2026/08/26 更新

写真a

ミムラ マキコ
三村 真紀子
MIMURA Makiko
所属
環境生命自然科学学域 教授
職名
教授
外部リンク

学位

  • Ph.D. ( University of British Columbia )

研究キーワード

  • 分子生態学

  • 進化生態学

研究分野

  • ライフサイエンス / 生態学、環境学

所属学協会

委員歴

  • 日本進化学会   編集委員会  

    2024年 - 現在   

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    団体区分:学協会

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  • 種生物学会   英文誌編集委員会  

    2022年 - 現在   

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    団体区分:学協会

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  • Society for the Study of Evolution   International Committee  

    2020年10月 - 現在   

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    団体区分:学協会

 

論文

  • Brain circadian clock neurons drive fitness advantages in Drosophila 査読

    Sae Aikawa, Shoichiro Tamura, Makiko Mimura, Taishi Yoshii

    iScience   29 ( 8 )   117125 - 117125   2026年8月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.isci.2026.117125

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  • Reticulate evolution, introgression, and recent diversification in Epimedium sect. Macroceras 査読

    Emi Kusatake, Momoka Konishi, Shuto Tomokuni, Yosuke Yanagi, Shungo Kariyama, Takehito Itoh, Atsushi Toyoda, Seung-Chul Kim, Makiko Mimura

    Molecular Phylogenetics and Evolution   223 ( 108646 )   2026年

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    担当区分:責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ympev.2026.108646

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  • Unexpected Occurrence of Triploids and Preliminary Assessment of Genetic Relationships Using SSR Markers in Rubus parvifolius on Amami Oshima and Kakeroma, Japan 査読

    Saki Toshima, Kodai Egashira, Makiko Mimura, Yuichi Saeki, Tomonari Hirano, Hisato Kunitake

    Plant Molecular Biology Reporter   44   56   2026年

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1007/s11105-026-01686-7

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    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s11105-026-01686-7

  • Direct and element-mediated edaphic effects shape resource-conservative leaf trait variation across serpentine and limestone soils 査読

    Shogo Ueyama, Emi Kusatake, Makiko Mimura

    Ecological Research   in press   2026年

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    担当区分:責任著者  

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  • Genomic Introgression in the Hybrid zones at the Margins of the Species' Range Between Ecologically Distinct Rubus Species 査読

    Makiko Mimura, Zhenxing Tang, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Tetsukazu Yahara

    Ecology and Evolution   14 ( 11 )   e70476   2024年11月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Wiley  

    ABSTRACT

    Populations in extreme environments at the margins of a species' range are often the most vulnerable to climate change, but they may also experience novel evolutionary processes, such as secondary contact and hybridization with their relatives. The range overlap resulting from secondary contact with related species that have adapted to different climatic zones may act as corridors for adaptive introgression. To test this hypothesis, we examined the hybrid zones along the altitude of two closely related Rubus species, one temperate and the other subtropical species, at their southern and northern limits on Yakushima Island, Japan. Genomic cline analysis revealed non‐neutral introgression throughout the genome in both directions in the two species. Some of these genomic regions involve gene ontology terms related to the regulation of several biological processes. Our niche modeling suggests that, assuming niche conservatism, the temperate species are likely to lose their suitable habitat, and the backcrossed hybrids with the subtropical species are already expanding upslope on the island. Adaptive introgression through the hybrid zone may contribute to the persistence and expansion of the species in the southernmost and northernmost populations.

    DOI: 10.1002/ece3.70476

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  • Genetic diversity in the traditional cultivars and wild ancestor of near-threatened Japanese iris (Iris ensata Thunb.) 査読

    Makiko Mimura, Marina Takeuchi, Takayuki Kobayashi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Hirofumi Yamaguchi, Toshihito Tabuchi

    Conservation Genetics   25 ( 5 )   1079 - 1086   2024年7月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Wild relatives of cultivars are crucial sources of genetic variation for further enhancement, yet they face potential threats due to contemporary environmental changes. Iris ensata var. spontanea, a wild progenitor of the Japanese iris cultivars (I. ensata var. ensata), is extensively cultivated in Japanese gardens, is distributed across mesic meadows and wetlands in Japan and East Asia. This species is currently threatened owing to habitat loss linked to land use alterations. We assessed genetic diversity and phylogenetic relationships in 32 wild accessions and the 14 principal Edo Group of Japanese iris cultivars, originally bred during the Edo period (1600–1868). In the phylogenetic tree, the cultivars formed a cluster with low inbreeding coefficients, suggesting a singular origin and interbreeding between the genetically distinct accessions. Conversely, wild accessions exhibited greater overall genetic diversity and higher inbreeding coefficients than cultivars, indicating frequent inbreeding within divergent natural populations. Our findings highlight the distinct genetic reservoirs of both wild accessions and Edo cultivars, although the former may face inbreeding challenges. Urgent conservation action is needed to ensure the genetic diversity of wild populations as natural resources.

    DOI: 10.1007/s10592-024-01625-7

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    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s10592-024-01625-7/fulltext.html

  • Plant characteristics drive ontogenetic changes in herbivory damage in a temperate forest 査読

    Hiroko Kurokawa, Michio Oguro, Sakino Takayanagi, Masahiro Aiba, Rei Shibata, Makiko Mimura, Hiroshi Yoshimaru, Tohru Nakashizuka

    Journal of Ecology   110 ( 11 )   2772 - 2784   2022年9月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Wiley  

    DOI: 10.1111/1365-2745.13990

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    その他リンク: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/1365-2745.13990

  • Phylogenetic inferences using nuclear ribosomal ITS and chloroplast sequences provide insights into the biogeographic origins, diversification timescales and trait evolution of Rubus in the Japanese Archipelago 査読

    Satoshi Kikuchi, Makiko Mimura, Naohiro Naruhashi, Suzuki Setsuko, Wajiro Suzuki

    Plant Systematics and Evolution   308 ( 3 )   20   2022年6月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media {LLC}  

    DOI: 10.1007/s00606-022-01810-6

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    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s00606-022-01810-6/fulltext.html

  • Phylogenetic signal in the topographic niche of trees: Current and historical significance of habitat structure on the species arrangement pattern within East Asian rugged forests 査読

    Ryo Kitagawa, Makiko Mimura, Akira S. Mori, Akiko Sakai

    Ecological Research   35 ( 4 )   613 - 624   2020年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/1440-1703.12110

    Web of Science

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    その他リンク: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full-xml/10.1111/1440-1703.12110

  • Ambiguous species boundaries: Hybridization and morphological variation in two closely relatedRubusspecies along altitudinal gradients 査読

    Makiko Mimura, Mihoko Suga

    Ecology and Evolution   10 ( 14 )   7476 - 7486   2020年7月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/ece3.6473

    Web of Science

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  • 進化を考慮した保全生態学の確立と生態系管理に向けて 査読

    門脇 浩明, 山道 真人, 深野 祐也, 石塚 航, 三村 真紀子, 西廣 淳, 横溝 裕行, 内海 俊介

    保全生態学研究   25 ( 2 )   1933 - 234   2020年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    CiNii Article

    CiNii Books

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  • Phylogeny and trait variation of Japanese Rubus subgenus Ideaobatus 査読

    Okada, A, Kikuchi, S, Hoshino, Y, Kunitake, H, Mimura, M

    Scientia Horticulturae   264   109150   2020年

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.scienta.2019.109150

    Web of Science

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  • Understanding and monitoring the consequences of human impacts on intraspecific variation 査読

    Makiko Mimura, Tetsukazu Yahara, Daniel P. Faith, Ella Vazquez-Dominguez, Robert I. Colautti, Hitoshi Araki, Firouzeh Javadi, Juan Nunez-Farfan, Akira S. Mori, Shiliang Zhou, Peter M. Hollingsworth, Linda E. Neaves, Yuya Fukano, Gideon F. Smith, Yo-Ichiro Sato, Hidenori Tachida, Andrew P. Hendry

    Evolutionary Applications   10 ( 2 )   121 - 139   2017年2月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語  

    DOI: 10.1111/eva.12436

    Web of Science

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  • Historical Relationships Among Wild Boar Populations of the Ryukyu Archipelago and Other Eurasian regions, as Inferred from Mitochondrial Cytochrome b Gene Sequences 査読

    Saka Yoshikawa, Makiko Mimura, Shin Watanabe, Liang-Kong Lin, Hidetoshi Ota, Yasushi Mizoguchi

    Zoological Science   33 ( 5 )   520 - 526   2016年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.2108/zs160025

    Web of Science

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  • キイチゴたちが屋久島で出会うとき:気候変動と遺伝的交流

    三村 真紀子

    屋久島学   2   97 - 99   2015年11月

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    記述言語:日本語  

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  • Topographic patterns in the phylogenetic structure of temperate forests on steep mountainous terrain 査読

    Ryo Kitagawa, Makiko Mimura, Akira S. Mori, Akiko Sakai

    AOB PLANTS   7   2015年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/aobpla/plv134

    Web of Science

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  • Asymmetric gene flow and the distribution of genetic diversity in morphologically distinct Abies mariesii populations in contrasting eco-habitats 査読

    Shenhua Qian, Waka Saito, Makiko Mimura, Shingo Kaneko, Yuji Isagi, Eri Mizumachi, Akira S. Mori

    PLANT ECOLOGY   215 ( 12 )   1385 - 1397   2014年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11258-014-0395-y

    Web of Science

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  • Range shift and introgression of the rear and leading populations in two ecologically distinct Rubus species 査読

    Makiko Mimura, Misako Mishima, Martin Lascoux, Tetsukazu Yahara

    BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY   14   209   2014年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1186/s12862-014-0209-9

    Web of Science

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  • A multi-year assessment of the environmental impact of transgenic Eucalyptus trees harboring a bacterial choline oxidase gene on biomass, precinct vegetation and the microbial community 査読

    Taichi Oguchi, Yuko Kashimura, Makiko Mimura, Xiang Yu, Etsuko Matsunaga, Kazuya Nanto, Teruhisa Shimada, Akira Kikuchi, Kazuo N. Watanabe

    TRANSGENIC RESEARCH   23 ( 5 )   767 - 777   2014年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11248-014-9809-9

    Web of Science

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  • Biodiversity only makes sense in the light of evolution 査読

    R. Geeta, Lucia G. Lohmann, Susana Magallon, Daniel P. Faith, Andrew Hendry, Keith Crandall, Luc de Meester, Campbell O. Webb, Anne-Helene Prieur-Richard, Makiko Mimura, Elena Conti, Joel Cracraft, Felix Forest, Carlos Jaramillo, Michael Donoghue, Tetsukazu Yahara

    JOURNAL OF BIOSCIENCES   39 ( 3 )   333 - 337   2014年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s12038-014-9427-y

    Web of Science

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  • Standing variation boosted by multiple sources of introduction contributes to the success of the introduced species, Lotus corniculatus 査読

    M. Mimura, K. Ono, K. Goka, T. Hara

    BIOLOGICAL INVASIONS   15 ( 12 )   2743 - 2754   2013年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s10530-013-0488-x

    Web of Science

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  • Global legume diversity assessment: Concepts, key indicators, and strategies 査読

    Tetsukazu Yahara, Firouzeh Javadi, Yusuke Onoda, Luciano Paganucci de Queiroz, Daniel P. Faith, Darien E. Prado, Munemitsu Akasaka, Taku Kadoya, Fumiko Ishihama, Stuart Davies, J. W. Ferry Slik, Tingshuang Yi, Keping Ma, Chen Bin, Dedy Darnaedi, R. Toby Pennington, Midori Tuda, Masakazu Shimada, Motomi Ito, Ashley N. Egan, Sven Buerki, Niels Raes, Tadashi Kajita, Mohammad Vatanparast, Makiko Mimura, Hidenori Tachida, Yoh Iwasa, Gideon F. Smith, Janine E. Victor, Tandiwe Nkonki

    TAXON   62 ( 2 )   249 - 266   2013年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

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  • Colonization of vegetation-rich moraines and inference of multiple sources of colonization in the High Arctic for Salix arctica 査読

    Makiko Mimura, Akira S. Mori, Masaki Uchida, Hiroshi Kanda

    CONSERVATION GENETICS   14 ( 1 )   223 - 229   2013年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s10592-012-0413-3

    Web of Science

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  • Genetic and phenotypic variation in Lotus japonicus (Regel) K. Larsen, a model legume species 査読

    Makiko Mimura

    Canadian Journal of Plant Science   93 ( 3 )   435 - 444   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.4141/CJPS2012-097

    Scopus

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  • Local adaptation at the range peripheries of Sitka spruce 査読

    M. Mimura, S. N. Aitken

    JOURNAL OF EVOLUTIONARY BIOLOGY   23 ( 2 )   249 - 258   2010年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1420-9101.2009.01910.x

    Web of Science

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  • 我々は「生態リスク」とどう向き合うのか?

    森章, 三村真紀子, 黒川紘子

    日本生態学会誌   60 ( 3 )   323 - 325   2010年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • 分布域のダイナミクス--シトカトウヒの分布拡大と局所適応 招待 査読

    三村真紀子

    林木の育種   236 ( 236 )   1 - 6   2010年

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(大学,研究機関等紀要)   出版者・発行元:林木育種協会  

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  • Mycorrhizal colonization of transgenic Eucalyptus camaldulensis carrying the mangrin gene for salt tolerance 査読

    Kipkorir E. Lelmen, Xiang Yu, Akira Kikuchi, Takayoshi Shimazaki, Makiko Mimura, Kazuo N. Watanabe

    PLANT BIOTECHNOLOGY   27 ( 4 )   339 - 344   2010年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.5511/plantbiotechnology.27.339

    Web of Science

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  • Comparison of contemporary mating patterns in continuous and fragmented Eucalyptus globulus native forests 査読

    Makiko Mimura, Robert C. Barbour, Brad M. Potts, Rene E. Vaillancourt, Kazuo N. Watanabe

    MOLECULAR ECOLOGY   18 ( 20 )   4180 - 4192   2009年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1365-294X.2009.04350.x

    Web of Science

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  • Genetic variation of chloroplast DNA in Zingiberaceae taxa from Myanmar assessed by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis 査読

    D. Ahmad, A. Kikuchi, S. A. Jatoi, M. Mimura, K. N. Watanabe

    ANNALS OF APPLIED BIOLOGY   155 ( 1 )   91 - 101   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1744-7348.2009.00322.x

    Web of Science

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  • Relationships of Zingiber species, and genetic variability assessment in ginger (Zingiber officinale) accessions from ex-situ genebank, on-farm and rural markets 査読

    Shakeel Ahmad Jatoi, Akira Kikuchi, Makiko Mimura, San-San-Yi, Kazuo N. Watanabe

    BREEDING SCIENCE   58 ( 3 )   261 - 270   2008年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1270/jsbbs.58.261

    Web of Science

    CiNii Article

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  • Impact of Environmental Stress-Tolerant Transgenic Potato on Genotypic Diversity of Microbial Communities and Soil Enzyme Activities under Stress Conditions 査読

    Makiko Mimura, Kipkorir E. Lelmen, Takayoshi Shimazako, Akira Kikucho, Kazuo N. Watanabe

    MICROBES AND ENVIRONMENTS   23 ( 3 )   221 - 228   2008年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1264/jsme2.23.221

    Web of Science

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  • Adaptive gradients and isolation-by-distance with postglacial migration in Picea sitchensis 査読

    M. Mimura, S. N. Aitken

    HEREDITY   99 ( 2 )   224 - 232   2007年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/sj.hdy.6800987

    Web of Science

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  • Increased selfing and decreased effective pollen donor number in peripheral relative to central populations in Picea sitchensis (Pinaceae) 査読

    Makiko Mimura, Sally N. Aitken

    AMERICAN JOURNAL OF BOTANY   94 ( 6 )   991 - 998   2007年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3732/ajb.94.6.991

    Web of Science

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  • SSR diversity of vegetable soybean [Glycine max (L.) merr.] 査読

    Makiko Mimura, Clarice J. Coyne, Marie W. Bambuck, Thomas A. Lumpkin

    GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION   54 ( 3 )   497 - 508   2007年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s10722-006-0006-4

    Web of Science

    CiNii Article

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  • RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia 査読

    M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi

    GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION   47 ( 6 )   603 - 610   2000年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1023/A:1026584824584

    Web of Science

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書籍等出版物

  • 種分化の生物学 : 生物多様性を生み出す進化のしくみ

    種生物学会, 阪口, 翔太, 村中, 智明, 川北, 篤( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 第8章 分布域の限界でおこる浸透性交雑)

    文一総合出版  2025年9月  ( ISBN:9784829962138

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    総ページ数:viii, 287p   記述言語:日本語 著書種別:学術書

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  • 栽培植物の自然史II

    三村 真紀子( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 栽培アズキの成立と伝播)

    北海道大学出版会  2013年9月 

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  • 雑草学事典 WEB版

    日本雑草学会( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 自己間引き、自然選択、ギャップ、寒さの指数、暖かさの指数(三村真紀子))

    日本雑草学会雑草学事典編集委員会編集  2012年 

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  • エコシステムマネジメント ―包括的な生態系の保全と管理へ―

    森 章( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Box 13-1 気候変動下での生物多様性保全のための「代替戦略」(森 章・三村 真紀子))

    共立出版  2012年 

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MISC

  • 種内変異と環境変動,そのモニタリング

    三村真紀子, 矢原徹一

    日本生態学会大会講演要旨(Web)   65th   ROMBUNNO.S01‐2 (WEB ONLY)   2018年

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    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

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  • RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 47, pg 603, 2014)

    Makiko Mimura, Kentaro Yasuda, Hirofumi Yamaguchi

    GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION   61 ( 5 )   1033 - 1034   2014年6月

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  • RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 48, pg 189, 2001)

    M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi

    GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION   48 ( 3 )   319 - 319   2001年6月

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    記述言語:英語  

    Web of Science

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  • RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 47, pg 603, 2000)

    M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi

    GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION   48 ( 1 )   107 - 107   2001年2月

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    記述言語:英語  

    Web of Science

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講演・口頭発表等

  • ノハナショウブ野生系統と江戸系ハナショウブ園芸品種の遺伝的構造とその多様性

    三村真紀子・小林孝至・竹内鞠奈・廣田峻・陶山佳久・知野奈苗・田淵俊人

    照葉樹林文化研究会  2021年12月5日 

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    開催年月日: 2021年12月5日

受賞

  • ポスター発表 最優秀賞(生物多様性分野)

    2024年3月   第71回日本生態学会大会(横浜)   四国に多様化するイカリソウ属のニッチ分化

    小西 桃花, 草竹 恵実, 三村 真紀子

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共同研究・競争的資金等の研究

  • 同倍数性交雑は連続的な種分化を駆動するか

    研究課題/領域番号:24K09619  2024年04月 - 2028年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    三村 真紀子

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    配分額:4680000円 ( 直接経費:3600000円 、 間接経費:1080000円 )

    雑種の倍数化を伴わない同倍数性交雑種分化は、親種との生殖隔離が成立しにくいと考えられてきたため、生物多様性における重要性が今でも議論されている。しかし、申請者の研究から、急速な分化を示す種群において、新規ニッチを獲得した交雑起源種からさらに新規のニッチを獲得する集団が発生するという連続したニッチ進化が示唆された。当該年度は、イカリソウ属を沖縄を除く全国から収集し、ゲノム系統樹を精度高く構築することができた。その結果、イカリソウ属は大陸と共有する近縁種が九州地方に上陸し、交雑しながら国内で種分化を遂げたことが示唆された。さらに来年度に予定していた環境ストレス実験(耐塩性)を実施し、耐塩性を獲得した系統は葉にナトリウムを蓄積しないのに対し、その同種亜種では、葉に多くのナトリウムを蓄積し障害を受けることを明らかにした。こうした生理的形質の違いが耐塩性の獲得に寄与したと考えられる。トランスクリプトームの予備的解析を行い、浸透圧調整に関わる遺伝子群を検出した。また、イカリソウ属は沿岸部だけでなく蛇紋岩といった特殊な土壌にも生育する。これらの土壌ではニッケルやマグネシウムなどが多く検出され、この土壌に分布する種では土壌に適応するなんらかの仕組みをもつことが示唆された。蛇紋岩・石灰岩に生育する系統について葉の形質に基づく戦略解析(CSR解析)では蛇紋岩に生育する系統でよりストレス応答的な、石灰岩に生息する系統でより撹乱依存的な葉形質をもつことがあきらかとなった。イカリソウ属の多様化に寄与した進化的背景についてさらに解析を進めていく。

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  • 森林生態系機能における種内多様性の生態学的意義の検証

    2021年11月 - 2022年11月

    住友財団  環境研究助成 

    三村真紀子

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    担当区分:研究代表者 

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  • 倍数化を伴わない交雑種分化による生殖隔離と多様化の検証

    研究課題/領域番号:21K06334  2021年04月 - 2024年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    三村 真紀子

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    配分額:4030000円 ( 直接経費:3100000円 、 間接経費:930000円 )

    倍数化を伴わない交雑種分化(Homoploid Hybrid Speciation)は、親種との生殖隔離が成立しにくいと考えられてきたため、種分化における重要性が今でも議論されている。しかし、同じ倍数体でも、新規の表現型による生態学的隔離やそれによって形成される地理的隔離に加え、遺伝的不和合による内因的隔離など様々なフェーズで雑種と親種との間に生殖隔離は成立しうる。交雑は集団内に膨大な多様性を作り出し、迅速な適応進化をも可能にする。本研究では、西日本で多様化しているイカリソウ属を用いて、倍数化を伴わない交雑種分化における生殖隔離機構を明らかにするとともに、交雑種からさらなる分化が引き起こされる種分化プロセスを明らかにすることを目的としている。
    本年度は、サンプルの収集、標本データベースの整理、形態的特性、分布域の気象情報、種子発芽要求性、種間交配親和性検証のための交配実験、NGSによる分子系統樹の作成を行った。分子系統樹からは、雑種起源とされる種が推定親種とは独立した単系統を示した。ただし、ネットワーク解析では、推定親種と多型の共有が高く、雑種起源説を支持した。形態的多様性の検証では、葉茎の形態において種を代表するタイプがあるものの、種内多型は高かった。交雑起源種とされるものには特に高い種内多型がみられた。イカリソウ属は属の分岐そのものも比較的若く、種分化プロセスにおいて形質的な固定がされていないことが明らかとなった。しかし、分子系統樹ではいずれの種も単系統を示す傾向にあり、なんらかの生殖隔離機構が作用していることが明らかとなった。種子発芽特性についても、分布域の年間平均気温に応じた低温要求性を示す傾向にあり、種分化に伴う生態学的分化と交雑の関わりについてさらに検証を進めていく。

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  • 気候変動に対する適応的応答プロセスの遺伝的基盤の解明

    2020年10月 - 2021年09月

    日本生命財団  若手研究・奨励研究助成 

    三村真紀子

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    担当区分:研究代表者 

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  • 希少種を含むイカリソウ属の系統分類学的研究

    2020年 - 2021年03月

    八雲環境科学振興財団  環境研究助成 

    三村真紀子

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    担当区分:研究代表者 

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  • 西日本に多様に分化するイカリソウ属における種分化の維持機構に関する研究

    2019年10月 - 2020年10月

    両備檉園記念財団  生物学研究奨励賞 

    三村真紀子

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    担当区分:研究代表者 

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  • 近縁な種間でみられる収斂進化の遺伝的基盤

    研究課題/領域番号:17K07571  2017年04月 - 2021年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(C)  基盤研究(C)

    三村 真紀子

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    配分額:4940000円 ( 直接経費:3800000円 、 間接経費:1140000円 )

    本研究の目的である多様に分化したバラ科キイチゴ属の種分化と気候適応に関する収斂進化に関するメカニズムを明らかにするために、試料株の採集、系統関係の検証、ゲノム系統解析を行った。国内に自生するキイチコゴ属Idaeobatus亜属に属する22種(全て2倍体)を収集し、他の亜属を含む系統樹を作成したところ、Idaeobatus亜属は多系統であり、うち1つの系統グループはバライチゴやモミジイチゴなど国内種15種を含む最大のグループであることがわかった。また、Idaeobatus亜属は主に冷温帯に分布するが、国内のIdaeobatus亜属には、温暖な気候に分布する種も多く、亜熱帯気候への進出を遂げたオオバライチゴとリュウキュウイチゴは、それぞれ異なる温帯性のサブクレードから派生したことがわかった。この結果をもとに、異なる気候に分布する近縁な計8種14系統を選定し、ゲノムシーケンスを行った。外群として、系統グループの異なるナワシロイチゴの北海道系統および沖縄系統の計2系統を用いた。計885M readsを取得し、クオリティコントロールを行った。現在、リファレンスとして、モミジイチゴおよびヨーロッパキイチゴのゲノム情報を利用し、ゲノム系統解析から過去の種間交雑の影響を踏まえた種分化プロセスを検証している。また、交配実験による種間交配親和性の検証では、異なる系統グループに属する種間であってもある程度結実することがわかった。しかし、亜熱帯性キイチゴを含む国内キイチゴ属を対象にした交配実験では、同じサブクレードに属する種間では容易に交配するが、異なるサブクレード間では、交配親和性が著しく低いことが示唆された。

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  • 迅速な適応を可能にする遺伝子変異の由来の判定

    研究課題/領域番号:25840161  2013年04月 - 2016年03月

    日本学術振興会  科学研究費補助金、若手研究(B)  若手研究(B)

    三村 真紀子

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    本研究では、東北から屋久島(南九州)まで分布し、すでにドラフトゲノムが決定しているモミジイチゴを対象として、ゲノム変異解析と相互移植実験から分布域の維持に貢献する遺伝的変異の由来を検証した。相互移植実験では、明瞭な形態的・形質的な地域間変異が検出されている。また、RADseqによるゲノムワイド変異解析では、初期解析において複数の適応関連候補SNPsが検出された。形質的には同地域間で類似しているものの、選択下にあると推定されたSNPsは同一地域内集団間で異なるものもあり、環境へ対する類似の形質変化への既存の遺伝的変異の寄与が示唆された。今後、形質との関連を精査する。

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  • 温帯性および亜熱帯性植物の適応分化と遺伝子流動に関する研究

    2013年04月 - 2014年03月

    基礎生物学研究所  自然科学研究機構基礎生物学研究所共同利用研究 

    三村 真紀子

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

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  • 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学(分担)

    研究課題/領域番号:24247005  2012年04月 - 2015年03月

    日本学術振興会  科学研究費補助金、基盤研究(A)  基盤研究(A)

    矢原 徹一

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    資金種別:競争的資金

    対照的な適応戦略を持つ姉妹種の間で、どのような遺伝的変化が生じているかを、次世代シークエンサーを活用して解析した。キスゲ属の姉妹種(アゲハチョウ媒の昼咲き赤花種ハマカンゾウとススメガ媒の夜咲き黄花種キスゲ)では、赤い色素であるアントシアニンの量と発現量が相関する遺伝子群を同定した。これらのうち、調節遺伝子の変化によって赤花から黄花への進化が起きたことが支持された。キイチゴ属の姉妹種(落葉性・温帯性のヤクシマキイチゴと常緑性・暖帯性のリュウキュウイチゴ)では、赤色光受容体の抑制遺伝子が2種間で大きく分化していることが判明し、光受容体の抑制が落葉性・温帯性の違いに関与していることが示唆された。

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  • 東アジア原産観賞植物の栽培化と野生化に関する保全生物学的研究 (分担)

    研究課題/領域番号:23310168  2011年04月 - 2014年03月

    日本学術振興会  科学研究費補助金、基盤研究(B)  基盤研究(B)

    山口 裕文

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    資金種別:競争的資金

    東アジア原産観賞植物のうち日本の民家庭園で普通に使用されている182種を抽出し、園芸化症候と生態的特徴を一覧化し、野生化や自然交雑等の生態系リスクをまとめた。原産種の半栽培、野生化品の奨励雑草的活用、栽培品種の自然の場への移植や観賞利用を目的とした移動地での野生化等の実態を記述し、東洋花文化センター構成種の分布拡大をまとめた。古典園芸植物を含む数種をモデルとして野生祖先種の遺伝的多様性を評価し、移動個体を認識するための基盤情報を得た。招待講演での討論と併せて観賞植物の生態系リスクを考察し、農作物の栽培化と野生化を対比しつつ、観賞植物の栽培化に関する要因を整理し、保全のあり方を考察した。

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  • 異なる環境に適応分化する2種間の遺伝子浸透とニッチ変化過程の解明

    研究課題/領域番号:22770021  2010年04月 - 2013年03月

    日本学術振興会  科学研究費補助金、若手研究(B)  若手研究(B)

    三村 真紀子

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    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    異所的種分化によって異なる環境に適応した 2 種が、気候変動によってその分布を変化させるとき、分布域末端の集団は、環境の変化や他種との交雑など進化的なダイナミクスを経験すると考えられる。本研究では、
    (1) 亜熱帯および温帯にそれぞれ生育する系統的に非常に近縁なキイチゴ 2 種の過去の分布変遷、
    (2) 他種との接触による交雑の開始と適応的な浸透交雑について検証した。まず標本データと気象データに基づいた種の分布域予測、および西日本計 9 集団におけるコアレセンス解析から過去の気候変動に対する分布域変遷を検証した。その結果から、亜熱帯性キイチゴは最終氷期以後に分布を北上させ現在の南限である屋久島に到達した一方、温帯性キイチゴは、分布が隔離されながら、現分布域の南限である屋久島集団を最終氷期以前から保っていたことが推測された。さらに現在の分布が交わる屋久島では2種間の遺伝子流動が検出された。気候変動による分布域変遷が、近縁種の分布域の接触と交雑を促したと考えられる。さらに詳細に屋久島内の集団を解析したところ、標高帯に沿った連続的な交雑帯が形成され浸透交雑が起こっていることが分かった。交雑帯において、幾つかの遺伝子は中立的に予測されるよりも早いスピードで亜熱帯種から温帯種に浸透していることが示唆された。

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担当授業科目

  • 植物進化生態学特別演習 (2025年度) その他  - その他

  • 植物進化生態学特別演習 (2025年度) 通年  - その他

  • 生態学 (2025年度) 3・4学期  - 水3~4

  • 生態学Ⅰ (2025年度) 第3学期  - 水3~4

  • 生態学Ⅱ (2025年度) 第4学期  - 水3~4

  • 生態遺伝学 (2025年度) 前期  - 火1~2

  • 細胞生物学IIIA (2025年度) 第3学期  - 水3~4

  • 細胞生物学IIIB (2025年度) 第4学期  - 水3~4

  • 自然系博物館実習 (2025年度) 特別  - その他

  • 進化生態学 (2025年度) 前期  - その他

  • 進化生態学演習 (2025年度) その他  - その他

  • 進化生態学演習 (2025年度) 通年  - その他

  • 遺伝学IIB (2025年度) 第2学期  - 木3~4

  • (L20)Ecological Genetics (2025年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学B2 (2024年度) 第4学期  - 水3~4

  • 植物進化生態学特別演習 (2024年度) 通年  - その他

  • 生態学 (2024年度) 3・4学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅰ (2024年度) 第3学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅱ (2024年度) 第4学期  - 火3~4

  • 生態遺伝学 (2024年度) 前期  - 火1~2

  • 細胞生物学IIIA (2024年度) 第3学期  - 火3~4

  • 細胞生物学IIIB (2024年度) 第4学期  - 火3~4

  • 進化生態学 (2024年度) 前期  - その他

  • 進化生態学演習 (2024年度) その他  - その他

  • 進化生態学演習 (2024年度) 通年  - その他

  • 遺伝学IIB (2024年度) 第2学期  - 木3~4

  • (L20)Ecological Genetics (2024年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学実験 (2023年度) 夏季集中  - その他

  • 基礎生物学実験 (2023年度) 夏季集中  - その他

  • 基礎生物学B2 (2023年度) 第4学期  - 水3~4

  • 植物進化生態学演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 植物進化生態学特別演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 生態学 (2023年度) 3・4学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅰ (2023年度) 第3学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅱ (2023年度) 第4学期  - 火3~4

  • 生態遺伝学 (2023年度) 前期  - 火1~2

  • 生態遺伝学 (2023年度) 前期  - 火1~2

  • 細胞生物学IIIA (2023年度) 第3学期  - 火3~4

  • 細胞生物学IIIB (2023年度) 第4学期  - 火3~4

  • 進化生態学 (2023年度) 前期  - その他

  • 進化生態学 (2023年度) 後期  - その他

  • 進化生態学演習 (2023年度) その他  - その他

  • 遺伝学IIB (2023年度) 第2学期  - 木3~4

  • (L20)Ecological Genetics (2023年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学B2 (2022年度) 第4学期  - 水3~4

  • 植物進化生態学演習 (2022年度) 通年  - その他

  • 生態学 (2022年度) 3・4学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅰ (2022年度) 第3学期  - 火3~4

  • 生態学Ⅱ (2022年度) 第4学期  - 火3~4

  • 生態遺伝学 (2022年度) 前期  - 火1~2

  • 細胞生物学IIIA (2022年度) 第3学期  - 火3~4

  • 細胞生物学IIIB (2022年度) 第4学期  - 火3~4

  • 進化生態学 (2022年度) 後期  - その他

  • 遺伝学IIB (2022年度) 第2学期  - 木3~4

  • 基礎生物学B (2021年度) 3・4学期  - 水3,水4

  • 基礎生物学B2 (2021年度) 第4学期  - 水3,水4

  • 植物進化生態学演習 (2021年度) 通年  - その他

  • 生態遺伝学 (2021年度) 前期  - 火1,火2

  • 細胞生物学III (2021年度) 3・4学期  - 火3,火4

  • 細胞生物学IIIA (2021年度) 第3学期  - 火3,火4

  • 細胞生物学IIIB (2021年度) 第4学期  - 火3,火4

  • 自然系博物館実習 (2021年度) 特別

  • 進化生態学 (2021年度) 後期  - その他

  • 遺伝学II (2021年度) 1・2学期  - 木3,木4

  • 遺伝学IIB (2021年度) 第2学期  - 木3,木4

  • 基礎生物学実験 (2020年度) 夏季集中  - その他

  • 基礎生物学実験 (2020年度) 夏季集中  - その他

  • 基礎生物学B (2020年度) 3・4学期  - 水3,水4

  • 基礎生物学B2 (2020年度) 第4学期  - 水3,水4

  • 植物進化生態学演習 (2020年度) 通年  - その他

  • 生態遺伝学 (2020年度) 前期  - 火1,火2

  • 細胞生物学III (2020年度) 3・4学期  - 火3,火4

  • 細胞生物学IIIA (2020年度) 第3学期  - 火3,火4

  • 細胞生物学IIIB (2020年度) 第4学期  - 火3,火4

  • 進化生態学 (2020年度) 特別  - その他

  • 遺伝学II (2020年度) 1・2学期  - 木3,木4

  • 遺伝学IIB (2020年度) 第2学期  - 木3,木4

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