2025/06/12 更新

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オオノ アユム
大野 歩
Ohno Ayumu
所属
医歯薬学域 助教(特任)
職名
助教(特任)
外部リンク

学位

  • 博士(医学) ( 2013年3月   東北大学 )

研究分野

  • ライフサイエンス / 分子生物学

  • ライフサイエンス / 細菌学

  • ライフサイエンス / ウイルス学

学歴

  • 東北大学大学院 医学系研究科 博士課程    

    2009年4月 - 2013年3月

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  • 金沢大学大学院 医学系研究科 修士課程    

    2007年4月 - 2009年3月

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  • 東海大学 開発工学部 生物工学科    

    2003年4月 - 2007年3月

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経歴

  • Collaborative Research Center of OKAYAMA University for Infectious Diseases in India at NICED

    2021年11月 - 現在

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  • 岡山大学   大学院医歯薬学総合研究科   助教(特任)

    2021年9月 - 現在

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  • 東海大学   医学部基礎医学系分子生命科学情報生物医学研究室   研究員

    2017年9月 - 2021年8月

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  • 富山大学   大学院医学薬学研究部'(医学)ウイルス学講座   研究員

    2017年4月 - 2017年7月

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  • 富山大学   大学院医学薬学研究部(医学)ウイルス学講座   助教

    2016年4月 - 2017年3月

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所属学協会

 

論文

  • Effect of chemical peeling therapy for treatment of cervical intraepithelial neoplasia on cervicovaginal microbiota. 国際誌

    Takeo Shibata, Ayumu Ohno, Isao Murakami, Masahiro Takakura, Toshiyuki Sasagawa, Tadashi Imanishi, Mikio Mikami

    Journal of applied microbiology   136 ( 5 )   2025年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    AIM: The cervicovaginal microbiome is associated with progression and regression of cervical intraepithelial neoplasia (CIN). Chemical peeling, an investigational treatment that shows promise as a non-invasive treatment for CIN, exfoliates the human papillomavirus (HPV)-infected cervical epithelium; subsequent alterations to the cervicovaginal microbiome may be a key mechanism of its effect. METHODS AND RESULTS: Using a retrospective paired-sample analysis, we investigated the cervicovaginal microbiota of 28 CIN patients, comparing pre- and post-treatment samples from the same individuals who achieved high-risk HPV clearance. We used 16S ribosomal RNA gene sequencing to detect microbial markers in liquid-based cytology solution from cervical scrapings. Enrichment of Lactobacillus hominis was significantly observed after chemical peeling by differential abundance analysis. Alterations in cervicovaginal bacteria after chemical peeling predicted multiple biochemical changes such as increased selenocompound and thiamine metabolism. CONCLUSIONS: Chemical peeling may modulate microbiota and bacteria-derived metabolites, thereby contributing to an additional therapeutic mechanism against CIN.

    DOI: 10.1093/jambio/lxaf080

    PubMed

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  • Identifying clustering of cholera cases using geospatial analysis in Kolkata and surrounding districts: data from patients at tertiary care referral hospitals. 国際誌

    Rounik Talukdar, Suman Kanungo, Kei Kitahara, Goutam Chowdhury, Debmalya Mitra, Asish Kumar Mukhopadhyay, Alok Kumar Deb, Pallavi Indwar, Biswanath Sharma Sarkar, Sandip Samanta, Basilua Andre Muzembo, Ayumu Ohno, Shin-Ichi Miyoshi, Shanta Dutta

    The Lancet regional health. Southeast Asia   31   100510 - 100510   2024年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: Cholera cases have increased globally across the Eastern Mediterranean, Africa, Southeast Asia, and parts of Europe since early 2024. This study aims to identify cholera hotspots and understand the spatial distribution of cholera in Kolkata and surrounding regions, a key cholera reservoir. Additionally, we examine sociodemographic factors and aspects related to water, sanitation, and hygiene (WASH). METHODS: Cholera clusters were detected using kernel density estimation and spatial autocorrelation through Global Moran's-I statistics, with local cluster patterns examined using Local Moran's-I statistics. Cholera cases from August 2021 to December 2023, treated at two tertiary care facilities in Kolkata: Infectious Diseases and Beleghata General Hospital and Dr. B C Roy Post Graduate Institute of Paediatric Sciences Hospital were included. Additionally, through a case-control study, 196 culture-confirmed cholera cases and 764 age/sex-matched neighborhood controls were enrolled, to investigate cholera risk factors. FINDINGS: Spatial analysis revealed a concentration of 196 cholera cases in Kolkata and its surrounding regions of Howrah, Hooghly, and North and South 24 Parganas. Hotspot analysis showed significant clustering in several Kolkata wards (31, 33, 56, 46, 57, 58, 59, 61, 66, 71, and 107), particularly in the northern, central, and east Kolkata wetlands areas (Global Moran's I statistic = 0.14, p < 0.001). These clusters had proximity between cases, with a median distance of 187.7 m, and 25.5% of cases as close as 73.9 m apart, suggesting localized transmission. Hotspots were identified with an average distance of 1600 m between them. Local Moran's I analysis found dense "high-high" clusters in these areas (p < 0.01), with a mean Moran's I index of 0.3, (range 0.1-4.6). The case-control study revealed that males were more likely to contract cholera, with an adjusted odds ratio of 2.4 (p < 0.01). There was no significant association found between cholera infection and sociodemographic factors or various WASH practices. INTERPRETATION: The findings emphasize the importance of targeted interventions, especially in identified hotspots, to mitigate cholera transmission. Addressing Socio-economic, and environmental factors especially improvement in WASH practices may further enhance prevention effects. FUNDING: The author KK, received funding from the program of the Japan Initiative for Global Research Network on Infectious Diseases, (grant id: JP23wm0125004), from the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology in Japan, and Japan Agency for Medical Research and Development.

    DOI: 10.1016/j.lansea.2024.100510

    PubMed

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  • Non-cholera Vibrio infections in Southeast Asia: A systematic review and meta-analysis 国際誌

    Basilua Andre Muzembo, Kei Kitahara, Chisato Hayashi, Sonoe Mashino, Junko Honda, Ayumu Ohno, Januka Khatiwada, Shanta Dutta, Shin-Ichi Miyoshi

    Journal of Infection and Public Health   17 ( 11 )   102564 - 102564   2024年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    We reviewed and analyzed the existing data on vibriosis in Southeast Asia to better understand its burden and prevalent causal agents. We searched PubMed, Web of Science, and EMBASE for studies published between January 2000 and April 2024. A random-effects meta-analysis was used to estimate the pooled isolation rate of non-cholera Vibrio species. Among the 1385 retrieved studies, 22 met the inclusion criteria for the systematic review and 11 were included in the meta-analysis. The pooled isolation rate of non-cholera Vibrio species among diarrheal patients was 5.0 %. Most species that caused vibriosis included V. parahaemolyticus, V. mimicus, V. vulnificus, non-O1/non-O139 V. cholerae, V. fluvialis, and V. alginolyticus. Pooled isolation rate of V. parahaemolyticus and non-O1 V. cholerae were 7.0, and 4.0, respectively. The prevalence of vibriosis in Southeast Asia is non-negligible. Public health strategies should prioritize enhanced surveillance, and clinicians should consider vibriosis in diarrheal patients with seafood consumption history.

    DOI: 10.1016/j.jiph.2024.102564

    PubMed

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  • Rapid diagnostic tests and loop-mediated isothermal amplification method for the detection of Shigella species: A systematic review and meta-analysis 国際誌

    Basilua Andre Muzembo, Kei Kitahara, Ayumu Ohno, Januka Khatiwada, Shanta Dutta, Shin-Ichi Miyoshi

    Journal of Infection and Public Health   17 ( 6 )   1065 - 1078   2024年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    We meta-analyzed the diagnostic accuracy of rapid diagnostic tests (dipsticks) and loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method to detect Shigella species. We searched MEDLINE, Embase, Web of Science and Google Scholar from inception to 2023 for studies reporting on the performance of Shigella dipstick and LAMP tests compared with culture or polymerase chain reaction (PCR). Our search identified 2618 studies, of which fourteen met the inclusion criteria for the systematic review. Ten studies covering 4056 tests (from twelve countries) were included in the meta-analysis. The overall pooled sensitivity and specificity were 98% (95% CI: 94-100) and 97% (95% CI: 92-99), respectively. Pooled sensitivity and specificity of dipsticks were 95% and 98%, respectively. In contrast, LAMP showed higher pooled sensitivity (100%) and diagnostic odds ratio (431752), but similar specificity (97%). LAMP and dipstick tests exhibited promising performance, suggesting that they could be useful for assisting in the diagnosis of shigellosis.

    DOI: 10.1016/j.jiph.2024.04.013

    PubMed

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  • Vibriosis in South Asia: a systematic review and meta-analysis. 国際誌

    Basilua Andre Muzembo, Kei Kitahara, Ayumu Ohno, Januka Khatiwada, Shanta Dutta, Shin-Ichi Miyoshi

    International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases   141   106955 - 106955   2024年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: South Asia remains home to foodborne diseases caused by Vibrio species. We aimed to compile and update information on the epidemiology of vibriosis in South Asia. METHODS: For this systematic review and meta-analysis, we searched PubMed, Web of Science, EMBASE, and Google Scholar for studies related to vibriosis in South Asia published up to May 2023. A random-effects meta-analysis was used to estimate the pooled isolation rate of non-cholera-causing Vibrio species. RESULTS: In total 38 studies were included. Seven of these were case reports and 22 were included in the meta-analysis. Reported vibriosis cases were caused by non-O1/non-O139 V. cholerae, V. parahaemolyticus, V. fluvialis, and V. vulnificus. The overall pooled isolation rate was 4.0% (95% CI: 3.0-5.0%) in patients with diarrhea. Heterogeneity was high (I2= 98.0%). The isolation rate of non-O1/non-O139 V. cholerae, V. parahaemolyticus, V. fluvialis were 9.0 (95% CI: 7.0-10.0%), 1.0 (95% CI: 1.0-2.0%), and 2.0 (95% CI: 1.0-3.0%), respectively. Regarding V. parahaemolyticus, O3:K6 was the most frequently isolated serotype. Cases peaked during summer. Several studies reported antibiotic-resistant strains and those harboring extended-spectrum beta-lactamases genes. CONCLUSIONS: This study demonstrates a high burden of infections caused by non-cholera-causing Vibrio species in South Asia.

    DOI: 10.1016/j.ijid.2024.01.022

    PubMed

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MISC

  • インドコルカタ市におけるヒト患者由来Shigella spp.の比較ゲノム解析

    森田大地, 加藤悠真, MUKHOPADHYAY Asish K, CHOWDHURY Goutam, 丸山史人, 山本佑樹, 田原栄俊, 熊谷孝則, 大野歩, 北原圭, 三好伸一, DUTTA Shanta, 黒田照夫

    日本薬学会年会要旨集(Web)   144th   2024年

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  • ゲノム配列解析による子宮頸がん再発モニタリングのためのリキッドバイオプシー

    今西規, 今西規, 今西規, 鈴木優, 大野歩, 大野歩, 池田仁惠, 矢坂美和, 三上幹男, 梶原博, 平林健一, 平林健一, 嶋田美穂, 田中克, 長井陽子

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   46th   2023年

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  • インド・コルカタ市,メタゲノム解析による下痢症原因菌の検出と感染経路の検討

    大野歩, 大野歩, MITRA Debmalya, CHOWDHURY Goutam, 北原圭, 北原圭, KANUNGO Suman, KOLEY Hemanta, DUTTA Shanta, MUKHOPADHYAY Asish, 三好伸一

    微生物シンポジウム講演要旨集   35th   2023年

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  • インド・コルカタ市における下痢症患者便を用いたメタゲノム解析

    大野歩, 大野歩, MITRA Debmalya, CHOWDHURY Goutam, 北原圭, 北原圭, KANUNGO Suman, KOLEY Hemanta, DUTTA Shanta, MUKHERJEE Asish, 三好伸一

    日本防菌防黴学会年次大会要旨集   50th   2023年

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  • インド・コルカタ市におけるCampylobacter症原因菌の全ゲノム解析

    森田大地, MUKHOPADHYAY Asish K, CHOWDHURY Goutam, 丸山史人, 神田美幸, 山本佑樹, 田原栄俊, 熊谷孝則, 大野歩, 北原圭, 三好伸一, DUTTA Shanta, 黒田照夫

    微生物シンポジウム講演要旨集   35th   2023年

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 次世代シークエンサーを用いた鼻腔内混合感染の実態調査および重症化リスクの検証

    研究課題/領域番号:20K17196  2020年04月 - 2022年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究  若手研究

    大野 歩

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    配分額:4160000円 ( 直接経費:3200000円 、 間接経費:960000円 )

    鼻腔は多くの呼吸器感染症の原因となる各種病原微生物が侵入・定着する場所である。そのことから、呼吸器感染症の予防および治療には鼻腔の細菌叢を効果的に制御することが重要であることがすでに報告されている。本研究では、2017年に開発された感染症診断用のポータブル型ゲノム解析システムを基盤とし、ナノポアDNAシークエンサーによる鼻腔内の細菌叢および呼吸器ウイルスを網羅的に検出可能な技術の開発を目的の一つとして挙げている。2021年度では課題2として設定した「呼吸器ウイルスの検出技術の確立」について、3種のRNAウイルス(RSウイルス、ライノウイルス、パラインフルエンザウイルス)を購入し、検討した。ゲノム抽出法および次世代シークエンサー解析用のライブラリ調製方法の検討の結果、網羅的に検出可能であることが示唆された。また検出効率の低いウイルスの存在が懸念されるものの、サンプル中のウイルスゲノムが少量であっても、PCR増幅せずに検出可能な方法であることが期待された。このことから、見出した方法を用いて呼吸器感染症患者から採取された鼻腔ぬぐい液18例からの細菌およびウイルスの検出を試みた。その結果、細菌検出では慢性副鼻腔炎との関連が報告されているPeptoniphilus lacydonensisが検出し、本研究の症例との関連性を検討している。また、ウイルス検出では、多数のウイルスが検出されたものの、残念ながら本研究の症例との関連性が疑われるウイルスは検出されなかった。今後は症例数を増やし検討を進める予定である。

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