2024/02/01 更新

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タカハシ タク
髙橋 卓
TAKAHASHI Taku
所属
環境生命自然科学学域 教授
職名
教授
外部リンク

学位

  • 理学修士 ( 東京大学 )

  • 博士(理学) ( 東京大学 )

  • Doctor(Science) ( 東京大学 )

研究キーワード

  • Plant development

  • 表皮分化

  • 植物発生

  • ポリミアン

  • 形態形成

  • Gene expression

  • Polyamine

  • シロイヌナズナ

  • Epidermis

  • 遺伝子発現

  • 花茎伸長

研究分野

  • ライフサイエンス / 植物分子、生理科学

  • ライフサイエンス / 遺伝学

  • ライフサイエンス / 形態、構造

学歴

  • 東京大学    

    - 1992年

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    国名: 日本国

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  • 東京大学   Graduate School, Division of Science   Plant Biology

    - 1992年

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  • 東京大学   Faculty of Science   Department of Biological Sciences

    - 1987年

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    国名: 日本国

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  • 東京大学   Faculty of Science   Department of Biology

    - 1987年

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経歴

  • 岡山大学   大学院自然科学研究科   教授

    2004年4月 - 現在

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  • - Professor,Graduate School of Natural Science and Technology,Okayama University

    2004年

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  • 北海道大学   大学院理学研究科   助教

    1995年1月 - 2004年3月

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  • ロックフェラー大学   博士研究員

    1992年4月 - 1995年1月

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所属学協会

  • 日本植物学会

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  • 日本ポリアミン学会

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  • 日本植物生理学会

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  • アメリカ植物生物学会(The American Society of Plant Biologists)

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委員歴

  • 日本ポリアミン学会   評議委員  

    2020年1月 - 現在   

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論文

  • Microtubule-associated proteins WDL5 and WDL6 play a critical role in pollen tube growth in Arabidopsis thaliana 査読

    Takashi Okamoto, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    Plant Signaling & Behavior   18 ( 1 )   2023年11月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Informa UK Limited  

    DOI: 10.1080/15592324.2023.2281159

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  • Suppression of the dwarf phenotype of an Arabidopsis mutant defective in thermospermine biosynthesis by a synonymous codon change in the SAC51 uORF. 査読 国際誌

    Yuichi Nishii, Daiki Koyama, Hiroko Fukushima, Taku Takahashi

    Molecular genetics and genomics : MGG   2023年10月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Thermospermine plays a critical role in negatively regulating xylem development in angiosperms. A mutant of Arabidopsis thaliana that is defective in thermospermine biosynthesis, acaulis5 (acl5), exhibits a dwarf phenotype with excessive xylem formation. Mechanistically thermospermine acts in attenuating the inhibitory effect of an evolutionarily conserved upstream open reading frame (uORF) on the main ORF of SAC51, which encodes a basic helix-loop-helix protein involved in xylem repression. Here, we revealed that a semidominant suppressor of acl5, sac503, which partially restores the acl5 phenotype, has a point mutation in the conserved uORF of SAC51 with no amino acid substitution in the deduced peptide sequence. In transgenic lines carrying the β-glucuronidase (GUS) reporter gene fused with the SAC51 5' region containing the uORF, the mutant construct was shown to confer higher GUS activity than does the wild-type SAC51 construct. We confirmed that sac503 mRNA was more stable than SAC51 mRNA in acl5. These results suggest that the single-base change in sac503 positively affects the translation of its main ORF instead of thermospermine. We further found that the uORF-GUS fusion protein could be synthesized in planta from the wild-type and sac503 translational fusion constructs.

    DOI: 10.1007/s00438-023-02076-4

    PubMed

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  • Thermospermine is an evolutionarily ancestral phytohormone required for organ development and stress responses in the basal land plantMarchantia polymorpha

    Takuya Furumoto, Shohei Yamaoka, Takayuki Kohchi, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    bioRxiv   2023年7月

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    担当区分:責任著者   出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Thermospermine, a structural isomer of spermine, suppresses auxin-inducible xylem differentiation, whereas spermine is implicated in stress responses in angiosperms. Thermospermine synthase ACAULIS5 (ACL5) is well conserved from algae to land plants, but its physiological function remains elusive in non-vascular plants. Here we focused on MpACL5, a gene in the liverwortMarchantia polymorpha, which rescued the dwarf phenotype of theacl5mutant ofArabidopsis. In the Mpacl5mutants generated by genome editing, growth of the vegetative organ, thallus, and the sexual reproductive organ, gametangiophore, was severely retarded. The mutant gametangiophore exhibited remarkable morphological defects such as short stalks, fasciation, and indeterminate growth; it was formed as a fusion of two gametangiophores and a new gametangiophore was often initiated from the old one. Furthermore, Mpacl5was shown to be hypersensitive to heat and salt stresses. Given the absence of spermine in liverworts includingM. polymorpha, these results reveal that thermospermine has a dual primordial function in organ development and stress responses in the basal land plant lineage, the latter of which may have eventually been assigned to spermine during the land plant evolution.

    DOI: 10.1101/2023.07.13.548936

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  • Loss of function of an Arabidopsis homologue of JMJD6 suppresses the dwarf phenotype of acl5, a mutant defective in thermospermine biosynthesis. 査読 国際誌

    Hirotoshi Matsuo, Hiroko Fukushima, Shinpei Kurokawa, Eri Kawano, Takashi Okamoto, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    FEBS letters   596 ( 23 )   3005 - 3014   2022年12月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In Arabidopsis thaliana, the ACL5 gene encodes thermospermine synthase and its mutant, acl5, exhibits a dwarf phenotype with excessive xylem formation. Studies of suppressor mutants of acl5 reveal the involvement of thermospermine in enhancing mRNA translation of the SAC51 gene family. We show here that a mutant, sac59, which partially suppresses the acl5 phenotype, has a point mutation in JMJ22 encoding a D6-class Jumonji C protein (JMJD6). A T-DNA insertion allele, jmj22-2, also partially suppressed the acl5 phenotype while mutants of its closest two homologs JMJ21 and JMJ20 had no such effects, suggesting a unique role for JMJ22 in plant development. We found that mRNAs of the SAC51 family are more stabilized in acl5 jmj22-2 than in acl5.

    DOI: 10.1002/1873-3468.14470

    PubMed

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  • RNA processing/modifying enzymes play key roles in the response to thermospermine in Arabidopsis thaliana

    Takahiro Tanaka, Daiki Koyama, Mitsuru Saraumi, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    bioRxiv   2022年9月

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    担当区分:責任著者   出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Thermospermine acts in negative regulation of xylem differentiation through enhancing mRNA translation of the members of the SAC51 gene family in Arabidopsis. These mRNAs contain conserved upstream open-reading-frames (uORFs) that are inhibitory to the main ORF translation. To address the mode of action of thermospermine in this process, we have isolated mutants that are insensitive to thermospermine, named its. We show here that four genes responsible for the mutants, its1 to its4, encode a homologue of SPOUT RNA methyl transferase, an rRNA pseudouridine synthase CBF5/NAP57, a putative spliceosome disassembly factor STIPL1/NTR1, and a plant-specific RNA-binding protein PHIP1, respectively. While these mutants except its1 are almost normal in appearance, they enhance the dwarf phenotype of a mutant of ACL5 defective in thermospermine biosynthesis, resulting in tiny-sized plants reminiscent of a double knockout of ACL5 and SACL3, a member of the SAC51 family. We confirmed that the GUS reporter activity from the SAC51 5’-GUS fusion transcript was severely reduced in all of these mutants. These results unveil the importance of RNA processing and modification for the translation of transcripts containing regulatory uORFs.

    DOI: 10.1101/2022.09.19.508594

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  • Establishment and application of novel culture methods in Marchantia polymorpha: persistent tip growth is required for substrate penetration by rhizoids 招待 査読

    Hikari Mase, Hirofumi Nakagami, Takashi Okamoto, Taku Takahashi, Hiroyasu Motose

    Commun.Integr. Biol.   15   164 - 167   2022年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/19420889.2022.2095137

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  • Plant specific armadillo repeat kinesin directs organelle transport and microtubule convergence to promote tip growth

    Asaka Kanda, Kento Otani, Taku Takahashi, Hiroyasu Motose

    bioRxiv   2022年

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    出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Tip growth is essential for plant growth and reproduction. However, it remains elusive how highly polarized tip-growing cells coordinate the organization of intracellular components. Here, we show that plant-specific armadillo-repeat containing kinesin, MpARK, mediates organelle transport and microtubule convergence in tip growing rhizoids in the early diverging land plantMarchantia polymorpha. MpARK is required for anterograde transport of organelles to maintain their position. Furthermore, MpARK participates in the formation of microtubule foci at the rhizoid apex to stabilize growth direction. MpARK-dependent rhizoid growth is essential for plant anchorage and soil holding capacity. Thus, ARK might be a principal organelle transporter and intracellular organizer in the primitive rooting cells for the adaptation to terrestrial environments. Our findings suggest that ARK is functionally comparable to canonical anterograde kinesins in animals and fungi.

    DOI: 10.1101/2022.07.08.499237

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  • Responses of Polyamine-Metabolic Genes to Polyamines and Plant Stress Hormones in Arabidopsis Seedlings 査読

    Yusaku Yariuchi, Takashi Okamoto, Yoshiteru Noutoshi, Taku Takahashi

    Cells   10 ( 12 )   3283 - 3283   2021年11月

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    担当区分:最終著者, 責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MDPI AG  

    In plants, many of the enzymes in polyamine metabolism are encoded by multiple genes, whose expressions are differentially regulated under different physiological conditions. For comprehensive understanding of their regulation during the seedling growth stage, we examined the expression of polyamine metabolic genes in response to polyamines and stress-related plant hormones in Arabidopsis thaliana. While confirming previous findings such as induction of many of the genes by abscisic acid, induction of arginase genes and a copper amine oxidase gene, CuAOα3, by methyl jasmonate, that of an arginine decarboxylase gene, ADC2, and a spermine synthase gene, SPMS, by salicylic acid, and negative feedback regulation of thermospermine biosynthetic genes by thermospermine, our results showed that expressions of most of the genes are not responsive to exogenous polyamines. We thus examined expression of OsPAO6, which encodes an apoplastic polyamine oxidase and is strongly induced by polyamines in rice, by using the promoter-GUS fusion in transgenic Arabidopsis seedlings. The GUS activity was increased by treatment with methyl jasmonate but neither by polyamines nor by other plant hormones, suggesting a difference in the response to polyamines between Arabidopsis and rice. Our results provide a framework to study regulatory modules directing expression of each polyamine metabolic gene.

    DOI: 10.3390/cells10123283

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  • 植物ポリアミンの代謝と機能 招待 査読

    高橋 卓, 本瀬 宏康

    化学と生物   59 ( 6 )   290 - 297   2021年6月

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    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Distinct functions of ethylene and ACC in the basal land plant marchantia polymorpha.

    Asuka Katayose, Asaka Kanda, Yasutaka Kubo, Taku Takahashi, Hiroyasu Motose

    Plant & cell physiology   2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Ethylene is a gaseous phytohormone involved in various physiological processes including fruit ripening, senescence, root hair development, and stress responses. Recent genomics have suggested that most homologous genes of ethylene biosynthesis and signaling are conserved from algae to angiosperms, whereas function and biosynthesis of ethylene remain unknown in basal plants. Here, we examined physiological effects of ethylene, an ethylene precursor, 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid (ACC), and an inhibitor of ethylene perception, silver thiosulfate (STS), in a basal land plant Marchantia polymorpha. M. polymorpha plants biosynthesized ethylene and treatment with high concentrations of ACC slightly promoted ethylene production. ACC remarkably suppressed growth of thalli (vegetative organs) and rhizoids (root-hair-like cells), whereas exogenous ethylene slightly promoted thallus growth. STS suppressed thallus growth and induced ectopic rhizoid formation on the dorsal surface of thalli. Thus, ACC and ethylene have different effects on vegetative growth of M. polymorpha. We generated single and double mutants of ACC synthase-like (ACSL) genes, MpACSL1 and MpACSL2. They did not show obvious defects in thallus growth, ACC content, and ethylene production, indicating that MpACSL genes are not essential for the vegetative growth and the biosynthesis of ACC and ethylene. The gene expression analysis suggested involvement of MpACSL1 and MpACSL2 in stress responses. Collectively, our results imply ethylene-independent function of ACC and the absence of ACC-mediated ethylene biosynthesis in M. polymorpha.

    DOI: 10.1093/pcp/pcab042

    PubMed

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  • The root growth reduction in response to mechanical stress involves ethylene-mediated microtubule reorganization and transmembrane receptor-mediated signal transduction in Arabidopsis. 国際誌

    Takashi Okamoto, Shogo Takatani, Hiroyasu Motose, Hidetoshi Iida, Taku Takahashi

    Plant cell reports   40 ( 3 )   575 - 582   2021年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    KEY MESSAGE: We found that mutations in a Ca2+-permeable mechanosensitive channel MCA1, an ethylene-regulated microtubule-associated protein WDL5, and a versatile co-receptor BAK1 affect root growth response to mechanical stress. Plant root tips exposed to mechanical impedance show a temporal reduction in the elongation growth. The process involves a transient Ca2+ increase in the cytoplasm followed by ethylene signaling. To dissect the molecular mechanisms underlying this response, we examined the root growth of a series of Arabidopsis mutants with potentially altered response to mechanical stress after transfer from vertical to horizontal plates that were covered by dialysis membrane as an impedance. Among the plant hormone-response mutants tested, the ethylene-insensitive mutant ein3 was confirmed to show no growth reduction after the transfer. The root growth reduction was attenuated in a mutant of MCA1 encoding a Ca2+-permeable mechanosensitive channel and that of WDL5 encoding an ethylene-regulated microtubule-associated protein. We also found that the growth reduction was enhanced in a mutant of BAK1 encoding a co-receptor that pairs with numerous leucine-rich repeat receptor kinases to modulate growth and immunity. These results suggest the root growth reduction in response to mechanical stress involves ethylene-mediated microtubule reorganization and also transmembrane receptor-mediated signal transduction.

    DOI: 10.1007/s00299-020-02653-6

    PubMed

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  • Ceramides mediate positional signals in Arabidopsis thaliana protoderm differentiation. 国際誌

    Kenji Nagata, Toshiki Ishikawa, Maki Kawai-Yamada, Taku Takahashi, Mitsutomo Abe

    Development (Cambridge, England)   148 ( 2 )   2021年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The differentiation of distinct cell types in appropriate patterns is a fundamental process in the development of multicellular organisms. In Arabidopsis thaliana, protoderm/epidermis differentiates as a single cell layer at the outermost position. However, little is known about the molecular nature of the positional signals that achieve correct epidermal cell differentiation. Here, we propose that very-long-chain fatty acid-containing ceramides (VLCFA-Cers) mediate positional signals by stimulating the function of ARABIDOPSIS THALIANA MERISTEM LAYER1 (ATML1), a master regulator of protoderm/epidermis differentiation, during lateral root development. We show that VLCFA-Cers, which are synthesized predominantly in the outermost cells, bind to the lipid-binding domain of ATML1. Importantly, this cell type-specific protein-lipid association alters the activity of ATML1 protein and consequently restricts its expression to the protoderm/epidermis through a transcriptional feedback loop. Furthermore, establishment of a compartment, enriched with VLCFA-containing sphingolipids, at the outer lateral membrane facing the external environment may function as a determinant of protodermal cell fate. Taken together, our results indicate that VLCFA-Cers play a pivotal role in directing protoderm/epidermis differentiation by mediating positional signals to ATML1.This article has an associated 'The people behind the papers' interview.

    DOI: 10.1242/dev.194969

    PubMed

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  • Easy-to-Use InDel Markers for Genetic Mapping between Col-0 and Ler-0 Accessions of Arabidopsis thaliana. 査読 国際誌

    Takahiro Tanaka, Yuichi Nishii, Hirotoshi Matsuo, Taku Takahashi

    Plants (Basel, Switzerland)   9 ( 6 )   2020年6月

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    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Map-based gene cloning has played a key role in many genetic studies using the model plant, Arabidopsis thaliana. In the post- next generation sequencing era, identification of point mutations and their corresponding genes is increasingly becoming a powerful and important approach to define plant gene function. To perform initial mapping experiments efficiently on Arabidopsis mutants, enrichment of easy-to-use and reliable polymorphic DNA markers would be desirable. We present here a list of InDel polymorphic markers between Col-0 and Ler-0 accessions that can be detected in standard agarose gel electrophoresis.

    DOI: 10.3390/plants9060779

    PubMed

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  • Chemical Synthesis and Biological Effect on Xylem Formation of Xylemin and Its Analogues 査読

    Hiroyoshi Takamura, Hiroyasu Motose, Taichi Otsu, Shiori Shinohara, Ryugo Kouno, Isao Kadota, Taku Takahashi

    EUROPEAN JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY   2020 ( 18 )   2745 - 2753   2020年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-V C H VERLAG GMBH  

    Xylemin (6) and its designed structural analogues 18-23, N-(4-aminobutyl)alkylamines, were synthesized by 2-nitrobenzenesulfonamide (Ns) strategy. Investigation of the improved synthesis of 20-23 resulted in the development of one-step synthesis of these analogues from the commercially available corresponding ketones. Biological assessment of the synthetic molecules elucidated that xylemin (6) and the analogue N-(4-aminobutyl)cyclopentylamine (21) promoted the expression level of thermospermine synthase ACAULIS5 (ACL5) and enhanced xylem formation. In addition, xylemin (6) was found to significantly promote lateral root formation, whereas xylemin analogues 18-23 including 21 did not. These results indicate that the analogue 21 has the potential as a novel inhibitor of thermospermine synthesis to work specifically in xylem differentiation.

    DOI: 10.1002/ejoc.202000322

    Web of Science

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  • Plant Polyamines. 国際誌

    Taku Takahashi

    Plants (Basel, Switzerland)   9 ( 4 )   2020年4月

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    記述言語:英語  

    Polyamines are small organic compounds found in all living organisms. According to the high degree of positive charge at physiological pH, they interact with negatively charged macromolecules, such as DNA, RNA, and proteins, and modulate their activities. In plants, polyamines, some of which are presented as a conjugated form with cinnamic acids and proteins, are involved in a variety of physiological processes. In recent years, the study of plant polyamines, such as their biosynthetic and catabolic pathways and the roles they play in cellular processes, has flourished, becoming an exciting field of research. There is accumulating evidence that polyamine oxidation, the main catabolic pathway of polyamines, may have a potential role as a source of hydrogen peroxide. The papers in this Special Issue highlight new discoveries and research in the field of plant polyamine biology. The information will help to stimulate further research and make readers aware of the link between their own work and topics related to polyamines.

    DOI: 10.3390/plants9040511

    PubMed

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  • Microtubule Response to Tensile Stress Is Curbed by NEK6 to Buffer Growth Variation in the Arabidopsis Hypocotyl. 査読 国際誌

    Shogo Takatani, Stéphane Verger, Takashi Okamoto, Taku Takahashi, Olivier Hamant, Hiroyasu Motose

    Current biology : CB   2020年3月

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    記述言語:英語  

    Growth variability generates mechanical conflicts in tissues. In plants, cortical microtubules usually align with maximal tensile stress direction, thereby mechanically reinforcing cell walls, and channeling growth rate and direction. How this is achieved remains largely unknown and likely involves microtubule regulators. The NIMA-related microtubule-associated kinase NEK6 phosphorylates tubulin, leading to the depolymerization of a subset of microtubules. We found that cortical microtubules exhibit a hyper-response to mechanical stress in the nek6 mutant. This response contributes to local cell protrusions in slow-growing regions of the nek6 mutant hypocotyl. When growth amplitude is higher, the hyper-alignment of microtubules leads to variable, stop-and-go, phenotypes, resulting in wavy hypocotyl shapes. After gravistimulation or touch, the nek6 mutant also exhibits a hyperbent hypocotyl phenotype, consistent with an enhanced perception of its own deformation. Strikingly, we find that NEK6 exhibits a novel form of polarity, being recruited at the ends of a subset of microtubules at cell edges. This pattern can be modified after local ablation, matching the new maximal tensile stress directions. We propose that NEK6 depolymerizes cortical microtubules that best align with maximal tensile stress to generate a noisier network of microtubules. This prevents an overreaction of microtubules to growth fluctuations and, instead, promotes the buffering of growth variations.

    DOI: 10.1016/j.cub.2020.02.024

    PubMed

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  • Salt hypersensitivity is associated with excessive xylem development in a thermospermine‐deficient mutant of Arabidopsis thaliana 査読

    Shiori Shinohara, Takashi Okamoto, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    The Plant Journal   100 ( 2 )   374 - 383   2019年10月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/tpj.14448

    Web of Science

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  • Ethylene signaling plays a pivotal role in mechanical stress-induced root growth cessation in Arabidopsis thaliana. 査読

    Takashi Okamoto, Taku Takahashi

    Plant Signaling and Behavior   2019年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/15592324.2019.1669417

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  • Effect of Thermospermine on the Growth and Expression of Polyamine-Related Genes in Rice Seedlings 査読

    Taku Takahashi

    Plants   8 ( 8 )   2019年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    <jats:p>A mutant defective in the biosynthesis of thermospermine, acaulis5 (acl5), shows a dwarf phenotype with excess xylem vessels in Arabidopsis thaliana. Exogenous supply of thermospermine remarkably represses xylem differentiation in the root of seedlings, indicating the role of thermospermine in proper repression of xylem differentiation. However, the effect of thermospermine has rarely been investigated in other plant species. In this paper, we examined its effect on the growth and gene expression in rice seedlings. When grown with thermospermine, rice seedlings had no clearly enlarged metaxylem vessels in the root. Expression of OsACL5 was reduced in response to thermospermine, suggesting a negative feedback control of thermospermine biosynthesis like in Arabidopsis. Unlike Arabidopsis, however, rice showed up-regulation of phloem-expressed genes, OsHB5 and OsYSL16, by one-day treatment with thermospermine. Furthermore, expression of OsPAO2 and OsPAO6, encoding extracellular polyamine oxidase whose orthologs are not present in Arabidopsis, was induced by both thermospermine and spermine. These results suggest that thermospermine affects the expression of a subset of genes in rice different from those affected in Arabidopsis.</jats:p>

    DOI: 10.3390/plants8080269

    Web of Science

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  • Complexity and Conservation of Thermospermine-Responsive uORFs of SAC51 Family Genes in Angiosperms 査読

    Taku Takahashi

    Frontiers in Plant Science   10 ( 564 )   2019年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3389/fpls.2019.00564

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  • Omeprazole Enhances Mechanical Stress-Induced Root Growth Reduction in Arabidopsis thaliana. 査読

    Takashi Okamoto, Shogo Takatani, Yoshiteru Noutoshi, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    Plant & cell physiology   59 ( 8 )   1581 - 1591   2018年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Mechanical sensing is one of the most fundamental processes for sessile plants to survive and grow. The response is known to involve calcium elevation in the cell. Arabidopsis seedlings grown horizontally on agar plates covered with a dialysis membrane show a 2-fold reduction in root growth compared with those grown vertically, a response to mechanical stress generated due to gravitropism of the root. To understand the molecular mechanism of how plant roots sense and respond to mechanical stimuli, we screened chemical libraries for compounds that affect the horizontal root growth in this experimental system and found that, while having no effect on root gravitropism, omeprazole known as a proton pump inhibitor significantly enhanced the mechanical stress-induced root growth reduction especially in lower pH media. In contrast, omeprazole reversed neither the alleviation of the mechanical stress-induced growth reduction caused by calcium depletion nor the insensitivity to the mechanical stress in the ethylene signaling mutant ein2. Together with the finding that omeprazole increased expression of touch-induced genes and ETHYLENE RESPONSE FACTOR1, our results suggest that the target of omeprazole mediates ethylene signaling in the root growth response to mechanical stress.

    DOI: 10.1093/pcp/pcy131

    PubMed

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  • An evolutionarily conserved NIMA-related kinase directs rhizoid tip growth in the basal land plant Marchantia polymorpha. 査読 国際誌

    Kento Otani, Kimitsune Ishizaki, Ryuichi Nishihama, Shogo Takatani, Takayuki Kohchi, Taku Takahashi, Hiroyasu Motose

    Development (Cambridge, England)   145 ( 5 )   2018年3月

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    記述言語:英語  

    Tip growth is driven by turgor pressure and mediated by the polarized accumulation of cellular materials. How a single polarized growth site is established and maintained is unclear. Here, we analyzed the function of NIMA-related protein kinase 1 (MpNEK1) in the liverwort Marchantia polymorpha In the wild type, rhizoid cells differentiate from the ventral epidermis and elongate through tip growth to form hair-like protrusions. In Mpnek1 knockout mutants, rhizoids underwent frequent changes in growth direction, resulting in a twisted and/or spiral morphology. The functional MpNEK1-Citrine protein fusion localized to microtubule foci in the apical growing region of rhizoids. Mpnek1 knockouts exhibited increases in both microtubule density and bundling in the apical dome of rhizoids. Treatment with the microtubule-stabilizing drug taxol phenocopied the Mpnek1 knockout. These results suggest that MpNEK1 directs tip growth in rhizoids through microtubule organization. Furthermore, MpNEK1 expression rescued ectopic outgrowth of epidermal cells in the Arabidopsis thaliana nek6 mutant, strongly supporting an evolutionarily conserved NEK-dependent mechanism of directional growth. It is possible that such a mechanism contributed to the evolution of the early rooting system in land plants.

    DOI: 10.1242/dev.154617

    PubMed

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  • Thermospermine: An evolutionarily ancient but functionally new compound in plants 査読

    Taku Takahashi

    Methods in Molecular Biology   1694   51 - 59   2018年

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Humana Press Inc.  

    Themospermine is a structural isomer of spermine and is present in some bacteria and most of plants. An Arabidopsis mutant, acaulis5 (acl5), that is defective in the biosynthesis of thermospermine displays excessive proliferation of xylem vessels with dwarfed growth. Recent studies using acl5 and its suppressor mutants that recover the growth without thermospermine have revealed that thermospermine plays a key role in the negative control of the proliferation of xylem vessels through enhancing translation of specific mRNAs that contain a conserved upstream open-reading-frame (uORF) in the 50 leader region.

    DOI: 10.1007/978-1-4939-7398-9_4

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  • Detection of thermospermine and spermine by HPLC in plants 査読

    Taku Takahashi, Ayaka Takano, Jun-Ichi Kakehi

    Methods in Molecular Biology   1694   69 - 73   2018年

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Humana Press Inc.  

    Thermospermine, a structural isomer of spermine, is widely spread in the plant kingdom and has recently been shown to play a key role in the repression of xylem differentiation in vascular plants. However, a standard high-performance liquid chromatography (HPLC) protocol for detecting polyamines as their dansyl derivative cannot distinguish themospermine from spermine. These isomers become separated from each other after benzoylation. In this chapter, we describe a simple protocol for extraction, benzoylation, and HPLC detection of thermospermine and spermine with other polyamines from plant material.

    DOI: 10.1007/978-1-4939-7398-9_6

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  • Directional cell expansion requires NIMA-related kinase 6 (NEK6)-mediated cortical microtubule destabilization 査読

    Shogo Takatani, Shinichiro Ozawa, Noriyoshi Yagi, Takashi Hotta, Takashi Hashimoto, Yuichiro Takahashi, Taku Takahashi, Hiroyasu Motose

    SCIENTIFIC REPORTS   7   7826   2017年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    Plant cortical microtubules align perpendicular to the growth axis to determine the direction of cell growth. However, it remains unclear how plant cells form well-organized cortical microtubule arrays in the absence of a centrosome. In this study, we investigated the functions of Arabidopsis NIMA-related kinase 6 (NEK6), which regulates microtubule organization during anisotropic cell expansion. Quantitative analysis of hypocotyl cell growth in the nek6-1 mutant demonstrated that NEK6 suppresses ectopic outgrowth and promotes cell elongation in different regions of the hypocotyl. Loss of NEK6 function led to excessive microtubule waving and distortion, implying that NEK6 suppresses the aberrant cortical microtubules. Live cell imaging showed that NEK6 localizes to the microtubule lattice and to the shrinking plus and minus ends of microtubules. In agreement with this observation, the induced overexpression of NEK6 reduced and disorganized cortical microtubules and suppressed cell elongation. Furthermore, we identified five phosphorylation sites in beta-tubulin that serve as substrates for NEK6 in vitro. Alanine substitution of the phosphorylation site Thr166 promoted incorporation of mutant beta-tubulin into microtubules. Taken together, these results suggest that NEK6 promotes directional cell growth through phosphorylation of beta-tubulin and the resulting destabilization of cortical microtubules.

    DOI: 10.1038/s41598-017-08453-5

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  • Editorial: Molecular Mechanisms Underlying Polyamine Functions in Plants 査読

    Patrick H. Masson, Taku Takahashi, Riccardo Angelini

    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE   8 ( 14 )   2017年1月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:FRONTIERS MEDIA SA  

    DOI: 10.3389/fpls.2017.00014

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  • TLCを用いた簡便なポリアミン検出

    高橋卓, 懸樋潤一, 今井章裕

    ポリアミン   4 ( 1 )   14 - 16   2017年

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  • Thermospermine enhances translation of SAC51 and SACL1 in Arabidopsis 査読

    Mai Yamamoto, Taku Takahashi

    PLANT SIGNALING & BEHAVIOR   12 ( 1 )   414 - 421   2017年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:TAYLOR & FRANCIS INC  

    The excessive xylem phenotype of acaulis5 (acl5), an Arabidopsis mutant defective in the synthesis of thermospermine, indicates that thermospermine is required for negative regulation of xylem differentiation. SAC51 was identified from a dominant suppressor of acl5, sac51-d, and encodes a basic helix-loop-helix (bHLH) protein. sac51-d has a premature termination codon in one of upstream open-reading frames (uORFs) of the SAC51 mRNA that is conserved among the SAC51 family members. Thermospermine may act to bypass the inhibitory effect of the uORF on main ORF translation. Another suppressor, sac57-d, also has a mutation in the conserved uORF of SACL3, a member of the SAC51 family. On the other hand, the double knockout of SAC51 and SACL3 is insensitive to thermospermine, suggesting their key role in the response to thermospermine. However, we found that thermospermine enhances mRNA translation of SAC51 and SACL1 but not of SACL2 and SACL3. Taken together with recent findings from other groups, we propose a mechanism by which thermospermine diffused from xylem precursor cells acts non-cell-autonomously to restrict their proliferation.

    DOI: 10.1080/15592324.2016.1276685

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  • The SAC51 Family Plays a Central Role in Thermospermine Responses in Arabidopsis 査読

    Qingqing Cai, Hiroko Fukushima, Mai Yamamoto, Nami Ishii, Tomoaki Sakamoto, Tetsuya Kurata, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   57 ( 8 )   1583 - 1592   2016年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    The acaulis5 (acl5) mutant of Arabidopsis thaliana is defective in the biosynthesis of thermospermine and shows a dwarf phenotype associated with excess xylem differentiation. SAC51 was identified from a dominant suppressor of acl5, sac51-d, and encodes a basic helix-loop-helix protein. The sac51-d mutant has a premature termination codon in an upstream open reading frame (uORF) that is conserved among all four members of the SAC51 family, SAC51 and SACL1-SACL3. This suggests that thermospermine cancels the inhibitory effect of the uORF in main ORF translation. Another suppressor, sac57-d, has a mutation in the conserved uORF of SACL3. To define further the function of the SAC51 family in the thermospermine response, we analyzed T-DNA insertion mutants of each gene. Although sacl1-1 may not be a null allele, the quadruple mutant showed a semi-dwarf phenotype but with an increased level of thermospermine and decreased sensitivity to exogenous thermospermine that normally represses xylem differentiation. The sac51-1 sacl3-1 double mutant was also insensitive to thermospermine. These results suggest that SAC51 and SACL3 play a key role in thermospermine-dependent negative control of thermospermine biosynthesis and xylem differentiation. Using 5' leader-GUS (beta-glucuronidase) fusion constructs, however, we detected a significant enhancement of the GUS activity by thermospermine only in SAC51 and SACL1 constructs. Furthermore, while acl5-1 sac51-1 showed the acl5 dwarf phenotype, acl5-1 sacl3-1 exhibited an extremely tiny-plant phenotype. These results suggest a complex regulatory network for the thermospermine response in which SAC51 and SACL3 function in parallel pathways.

    DOI: 10.1093/pcp/pcw113

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  • Polyamine Resistance Is Increased by Mutations in a Nitrate Transporter Gene NRT1.3 (AtNPF6.4) in Arabidopsis thaliana 査読

    Wurina Tong, Akihiro Imai, Ryo Tabata, Shuji Shigenobu, Katsushi Yamaguchi, Masashi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shinichiro Sawa, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE   7 ( 834 )   2016年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:FRONTIERS MEDIA SA  

    Polyamines are small basic compounds present in all living organisms and act in a variety of biological processes. However, the mechanism of polyamine sensing, signaling and response in relation to other metabolic pathways remains to be fully addressed in plant cells. As one approach, we isolated Arabidopsis mutants that show increased resistance to spermine in terms of chlorosis. We show here that two of the mutants have a point mutation in a nitrate transporter gene of the NRT1/PTR family (NPF), NRT1.3 (AtNPF6.4). These mutants also exhibit increased resistance to putrescine and spermidine while loss-of-function mutants of the two closest homologs of NRT1.3, root-specific NRT1.1 (AtNPF6.3) and petiole-specific NRT1.4 (AtNPF6.2), were shown to have a normal sensitivity to polyamines. When the GUS reporter gene was expressed under the control of the NRT1.3 promoter, GUS staining was observed in leaf mesophyll cells and stem cortex cells but not in the epidermis, suggesting that NRT1.3 specifically functions in parenchymal tissues. We further found that the aerial part of the mutant seedling has normal levels of polyamines but shows reduced uptake of norspermidine compared with the wild type. These results suggest that polyamine transport or metabolism is associated with nitrate transport in the parenchymal tissue of the shoot.

    DOI: 10.3389/fpls.2016.00834

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  • Chemical control of xylem differentiation by thermospermine, xylemin, and auxin 査読

    Kaori Yoshimoto, Hiroyoshi Takamura, Isao Kadota, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    SCIENTIFIC REPORTS   6 ( 21487 )   2016年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:NATURE PUBLISHING GROUP  

    The xylem conducts water and minerals from the root to the shoot and provides mechanical strength to the plant body. The vascular precursor cells of the procambium differentiate to form continuous vascular strands, from which xylem and phloem cells are generated in the proper spatiotemporal pattern. Procambium formation and xylem differentiation are directed by auxin. In angiosperms, thermospermine, a structural isomer of spermine, suppresses xylem differentiation by limiting auxin signalling. However, the process of auxin-inducible xylem differentiation has not been fully elucidated and remains difficult to manipulate. Here, we found that an antagonist of spermidine can act as an inhibitor of thermospermine biosynthesis and results in excessive xylem differentiation, which is a phenocopy of a thermospermine-deficient mutant acaulis5 in Arabidopsis thaliana. We named this compound xylemin owing to its xylem-inducing effect. Application of a combination of xylemin and thermospermine to wild-type seedlings negates the effect of xylemin, whereas co-treatment with xylemin and a synthetic proauxin, which undergoes hydrolysis to release active auxin, has a synergistic inductive effect on xylem differentiation. Thus, xylemin may serve as a useful transformative chemical tool not only for the study of thermospermine function in various plant species but also for the control of xylem induction and woody biomass production.

    DOI: 10.1038/srep21487

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  • サーモスペルミン/木部分化の鍵を握る低分子

    高橋卓, 本瀬宏康

    生物の科学 遺伝   ( 9 )   356 - 360   2016年

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  • Structure, function, and evolution of plant NIMA-related kinases: Implication for phosphorylation-dependent microtubule regulation(共著) 査読

    S. Takatani, K. Otani, M. Kanazawa, T. Takahashi, H. Motose

    J. Plant Res.   128 ( 6 )   875 - 891   2015年11月

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  • ATML1 and PDF2 play a redundant and essential role in Arabidopsis embryo development(共著) 査読

    E. Ogawa, Y. Yamada, N. Sezaki, S. Kosaka, H. Kondo, N. Kamata, M. Abe, Y. Komeda, T. Takahashi

    Plant Cell Physiol.   56 ( 6 )   1183 - 1192   2015年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcv045

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  • Abscisic acid induces ectopic outgrowth in epidermal cells through cortical microtubule reorganization in Arabidopsis thaliana(共著) 査読

    S. Takatani, T. Hirayama, T. Hashimoto, T. Takahashi, H. Motose

    Sci. Rep.   5   11364   2015年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/srep11364

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  • Regulation and diversity of polyamine biosynthesis in plants 査読

    Taku Takahashi, Wurina Tong

    Polyamines: A Universal Molecular Nexus for Growth, Survival, and Specialized Metabolism   27 - 44   2015年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer Japan  

    In higher plants, the main route for putrescine synthesis may be from arginine. Higher accumulation of putrescine under biotic and abiotic stress conditions is attributed at least in part to stress-inducible expression of arginine decarboxylase genes. Regulation of spermidine synthesis involves translational control of the S -adenosylmethionine decarboxylase mRNA, which is responsive to cellular polyamine levels. Genes encoding S -adenosylmethionine decarboxylase and spermine synthase are also responsive to environmental stimuli or show preferential expression in certain organs. Stress-inducible expression of these genes involves plant hormone signaling of abscisic acid (ABA) or methyl jasmonate (MeJA). Thermospermine synthase is widely distributed in the plant kingdom but has a unique role in the repression control of xylem differentiation in higher plants. Expression of the gene for thermospermine synthase is under negative feedback control by thermospermine. Putrescine, spermidine, and cadaverine are also essential precursors for alkaloid biosynthesis in some plant species. Polyamines occur in various aspects of plant growth as a conjugated form with cinnamic acids and proteins. Genes responsible for these conjugations have been increasingly identified.

    DOI: 10.1007/978-4-431-55212-3_3

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  • Mutations in ribosomal proteins, RPL4 and RACK1, suppress the phenotype of a thermospermine-deficient mutant of Arabidopsis thaliana(共著) 査読

    J. I. Kakehi, E. Kawano, K. Yoshimoto, Q. Cai, A. Imai, T. Takahashi

    PLoS ONE   10 ( 1 )   e0117309   2015年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.pone.0117309

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  • Thermospermine modulates expression of auxin-related genes in Arabidopsis(共著) 査読

    W. Tong, K. Yoshimoto, J.-I. Kakehi, H. Motose, M. Niitsu, T. Takahashi

    Front. Plant Sci.   5 ( 94 )   2014年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3389/fpls.2014.00094

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  • Allele-specific effects of PDF2 on floral morphology in Arabidopsis thaliana 査読

    Naoko Kamata, Ayaka Sugihara, Yoshibumi Komeda, Taku Takahashi

    Plant Signaling and Behavior   8 ( 12 )   1 - 3   2014年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The class IV Homeodomain-leucine zipper (HD-ZIP IV) gene family includes several genes that are functionally significant in epidermal development. Our recent study revealed that double mutants of the epidermis-expressed HD-ZIP IV members, PROTODERMAL FACTOR2 (PDF2) in combination with some HOMEODOMAIN GLABROUS (HDG, pronounced "hedge") genes, affect stamen development and specification of petal and stamen identity, possibly in a non cell-autonomous manner. However, the effect of the pdf2 mutations on the floral development was largely different depending on T-DNA insertion locations: pdf2-1 hdg flowers exhibited homeotic conversion of petals and stamens, while pdf2-2 hdg flowers had only a reduced number of stamens. Here, we used 2 additional pdf2 alleles to make double mutants and found that their floral phenotypes were rather similar to those of pdf2-2 hdg. The allele-specific effect caused by pdf2-1, which carries a T-DNA in a steroidogenic acute regulatory protein-related lipid transfer (START) domainencoding region, suggests the importance of the START domain in proper function of HD-ZIP IV proteins. © 2014 Landes Bioscience.

    DOI: 10.4161/psb.27417

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  • Mutations in epidermis-specific HD-ZIP IV genes affect floral organ identity in Arabidopsis thaliana.(共著) 査読

    Kamata N, Okada H, Komeda Y, Takahashi T

    The Plant Journal   75 ( 3 )   430 - 440   2013年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/tpj.12211

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  • Determination of polyamines in Arabidopsis thaliana by capillary electrophoresis using salicylaldehyde-5-sulfonate as a derivatizing reagent 査読

    Genki Inoue, Takashi Kaneta, Toshio Takayanagi, Junichi Kakehi, Hiroyasu Motose, Taku Takahashi

    ANALYTICAL METHODS   5 ( 11 )   2854 - 2859   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ROYAL SOC CHEMISTRY  

    Herein, we report a novel method for the determination of polyamines in a sample extracted from Arabidopsis thaliana by capillary electrophoresis (CE) using salicylaldehyde-5-sulfonate (SAS) as a derivatizing reagent. An aldehyde group of SAS forms a Schiff base with amino groups of aliphatic polyamines, resulting in an anionic species with an absorption band in the ultraviolet region. The derivatization method was straightforward since the derivatives were formed by mixing a sample with the derivatizing reagent at a neutral pH. In addition, the negative charges induced by SAS led to a high resolution with a short analysis time. This method permitted the separation of five polyamines, which play important roles in plants. However, further improvement in sensitivity was needed for the determination of the polyamines in plant samples. Therefore, the CE method was coupled with solid-phase extraction (SPE) using an ion-pairing formation with sodium dodecyl benzene sulfonate. The SPE method improved the concentration limits of detection to sub-mu M levels, which corresponded with a 10-fold enhancement. The calibration curves for cadaverine, putrescine, and spermidine were linear with concentrations that ranged from 1 to 20 mu M and correlation coefficients (R-2) were greater than 0.998. The proposed method was applied to the determination of spermidine in a plant sample, Arabidopsis thaliana.

    DOI: 10.1039/c3ay26360f

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  • NIMA-related kinases regulate directional cell growth and organ development through microtubule function in Arabidopsis thaliana.(共著) 査読 国際誌

    Motose H, Takatani S, Ikeda T, Takahashi T

    Plant Signaling Behavior   7 ( 12 )   1552 - 5   2012年12月

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    記述言語:英語  

    DOI: 10.4161/psb.22412

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  • Thermospermine suppresses auxin-inducible xylem differentiation in Arabidopsis thaliana. (共著) 査読

    Yoshimoto K, Noutoshi Y, Hayashi K, Shirasu K, Takahashi T, Motose H

    Plant Signaling Behavior   7 ( 8 )   937 - 939   2012年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.4161/psb.20784

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  • Thermospermine is Not a Minor Polyamine in the Plant Kingdom 査読

    Ayaka Takano, Jun-Ichi Kakehi, Taku Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   53 ( 4 )   606 - 616   2012年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    Thermospermine is a structural isomer of spermine, which is one of the polyamines studied extensively in the past, and is produced from spermidine by the action of thermospermine synthase encoded by a gene named ACAULIS5 (ACL5) in plants. According to recent genome sequencing analyses, ACL5-like genes are widely distributed throughout the plant kingdom. In Arabidopsis, ACL5 is expressed specifically during xylem formation from procambial cells to differentiating xylem vessels. Loss-of-function mutants of ACL5 display overproliferation of xylem vessels along with severe dwarfism, suggesting that thermospermine plays a role in the repression of xylem differentiation. Studies of suppressor mutants of acl5 that recover the wild-type phenotype in the absence of thermospermine suggest that thermospermine acts on the translation of specific mRNAs containing upstream open reading frames (uORFs). Thermospermine is a novel type of plant growth regulator and may also serve in the control of wood biomass production.

    DOI: 10.1093/pcp/pcs019

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  • A chemical biology approach reveals an opposite action between thermospermine and auxin inxylem development in Arabidopsis thaliana.(共著) 査読

    Yoshimoto K, Noutoshi Y, Hayashi K, Shirasu K, Takahashi T, Motose H

    Plant and Cell Physiology   53 ( 4 )   635 - 645   2012年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcs017

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  • Key proliferative activity in the junction between the leaf blade and leaf petiole of Arabidopsis thaliana.(共著) 査読

    Ichihashi Y, Kawade K, Usami T, Horiguchi G, Takahashi T, Tsukaya H

    Plant Physiology   157 ( 3 )   1151 - 1162   2011年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.111.185066

    Web of Science

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  • NIMA-related kinases 6, 4, and 5 interact with each other to regulate microtubule organization during epidermal cell expansion in Arabidopsis thaliana.(共著) 査読

    Motose H, Hamada T, Yoshimoto K, Murata T, Hasebe M, Watanabe Y, Hashimoto T, Sakai T, Takahashi T

    The Plant Journal   67 ( 6 )   993 - 1005   2011年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.2011.04652.x

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  • Arabidopsis Qa-SNARE SYP2 proteins localized to different subcellular regions function redundantly in vacuolar protein sorting and plant development. (共著)

    M. Shirakawa, H. Ueda, T. Shimada, Y. Koumoto, T.-L. Shimada, M. Kondo, T. Takahashi, Y. Okuyama, M. Nishimura, I. Hara-Nishimura

    Plant J.   64 ( 6 )   924 - 935   2010年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.2010.04394.x

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  • Norspermine substitutes for thermospermine in the control of stem elongation in Arabidopsis thaliana. (共著) 査読

    J.-I. Kakehi, Y. Kuwashiro, H. Motose, K. Igarashi, T. Takahashi

    FEBS Lett.   584 ( 14 )   3042 - 3046   2010年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.febslet.2010.05.035

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  • Polyamines: Ubiquitous Polycations with Unique Roles in Growth and Stress Responses.(共著) 査読

    T. Takahashi, J.-I. Kakehi

    Ann. Bot.   105 ( 1 )   1 - 6   2010年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/aob/mcp259

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  • シロイヌナズナSYP2ファミリーSNAREタンパク質の機能解析 査読

    白川 一, 上田 晴子, 西山 千晶, 嶋田 知生, 河本 恭子, 近藤 真紀, 高橋 卓, 西村 幹夫, 西村 いくこ

    日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集   2010 ( 0 )   127 - 127   2010年

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    出版者・発行元:日本植物生理学会  

    シロイヌナズナゲノムには4種類のSYP2ファミリーSNAREタンパク質がコードされている.過去に,VAM3/SYP22 及びPEP12/SYP21の単独変異体は致死性を示すことが報告されている.しかしながら,我々はこれまで,vam3/syp22変異体を単離することに成功し,変異体の解析から,VAM3/SYP22が植物の成長・維管束パターンの形成・ミロシン細胞分化に関与していることを報告してきた.このことから,SYP2ファミリーの機能について再検証が必要であると考えられる.今回,我々はplp/syp23の変異体を確立することに成功し,加えて,vam3/syp22との多重変異体を作製した.さらに,artificial microRNAによる遺伝子抑制法により,vam3/syp22変異体背景でPEP12/SYP21の遺伝子発現を抑制することに成功した.これらの変異体の表現型の解析から,VAM3/SYP22PEP12/SYP21PLP/SYP23が冗長的に機能していることを発見した.興味深いことに,GFP融合タンパク質を用いた細胞内局在の解析により,PLP/SYP23が膜成分に局在することなくSNAREタンパク質として機能している可能性を見出した.そこで,本大会ではSYP2ファミリーの機能について議論したい.

    DOI: 10.14841/jspp.2010.0.0127.0

    CiNii Article

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  • Infrared laser-mediated local gene induction in medaka, zebrafish and Arabidopsis thaliana 査読

    Tomonori Deguchi, Mariko Itoh, Hiroko Urawa, Tomohiro Matsumoto, Sohei Nakayama, Takashi Kawasaki, Takeshi Kitano, Shoji Oda, Hiroshi Mitani, Taku Takahashi, Takeshi Todo, Junichi Sato, Kiyotaka Okada, Kohei Hatta, Shunsuke Yuba, Yasuhiro Kamei

    Development Growth and Differentiation   51 ( 9 )   769 - 775   2009年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Heat shock promoters are powerful tools for the precise control of exogenous gene induction in living organisms. In addition to the temporal control of gene expression, the analysis of gene function can also require spatial restriction. Recently, we reported a new method for in vivo, single-cell gene induction using an infrared laser-evoked gene operator (IR-LEGO) system in living nematodes (Caenorhabditis elegans). It was demonstrated that infrared (IR) irradiation could induce gene expression in single cells without incurring cellular damage. Here, we report the application of IR-LEGO to the small fish, medaka (Japanese killifish
    Oryzias latipes) and zebrafish (Danio rerio), and a higher plant (Arabidopsis thaliana). Using easily observable reporter genes, we successfully induced gene expression in various tissues in these living organisms. IR-LEGO has the potential to be a useful tool in extensive research fields for cell/tissue marking or targeted gene expression in local tissues of small fish and plants. © 2009 Japanese Society of Developmental Biologists.

    DOI: 10.1111/j.1440-169X.2009.01135.x

    Scopus

    PubMed

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  • A semi-dominant mutation in a ribosomal protein L10 gene suppresses the dwarf phenotype of the acl5 mutant in Arabidopsis thaliana. (共著)

    A. Imai, M. Komura, E. Kawano, Y. Kuwashiro, T. Takahashi

    The Plant Journal   56 ( 6 )   881 - 890   2008年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.2008.03647.x

    Web of Science

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  • Thermospermine is required for stem elongation in Arabidopsis thaliana. (共著)

    J.-I. Kakehi, Y. Kuwashiro, M. Niitsu, T. Takahashi

    Plant and Cell Physiology   49 ( 9 )   1342 - 1349   2008年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcn109

    Web of Science

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  • ミロシン細胞分化におけるSYP2ファミリーSNAREタンパク質の役割 査読

    上田 晴子, 白川 一, 西山 千晶, 嶋田 知生, 高橋 卓, 西村 いくこ

    日本植物生理学会年会およびシンポジウム 講演要旨集   2008 ( 0 )   794 - 794   2008年

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    出版者・発行元:日本植物生理学会  

    ミロシン細胞はアブラナ科に特異的な異型細胞である.葉のミロシン細胞は主に維管束近傍に点在し,周囲の細胞に比べて顕著に伸張し分枝する場合もある.ミロシン細胞の液胞は発達しており,内部に蓄積されたミロシナーゼがグルコシノレート(カラシ油配糖体)を分解して辛み成分を生成することによって植物の生体防御に関与する.現在のところ,ミロシン細胞の分化機構は全く未知である.これまで,ミロシン細胞の数が増加して異常な分布パターンを示すatvam3変異体の解析から,ミロシン細胞と導管の分化が植物ホルモンによって制御されている可能性を報告してきた.AtVAM3は液胞膜と液胞前区画膜に局在するSYP2ファミリーに属するSNAREタンパク質である.シロイヌナズナにはAtVAM3以外に2つのSYP2タンパク質 (AtPEP12およびAtPLP) が存在することから,ミロシン細胞分化におけるこれらの関与を解析した.その結果,atpep12変異体およびatplp変異体では,ミロシン細胞の数と分布パターンに異常はなかった.atvam3変異体との多重変異体では,atvam3単独変異体よりもミロシン細胞分化において顕著な異常を示し,さらにatvam3単独変異体では見られなかった新たな表現型を持つことが明らかとなった.以上の結果から,SYP2ファミリーの機能について考察したい.

    DOI: 10.14841/jspp.2008.0.0794.0

    CiNii Article

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  • A protective role for the polyamine spermine against drought stress in Arabidopsis

    Koji Yamaguchi, Yoshihiro Takahashi, Thomas Berberich, Akihiko Imai, Taku Takahashi, Anthonv J. Michael, Tomonobu Kusano

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   352 ( 2 )   486 - 490   2007年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE  

    Cellular polyamine content often changes in response to abiotic stresses. However, its physiological relevance is unknown. We found that an Arabidopsis mutant plant (acl5lspms), which cannot produce spermine, is hypersensitive to high salt. Examination of drought sensitivity of the mutant and comparison with wild type plants indicated hypersensitivity to drought. This phenotype was cured by spermine pretreatment but not by the other polyamines putrescine and spermidine, suggesting that drought-hypersensitivity exhibited by the mutant is due to spermine deficiency. The water loss rate of wild type and mutant plants were similar until 20 min after onset of dehydration stress, but after a longer exposure the rate in mutant plants was higher than in wild type plants. Consistent with this result, the stomata of the mutant leaves remained open while in wild type leaves they closed. Based on the collected data, we discuss a role for spermine in response to drought stress. (c) 2006 Elsevier Inc. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2006.11.041

    Web of Science

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  • The polyamine spermine protects against high salt stress in Arabidopsis thaliana

    Koji Yamaguchi, Yoshihiro Takahashi, Thomas Berberich, Akihiko Imai, Atsushi Miyazaki, Taku Takahashi, Anthony Michael, Tomonobu Kusano

    FEBS LETTERS   580 ( 30 )   6783 - 6788   2006年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    It is well known that changes in abiotic conditions such as the concentration of ions, temperature and humidity lead to modulation of polyamine contents in plants. However, little is known about the relevant parts these polyamines play in abiotic stress responses. Here we addressed a specific role of spermine during high salt stress using an Arabidopsis double knockoutmutant plant (acl5lspnrs) which cannot produce spermine. The mutant showed higher sensitivity to high salt than wild type plants. This phenotype was cured by exogenous spermine but not by the other polyamines putrescine and spermidine, suggesting a strong link between spermine-deficiency and NaCl-hypersensitivity. The mutant was also hypersensitive to high levels of KCl but not to MgCl2 or to high osmoticum. NaCl-hypersensitivity of the mutant was compromised by treatment with Ca2+ channel blockers. Moreover, the mutant showed poor growth on Ca2+-depleted Murashige-Skoog agar media. The data suggest that the absence of spermine causes an imbalance in Ca2+ homeostasis in the mutant plant. Based on the data obtained, we propose a model for a role of spermine in high salt stress responses. (c) 2006 Federation of European Biochemical Societies. Published by Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.febslet.2006.10.078

    Web of Science

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  • The dwarf phenotype of the Arabidopsis acl5 mutant is suppressed by a mutation in an upstream ORF of a bHLH gene

    Akihiro Imai, Yoshie Hanzawa, Mio Komura, Kotaro T. Yamamoto, Yoshibumi Komeda, Taku Takahashi

    DEVELOPMENT   133 ( 18 )   3575 - 3585   2006年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:COMPANY OF BIOLOGISTS LTD  

    Loss-of-function mutants of the Arabidopsis thaliana ACAULIS 5 (ACL5) gene, which encodes spermine synthase, exhibit a severe dwarf phenotype. To elucidate the ACL5-mediated regulatory pathways of stem internode elongation, we isolated four suppressor of acaulis (sac) mutants that reverse the acl5 dwarf phenotype. Because these mutants do not rescue the dwarfism of known phytohormone-related mutants, the SAC genes appear to act specifically on the ACL5 pathways. We identify the gene responsible for the dominant sac51-d mutant, which almost completely suppresses the acl5 phenotype. sac51-d disrupts a short upstream open reading frame (uORF) of SAC51, which encodes a bHLH-type transcription factor. Our results indicate that premature termination of the uORF in sac51-d results in an increase in its own transcript level, probably as a result of an increased translation of the main ORF. We suggest a model in which ACL5 plays a role in the translational activation of SAC51, which may lead to the expression of a subset of genes required for stem elongation.

    DOI: 10.1242/dev.02535

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  • Characterization of the class IV homeodomain-leucine zipper gene family in Arabidopsis

    Miyuki Nakamura, Hiroshi Katsumata, Mitsutomo Abe, Naoto Yabe, Yoshibumi Komeda, Kotaro T. Yamamoto, Taku Takahashi

    PLANT PHYSIOLOGY   141 ( 4 )   1363 - 1375   2006年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC PLANT BIOLOGISTS  

    The Arabidopsis ( Arabidopsis thaliana) genome contains 16 genes belonging to the class IV homeodomain-Leucine zipper gene family. These include GLABRA2, ANTHOCYANINLESS2, FWA, ARABIDOPSIS THALIANA MERISTEM LAYER1 ( ATML1), and PROTODERMAL FACTOR2 (PDF2). Our previous study revealed that atml1 pdf2 double mutants have severe defects in the shoot epidermal cell differentiation. Here, we have characterized additional members of this gene family, which we designated HOMEODOMAIN GLABROUS1 (HDG1) through HDG12. Analyses of transgenic Arabidopsis plants carrying the gene-specific promoter fused to the bacterial beta-glucuronidase reporter gene revealed that some of the promoters have high activities in the epidermal layer of the shoot apical meristem and developing shoot organs, while others are temporarily active during reproductive organ development. Expression profiles of highly conserved paralogous gene pairs within the family were found to be not necessarily overlapping. Analyses of T-DNA insertion mutants of these HDG genes revealed that all mutants except hdg11 alleles exhibit no abnormal phenotypes. hdg11 mutants show excess branching of the trichome. This phenotype is enhanced in hdg11 hdg12 double mutants. Double mutants were constructed for other paralogous gene pairs and genes within the same subfamily. However, novel phenotypes were observed only for hdg3 atml1 and hdg3 pdf2 mutants that both exhibited defects in cotyledon development. These observations suggest that some of the class IV homeodomain-Leucine zipper members act redundantly with other members of the family during various aspects of cell differentiation. DNA-binding sites were determined for two of the family members using polymerase chain reaction-assisted DNA selection from random oligonucleotides with their recombinant proteins. The binding sites were found to be similar to those previously identified for ATML1 and PDF2, which correspond to the pseudopalindromic sequence 5'-GCATTAAATGC-3' as the preferential binding site.

    DOI: 10.1104/pp.106.077388

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  • AtVAM3 is required for normal specification of idioblasts, myrosin cells

    H Ueda, C Nishiyama, T Shimada, Y Koumoto, Y Hayashi, M Kondo, T Takahashi, Ohtomo, I, M Nishimura, Hara-Nishimura, I

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   47 ( 1 )   164 - 175   2006年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    Myrosin cells in Capparales plants are idioblasts that accumulate thioglucoside glucohydrolase (TGG, also called myrosinase), which hydrolyzes glucosinolates to produce toxic compounds for repelling pests. Here, we show that AtVAM3 is involved in development of myrosin cells. It has been shown that yeast VAM3 is a Q.-SNARE that is involved in vesicle transport of vacuolar proteins and vacuolar assembly. We found that two Arabidopsis atvam3 alleles, atvam3-3 and atvain3-4/ssin, accumulate large amounts of TGG1 and TGG2 that are enzymatically active. An immunogold analysis revealed that TGGs were specifically localized in the vacuole of myrosin cells in atvam3 mutants. This result indicates that TGGs are normally transported to vacuoles in these mutants and that AtVAM3 is not essential for vacuolar transport of the proteins. We developed a staining method with Coomassie brilliant blue that detects myrosin cells in whole leaves by their high TGG content. This method showed that atvam3 leaves have a larger number of myrosin cells than do wild-type leaves. Myrosin cells were scattered along leaf veins in wild-type leaves, while they were abnormally distributed in atvam3 leaves. The mutants developed a network of myrosin cells throughout the leaves: myrosin cells were not only distributed continuously along leaf veins, but were also observe independent of leaf veins. The excess of myrosin cells in atvam3 mutants might be responsible for the abnormal abundance of TGGs and the reduction of elongation of inflorescence stems and leaves in these mutants. Our results suggest that AtVAM3 has a plant-specific function in development of myrosin cells.

    DOI: 10.1093/pcp/pci232

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  • Identification of an allele of VAM3/SYP22 that confers a semi-dwarf phenotype in Arabidopsis thaliana

    Ohtomo, I, H Ueda, T Shimada, C Nishiyama, Y Komoto, Hara-Nishimura, I, T Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   46 ( 8 )   1358 - 1365   2005年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    The short stem and midrib (ssm) mutants of Arabidopsis thaliana show both semi-dwarf and wavy leaf phenotypes due to defects in the elongation of the stem internodes and leaves. Moreover, these abnormalities cannot be recovered by exogenous phytohormones. ssm was originally identified as a single recessive mutant of the ecotype Columbia (Col-0), but genetic crossing experiments have revealed that this mutant phenotype is restored by another gene that is functional in the ecotype Landsberg erecta (Ler) and not in Col-0. Map-based cloning of the gene that is defective in ssm mutants has uncovered a small deletion in the sixth intron of a gene encoding a syntaxin, VAM3/SYP22, which has been implicated in vesicle transport to the vacuole. This mutation appears to cause a peptide insertion in the deduced VAM3/SYP22 polypeptide sequence due to defective splicing of the shortened sixth intron. Significantly, when compared with the wild-type Ler genome, the wild-type Col-0 genome has a single base pair deletion causing a frameshift mutation in SYP23, a gene with the highest known homology to VAM3/SYP22. These findings suggest that VAM3/SYP22 and SYP23 have overlapping functions and that the vesicle transport mediated by these syntaxins is important for shoot morphogenesis.

    DOI: 10.1093/pcp/pci146

    Web of Science

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  • AtXTH27 plays an essential role in cell wall modification during the development of tracheary elements

    A Matsui, R Yokoyama, M Seki, T Ito, K Shinozaki, T Takahashi, Y Komeda, K Nishitani

    PLANT JOURNAL   42 ( 4 )   525 - 534   2005年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:WILEY-BLACKWELL  

    Xyloglucan endotransglucosylases/hydrolases (XTHs) are a class of enzymes capable of catalyzing the molecular grafting between xyloglucans and/or the endotype hydrolysis of a xyloglucan molecule. They are encoded by 33 genes in Arabidopsis. Whereas recent studies have revealed temporally and spatially specific expression profiles for individual members of this family in plants, their biological roles are still to be clarified. To identify the role of each member of this gene family, we examined phenotypes of mutants in which each of the Arabidopsis XTH genes was disrupted. This was undertaken using a reverse genetic approach, and disclosed two loss-of-function mutants for the AtXTH27 gene, xth27-1 and xth27-2. These exhibited short-shaped tracheary elements in tertiary veins, and reduced the number of tertiary veins in the first leaf. In mature rosette leaves of the mutant, yellow lesion-mimic spots were also observed. Upon genetic complementation by introducing the wild-type XTH27 gene into xth27-1 mutant plants, the number of tertiary veins was restored, and the lesions disappeared completely. Extensive expression of the pXTH27::GUS fusion gene was observed in immature tracheary elements in the rosette leaves. The highest level of AtXTH27 mRNA expression in the rosette leaves was observed during leaf expansion, when the tracheary elements were elongating. These findings indicate that AtXTH27 plays an essential role during the generation of tracheary elements in the rosette leaves of Arabidopsis.

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.2005.02395.x

    Web of Science

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  • The plant exon finder: a tool for precise detection of exons using a T-DNA-based tagging approach

    F Jingu, T Shirase, Ohtomo, I, A Imai, Y Komeda, T Takahashi

    GENE   338 ( 2 )   267 - 273   2004年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    We have developed a new tool, named the plant exon finder (PEF), for identifying exons in plant genome sequences as an applied technique of T-DNA insertional mutagenesis. The T-DNA constructs contain a heat-shock gene promoter or the cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S promoter, followed by the first exon of an Arabidopsis gene with its start codon and the intron donor sequence facing the TDNA left border (LB) in order to trap exons in the genome. The constructs were used to make transgenic Arabidopsis plants. We generated 280 transgenic lines and identified 156 T-DNA-tagged readthrough transcripts by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) using an oligo(dT)-linker primer and a T-DNA-specific primer. Sequence analysis of the RT-PCR products revealed that 18 of them carried cDNAs processed by the use of an intron acceptor sequence adjacent to T-DNA insertion sites and 11 of them were in-frame fusions. In one case, the readthrough transcript trapped an exon located 1.6 kb downstream of the site of the insertion. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.gene.2004.06.004

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  • Gene silencing using a heat-inducible RNAi system in Arabidopsis

    F Masclaux, M Charpenteau, T Takahashi, R Pont-Lezica, JP Galaud

    BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS   321 ( 2 )   364 - 369   2004年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE  

    Controlling gene expression during plant development is an efficient tool to explore gene function. In this paper, we describe a gene expression system driven by a heat-shock gene promoter (HSP18.2), to trigger the expression of an intron-containing inverted-repeat. RNA interference became a powerful way for gene functional analysis by reverse genetic approaches. However, constitutive gene silencing cannot be used with genes involved in fundamental processes such as embryo viability. Inducible promoters provide an alternative approach for temporal and spatial gene expression control and we described here a new system, complementary to those using chemical gene inducers. To evaluate the efficiency of this system, RNA corresponding to the phytoene desaturase gene of Arabidopsis thaliana was used as a reporter gene in transgenic plants and a comparative study was performed using either the CaMV35S constitutive promoter or the HSP18.2 inducible promoter. (C) 2004 Elsevier Inc. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/j.bbrc.2004.06.154

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  • Spermidine synthase genes are essential for survival of Arabidopsis

    A Imai, T Matsuyama, Y Hanzawa, T Akiyama, M Tamaoki, H Saji, Y Shirano, T Kato, H Hayashi, D Shibata, S Tabata, Y Komeda, T Takahashi

    PLANT PHYSIOLOGY   135 ( 3 )   1565 - 1573   2004年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC PLANT BIOLOGISTS  

    The cellular polyamines putrescine, spermidine, and spermine are ubiquitous in nature and have been implicated in a wide range of growth and developmental processes. There is little information, however, on mutant plants or animals defective in the synthesis of polyamines. The Arabidopsis genome has two genes encoding spermidine synthase, SPDS1 and SPDS2. In this paper, we describe T-DNA insertion mutants of both of these genes. While each mutant allele shows normal growth, spds1-1 spds2-1 double-mutant seeds are abnormally shrunken and they have embryos that are arrested morphologically at the heart-torpedo transition stage. These seeds contain significantly reduced levels of spermidine and high levels of its precursor, putrescine. The embryo lethal phenotype of spds1-1 spds2-1 is complemented by the wild-type SPDS1 gene. In addition, we observed a nearly identical seed phenotype among an F, seed population from the cross between the spds2-1. allele and SPDS1 RNA interference transgenic lines. These data provide the first genetic evidence indicating a critical role of the spermidine synthase in plant embryo development.

    DOI: 10.1104/pp.104.041699

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  • Spermine is not essential for survival of Arabidopsis

    A Imai, T Akiyama, T Kato, S Sato, S Tabata, KT Yamamoto, T Takahashi

    FEBS LETTERS   556 ( 1-3 )   148 - 152   2004年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    Spermine is the final product of the polyamine biosynthetic pathway and is ubiquitously present in most organisms. The genome of Arabidopsis thaliana has two genes encoding spermine synthase: ACAULIS5 (ACL5), whose loss-of-function mutants show a severe defect in stem elongation, and SPMS. In order to elucidate the function of spermine in plants, we isolated a T-DNA insertion mutant of the SPMS gene. Free and conjugated spermine levels in the mutant, designated spms-1, were significantly decreased compared with those in the wildtype, but no obvious morphological phenotype was observed in spms-1 plants. We further confirmed that acl5-1 spms-1 double mutants contained no spermine. Surprisingly, acl5-1 spms-1 was fully as viable as the wild-type and showed no phenotype except for the reduced stem growth due to acl5-1. These results indicate that spermine is not essential for survival of Arabidopsis, at least under normal growth conditions. (C) 2003 Federation of European Biochemical Societies. Published by Elsevier B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/S0014-5793(03)01395-4

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  • Regulation of shoot epidermal cell differentiation by a pair of homeodomain proteins in Arabidopsis

    M Abe, H Katsumata, Y Komeda, T Takahashi

    DEVELOPMENT   130 ( 4 )   635 - 643   2003年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:COMPANY OF BIOLOGISTS LTD  

    In higher plants, the outermost cell layer (L1) of the shoot apex gives rise to the epidermis of shoot organs. Our previous study demonstrated that an 8-bp motif named the L1 box functions as a cis-regulatory element for L1-specific gene expression in the shoot system of Arabidopsis. We show here that PROTODERMAL FACTOR2 (PDF2), a member of the HD-GL2 class of homeobox genes, is expressed exclusively in the L1 of shoot meristems and that recombinant PDF2 protein specifically binds to the L1 box in vitro. Although knockout mutants of PDF2 and ATML1, another L1-specific HD-GL2 class gene sharing the highest homology with PDF2, display normal shoot development, the double mutant results in severe defects in shoot epidermal cell differentiation. This suggests that PDF2 and ATML1 are functionally interchangeable and play a critical role in maintaining the identity of L1 cells, possibly by interacting with their L1 box and those of downstream target-gene promoters.

    DOI: 10.1242/dev.00292

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  • Characterization of the spermidine synthase-related gene family in Arabidopsis thaliana

    Y Hanzawa, A Imai, AJ Michael, Y Komeda, T Takahashi

    FEBS LETTERS   527 ( 1-3 )   176 - 180   2002年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:ELSEVIER SCIENCE BV  

    The Arabidopsis genome contains four genes that encode proteins similar to both spermidine synthase and spermine synthase of other organisms. Our previous study revealed that one of these genes, designated ACAULIS5 (ACL5), encodes spermine synthase and that its null mutation results in a severe defect in the elongation of stem internodes. Here we report the characterization of the other three genes, designated SPDS1, SPDS2 and SPDS3. Our results showed that SPDS1 and SPDS2 possess spermidine synthase activity in yeast spermidine synthase-deficient mutants, but the enzyme activity of SPDS3 remained to be determined. RNA gel blot analysis revealed that all of these genes are expressed in all plant organs but show different responses to exogenous plant hormones, suggesting that they are involved in different aspects of growth by modulating the contents of polyamines in plant cells. (C) 2002 Federation of European Biochemical Societies. Published by Elsevier Science B.V. All rights reserved.

    DOI: 10.1016/S0014-5793(02)03217-9

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  • Disruption of a DNA topoisomerase I gene affects morphogenesis in Arabidopsis

    T Takahashi, S Matsuhara, M Abe, Y Komeda

    PLANT CELL   14 ( 9 )   2085 - 2093   2002年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC PLANT BIOLOGISTS  

    The genesis of phyllotaxis, which often is associated with the Fibonacci series of numbers, is an old unsolved puzzle in plant morphogenesis. Here, we show that disruption of an Arabidopsis topoisomerase (topo) I gene named TOP1alpha affects phyllotaxis and plant architecture. The divergence angles and internode lengths between two successive flowers were more random in the top1alpha mutant than in the wild type. The top1alpha plants sporadically produced multiple flowers from one node, and the number of floral organ primordia often was different. The mutation also caused the twisting of inflorescences; and individual flowers and the serration of leaf margins. These morphological abnormalities indicate that TOP1alpha may play a critical role in the maintenance of a regular pattern of organ initiation. The top1alpha mutant transformed with the RNA interference construct for TOP1beta, another topo I gene arrayed tandemly with TOP1alpha, was found to be lethal at young seedling stages, suggesting that topo I activity is essential in plants.

    DOI: 10.1105/tpc.001925

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  • Formation of corymb-like inflorescences due to delay in bolting and flower development in the corymbosa2 mutant of arabidopsis

    M Suzuki, T Takahashi, Y Komeda

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   43 ( 3 )   298 - 306   2002年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    Among the wild-type ecotypes of Arabidopsis thaliana vegetative shoot meristem to an inflorescence meristem is whose shape of inflorescence is categorized as raceme, the ecotype Landsberg harboring the erecta (er) mutation shows a corymb-like inflorescence, namely, a compact inflorescence with a flattened arrangement of flower buds at the tip. The fact that the ER gene encodes a receptor-like protein kinase implies the presence of a signaling cascade responsible for the inflorescence morphology of flowering plants. We report here the characterization of another mutant with a corymb-like inflorescence, named corymbosa2 (crm2), and the isolation of the CRM2 gene. While the er mutation causes a severe reduction in the length of pedicels, the crm2 mutation results in a significant delay in the initiation of internode elongation and in the development of flowers, despite having little effect on the timing of floral induction. Consequently, the number of flower buds is apparently increased at the tip of crm2 inflorescence. The crm2 er double mutant shows an additive phenotype. These results suggest that CRM2 and ER may act in different ways to generate wild-type inflorescence. The CRM2 gene was isolated by positional cloning and appears to encode a polypeptide with no significant homology to known sequences.

    DOI: 10.1093/pcp/pcf036

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  • Identification of a cis-regulatory element for L1 layer-specific gene expression, which is targeted by an L1-specific homeodomain protein

    M Abe, T Takahashi, Y Komeda

    PLANT JOURNAL   26 ( 5 )   487 - 494   2001年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BLACKWELL SCIENCE LTD  

    The Arabidopsis thaliana PROTODERMAL FACTOR1 (PDF1) gene encoding a putative extracellular proline-rich protein is exclusively expressed in the L1 layer of shoot apices and the protoderm of organ primordia. In order to identify essential cis-regulatory sequences required for the L1 layer-specific expression, a series of 5' deletions of the PDF1 promoter were fused to the beta -glucronidase (GUS) gene and introduced into Arabidopsis plants. Our analysis revealed that the minimum region necessary to confer L1-specific expression of PDF1 is confined within a 260-bp fragment upstream of the transcription start site. We identified an 8-bp motif in this region that is conserved between promoter regions of all the L1-specific genes so far cloned, and we designated it the L1 box. Electrophoretic mobility shift assays demonstrated that the L1-specific homeodomain protein ATML1 can bind to the L1 box sequence in vitro. The GUS expression in transgenic plants disappeared when a mutation that abolishes binding of ATML1 was introduced into the PDF1 /1 box sequence of the construct. These results suggest that the L1 box plays a crucial role in the regulation of PDF1 expression in L1 cells and that ATML1 could cooperate to drive L1-specific expression.

    DOI: 10.1046/j.1365-313X.2001.01047.x

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  • ACAULIS5, an Arabidopsis gene required for stem elongation, encodes a spermine synthase

    Y Hanzawa, T Takahashi, AJ Michael, D Burtin, D Long, M Pineiro, G Coupland, Y Komeda

    EMBO JOURNAL   19 ( 16 )   4248 - 4256   2000年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

    Polyamines have been implicated in a wide range of biological processes, including growth and development in bacteria and animals, but their function in higher plants is unclear. Here we show that the Arabidopsis ACAULIS5 (ACL5) gene, whose inactivation causes a defect in the elongation of stem internodes by reducing cell expansion, encodes a protein that shares sequence similarity with the polyamine biosynthetic enzymes spermidine synthase and spermine synthase, Expression of the recombinant ACL5 protein in Escherichia coli showed that ACL5 possesses spermine synthase activity. Restoration of the acl5 mutant phenotype by somatic reversion of a transposon-induced allele suggests a non-cell-autonomous function for the ACL5 gene product, We also found that expression of the ACL5 cDNA under the control of a heat shock gene promoter in acl5 mutant plants restores the phenotype in a heat shock-dependent manner. The results of the experiments showed that polyamines play an essential role in promotion of internode elongation through cell expansion in Arabidopsis, We discuss the relationships to plant growth regulators such as auxin and gibberellins that have related functions.

    DOI: 10.1093/emboj/19.16.4248

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  • Heat-shock tagging: a simple method for expression and isolation of plant genome DNA flanked by T-DNA insertions

    S Matsuhara, F Jingu, T Takahashi, Y Komeda

    PLANT JOURNAL   22 ( 1 )   79 - 86   2000年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:BLACKWELL SCIENCE LTD  

    This paper describes expression profiles of the Arabidopsis HSP18.2 heat-shock gene promoter by using three different reporter genes, and the application of this promoter to a method we have developed to drive heat-shock-dependent transcription of plant genome DNA flanked by T DNA insertions. We show that, irrespective of the location of the T-DNA insertion, an HSP18.2 promoter towards the left border of the T-DNA effectively induces transcription of flanking genome sequences in response to heat shock, if polyadenylated, tagged transcripts can be easily identified by RT-PCR.

    DOI: 10.1046/j.1365-313X.2000.00716.x

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  • Salicylic acid induces the expression of a number of receptor-like kinase genes in Arabidopsis thaliana

    Y. Ohtake, T. Takahashi, Y. Komeda

    Plant and Cell Physiology   41 ( 9 )   1038 - 1044   2000年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    Receptor-like protein kinases (RLKs) are encoded by a divergent multigene family and their functions have been implicated in a wide range of signal transduction pathways. In this study, we examined the effect of salicylic acid (SA) on the expression of RLK genes in Arabidopsis thaliana. RNA gel blot analysis revealed that transcripts of RKC1 and a number of its homologs, whose translation products contain C-X8-C-X2-C motifs in the putative extracellular domain, accumulated to a higher level in response to SA treatment of plants. The chimeric fusion between the RKC1 5'-upstream region and the β-glucuronidase (GUS) reporter gene reproduced the SA responsiveness in transgenic plants. In addition, some of RLK genes of the leucine-rich repeat (LRR) class and those of the S-domain class were also induced by SA. We found that the upstream regions of these SA-responsive RLK genes contain the TTGAC sequence, which has been suggested to be important for induced expression of many plant defense genes. These results suggest the involvement of a number of RLKs in SA-mediated defense responses.

    DOI: 10.1093/pcp/pcd028

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  • 茎伸長の分子機構

    半澤芳恵, 高橋卓, 米田好文

    細胞工学別冊 植物細胞工学シリーズ   12巻 128-137頁   2000年

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  • Expression of endoxyloglucan transferase genes in acaulis mutants of Arabidopsis

    T Akamatsu, Y Hanzawa, Y Ohtake, T Takahashi, K Nishitani, Y Komeda

    PLANT PHYSIOLOGY   121 ( 3 )   715 - 721   1999年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:AMER SOC PLANT PHYSIOLOGISTS  

    A mutant of Arabidopsis with reduced internodal cell length, acaulis5 (acl5), has recently been shown to have reduced transcript levels of a gene for endoxyloglucan transferase, EXGT-A1 (Y. Hanzawa, T. Takahashi, Y. Komeda [1997] Plant J 12: 863-874). In the present study, we cloned genomic fragments of five members of the EXGT gene family, EXGT-A1, EXGT-A3, EXGT-A4, XTR2, and XTR3, and examined their expression in the wild type and in a series of acl mutants. In wild-type plants, the EXGT-A3 gene showed higher expression in lower internodes (internodes between nodes bearing axillary shoots) than in upper and young internodes, in which EXGT-A1 was highly expressed. EXGT-A4 was preferentially expressed in roots and XTR3 in siliques. The XTR2 gene was constitutively expressed. In acl1, acl3, and acl4 mutants, which have a severe defect in leaf expansion as well as in internode elongation, the EXGT-A1 gene showed reduced levels of expression before bolting of plants. In contrast, XTR3 was increased in these mutant seedlings. Reduction of EXGT-A1 expression was also detected after bolting of all acl mutants except acl2, whose growth defect is restricted to lower internodes. These results suggest the involvement of each EXGT in different aspects of organ development.

    DOI: 10.1104/pp.121.3.715

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  • Cloning and characterization of an L1 layer-specific gene in Arabidopsis thaliana

    M Abe, T Takahashi, Y Komeda

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   40 ( 6 )   571 - 580   1999年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:JAPANESE SOC PLANT PHYSIOLOGISTS  

    The shoot apical meristem unknown. In order to identify the genes that function in the SAM, we performed cDNA subtraction experiments between wild-type and terminal flower1 shoot apices. Here, we describe the cloning of a gene designated PDF1 (PROTODERMAL FACTOR1). In situ hybridization revealed that the expression of PDF1 is exclusively limited to the L1 layer of vegetative, inflorescence and floral meristems and to the protoderm of organ primordia. By contrast, P (SAM) of Arabidopsis thaliana constitutes the tunica of L1 and L2 and the corpus represented by L3 cells. Regulatory networks involved in establishing and maintaining this structure of shoot meristems remain largelyDF1 shows no detectable level of expression in the epidermis of mature organs. Specific expression of the PDF1 gene in protodermal cells is also observed during embryogenesis. The deduced amino acid sequence of PDF1 shares no significant homology with that of other known proteins but contains a putative signal peptide and novel proline-rich repeat motifs, suggesting a cell-wall protein. Possible roles of the PDF1 gene in the SAM are discussed.

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  • 熱ショック応答の分子機構

    高橋卓, 米田好文

    蛋白質核酸酵素臨時増刊 「環境応答・適応の分子機構」   44巻 39-44頁   1999年

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  • The Arabidopsis ERECTA gene is expressed in the shoot apical meristem and organ primordia(共著)

    Plant Journal   15 ( 3 )   301 - 310   1998年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1046/j.1365-313X.1998.00203.x

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  • Identification by PCR of receptor-like protein kinases from Arabidopsis flowers. (共著)

    Plant Molecular Biology   37 ( 4 )   587 - 596   1998年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1023/A:1005924817190

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  • ACL5 : an Arabidopsis gene required for internodal elongation after flowering(共著)

    Plant Journal   12 ( 4 )   863 - 874   1997年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1046/j.1365-313X.1997.12040863.x

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  • DIMINUTO gene of Arabidopsis is involved in regulating cell elongation(共著)

    Takahashi T

    Gene & Development   9 ( 1 )   97 - 107   1995年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1101/gad.9.1.97

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  • ANALYSIS OF TISSUE-SPECIFIC EXPRESSION OF ARABIDOPSIS-THALIANA HSP9O-FAMILY GENE HSP81 査読

    N YABE, T TAKAHASHI, Y KOMEDA

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   35 ( 8 )   1207 - 1219   1994年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:JAPANESE SOC PLANT PHYSIOLOGISTS  

    We have isolated three HSP90-family genes from Arabidopsis: HSP81-1 which is heat-inducible, and HSP81-2 and -3 which are highly expressed under normal growth temperatures. Northern blot analysis and RNase protection analysis, using gene specific probes, showed that HSP81-2 and -3 mRNA were present in all tissues and abundant in roots, floral bud clusters, and flowers at 22 degrees C. A small amount of HSP81-1 mRNA was detected only in roots. In situ hybridization and histochemical analysis using transgenic plants carrying chimeric gene fusions, with an HSP81 promotor region fused to a beta-glucuronidase (GUS) gene, confirmed these results. At 22 degrees C, high GUS activity was observed in the root apical meristems, pollen and tapeta in HSP81-2::GUS and HSP81-3::GUS transgenic plants, while only branches of the root in HSP81-1::GUS transgenic plants expressed high GUS activity. After 2 hours of 35 degrees C treatment, extensively high GUS activity was observed in all tissues in HSP81-1::GUS transgenic plants, while elevated but tissue specific expression was observed in HSP81-2 and -3 transgenic plants.
    Exogenous application of various chemicals such as ABA, GA(3), kinetin, IAA, NaCl, and mannitol revealed that 10 mM IAA and 0.1 M NaCl significantly enhanced the accumulation of HSP81-2 and -3 transcripts. Only a slight response to IAA was observed in HSP81-1 mRNA accumulation at 22 degrees C; the increase was possibly caused by a novel pathway other than heat-shock-response pathway.

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  • Expression in yeast of a fusion gene composed of the promoter of a heat-shock gene from Arabidopsis and a bacterial gene for β-glucuronidase(共著)

    TAKAHASHI Taku, YABE Naoto, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and Cell Physiology   34 ( 1 )   161 - 164   1993年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    Production of a functional β-glucuronidase (GUS) protein was induced by exposure of exponentially growing yeast cells to heat shock after transformation of the GUS gene under the control of the promoter of the heat-shock gene, HSP18.2, from Arabidopsis. Yeast cyr and bcy mutations appeared to have essentially no effect.

    CiNii Article

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=181806

  • The Arabidopsis HPS18.2 promoter/GUS gene fusion in transgenic Arabidopsis plants : a powerful tool for the isolation of regulatory mutants of the heat-shock response(共著)

    Plant Journal   2 ( 5 )   751 - 761   1992年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/j.1365-313X.1992.tb00144.x

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  • Isolation and analysis of the expression of two genes for the 81-kilodalton heat-shock proteins from Arabidopsis(共著)

    Plant Physiology   99 ( 2 )   383 - 390   1992年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.99.2.383

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  • Heat-shock induced accumulation of extremely long transcripts containing the rDNA intergenic spacer in Arabidopsis(共著)

    Takahashi Taku, Komeda Yoshibumi

    Plant and Cell Physiology   33 ( 4 )   389 - 394   1992年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    A cDNA clone containing a 1.2-kb fragment derived from the ribosomal DNA (rDNA) intergenic spacer (IGS) of Arabidopsis was characterized. Isolation of this clone was achieved in a previous study by differential screening of a cDNA library prepared from heat-shocked Arabidopsis seedlings (Takahashi and Komeda 1989). Nucleotide sequence analysis revealed that the cDNA had an oligo(dA) sequence that corresponded to the sequence found in the IGS. Northern blot analysis using the cloned cDNA as probe demonstrated that heat-shock treatment of seedlings induced the accumulation of extremely long transcripts with apparent lengths of more than 7 kb. Treatment with arsenite and cadmium ions also led to the accumulation of the RNA, a phenomenon very similar to that observed in the case of expression of genes for heat-shock proteins (HSPs). Although the possibility remains to be excluded that these transcripts might be derived from,a region homologous to the IGS Iocated outside the rDNA clusters in Arabidopsis, it is most likely that processing of precursor rRNA and/or termination of transcription of rRNA are greatly impaired under stressed conditions in plants, as reported in the case of animal genes for rRNA (Labhart and Reeder 1987, Parker and Bond 1989).

    CiNii Article

    CiNii Books

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=181630

  • Characterization of two genes encoding small heat-shock proteins in Arabidopsis thaliana(共著)

    Takahashi T, Komeda Y

    Molecular and General Genetics   219 ( 3 )   365 - 372   1989年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/BF00259608

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書籍等出版物

  • 新しい植物ホルモンの科学 第3版

    浅見忠男, 柿本辰男( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Column サーモスペルミン)

    講談社  2016年11月 

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  • 基礎生物科学

    鷲谷いずみ 監修( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 第9章 生物のからだを作る仕組み)

    培風館  2016年7月 

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  • Polyamines

    T. Kusano, H. Suzuki( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Regulation and diversity of polyamine biosynthesis in plants)

    Springer Japan  2015年 

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  • レーヴン,ジョンソン/生物学[下]

    培風館  2006年 

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  • 改訂3版 ”モデル植物の実験プロトコール”

    秀潤社  2005年 

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MISC

  • ゼニゴケNIMA関連キナーゼの発現誘導系を用いた機能解析

    間瀬輝, 吉竹良洋, 河内孝之, 高橋卓, 本瀬宏康

    日本植物生理学会年会(Web)   62nd   2021年

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  • 異所的な分裂組織を形成するゼニゴケeda1変異体の解析

    毛利遊野, 大谷健人, 山岡尚平, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓, 本瀬宏康

    日本植物生理学会年会(Web)   60th   766 (WEB ONLY)   2019年

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    記述言語:日本語  

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  • ゼニゴケの細胞分裂関連遺伝子の機能解析

    倉田元気, 大谷健人, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓, 本瀬宏康

    日本植物生理学会年会(Web)   59th   ROMBUNNO.P.121   2018年

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    記述言語:日本語  

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  • 枝状突起を形成する新奇ゼニゴケ変異体eda1の解析

    毛利遊野, 大谷健人, 山岡尚平, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓, 本瀬宏康

    日本植物生理学会年会(Web)   59th   ROMBUNNO.1aF06   2018年

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    記述言語:日本語  

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  • 基部陸上植物ゼニゴケの仮根細胞における微小管依存的な先端成長機構の解析

    本瀬宏康, 大谷健人, 石崎公庸, 高谷彰吾, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓

    日本植物生理学会年会(Web)   59th   ROMBUNNO.3aD01   2018年

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    記述言語:日本語  

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  • ゼニゴケから見た微小管関連遺伝子の機能と進化

    本瀬宏康, 大谷健人, 倉田元気, 高谷彰吾, 石崎公庸, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓

    日本植物学会大会研究発表記録   81st   189   2017年9月

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    記述言語:日本語  

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  • ゲノム編集を用いたゼニゴケ微小管関連遺伝子の機能解析

    本瀬宏康, 大谷健人, 石崎公庸, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓

    日本植物学会大会研究発表記録   80th   194   2016年9月

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    記述言語:日本語  

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  • ゼニゴケNIMA関連キナーゼは仮根細胞の伸長を制御する

    大谷健人, 高谷彰吾, 石崎公庸, 西浜竜一, 河内孝之, 高橋卓, 本瀬宏康

    日本植物学会大会研究発表記録   79th   170   2015年9月

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    記述言語:日本語  

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  • SYP2ファミリーSNAREタンパク質は植物の成長と液胞輸送系に冗長的に機能する

    白川一, 上田晴子, 嶋田知生, 河本恭子, 島田貴士, 近藤真紀, 高橋卓, 奥山雄大, 西村幹夫, 西村いくこ

    日本植物生理学会年会要旨集   52nd   138   2011年3月

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  • シロイヌナズナSYP2ファミリーSNAREタンパク質の液胞輸送系とその高次機能における役割

    白川一, 上田晴子, 嶋田知生, 河本恭子, 島田貴士, 近藤真紀, 高橋卓, 奥山雄大, 西村幹夫, 西村いくこ

    生化学   2011年

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  • The uORF-mediated gene expression control in higher plants

    Taku Takahashi

    GENES & GENETIC SYSTEMS   82 ( 6 )   500 - 500   2007年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:GENETICS SOC JAPAN  

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  • 高塩及び乾燥ストレス時の植物におけるスペルミンの役割

    山口公志, 高橋芳弘, ベルベリッヒ トーマス, 今井章裕, 高橋卓, マイケル アンソニー, 草野友延

    日本農芸化学会大会講演要旨集   2007   217   2007年3月

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    記述言語:日本語  

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  • Molecular and genetic analyses of a homeobox gene, PDF2, which is involved in the shoot epidermal cell differentiation of Arabidopsis thaliana.

    Taku Takahashi, Hitoshi Kondoh

    GENES & GENETIC SYSTEMS   81 ( 6 )   446 - 446   2006年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:GENETICS SOC JAPAN  

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  • シロイヌナズナAtVAM3(SNAREタンパク質VAM3ホモログ)はミロシン細胞の分化に関与する

    上田晴子, 西山千晶, 嶋田知生, 河本恭子, 林八寿子, 近藤真紀, 大友一郎, 高橋卓, 西村幹夫, 西村いくこ

    日本植物生理学会年会要旨集   47th   196   2006年3月

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  • 塩ストレスに対する植物の適応反応へのスペルミンの関与について

    山口公志, 高橋芳弘, トーマス ベルベリッヒ, 今井章裕, 宮嵜厚, 高橋卓, 草野友延

    日本植物生理学会年会要旨集   47th   114   2006年3月

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  • Identification of genes that act downstream of ACL5 during stem elongation in Arabidopsis by cDNA microarray analysis

    A Imai, M Komura, T Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   47   S99 - S99   2006年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • AtVAM3, a homolog of Q(a)-SNARE VAM3, is involved in development of rnyrosin cells in Arabidopsis

    H Ueda, C Nishiyama, T Shimada, Y Koumoto, Y Hayashi, M Kondo, Ohtomo, I, T Takahashi, M Nishimura, Hara-Nishimura, I

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   47   S116 - S116   2006年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • シロイヌナズナの異型細胞(ミロシン細胞)分化にはSNAREタンパク質AtVAM3が関与する

    上田晴子, 西山千晶, 嶋田知生, 河本恭子, 林八寿子, 大友一郎, 高橋卓, 西村いくこ

    日本分子生物学会年会講演要旨集   28th   722   2005年11月

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    記述言語:日本語  

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  • シロイヌナズナAtVAM3変異体はミロシナーゼを大量に蓄積する

    上田晴子, 西山千晶, 中村潤, 林八寿子, 大友一郎, 高橋卓, 嶋田知生, 西村いくこ

    日本植物生理学会年会要旨集   46th   233   2005年3月

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  • Analysis of the Arabidopsis mutant accumulating a large amount of myrosinases

    H Ueda, C Nishiyama, J Nakamura, Y Hayashi, Ohtomo, I, T Takahashi, T Shimada, Nishimura, I

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   46   S153 - S153   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • Analysis of suppressors of the spermine synthase mutant, acl5, that is defective in stem elongation in Arabidopsis

    A Imai, M Komura, K Yamamoto, T Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   46   S30 - S30   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • Analysis of an Arabidopsis mutant with a peptide insertion in a syntaxin-related potein SYP23/AtVAM3

    Ohtomo, I, T Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   44   S201 - S201   2003年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • Isolation and characterization of suppressor of ac15 (sac) mutants in Arabidopsis

    A Imai, M Komura, Y Hanzawa, Y Komeda, T Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   44   S109 - S109   2003年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • Functional analysis of Arabidopsis L1 layer-specific homeobox genes

    M Abe, T Takahashi, Y Komeda

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   43   S218 - S218   2002年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

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  • MOLECULAR GENETIC ANALYSIS OF CRM2; AN ARABIDOPSIS MUTANT WITH CORYMB-LIKE INFLORESCENCE :

    SUZUKI Mitsuhiro, TAKAHASHI Taku, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   42   s52   2001年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=184665

  • CHARACTERIZATION OF THE SPERMIDINE SYNTHASE GENE FAMILY IN ARABIDOPSIS THALIANA :

    HANZAWA Yoshie, IMAI Akihiro, TAKAHASHI Taku, FRANCESCHETTI Marina, MICHAEL Anthony, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   42   s91   2001年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    CiNii Article

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=184820

  • EXPRESSION AND ISOLATION OF T-DNA FLANKING REGIONS BY HEAT-SHOCK TAGGING :

    TAKAHASHI Taku, MATSUHARA Shio, JINGU Fumito, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   41   s209   2000年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    CiNii Article

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=184284

  • MOLECULAR GENETIC ANALYSIS OF corymbosa2,AN ARABIDOPSIS MUTANT WITH CORYMB-LIKE INFLORESCENCE :

    SUZUKI Mitsuhiro, TAKAHASHI Taku, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   41   s215   2000年

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    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    CiNii Article

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    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=184304

  • POSITIONAL CLONING OF ACAULIS5, A GENE REQUIRED FOR INTERNODE FLONGATION IN Arabidopsis thaliana.

    HANZAWA Yoshie, TAKAHASHI Taku, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   40   s27 - s27   1999年3月

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  • CHARACTERIZATION OF ARABIDOPSIS MUTANTS CARRYING THE CORYMBOSE INFLORESCENCE

    SUZUKI Mitsuhiro, TAKAHASHI Taku, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   39   S62 - S62   1998年5月

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  • THE ROLE OF ACAULIS5 IN THE INTERNODAL GROWTH OF Arabidopsis thaliana

    HANZAWA Yoshie, TAKAHASHI Taku, KOMEDA Yoshibumi

    Plant and cell physiology   39   S62 - S62   1998年5月

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  • ANALYSIS OF THE Arabidopsis HSP GENE PROMOTER BY USING REPORTER GENE FUSIONS

    MATSUHARA Shio, KOMEDA Yoshibumi, TAKAHASHI Taku

    Plant and cell physiology   39   S142 - S142   1998年5月

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  • FLORAL ORGAN-SPECIFIC AND CONSTITUTIVE EXPRESSION OF AN ARABIDOPSIS-THALIANA HEAT-SHOCK HSP18.2=GUS FUSION GENE IS RETAINED EVEN AFTER HOMEOTIC CONVERSION OF FLOWERS BY MUTATION

    H TSUKAYA, T TAKAHASHI, S NAITO, Y KOMEDA

    MOLECULAR & GENERAL GENETICS   237 ( 1-2 )   26 - 32   1993年2月

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    記述言語:英語   出版者・発行元:SPRINGER VERLAG  

    Organ-specific and constitutive expression of the Arabidosis HSP18.2 gene under normal growth conditions (22-degrees-C) was observed in transgenic A. thaliana, which carried a fusion gene composed of the promoter region of HSP18.2, one of the genes for low molecular weight heat-shock proteins in Arabidopsis, and the gene for beta-glucuronidase (GUS) from Escherichia coli. In order to clarify the organ-specific nature of promoter expression, various mutations that affect flower morphology were introduced into the transgenic Arabidopsis line, AHS9. The results show that the pattern of expression observed in sepals, filaments, and styles is regulated in a structure-dependent manner, and suggest that the HSP18.2 gene might have an important role in the process of differentiation of flower buds, as do several other stress-related genes.

    DOI: 10.1007/BF00280197

    Web of Science

    PubMed

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講演・口頭発表等

  • A thermospermine-deficient mutant of Arabidopsis is sensitive to salt stress.

    Plant Signaling & Behavior 2017  2017年 

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  • Repression of xylem differentiation by thermospermine in Arabidopsis thaliana

    Plant Signaling & Behavior 2017  2017年 

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  • ミロシン細胞分化におけるSYP2ファミリーSNAREタンパク質の役割

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

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  • シロイヌナズナの花茎の伸長はサーモスペルミンを必要とする

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

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  • シロイヌナズナacl5変異株の茎伸長欠損を抑圧する新たな変異株の単離と遺伝子の同定

    日本植物学会第72回大会  2008年 

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  • Polyamine-dependent control of stem elongation in Arabidopsis

    55th NIBB Conference/ Arabidopsis Workshop 2008  2008年 

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  • シロイヌナズナの表皮に特異的な遺伝子発現に関わる転写因子の探索

    第 31 回日本分子生物学会年会  2008年 

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  • シロイヌナズナのacl5変異株の茎伸長欠損を抑圧する新たな変異株の単離

    第 31 回日本分子生物学会年会  2008年 

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  • シロイヌナズナの花器官におけるHD-ZIP IV遺伝子群の機能

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

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  • シロイヌナズナの茎の伸長におけるテルモスペルミンの重要性

    日本ポリアミン研究会第22回研究発表会  2008年 

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  • 非生物的/生物的ストレスに対する植物生体防御におけるスペルミンの役割の検証

    日本ポリアミン研究会第21回研究発表会  2007年 

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  • シロイヌナズナの茎伸長におけるスペルミンの作用機構の遺伝学的解析

    日本ポリアミン研究会第21回研究発表会  2007年 

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  • The uORF-mediated gene expression control in higher plants.

    第79回日本遺伝学会大会国際シンポジウム  2007年 

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  • A semi-dominant mutation in a ribosomal protein L10 gene suppresses the dwarf phenotype of the acl5 mutant.

    18th International Conference on Arabidopsis Research  2007年 

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  • Polyamine-dependent control of stem elongation in Arabidopsis

    International Symposium – Comprehensive understanding of diverse biological timing mechanism.  2007年 

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  • シロイヌナズナの病原菌に対する防御応答におけるスペルミンシグナル伝達経路の役割

    日本ポリアミン研究会第20回研究発表会  2006年 

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  • The dwarf phenotype of the Arabidopsis acl5 mutant is suppressed by a mutation in an upstream ORF of a bHLH gene.

    8th International Congress of Plant Molecular Biology  2006年 

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  • Requirement of AtVAM3 for specification of idioblasts (myrosin cells) in Arabidopsis thaliana.

    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology  2006年 

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  • シロイヌナズナの表皮細胞分化に関わるホメオボックス遺伝子PDF2の分子遺伝学的解析

    第78回日本遺伝学会大会  2006年 

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  • Characterization of the Class IV Homeodomain-Leucine Zipper Gene Family in Arabidopsis.

    8th International Congress of Plant Molecular Biology  2006年 

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  • Analysis of uORF-mediated translational control of the Arabidopsis SAC51 gene.

    20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology  2006年 

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  • シロイヌナズナのマイクロアレイを用いたACL5に依存的な花茎伸長制御遺伝子の同定

    第47回日本植物生理学会大会  2006年 

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  • シロイヌナズナにおけるスペルミン合成酵素遺伝子欠損変異体acl5のサプレッサー変異体の分子遺伝学的解析

    日本ポリアミン研究会第20回研究発表会  2006年 

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  • シロイヌナズナAtVAM3変異体はミロシナーゼを大量に蓄積する

    第46回日本植物生理学会年会  2005年 

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  • シロイヌナズナスペルミン合成酵素遺伝子欠損株acl5の花茎伸長欠損に対するサプレッサー変異体の解析

    第46回日本植物生理学会年会  2005年 

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  • シロイヌナズナ花茎伸長欠損変異株acl5のサプレッサー変異体の単離と解析

    第62回日本植物学会中国四国支部大会  2005年 

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  • シロイヌナズナの表皮分化に関わるHD-GL2遺伝子群の包括的解析

    第62回日本植物学会中国四国支部大会  2005年 

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  • シロイヌナズナの花茎伸長制御機構においてACL5の下流で機能する遺伝子の探索

    第28回日本分子生物学会年会  2005年 

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  • シロイヌナズナの表皮分化におけるホメオボックス遺伝子PDF2の機能解析

    第62回日本植物学会中国四国支部大会  2005年 

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  • シロイヌナズナの異型細胞(ミロシン細胞)分化にはSNAREタンパク質AtVAM3が関与する

    第28回日本分子生物学会年会  2005年 

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  • SYP22/AtVAM3の膜隣接領域へのペプチド挿入変異体の解析

    日本植物生理学会2003年度年会  2003年 

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  • 花茎伸長欠損変異株acl5のサプレッサー変異体の単離と解析

    日本植物生理学会2003年度年会  2003年 

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  • Analysis of an Arabidopsis mutant with a peptide insertion in a syntaxin protein SYP22/AtVAM3.

    Plant Physiology 2003  2003年 

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  • Spermidine synthase genes are essential for survival of Arabidopsis thaliana.

    Plant Physiology 2003.  2003年 

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  • シロイヌナズナの生育にとってスペルミンは必須な物質ではない

    第26回日本分子生物学会年会  2003年 

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  • シロイヌナズナの器官形成における表皮分化の役割とHD-GL2型転写因子の関わり

    日本植物学会第67回大会  2003年 

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  • シロイヌナズナの花茎伸長欠損変異acl5に対する抑圧変異Sac54の解析

    日本植物学会第67回大会  2003年 

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  • シロイヌナズナL1層特異的ホメオボックス遺伝子の機能解析

    日本植物生理学会2002年度年会  2002年 

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  • 花序先端の構築に関わるCORYMBOSA2遺伝子

    第25回日本分子生物学会年会  2002年 

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  • エンド型キシログルカン転移酵素/加水分解酵素遺伝子XTH-27の発現様式の解析

    日本植物学会第66回大会  2002年 

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  • PEF (Plant Exon Finder): T-DNAを用いた強制発現系による新しい植物遺伝子タギング法の確立

    第25回日本分子生物学会年会  2002年 

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  • シロイヌナズナにおけるスペルミジン合成酵素欠損変異体の単離と解析

    第25回日本分子生物学会年会  2002年 

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  • シロイヌナズナの表皮分化に関わるHox遺伝子群HD-GL2ファミリーの分子遺伝学的解析

    日本植物学会第66回大会  2002年 

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  • CORYMBOSA2遺伝子による花序先端の形作り

    日本植物学会第66回大会  2002年 

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  • 花茎伸長欠損変異株acl5のサプレッサー変異体の単離と解析

    日本植物学会第66回大会  2002年 

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  • シロイヌナズナの花序形成におけるDNAトポイソメラーゼIの機能

    日本植物学会第65回大会  2001年 

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  • シロイヌナズナにおけるスペルミジン合成酵素遺伝子群の単離と解析

    日本植物生理学会2001年度年会  2001年 

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  • シロイヌナズナのL1層における遺伝子発現の制御機構

    第24回日本分子生物学会年会  2001年 

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  • HD-GL2クラスホメオボックス遺伝子PDF2の表皮細胞分化への関わり

    日本植物学会第65回大会  2001年 

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  • シロイヌナズナの花茎伸長過程の研究

    第24回日本分子生物学会年会  2001年 

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  • 花序形態形成変異体crm2の分子遺伝学的解析

    日本植物生理学会2001年度年会  2001年 

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  • シロイヌナズナ花序形態形成に関与するCRM2遺伝子のポジショナルクローニング

    日本植物生理学会2000年度年会  2000年 

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  • Molecular genetic analysis of corymbosa2, an Arabidopsis mutant with corymb-like inflorescence.

    11th International Conference on Arabidopsis Research  2000年 

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  • Regulation of the L1-layer-specific gene expression in Arabidopsis thaliana.

    11th International Conference on Arabidopsis Research  2000年 

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  • シロイヌナズナL1層特異的ホメオボックス遺伝子の単離と機能解析

    第23回日本分子生物学会年会  2000年 

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  • シロイヌナズナL1層特異的遺伝子の発現制御

    日本植物学会第64回大会  2000年 

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  • ヒートショックタギングによるT-DNA挿入変異遺伝子の単離

    日本植物生理学会2000年度年会  2000年 

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  • Heat-shock tagging: a simple method for expression and isolation of plant genome DNA flanked by T-DNA insertions.

    11th International Conference on Arabidopsis Research  2000年 

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  • ACAULIS5, an Arabidopsis gene required for stem elongation, encodes a spermine synthase.

    10th International Conference on Arabidopsis Research  1999年 

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  • シロイヌナズナの花茎伸長に関与するACL5遺伝子の単離とその解析

    日本植物学会第63回大会  1999年 

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  • シロイヌナズナにおける受容体型プロテインキナーゼ遺伝子のサリチル酸による発現誘導

    日本植物学会第63回大会  1999年 

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  • 散房花序様の表現型を示すシロイヌナズナ新規突然変異体の解析と遺伝子単離

    日本植物学会第63回大会  1999年 

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  • シロイヌナズナの花茎伸長に必須なACL5遺伝子の単離

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

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共同研究・競争的資金等の研究

  • シロイヌナズナの応答変異株を用いたサーモスペルミンの作用機構の解明

    研究課題/領域番号:22K06281  2022年04月 - 2025年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    高橋 卓

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    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

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  • サーモスペルミンによる植物遺伝子翻訳促進機構の解明

    研究課題/領域番号:19K06724  2019年04月 - 2022年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    高橋 卓

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    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

    シロイヌナズナのサーモスペルミン非感受性変異株itsの解析をすすめ,its1, its3, its7, its11がそれぞれRNAメチル化酵素,RNAスプライシング関連タンパク,RNA結合タンパク,RNAシュードウリジン化酵素をコードする遺伝子に変異を持っていることを突き止めた。以上の結果から,サーモスペルミンの作用にRNA修飾が深く関わることが強く示唆される状況に至った。
    サーモスペルミン欠損変異acl5に対する抑圧変異株sac503についても原因遺伝子を特定し,サーモスペルミンが翻訳促進する標的遺伝子SAC51のuORFに塩基置換を見出した。

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  • 植物表皮細胞の起源を探る

    研究課題/領域番号:16K07422  2016年04月 - 2019年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    高橋 卓, 本瀬 宏康, 岡本 崇

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    配分額:4940000円 ( 直接経費:3800000円 、 間接経費:1140000円 )

    本研究は,植物がどのように表皮最外層という位置情報を認識し,表皮細胞としての同一性を確立するのかという課題の解明を目的とする。
    シロイヌナズナの表皮分化のマスター転写因子ATML1, PDF2のゼニゴケにおける相同遺伝子MpPDF2について,ゲノム編集による変異株を作出し,機能欠損では致死,タンパク質機能領域のC末端側の弱い変異では成長に著しい遅延が見られ,この遺伝子が必須であることを明らかにした。一方,東京大学との共同研究において,シロイヌナズナの表皮最外層という位置情報は転写因子ATML1が最外層に特異的なスフィンゴ脂質との相互作用により活性化されることに変換される機構が明らかになった。

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  • 植物発生におけるサーモスペルミンの機能の解明

    研究課題/領域番号:16H01245  2016年04月 - 2018年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    高橋 卓

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    配分額:10400000円 ( 直接経費:8000000円 、 間接経費:2400000円 )

    シロイヌナズナにおいて、サーモスペルミンはSAC51遺伝子の翻訳促進を介して、木部分化抑制に関わる。サーモスペルミンの合成欠損変異acl5では木部が過剰に分化し、茎の伸長が抑制される。しかし、優性変異sac51-dによって、SAC51の翻訳がサーモスペルミン非依存的に促進されると、茎伸長が回復する。SAC51はSACL1, SACL2, SACL3と遺伝子ファミリーを構成するが,SACL2, SACL3にはサーモスペルミンによる翻訳促進が認められない。本研究では,サーモスペルミンの作用機構と生理機能の解明を目指した。
    SAC51, SACL1のmRNAに保存されたuORFの内部に存在する,短いuORFがサーモスペルミンによるメインORFの翻訳促進制御に関わっている可能性が示唆された。ポプラ,ダイズ,ブロッコリーのSAC51ファミリー各遺伝子の5’リーダー領域をGUSレポーターと融合して調べた結果も,サーモスペルミン応答を示した遺伝子には, uORF内部に同じ読み枠で短いuORFが存在していた。単子葉類のイネでも調べた結果,保存されたuORFの内部に短いuORFがあるOsSACL3A, OsSACL3Cには,サーモスペルミン応答性が認められた。
    一方,スペルミンは非生物ストレス応答に関わることが示唆されてきたが,acl5とスペルミン合成酵素変異spmsとは詳細に比較されていなかった。塩耐性を確かめた結果,acl5はNaClに対して,野生型やspms変異よりも著しく感受性が高いことがわかった。過剰な木部分化と塩耐性低下の相関から,塩水の過剰な吸収が原因と予想された。
    ゲノム編集によるゼニゴケMpACL5遺伝子破壊株について,形態異常に加えて常温での熱ショック遺伝子の発現増加を見出した。しかし,変異株は高温にも塩にも高い感受性を示し,維管束植物とは異なる多機能が示唆された。

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  • 植物発生におけるサーモスペルミンの機能の解明

    研究課題/領域番号:26113516  2014年04月 - 2016年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    高橋 卓

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    配分額:11310000円 ( 直接経費:8700000円 、 間接経費:2610000円 )

    維管束木部の過剰な分化を示す,シロイヌナズナの矮性変異株acl5の原因遺伝子は,サーモスペルミン合成酵素をコードする。acl5変異に対するサプレッサー変異株の解析から,サーモスペルミンは転写因子遺伝子SAC51の翻訳を促進して木部分化を抑えていると示唆された。SAC51は,SACL1, 2, 3と合わせて4つからなる遺伝子ファミリーを構成し,いずれもmRNA 5’リーダー領域に,保存されたuORFを持つ。本研究では,サーモスペルミンの作用標的としてSAC51に注目し,サーモスペルミンによる遺伝子の翻訳制御という,植物の新しい発生ロジックの実体解明を目指した。
    サプレッサー変異sac57-dの原因遺伝子はSACL3で,sac51-d同様,uORFに点変異がある。しかし,SAC51ファミリーの各遺伝子5’リーダー領域について,GUSレポーターを用いてサーモスペルミン応答性を調べた結果,SAC51, SACL1と異なり,SACL2, SACL3には応答に伴うGUS活性の増加が認められなかった。一方,SAC51はuORFの開始コドンを5’リーダー領域から除いてもサーモスペルミン応答したことから,サーモスペルミンの作用標的がuORFやそのコードするペプチドとは別に,mRNA 5’リーダー領域の二次構造やリボソームRNAである可能性が示唆された。
    SAC51ファミリーの各遺伝子の欠損変異株は正常な表現型を示すが,4重変異株は半矮性を示すとともに,サーモスペルミンを過剰蓄積していた。さらに,高濃度のサーモスペルミン添加培地では,野生型の根の木部分化は著しく抑制されるが,4重変異では抑制されず,サーモスペルミン非感受性を示した。この傾向はSAC51, SACL3の欠損二重変異でも認められ,これら2つがサーモスペルミン信号伝達の中心的な仲介因子であると思われる。

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  • 維管束分化を制御する細胞間情報伝達機構の解析

    研究課題/領域番号:25440137  2013年04月 - 2016年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    本瀬 宏康, 高橋 卓

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    配分額:5330000円 ( 直接経費:4100000円 、 間接経費:1230000円 )

    木部分化を促進するxylogenの輸送機構を解析し、ゴルジ体から細胞膜への輸送過程を明らかにした。また、Xylogenの相互作用因子の探索を行った。木部分化を抑制するサーモスペルミンの合成阻害剤を開発することに成功し、xyleminと名付けた(Yoshimoto et al. 2016)。Xyleminとオーキシン類縁体を添加すると、様々な植物で顕著に木部分化が促進された。

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  • 高等植物の表皮分化機構の確立と維持に関わる転写因子の解析

    研究課題/領域番号:23012032  2011年 - 2012年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓, 本瀬 宏康

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    配分額:6400000円 ( 直接経費:6400000円 )

    植物のからだ作りにおいて,表皮細胞分化は不可欠である。シロイヌナズナでは,地上部表皮の幹細胞,すなわち茎頂L1層に特異的な遺伝子発現に転写因子PDF2,ATML1が関わり,これらが表皮細胞分化において中心的なはたらきを担う。PDF2,ATML1は,標的遺伝子の調節領域にあるL1ボックス配列に結合して,その発現を正に制御しているが,自身の調節領域にもL1ボックスが存在することから,正の自己制御が予想される。本研究では,胚発生過程において,PDF2,ATML1遺伝子の発現がどのようにL1層に限定されて自己制御が確立するか,その分子基盤を明らかにすることを目標とした。
    PDF2が胚のL1層より内側の細胞では他の因子と相互作用して機能できなくなる可能性を考えて,PDF2と相互作用する因子を酵母2ハイブリッド法により探索した結果,RNA結合タンパクとE3ユビキチンリガーゼが2種類ずつ,BAHタンパク,機能不明タンパクが得られた。これらは,同じHD-ZIP IVファミリーに属するHDG2とも相互作用する一方,HD-ZIP IIIファミリーのCNAとは相互作用が認められなかった。PDF2タンパクのどの領域と相互作用するか調べた結果,START領域のC末端側からSAD領域にかけて結合部位があると予想された。
    一方,表皮が欠損するpdf2-1 atml1-1二重変異株を用いたマイクmアレイの結果に基づき,転写因子に絞って遺伝子発現解析を行い,表皮に特異的に発現する転写因子として,Znフィンガーを持つタンパク質を新たに見出した。プロモーター=GUS遺伝子の発現から表皮に特異的な発現が確認され,この遺伝子をPDF3と名付けた。さらに,PDF3と非常に相同性の高い遺伝子PDF31と二重欠損変異を作出した結果,胚致死になった。

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  • 植物の茎伸長過程におけるサーモスペルミンの作用機構の解明

    研究課題/領域番号:22370021  2010年04月 - 2014年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    高橋 卓, 本瀬 宏康

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    配分額:17940000円 ( 直接経費:13800000円 、 間接経費:4140000円 )

    サーモスペルミンはポリアミンの1つで,植物において維管束分化の抑制に関わり,欠乏すると維管束の異常な増殖と矮化が起きる。その作用機構を解明するため,シロイヌナズナのサーモスペルミン合成欠損変異株から,サーモスペルミンなしで茎の伸長が回復する変異株sac53-d, sac56-dを単離し,原因遺伝子としてリボソームタンパクRACK1, L4をそれぞれ同定した。一方,サーモスペルミンの代替効果を持つ活性物質として,ノルスペルミンを見つけた。さらに,サーモスペルミンがオーキシンと拮抗し,維管束形成を抑制する作用を持つことを明らかにした。

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  • 植物細胞の極性を制御する機構の解明

    研究課題/領域番号:22770043  2010年 - 2012年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(B)

    本瀬 宏康, 高橋 卓

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    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

    植物細胞は移動することができないため、細胞の分裂・伸長・分化の方向や極性が厳密に制御されることで、葉や根などの器官が作られる。本研究では、シロイヌナズナの NIMA関連キナーゼが微小管の制御を介して植物細胞の分裂・伸長の方向を調節し、器官形成に関わることを示した。また、連続的で方向性のある木部分化に必要な糖タンパク質 xylogenの輸送機構、xylogen ファミリーの発現パターンを明らかにした。

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  • 高等植物の表皮分化機構の確立と維持に関わる転写因子の解析

    研究課題/領域番号:21027028  2009年 - 2010年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:5200000円 ( 直接経費:5200000円 )

    高等植物における表皮分化の分子機構を明らかにするため,シロイヌナズナの茎頂L1層に特異的な遺伝子発現に関わる転写因子PDF2,ATML1の解析をすすめた。
    1)レポーターを用いたPDF2とATML1の発現解析
    PDF2,ATML1各遺伝子プロモーターとGUSレポーター融合遺伝子の発現解析から,PDF2のuORFは翻訳に対して抑制的に働くこと,第1イントロンは発現を促進する効果を持つことが示唆されたが,それらが発現をL1層に限定する機構に関わる証拠は得られなかった。ATML1の第2転写開始点からの発現は,第1転写開始点に比べて弱く,表皮細胞の発生後期に強まることから,補足的であると推定された。
    PDF2,ATML1を含むHD-ZIP IVファミリー全16遺伝子のうち,10遺伝子の3'非翻訳領域には短い配列HDCボックスがある。精査するといずれのHDCボックスにも逆向き相補配列が存在し,ステムループ構造の2本鎖RNAを形成することが予想された。
    2)pdf2 atml1二重変異の解析
    表皮欠損を示すpdf2-1 atm-1二重変異において,葉の表側マーカーPHB,裏側マーカーFILの発現をGFPレポーターを用いて調べたところ,表皮欠損は表裏の決定には影響しないことが示唆された。一方,胚発生過程におけるDR5プロモーターによるGFPの蛍光観察から,表皮欠損に伴うオーキシン極性輸送の喪失が発生遅延と器官形態異常の原因であると示唆された。さらに,PDF2遺伝子の新たなT-DNA挿入変異アレルpdf2-2の解析をすすめ,pdf2-1同様,atmll-1との組み合わせでは表皮欠損,atmll-2との組み合わせでは胚性致死の表現型を示すことを確認した。

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  • シロイヌナズナの受精過程におけるHD-GL2型転写因子群の機能解析

    研究課題/領域番号:19043012  2007年 - 2008年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:5600000円 ( 直接経費:5600000円 )

    HD-GL2ファミリーは植物に特有のホメオドメインを持つ転写因子の一群で、その多くの遺伝子が茎頂最外層(L1)や表皮細胞で強く発現する。そのうち、いくつかの遺伝子は受粉前後の花器官において特異的な発現を示す。しかし、これらの遺伝子のT-DNA挿入変異体は、それぞれ単独では異常な表現型を表さず、遺伝子間に機能の冗長性があることが示唆される。他方、同じファミリーに属するPDF2, ATML 1は茎頂最外層からの表皮分化に必須であり、その二重欠損変異は地上部の表皮細胞を欠く。花器官の特定の組織や細胞で発現しているHD-GL2遺伝子は、配偶体の形成から受粉、受精に至る、最も動的な細胞間認識が起こる過程で重要な転写調節機能を担っている可能性があることから、本研究では、これらの遺伝子について生殖過程における機能の解明を目指した。
    (1) PDF2遺伝子の欠損変異pdf2-1と他のHD-GL2遺伝子の欠損変異との二重変異体の表現型観察から、それらのいくつかに見られた稔性低下の原因が、主にAP3遺伝子の発現低下による花小器官のホメオティック変異(花弁のがく化と雄蕊の心皮化)にあることを明らかにした。これらのHD-GL2遺伝子は花小器官の表皮に発現しており、生殖器官分化における表皮細胞の寄与の重要性が示唆された。
    (2) HDG2遺伝子は胚のう形成後、反足細胞において特異的に強く発現する。この発現には、表皮に特異的な遺伝子発現に関わるL1ボックス配列がシス配列として必要であることを前年度明らかにしていた。L1ボックス配列はHD-GL2ファミリーの標的配列でもあり、自己制御が示唆されたため、hdg2変異体や同じ反足細胞で発現が見られるHD-GL2遺伝子の三重変異体hdg2 hdg5 hdg9でGUSレポーターによりHDG2の発現を確かめた。その結果、いずれの変異体でも反足細胞での発現が認められた。

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  • ポリアミンによる植物の花茎伸長制御機構の分子遺伝学的解析

    研究課題/領域番号:17370023  2005年 - 2007年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    高橋 卓

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    配分額:15280000円 ( 直接経費:14500000円 、 間接経費:780000円 )

    本研究は,シロイヌナズナの茎伸長に欠損を示す変異株acl5の原因遺伝子ACL5がポリアミン合成に関わることから,その茎伸長における作用機構の解明を目指して研究を進めた。
    acl5の茎伸長が回復したサプレッサー変異株sac51〜54の単離,解析から,
    1.sac51の原因遺伝子を同定し,それがコードする転写因子の翻訳効率の上昇が茎の伸長回復をもたらしていることを明らかにした。 2.sac52の原因遺伝子がリボソームタンパクRLP10Aをコードしていることを突き止めた。3.sac54について,原因遺伝子は機能未知のタンパク質をコードしていたが,そのT-DNA挿入変異株に花成遅延の異常を認め,SAC54が花成制御に関わることを明らかにした。 4.新たなサプレッサー変異を数株単離し,sac56がリボソームタンパクRLP4をコードしていることを示唆する結果を得た。 5.ヒメツリガネゴケのゲノムに3つのACL5相同遺伝子があることを突き止め,各cDNAを単離した。
    一方,ACL5がスペルミンの構造異性体であるサーモスペルミンを合成する可能性について検討を加え,
    6.植物へのサーモスペルミン投与実験から,acl5変異株の部分的な茎の伸長回復と,過剰に発現していたacl5遺伝子の野生型レベルへの低下を確認した。 7.植物から容易にスペルミンとサーモスペルミンを分離,検出する方法を確立し,野生株にあるサーモスペルミンがacl5変異株では検出されず,ACL5はサーモスペルミン合成酵素をコードすると結論された。
    さらに,スペルミン合成酵素をコードするSPMS遺伝子についても,その欠損変異株の解析を行い,
    8.スペルミンが乾燥や塩のストレス応答に機能することを明らかにした。
    以上より,今後の研究発展につながる,植物の発生,生育におけるポリアミンの機能に関する重要な知見を数多く得ることができた。

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  • 植物の茎頂における細胞層状構造の分化・維持に関わる転写制御因子の解析

    研究課題/領域番号:17027021  2005年 - 2006年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:6400000円 ( 直接経費:6400000円 )

    シロイヌナズナの茎頂L1層における遺伝子発現制御には、ホメオドメインを持った転写因子PDF2,ATML1が関わる。本研究では、PDF2,ATML1が属するHD-ZIP IVファミリーの各メンバーの解析から、その包括的な機能解明を目指した。
    1)各メンバーのT-DNA挿入変異株を用いたマイクロアレイ解析をすすめた。
    1a)pdf2-1変異株およびatml1-1変異株と野生型株の芽生えを用いたマイクロアレイ解析、リアルタイムRT-PCR実験から、2つの変異株において同様に影響を受ける遺伝子、一方の変異株のみで特異的に発現量が変動する遺伝子を見つけた。この結果から、PDF2とATML1の機能が完全には同一でないことが分子レベルで確かめられた。
    1b)トライコームの分枝増加の表現型を示すhdg11-1変異株において、野生型株と比較して発現が増加、および低下した遺伝子を同定した。
    2)かけ合わせF1個体が稔性低下を示す、an12-t変異株とhdg1-1変異株について、詳しい分離を調べた結果、F1自家受粉のF2世代やan12-tホモ/hdg1-1ヘテロの次世代にはan12-thdg1-1二重変異株が得られないこと、an12-tヘテロ/hdg1-1ホモの次世代に分離する二重変異株は正常な稔性を示すことがわかった。稔性低下は雄しべの花糸の伸長低下が原因であった。
    3)PDF2,ATML1に最も相同性の高いHDG2が胚のうの反足細胞に特異的な発現を示したことから、HDG2プロモーターの欠失変異体シリーズを作成し、反足細胞における発現に必要なシス領域を約50bpに限定した。
    4)熱ショックプロモーターにつないだCreリコンビナーゼを用いて、Engrailed-PDF2融合遺伝子をL1層に特異的に誘導発現する系を確立した。

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  • 植物の茎頂における細胞層状構造の分化・維持に関わる転写制御因子の解析

    研究課題/領域番号:15031201  2003年 - 2004年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:6000000円 ( 直接経費:6000000円 )

    シロイヌナズナの茎頂L1層における遺伝子発現制御には、HD-GL2ファミリーに属するホメオドメインを持った転写因子ML1,PDF2が関わる。本研究では、植物の茎頂において表皮細胞を分化するL1層が、胚発生の過程でどのように確立し、維持されているかを明らかにするため、シロイヌナズナゲノムに16遺伝子存在するHD-GL2ファミリーに注目し、その包括的な機能解析をすすめた。
    1)以前にpdf2-1 ml1-1二重変異が表皮分化欠損を示すことに加えて、胚致死になる個体が分離することを確認していたが、ホメオドメインのコード領域にT-DNAが挿入されたml1-2アリルを用いた場合には、pdf2-1 ml1-2二重変異のすべてが胚致死となり、これらの遺伝子が胚発生において必須であることを確認した。
    2)表皮欠損を示すpdf2-1 ml1-1変異の芽生えを用いてcDNAマイクロアレイ解析を行なったところ、膨大な数の遺伝子に野生型芽生えとの発現の相違が認められたが、表皮に形成されるクチクラやワックス合成に関わると予想される脂質の合成や代謝関連の遺伝子発現の低下が目立った。ML1,PDF2はL1層で発現するこれらの遺伝子のプロモーター領域に存在するL1ボックスへの結合を介して、それらの発現を正に制御し、表皮分化をもたらすことが示唆された。
    3)一方、HDG1〜HDG12と名付けたHD-GL2ファミリーの各遺伝子については、T-DNA挿入変異株のアリルを追加して解析をすすめたところ、hdg11-1にトライコームの分枝増加の表現型を見つけた。さらに、最も相同性の高い遺伝子HDG12のT-DNA挿入変異hdg12-2の分枝には異常が見られなかったが、bdg11-1 hdg12-2二重変異では分枝増加が強調されたことから、これらの遺伝子はトライコームの分枝調節に関わると予想された。

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  • シロイヌナズナの変異株を用いた花序形態、花茎伸長制御の分子遺伝学的解析

    研究課題/領域番号:15570027  2003年 - 2004年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    高橋 卓

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    配分額:3700000円 ( 直接経費:3700000円 )

    以前の研究でシロイヌナズナの茎伸長欠損変異株acaulis5(acl5)の分子遺伝学的解析を行ない、その原因遺伝子ACL5がスペルミン合成酵素をコードしていることを明らかにした。そこで植物の器官形態形成におけるポリアミンの作用機構の解明を目指し、シロイヌナズナからスペルミジンおよびスペルミン合成酵素全遺伝子の突然変異株を単離してその解析をすすめた。2つのスペルミジン合成酵素遺伝子SPDS1,SPDS2についてT-DNA挿入による突然変異株を単離したところ、それぞれ単独の変異株は正常に生育するのに対し、二重突然変異株は胚致死となり、スペルミジンが植物の生育に必須であることを証明した。さらに、スペルミン合成酵素遺伝子SPMS遺伝子についてもT-DNA挿入変異株(spms-1)を単離した。spms-1変異株は、スペルミン含量がかなり低下しているものの表現型は正常であった。spms-1 acl5-1二重変異殊は、スペルミンをまったく合成しないにもかかわらずacl5-1変異による茎伸長欠損以外は正常な生育を示し、スペルミンは少なくとも通常の生育に必須ではないことがわかった。また、acl5変異株にさらに変異を誘発して茎伸長の回復したサプレッサー(抑圧)変異株の解析をすすめた。これまでに単離した回復度合いの異なる4つの優性変異株sac51〜54のうち、sac51は原因遺伝子を同定した。
    他方、新たに単離して解析をすすめていたシロイヌナズナの矮性突然変異株ssmについて、本研究によりその原因として小胞輸送関連遺伝子の欠損を見つけることができた。

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  • 植物の茎頂における細胞層状構造の分化・維持に関わる転写制御因子の解析

    研究課題/領域番号:14036202  2002年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:3000000円 ( 直接経費:3000000円 )

    高等植物の茎頂では細胞が層状構造を成しており、最外層(L1層)は各器官の表皮へと分化する。本研究では、胚発生の過程でこのL1層がどのように確立し、また茎頂において維持されているのか、その分子的基盤を明らかにするために、L1層に特異的な遺伝子の発現制御に関わると予想されるホメオドメインを持つ転写因子に注目し、シロイヌナズナにおいてこれをコードしている遺伝子PDF2,ATML1についてその発現調節および機能の解析を進めた。
    これまでに、L1層に特異的な遺伝子の発現に関与する遺伝子上流のシス配列としてL1ボックスを同定していたが、PDF2, ATML1両遺伝子産物がL1ボックスに結合する活性を示し、その二重変異は表皮細胞が分化せずに致死となることを明らかにした。PDF2の過剰発現は花成遅延、発現抑制はがくや花弁の表皮細胞の形態異常をもたらした。PDF2, ATML1両遺伝子自身の上流域にもL1ボックスが存在し、正の自己制御機構の存在が示唆されたことから、胚発生とともにL1層に特異的な遺伝子発現調節機構が確立するためには、L1層に発現を限定するための別の転写制御因子の関与が予想された。また、レポーター遺伝子を用いたPDF2プロモーターの解析から、L1層におけるPDF2遺伝子の発現には、L1ボックスに加えて別の転写因子WUSの標的配列も必要であることを明らかにした。他方、PDF2, ATML1を含む遺伝子群の全16遺伝子のうち、未解析のものについて、発現解析、ノックアウト変異株の探索を進めた。PDF2, ATML1に最も高い相同性を示すHDG2は若い葉や花茎の表皮で遺伝子発現が認められたが、T-DNA挿入変異株は正常に生育した。

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  • 植物病原体認識機構としての受容体型キナーゼ-リガンド相互作用に関する研究

    研究課題/領域番号:13039001  2001年 - 2002年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    高橋 卓

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    配分額:3800000円 ( 直接経費:3800000円 )

    シロイヌナズナの突然変異体を用いた遺伝学的解析から、植物の形態形成や環境応答など様々な局面において、受容体型プロテインキナーゼの関与が明らかになりつつある。病原菌認識、応答機構では、細菌ベン毛の構成タンパク質であるフラジェリンを、ロイシンリピートをもつ受容体型プロテインキナーゼFLS2が認識する系が知られている。本研究では、シロイヌナズナの形質転換によりフラジェリンのエピトープを植物自身に誘導的に発現させて、これが自身の病原抵抗反応を誘発するか、その効果を調べるとともに、耐病性向上という視点から、受容体型キナーゼを介した信号伝達の人為的操作を可能にする系の確立を目指した。
    エリシターとして機能することが示されている大腸菌のフラジェリンN末端22アミノ酸のエピトープを、細胞壁タンパク質PDF1の分泌シグナルペプチドに融合させ、熱ショックプロモーターのもとで発現するように構築したT-DNAをシロイヌナズナに導入し、形質転換植物を作出した。その結果、熱ショックによって導入した融合遺伝子が誘導的に発現するとともに、PR1aタンパク質をコードする遺伝子の発現誘導が認められた。同じ処理条件で野生型植物には誘導が認められないことから、フラジェリンの発現によって引き起こされた応答反応であると示唆された。一方、菌の感染や外からのフラジェリン処理で認められる生長阻害など、形態的な変化はみられなかった。他の抵抗性関連遺伝子の発現が同時に誘導されているか、実際に抵抗性が高まっているかについては、さらに解析中である。

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  • シロイヌナズナの突然変異株を用いた花序形態形成の分子遺伝学的解析

    研究課題/領域番号:12740431  2000年 - 2001年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  奨励研究(A)

    高橋 卓

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    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    フィボナッチ数列で表される、高等植物のらせん葉序および花序の分子的基盤は、多細胞生物の形作りについて、まだ解析の進んでいない問題のひとつである。本研究では、シロイヌナズナのT-DNA挿入形質転換植物の中から見つかった、葉や花の分枝パターンに異常を示す変異株について、形態学的な解析を行うと共に、原因遺伝子の同定を試みた。
    この変異株は、高い頻度で葉序の乱れや二叉分岐、一つの節から二つ以上の花芽を分化するなどの表現型を示すのに加えて、葉の鋸歯化、花序や個々の花のねじれを引き起こす。花器官の数の異常も観察された。T-DNA挿入による劣性変異であることが遺伝解析からわかったので、昨年度に確立した熱ショックタギング法により、原因遺伝子を単離したところ、I型DNAトポイソメラーゼ遺伝子TOP1Aのコード領域にT-DNA挿入を見つけた。この遺伝子プロモーターに野生型TOP1A遺伝子に由来する全長cDNAをつないだT-DNAを変異株に導入した結果、変異表現型は完全に回復したことから、確かにTOP1A遺伝子の欠損が形態異常の原因であることを証明した。TOP1A遺伝子の発現は、野生型株の名器官に認められた。
    さらに、この遺伝子は、染色体上で相同遺伝子TOP1Bとタンデムに並んで存在することから、TOP1BについてRNAiを利用した発現抑制を試みた。野生型株への導入では、形態的な異常は観察されなかったが、top1a変異株のバックグラウンドでは、発芽後致死になったことから、I型DNAトポイソメラーゼ遺伝子が植物の生育に必須であることが示唆された。

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  • シロイヌナズナの矮性変異株を用いた花茎伸長の分子遺伝学的解析

    研究課題/領域番号:09740561  1997年 - 1998年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  奨励研究(A)

    高橋 卓

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    配分額:2300000円 ( 直接経費:2300000円 )

    高等植物の花茎伸長および花序形態形成に関わる遺伝子を同定する目的で、前年度に引き続いてシロイヌナズナ(Anbidopsis thaliana)のT-DNA挿入による形質転換植物を多数作出し、花茎や花序に形態異常が見られる変異株の探索を試みた。得られた約500の独立な形質転換株の中には、地上部の形態異常や花芽形成の遅延などの表現型を示す個体がいくつか認められたが、花芽の出現パターンに規則性がなくなり、時として花茎のひとつの節に複数の花が分化する、あるいは主軸が二股に分岐してその後の花茎伸長が続くなどの表現型を示す一株に注目して解析した。遺伝解析の結果、T-DNA挿入による劣性変異であることがわかり、IPCR法による遺伝子クローニングから5番染色体上に挿入変異を見出した。原因遺伝子の同定、発現解析は途上にあるが、形態観察の結果から花序茎頂の分裂組織が分裂活性を維持できないことが変異表現型の原因であると示唆された。
    他方、細胞壁の伸展性調節に関わることが示唆されているエンドキシログルカン転移酵素(EXGT)の5種類の遺伝子について、野生型植物および矮性変異株ac11〜ac15における発現をそれぞれ調べた結果、EXGT-A1遺伝子についてのみ、その発現量と花茎伸長に強い正の相関を認めた。また、花序形態変異erectaの原因遺伝子として同定されていた受容体型プロテインキナーゼと相同性の高い配列をコードする遺伝子を単離し、雄ずいおよび花粉での高い発現を明らかにするとともに、プロテインキナーゼとしての自己リン酸化活性を確かめた。

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担当授業科目

  • 基礎生物学2a (2023年度) 第3学期  - 火1~2

  • 基礎生物学A (2023年度) 1・2学期  - 金3~4

  • 基礎生物学A1 (2023年度) 第1学期  - 金3~4

  • 基礎生物学A2 (2023年度) 第2学期  - 金3~4

  • 植物生理学 (2023年度) 3・4学期  - 金3~4

  • 植物生理学I (2023年度) 第3学期  - 金3~4

  • 植物生理学II (2023年度) 第4学期  - 金3~4

  • 植物発生機構学 (2023年度) 後期  - 金1~2

  • 植物発生機構学 (2023年度) 後期  - 金1~2

  • 植物発生機構学演習 (2023年度) その他  - その他

  • 植物発生遺伝学 (2023年度) 後期  - その他

  • 植物発生遺伝学 (2023年度) 後期  - その他

  • 生体制御学III (2023年度) 夏季集中  - その他

  • 生物科学ゼミナール (2023年度) その他  - その他

  • 生物科学演習 (2023年度) その他  - その他

  • 生物科学特別研究 (2023年度) その他  - その他

  • 発生機構学演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 発生機構学特別演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 発生生物学IIB (2023年度) 第2学期  - 月1~2

  • 自然・環境科学教養・実践論 (2023年度) 後期  - 木7~8

  • (L21)Mechanisms of Plant Development (2023年度) 特別  - その他

  • (T13)Plant Developmental Biology (2023年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学2a (2022年度) 第3学期  - 火1~2

  • 基礎生物学A (2022年度) 1・2学期  - 金3~4

  • 基礎生物学A1 (2022年度) 第1学期  - 金3~4

  • 基礎生物学A2 (2022年度) 第2学期  - 金3~4

  • 植物生理学 (2022年度) 3・4学期  - 金3~4

  • 植物生理学I (2022年度) 第3学期  - 金3~4

  • 植物生理学II (2022年度) 第4学期  - 金3~4

  • 植物発生機構学 (2022年度) 後期  - 金1~2

  • 植物発生遺伝学 (2022年度) 後期  - その他

  • 生物学ゼミナールA (2022年度) 3・4学期  - その他

  • 生物学ゼミナールB (2022年度) 特別  - その他

  • 生物学実験D (2022年度) 3・4学期  - その他

  • 生物科学ゼミナール (2022年度) 通年  - その他

  • 生物科学概論I (2022年度) 前期  - 月5~6

  • 生物科学演習 (2022年度) 通年  - その他

  • 生物科学特別研究 (2022年度) 通年  - その他

  • 発生機構学演習 (2022年度) 通年  - その他

  • 発生生物学IIB (2022年度) 第2学期  - 月1~2

  • 自然・環境科学教養・実践論 (2022年度) 後期  - 木7~8

  • 自然・環境科学教養・実践論 (2022年度) 後期  - 木7~8

  • 自然・環境科学教養・実践論 (2022年度) 後期  - 木7,木8

  • 課題研究 (2022年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学2a (2021年度) 第3学期  - 火1,火2

  • 基礎生物学2a (2021年度) 第3学期  - 火1~2

  • 基礎生物学A (2021年度) 1・2学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学A1 (2021年度) 第1学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学A2 (2021年度) 第2学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学II (2021年度) 3・4学期  - 火1,火2

  • 植物生理学 (2021年度) 3・4学期  - 金3,金4

  • 植物生理学I (2021年度) 第3学期  - 金3,金4

  • 植物生理学II (2021年度) 第4学期  - 金3,金4

  • 植物発生機構学 (2021年度) 後期  - 金1,金2

  • 植物発生遺伝学 (2021年度) 後期  - その他

  • 発生機構学演習 (2021年度) 通年  - その他

  • 発生生物学II (2021年度) 1・2学期  - 月1,月2

  • 発生生物学IIB (2021年度) 第2学期  - 月1,月2

  • 基礎生物学2a (2020年度) 第3学期  - 火1,火2

  • 基礎生物学A (2020年度) 1・2学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学A1 (2020年度) 第1学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学A2 (2020年度) 第2学期  - 金3,金4

  • 基礎生物学II (2020年度) 3・4学期  - 火1,火2

  • 植物生理学 (2020年度) 3・4学期  - 金3,金4

  • 植物生理学I (2020年度) 第3学期  - 金3,金4

  • 植物生理学II (2020年度) 第4学期  - 金3,金4

  • 植物発生機構学 (2020年度) 後期  - 金1,金2

  • 植物発生遺伝学 (2020年度) 後期  - その他

  • 発生機構学演習 (2020年度) 通年  - その他

  • 発生生物学II (2020年度) 1・2学期  - 月1,月2

  • 発生生物学IIA (2020年度) 第1学期  - 月1,月2

  • 発生生物学IIB (2020年度) 第2学期  - 月1,月2

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