Updated on 2023/01/05

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MONDEN Yuki
 
Organization
Faculty of Environmental and Life Science Associate Professor
Position
Associate Professor
External link

Degree

  • 修士(農学) ( 京都大学 )

  • 博士(農学) ( 京都大学 )

Research Interests

  • 高次倍数体

  • NGS

  • DNAマーカー

  • 品種識別

  • トランスポゾン

  • 植物遺伝学

  • 植物育種学

Research Areas

  • Environmental Science/Agriculture Science / Science in plant genetics and breeding

Education

  • Kyoto University   農学研究科   農学専攻博士後期課程

    2009.4 - 2012.3

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    Country: Japan

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  • Kyoto University   農学研究科   農学専攻博士前期課程

    2007.4 - 2009.3

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    Country: Japan

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  • Kyoto University   農学部  

    2003.4 - 2007.3

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    Country: Japan

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Research History

  • Okayama University   The Graduate School of Environmental and Life Science   Associate Professor

    2021.4

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  • Okayama University   The Graduate School of Environmental and Life Science   Associate Professor

    2018.3 - 2021.3

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  • 岡山大学環境生命科学研究科 助教

    2012 - 2018

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  • University of California, Riverside   Visiting student

    2010 - 2011

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  • 日本学術振興会 日本学術振興会特別研究員(DC1)

    2009 - 2012

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  • University of Georgia   Visiting student

    2009 - 2010

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Professional Memberships

Committee Memberships

  • 岡山大学農学部   学生生活委員会委員長  

    2021.4 - 2022.3   

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  • 日本DNA多型学会   理事  

    2020.11   

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    Committee type:Academic society

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  • 日本DNA多型学会   キャリアパス委員会委員長  

    2020.11   

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  • 日本育種学会   集会幹事  

    2020.4   

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    Committee type:Academic society

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  • 日本DNA多型学会   キャリアパス委員会  

    2018.12   

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    Committee type:Academic society

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  • 日本DNA多型学会   代議員  

    2018.12   

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    Committee type:Academic society

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  • 岡山大学農学部   学生生活委員会  

    2018.10   

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    Committee type:Academic society

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  • Trilateral Research Association of Sweetpotato   Steering committee members  

    2018.10   

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    Committee type:Other

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  • 植物インフォマティクス学会   運営委員  

    2018.9   

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    Committee type:Other

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  • 日本DNA多型学会   編集委員会  

    2018.4   

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    Committee type:Academic society

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  • 日本育種学会   男女共同参画推進委員会  

    2018.4 - 2022.3   

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    Committee type:Academic society

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Papers

  • Comprehensive survey of transposon mPing insertion sites and transcriptome analysis for identifying candidate genes controlling high protein content of rice International journal

    Yuki Monden, Hirona Tanaka, Ryota Funakoshi, Seiya Sunayama, Kiyotaka Yabe, Eri Kimoto, Kentaro Matsumiya, Takanori Yoshikawa

    Frontiers in Plant Science   13   969582 - 969582   2022.9

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    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Frontiers Media SA  

    Rice is the most important crop species in the world, being staple food of more than 80% of people in Asia. About 80% of rice grain is composed of carbohydrates (starch), with its protein content as low as 7–8%. Therefore, increasing the protein content of rice offers way to create a stable protein source that contributes to improving malnutrition and health problems worldwide. We detected two rice lines harboring a significantly higher protein content (namely, HP5-7 and HP7-5) in the EG4 population. The EG4 strain of rice is a unique material in that the transposon mPing has high transpositional activity and high copy numbers under natural conditions. Other research indicated that mPing is abundant in the gene-rich euchromatic regions, suggesting that mPing amplification should create new allelic variants, novel regulatory networks, and phenotypic changes in the EG4 population. Here, we aimed to identify the candidate genes and/or mPing insertion sites causing high protein content by comprehensively identifying the mPing insertion sites and carrying out an RNA-seq-based transcriptome analysis. By utilizing the next-generation sequencing (NGS)-based methods, ca. 570 mPing insertion sites were identified per line in the EG4 population. Our results also indicated that mPing apparently has a preference for inserting itself in the region near a gene, with 38 genes in total found to contain the mPing insertion in the HP lines, of which 21 and 17 genes were specific to HP5-7 and HP7-5, respectively. Transcriptome analysis revealed that most of the genes related to protein synthesis (encoding glutelin, prolamin, and globulin) were up-regulated in HP lines relative to the control line. Interestingly, the differentially expressed gene (DEG) analysis revealed that the expression levels of many genes related to photosynthesis decreased in both HP lines; this suggests the amount of starch may have decreased, indirectly contributing to the increased protein content. The high-protein lines studied here are expected to contribute to the development of high protein-content rice by introducing valuable phenotypic traits such as high and stable yield, disease resistance, and abundant nutrients.

    DOI: 10.3389/fpls.2022.969582

    PubMed

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  • Exploiting the miniature inverted-repeat transposable elements insertion polymorphisms as an efficient DNA marker system for genome analysis and evolutionary studies in wheat and related species International journal

    Benjamin Ewa Ubi, Yasir Serag Alnor Gorafi, Beery Yaakov, Yuki Monden, Khalil Kashkush, Hisashi Tsujimoto

    Frontiers in Plant Science   13   995586 - 995586   2022.9

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Frontiers Media SA  

    Transposable elements (TEs) constitute ~80% of the complex bread wheat genome and contribute significantly to wheat evolution and environmental adaptation. We studied 52 TE insertion polymorphism markers to ascertain their efficiency as a robust DNA marker system for genetic studies in wheat and related species. Significant variation was found in miniature inverted-repeat transposable element (MITE) insertions in relation to ploidy with the highest number of “full site” insertions occurring in the hexaploids (32.6 ± 3.8), while the tetraploid and diploid progenitors had 22.3 ± 0.6 and 15.0 ± 3.5 “full sites,” respectively, which suggested a recent rapid activation of these transposons after the formation of wheat. Constructed phylogenetic trees were consistent with the evolutionary history of these species which clustered mainly according to ploidy and genome types (SS, AA, DD, AABB, and AABBDD). The synthetic hexaploids sub-clustered near the tetraploid species from which they were re-synthesized. Preliminary genotyping in 104 recombinant inbred lines (RILs) showed predominantly 1:1 segregation for simplex markers, with four of these markers already integrated into our current DArT-and SNP-based linkage map. The MITE insertions also showed stability with no single excision observed. The MITE insertion site polymorphisms uncovered in this study are very promising as high-potential evolutionary markers for genomic studies in wheat.

    DOI: 10.3389/fpls.2022.995586

    PubMed

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  • Mapping of Nematode Resistance in Hexaploid Sweetpotato Using a Next-Generation Sequencing-Based Association Study

    Nozomi Obata, Hiroaki Tabuchi, Miyu Kurihara, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Yuki Monden

    Frontiers in Plant Science   13   2022.3

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Frontiers Media SA  

    The southern root-knot nematode (SRKN; Meloidogyne incognita) is a typical parasitic nematode that affects sweetpotato [Ipomoea batatas (L.) Lam.], causing a significant decrease in crop yield and commercial value. In Japan, the SRKN is classified into 10 races: SP1–SP5, SP6-1, SP6-2, and SP7–SP9, with the dominant race differing according to the cultivation area. Soil insecticides have previously been used to reduce the soil density of SRKNs; however, this practice is both costly and labor intensive. Therefore, the development of SRKN-resistant sweetpotato lines and cultivars is necessary. However, due to the complexity of polyploid inheritance and the highly heterogeneous genomic composition of sweetpotato, genetic information and research for this species are significantly lacking compared to those for other major diploid crop species. In this study, we utilized the recently developed genome-wide association approach, which uses multiple-dose markers to assess autopolyploid species. We performed an association analysis to investigate resistance toward SRKN-SP2, which is the major race in areas with high sweetpotato production in Japan. The segregation ratio of resistant and susceptible lines in the F1 mapping population derived from the resistant “J-Red” and susceptible “Choshu” cultivars was fitted to 1: 3, suggesting that resistance to SP2 may be regulated by two loci present in the simplex. By aligning the double digest restriction-site associated DNA sequencing reads to the published Ipomoea trifida reference sequence, 46,982 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified (sequencing depth > 200). The association study yielded its highest peak on chromosome 7 (Chr07) and second highest peak on chromosome 3 (Chr03), presenting as a single-dose in both loci. Selective DNA markers were developed to screen for resistant plants using the SNPs identified on Chr03 and Chr07. Our results showed that SRKN-SP2-resistant plants were selected with a probability of approximately 70% when combining the two selective DNA markers. This study serves as a model for the identification of genomic regions that control agricultural traits and the elucidation of their effects, and is expected to greatly advance marker-assisted breeding and association studies in polyploid crop species.

    DOI: 10.3389/fpls.2022.858747

    PubMed

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  • Transcriptome Analysis Reveals Key Genes Involved in Weevil Resistance in the Hexaploid Sweetpotato Reviewed

    Kanoko Nokihara, Yoshihiro Okada, Shinichiro Ohata, Yuki Monden

    Plants   10 ( 8 )   1535 - 1535   2021.7

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:MDPI AG  

    Because weevils are the most damaging pests of sweetpotato, the development of cultivars resistant to weevil species is considered the most important aspect in sweetpotato breeding. However, the genes and the underlying molecular mechanisms related to weevil resistance are yet to be elucidated. In this study, we performed an RNA sequencing-based transcriptome analysis using the resistant Kyushu No. 166 (K166) and susceptible Tamayutaka cultivars. The weevil resistance test showed a significant difference between the two cultivars at 30 days after the inoculation, specifically in the weevil growth stage and the suppressed weevil pupation that was only observed in K166. Differential expression and gene ontology analyses revealed that the genes upregulated after inoculation in K166 were related to phosphorylation, metabolic, and cellular processes. Because the weevil resistance was considered to be related to the suppression of larval pupation, we investigated the juvenile hormone (JH)-related genes involved in the inhibition of insect metamorphosis. We found that the expression of some terpenoid-related genes, which are classified as plant-derived JHs, was significantly increased in K166. This is the first study involving a comprehensive gene expression analysis that provides new insights about the genes and mechanisms associated with weevil resistance in sweetpotato.

    DOI: 10.3390/plants10081535

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  • Correction to: Comparative Gene Analysis Focused on Silica Cell Wall Formation: Identification of Diatom-Specific SET Domain Protein Methyltransferases. International journal

    Michiko Nemoto, Sayako Iwaki, Hisao Moriya, Yuki Monden, Takashi Tamura, Kenji Inagaki, Shigeki Mayama, Kiori Obuse

    Marine biotechnology (New York, N.Y.)   23 ( 1 )   157 - 157   2021.2

     More details

  • Genetic Mapping in Autohexaploid Sweet Potato with Low-Coverage NGS-Based Genotyping Data Reviewed International journal

    Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Takumi Kimura, Yuki Monden, Masaru Tanaka, Sachiko Isobe

    G3 Genes|Genomes|Genetics   10 ( 8 )   2661 - 2670   2020.8

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Oxford University Press (OUP)  

    <title>Abstract</title>
    Next-generation sequencing (NGS)-based genotyping methods can generate numerous genetic markers in a single experiment and have contributed to plant genetic mapping. However, for high precision genetic analysis, the complicated genetic segregation mode in polyploid organisms requires high-coverage NGS data and elaborate analytical algorithms. In the present study, we propose a simple strategy for the genetic mapping of polyploids using low-coverage NGS data. The validity of the strategy was investigated using simulated data. Previous studies indicated that accurate allele dosage estimation from low-coverage NGS data (read depth &amp;lt; 40) is difficult. Therefore, we used allele dosage probabilities calculated from read counts in association analyses to detect loci associated with phenotypic variations. The allele dosage probabilities showed significant detection power, although higher allele dosage estimation accuracy resulted in higher detection power. On the contrary, differences in the segregation patterns between the marker and causal genes resulted in a drastic decrease in detection power even if the marker and casual genes were in complete linkage and the allele dosage estimation was accurate. These results indicated that the use of a larger number of markers is advantageous, even if the accuracy of allele dosage estimation is low. Finally, we applied the strategy for the genetic mapping of autohexaploid sweet potato (Ipomoea batatas) populations to detect loci associated with agronomic traits. Our strategy could constitute a cost-effective approach for preliminary experiments done performed to large-scale studies.

    DOI: 10.1534/g3.120.401433

    PubMed

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  • Comparative Gene Analysis Focused on Silica Cell Wall Formation: Identification of Diatom-Specific SET Domain Protein Methyltransferases. Reviewed International journal

    Michiko Nemoto, Sayako Iwaki, Hisao Moriya, Yuki Monden, Takashi Tamura, Kenji Inagaki, Shigeki Mayama, Kiori Obuse

    Marine biotechnology (New York, N.Y.)   2020.6

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)  

    Silica cell walls of diatoms have attracted attention as a source of nanostructured functional materials and have immense potential for a variety of applications. Previous studies of silica cell wall formation have identified numerous involved proteins, but most of these proteins are species-specific and are not conserved among diatoms. However, because the basic process of diatom cell wall formation is common to all diatom species, ubiquitous proteins and molecules will reveal the mechanisms of cell wall formation. In this study, we assembled de novo transcriptomes of three diatom species, Nitzschia palea, Achnanthes kuwaitensis, and Pseudoleyanella lunata, and compared protein-coding genes of five genome-sequenced diatom species. These analyses revealed a number of diatom-specific genes that encode putative endoplasmic reticulum-targeting proteins. Significant numbers of these proteins showed homology to silicanin-1, which is a conserved diatom protein that reportedly contributes to cell wall formation. These proteins also included a previously unrecognized SET domain protein methyltransferase family that may regulate functions of cell wall formation-related proteins and long-chain polyamines. Proteomic analysis of cell wall-associated proteins in N. palea identified a protein that is also encoded by one of the diatom-specific genes. Expression analysis showed that candidate genes were upregulated in response to silicon, suggesting that these genes play roles in silica cell wall formation. These candidate genes can facilitate further investigations of silica cell wall formation in diatoms.

    DOI: 10.1007/s10126-020-09976-1

    PubMed

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  • Molecular discrimination of Japanese tetraploid grape cultivars based on retrotranspon sequences

    高田翔太, 藤田景子, 福永健二, 門田有希

    DNA多型   28 ( 1 )   46 - 50   2020.6

  • Foliar disease resistant and productive mutants from the introgression lines of peanut ( Arachis hypogaea ) Reviewed

    Pushpesh Joshi, Mangesh P. Jadhav, Kenta Shirasawa, Arati Yadawad, Ramesh S. Bhat, Ram Singh

    Plant Breeding   139 ( 1 )   148 - 155   2020.2

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Wiley  

    DOI: 10.1111/pbr.12762

    Web of Science

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  • Developing transposable element marker system for molecular breeding

    R. S. Bhat, K. Shirasawa, Y. Monden, H. Yamashita, M. Tahara

    Methods in Molecular Biology   2107   233 - 251   2020.1

     More details

    © Springer Science+Business Media, LLC, part of Springer Nature 2020. Transposable element (TE) marker system was developed considering the useful properties of the transposable elements such as their large number in the animal and plant genomes, high rate of insertion polymorphism, and ease of detection. Various methods have been employed for developing a large number of TE markers in several crop plants for genomics studies. Here we describe some of these methods including the recent whole genome search. We also review the application of TE markers in molecular breeding.

    DOI: 10.1007/978-1-0716-0235-5_11

    Scopus

    PubMed

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  • QTL analysis and GWAS of agronomic traits in sweetpotato (Ipomoea batatas L.) using genome wide SNPs Reviewed

    Emdadul Haque, Hiroaki Tabuchi, Yuki Monden, Keisuke Suematsu, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Masaru Tanaka

    Breeding Science   70 ( 3 )   283 - 291   2020

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    <p>While sweetpotato (Ipomoea batatas L.) improvement has generally been done by field-based selection, molecular genetic studies on traits of interest, i.e., molecular markers are needed for enhancing the breeding program of this world's 7th most important crop, as such markers facilitate marker-assisted selection. Here, we performed a combined approach of QTLs analyses and GWAS of storage root β-carotene content (BC), dry-matter (DM) and starch content (SC) using the genetic linkage maps constructed with 5,952 and 5,640 SNPs obtained from F1 progenies between cultivars 'J-Red' and 'Choshu'. BC was negatively correlated with DM (r = –0.45) and SC (r = –0.51), while DM was positively correlated with SC (r = 0.94). In both parental maps, a total of five, two and five QTL regions on linkage groups 7 and 8 were associated with BC, DM and SC, respectively. In GWAS of BC, one strong signal (P = 1.04 × 10–9) was observed on linkage group 8, which co-located with one of the above QTL regions. The SNPs markers found here, particularly for β-carotene, would be useful base resources for future marker-assisted selection program with this trait.</p>

    DOI: 10.1270/jsbbs.19099

    CiNii Article

    CiNii Books

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  • DNA markers based on retrotransposon insertion polymorphisms can detect short DNA fragments for strawberry cultivar identification Reviewed

    Chiharu Hirata, Takamitsu Waki, Katsumi Shimomura, Takuya Wada, Seiya Tanaka, Hidetoshi Ikegami, Yousuke Uchimura, Keita Hirashima, Yoshiko Nakazawa, Kaori Okada, Kiyoshi Namai, Makoto Tahara, Yuki Monden

    Breeding Science   70 ( 2 )   231 - 240   2020

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    DOI: 10.1270/jsbbs.19116

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  • Genome-Wide Association Studies (GWAS) for Yield and Weevil Resistance in Sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam). Reviewed International journal

    Yoshihiro Okada, Yuki Monden, Kanoko Nokihara, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Makoto Tahara

    Plant cell reports   38 ( 11 )   1383 - 1392   2019.11

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    Language:English  

    KEY MESSAGE: We apply the GWAS to sweet potato genome, and identified the SNPs associated with yield and weevil resistance. The sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam) is a highly heterozygous, outcrossing, polyploid species, which presents challenges for genetic analysis. Therefore, we considered that genome-wide association studies (GWAS) may be applied to the study of the sweet potato genome. The yield of two sweet potato varieties [Purple Sweet Lord (PSL) and 90IDN-47] was assessed at two locations (Kumamoto and Okinawa prefectures) in Japan in 2013 and the yield scores were used for GWAS. The results showed that there were several single nucleotide polymorphisms (SNP) above the significance thresholds in PSL; two peaks were detected in Kumamoto and Okinawa on the Ib03-3 and Ib01-4 linkage groups of PSL, respectively. As for 90IDN-47, one relatively high peak was detected in Kumamoto on the Ib13-8 linkage group. Interestingly, although high peaks above significance thresholds were detected in Kumamoto and Okinawa in PSL, the peaks were located in different linkage groups. This result suggests that the genetic regions controlling yield may change in response to environmental conditions. Additionally, we investigated the degree of weevil damage to the plants, which is the greatest problem in sweet potato cultivation in Okinawa. In this experiment, no SNPs were identified above the significance thresholds. However, one relatively high peak was found in the 90IDN-47 genotype, which showed resistance to weevils. On the other hand, one relatively high peak was also detected in the PSL genotype, which showed susceptibility to weevils. These results suggest that two regions could affect weevil resistance and may contain the gene(s) controlling weevil resistance.

    DOI: 10.1007/s00299-019-02445-7

    PubMed

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  • Development of molecular markers associated with resistance to Meloidogyne incognita by performing quantitative trait locus analysis and genome-wide association study in sweetpotato. Reviewed International journal

    Rumi Sasai, Hiroaki Tabuchi, Kenta Shirasawa, Kazuki Kishimoto, Shusei Sato, Yoshihiro Okada, Akihide Kuramoto, Akira Kobayashi, Sachiko Isobe, Makoto Tahara, Yuki Monden

    DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes   26 ( 5 )   399 - 409   2019.10

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Language:English   Publisher:Oxford University Press ({OUP})  

    The southern root-knot nematode, Meloidogyne incognita, is a pest that decreases yield and the quality of sweetpotato [Ipomoea batatas (L.) Lam.]. There is a demand to produce resistant cultivars and develop DNA markers to select this trait. However, sweetpotato is hexaploid, highly heterozygous, and has an enormous genome (∼3 Gb), which makes genetic linkage analysis difficult. In this study, a high-density linkage map was constructed based on retrotransposon insertion polymorphism, simple sequence repeat, and single nucleotide polymorphism markers. The markers were developed using F1 progeny between J-Red, which exhibits resistance to multiple races of M. incognita, and Choshu, which is susceptible to multiple races of such pest. Quantitative trait locus (QTL) analysis and a genome-wide association study detected highly effective QTLs for resistance against three races, namely, SP1, SP4, and SP6-1, in the Ib01-6 J-Red linkage group. A polymerase chain reaction marker that can identify genotypes based on single nucleotide polymorphisms located in this QTL region can discriminate resistance from susceptibility in the F1 progeny at a rate of 70%. Thus, this marker could be helpful in selecting sweetpotato cultivars that are resistant to multiple races of M. incognita.

    DOI: 10.1093/dnares/dsz018

    PubMed

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  • Impairment of Lhca4, a subunit of LHCI, causes high accumulation of chlorophyll and the stay-green phenotype in rice Reviewed

    Hiroshi Yamatani, Kaori Kohzuma, Michiharu Nakano, Tsuneaki Takami, Yusuke Kato, Yoriko Hayashi, Yuki Monden, Yutaka Okumoto, Tomoko Abe, Toshihiro Kumamaru, Ayumi Tanaka, Wataru Sakamoto, Makoto Kusaba

    Journal of Experimental Botany   69 ( 5 )   1027 - 1035   2018.2

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Oxford University Press (OUP)  

    DOI: 10.1093/jxb/erx468

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  • Southern root-knot nematode race SP6 is divided into two races Reviewed

    Hiroaki Tabuchi, Toshikazu Kuranouchi, Akira Kobayashi, Yuki Monden, Kazuki Kishimoto, Makoto Tahara, Yoshihiro Okada, Hideaki Iwahori

    Nematological Research (Japanese Journal of Nematology)   47 ( 2 )   29 - 33   2017.12

     More details

    Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:The Japanese Nematological Society  

    DOI: 10.3725/jjn.47.29

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  • Development of cultivar discrimination technique for foreign wheat cultivars Reviewed

    25 ( 1 )   68 - 71   2017

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • Assessment of Simplified Cultivar Identification Method in Azuki Processed Products Using Single Tag Hybridization (STH) Chromatographic Printed Array Strip (PAS) Reviewed

    25 ( 1 )   88 - 91   2017

     More details

  • Genetic linkage analysis using DNA markers in sweetpotato Reviewed

    Yuki Monden, Makoto Tahara

    Breeding Science   67 ( 1 )   41 - 51   2017

     More details

    Authorship:Lead author, Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    DOI: 10.1270/jsbbs.16142

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  • 色素原料用サツマイモ品種の識別に利用可能なレトロトランスポゾンRtsp-1挿入箇所の選定 Reviewed

    田中勝, 岡田吉弘, 高畑康浩, 門田有希, 田原誠

    DNA多型   24   115 - 118   2016

     More details

  • レトロトランスポゾン挿入多型を利用したリンゴの品種識別マーカー開発

    西谷千佳子, 山本俊哉, 藤井浩, 岡田和馬, 門田有希, 田原誠

    DNA多型   24   101 - 107   2016

     More details

  • DNAクロマトを利用したアズキ品種識別法の開発

    高崎一人, リズティアン, 門田有希, 田原誠, 布藤聡

    DNA多型   24   134 - 137   2016

     More details

  • 稲糯品種におけるイネトランスポゾンmPingの品種間挿入多型調査 Reviewed

    岸本和樹, 門田有希, 相川祥胤, 湯浅まり恵, 田原誠, 齋木萌, 高橋剛

    DNA多型   24   8 - 14   2016

     More details

  • Plant Transposable Elements and Their Application to Genetic Analysis via High-throughput Sequencing Platform Reviewed

    Yuki Monden, Makoto Tahara

    HORTICULTURE JOURNAL   84 ( 4 )   283 - 294   2015.10

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publisher:JAPAN SOC HORTICULTURAL SCI  

    Transposable elements (TEs) are mobile genetic elements in the eukaryotic genome. They are divided into two classes (class I: retrotransposons and class II: DNA transposons) based on their structure and manner of transposition. TEs are major components of the eukaryotic genome and retrotransposons are especially abundant in higher-plant genomes. As retrotransposon insertions with high copy numbers are dispersed throughout the genome and are inherited genetically, insertion polymorphisms among crop cultivars have been used as molecular markers. Recently, we developed an efficient method for screening the long terminal repeats (LTRs) of retrotransposon families that exhibit high levels of insertion polymorphisms among crop cultivars using a next-generation sequencing (NGS) platform. This method focuses on the primer binding site (PBS) that is adjacent to the 5' LTR and has a conserved DNA sequence among different LTR retrotransposon families. Construction of a sequencing library through PCR amplification using the PBS conserved sequence allowed us to acquire a large number of LTR sequences and their insertion sites throughout the genome. From our data analysis, we screened the LTR sequences that showed high levels of insertion polymorphism among closely related cultivars. In addition, we identified the insertion sites of these identified LTR retrotransposon families at the genome-wide scale in a number of cultivars with an NGS platform, which enabled us to reveal the genetic relationships among the cultivars and acquire a number of molecular markers for cultivar screening. Our results indicated that the target sequencing of these retrotransposon insertion sites was highly effective for DNA genotyping and marker development without requiring any whole-genome sequence information. This review describes the genomic structure and evolutionary aspects of TEs and discusses the development of molecular markers based on retrotransposon insertion polymorphisms.

    DOI: 10.2503/hortj.MI-IR02

    Web of Science

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  • Construction of a linkage map based on retrotransposon insertion polymorphisms in sweetpotato via high-throughput sequencing Reviewed

    Yuki Monden, Takuya Hara, Yoshihiro Okada, Osamu Jahane, Akira Kobayashi, Hiroaki Tabuchi, Shoko Onaga, Makoto Tahara

    BREEDING SCIENCE   65 ( 2 )   145 - 153   2015.3

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    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:JAPANESE SOC BREEDING  

    Sweetpotato (Ipomoea batatas L.) is an outcrossing hexaploid species with a large number of chromosomes (2n = 6x = 90). Although sweetpotato is one of the world's most important crops, genetic analysis of the species has been hindered by its genetic complexity combined with the lack of a whole genome sequence. In the present study, we constructed a genetic linkage map based on retrotransposon insertion polymorphisms using a mapping population derived from a cross between 'Purple Sweet Lord' (PSL) and '90IDN-47' cultivars. High-throughput sequencing and subsequent data analyses identified many Rtsp-1 retrotransposon insertion sites, and their allele dosages (simplex, duplex, triplex, or double-simplex) were determined based on segregation ratios in the mapping population. Using a pseudo-testcross strategy, 43 and 47 linkage groups were generated for PSL and 90IDN-47, respectively. Interestingly, most of these insertions (similar to 90%) were present in a simplex manner, indicating their utility for linkage map construction in polyploid species. Additionally, our approach led to savings of time and labor for genotyping. Although the number of markers herein was insufficient for map-based cloning, our trial analysis exhibited the utility of retrotransposon-based markers for linkage map construction in sweetpotato.

    DOI: 10.1270/jsbbs.65.145

    Web of Science

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  • シイタケ(Lentinula edodes)におけるレトロトランスポゾン挿入多型を 利用したHigh-Throughput な品種判定マーカーの開発 Reviewed

    湯浅まり恵, 門田有希, 田原誠

    DNA多型   23 ( 1 )   34 - 38   2015

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  • パインアップルにおけるレトロトランスポゾン挿入多型マーカー開発と品種識別への適用

    奈島 賢児, 寺上 伸吾, 國久 美由紀, 西谷 千佳子, 正田 守幸, 竹内 誠人, 浦崎 直也, 太郎良 和彦, 門田 有希, 田原 誠, 山本 俊哉

    DNA多型   23 ( 1 )   29 - 33   2015

  • Efficient DNA Fingerprinting Based on the Targeted Sequencing of Active Retrotransposon Insertion Sites Using a Bench-Top High-Throughput Sequencing Platform Reviewed

    Yuki Monden, Ayaka Yamamoto, Akiko Shindo, Makoto Tahara

    DNA RESEARCH   21 ( 5 )   491 - 498   2014.10

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:OXFORD UNIV PRESS  

    In many crop species, DNA fingerprinting is required for the precise identification of cultivars to protect the rights of breeders. Many families of retrotransposons have multiple copies throughout the eukaryotic genome and their integrated copies are inherited genetically. Thus, their insertion polymorphisms among cultivars are useful for DNA fingerprinting. In this study, we conducted a DNA fingerprinting based on the insertion polymorphisms of active retrotransposon families (Rtsp-1 and LIb) in sweet potato. Using 38 cultivars, we identified 2,024 insertion sites in the two families with an Illumina MiSeq sequencing platform. Of these insertion sites, 91.4% appeared to be polymorphic among the cultivars and 376 cultivar-specific insertion sites were identified, which were converted directly into cultivar-specific sequence-characterized amplified region (SCAR) markers. A phylogenetic tree was constructed using these insertion sites, which corresponded well with known pedigree information, thereby indicating their suitability for genetic diversity studies. Thus, the genome-wide comparative analysis of active retrotransposon insertion sites using the bench-top MiSeq sequencing platform is highly effective for DNA fingerprinting without any requirement for whole genome sequence information. This approach may facilitate the development of practical polymerase chain reaction-based cultivar diagnostic system and could also be applied to the determination of genetic relationships.

    DOI: 10.1093/dnares/dsu015

    Web of Science

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  • A rapid and enhanced DNA detection method for crop cultivar discrimination Reviewed

    Yuki Monden, Kazuto Takasaki, Satoshi Futo, Kousuke Niwa, Mitsuo Kawase, Hiroto Akitake, Makoto Tahara

    JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY   185   57 - 62   2014.9

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:ELSEVIER SCIENCE BV  

    In many crops species, the development of a rapid and precise cultivar discrimination system has been required for plant breeding and patent protection of plant cultivars and agricultural products. Here, we successfully evaluated strawberry cultivars via a novel method, namely, the single tag hybridization (STH) chromatographic printed array strip (PAS) using the PCR products of eight genomic regions. In a previous study, we showed that genotyping of eight genomic regions derived from FaRE1 retrotransposon insertion site enabled to discriminate 32 strawberry cultivars precisely, however, this method required agarose/acrylamide gel electrophoresis, thus has the difficulty for practical application. In contrast, novel DNA detection method in this study has some great advantages over standard DNA detection methods, including agarose/acrylamide gel electrophoresis, because it produces signals for DNA detection with dramatically higher sensitivity in a shorter time without any preparation or staining of a gel. Moreover, this method enables the visualization of multiplex signals simultaneously in a single reaction using several independent amplification products. We expect that this novel method will become a rapid and convenient cultivar screening assay for practical purposes, and will be widely applied to various situations, including laboratory research, and on-site inspection of plant cultivars and agricultural products. (C) 2014 The Authors. Published by Elsevier B.V.

    DOI: 10.1016/j.jbiotec.2014.06.013

    Web of Science

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  • Application of iPBS in high-throughput sequencing for the development of retrotransposon-based molecular markers Reviewed

    Yuki Monden, Kentaro Yamaguchi, Makoto Tahara

    Current Plant Biology   1   40 - 44   2014.8

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Elsevier  

    Retrotransposons are major components of higher plant genomes, and long terminal repeat (LTR) retrotransposons are especially predominant. Thus, numerous LTR retrotransposon families with high copy numbers exist in most plant genomes. As the integrated copies of these retrotransposons are genetically inherited, their insertion polymorphisms among crop cultivars have been used as functional molecular markers such as inter-retrotransposon amplification polymorphism (IRAP), retrotransposon microsatellite amplification polymorphism (REMAP), retrotransposon-based insertion polymorphism (RBIP) and sequence-specific amplification polymorphism (S-SAP). However, the effective use of these methods requires suitable LTR sequences showing high insertion polymorphism among crop cultivars. Recently, we conducted an efficient screening of LTR retrotransposon families that showed high insertion polymorphism among closely related strawberry cultivars using a next-generation sequencing platform. This method focuses on the primer binding site (PBS), which is adjacent to the 5' LTR sequence and is conserved among different LTR retrotransposon families. Construction of a sequencing library using the PBS motif allowed us to identify a large number of LTR sequences and their insertion sites throughout the genome. The LTR sequences identified by our method showed high insertion polymorphism among closely related strawberry cultivars, and these families should thus be useful in the development of molecular markers for phylogenetic and genetic diversity studies. This article briefly describes the general aspects of retrotransposon-based molecular markers and also outlines our method for screening LTR sequences suitable for genetic analyses.(. http://www.ddbj.nig.ac.jp/).

    DOI: 10.1016/j.cpb.2014.09.001

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  • mPing: The bursting transposon Reviewed

    Ken Naito, Yuki Monden, Kanako Yasuda, Hiroki Saito, Yutaka Okumoto

    BREEDING SCIENCE   64 ( 2 )   109 - 114   2014.6

     More details

    Language:English   Publisher:JAPANESE SOC BREEDING  

    Though transposable elements (TEs) have been considered as an efficient source of evolution, it has never been possible to test this hypothesis because most of TE insertions had occurred millions of years ago, or because currently active TEs have very few copies in a host genome. However, mPing, the first active DNA transposon in rice, was revealed to hold a key to answer this question. mPing has attained high copy numbers and still retained very high activity in a traditional rice strain, which enabled direct observation of behavior and impact of a bursting TE. A comprehensive analysis of mPing insertion sites has revealed it avoids exons but prefers promoter regions and thus moderately affects transcription of neighboring genes. Some of the mPing insertions have introduced possibly useful expression profile to adjacent genes that indicated TE's potential in de novo formation of gene regulatory network.

    DOI: 10.1270/jsbbs.64.109

    Web of Science

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  • Efficient screening of long terminal repeat retrotransposons that show high insertion polymorphism via high-throughput sequencing of the primer binding site Reviewed

    Yuki Monden, Nobuyuki Fujii, Kentaro Yamaguchi, Kazuho Ikeo, Yoshiko Nakazawa, Takamitsu Waki, Keita Hirashima, Yosuke Uchimura, Makoto Tahara

    GENOME   57 ( 5 )   245 - 252   2014.5

     More details

    Authorship:Lead author   Language:English   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:CANADIAN SCIENCE PUBLISHING, NRC RESEARCH PRESS  

    Retrotransposons have been used frequently for the development of molecular markers by using their insertion polymorphisms among cultivars, because multiple copies of these elements are dispersed throughout the genome and inserted copies are inherited genetically. Although a large number of long terminal repeat (LTR) retrotransposon families exist in the higher eukaryotic genomes, the identification of families that show high insertion polymorphism has been challenging. Here, we performed an efficient screening of these retrotransposon families using an Illumina HiSeq2000 sequencing platform with comprehensive LTR library construction based on the primer binding site (PBS), which is located adjacent to the 5' LTR and has a motif that is universal and conserved among LTR retrotransposon families. The paired-end sequencing library of the fragments containing a large number of LTR sequences and their insertion sites was sequenced for seven strawberry (Fragaria x ananassa Duchesne) cultivars and one diploid wild species (Fragaria vesca L.). Among them, we screened 24 families with a "unique" insertion site that appeared only in one cultivar and not in any others, assuming that this type of insertion should have occurred quite recently. Finally, we confirmed experimentally the selected LTR families showed high insertion polymorphisms among closely related cultivars.

    DOI: 10.1139/gen-2014-0031

    Web of Science

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  • 新規活性型レトロトランスポゾンTriRe-1の挿入多型を利用した、High-throughputなコムギ品種判定マーカーの開発 Reviewed

    門田有希, 高井健, 田原誠, 梅野佑太, 中村遼太

    DNA 多型   22 ( 1 )   60 - 65   2014

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • Characterization of a novel retrotransposon TriRe-1 using nullisomic-tetrasomic lines of hexaploid wheat

    Yuki Monden, Takeru Takai, Makoto Tahara

    岡山大学農学部学術報告   103   21 - 30   2014

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • イチゴにおけるレトロトランスポゾン品種識別マーカーの開発

    秋竹広翔, 田原誠, 門田有希, 高崎一人, 布藤聡

    DNA多型   ( 21 )   64 - 72   2013

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  • 活性型レトロトランスポゾンを利用したアントシアニン含有紫サツマイモ品種識別用DNAマーカーの開発

    門田有希, 山本彩加, 田原誠

    DNA多型   ( 21 )   47 - 54   2013

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • Physical mapping of two novel photoperiod sensitivity genes, se14 and se15, using mPing SCAR markers Reviewed

    ASAMI Takehito, OKUMOTO Yutaka, SAITO Hiroki, YUAN Qingbo, MONDEN Yuki, TERAISHI Masayoshi, TSUKIYAMA Takuji, TANISAKA Takatoshi

    作物研究   ( 54 )   85 - 89   2009.11

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  • High Potential of a Transposon mPing as a Marker System in japonica x japonica Cross in Rice Reviewed

    Y. Monden, K. Naito, Y. Okumoto, H. Saito, N. Oki, T. Tsukiyama, O. Ideta, T. Nakazaki, S. R. Wessler, T. Tanisaka

    DNA Research   16 ( 2 )   131 - 140   2009.1

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    Authorship:Lead author   Publishing type:Research paper (scientific journal)   Publisher:Oxford University Press (OUP)  

    DOI: 10.1093/dnares/dsp004

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  • Up regulation of a rice transposon Ping in active strain EG4

    Yuki Monden, Ken Naito, Takuji Tsukiyama, Yutaka Okumoto, Takatoshi Tanisaka

    Journal of crop research   54   119 - 123   2009

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • mPingを含んで転写される遺伝子の同定 Reviewed

    稲垣春香, 築山拓司, 門田有希, Shanta Karki, 奥本裕, 中崎鉄也, 寺石政義, 谷坂隆俊

    作物研究   54   75 - 80   2009

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    Language:Japanese  

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MISC

  • デュラムコムギにおいてPCL1と相互作用する新規早生QTLs の解析

    藤岡 明雅, 門田 有希, 西田 英隆, 加藤 鎌司

    育種学研究   24 ( 2 )   157 - 15   2022.9

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    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • オオムギ匍匐性は作用が異なる3つのQTLが制御する複合形質である

    福嶋 七海, 松浦 恭和, 門田 有希, 西田 英隆, 平山 隆志, 加藤 鎌司

    育種学研究   24 ( 2 )   158 - 158   2022.9

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    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • サツマイモネコブセンチュウに対するレース横断的抵抗性QTLsの同定と 抵抗性選抜DNAマーカーの開発

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 磯部祥子, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    育種学研究   24 ( 2 )   32 - 32   2022.9

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    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性候補遺伝子で 見出されたシスエレメント内の配列変異

    泉谷真, 大畑慎一郎, 田淵宏朗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    育種学研究   24 ( 2 )   33 - 33   2022.9

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    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • メロンの全ゲノム解析により明らかになった葉緑体ゲノム(母系)の多様性と系統進化

    十河 奈々, 大熊 眞歩, Odirichi Nnennaya Imoh, 長井 朋美, 清古 貴, 武藤 千秋, 内藤 健, 門田 有希, 杉山 充啓, 鴫田 玄太郎, 田中 克典, 西田 英隆, 川頭 洋一, 友岡 憲彦, 加藤 鎌司

    育種学研究   24 ( 2 )   18 - 18   2022.9

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    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • Identification of genetic loci controlling the SRKN resistance with GWAS using novel Ipomoea trifida genome sequence as a reference in sweetpotato

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 磯部祥子, 門田有希

    育種学研究   24 ( 1 )   28 - 28   2022.3

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    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • Identification and characterization of endophytic microorganisms in barley root

    木代勝元, 最相大輔, 山下純, 山地直樹, 山本敏央, 門田有希, 持田恵一, 中川智行, 谷明生

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2022   2022.3

  • サツマイモのSSII 遺伝子における新規原因変異の同定

    志茂 暉月, 多田 健太郎, 田中 勝, 小林 晃, 門田 有希

    育種学研究   24 ( 1 )   112 - 112   2022.3

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • ゲノム解析で解き明かすサクラ品種「ソメイヨシノ」のルーツ

    白澤 健太, 江角 智也, 板井 章浩, 畠山 勝徳, 高品 善, 八鍬 拓司, 住友 克彦, 黒倉 健, 深井英吾, 佐藤 慶一, 島田 武彦, 白武 勝裕, 細川 宗孝, 門田 有希, 草場 信, 池上 秀利, 磯部祥子

    育種学研究   24 ( 1 )   16 - 16   2022.3

     More details

    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • ある一つのサツマイモ品種において抵抗性反応の異なる2つの線虫レース(SP1, SP2)に 応答する網羅的な遺伝子発現解析

    泉谷 真, 大畑 慎一郎, 田淵 宏朗, 門田 有希

    育種学研究   24 ( 1 )   111 - 111   2022.3

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • DNA解析で品種を守る Invited

    門田 有希

    アグリバイオ 2021年12月臨時増刊号   5 ( 44 )   6 - 7   2021.12

     More details

    Authorship:Lead author, Corresponding author   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (trade magazine, newspaper, online media)  

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  • Discovery of genetic regions controlling the southern root-knot nematode resistance in hexaploid sweetpotato and comparison of analytical results among races

    栗原未結, 小畠望美, 田淵宏朗, 白澤健太, 門田有希

    育種学研究   23 ( 2 )   27 - 27   2021.9

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性を制御する新規候補遺伝子の同定と原因変異の探索

    泉谷 真, 大畑 慎一郎, 田淵 宏朗, 門田 有希

    育種学研究   23 ( 2 )   69 - 69   2021.9

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • レトロトランスポゾンを利用したDNAマーカーの開発とその応用 Invited

    門田有希

    アグリバイオ   5 ( 4 )   23 - 27   2021.4

     More details

    Authorship:Lead author   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (trade magazine, newspaper, online media)  

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  • ナノポアシーケンシングを用いたサツマイモ澱粉の特性変化を引き起こす原因変異の探索

    多田 健太郎, 田中 勝, 小林 晃, 牛島 幸一郎, 門田 有希

    育種学研究   23 ( 1 )   114 - 114   2021.3

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author  

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  • Historical and Recent Progress in Genetic Linkage Analysis of Hexaploid Sweetpotato Invited

    Yuki Monden

    Sweetpotato Research Front   ( 36 )   6 - 6   2021.2

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • Development of PCR-Based DNA Markers Associated with Resistance to Southern Root-Knot Nematode in Sweetpotato

    Tabuchi, H, Sasai, R, Shirasawa, K, Kishimoto, K, Sato, S, Okada, Y, Kuramoto, A, Kobayashi, A, Isobe, S, Tahara, M, Monden, Y

    Sweetpotato Research Front   ( 36 )   3 - 3   2021.2

     More details

    Publishing type:Internal/External technical report, pre-print, etc.  

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  • Genetic Analysis of Agronomic Traits in Sweetpotato using Genome-Wide SNP.

    Haque, E, Tabuchi, H, Monden, Y, Suematsu, K, Shirasawa, K, Isobe, S, Tanaka, M

    Sweetpotato Research Front   ( 36 )   4 - 4   2021.2

     More details

    Publishing type:Internal/External technical report, pre-print, etc.  

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  • 作物における品種識別技術の開発と遺伝育種学的解析 Invited

    門田 有希

    JATAFFジャーナル   9 ( 4 )   23 - 29   2021

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • 倍数体用新規GWAS法を利用したサツマイモネコブセンチュウレー スSP2抵抗性に関する遺伝領域の同定

    小畠 望美, 笹井 瑠美, 田淵 宏朗, 山本 英司, 白澤 健太, 田原 誠, 門田 有希

    育種学研究   23 ( 1 )   40 - 40   2021

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • Genetic diversity analysis and selection of core collection candidates based on genome-wide GBS-SNPs in melon genetic resources

    鴫田玄太郎, 鴫田玄太郎, PHUONG DUNG Tran, PERVIN Mst. Naznin, NNENNAYA IMOH Odirichi, 門田有希, 西田英隆, 田中克典, 杉山充啓, 川頭洋一, 加藤鎌司

    育種学研究   22 ( 2 )   82 - 82   2020.9

  • サツマイモ澱粉の低温糊化性に関連するSSII遺伝子の配列解析

    多田 健太郎, 田中 勝, 小林 晃, 門田 有希

    育種学研究   22 ( 2 )   151 - 151   2020.9

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • Legume Genomics

    R. S. Bhat, Kenta Shirasawa, Yuki Monden, H. Yamashita, M. Tahara

    Methods in Molecular Biology   2020

  • ゲノムワイドなGBS-SNPsデータに基づくキュウリ遺伝資源の多様性解析とコアコレクション候補の選定

    鴫田玄太郎, PHUONG DUNG Tran, PERVIN Mst.Naznin, 西田英隆, 門田有希, 杉山充啓, 田中克典, 加藤鎌司

    育種学研究   21 ( 2 )   75 - 75   2019.9

     More details

    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関するRNA-seq解析

    大畑 慎一郎, 牛島 幸一郎, 田淵 宏朗, 田原 誠, 門田 有希

    育種学研究   21 ( 2 )   172 - 172   2019.9

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • レトロトランスポゾンGret1を用いた4倍体ブドウ品種識別DNAマーカーの開発

    高田 翔太, 藤田 景子, 門田 有希, 福永 健二

    育種学研究   21 ( 2 )   152 - 152   2019.9

     More details

    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • RNA-seqを利用したサツマイモゾウムシ類抵抗性に関与する発現遺伝子の網羅的解析

    軒原 香乃子, 岡田 吉弘, 大畑 慎一郎, 門田 有希

    育種学研究   21 ( 2 )   171 - 171   2019.9

     More details

    Authorship:Last author, Corresponding author   Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • Application of Next Generation Sequencing (NGS) technologies for polyploid crops Invited

    Tsuyoshi Tanaka, Sachiko N. Isobe, Yuki Monden, Goro Ishikawa, Jun Sese

    Breeding Research   21 ( 1 )   55 - 60   2019.6

     More details

    Language:Japanese   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    DOI: 10.1270/jsbbr.21.w02

    CiNii Article

    CiNii Books

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  • ゲノムワイド SNPマーカーを用いたサツマイモ(Ipomoea batatas)農業形質のGWASおよびQTL解析

    ハク エムダドウル, 田淵 宏朗, 門田 有希, 末松 恵祐, 白澤 健太, 磯部 祥子, 田中 勝

    育種学研究   21 ( 1 )   2019.3

     More details

    Publishing type:Research paper, summary (national, other academic conference)  

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  • かんしょにおけるGWAS解析の試み―収量性およびゾウムシ類被害低減に関連するゲノム領域の解析―

    岡田吉弘, 門田有希, 文屋慧亮, 田原誠

    沖縄農業研究会大会講演要旨・総会資料   57th   31‐32   2018.8

     More details

    Language:Japanese  

    J-GLOBAL

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  • サツマイモ塊根におけるGWASを用いた着色ゲノム領域の探索

    木村拓海, 田中勝, 白澤健太, 磯部祥子, 田原誠, 門田有希

    育種学研究   20   181   2018.3

     More details

    Language:Japanese  

    J-GLOBAL

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  • Genetic analysis technology based on retrotransposons via high-throughput sequencing platform Invited

    Breeding Research   20 ( 2 )   185 - 191   2018

     More details

    Authorship:Lead author  

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  • ゲノムワイドなSNPsデータを用いた国内外のメロン382系統の多様性・類縁関係の解析

    鴫田玄太郎, NAZNIN Pervin Mst., DUNG Tran Phuong, 西田英隆, 門田有希, 杉山充啓, 田中克典, 加藤鎌司

    育種学研究   20   2018

  • サツマイモネコブセンチュウに対する3種類の抵抗性評価指標の比較

    田淵宏朗, 小林晃, 門田有希, 岸本和樹, 田原誠, 岡田吉弘

    Nematological Research   47 ( 2 )   43   2017.12

     More details

    Language:Japanese  

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  • 六倍体サツマイモにおけるゲノムワイドな多型情報を利用したネコブセンチュウ抵抗性選抜マーカーの開発

    笹井瑠美, 岸本和樹, 白澤健太, 田淵宏朗, 岡田吉弘, 藏本晃栄, 小林晃, 磯部祥子, 田原誠, 門田有希

    育種学研究   19   32   2017.10

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    Language:Japanese  

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  • サツマイモ立枯病抵抗性遺伝子の同定に向けた高密度連鎖地図の作成およびQTL解析

    相川祥胤, 白澤健太, 岡田吉弘, 謝花治, 藏本晃栄, 今井佑美, 磯部祥子, 田原誠, 門田有希

    育種学研究   19   193   2017.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • 農作物・食品の品種判別検査技術の開発 -日本の大切な品種を守るために-

    門田有希

    化学と生物   55 ( 12 )   817 - 824   2017

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  • Southern root-knot nematode race SP6 is divided into two races

    Tabuchi Hiroaki, Kuranouchi Toshikazu, Kobayashi Akira, Monden Yuki, Kishimoto Kazuki, Tahara Makoto, Okada Yoshihiro, Iwahori Hideaki

    Nematological Research (Japanese Journal of Nematology)   47 ( 2 )   29 - 33   2017

     More details

    Language:English   Publisher:The Japanese Nematological Society  

    <p>The southern root-knot nematode (SRKN) includes at least nine races, SP1 to SP9, which were identified based on their different responses to five differential sweetpotato cultivars, ' Norin-1', ' Norin-2', 'Tanegashimamurasaki-7', 'Elegant Summer', and 'J-Red'. In this study, we propose a modified method for SRKN race identification in which the threshold of response is 10 egg masses instead of the two-egg-mass threshold used in the original method, when a sweetpotato plant was inoculated with 500 second-stage juveniles. According to this method, two isolates of SP6, Okiishi-12 and Ishigaki-2, showed the same response to each of these five cultivars. We found, however, that three sweetpotato cultivars, 'Murasakimasari', 'Suzukogane', and 'Chienoha', were resistant to the Okiishi-12 isolate and susceptible to the Ishigaki-2 isolate. These results indicated that the Okiishi-12 and Ishigaki-2 isolates were distinct and that SP6 included at least two races. We suggest that the Okiishi-12 and Ishigaki-2 isolates should be distinguished by sub-numbers and designated SP6-1 and SP6-2, respectively. Five isolates of SP6 collected from a sweetpotato field in Chiba prefecture were examined, and all of them were identified as SP6-1.</p>

    DOI: 10.3725/jjn.47.29

    CiNii Article

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    Other Link: https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010921264

  • サツマイモの澱粉生合成関連酵素遺伝子中に存在する変異の探索

    田中勝, 片山健二, 門田有希, 磯部祥子, 甲斐由美

    育種学研究   19   2017

  • サツマイモネコブセンチュウレースSP6のサブグループ

    田淵宏朗, 小林晃, 門田有希, 岸本和樹, 田原誠, 岡田吉弘, 岩堀英晶

    Nematological Research   46 ( 2 )   95   2016.12

     More details

    Language:Japanese  

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  • サツマイモ立枯病抵抗性遺伝子の同定に向けた高密度連鎖地図の作成

    相川祥胤, 白澤健太, 藏本晃栄, 今井佑美, 磯部祥子, 田原誠, 岡田吉弘, 謝花治, 門田有希

    育種学研究   18   245   2016.9

     More details

    Language:Japanese  

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  • サツマイモネコブセンチュウ(Meloidogyne incognita)抵抗性遺伝子の同定に向けた高密度連鎖地図の構築

    岸本和樹, 白澤健太, 笹井瑠美, 藏本晃栄, 磯部祥子, 田原誠, 岡田吉弘, 田淵宏朗, 小林晃, 門田有希

    育種学研究   18   249   2016.9

     More details

    Language:Japanese  

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  • イネstay‐green突然変異体dcd1の分子遺伝学的解析

    山谷浩史, 上妻馨梨, 中野道治, 林依子, 高見常明, 加藤裕介, 門田有希, 熊丸敏博, 奥本裕, 坂本亘, 坂本亘, 阿部知子, 草場信, 草場信

    育種学研究   18   196   2016.9

     More details

    Language:Japanese  

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  • アメリカでの研究生活を振り返って

    門田 有希

    表面科学   37 ( 10 )   513 - 514   2016

     More details

  • Be happy with your Perl scripts

    Kobayashi Masaaki, Monden Yuki, Mochizuki Takako, Kudo Toru, Terashima Shin, Nakamura Yukino, Nakamura Yasukazu, Yano Kentaro

    Breeding Research   18 ( 1 )   27 - 33   2016

     More details

    Language:Japanese   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    DOI: 10.1270/jsbbr.18.27

    CiNii Article

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    Other Link: https://jlc.jst.go.jp/DN/JLC/20021779242?from=CiNii

  • サツマイモ品種「ジェイレッド」におけるサツマイモネコブセンチュウ抵抗性の遺伝解析

    田淵宏朗, 小林晃, 門田有希, 謝花治, 翁長彰子, 岸本和樹, 田原誠, 岡田吉弘

    Nematological Research   45 ( 2 )   132‐133   2015.12

     More details

    Language:Japanese  

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  • Screening of retrotransposon Rtsp-1 insertion sites useful as DNA markers for identification of sweetpotato cultivar "Beniharuka"

    TANAKA Masaru, MONDEN Yuki, TAHARA Makoto, KAI Yumi, OKADA Yoshihiro, TAKAHATA Yasuhiro

    日本作物学会九州支部会報   ( 81 )   43 - 45   2015.5

     More details

    Language:Japanese   Publisher:日本作物学会九州支部  

    供試したサツマイモ主要品種の中で「べにはるか」に特異的なRtsp-1挿入箇所INS1が得られ,「べにはるか」の品種判別用DNAマーカーの開発に有用と考えられた.ただし,親品種である「春こがね」でも増幅が認められたことから,「春こがね」との判別が必要な場合は,「春こがね」で増幅の見られない挿入箇所INS2の利用などの検討も必要である.

    CiNii Article

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  • Introduction of NIG supercomputer with command line-based NGS analysis

    Kaminuma Eli, Mochizuki Takako, Monden Yuki, Kobayashi Masaaki, Ohyanagi Hajime, Yano Kentaro

    Breeding Research   17 ( 2 )   88 - 93   2015

     More details

    Language:Japanese   Publisher:Japanese Society of Breeding  

    DOI: 10.1270/jsbbr.17.88

    CiNii Article

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    Other Link: https://jlc.jst.go.jp/DN/JLC/20012694561?from=CiNii

  • 次世代シーケンスを利用したサツマイモにおける品種間挿入多型を示す新規レトロトランスポゾンのスクリーニング

    今井佑美, 門田有希, 岡田吉弘, 謝花治, 小林晃, 田淵宏朗, 田原誠

    育種学研究   16   208   2014.9

     More details

    Language:Japanese  

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  • サツマイモ品種「べにはるか」の品種判別マーカー開発のためのレトロトランスポゾンRtsp‐1挿入箇所のスクリーニング

    田中勝, 門田有希, 田原誠, 甲斐由美, 岡田吉弘, 高畑康浩

    九州農業研究発表会専門部会発表要旨集   77th   50   2014.8

     More details

    Language:Japanese  

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  • 次世代シーケンスを用いた活動型レトロトランスポゾンの挿入多型解析によるサツマイモ連鎖地図開発

    原拓也, 門田有希, 岡田吉弘, 謝花治, 小林晃, 田淵宏朗, 田原誠

    育種学研究   16   130   2014.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • On‐site検査を実現するSTHクロマトPAS法を利用した品種識別技術の開発

    門田有希, 高崎一人, 川瀬三雄, 秋竹広翔, 田原誠, 布藤聡

    育種学研究   16   57   2014.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • 色素原料用紫サツマイモ品種の判別に利用可能なレトロトランスポゾン挿入部位の選定

    田中勝, 門田有希, 山本彩加, 進藤彰子, 田原誠, 岡田吉弘, 高畑康浩

    育種学研究   16   159   2014.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • STHクロマトPASを利用した色素生産用サツマイモ品種判別法の開発

    高崎一人, 田中勝, 峯岸恭孝, 川瀬三雄, 門田有希, 田原誠, 布藤聡

    日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)   2014   3C01A15 (WEB ONLY)   2014.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • 突然変異に食の未来を託す

    築山 拓司, 齊藤 大樹, 内藤 健, 寺石 政義, 門田 有希, 谷坂 隆俊

    Gamma field symposia   ( 50 )   1 - 18   2014.3

     More details

    Language:English   Publisher:Institute of Radiation Breeding, Ministry of Agriculture & Forestry  

    Mendelの遺伝法則の再発見(1900)を契機として、遺伝学に基礎を置く科学的育種が始まり、これによってイネやコムギを中心に作物の品種改良は急速な勢いで進展した。しかし、1990年代に入ると、この伸びは急に鈍化し、食の確保に対する不安がにわかに現実のものとなってきた。近年のイネ、コムギの多収化は、半矮性という草型を基本骨格とし、収穫指数を高めることによって実現した。しかし、収穫指数が上限に達したとみられる今日、従来の半矮性遺伝子を利用した育種を行う限り、これ以上の多収は望めないとみられている。このため、多収を実現する新規有用遺伝子の開発が世界的な重要課題となっており、これには突然変異の誘発が大きな役割を担うと考えられている。突然変異には、自然突然変異と誘発突然変異とがあるが、分子あるいは染色体レベルでそれらを特徴づけることはできない。人間は長い間、自然突然変異を利用して作物改良を行ってきた。これらの遺伝資源が利用尽くされつつある今、新たな有用遺伝子の開発を誘発突然変異に求めることは自然のなりゆきであろう。本報告では、まず、農業上有用な遺伝子の大半が地球上から消失することがあっても、放射線や化学変異原、さらにはゲノム中に存在する転移因子によってそれらとほぼ同じ機能(表現型)をもつ同類対立遺伝子を誘発できることを、台湾の稲作に著しい生産性の向上と安定とをもたらした、基本栄養成長相遺伝子座Ef1座の機能喪失型アレル1ef1と同類対立遺伝子の関係にある誘発突然変異アレルef1-h、およびわが国イネ品種の出穂期の変異に関わるHd17座の劣性アレルより機能喪失度の大きい同座の誘発突然変異アレルef7、さらに、緑の革命のイネ版に寄与した半矮性遺伝子d47(自然突然変異)の同類対立遺伝子d49(t)およびsd1を例にとって説明する。つぎに、突然変異原処理によって新たな有用遺伝子が誘発できることを、日長感応性を完全に消失させ、著しい早生化をもたらす遺伝子se13を例にとって、また、これまで有用性が認識されていなかった遺伝子のなかにも視点を変えれば有用遺伝子になる可能性のある遺伝子があることを、中国における固定型ジャポニカ品種の超多収化に貢献する直立穂遺伝子EPを例にとって説明する。また、転移因子のなかでも、その数の多さから遺伝子やゲノムの進化に大きく関わっていると考えられているMITE(miniature inverted-repeat transposable elements)のなかで現在、もっとも活発に転移を繰り返しているイネのmPingの発見の経緯とその遺伝学的特徴、さらにその育種上の利用について説明する。

    CiNii Article

    CiNii Books

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  • Induced mutations will help mold the future of food

    Tsukiyama T, Saito H, Naito K, Teraishi M, Monden Y, Tanisaka T

    Gamma Field Symposia   50   1 - 19   2014.3

     More details

  • カンキツゲノム情報を利用したLTRレトロトランスポゾンの品種間多型の解析

    清水徳朗, 田原誠, 門田有希, 野中圭介, 今井篤, 吉岡照高

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   36th   2P-0006 (WEB ONLY)   2013

     More details

    Language:Japanese  

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  • イネトランスポゾンmPingの転移を活性化する染色体領域の同定

    YOSHIDA YURI, TSUKIYAMA TAKUJI, MONDEN YUKI, TERAISHI MASAYOSHI, TANISAKA TAKATOSHI, OKUMOTO YUTAKA

    育種学研究   14   45   2012.9

     More details

    Language:Japanese  

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  • Gene regulatory network formation by a massive amplification of a rice transposon

    Ken Naito, Yuki Monden, Yutaka Okumoto, Ssan R. Wessler

    GENES & GENETIC SYSTEMS   86 ( 6 )   391 - 391   2011.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)   Publisher:GENETICS SOC JAPAN  

    Web of Science

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  • 転移因子の爆発的増殖による新たな遺伝子制御網の形成

    NAITO KEN, MONDEN YUKI, OKUMOTO YUTAKA, WESSLER SUSAN R

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   83rd   66   2011.8

     More details

    Language:Japanese  

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  • mPingはなぜ転移するのか?―エピジェネティックな制御機構から逸脱したイネ転移因子Pingの影響―

    MONDEN YUKI, NAITO KEN, WESSLER SUSAN R, OKUMOTO YUTAKA

    日本植物生理学会年会要旨集   52nd   169   2011.3

     More details

    Language:Japanese  

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  • Induced mutations will help mold the future of food

    Tsukiyama T, Saito H, Naito K, Teraishi M, Monden Y, Tanisaka T

    Gamma Field Symp.   50   1 - 19   2011

     More details

    Language:English   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (bulletin of university, research institution)  

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  • mPingはなぜ転移するのか?―エピジェネティックな制御機構から逸脱したイネ転移因子Pingの影響―

    MONDEN YUKI, NAITO KEN, CHEN TIANLE, WESSLER SUSAN R, OKUMOTO YUTAKA

    育種学研究   12   28   2010.9

     More details

    Language:Japanese  

    J-GLOBAL

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  • Identification of transcripts with mPing sequence in rice

    Journal of crop research   ( 54 )   99 - 102   2009

     More details

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Presentations

  • 倍数性作物種における遺伝育種学的解析と品種保護に向けた技術開発の紹介 Invited

    門田有希

    日本農芸化学会中四国支部創立20周年記念第32回若手研究者シンポジウム  2021.7.30 

     More details

    Event date: 2021.7.30

    Language:Japanese   Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • ナノポアシーケンシングを用いたサツマイモ澱粉の特性変化を引き起こす原因変異の探索

    多田健太郎・田中勝・小林晃・牛島 幸一郎・門田有希

    日本育種学会第139回講演会 

     More details

    Event date: 2021.3.19 - 2021.3.21

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン  

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  • 倍数体用新規GWAS法を利用したサツマイモネコブセンチュウレースSP2抵抗性に関する遺伝領域の同定

    小畠望美・笹井瑠美・田淵宏朗・山本英司・白澤健太・田原誠・門田有希

    日本育種学会第139回講演会 

     More details

    Event date: 2021.3.19 - 2021.3.21

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン  

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  • ゲノムワイドな多型情報を利用したサツマイモ品種識別マーカーの開発

    柿木茉歩・田中勝・ハクエムダドゥル・白澤健太・磯部祥子・門田有希

    第12回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2020.12.12

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:オンライン  

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  • サツマイモ澱粉の低温糊化性に関する遺伝様式の解明と原因変異の探索

    多田健太郎・田中勝・小林晃・門田有希

    第12回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2020.12.12

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:オンライン  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性を制御する新規候補遺伝子の配列解析

    泉谷真・大畑慎一郎・田淵宏朗・門田有希

    第12回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2020.12.12

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:オンライン  

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  • 倍数体用新規GWAS法を利用したサツマイモネコブセンチュウレースSP2抵抗性に関する遺伝領域の同定

    小畠望美・笹井瑠美・田淵宏朗・山本英司・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第12回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2020.12.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン  

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  • 高次倍数性作物種における遺伝育種学的解析と品種識別技術の開発

    門田 有希

    第19回 日本農学進歩賞受賞講演会 

     More details

    Event date: 2020.11.27

    Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:東京大学 弥生講堂  

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  • サツマイモネコブセンチュウ発生土壌における微生物叢の経時的変化

    田中瑞穂・田淵宏朗・鈴木崇之・田原誠・門田有希

    日本DNA多型学会 第29回学術集会 

     More details

    Event date: 2020.11.26 - 2020.11.27

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:東京  

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  • 16S rRNAアンプリコンシーケンスを利用した サツマイモの病害および線虫害土壌における微生物叢解析

    中島陽佳・石毛太一郎・横田健治・藏之内利和・百田洋二・米本謙悟・田原誠・門田有希

    日本DNA多型学会 第29回学術集会 

     More details

    Event date: 2020.11.26 - 2020.11.27

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京  

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  • ゲノムワイドなGBS-SNPsに基づくメロン遺伝資源の多様性解析とコアコレクション候補の選定

    鴫田玄太郎, Phuong Dung Tran, Pervin Mst. Naznin, Nnennaya Imoh Odirichi, 門田有希, 西田英隆, 田中克典, 杉山充啓, 川頭洋一, 加藤鎌司

    日本育種学会 第138回講演会 

     More details

    Event date: 2020.10.10 - 2020.10.11

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン  

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  • サツマイモ澱粉の低温糊化性に関連するSSII遺伝子の配列解析

    多田健太郎,田中勝,小林晃,門田有希

    日本育種学会 第138回講演会 

     More details

    Event date: 2020.10.10 - 2020.10.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:オンライン  

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  • NGS-based genetic and transcriptome analyses for sweetpotato breeding programs International conference

    Yuki Monden

    Symposium on Application of Advanced Technologies In Agriculture (AATA) 

     More details

    Event date: 2020.10.2

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:オンライン  

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  • RNA-seqを利用したサツマイモゾウムシ類抵抗性に関与する発現遺伝子の網羅的解析

    軒原香乃子・岡田吉弘・大畑慎一郎・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • 赤潮原因藻ヘテロシグマの系統地理学的マーカーの確立を目指した研究

    妹尾美紀・平松諒也・Anette Engesmo・Brian D. Bill・Vera L. Trainer・長井敏・門田有希・植木尚子

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • KASPジェノタイピングアッセイを利用したサツマイモ澱粉合成関連遺伝子のdosage予測システムの開発

    多田健太郎・田中勝・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • レトロトランスポゾン挿入多型を利用したサツマイモ品種識別マーカーの開発

    原田瑞生・田中勝・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • GBS-SNPsデータに基づくキュウリ遺伝資源の遺伝的多様性・集団構造解析 ~コアコレクションの開発に向けて~

    鴫田玄太郎・Tran Phuong Dung・Mst. Naznin Pervin・田中克典・杉山充啓・門田有希・西田英隆・加藤鎌司

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ感染時におけるサツマイモの遺伝子発現解析

    大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウレースSP2に対する抵抗性選抜DNAマーカーの開発

    小畠望美・笹井瑠美・田淵宏朗・山本英司・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • 高タンパク質含量イネ品種の育成にむけたEG4系統におけるトランスポゾンmPingの挿入部位解析

    田中佑奈・吉川貴徳・門田有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • QTL-seqを利用したサツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関する遺伝領域の同定

    青野 育美・笹井 瑠美・高木 宏樹・門田 有希

    第11回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2019.12.21 - 2019.12.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • KASPジェノタイピングアッセイを利用したサツマイモ澱粉合成関連遺伝子のdosage予測システムの開発

    多田健太郎・田中勝・門田有希

    いも類研究会(第33回) 

     More details

    Event date: 2019.12.5 - 2019.12.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州労働金庫宮崎支店労働福祉会館  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の同定に向けた最近の研究成果

    大畑慎一郎・小野菜奈・田淵宏朗・牛島幸一郎・田原誠・門田有希

    いも類研究会(第33回) 

     More details

    Event date: 2019.12.5 - 2019.12.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州労働金庫宮崎支店労働福祉会館  

    researchmap

  • NGSを利用した農作物品種識別技術の開発と遺伝育種学的解析

    門田 有希

    岡山大学と岡山県による共同研究に向けた情報交換会 

     More details

    Event date: 2019.11.8

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山大学農学部  

    researchmap

  • Comprehensive genome and transcriptome analyses for nematode resistance in sweetpotato (Ipomoea batatas (L.) Lam.) International conference

    Yuki Monden

    The 1st International Convolvulaceae Meeting 

     More details

    Event date: 2019.10.14 - 2019.10.16

    Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:Shanghai Chenshan Plant Science Research Center, Shanghai, China  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関する遺伝子発現解析

    大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    日本線虫学会第27回大会 

     More details

    Event date: 2019.9.11 - 2019.9.13

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:文部科学省研究交流センター  

    researchmap

  • RNA-seqを利用したサツマイモゾウムシ類抵抗性に関与する発現遺伝子の網羅的解析

    軒原香乃子・岡田吉弘・大畑慎一郎・門田有希

    日本育種学会第136回講演会 

     More details

    Event date: 2019.9.6 - 2019.9.7

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:近畿大学(奈良キャンパス)  

    researchmap

  • レトロトランスポゾンGret1を用いた4倍体ブドウ品種識別DNAマーカーの開発

    高田翔太・藤田景子・門田有希・福永健二

    日本育種学会第136回講演会 

     More details

    Event date: 2019.9.6 - 2019.9.7

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:近畿大学(奈良キャンパス)  

    researchmap

  • サツマイモ塊根におけるアントシアニン含量、デンプン含量および乾物率の遺伝解析

    ハク エムダドウル、田淵宏朗、境垣内兵雄、岡田吉弘、西中未央、門田有希、白澤健太、磯部祥子、田中勝

    日本育種学会第136回講演会 

     More details

    Event date: 2019.9.6 - 2019.9.7

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:近畿大学(奈良キャンパス)  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関するRNA-seq解析

    大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    日本育種学会第136回講演会 

     More details

    Event date: 2019.9.6 - 2019.9.7

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:近畿大学(奈良キャンパス)  

    researchmap

  • ゲノムワイドなGBS-SNPsデータに基づくキュウリ遺伝資源の多様性解析とコアコレクション候補の選定

    鴫田玄太郎、Phuong Dung Tran, Pervin Mst. Naznin, 西田英隆、門田有希、杉山充啓、田中克典、加藤鎌司

    日本育種学会第136回講演会 

     More details

    Event date: 2019.9.6 - 2019.9.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:近畿大学(奈良キャンパス)  

    researchmap

  • Large-scale genome and transcriptome analyses for sweet potato breeding International conference

    Yuki Monden

    MERU UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY-JICA/NACOSTI BIOTECHNOLOGY RESEARCH WORKSHOP PROGRAM 

     More details

    Event date: 2019.8.30

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:INNOVATION CENTER BOARDROOM  

    researchmap

  • Large-scale genome and transcriptome analyses for sweet potato breeding International conference

    Yuki Monden

    NACOSTI/JSPS BILATERAL RESEARCH SPECIAL JOINT SEMINAR 

     More details

    Event date: 2019.8.28

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:IPIC Main Seminar Room, JKUAT Main Campus  

    researchmap

  • A Simple Approach for Genetic Mapping in Polyploids Based on Allelic Dosage Estimates from RAD-Seq Data International conference

    Eiji Yamamoto, Kenta Shitasawa, Yuki Monden, Masaru Tanaka and Sachiko Isobe

    PAG ASIA2019 

     More details

    Event date: 2019.6.6 - 2019.6.8

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:China  

    researchmap

  • RNA-seqを利用したサツマイモネコブセンチュウ感染時における大規模トランスクリプトーム解析

    大畑慎一郎・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    第10回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2018.12.15 - 2018.12.16

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウレースSP2に対する抵抗性選抜DNAマーカーの開発

    小畠望美・笹井瑠美・田淵宏朗・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第10回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2018.12.15 - 2018.12.16

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • Iso-Seqを利用したサツマイモの高精度な完全長cDNA配列の構築

    小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・大畑慎一郎・田原誠・門田有希

    第10回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2018.12.15 - 2018.12.16

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • GWASを利用したサツマイモゾウムシ抵抗性および収量性を制御する遺伝領域の同定

    軒原香乃子・岡田吉弘・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第10回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2018.12.15 - 2018.12.16

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • GWASを利用したサツマイモ塊根の皮色に関わる遺伝領域の同定

    木村拓海・田中勝・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第10回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2018.12.15 - 2018.12.16

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • 高速シーケンサーを利用した種々作物種における遺伝解析とその応用

    門田 有希

    東京農業大学総合研究所研究会 生命科学研究部会 講演会 

     More details

    Event date: 2018.12.10

    Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:東京農業大学世田谷キャンパス  

    researchmap

  • レトロトランスポゾンマーカーによる作物品種判定

    田原誠、門田有希

    日本DNA多型学会第27回学術集会 

     More details

    Event date: 2018.12.5 - 2018.12.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:松江イングリッシュガーデン  

    researchmap

  • 現場検査を可能にする農作物品種識別法

    門田 有希

    BioJapan 2018 

     More details

    Event date: 2018.10.10 - 2018.10.12

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:パシフィコ横浜  

    researchmap

  • NGSで6倍体サツマイモの形質関連 領域を同定する

    門田 有希

    日本育種学会第134回講演会 

     More details

    Event date: 2018.9.22 - 2018.9.24

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 6倍体サツマイモにおけるゲノムワイドな遺伝解析

    門田 有希

    第1回 植物インフォマティクス研究集会 

     More details

    Event date: 2018.9.10

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:明治大学  

    researchmap

  • Genome-wide Genetic Analysis for Several Agronomical Traits in Sweetpotato International conference

    Yuki Monden

    8th International Sweetpotato Symposium 

     More details

    Event date: 2018.9.5 - 2018.9.8

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:Jeonju city, Korea  

    researchmap

  • RNA-seq based transcriptome analysis associated with root-knot nematode resistance in sweetopotato International conference

    Shinichiro Ohata1, Koichiro Ushijima1, Hiroaki Tabuchi2, Makoto Tahara1, Yuki Monden

    8th International Sweetpotato Symposium 

     More details

    Event date: 2018.9.5 - 2018.9.8

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeonju city, Korea  

    researchmap

  • Genome-wide association study for identifying genomic regions controlling tuberous root color in sweetpotato International conference

    Takumi Kimura1, Masaru Tanaka2, Kenta Shirasawa3, Sachiko Isobe3, Makoto Tahara1, Yuki Monden

    8th International Sweetpotato Symposium 

     More details

    Event date: 2018.9.5 - 2018.9.8

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeonju city, Korea  

    researchmap

  • Iso-Seq analysis for constructing full length cDNAs in sweetpotato International conference

    Nana Ono1, Koichiro Ushijima1, Hiroaki Tabuchi2, Shinichiro Ohata1, Makoto Tahara1, Yuki Monden

    8th International Sweetpotato Symposium 

     More details

    Event date: 2018.9.5 - 2018.9.8

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeonju city, Korea  

    researchmap

  • 高次倍数性植物に対するゲノムワイドな遺伝解析法 -サツマイモ(2n=6x=90)での大規模解析例-

    門田 有希

    日本植物細胞分子生物学会大会 

     More details

    Event date: 2018.8.26 - 2018.8.28

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:金沢商工会議所会館  

    researchmap

  • サツマイモ塊根におけるGWASを用いた着色ゲノム領域の探索

    木村拓海・田中勝・白澤健太・磯部祥子・田原誠・門田有希

    日本育種学会第133回講演会 

     More details

    Event date: 2018.3.25 - 2018.3.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:九州大学  

    researchmap

  • Iso-Seqを用いたサツマイモの完全長cDNA配列の構築および新規遺伝子の探索

    小野 菜奈・牛島 幸一郎・田淵 宏朗・田原 誠・門田 有希

    日本育種学会第133回講演会 

     More details

    Event date: 2018.3.25 - 2018.3.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:九州大学  

    researchmap

  • 高速シーケンサーによるレトロトランスポゾン遺伝解析技術の開発とその活用

    門田有希

    日本育種学会第133回講演会 

     More details

    Event date: 2018.3.25 - 2018.3.26

    Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:九州大学  

    researchmap

  • サツマイモ立枯病抵抗性選抜DNAマーカーの開発

    文屋慧亮・相川祥胤・白澤健太・岡田吉弘・謝花治・藏本晃栄・今井佑美・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第9回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2017.11.25 - 2017.11.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:広島大学  

    researchmap

  • GWASによるサツマイモ塊根の着色に関するゲノム領域の同定

    木村拓海・田中勝・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第9回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2017.11.25 - 2017.11.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:広島大学  

    researchmap

  • サツマイモ(2n=6x=90)における高密度連鎖地図を用いたネコブセンチュウ抵抗性関連マーカーの開発

    笹井瑠美・田淵宏朗・岸本和樹・白澤健太・岡田吉弘・藏本晃栄・小林晃・磯部祥子・田原誠・門田有希

    第9回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2017.11.25 - 2017.11.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:広島大学  

    researchmap

  • レトロトランスポゾン挿入部位を利用したイチゴの品種判定マーカーの開発

    船引健史・石川涼子・進藤彰子・門田有希・田原誠

    第9回日本育種学会中国地域談話会 

     More details

    Event date: 2017.11.25 - 2017.11.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:広島大学  

    researchmap

  • Iso-Seqを利用したサツマイモの高精度な完全長cDNA配列の構築

    小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    第9回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2017.11.25 - 2017.11.26

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:広島大学  

    researchmap

  • 非モデル作物における遺伝解析とロングリードシーケンスを利用したIso-seq解析

    門田有希

    Annotathon2017 生命科学データベースの利用価値向上のためのアノテーションマラソン 

     More details

    Event date: 2017.11.16 - 2017.11.17

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:国立遺伝学研究所  

    researchmap

  • Genetic analysis using next-generation sequencing technology in crop species International conference

    Yuki Monden

    Okayama University - Hue University Joint Symposium on Education and Research Programs for Environmental and Agricultural Sciences 

     More details

    Event date: 2017.11.5 - 2017.11.6

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:The Hue Learning Resource Center (LRC), Hue University  

    researchmap

  • 六倍体サツマイモにおける ゲノムワイドな多型情報を利用した ネコブセンチュウ抵抗性選抜マーカーの開発

    笹井瑠美, 岸本和樹, 白澤健太, 田淵宏朗, 岡田吉弘, 藏本晃栄, 小林晃, 磯部祥子, 田原誠, 門田有希

    日本育種学会第132回講演会 

     More details

    Event date: 2017.10.7 - 2017.10.8

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岩手大学  

    researchmap

  • Iso-Seqを利用したサツマイモにおける高精度な完全長cDNA配列の構築

    小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・田原誠・門田有希

    日本育種学会第132回講演会 

     More details

    Event date: 2017.10.7 - 2017.10.8

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岩手大学  

    researchmap

  • サツマイモの病害・線虫害抵抗性品種の育成に向けた遺伝解析

    門田有希

    かんしょゲノム研究最前線 

     More details

    Event date: 2017.6.29

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:沖縄県農業研究センター  

    researchmap

  • Investigation of the mutations in the genes related to starch properties of sweetpotato International conference

    Masaru Tanaka, Kenji Katayama, Yuki Monden, Sachiko Isobe, Yumi Kai

    Plant and Animal Genome Conference in Asia 

     More details

    Event date: 2017.5.29 - 2017.5.31

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Seoul, South Korea  

    researchmap

  • QTL Analyses and Genome Wide Association Study for Several Agronomical Traits in Sweetpotato International conference

    Yuki Monden

    Plant and Animal Genome Conference in Asia 

     More details

    Event date: 2017.5.29 - 2017.5.31

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:Seoul, South Korea  

    researchmap

  • イネstay-green 遺伝子DCD1 の単離と機能解析

    山谷 浩史, 上妻 馨, 中野 道治, 林 依子, 高見 常明, 門田 有希, 奥本 裕, 坂本 亘, 阿 部 知子, 草場 信

    日本育種学会 第131会講演会 

     More details

    Event date: 2017.3.29 - 2017.3.30

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名古屋大学  

    researchmap

  • サツマイモの澱粉生合成関連酵素遺伝子中に存在する変異の探索

    田中 勝,片山 健二,門田 有希,磯部 祥子,甲斐 由美

    日本育種学会 第131回講演会 

     More details

    Event date: 2017.3.29 - 2017.3.30

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:名古屋大学  

    researchmap

  • サツマイモ立枯病抵抗性遺伝子の同定に向けた高密度連鎖地図の作成およびQTL 解析

    相川 祥胤,白澤 健太,岡田 吉弘,謝花 治,藏本 晃栄,今井 佑美,磯部 祥子,田原 誠,門田 有希

    日本育種学会 第131回講演会 

     More details

    Event date: 2017.3.29 - 2017.3.30

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:名古屋大学  

    researchmap

  • NGSを利用したサツマイモ(Ipomoea batatas)における高密度連鎖地図の構築

    相川祥胤、白澤健太、岡田吉弘、謝花治、藏本晃栄、今井佑美、磯部祥子、田原誠、門田有希

    第9回アサガオ研究集会 

     More details

    Event date: 2017.3.4 - 2017.3.5

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:名城大学  

    researchmap

  • High Density Linkage Map Construction for Identifying Gene(s) Associated with Soil Rot Resistance in Sweetpotato International conference

    Yuki Monden

    Plant & Animal Genome Conference 

     More details

    Event date: 2017.1.14 - 2017.1.18

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:San Diego  

    researchmap

  • SNP情報を用いたサツマイモ立枯病抵抗性に関わるゲノム領域の同定

    相川祥胤、白澤健太、藏本晃栄、今井佑美、磯部祥子、田原誠、岡田吉弘、謝花治、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • GBS法を利用したメロン遺伝資源の多様性および類縁関係の解析

    鴫田 玄太郎、Mst. Naznin Pervin、西田 英隆、門田 有希、杉山 充啓、田中 克典、加藤 鎌司

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • イネstay-green突然変異体dcd1の分子遺伝学的解析

    山谷浩史,上妻 馨梨,中野 道治,林 依子,高見 常明,加藤 裕介,門田 有希,熊丸 敏博,奥本 裕,坂本 亘,阿 部 知子,草場 信

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • サツマイモ栽培品種と野生種の交配集団における形態的特徴

    木村拓海、田中勝、磯部祥子、田原誠、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • 成り行きでインフォマの世界へ飛び込んでみたらこうなった!

    門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ(Meloidogyne incognita)抵抗性遺伝子の同定に向けた遺伝解析

    本和樹、白澤健太、笹井瑠美、藏本晃栄、磯部祥子、田原誠、岡田吉弘、田淵宏朗、小林晃、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウおよびサツマイモ立枯病感染土壌におけるメタゲノム解析

    中島陽佳、石毛太一郎、藏之内利和、百田洋二、米本謙吾、田原誠、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • STHクロマトPAS法によるアズキ加工製品からの試験的な品種判定検査

    笹井瑠美、高崎一人、田原誠、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • レトロトランスポゾン挿入部位を利用した紫サツマイモにおける品種識別マーカーの開発

    小野菜奈、岸本和樹、田原誠、門田有希

    第8回 中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2016.12.10 - 2016.12.11

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山県倉敷市資源植物科学研究所  

    researchmap

  • NGSを利用したサツマイモにおける高密度連鎖地図の構築

    門田有希

    平成28年度(第30回)いも類研究会 

     More details

    Event date: 2016.12.8 - 2016.12.9

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:大分県別府市  

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  • 外国産コムギ品種を識別する技術の開発

    門田有希, 民本麻梨, 田原誠, 梅野佑太, 野口晃司

    日本DNA多型学会第25回学術集会 

     More details

    Event date: 2016.11.30 - 2016.12.2

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京大学海洋研究所  

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  • STHクロマトPASを利用したアズキ加工食品における品種判定法の検討

    笹井瑠美, 門田有希, 田原 誠, 高崎一人

    日本DNA多型学会第25回学術集会 

     More details

    Event date: 2016.11.30 - 2016.12.2

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:東京大学海洋研究所  

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  • Construction of a high-density linkage map for identifying root-knot nematode (Meloidogyne incognita) resistance gene in sweetpotato International conference

    Kazuki Kishimoto, Kenta Shirasawa, Rumi Sasai, Akihide Kuramoto, Sachiko Isobe, Makoto Tahara, Yoshihiro Okada, Hiroaki Tabuchi Akira Kobayashi, Yuki Monden

    7th China-Japan-Korea International Sweetpotato Workshop 

     More details

    Event date: 2016.10.11 - 2016.10.13

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jinan, China  

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  • 16S metagenomics analysis of microbiome communities in root-knot nematode (Meloidogyne incognita) and Streptomyces ipomoea infected soils International conference

    Nakashima Haruka, Ishige Taichirou, Kuranouchi Toshikazu, Momota Youji, Yonemoto Kengo, Tahara Makoto, Monden Yuki

    7th China-Japan-Korea International Sweetpotato Workshop 

     More details

    Event date: 2016.10.11 - 2016.10.13

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jina, China  

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  • イネstay green突然変異体dcd1の分子遺伝学的解析

    山谷浩史、上妻馨梨、中野道治、林依子、高見常明、加藤祐介、門田有希、内藤健、熊丸敏博、奥本裕、坂本亘、阿部知子、草場信

    日本育種学会第130回講演会 

     More details

    Event date: 2016.9.24 - 2016.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウおよびサツマイモ立枯病感染土壌における16S メタゲノム解析

    中島陽佳、石毛太一郎、藏之内利和、百田洋二、米本謙吾、田原誠、門田有希

    日本育種学会第130会講演会 

     More details

    Event date: 2016.9.24 - 2016.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • サツマイモ立枯病抵抗性遺伝子の同定に向けた高密度連鎖地図の作成

    相川祥胤、白澤健太、藏本晃栄、今井佑美、磯部祥子、田原誠、岡田吉弘、謝花治、門田有希

    日本育種学会第130回講演会 

     More details

    Event date: 2016.9.24 - 2016.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

    researchmap

  • GBS法を利用したメロン遺伝資源の多様性解析

    Mst. Naznin Pervin、鴫田玄太郎、西田英隆、門田有希、杉山充啓、田中克典、加藤鎌司

    日本育種学会第130回講演会 

     More details

    Event date: 2016.9.24 - 2016.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウレースSP6のサブグループ

    田淵宏朗・小林晃・門田有希・岸本和樹・田原誠・岡田吉弘・岩堀英晶

    2016 年度日本線虫学会大会(第 24 回大会) 

     More details

    Event date: 2016.9.14 - 2016.9.16

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京農工大  

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  • 16Sメタゲノム解析を利用した病害土壌における微生物相解析

    門田有希, 中島陽佳, 田原誠, 石毛太一郎, 藏之内利和, 百田洋二, 米本謙吾

    東京農業大学生物資源ゲノム解析拠点シンポジウム・研究発表会「NGS情報をどう活かすか、基礎から応用まで」 

     More details

    Event date: 2016.9.6

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:東京農業大学  

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  • 16Sメタゲノム解析を利用したサツマイモネコブセンチュウ発病土壌における微生物相の網羅的解析

    門田有希、中島陽佳、藏之内利和、田原誠

    日本育種学会 第129回講演会 

     More details

    Event date: 2016.3.21 - 2016.3.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:横浜市立大学  

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  • Exploitation of active transposons in wheat and related species

    ウビ ベンジャミン、ゴラフィ ヤシル、金俊植、門田有希、辻本壽

    日本育種学会 第129回講演会 

     More details

    Event date: 2016.3.21 - 2016.3.22

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜市立大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の同定に向けた連鎖地図の構築

    岸本和樹・笹井瑠美・門田有希・岡田吉弘・田淵宏朗・小林晃・謝花治・翁長彰子・磯部祥子・平川英樹・白澤健太・田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • Insertion site polymorphisms of the Stowaway miniature inverted-repeat transposable elements family infer different strata of evolutionary relationships in the Triticum - Aegilops complex

    Benjamin Ewa Ubi, Yasir Serag Alnor Mohammed, Yuki Monden, Makoto Tahara and Hisashi Tsujimoto

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ感染・非感染土壌における16Sメタゲノム解析

    中島陽佳・門田有希・蔵之内利和・田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • NGSを利用したレトロトランスポゾン挿入多型に基づくシイタケ品種判定マーカーの開発

    湯浅まり恵、門田有希、田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • サツマイモ立枯病抵抗性遺伝子の同定に向けた連鎖地図の作成およびQTL解析

    相川祥胤・今井佑美・門田有希・岡田吉弘・謝花治・翁長彰子・田淵宏朗・小林晃・田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • NGSを利用した活動型レトロトランスポゾンファミリー同定と連鎖解析への応用

    藏本晃栄・今井佑美・門田有希・岡田吉弘・田淵宏朗・小林晃・謝花治・翁長彰子・田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ(Meloidogyne incognita)抵抗性遺伝子の同定に向けた連鎖解析

    笹井瑠美・岸本和樹・門田有希・岡田吉弘・田淵宏朗・小林晃・謝花治・翁長彰子・磯部祥子・平川英樹・白澤健太・田原 誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • 銘柄として流通する外国産小麦の品種構成を推測する技術の開発

    民本麻梨・門田有希・梅野佑太・田原誠

    第7回中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2015.12.19 - 2015.12.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • 高速シーケンサーを利用した農作物の遺伝解析

    門田 有希

    2015年度女性研究者シーズ発信会 

     More details

    Event date: 2015.12.18

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学創立50周年記念館  

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  • 高次倍数性作物種における連鎖解析とその他研究トピックスの紹介

    門田有希

    第一回農学中手の会 

     More details

    Event date: 2015.12.12 - 2015.12.13

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:小田原箱根商工会議所  

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  • 耐乾性育種に向けたコムギ異種添加系統におけるトランスポゾンMITEの遺伝解析

    門田有希, YasirSeragAlnorMahommed, 辻本壽

    共同利用・共同研究拠点 鳥取大学乾燥地研究センター 平成27年度共同研究発表会 

     More details

    Event date: 2015.12.5 - 2015.12.6

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学乾燥地研究センター  

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  • DNAクロマトを利用したアズキ品種識別法の開発

    高崎一人、リズティアン、門田有希、田原誠、布藤聡

    日本DNA多型学会大24回学術集会 

     More details

    Event date: 2015.11.19 - 2015.11.20

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学  

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  • レトロトランスポゾン挿入多型を利用したリンゴの品種識別マーカーの開発

    西谷千佳子、山本俊哉、藤井浩、岡田和馬、門田有希、田原誠

    日本DNA多型学会大24回学術集会 

     More details

    Event date: 2015.11.19 - 2015.11.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモ品種識別に利用可能なレトロトランスポゾンRtsp-1挿入箇所の選定

    田中勝、岡田吉弘、高畑康浩、門田有希、田原誠

    日本DNA多型学会大24回学術集会 

     More details

    Event date: 2015.11.19 - 2015.11.20

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 動く遺伝子を利用した農作物の遺伝解析とその応用

    門田 有希

    農学部植物研研究交流会 

     More details

    Event date: 2015.11.5

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山大学農学部  

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  • 動く遺伝子を利用した植物の系統分類また食品検査技術の開発

    門田 有希

    第6回 食品薬学シンポジウム 

     More details

    Event date: 2015.10.30 - 2015.10.31

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ発生土壌における16S rRNA メタゲノム解析

    中島陽佳、門田有希、藏之内利和、田原誠

    ゲノム微生物学会若手の会 

     More details

    Event date: 2015.10.29 - 2015.10.30

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:八王子セミナーハウス  

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  • 次世代シークエンサーを利用したレトロトランスポゾン挿入部位の網羅的な配列決定とその園芸作物における遺伝解 析技術への応用

    田原誠、門田有希

    園芸学会 平成27年度秋季大会 

     More details

    Event date: 2015.9.26 - 2015.9.28

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:徳島大学  

    researchmap

  • STHクロマトPAS法による簡易且つ高感度なDNA検出

    田原誠、門田有希

    日本育種学会 第128回講演会 

     More details

    Event date: 2015.9.11 - 2015.9.12

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:新潟大学  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の同定に向けた連鎖解析

    岸本 和樹, 笹井 瑠美, 門田 有希, 岡田 吉弘,田淵 宏朗,小林 晃,謝花 治,翁長彰子,磯部 祥子,平川 英樹,白澤 健太,田原 誠

    日本育種学会 第128回講演会 

     More details

    Event date: 2015.9.11 - 2015.9.12

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:新潟大学  

    researchmap

  • Perl講習会 Be happy with your Perl scripts 「Perl基礎実習」

    矢野健太郎、門田有希、望月孝子、工藤徹、小林正明

    日本育種学会 第128回講演会 

     More details

    Event date: 2015.9.2 - 2015.9.12

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:新潟大学  

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  • サツマイモ品種「ジェイレッド」におけるサツマイモネコブセンチ ュウ抵抗性の遺伝解析

    田淵宏朗 ・小林晃 ・門田有希 ・謝花治 ・翁長彰子 ・岸本和樹 ・田原誠 ・岡田吉弘

    線虫学会 

     More details

    Event date: 2015.9.2 - 2015.9.4

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:中部大学  

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  • Exploiting the miniature inverted-repeat transposable elements (MITEs) insertion polymorphisms as an efficient DNA marker system in wheat International conference

    Benjamin Ewa Ubi, Yasir Serag Alnor Mohammed, Yuki Monden, Makoto Tahara and Hisashi Tsujimoto

    28th Annual International Conference of the Biotechnology Society of Nigeria 

     More details

    Event date: 2015.8.24 - 2015.8.29

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:Nigeria  

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  • バイオインフォマティクス講習会Ⅲ 「Perlプログラミングレッスン(初級編)」

    矢野健太郎、門田有希、中村保一、小林正明、工藤徹

    第33回 日本植物細胞分子生物学会 

     More details

    Event date: 2015.7.10 - 2015.7.12

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:東京大学  

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  • メタゲノム解析を利用した土壌病虫害選抜マーカーの開発

    門田有希、中島陽佳、藏之内利和、田原誠

    NGS 現場の会 第四回研究会 

     More details

    Event date: 2015.7.1 - 2015.7.3

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:つくば国際会議場  

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  • 高次倍数体作物のマーカー育種とゲノムデータ活用

    門田有希

    植物科学研究を農業用作物にどのように繋ぐか 

     More details

    Event date: 2015.6.30

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:ビジョンセンター東京  

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  • 次世代シーケンスを利用したサツマイモにおける品種間挿入多型を示す新規レトロトランスポゾンのスクリーニング

    今井佑美,門田有希,岡田吉弘,謝花治,小林晃,田淵宏朗,田原誠

    中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2014.12.20 - 2014.12.21

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学 乾燥地研究センター  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性遺伝子の同定に向けた連鎖地図の構築

    岸本和樹,門田有希,岡田吉弘,謝花治,小林晃,田淵宏朗,田原誠

    中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2014.12.20 - 2014.12.21

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学 乾燥地研究センター  

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  • シイタケ(Lentinula edodes)におけるレトロトランスポゾン挿入多型を利用した High-throughputな品種判定マーカーの開発

    湯浅まり恵,門田有希,田原誠

    中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2014.12.20 - 2014.12.21

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学 乾燥地研究センター  

    researchmap

  • NGSを利用した農作物のレトロトランスポゾン解析

    門田有希,田原誠

    中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2014.12.20 - 2014.12.21

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学 乾燥地研究センター  

    researchmap

  • ddRAD seqを用いたサツマイモにおける大規模SNPマーカーの開発

    相川祥胤,門田有希,田原誠

    中国地域育種談話会 

     More details

    Event date: 2014.12.20 - 2014.12.21

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:鳥取大学 乾燥地研究センター  

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  • サツマイモ立枯病およびネコブセンチュウ抵抗性に関する遺伝解析のアップデート情報

    門田有希, 岸本和樹, 今井佑美, 田原誠

    いも類研究会 

     More details

    Event date: 2014.12.11 - 2014.12.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:都城グリーンホテル  

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  • Targeted sequencing of active retrotransposon insertion sites for efficient DNA fingerprinting in sweet potato International conference

    Yuki Monden, Ayaka Yamamoto, Akiko Shindo, Makoto Tahara

    NARO Interantional Syposium 2014; New Era of Sweetpotato Research in East Asia (6th Japan - China - Korea Sweetpotato Workshop) 

     More details

    Event date: 2014.11.28 - 2014.11.30

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Kagoshima, Japan  

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  • Innovations of NGS (Next-Generation Sequencer) applications on retrotransposon analyses created distinctive genetic methods for sweet potato International conference

    Makoto Tahara, Yuki Monden

    NARO Interantional Syposium 2014; New Era of Sweetpotato Research in East Asia (6th Japan - China - Korea Sweetpotato Workshop) 

     More details

    Event date: 2014.11.28 - 2014.11.30

    Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    Venue:Kagoshima, Japan  

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  • A novel method for screening retrotransposons that show high insertion polymorphism among sweet potato cultivars via high-throughput sequencing platform International conference

    Yumi Imai, Yuki Monden, Yoshihiro Okada, Osamu Jahana, Akira Kobayashi, Hiroaki Tabuchi, Makoto Tahara

    NARO Interantional Syposium 2014; New Era of Sweetpotato Research in East Asia (6th Japan - China - Korea Sweetpotato Workshop) 

     More details

    Event date: 2014.11.28 - 2014.11.30

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Kagoshima, Japan  

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  • シイタケ (Lentinula edodes) におけるレトロトランスポゾン挿入多型を 利用した High-Throughput な品種判定マーカーの開発

    湯浅 まり恵,門田 有希,田原 誠

    日本DNA多型学会 第23回学術集会 

     More details

    Event date: 2014.11.27 - 2014.11.28

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:愛知県名古屋市  

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  • パインアップルにおけるレトロトランスポゾン挿入多型マーカー開発と品種識別 への適用

    奈島 賢児,寺上 伸吾,國久 美由紀,西谷 千佳子,正田 守幸, 竹内 誠人,浦崎 直也,太郎良 和彦,門田 有希,田原 誠, 山本 俊哉

    日本DNA多型学会 第23回学術集会 

     More details

    Event date: 2014.11.27 - 2014.11.28

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:愛知県名古屋市  

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  • 動く遺伝子 × NGSによる農作物の遺伝解析

    門田有希、田原誠

    生命情報科学若手の会 第6回研究会 

     More details

    Event date: 2014.10.29 - 2014.10.30

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:理化学研究所発生・再生科学総合研究センター(CDB)  

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  • 次世代シーケンスを利用したサツマイモにおける品種間挿入多型を示す新規レトロトランスポゾンのスクリーニング

    今井 佑美, 門田 有希, 岡田 吉弘, 謝花 治, 小林 晃, 田淵 宏朗, 田原 誠

    日本育種学会 第126回講演会 

     More details

    Event date: 2014.9.26 - 2014.9.27

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:南九州大学  

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  • 大規模レトロトランスポゾン多型情報を利用した南米およびオセアニア在来サツマイモ遺伝資源の系統ネットワーク解析

    門田有希, 田原谷薫, 印東道子, 斎藤成也, 田原誠

    日本育種学会 第126回講演会 

     More details

    Event date: 2014.9.26 - 2014.9.27

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:南九州大学  

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  • 遺伝研スパコンとコマンドラインでのNGSデータ使い倒し講座

    神山英理, 門田有希, 矢野健太郎

    日本育種学会 第126回講演会 

     More details

    Event date: 2014.9.25 - 2014.9.26

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:南九州大学  

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  • NGSを利用したレトロトランスポゾンの同定 および多型解析

    門田 有希

    植物NGSの最先端 

     More details

    Event date: 2014.7.9

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:国立遺伝学研究所  

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  • 次世代シーケンスを用いた活動型レトロトランスポゾンの挿入多型解析によるサツマイモ連鎖地図作成

    原拓也、門田有希、岡田吉弘、謝花治、小林晃、田淵宏明、田原誠

    日本育種学会 第125回講演会 

     More details

    Event date: 2014.3.21 - 2014.3.22

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東北大学  

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  • NGS使い倒し講座 –Breeding Informatics 研究 XII NGSデータ解析入門講座

    門田有希

    日本育種学会 第125回講演会 インフォマティクス研究集会 

     More details

    Event date: 2014.3.21 - 2014.3.22

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:東北大学  

    researchmap

  • On-site検査を実現するSTHクロマトPAS法を利用した品種識別技術の開発

    門田有希、高崎 一人、川瀬 三雄、秋竹 広翔、田原 誠、布藤 聡

    日本育種学会 第125回講演会 

     More details

    Event date: 2014.3.21 - 2014.3.22

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東北大学  

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  • サツマイモ活性型レトロトランスポゾン挿入部位のターゲットシーケンスによる効率的なGenotyping

    門田有希、山本彩加、進藤彰子、田原誠

    いも類研究会 

     More details

    Event date: 2013.12.5 - 2013.12.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:熊本  

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  • 次世代シーケンス解析を利用した活動型レトロトランスポゾン挿入部位情報によるサツマイモ連鎖地図開発

    原拓也、門田有希、田原誠

    いも類研究会 

     More details

    Event date: 2013.12.5 - 2013.12.6

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:熊本  

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  • カンキツゲノム情報を利用したLTRレトロトランスポゾンの品種間多型の解析

    清水 徳朗,田原 誠,門田 有希,野中 圭介,今井 篤,吉岡 照高

    分子生物学会 

     More details

    Event date: 2013.12.3 - 2013.12.6

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:パシフィコ横浜  

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  • 新規活性型レトロトランスポゾンTriRe-1の挿入多型を利用した,High-throughputなコムギ品種判定マーカーの開発

    門田有希、高井健、田原誠、梅野佑太、中村遼太

    日本DNA多型学会 第22回学術集会 

     More details

    Event date: 2013.11.20 - 2013.11.22

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:仙台  

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  • 次世代シーケンスによる品種識別性に優れたダイズ・レトロトランスポゾンファミリーの選定

    田原誠、門田有希、佐伯恵理佳

    日本DNA多型学会 第22回学術集会 

     More details

    Event date: 2013.11.20 - 2013.11.22

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:仙台  

    researchmap

  • 農作物種における活性型転移因子を利用した遺伝解析

    門田有希

    バイテク果樹研究集会 

     More details

    Event date: 2013.10.24 - 2013.10.25

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:広島・福山市  

    researchmap

  • Benchtop型シーケンサーを利用した非モデル作物種における効率的なGenotyping

    門田有希、山本彩加、進藤彰子、田原誠

    日本育種学会 第124回講演会 

     More details

    Event date: 2013.10.12 - 2013.10.13

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:鹿児島大学  

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  • Development of the molecular markers based on retrotransposon polymorphism for discriminating of strawberry cultivars International conference

    Symposium on Plant Gentic Resources in East Asia 

     More details

    Event date: 2013.9.24 - 2013.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • Toward the construction of a linkage map in polyploid crop species using active retrotransposon insertions International conference

    Symposium on Plant Gentic Resources in East Asia 

     More details

    Event date: 2013.9.24 - 2013.9.25

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • Active Restrotransposon in Crop Species;Identification and Application to the Genetic Analysis via High-throughput Sequencing International conference

    Symposium on Plant Gentic Resources in East Asia 

     More details

    Event date: 2013.9.24 - 2013.9.25

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • Novel techniques for identifying active LTR retrotransposon families via high-throughput sequencing of PBS sites International conference

    Yuki Monden, Kentaro Yamaguchi, Makoto Tahara

    Plant Genome Evolution 

     More details

    Event date: 2013.9.8 - 2013.9.10

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Amsterdam, Netherland  

    researchmap

  • 野外操作実験とRNA-seqによる樹木の温暖化への応答解析

    宮崎祐子、門田有希、中路達郎、日浦勉

    NGS現場の会第三回研究会 

     More details

    Event date: 2013.9.3 - 2013.9.4

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:神戸国際会議場  

    researchmap

  • Novel techniques for identifying active retrotransposon family using high-throughput sequencing of PBS sites International conference

    Yuki Monden, Kentaro Yamaguchi, Makoto Tahara

    Plant Genome Congress 

     More details

    Event date: 2013.5.14 - 2013.5.15

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:London, England  

    researchmap

  • 次世代シーケンスによるコムギ染色体欠損系統の新規活性型レトロトランスポゾン座乗部位解析

    高井健、田原誠、門田有希

    日本育種学会 

     More details

    Event date: 2013.3.27 - 2013.3.28

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京農業大学  

    researchmap

  • 次世代シーケンスを利用した活動型レトロトランスポゾンファミリーの新規同定方法の確立

    門田有希、山口健太郎、田原誠

    日本育種学会 

     More details

    Event date: 2013.3.27 - 2013.3.28

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:東京農業大学  

    researchmap

  • Transcriptome analysis of flowering and fruiting under the experimental warming in Quercus serrata

    Yuko Miyazaki, Yuki Monden, Tatsuro Nakaji, Tsutom Hiura

    日本植物生理学会 

     More details

    Event date: 2013.3.21 - 2013.3.23

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 野外操作実験による樹木の温暖化への応答:コナラにおけるトランスクリプトーム解析

    宮崎祐子、門田有希、中路達郎、日浦勉

    日本生態学会 

     More details

    Event date: 2013.3.6 - 2013.3.8

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:静岡  

    researchmap

  • 次世代シーケンスによるコムギ染色体欠損系統の新規活性型レトロトランスポゾン座乗部位解析

    高井健、田原誠、門田有希

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 農作物種における新規活動型レトロトランスポゾンの同定とその利用

    門田有希

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 次世代シーケンスによる活動型LTRレトロトランスポゾンの新規同定法の確立

    山口健太郎、門田有希、田原誠

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • イチゴにおけるレトロトランスポゾン品種識別マーカーの開発

    秋竹広翔、田原誠、門田有希

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 活動型レトロトランスポゾン挿入部位を利用した高次倍数性作物における連鎖地図開発

    原拓也、門田有希、田原誠

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • レトロトランスポゾン挿入部位解析によるサツマイモYen系統のポリネシアへの伝播の解明

    田原谷薫、門田有希、田原誠

    中国育種談話会 

     More details

    Event date: 2012.12.8 - 2012.12.9

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:岡山大学  

    researchmap

  • 活動型レトロトランスポゾン挿入部位を利用した高次倍数性作物における連鎖地図作成

    原拓也、門田有希、田原誠

    いも類研究会 

     More details

    Event date: 2012.12.6 - 2012.12.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:宮崎  

    researchmap

  • 活動型レトロトランスポゾンを利用したアントシアニン含有紫サツマイモ品種識別用DNAマーカーの開発

    山本彩加、門田有希、田原誠

    いも類研究会 

     More details

    Event date: 2012.12.6 - 2012.12.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:宮崎  

    researchmap

  • 活性型レトロトランスポゾンを利用したアントシアニン含有紫サツマイモ品種識別用DNAマーカーの開発

    門田有希、山本彩加、田原誠

    DNA多型学会 

     More details

    Event date: 2012.11.18 - 2012.11.19

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都  

    researchmap

  • イチゴにおけるレトロトランスポゾン品種識別マーカーの開発

    秋竹広翔、田原誠、門田有希、高崎一人、布藤聡

    DNA多型学会 

     More details

    Event date: 2012.11.18 - 2012.11.19

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:京都  

    researchmap

  • Transcriptome analysis of flowering and fruiting under the experimental warming in Quercus serrata International conference

    Yuko Miyazaki, Yuki Monden, Tatsuro Nakaji, Tsutom Hiura

    IUFRO 2012 conference; Genetics of Fagaceae and Nothofagaceae 

     More details

    Event date: 2012.10.9 - 2012.10.12

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:France  

    researchmap

  • Cultivar identification DNA markers for purple sweet potato using active retrotranposon Rtsp-1 and LIb insertion polymorphisms International conference

    Yuki Monden, Ayaka Ymamoto, Makoto Thara

    5th Korea-China-Japan Sweet potato Workshop 

     More details

    Event date: 2012.9.17 - 2012.9.18

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeju  

    researchmap

  • Sweetpotato Dispersion to Polymesian islands Before Columbus Based on Retrotransposon Insertion Analysis International conference

    Kaori Taharadani, Yuki Monden, Makoto Tahara, Yukimi Hirashima, Mishiko Intou

    5th Korea-China-Japan Sweet potato Workshop 

     More details

    Event date: 2012.9.17 - 2012.9.18

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeju  

    researchmap

  • Genome-wide DNA sequencing by the next-generation sequence for the insertion sites of the active sweet potato retrotransposon, Rtsp-1 International conference

    Makoto Tahara, Yuki Monden, Yukimi Hirashima

    5th Korea-China-Japan Sweet potato Workshop 

     More details

    Event date: 2012.9.17 - 2012.9.18

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:Jeju  

    researchmap

  • イネトランスポゾンmPingの転移を活性化する染色体領域の同定

    吉田由梨、築山拓司、門田有希、寺石政義、谷坂隆俊、奥本裕

    日本育種学会第122回講演会 

     More details

    Event date: 2012.9.14 - 2012.9.15

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都産業大学  

    researchmap

  • 加工食品に含まれる原料農作物品種検査技術の開発

    門田有希

    第17回岡山リサーチパーク研究・展示発表会 

     More details

    Event date: 2012.9.10

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

    Venue:テクノサポート岡山  

    researchmap

  • Understanding and Application of Rice Transposable Element mPing International conference

    Symposium on Diverse Pharmacological Substances and Plant Genetic Resources in East Asia 

     More details

    Event date: 2012.8.10

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    researchmap

  • 転移因子の爆発的増殖胃による新たな遺伝子制御網の形成

    内藤健、門田有希、奥本裕、Susan R Wessler

    日本遺伝学会第83回年会 

     More details

    Event date: 2011.9.20 - 2011.9.22

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:京都大学  

    researchmap

  • 動的なゲノム進化:全ゲノムシークエンスにより明らかにされた、イネ近縁品種間の大規模なゲノム構造変異

    門田有希、Yuan Yaowu、内藤健、奥本裕、Susan R Wessler

    日本育種学会第119回講演会 

     More details

    Event date: 2011.3.29 - 2011.3.30

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:横浜市立大学  

    researchmap

  • mPingはなぜ転移するのか?―エピジェネティックな制御機構から逸脱したイネ転移因子Pingの影響―

    門田有希、内藤健、Susan R Wessler, 奥本裕

    日本育種学会第118回講演会 

     More details

    Event date: 2010.9.24 - 2010.9.25

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:秋田県立大学  

    researchmap

  • イネトランスポゾンmPingおよびPingの転移制御機構解明に向けて

    門田有希

    日本育種学会第115回講演会グループ研究集会 

     More details

    Event date: 2009.3.27 - 2009.3.28

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    Venue:つくば国際会議場  

    researchmap

  • イネ自律性トランスポゾンPingの発現解析

    門田有希、内藤健、築山拓司、奥本裕、谷坂隆俊

    近畿作物・育種研究会 

     More details

    Event date: 2008.12.13

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:神戸大学  

    researchmap

  • mPing挿入をもつ遺伝子の転写産物の構造の解析

    稲垣晴香、築山拓司、奥本裕、門田有希、Shanta Karki、齊藤大樹、中崎哲也、谷坂隆俊

    日本育種学会第114回講演会 

     More details

    Event date: 2008.10.11 - 2008.10.12

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:北海道大学  

    researchmap

  • ジャポニカ品種間の遺伝解析に有効なmPingの挿入多型を利用したDNAマーカーの開発

    門田有希、内藤健、奥本裕、齊藤大樹、大木信彦、出田収、築山拓司、中崎哲也、谷坂隆俊

    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ 

     More details

    Event date: 2008.7.4 - 2008.7.5

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学  

    researchmap

  • mPingSCARマーカーを用いた突然変異遺伝子のマッピングシステムの構築

    齊藤大樹、浅見武人、袁清波、門田有希、内藤健、奥本裕、谷坂隆俊

    イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ 

     More details

    Event date: 2008.7.4 - 2008.7.5

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:九州大学  

    researchmap

  • mPingSCARマーカーを用いた早生突然変異遺伝子se14およびse15のマッピング

    浅見武人、奥本裕、齊藤大樹、袁清波、門田有希、谷坂隆俊

    近畿作物・育種研究会 

     More details

    Event date: 2008.6.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都工芸繊維大学  

    researchmap

  • mPing配列を含んで転写される遺伝子の同定

    稲垣晴香、築山拓司、門田有希、Shanta Karki、奥本裕、中崎哲也、寺石政義、谷坂隆俊

    近畿作物・育種研究会 

     More details

    Event date: 2008.6.7

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:京都工芸繊維大学  

    researchmap

  • mPingSCAR markers: a resolution to saturated linakge map construction using japonica x japonica cross International conference

    Yuki Monden, Ken Naito, Yutaka Okumoto, Tetsuya Nakazaki, Hiroki Saito, Nobuhiko Oki, Osamu Ideta, Tetsuya Nakazaki and Takatoshi Tanisaka

    The 5th International Symposium of Rice Functional Genomics 

     More details

    Event date: 2007.10.15 - 2007.10.17

    Presentation type:Poster presentation  

    Venue:つくば国際会議場  

    researchmap

  • mPingSCARマーカーはジャポニカイネ品種間の分子マーカーとして極めて有効である

    門田有希、内藤健、奥本裕、築山拓司、齊藤大樹、大木信彦、出田収、中崎哲也、谷坂隆俊

    日本育種学会第112回講演会 

     More details

    Event date: 2007.9.22 - 2007.9.23

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:山形大学  

    researchmap

  • mPingSCARマーカーを利用したイネ出穂期遺伝子座E2の同定

    齊藤大樹、門田有希、奥本裕、内藤健、大木信彦、袁清波、出田収、谷坂隆俊

    日本育種学会第112回講演会 

     More details

    Event date: 2007.9.22 - 2007.9.23

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:山形大学  

    researchmap

  • イネ品種銀坊主におけるmPingの急激な増殖を引き起こした原因の究明に向けて

    内藤健、奥本裕、門田有希、大木信彦、中崎鉄也、谷坂隆俊

    日本育種学会第110回講演会 

     More details

    Event date: 2006.9.22 - 2006.9.23

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    Venue:愛媛大学  

    researchmap

  • オオムギ匍匐性は、異なる作用を示す3つのQTLによる複合形質である

    福嶋七海・松浦恭和・門田有希・西田英隆・平山隆志・加藤鎌司

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性品種「ジェイレッド」が持つレース横断的QTLsの同定 と抵抗性選抜DNAマーカーの開発

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 磯部祥子, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • オオムギ出穂期突然変異遺伝子の特定に向けたエキソーム解析の試み

    西田英隆, 門田有希, 加藤鎌司

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • オオムギ出穂期関連遺伝子HvELF3、HvPhyC、およびPpd-H1 に関する遺伝子間相互作用の解 析

    板谷俊弥, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • Polyploid用GWAS法を利用したサツマイモの収量を制御する遺伝子座の同定

    堀田望未, 岡田吉弘, 栗原未結, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • SSII 遺伝子における機能欠損型変異はサツマイモ澱粉に低温糊化性をもたらす

    片岡育哉, 志茂暉月, 多田健太郎, 田中勝, 小林晃, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • オオムギ新規出穂期関連QTLが座乗する4H染色体候補領域の絞り込み

    大熊眞歩, 阿辻佳人, 門田有希, 加藤鎌司, 西田英隆

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • デュラムコムギにおいてPCL1 と相互作用する新規早生QTLsの解析

    藤岡明雅, 門田有希, 西田英隆, 加藤鎌司

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

    researchmap

  • 網羅的遺伝子発現解析から見えてきたサツマイモとサツマイモネコブセンチュウのせめぎ 合い

    泉谷真, 大畑慎一郎, 田淵宏朗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.10 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • Cucumis 属の全ゲノム解析により明らかになった葉緑体ゲノム(母系)の多様性と系統進化

    十河奈々, 大熊眞歩, Odirichi Nnennaya IMOH, 長井朋美, 清古貴, 武藤千秋, 内藤健, 門田有希, 杉山充啓, 鴫田玄太郎, 田中克典, 西田英隆, 川頭洋一, 友岡憲彦, 加藤鎌司

    第14回中国地域育種談話会  2022.12.10 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • サツマイモ品種の簡易・迅速な識別を可能とする DNA 検査キットの開発

    門田有希, 柿木茉歩, ハクエムダドゥル, 竹内朋幸, 高崎一人, 田中勝

    日本DNA多型学会第31回学術集会  2022.11.17 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • DNA分析によるサツマイモ加工品の品種識別の試み

    田中勝, ハクエムダドゥル, 進藤彰子, 門田有希, 田口和憲, 峯岸恭孝, 竹内朋幸, 高崎一人, 内藤嘉磯, 磯部 祥子

    日本DNA多型学会第31回学術集会  2022.11.17 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • ある一つのサツマイモ品種において抵抗性・感受性を示す2つの線虫レースに応答する遺伝子のトランスクリプトーム解析

    泉谷真, 大畑 慎一郎, 田淵宏朗, 門田有希

    第5回植物インフォマティクス研究会・年会  2022.10.18 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • Searching for causal mutations in a candidate gene associated with the southern root-knot nematode resistance in sweet potato Invited

    Makoto Izumitani, Shinichiro Ohata, Hiroaki Tabuchi, Hidetaka Nishida, Kenji Kato, Yuki Monden

    18th Japan Solanaceae Consortium Symposium, JSOL2022  2022.10.8 

     More details

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (invited, special)  

    researchmap

  • デュラムコムギにおいて PCL1 と相互作用する新 規早生 QTLs の解析

    藤岡 明雅, 門田 有希, 西田 英隆, 加藤 鎌司

    日本育種学会第142回講演会  2022.9.24 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • オオムギ匍匐性は作用が異なる 3 つの QTL が制御 する複合形質である

    福嶋 七海, 松浦 恭和, 門田 有希, 西田 英隆, 平山 隆志, 加藤 鎌司

    日本育種学会第142回講演会  2022.9.24 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性候補遺伝子で見出されたシスエレメント内の配列変異

    泉谷真, 大畑 慎一郎, 田淵宏朗, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第142回講演会  2022.9.23 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • サツマイモネコブセンチュウに対するレース横断的抵抗性QTLs の同定と抵抗性選抜DNA マーカーの開発

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 磯部祥子, 西田英隆, 加藤鎌司, 門田有希

    日本育種学会第142回講演会  2022.9.23 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

    researchmap

  • Searching for causal mutations in a candidate gene controlling the southern root-knot nematode resistance in sweetpotato

    Makoto Izumitani, Shinichiro Ohata, Hiroaki Tabuchi, Hidetaka Nishida, Kenji Kato, Yuki Monden

    9th International Sweetpotato Symposium & 5th Xuzhou World Sweetpotato Conference  2022.9.21 

     More details

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 六倍体サツマイモにおける線虫抵抗性遺伝子の同定と育種基盤技術の構築 Invited

    門田有希

    第39回日本植物バイオテクノロジー学会大会・シンポジウム「植物機能の活用・向上に向けたDX最前線」  2022.9.12 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

    researchmap

  • 六倍体サツマイモにおける有用遺伝子の同定と育種基盤の構築 Invited

    門田有希

    「どうする倍数体」オンライン研究集会  2022.8.26 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • 新規Ipomoea trifidaゲノム配列を用いたGWAS法によるサツマイモネコブセンチュウ抵抗性遺伝子座の同定

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 磯部祥子, 門田有希

    日本育種学会第141回講演会  2022.3.21 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • ある一つのサツマイモ品種において抵抗性反応の異なる2つの線虫レース(SP1, SP2)に応答する網羅的な遺伝子発現解析

    泉谷真, 大畑 慎一郎, 田淵宏朗, 門田有希

    日本育種学会第141回講演会  2022.3.21 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • サツマイモの SSII 遺伝子における新規原因変異の同定

    志茂暉月, 多田健太郎, 田中勝, 小林晃, 門田有希

    日本育種学会第141回講演会  2022.3.21 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • ゲノム解析で解き明かすサクラ品種「ソメイヨシノ」のルーツ

    白澤健太, 江角智也, 板井章浩, 畠山勝徳, 高品善, 八鍬拓司, 住友克彦, 黒倉健, 深井英吾, 佐藤慶一, 島田武彦, 白武勝裕, 細川宗孝, 門田有希, 草場信, 池上秀利, 磯部祥子

    日本育種学会第141回講演会  2022.3.20 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 倍数体用GWAS法を利用した線虫抵抗性遺伝子座の同定と比較ゲノム解析

    栗原未結, 小畠望美, 田淵宏朗, 白澤健太, 門田有希

    第13回中国地域育種談話会  2021.12.11 

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    Presentation type:Poster presentation  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関与する新規候補遺伝子の同定と原因変異の探索

    泉谷真, 大畑慎一郎, 田淵宏朗, 門田有希

    第13回中国地域育種談話会  2021.12.11 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • サツマイモ澱粉の低温糊化性に関する原因変異の特定に向けた配列解析

    志茂暉月, 多田健太郎, 田中勝, 小林晃, 門田有希

    第13回中国地域育種談話会  2021.12.11 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • 倍数体用GWAS法を利用したサツマイモネコブセンチュウ抵抗性を制御する遺伝子座の解析

    栗原未結, 小畠望美, 田淵宏朗, 白澤健太, 門田有希

    第4回植物インフォマティクス研究会・年会  2021.10.4 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 六倍体サツマイモにおける線虫抵抗性を制御する遺伝領域の同定とレース間の比較

    栗原未結, 田淵宏朗, 白澤健太, 門田有希

    日本育種学会第140回講演会  2021.9.24 

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    Language:Japanese   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性を制御する新規候補遺伝子の同定と原因変異の探索

    泉谷真, 大畑慎一郎, 田淵宏朗, 門田有希

    日本育種学会第140回講演会  2021.9.23 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • “動く遺伝子ʺを利用した農作物の遺伝解析

    門田 有希

    県立広島大学セミナー  2014.10.27 

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    Presentation type:Public lecture, seminar, tutorial, course, or other speech  

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Awards

  • 優秀発表賞

    2022.12   第14回中国地域育種談話会   網羅的遺伝子発現解析から見えてきたサツマイモとサツマイモネコブセンチュウのせめぎ合い

    泉谷真・大畑慎一郎・田淵宏朗・西田英隆・加藤鎌司・門田有希

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  • Best Presentation Award

    2022.9   9th International Sweetpotato Symposium & 5th Xuzhou World Sweetpotato Conference   Searching for causal mutations in a candidate gene controlling the southern root-knot nematode resistance in sweetpotato

    Makoto Izumitani, Shinichiro Ohata, Hiroaki Tabuchi, Hidetaka Nishida, Kenji Kato, Yuki Monden

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  • 優秀発表賞

    2021   第139回日本育種学会講演会   倍数体用新規GWAS法を利用したサツマイモネコブセンチュウレースSP2抵抗性に関する遺伝領域の同定

    小畠 望美, 笹井 瑠美, 田淵 宏朗, 山本 英司, 白澤 健太, 田原 誠, 門田 有希

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  • 日本農学進歩賞

    2020   公益財団法人農学会   高次倍数性作物種における遺伝育種学的解析と品種識別技術の開発

    門田 有希

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  • 「若手農林水産研究者表彰」農林水産技術会議会長賞

    2020   農林水産省   高速シーケンサーを利用した遺伝育種学的解析と品種識別技術の開発

    門田 有希

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  • 優秀発表賞

    2020   第 12 回中国地域育種談話会の報告   倍数体用新規 G WAS 法を利用したサツマイモネコブセンチュウレース S P2 抵抗 性に関する遺伝領域の同定

    小畠望美・笹井瑠美・田淵宏朗・山本英司・白澤健太・磯部祥子・田原誠・ 門田有希

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  • 優秀発表賞

    2019   第11回中国地域育種談話会   KASPジェノタイピングアッセイを利用したサツマイモ澱粉合成関連遺伝子のdosage予測システムの開発

    多田健太郎・田中勝・門田有希

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  • 生物学研究奨励賞

    2019   公益財団法人両備檉園財団   倍数性作物種における対立遺伝子の構造予測システムの開発

    門田 有希

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  • 優秀発表賞

    2018   第10回中国地域育種談話会   Iso-Seqを利用したサツマイモの高精度な完全長cDNA配列の構築

    小野菜奈・牛島幸一郎・田淵宏朗・大畑慎一郎・田原誠・門田有希

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  • BEST Presentation Award

    2018   8th International Sweetpotato Symposium   RNA-seq based transcriptome analysis associated with root-knot nematode resistance in sweetopotato

    Shinichiro Ohata, Koichiro Ushijima, Hiroaki Tabuchi, Makoto Tahara, Yuki Monden

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  • 日本育種学会奨励賞

    2018   高速シーケンサーによるレトロトランスポゾン遺伝解析技術の開発とその活用

    門田有希

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    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2017   第9回中国地域育種談話会   サツマイモ(2n=6x=90)における高密度連鎖地図を用いたネコブセンチュウ抵抗性関連マーカーの開発

    笹井瑠美・田淵宏朗・岸本和樹・白澤健太・岡田吉弘・藏本晃栄・小林晃・磯部祥子・田原誠・門田有希

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    Country:Japan

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  • Best Presentation Award

    2016   7th China-Japan-Korea International Sweetpotato Workshop   Construction of a high-density linkage map for identifying root-knot nematode (Meloidogyne incognita) resistance gene in sweetpotato

    Kazuki Kishimoto, Kenta Shirasawa, Rumi Sasai, Akihide Kuramoto, Sachiko Isobe, Makoto Tahara, Yoshihiro Okada, Hiroaki Tabuchi Akira Kobayashi, Yuki Monden

     More details

    Country:Japan

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  • Best Presentation Award

    2016   7th China-Japan-Korea International Sweetpotato Workshop   High-density linkage map construction for identifying Streptomyces ipomoeae pathogen resistant gene in sweetpotato

    Yoshikazu Aikawa, Kenta Shirasawa, Akihide Kuramoto, Yumi Imai, Sachiko Isobe, Makoto Tahara, Yoshihiro Okada, Osamu Jahana, Yuki Monden

     More details

    Country:Japan

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  • 日本育種学会論文賞

    2016   Construction of a linkage map based on retrotransposon insertion polymorphisms in sweetpotato via high-throughput sequencing

    Yuki Monden, Takuya hara, Yoshihiro Okada, Osamu Jahana, Akira Kobayashi, Hiroaki Tabuchi, Shoko Onaga, Makoto Tahara

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    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2016   第8回中国地域育種談話会   レトロトランスポゾン挿入部位を利用した紫サツマイモにおける品種識別マーカーの開発

    小野菜奈・岸本和樹・田原誠・門田有希

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2014   第6回中国地域育種談話会   次世代シークエンスを利用したサツマイモにおける品種間挿入多型を示す新規レトロトランスポゾンのスクリーニング

    今井佑美・門田有希・岡田吉弘・謝花治・小林晃・田淵宏朗・田原誠

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  • BEST PRESENTATION AWARD

    2014   6th Japan China Korea Sweet Potato Workshop  

    Yumi Imai, Yuki Monden, Yoshihiro Okada, Osamu Jahana, Akira Kobayashi, Hiroaki Tabuchi, Makoto Tahara

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2014   第125回日本育種学会講演会   On-site検査を実現するSTHクロマトPAS法を利用した品種識別技術の開発

    門田有希・高崎一人・川瀬三雄・秋竹広翔・田原誠・布藤聡

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀研究賞

    2013   日本DNA多型学会   次世代シーケンスによる品種識別性に優れたダイズ・レトロトランスポゾンファミリーの選定

    田原誠・門田有希・佐伯恵理佳

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2013   第124回講演会日本育種学会講演会   Benchtop型シーケンサーを利用した、非モデル作物種における効率的なGenotyping

    門田有希・山本彩加・進藤彰子・田原誠

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2013   第123回日本育種学会講演会   次世代シーケンスを利用した活動型レトロトランスポゾンファミリーの新規同定方法の確立

    門田有希・山口健太郎・田原誠

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀研究賞

    2012   日本DNA多型学会   活性型レトロトランスポゾンを利用したアントシアニン含有紫サツマイモ品種識別用DNAマーカーの開発

    門田有希・山本彩加・田原誠

     More details

    Country:Japan

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  • BEST PRESENTATION AWARD

    2012   5th Korea China Japan Sweetpotato Workshop   Cultivar identification DNA markers for purple sweet potato using active retrotranposon Rtsp-1 and LIb insertion polymorphisms

    Yuki Monden, Ayaka Yamamoto, Makoto Tahara

     More details

  • 優秀発表賞

    2012   第122回日本育種学会講演会   イネトランスポゾンmPingの転移を活性化する染色体領域の同定

    吉田由梨, 築山 拓司, 門田有希, 寺石政義, 谷坂隆俊, 奥本裕

     More details

    Country:Japan

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  • 優秀発表賞

    2010   第118回日本育種学会講演会   イネトランスポゾンmPingの転移制御機構解明に向けて

    門田有希, 内藤健, T. Chen, S. Wessler, 奥本裕

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    Country:Japan

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Research Projects

  • 品種識別技術の開発

    2020.07 - 2025.03

    農林水産省  農林水産研究推進事業委託プロジェクト研究 

    磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹, 門田有希, 島田武彦, 澤村豊, 谷口 郁也, 田中勝, ハク エムダドウル, 住友克彦, 高畠令王奈, 橘田和美, 岡本充智, 山本紗綺, 三好沙季, 峯岸恭孝, 土肥伸岳, 庄司和幸, 高崎 一人, 森中理慧馨

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

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  • Development of genome editing technology to accelerate gene function analysis in the hexaploid sweet potato

    Grant number:20K05984  2020.04 - 2023.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    門田 有希, 大谷 基泰, 刑部 祐里子

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\4290000 ( Direct expense: \3300000 、 Indirect expense:\990000 )

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  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性品種育成に向けた遺伝子機能解析

    2020.04 - 2021.03

    公益財団法人ウエスコ学術振興財団  研究活動費 

    門田 有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • 品種判別マーカー開発のためのレトロトランスポゾン挿入多型情報の収集と情報解析

    2019.11 - 2020.02

    国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構  サツマイモ品種判別のための品種のDNA配列解析及び判別技術適用のための予備的試験に関する研究 

    門田有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • 倍数性作物種における対立遺伝子の構造予測システムの開発

    2019.10 - 2020.03

    公益財団法人両備檉園財団  生物学研究奨励賞 

    門田 有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • Biological sustainability of double-cropping supported by seasonal change in root microbiome

    Grant number:19KT0011  2019.07 - 2022.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    谷 明生, 山本 敏央, 山地 直樹, 山下 純, 門田 有希, 中川 智行, 最相 大輔, 持田 恵一

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    Grant amount:\18590000 ( Direct expense: \14300000 、 Indirect expense:\4290000 )

    植物の生育は植物の遺伝背景や環境要因等の相互作用の結果として捉えることができる。根圏微生物叢は植物の生育に多大な影響を与えており、逆に、植物の遺伝的背景や環境要因にも規定され、相互作用すると考えられる。本研究の目的は、圃場環境において微生物叢を含むあらゆるパラメータをデータ化し、それらの要因間のネットワークを可視化し,農業生態系としての季節変動動態を理解することである。
    研究所実験圃場の慣行区と無施肥区において、アルミニウムに対する感受性の異なるイネとオオムギの品種対を対象に、隔週で各条件3植物個体ずつ(イネは6個体)サンプリングした。環境要因として、フィールドサーバーを用いて日照、降雨、温度、湿度、風向、風速を測定した。土壌環境データとして根圏土壌を採取し、ICP-MSによる水抽出可能な元素の組成を測定し、土壌センサを用いて土壌pHを測定した。さらに土壌の根圏微生物DNAを精製し、16S rRNA遺伝子アンプリコンシーケンスを行った。
    施肥の有無によりイオン等の動態は変化し、pHは慣行区で低く、カリウム、リンは慣行区で高濃度であるが早い時期に消費された。慣行区の硫黄、無施肥区のマグネシウム、マンガン、銅が落水により増加した。同じく落水によると考えられるヒ素の増加、カドミウムの低下が無施肥区で見られた。
    微生物叢は、イネではMassilia属、Pseudomonadaceae、Oxalobacteraceaeがstar1で多い傾向が見られた。オオムギでは根圏土壌と根のサンプルで相違が見られ、根のサンプルにのみJanthinobacterium, Methylibium属細菌が多く存在することが分かった。これらはオオムギ根のエンドファイトであると考えられ、そのオオムギに対する共生機構や成長への影響に興味が持たれる。

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  • メロン交雑集団を用いた棚持ち性関連遺伝子座の特定

    Grant number:19H02948  2019.04 - 2024.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    牛島 幸一郎, 門田 有希, 中野 龍平, 池田 和生

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    Grant amount:\17160000 ( Direct expense: \13200000 、 Indirect expense:\3960000 )

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  • イネjuvenile-adult相転換期を制御するQTLの同定および育種的活用

    Grant number:19H02929  2019.04 - 2022.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    吉川 貴徳, 門田 有希, 小出 陽平, 寺石 政義, 奥本 裕

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    Grant amount:\17550000 ( Direct expense: \13500000 、 Indirect expense:\4050000 )

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  • 赤潮原因藻ヘテロシグマの系統地理学的マーカーの確立を目指した研究

    2019.04 - 2020.03

    岡山大学 資源植物科学研究所  平成31年度共同研究課題 

    植木尚子, 門田有希

      More details

  • サツマイモネコブセンチュウ抵抗性に関する実用的な選抜DNAマーカーの開発

    2019.04 - 2020.03

    公益財団法人 八雲環境科学振興財団  環境研究助成 

    門田有希, 田淵宏朗

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • 16S metagenomics analysis of microbiome communities in soils infected with root-knot nematode (Meloidogyne incognita) and Streptomyces ipomoea

    Grant number:16KT0147  2016.07 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Monden Yuki

      More details

    Grant amount:\4810000 ( Direct expense: \3700000 、 Indirect expense:\1110000 )

    Several reports suggested soil microbiome affects the transmission and emergence of infectious disease. However, there have been no reports that investigated microbiome in soils infected with soil rot disease or root-knot nematode. Thus, in this study, 16S metagenomic analyses were conducted for investigating detailed microbiome communities using soils infected with root-knot nematode and Streptomyces Ipomoeae. The V1-V2 and V3-V4 regions of 16S rRNA gene were targeted for sequencing and taxonomic classification. PCR amplification of those regions were performed for constructing an Illumina MiSeq sequencing library. The MiSeq reads were analyzed using the QIIME software. Comparison analysis of microbiome in our study suggested that microbiome communities in the same area were very similar, in contrast, those among different area were totally different. Interestingly, our results indicated that microbiome diversity was much lower in soils with infection.

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  • Iso-Seq and RNA-seq based transcriptome analyses associated with root-knot nematode resistance in sweetpotato

    Grant number:16K07557  2016.04 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Monden Yuki

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\4810000 ( Direct expense: \3700000 、 Indirect expense:\1110000 )

    Sweetpotato is one of the most important crop species in the world, and it has been required to breed superior cultivars with disease resistance, high yield, and nutrient richness etc. However, as a result of the crop’s complex genomic architecture, which results from its hexaploidy (2n = 6x = 90), high heterozygosity, huge genome (2~3Gb), and outcrossing nature, its genetic analysis and marker-assisted breeding has been challenging. In addition, the lack of whole genome sequence or gene annotations has hindered the isolation of agronomically important genes or validation of QTL regions. In this study, we performed an Iso-Seq to obtain full length transcripts without the assembly, and also conducted an RNA-seq analysis to understand the mechanism for nematode resistance in sweetpotato. As a result, more than 54,000 isoforms were produced by the Iso-seq, and we could identify candidate gene(s) for controlling nematode resistance.

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  • Investigation of genetic locus associated with skin color in Vitis vinifera x V. labruscana tetraploid grapes

    Grant number:16K18652  2016.04 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Young Scientists (B)  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    Fujita Keiko, FUKUNAGA kenji, MONDEN yuki, TAKATA shota

      More details

    Authorship:Collaborating Investigator(s) (not designated on Grant-in-Aid) 

    Grant amount:\4030000 ( Direct expense: \3100000 、 Indirect expense:\930000 )

    Red-skinned tetraploid grape 'Akari' is thought to be a red-skinned mutation of black-skinned tetraploid grape 'Pione'. Their genomes were compared to determine the genetic locus associated with berry skin color. Simple sequence repeats (SSRs) as DNA markers showed monomorphic band patterns in both 'Akari' and 'Pione'. The MYB haplotype composition of 'Akari' was the same as that of 'Pione', and Myb-related gene sequences in 'Akari' were not unique. These findings suggested that a novel genetic locus associated with berry skin color exists. Then, 'Akari' and 'Pione' were subjected to inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) analysis and polymorphic band patterns were noted. To compare the positions of retrotransposons VINE1 and Gret1 in 'Akari' and 'Pione' genomes, data of their insertion sites in tetraploid grape cultivars were obtained with an Illumina MiSeq sequencing platform. It was revealed that the insertion sites differed between 'Akari' and 'Pione'.

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  • Induced disease resistance by cyclic lipopeptide derived from Bacillus sp. on Arabidopsis thaliana

    Grant number:16K07628  2016.04 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C)  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    YOKOTA Kenji

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    Grant amount:\4810000 ( Direct expense: \3700000 、 Indirect expense:\1110000 )

    Disease suppressions conferred by treatment of cyclic lipopeptides iturin A and surfactin derived from Bacillus sp. were evaluated. Both of iturin A and surfactin conferred significantly disease suppressions depending on induced disease resistant on lettuce and cabbage, respectively. However, losses of disease suppression were observed by the treatments at higher concentration of cyclic lipopeptides and the concentrations to cause the loss of disease suppression were different among the combination of cyclic lipopeptides and host plants. Our results might offer enhanced disease suppression by using of cyclic lipopeptides-producing Bacillus spp.

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  • Comprehensive analysis of full length cDNA and alternative splicing for the genes related to fruit development and ripening

    Grant number:16K14854  2016.04 - 2018.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    Ushijima Koichiro

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

    Grant amount:\3640000 ( Direct expense: \2800000 、 Indirect expense:\840000 )

    3rd generation sequences promotes not only genome sequencing but also transcript analysis. Iso-seq analysis using PacBio are very useful method for reading full length cDNA and detecting alternative splicing. In this analysis, we carried out Iso-seq analysis for melon fruits. We used three different methods for construction of full length cDNA library. The libraries were sequenced by PacBio sequel and Nanopore MinION. Isoforms were mapped on the reference genome of melon and compared them. PacBio and Nanopore isoforms fell into ~ 6,500 and 12,000 loci respectively. 509 loci of them were located at intergenic region and predicted novel loci.

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  • 平成27年度若手研究者スタートアップ研究支援事業

    2015.09 - 2017.09

    岡山大学 

    門田有希

      More details

  • 耐乾性育種に向けた、コムギ異種染色体添加系統におけるトランスポゾンMITEの遺伝解析

    2015 - 2016

    平成27年度鳥取大学乾燥地研究センター共同研究 若手奨励研究 

    門田有希, Benjamin Ewa Ubi, Yasir Serag Alnor Mohammed

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • STHクロマトPASを利用した、加工食品における農作物の品種判定検査

    2015 - 2016

    公益財団法人三島海雲記念財団  平成27年度(第53回)学術研究奨励金 

    門田 有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • Screening of novel active retrotransposon families with a potential for accelerating the genetic analysis in polyploid species

    Grant number:26660007  2014.04 - 2016.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

    Monden Yuki

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2210000 ( Direct expense: \1700000 、 Indirect expense:\510000 )

    The aim of this research was to screen the retrotransposon families that showed high insertion polymorphisms among crop cultivars. It was shown that the insertion polymorphisms of those families were quite useful for the genetic analysis in polyploidy species. A novel method was developed by modifying a previous method, which could be applied to non-model crop species including sweetpotato. As a result, 14 new retrotransposon families were identified in sweetpotato, and we experimentally verified their insertion polymorphisms. In addition, one retrotransposon family was cloned and its entire sequence could be determined. Moreover, comprehensive analyses of the insertion sites for several families were conducted. Thus, we achieved our initial goal.

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  • 次世代シーケンスを用いた活動型レトロトランスポゾンの挿入多型解析によるサツマイモ高密度連鎖地図の作成と立枯病およびネコブセンチュウ抵抗性マーカーの開発

    2013.04 - 2017.03

    ゲノム情報を活用した農産物の次世代生産基盤技術の開発プロジェクト(大豆および畑作物の有用遺伝子の同定とDNAマーカーの開発) 

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

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  • シイタケ(Lentinula edodes)活性型レトロトランスポゾンを利用したHigh-throughput な品種判別マーカーの開発

    2013.04 - 2014.03

    研究奨励金公益財団法人ホクト生物科学振興財団助成金 

    門田 有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

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  • 現場での検査導入を実現する農作物品種DNA 判定法の開発に関する研究

    2012.04 - 2015.03

    農林水産業・食品産業科学技術推進事業(実用技術開発ステージ) 

      More details

    Authorship:Coinvestigator(s) 

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  • テニュアトラック普及・定着事業

    2012.04 - 2014.03

    科学技術人材育成費補助金 

      More details

  • イネトランスポゾンmPingおよびPingの転移制御機構の解明

    Grant number:09J02906  2011 - 2012

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for JSPS Fellows  Grant-in-Aid for JSPS Fellows

    門田 有希

      More details

    Authorship:Principal investigator 

    Grant amount:\2100000 ( Direct expense: \2100000 )

    <具体的な研究内容>
    イネは2004年に日本晴の全ゲノム塩基配列が解読され、遺伝子の同定および機能解析が盛んに進められている。近年は、次世代シークエンサーを用いた比較ゲノム解析により、コシヒカリおよび雄町と日本晴との間において、それぞれ約67,000箇所、約130,000箇所の一塩基多型(SNP)が同定された。しかし、短いリードをReference genomeにマッピングし、小さな変異を同定する手法では、欠失、挿入、逆位等、大きな構造変異を同定することはできない。そこで本研究では、銀坊主のゲノム配列を高い精度で解読、新規コンティグを用いた比較ゲノム解析により、多様なゲノム構造変異についても明らかにした。
    イネ品種銀坊主を用いて、二種類のライブラリー(500bpのPair endlibrary、3kbのMate pair library)を作成、Hiseq2000によりシークエンス解析を行った。得られた配列を、日本晴ゲノム配列にマッピングした後、123,299か所のSNP、43,480箇所の短い欠失および挿入を同定した。さらに、複数のソフトウェアを組み合わせ、数100bpから数100kb以上に及ぶ大きな構造変異を1500箇所以上同定した。その後、銀坊主の新規コンティグを作成し、マッピング解析により得られた構造変異の妥当性を検証した。確認された構造変異の70%は、転移因子配列の切り出しもしくは挿入によるものであり、転移因子を介して生じたと思われる逆位も複数存在した。
    <意義および重要性>
    今回の研究結果から、イネ近縁品種間において大規模なゲノム構造変異が多数存在していること、並びに、このような構造変異に転移因子が密接に関与することを明らかにした。これは、自殖性作物であり遺伝的均一性の高いイネにおいて、転移因子を介したダイナミックなゲノム進化が短期間に進行することを示す重要な成果である。

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Class subject in charge

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2022academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2022academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2022academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2022academic year) Prophase  - その他

  • Topics in Plant Genome Analysis (2022academic year) Late  - 水3,水4

  • Course Seminar 1 (2022academic year) 1st and 2nd semester  - 水3

  • Course Seminar 2 (2022academic year) 3rd and 4th semester  - 水3

  • Course Seminar 3 (2022academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Course Seminar 4 (2022academic year) 3rd and 4th semester  - その他

  • Introduction to Bioinformatics (2022academic year) Summer concentration  - その他

  • Undergraduate's-level thesis research (2022academic year) 1st-4th semester  - その他

  • Applied Biological Data Science 2 (2022academic year) Fourth semester  - 火1,火2

  • Plant genetics 1 (2022academic year) 1st semester  - 月1,月2

  • Plant genetics 2 (2022academic year) Second semester  - 月1,月2

  • Plant genetic information analysis (2022academic year) Late  - その他

  • Specific Research of Science for Bio-Production (2022academic year) Year-round  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 1 (2022academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 2 (2022academic year) 3rd and 4th semester  - その他

  • Laboratory in Applied Plant Science 1 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Laboratory in Applied Plant Science 2 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - 金5,金6,金7,金8

  • Laboratory in Applied Plant Science 3 (2021academic year) 3rd and 4th semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2021academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2021academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2021academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2021academic year) Prophase  - その他

  • Topics in Plant Genome Analysis (2021academic year) Late  - 水3,水4

  • Course Seminar 3 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Course Seminar 4 (2021academic year) 3rd and 4th semester  - その他

  • Undergraduate's-level thesis research (2021academic year) 1st-4th semester  - その他

  • Experiment in Applied Plant Science 1 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Experiment in Applied Plant Science 2 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - 金5,金6,金7,金8

  • Experiment in Applied Plant Science 3 (2021academic year) 3rd and 4th semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Applied Biological Data Science 2 (2021academic year) Fourth semester  - 火1,火2

  • Plant genetics 1 (2021academic year) 1st semester  - 月1,月2

  • Plant genetics 2 (2021academic year) Second semester  - 月1,月2

  • Plant genetic information analysis (2021academic year) Late  - その他

  • Specific Research of Science for Bio-Production (2021academic year) Year-round  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 1 (2021academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 2 (2021academic year) 3rd and 4th semester  - その他

  • Laboratory in Applied Plant Science 1 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Laboratory in Applied Plant Science 2 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - 金5,金6,金7,金8

  • Laboratory in Applied Plant Science 3 (2020academic year) 3rd and 4th semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2020academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2020academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2020academic year) Late  - その他

  • Seminar in Plant Genome Dynamics Analysis (2020academic year) Prophase  - その他

  • Topics in Plant Genome Analysis (2020academic year) Late  - 水3,水4

  • Course Seminar 3 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Course Seminar 4 (2020academic year) 3rd and 4th semester  - その他

  • Introduction to Bioinformatics (2020academic year) Summer concentration  - その他

  • Undergraduate's-level thesis research (2020academic year) 1st-4th semester  - その他

  • Experiment in Applied Plant Science 1 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - 木5,木6,木7,木8

  • Experiment in Applied Plant Science 2 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - 金5,金6,金7,金8

  • Experiment in Applied Plant Science 3 (2020academic year) 3rd and 4th semester  - 木5,木6,木7,木8

  • 応用生物データサイエンス学2 (2020academic year) 第4学期  - 火1,火2

  • Plant genetics 1 (2020academic year) 1st semester  - 月1,月2

  • Plant genetics 2 (2020academic year) Second semester  - 月1,月2

  • Plant genetic information analysis (2020academic year) special  - その他

  • Specific Research of Science for Bio-Production (2020academic year) Year-round  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 1 (2020academic year) 1st and 2nd semester  - その他

  • Seminars in Special Field of Study 2 (2020academic year) 3rd and 4th semester  - その他

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Social Activities

  • 2021シンポジウム Are you ready? SDGsが拓く未来

    Role(s):Lecturer

    日経ウーマノミクス・プロジェクト実行委員会(日本経済新聞社)  2021.7.13

     More details

  • 教えて!博士!ー大学の先生に聞いてみよう!ー

    Role(s):Appearance, Lecturer

    おかやまサイエンス・ライブ  2020.8.8

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    Type:Science cafe

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  • 作物の品種識別技術の開発と農学研究の紹介

    Role(s):Lecturer

    岡山県立倉敷青陵高等学校  2018.7.27

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    Type:Visiting lecture

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  • 作物の品種判定とは?-日本の農業と私たちの食生活を守るために-

    Role(s):Lecturer

    吉備国際大学  高校生シンポジウム 〜生命を支える農学研究〜  2017.8.26

     More details

    Type:Seminar, workshop

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  • 作物の多様性-DNAで探る変わり者たち―

    Role(s):Lecturer

    岡山大学ダイバーシティ推進本部  岡大方式 サイエンス・トライアル  2015.11.28

     More details

  • ”動く遺伝子”を使った農作物の品種判定 -日本の農業、そして私たちの食生活を守るために-

    Role(s):Lecturer

    吉備国際大学  高校生シンポジウム「ここまでわかった!植物研究!」  2015.8.24

     More details

    Type:Seminar, workshop

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  • ”動く遺伝子”を使った農作物の品種判定 -食の安心・安全を―

    Role(s):Lecturer

    おかやまサイエンストーク(福山暁の星中学校)  2015.1.22

     More details

    Type:Lecture

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  • 動く遺伝子を利用した農作物における遺伝解析

    Role(s):Lecturer

    吉備国際大学 地域創成農学部  遺伝学概論  2015.1.20

     More details

    Type:Visiting lecture

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  • ”動く遺伝子”を使った農作物の品種判定 -食の安心・安全を―

    Role(s):Lecturer

    おかやま サイエンストーク(ノートルダム清心学園 清心中学校)  2014.9.13

     More details

    Type:Lecture

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  • DNA鑑定とは? -’動く遺伝子’を使った農作物品種判定技術の開発―

    Role(s):Lecturer

    岡山県立林野高等学校  2014.7.15

     More details

    Type:Visiting lecture

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  • "動く遺伝子”を使った農作物の品種判定-食の安心・安全を-

    Role(s):Lecturer

    おかやまサイエンストーク(岡山県立作陽高校)  2014.7.11

     More details

    Type:Lecture

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  • DNA 鑑定で何ができるの?-日本の農業、そして、私たちの食生活を守るために―

    Role(s):Lecturer

    集まれ!理系女子 第5回女子生徒による科学研究発表交流会  2013.10.26

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    Type:Seminar, workshop

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  • 岡山大学WTT(ウーマンテニュアトラック)教員として過ごす研究生活

    Role(s):Lecturer

    第124回日本育種学会男女共同参画室主催ランチョンセミナー  2013.10.13

     More details

    Type:Seminar, workshop

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  • DNA鑑定で何ができるの?-日本の農業、そして、私たちの食生活を守るために

    Role(s):Lecturer

    おかやまサイエンストーク(ノートルダム清心女子高等学校)  2013.8.29

     More details

    Type:Lecture

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  • 聞かせて先輩~人生との交差点~

    Role(s):Lecturer

    広島県立府中高等学校  2013.2.22

     More details

    Type:Lecture

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  • 日本の農家を守ろう!動く遺伝子トランスポゾンとその応用

    Role(s):Lecturer

    おかやまサイエンストーク(岡山県立矢掛高等学校)  2012.7

     More details

    Type:Lecture

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Media Coverage

  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2022.12.14

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  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2022.12.7

     More details

  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2022.4.27

     More details

  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2022.4.20

     More details

  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2021.11.7

     More details

  • 「技術の森」に出演

    RSKラジオ  2021.2.3

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  • 「技術の森」に出演 TV or radio program

    RSKラジオ  技術の森  2021.1.27

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  • 高次倍数体農作物の農業形質を遺伝的に解析する手法を開発しました〜高収量などを目指した育種が可能に〜 Internet

    岡山大学プレスリリース  2020.6

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  • 害虫に強いサツマイモ選別 Newspaper, magazine

    日経産業新聞  2020.3

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  • 遺伝解析の難しかったサツマイモで線虫抵抗性個体を高効率に選抜可能なDNAマーカーの開発に成功! Internet

    岡山大学プレスリリース  2020.3

     More details

  • 岡山大学×SDGs理想の未来へ導く知の拠点 Newspaper, magazine

    山陽新聞  食の安全と安定供給へ「動く遺伝子」に注目  2019.1

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  • 人類の今と未来をつなぐ~SDGs達成に向けて~ Promotional material

    岡山大学  いちょう並木(岡山大学広報誌)  2018.10

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  • 輝く女性研究者紹介 Promotional material

    岡山大学  いちょう並木(岡山大学広報誌)  2015.6

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  • 大学研究室訪問 Newspaper, magazine

    Osera誌  2015.2

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  • ”動く遺伝子”で遺伝解析を効率化~解析困難だった農作物にも利用可能~ Internet

    岡山大学プレスリリース  2014.8

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  • 現場で使える!DNA増幅後15分間でイチゴの品種を判定! Internet

    岡山大学プレスリリース  2014.8

     More details

  • 実用的な農作物品種識別技術の開発へ向けて ―現場検査に導入可能な、簡便かつ正確に農作物品種を識別する技術の確立―

    日本育種学会第125回講演会会  記者発表  2014.3

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Academic Activities

  • 現場検査を可能にする農作物品種識別法

    BioJapan 2018  2018.10.10

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    Type:Exhibition 

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  • 簡便・迅速・高感度な農作物品種判定検査法

    岡山リサーチパーク 研究・展示発表会  2016.3.18

     More details

    Type:Exhibition 

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  • 簡便・迅速・高感度な品種判定検査の開発

    岡山大学 知恵の見本市2015  2015.12.4

     More details

    Type:Exhibition 

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  • 現場での検査を実現する農作物品種判定法

    BioJapan2014 -World Business Forum-  2014.10.14

     More details

    Type:Exhibition 

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  • 革新的な農作物品種判定法の開発 -食の安心・安全をー

    イノベーション・ジャパン2014  2014.9.11

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    Type:Exhibition 

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  • 加工食品に含まれる原料品種検査技術の開発

    岡山リサーチパーク  2012.9.10

     More details

    Type:Exhibition 

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