学 歯周病細菌叢の病原性を抑える試み

    佐藤 啓子, 納屋 昌実, 近藤 好夫, 武部 克希, 内藤 真理子, 鈴木 守, 今田 勝巳, 石川 岳志, 佐藤 主税

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   40 - 40   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 微生物の分子論(遺伝子・タンパク質・情報伝達・代謝・各種オミクス等) 結晶構造解析に基づく化膿レンサ球菌におけるヒアルロン酸分解酵素の分子機構解明

    東 孝太郎, 山口 雅也, 中田 匡宣, 武部 克希, 住友 倫子, 鈴木 守, 川端 重忠

    日本細菌学雑誌   76 ( 1 )   53 - 53   2021年2月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：日本細菌学会  

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  • 化膿レンサ球菌の不活性型ヒアルロン酸分解酵素の結晶構造解析と活性型変異体の構造予測

    東孝太郎, 山口雅也, 中田匡宣, 武部克希, 住友倫子, 鈴木守, 川端重忠

    Journal of Oral Biosciences Supplement (Web)   2021   2021年

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  • 口腔扁平上皮癌における腫瘍浸潤様式と活性化制御性T細胞の発現との関連性

    梶川ひとみ, 武部克希, 松永和秀, 鵜澤成一

    日本口腔腫瘍学会総会・学術大会プログラム・抄録集   39th   2021年

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  • COMTと阻害剤の相互作用における官能基の寄与のFMO法による評価

    白井智子, 山本亜美, 古石誉之, 米持悦生, 武部克希, 鵜澤成一, 飯島洋, 福澤薫

    構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM)   49th   2021年

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  • FMO法によるCOMTと阻害剤の相互作用におけるニトロ基の寄与の評価

    白井智子, 山本亜美, 古石誉之, 米持悦生, 武部克希, 飯島洋, 福澤薫

    日本薬学会関東支部大会講演要旨集(CD-ROM)   65th   2021年

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  • COMT/阻害剤複合体の結晶構造解析 脱ニトロカテコールタイプ阻害剤の分子設計

    天野 雅之, 武部 克希, 鈴木 守, 楠瀬 隆生, 松本 和樹, 茂庭 歩美, 小林 弘子, 齋藤 弘明, 高宮 知子, 丹羽 典朗, 飯島 洋

    日本薬学会年会要旨集   140年会   28K - pm05S   2020年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本薬学会  

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  • COMT/阻害剤複合体の結晶構造解析及び,量子化学計算による相互作用解析

    武部克希, 福澤薫, 鈴木守, 桑田(楠瀬)隆生, 鵜澤成一, 飯島洋

    構造活性相関シンポジウム講演要旨集(CD-ROM)   48th   2020年

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  • 9型分泌装置分泌タンパク質のImmunoglobulin-like domainsは細胞内構造安定性に関与する

    佐藤啓子, 角田真二, 武部克希, 鈴木守

    KEK Progress Report (Web)   ( 2019-7 )   2019年

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  • 化膿レンサ球菌におけるヒアルロン酸分解酵素の分子系統解析およびタンパク質構造解析

    東 孝太郎, 武部 克希, 山口 雅也, 住友 倫子, 中田 匡宣, 鈴木 守, 川端 重忠

    Journal of Oral Biosciences Supplement   2018   351 - 351   2018年9月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(一社)歯科基礎医学会  

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  • 化膿レンサ球菌におけるヒアルロン酸分解酵素の分子系統解析およびタンパク質構造解析

    東孝太郎, 武部克希, 山口雅也, 住友倫子, 中田匡宣, 鈴木守, 川端重忠

    Journal of Oral Biosciences Supplement (Web)   2018   2018年

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  • Streptococcus sanguinisが産生するSrtCのX線結晶構造

    武部克希, 中田匡宣, 川端重忠, 鈴木守

    日本結晶学会年会講演要旨集   2018   2018年

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  • ヤマブシタケ由来RNase He1のZn複合体のX線構造解析

    小林 弘子, 元吉 尚美, 板垣 正, 武部 克希, 寒川 剛, 鈴木 守

    日本薬学会年会要旨集   137年会 ( 3 )   129 - 129   2017年3月

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    記述言語：日本語   出版者・発行元：(公社)日本薬学会  

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  • 細胞接着因子Nectin-1/3ヘテロ複合体の立体構造解析

    寒川剛, 武部克希, 勝谷拓也, 鈴木守

    日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集   16th   2016年

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  • M3型化膿レンサ球菌が産生する線毛タンパク質FctA3の結晶構造解析

    寒川剛, 武部克希, 中田匡宣, 川端重忠, 鈴木守

    日本結晶学会年会講演要旨集   2016   2016年

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  • 細胞接着因子ネクチンのヘテロ複合体の結晶構造解析

    寒川剛, 武部克希, 勝谷拓也, 鈴木守

    日本結晶学会年会講演要旨集   2015   2015年

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講演・口頭発表等

  • 細菌性コラゲナーゼの基質ほぐし及び切断機構について

    武部 克希, 美間 健彦, 沖 大也, 河原 一樹, 松下 治

    第77回日本細菌学会中国・四国支部総会  2024年10月6日 

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    開催年月日： 2024年10月5日 - 2024年10月6日

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  • COMT(カテコール-O-メチル基転移酵素)阻害剤の複合体 X 線結晶構造解析 及び、FMO(Fragment molecular orbital)法を用いた活性中心における 相互作用評価 招待

    武部克希

    大阪大学歯学会 第 137 回例会 優秀研究奨励賞 受賞講演  2024年7月25日 

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    開催年月日： 2024年7月25日

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  • RNase T1ファミリーの新規触媒残基および、RNase活性と抗腫瘍活性の関係性

    武部 克希, 宮川 柊兵, 原 由美子, 鈴木 守, 板垣 正, 元吉 尚美, 福澤 薫, 岡元 邦彰, 小林 弘子

    第41回創薬・薬理フォーラム岡山 

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    開催年月日： 2024年7月20日

    記述言語：日本語  

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  • COMTの反応機構と賦活化物質による立体構造変化 招待

    武部 克希, 桑田-楠瀬 隆生, 鈴木 守, 飯島 洋

    日本薬学会第144回  2024年3月30日 

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    開催年月日： 2024年3月28日 - 2024年3月31日

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  • パノラマ X 線画像における下顎智歯-下歯槽管接触関係の自動判定深層学習モデル構築の試み

    武部克希, 西元彩乃, 桂(渕端)尚, 窪田星子, 今井智章, 鵜澤成一

    .第68回 日本口腔外科学会 総会  2023年11月10日 

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  • Streptococcus sanguinis が産生する線毛タンパク質のX線結晶構造解析

    武部 克希, 鈴木 守, 東 孝太郎, 山口 雅也, 住友 倫子, 川端 重忠, 中田 匡宣

    第65回歯科基礎医学会  2023年9月16日 

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  • ヤマブシタケ由来 RNase He1 改変体のX 線構造解析と抗腫瘍活性

    武部克希, 千田正, 森田祥弘, 西村遵也, 西元彩乃, 鵜澤成一, 小林弘子

    第77回 日本口腔科学会  2023年5月 

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  • Investigation of hydrogen bond network in the active center of catechol O-methyltransferase by X-ray crystallography and FMO method

    Katsuki Takebe, Tomoko Shirai, Yuma Handa, Kaori Fukuzawa, Mamoru Suzuki, Takao Kuwada-Kusunose, Tokomo Takamiya, Narikazu Uzawa, Hiroshi Iijima

    CBI学会2022年大会  2022年10月 

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  • パノラマ X 線画像における下顎智歯-下歯槽管接触関係の自動判定深層学習モデル構築の試み. 招待

    武部 克希, 今井 智章, 窪田 星子, 西元 彩乃, 鵜澤 成一

    第76回 日本口腔科学会  2022年4月 

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  • COMT（カテコールO-メチル基転移酵素）-新規阻害剤の複合体の構造解析: Opicaponeは基質（SAM）、生成物（SAH）とも安定な複合体を形成する

    武部克希, 桑田(楠瀬) 隆夫, 鈴木 守, 高宮 知子, 鵜澤 成一, 飯島 洋

    日本薬学会第142年会  2022年3月27日 

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  • パノラマX線画像における下顎智歯と下歯槽管接触の自動判定深層学習モデルの構築

    武部克希, 今井智章, 西元彩乃, 窪田星子, 鵜澤成一

    第33回日本口腔科学会近畿地方会  2021年12月6日 

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  • COMT/阻害剤複合体の結晶構造解析及び、量子化学計算による相互作用解析

    武部克希, 福澤薫, 鈴木守, 楠瀬隆生, 鵜澤成一, 飯島洋

    第48 回構造活性相関シンポジウム  2020年12月10日 

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受賞

  • 第46回 両備檉園記念財団 奨励賞

    2024年10月   両備檉園記念財団   サングイニスレンサ球菌の線毛連結機構を基にした薬剤開発

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  • 令和5年度 大阪大学歯学会 優秀研究奨励賞

    2024年7月   大阪大学 歯学会  

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  • 令和5年度 研究科長賞（最優秀賞）

    2024年3月   大阪大学  

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  • 第33回日本口腔科学会近畿地方部会 新人賞

    2022年4月   口腔科学会  

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  • 令和3年度 研究科長賞（奨励賞)

    2022年4月   大阪大学  

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共同研究・競争的資金等の研究

  • サングイニスレンサ球菌の線毛連結機構の解明及び、連結阻害に基づく感染制御の創薬

    研究課題/領域番号：24K23551  2024年07月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  研究活動スタート支援

    武部 克希

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    担当区分：研究代表者 

    配分額：2860000円 （ 直接経費：2200000円 、 間接経費：660000円 ）

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  • 歯周病細菌主要病原因子ジンジパインの宿主直接作用と必須新奇オペロンの解明

    研究課題/領域番号：24K02614  2024年04月 - 2028年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    大原 直也

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    配分額：18590000円 （ 直接経費：14300000円 、 間接経費：4290000円 ）

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  • 膜ダイナミクスをターゲットとしたがん骨転移ニッチモデルと病態制御機構の開発

    研究課題/領域番号：24K13239  2024年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    岡元 邦彰

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    配分額：4550000円 （ 直接経費：3500000円 、 間接経費：1050000円 ）

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  • 難治性癌の細胞外小胞によるマクロファージハイジャックと転移ニッチの解明

    研究課題/領域番号：23K28000  2023年04月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    江口 傑徳, 高橋 賢, 河合 穂高, 岡元 邦彰, 冨樫 庸介, 武部 克希

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    配分額：18720000円 （ 直接経費：14400000円 、 間接経費：4320000円 ）

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担当授業科目

  • 分子から生命体へ （2024年度） 第３学期  - 金5～6