Organization
Faculty of Environmental, Life, Natural Science and Technology Professor
Position
Professor
External link
MIMURA Makiko
Degree
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Ph.D. ( University of British Columbia )
Research Interests
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分子生態学
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進化生態学
Research Areas
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Life Science / Ecology and environment
Professional Memberships
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THE JAPANESE FORESTRY SOCIETY
2019
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日本進化学会
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ECOLOGICAL SOCIETY OF JAPAN
Committee Memberships
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Society of Evolutionary Studies, Japan News Letter editors
2024
Committee type：Academic society
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The Society for the Study of Species Biology Plant Species Biology Editorial Board
2022
Committee type：Academic society
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Society for the Study of Evolution International Committee
2020.10
Committee type：Academic society
Papers
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Makiko Mimura, Zhenxing Tang, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Tetsukazu Yahara
Ecology and Evolution 14 ( 11 ) e70476 2024.11
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Makiko Mimura, Marina Takeuchi, Takayuki Kobayashi, Shun K. Hirota, Yoshihisa Suyama, Hirofumi Yamaguchi, Toshihito Tabuchi
Conservation Genetics 25 ( 5 ) 1079 - 1086 2024.7
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Plant characteristics drive ontogenetic changes in herbivory damage in a temperate forest Reviewed
Hiroko Kurokawa, Michio Oguro, Sakino Takayanagi, Masahiro Aiba, Rei Shibata, Makiko Mimura, Hiroshi Yoshimaru, Tohru Nakashizuka
Journal of Ecology 110 ( 11 ) 2772 - 2784 2022.9
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Satoshi Kikuchi, Makiko Mimura, Naohiro Naruhashi, Suzuki Setsuko, Wajiro Suzuki
Plant Systematics and Evolution 308 ( 3 ) 20 2022.6
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Ryo Kitagawa, Makiko Mimura, Akira S. Mori, Akiko Sakai
Ecological Research 35 ( 4 ) 613 - 624 2020.7
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Ambiguous species boundaries: Hybridization and morphological variation in two closely relatedRubusspecies along altitudinal gradients Reviewed
Makiko Mimura, Mihoko Suga
Ecology and Evolution 10 ( 14 ) 7476 - 7486 2020.7
-
An evolutionary approach to conservation ecology and ecosystem management Reviewed
Kohmei Kadowaki, Masato Yamamichi, Yuya Fukano, Wataru Ishizuka, Makiko Mimura, Jun Nishihiro, Hiroyuki Yokomizo, Shunsuke Utsumi
Japanese Journal of Conservation Ecology 25 ( 2 ) 1933 - 234 2020
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Phylogeny and trait variation of Japanese Rubus subgenus Ideaobatus Reviewed
Ayana Okada, Satoshi Kikuchi, Yoichiro Hoshino, Hisato Kunitake, Makiko Mimura
SCIENTIA HORTICULTURAE 264 109150 2020
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Understanding and monitoring the consequences of human impacts on intraspecific variation Reviewed
Makiko Mimura, Tetsukazu Yahara, Daniel P. Faith, Ella Vazquez-Dominguez, Robert I. Colautti, Hitoshi Araki, Firouzeh Javadi, Juan Nunez-Farfan, Akira S. Mori, Shiliang Zhou, Peter M. Hollingsworth, Linda E. Neaves, Yuya Fukano, Gideon F. Smith, Yo-Ichiro Sato, Hidenori Tachida, Andrew P. Hendry
Evolutionary Applications 10 ( 2 ) 121 - 139 2017.2
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Historical Relationships Among Wild Boar Populations of the Ryukyu Archipelago and Other Eurasian regions, as Inferred from Mitochondrial Cytochrome b Gene Sequences Reviewed
Saka Yoshikawa, Makiko Mimura, Shin Watanabe, Liang-Kong Lin, Hidetoshi Ota, Yasushi Mizoguchi
Zoological Science 33 ( 5 ) 520 - 526 2016.10
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キイチゴたちが屋久島で出会うとき：気候変動と遺伝的交流
三村 真紀子
屋久島学 2 97 - 99 2015.11
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Topographic patterns in the phylogenetic structure of temperate forests on steep mountainous terrain Reviewed
Ryo Kitagawa, Makiko Mimura, Akira S. Mori, Akiko Sakai
AOB PLANTS 7 2015
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Asymmetric gene flow and the distribution of genetic diversity in morphologically distinct Abies mariesii populations in contrasting eco-habitats Reviewed
Shenhua Qian, Waka Saito, Makiko Mimura, Shingo Kaneko, Yuji Isagi, Eri Mizumachi, Akira S. Mori
PLANT ECOLOGY 215 ( 12 ) 1385 - 1397 2014.12
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A multi-year assessment of the environmental impact of transgenic Eucalyptus trees harboring a bacterial choline oxidase gene on biomass, precinct vegetation and the microbial community Reviewed
Taichi Oguchi, Yuko Kashimura, Makiko Mimura, Xiang Yu, Etsuko Matsunaga, Kazuya Nanto, Teruhisa Shimada, Akira Kikuchi, Kazuo N. Watanabe
TRANSGENIC RESEARCH 23 ( 5 ) 767 - 777 2014.10
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Range shift and introgression of the rear and leading populations in two ecologically distinct Rubus species Reviewed
Makiko Mimura, Misako Mishima, Martin Lascoux, Tetsukazu Yahara
BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY 14 209 2014.10
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Biodiversity only makes sense in the light of evolution Reviewed
R. Geeta, Lucia G. Lohmann, Susana Magallon, Daniel P. Faith, Andrew Hendry, Keith Crandall, Luc de Meester, Campbell O. Webb, Anne-Helene Prieur-Richard, Makiko Mimura, Elena Conti, Joel Cracraft, Felix Forest, Carlos Jaramillo, Michael Donoghue, Tetsukazu Yahara
JOURNAL OF BIOSCIENCES 39 ( 3 ) 333 - 337 2014.6
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Standing variation boosted by multiple sources of introduction contributes to the success of the introduced species, Lotus corniculatus Reviewed
M. Mimura, K. Ono, K. Goka, T. Hara
BIOLOGICAL INVASIONS 15 ( 12 ) 2743 - 2754 2013.12
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Global legume diversity assessment: Concepts, key indicators, and strategies Reviewed
Tetsukazu Yahara, Firouzeh Javadi, Yusuke Onoda, Luciano Paganucci de Queiroz, Daniel P. Faith, Darien E. Prado, Munemitsu Akasaka, Taku Kadoya, Fumiko Ishihama, Stuart Davies, J. W. Ferry Slik, Tingshuang Yi, Keping Ma, Chen Bin, Dedy Darnaedi, R. Toby Pennington, Midori Tuda, Masakazu Shimada, Motomi Ito, Ashley N. Egan, Sven Buerki, Niels Raes, Tadashi Kajita, Mohammad Vatanparast, Makiko Mimura, Hidenori Tachida, Yoh Iwasa, Gideon F. Smith, Janine E. Victor, Tandiwe Nkonki
TAXON 62 ( 2 ) 249 - 266 2013.4
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Colonization of vegetation-rich moraines and inference of multiple sources of colonization in the High Arctic for Salix arctica Reviewed
Makiko Mimura, Akira S. Mori, Masaki Uchida, Hiroshi Kanda
CONSERVATION GENETICS 14 ( 1 ) 223 - 229 2013.2
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Genetic and phenotypic variation in Lotus japonicus (Regel) K. Larsen, a model legume species Reviewed
Makiko Mimura
Canadian Journal of Plant Science 93 ( 3 ) 435 - 444 2013
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Local adaptation at the range peripheries of Sitka spruce Reviewed
M. Mimura, S. N. Aitken
JOURNAL OF EVOLUTIONARY BIOLOGY 23 ( 2 ) 249 - 258 2010.2
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我々は「生態リスク」とどう向き合うのか?
森章, 三村真紀子, 黒川紘子
日本生態学会誌 60 ( 3 ) 323 - 325 2010
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Dynamics of species' range: range expansion and local adaptation in Picea sitchensis Invited Reviewed
Forest tree breeding 236 ( 236 ) 1 - 6 2010
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Mycorrhizal colonization of transgenic Eucalyptus camaldulensis carrying the mangrin gene for salt tolerance Reviewed
Kipkorir E. Lelmen, Xiang Yu, Akira Kikuchi, Takayoshi Shimazaki, Makiko Mimura, Kazuo N. Watanabe
PLANT BIOTECHNOLOGY 27 ( 4 ) 339 - 344 2010
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Comparison of contemporary mating patterns in continuous and fragmented Eucalyptus globulus native forests Reviewed
Makiko Mimura, Robert C. Barbour, Brad M. Potts, Rene E. Vaillancourt, Kazuo N. Watanabe
MOLECULAR ECOLOGY 18 ( 20 ) 4180 - 4192 2009.10
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Genetic variation of chloroplast DNA in Zingiberaceae taxa from Myanmar assessed by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis Reviewed
D. Ahmad, A. Kikuchi, S. A. Jatoi, M. Mimura, K. N. Watanabe
ANNALS OF APPLIED BIOLOGY 155 ( 1 ) 91 - 101 2009
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Relationships of Zingiber species, and genetic variability assessment in ginger (Zingiber officinale) accessions from ex-situ genebank, on-farm and rural markets Reviewed
Shakeel Ahmad Jatoi, Akira Kikuchi, Makiko Mimura, San-San-Yi, Kazuo N. Watanabe
BREEDING SCIENCE 58 ( 3 ) 261 - 270 2008.9
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Impact of Environmental Stress-Tolerant Transgenic Potato on Genotypic Diversity of Microbial Communities and Soil Enzyme Activities under Stress Conditions Reviewed
Makiko Mimura, Kipkorir E. Lelmen, Takayoshi Shimazako, Akira Kikucho, Kazuo N. Watanabe
MICROBES AND ENVIRONMENTS 23 ( 3 ) 221 - 228 2008
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Adaptive gradients and isolation-by-distance with postglacial migration in Picea sitchensis Reviewed
M. Mimura, S. N. Aitken
HEREDITY 99 ( 2 ) 224 - 232 2007.8
-
Increased selfing and decreased effective pollen donor number in peripheral relative to central populations in Picea sitchensis (Pinaceae) Reviewed
Makiko Mimura, Sally N. Aitken
AMERICAN JOURNAL OF BOTANY 94 ( 6 ) 991 - 998 2007.6
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SSR diversity of vegetable soybean [Glycine max (L.) merr.] Reviewed
Makiko Mimura, Clarice J. Coyne, Marie W. Bambuck, Thomas A. Lumpkin
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION 54 ( 3 ) 497 - 508 2007.5
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RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia Reviewed
M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION 47 ( 6 ) 603 - 610 2000.12
Books
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栽培植物の自然史II
三村 真紀子（ Role： Contributor , 栽培アズキの成立と伝播）
北海道大学出版会 2013.9
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雑草学事典 WEB版
日本雑草学会（ Role： Contributor , 自己間引き、自然選択、ギャップ、寒さの指数、暖かさの指数（三村真紀子））
日本雑草学会雑草学事典編集委員会編集 2012
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エコシステムマネジメント ―包括的な生態系の保全と管理へ―
森 章（ Role： Contributor , Box 13-1 気候変動下での生物多様性保全のための「代替戦略」（森 章・三村 真紀子））
共立出版 2012
MISC
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三村真紀子, 矢原徹一
日本生態学会大会講演要旨(Web) 65th ROMBUNNO.S01‐2 (WEB ONLY) 2018
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RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 47, pg 603, 2014)
Makiko Mimura, Kentaro Yasuda, Hirofumi Yamaguchi
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION 61 ( 5 ) 1033 - 1034 2014.6
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RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 48, pg 189, 2001)
M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION 48 ( 3 ) 319 - 319 2001.6
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RAPD variation in wild, weedy and cultivated azuki beans in Asia (vol 47, pg 603, 2000)
M Mimura, K Yasuda, H Yamaguchi
GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION 48 ( 1 ) 107 - 107 2001.2
Presentations
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ノハナショウブ野生系統と江戸系ハナショウブ園芸品種の遺伝的構造とその多様性
三村真紀子・小林孝至・竹内鞠奈・廣田峻・陶山佳久・知野奈苗・田淵俊人
照葉樹林文化研究会 2021.12.5
Research Projects
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森林生態系機能における種内多様性の生態学的意義の検証
2021.11 - 2022.11
住友財団 環境研究助成
三村真紀子
Authorship：Principal investigator
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Reproductive isolation and diversification with homoploid speciation
Grant number：21K06334 2021.04 - 2024.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C) Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
三村 真紀子
Grant amount：\4030000 （ Direct expense: \3100000 、 Indirect expense：\930000 ）
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気候変動に対する適応的応答プロセスの遺伝的基盤の解明
2020.10 - 2021.09
日本生命財団 若手研究・奨励研究助成
三村真紀子
Authorship：Principal investigator
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希少種を含むイカリソウ属の系統分類学的研究
2020 - 2021.03
八雲環境科学振興財団 環境研究助成
三村真紀子
Authorship：Principal investigator
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西日本に多様に分化するイカリソウ属における種分化の維持機構に関する研究
2019.10 - 2020.10
両備檉園記念財団 生物学研究奨励賞
三村真紀子
Authorship：Principal investigator
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Genetics of convergent evolution in relative species
Grant number：17K07571 2017.04 - 2021.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C) Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
三村 真紀子
Grant amount：\4940000 （ Direct expense: \3800000 、 Indirect expense：\1140000 ）
本研究の目的である多様に分化したバラ科キイチゴ属の種分化と気候適応に関する収斂進化に関するメカニズムを明らかにするために、試料株の採集、系統関係の検証、ゲノム系統解析を行った。国内に自生するキイチコゴ属Idaeobatus亜属に属する22種（全て2倍体）を収集し、他の亜属を含む系統樹を作成したところ、Idaeobatus亜属は多系統であり、うち１つの系統グループはバライチゴやモミジイチゴなど国内種15種を含む最大のグループであることがわかった。また、Idaeobatus亜属は主に冷温帯に分布するが、国内のIdaeobatus亜属には、温暖な気候に分布する種も多く、亜熱帯気候への進出を遂げたオオバライチゴとリュウキュウイチゴは、それぞれ異なる温帯性のサブクレードから派生したことがわかった。この結果をもとに、異なる気候に分布する近縁な計8種14系統を選定し、ゲノムシーケンスを行った。外群として、系統グループの異なるナワシロイチゴの北海道系統および沖縄系統の計2系統を用いた。計885M readsを取得し、クオリティコントロールを行った。現在、リファレンスとして、モミジイチゴおよびヨーロッパキイチゴのゲノム情報を利用し、ゲノム系統解析から過去の種間交雑の影響を踏まえた種分化プロセスを検証している。また、交配実験による種間交配親和性の検証では、異なる系統グループに属する種間であってもある程度結実することがわかった。しかし、亜熱帯性キイチゴを含む国内キイチゴ属を対象にした交配実験では、同じサブクレードに属する種間では容易に交配するが、異なるサブクレード間では、交配親和性が著しく低いことが示唆された。
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迅速な適応を可能にする遺伝子変異の由来の判定
2013.04 - 2016.03
日本学術振興会 科学研究費補助金、若手研究(B)
三村 真紀子
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
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温帯性および亜熱帯性植物の適応分化と遺伝子流動に関する研究
2013.04 - 2014.03
基礎生物学研究所 自然科学研究機構基礎生物学研究所共同利用研究
三村 真紀子
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
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植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学（分担）
2012.04 - 2015.03
日本学術振興会 科学研究費補助金、基盤研究(A)
矢原 徹一
Grant type：Competitive
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東アジア原産観賞植物の栽培化と野生化に関する保全生物学的研究 （分担）
2011.04 - 2014.03
日本学術振興会 科学研究費補助金、基盤研究(B)
山口 裕文
Grant type：Competitive
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異なる環境に適応分化する2種間の遺伝子浸透とニッチ変化過程の解明
2010.04 - 2013.03
日本学術振興会 科学研究費補助金、若手研究(B)
三村 真紀子
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
Class subject in charge
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Basic Biology B2 （2024academic year） Fourth semester - 水3～4
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2024academic year） Year-round - その他
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Ecology （2024academic year） 3rd and 4th semester - 火3～4
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Ecology I （2024academic year） Third semester - 火3～4
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Ecology II （2024academic year） Fourth semester - 火3～4
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Ecological Genetics （2024academic year） Prophase - 火1～2
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Cell Biology IIIA （2024academic year） Third semester - 火3～4
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Cell Biology IIIB （2024academic year） Fourth semester - 火3～4
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Evolutionary Ecology （2024academic year） Prophase - その他
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Seminar in Evolutionary Ecology （2024academic year） Other - その他
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Seminar in Evolutionary Ecology （2024academic year） Year-round - その他
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Genetics IIB （2024academic year） Second semester - 木3～4
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（L20）Ecological Genetics （2024academic year） special - その他
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Experiments in Basic Biology （2023academic year） Summer concentration - その他
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Experiments in Basic Biology （2023academic year） Summer concentration - その他
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Basic Biology B2 （2023academic year） Fourth semester - 水3～4
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2023academic year） Year-round - その他
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2023academic year） Year-round - その他
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Ecology （2023academic year） 3rd and 4th semester - 火3～4
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Ecology I （2023academic year） Third semester - 火3～4
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Ecology II （2023academic year） Fourth semester - 火3～4
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Ecological Genetics （2023academic year） Prophase - 火1～2
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Ecological Genetics （2023academic year） Prophase - 火1～2
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Cell Biology IIIA （2023academic year） Third semester - 火3～4
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Cell Biology IIIB （2023academic year） Fourth semester - 火3～4
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Evolutionary Ecology （2023academic year） Prophase - その他
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Evolutionary Ecology （2023academic year） Late - その他
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Seminar in Evolutionary Ecology （2023academic year） Other - その他
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Genetics IIB （2023academic year） Second semester - 木3～4
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（L20）Ecological Genetics （2023academic year） special - その他
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Basic Biology B2 （2022academic year） Fourth semester - 水3～4
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2022academic year） Year-round - その他
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Ecology （2022academic year） 3rd and 4th semester - 火3～4
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Ecology I （2022academic year） Third semester - 火3～4
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Ecology II （2022academic year） Fourth semester - 火3～4
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Ecological Genetics （2022academic year） Prophase - 火1～2
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Cell Biology IIIA （2022academic year） Third semester - 火3～4
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Cell Biology IIIB （2022academic year） Fourth semester - 火3～4
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Evolutionary Ecology （2022academic year） Late - その他
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Genetics IIB （2022academic year） Second semester - 木3～4
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Basic Biology B （2021academic year） 3rd and 4th semester - 水3,水4
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Basic Biology B2 （2021academic year） Fourth semester - 水3,水4
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2021academic year） Year-round - その他
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Ecological Genetics （2021academic year） Prophase - 火1,火2
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Comparative Morphogenesis （2021academic year） 3rd and 4th semester - 火3,火4
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Cell Biology IIIA （2021academic year） Third semester - 火3,火4
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Cell Biology IIIB （2021academic year） Fourth semester - 火3,火4
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自然系博物館実習 （2021academic year） 特別
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Evolutionary Ecology （2021academic year） Late - その他
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Genetics 2 （2021academic year） 1st and 2nd semester - 木3,木4
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Genetics IIB （2021academic year） Second semester - 木3,木4
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Experiments in Basic Biology （2020academic year） Summer concentration - その他
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Experiments in Basic Biology （2020academic year） Summer concentration - その他
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Basic Biology B （2020academic year） 3rd and 4th semester - 水3,水4
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Basic Biology B2 （2020academic year） Fourth semester - 水3,水4
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Seminar in Plant Ecology and Evolution （2020academic year） Year-round - その他
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Ecological Genetics （2020academic year） Prophase - 火1,火2
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Comparative Morphogenesis （2020academic year） 3rd and 4th semester - 火3,火4
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Cell Biology IIIA （2020academic year） Third semester - 火3,火4
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Cell Biology IIIB （2020academic year） Fourth semester - 火3,火4
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Evolutionary Ecology （2020academic year） special - その他
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Genetics 2 （2020academic year） 1st and 2nd semester - 木3,木4
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Genetics IIB （2020academic year） Second semester - 木3,木4