研究者詳細 - 長岐　清孝

2025/08/23 更新

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ナガキ　キヨタカ

長岐　清孝

NAGAKI Kiyotaka

所属

学術研究院先鋭研究領域（大麦・野生）准教授

ホームページ

https://www.rib.okayama-u.ac.jp/nucleus/IGBj/

外部リンク

学位

博士（理学）（横浜市立大学）

研究キーワード

Chromosome
repetitive DNA sequences
epigenetics
centromere
heterochromatin
動原体
ヘテロクロマチン
染色体
エピジェネティクス
反復配列
セントロメア

研究分野

ライフサイエンス / 遺伝学

所属学協会

染色体学会

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日本遺伝学会

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園芸学会

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日本メンデル協会

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委員歴

日本遺伝学会評議員

2023年 - 2024年

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団体区分：学協会

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日本遺伝学会評議員

2017年 - 2020年

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団体区分：学協会

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財団法人染色体学会理事

2016年 - 現在

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団体区分：学協会

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染色体学会評議員

2007年 - 2016年

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団体区分：学協会

染色体学会

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論文

Pancentromere analysis of Allium species reveals diverse centromere positions in onion and gigantic centromeres in garlic. 査読国際誌

Kiyotaka Nagaki, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi

The Plant cell 2025年6月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

In eukaryotes, centromeres interact with the kinetochore for distribution of genetic information in cell division, yet their sequence and size are diverse among species. However, their position on chromosomes is considered to be conserved within a species. In this study, we analyzed the centromeres of three Allium species, namely, Welsh onion (Allium fistulosum), onion (Allium cepa), and garlic (Allium sativum) via pancentromere analysis and repetitive sequence analysis of centromeres and their neighborhoods and revealed their mobility, sequence organization, and size. Among the three species, Welsh onion and garlic had stable centromeres, but the onion centromere appeared to be polymorphic and frequently differed in position by up to 28.0 Mb among cultivars and between multiple individuals of the same cultivar. This mobility was stabilized by hybridization with Welsh onions. Furthermore, these three species have very different centromere sequence organization, including differences in the existence and maturity of centromeric satellites, and differences in centromere size, with Welsh onion having a centromere of 1.9 Mb, and garlic having a centromere of approximately 10.6 Mb, the largest of any organism with monocentric chromosomes analyzed to date. Our pancentromere analysis of these Allium species reveals the variation in sequence organization, size and position of this important chromosomal region.

DOI： 10.1093/plcell/koaf142

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Elucidation of the phylogenetic relationships among Alpinia species native to the Nansei Islands, Japan 査読

Kiyotaka Nagaki, Mari Narusaka, Yoshihiro Narusaka

CYTOLOGIA 90 ( 1 ) 29 - 36 2025年3月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1508/cytologia.90.29

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Rapid and dynamic evolution of a giant Y chromosome in Silene latifolia. 査読国際誌

Takashi Akagi, Naoko Fujita, Kenta Shirasawa, Hiroyuki Tanaka, Kiyotaka Nagaki, Kanae Masuda, Ayano Horiuchi, Eriko Kuwada, Kanta Kawai, Riko Kunou, Koki Nakamura, Yoko Ikeda, Atsushi Toyoda, Takehiko Itoh, Koichiro Ushijima, Deborah Charlesworth

Science (New York, N.Y.) 387 ( 6734 ) 637 - 643 2025年2月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Some plants have massive sex-linked regions. To test hypotheses about their evolution, we sequenced the genome of Silene latifolia, in which giant heteromorphic sex chromosomes were first discovered in 1923. It has long been known that the Y chromosome consists mainly of a male-specific region that does not recombine with the X chromosome and carries the sex-determining genes and genes with other male functions. However, only with a whole Y chromosome assembly can candidate genes be validated experimentally and their locations determined and related to the suppression of recombination. We describe the genomic changes as the ancestral chromosome evolved into the current XY pair, testing ideas about the evolution of large nonrecombining regions and the mechanisms that created the present recombination pattern.

DOI： 10.1126/science.adk9074

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Centrophilic retrotransposon integration via CENH3 chromatin in Arabidopsis. 査読国際誌

Sayuri Tsukahara, Alexandros Bousios, Estela Perez-Roman, Sota Yamaguchi, Basile Leduque, Aimi Nakano, Matthew Naish, Akihisa Osakabe, Atsushi Toyoda, Hidetaka Ito, Alejandro Edera, Sayaka Tominaga, Juliarni, Kae Kato, Shoko Oda, Soichi Inagaki, Zdravko Lorković, Kiyotaka Nagaki, Frédéric Berger, Akira Kawabe, Leandro Quadrana, Ian Henderson, Tetsuji Kakutani

Nature 637 ( 8046 ) 744 - 748 2025年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

In organisms ranging from vertebrates to plants, major components of centromeres are rapidly evolving repeat sequences, such as tandem repeats (TRs) and transposable elements (TEs), which harbour centromere-specific histone H3 (CENH3)1,2. Complete centromere structures recently determined in human and Arabidopsis suggest frequent integration and purging of retrotransposons within the TR regions of centromeres3-5. Despite the high impact of 'centrophilic' retrotransposons on the paradox of rapid centromere evolution, the mechanisms involved in centromere targeting remain poorly understood in any organism. Here we show that both Ty3 and Ty1 long terminal repeat retrotransposons rapidly turnover within the centromeric TRs of Arabidopsis species. We demonstrate that the Ty1/Copia element Tal1 (Transposon of Arabidopsis lyrata 1) integrates de novo into regions occupied by CENH3 in Arabidopsis thaliana, and that ectopic expansion of the CENH3 region results in spread of Tal1 integration regions. The integration spectra of chimeric TEs reveal the key structural variations responsible for contrasting chromatin-targeting specificities to centromeres versus gene-rich regions, which have recurrently converted during the evolution of these TEs. Our findings show the impact of centromeric chromatin on TE-mediated rapid centromere evolution, with relevance across eukaryotic genomes.

DOI： 10.1038/s41586-024-08319-7

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Chromosome-specific barcode system with centromeric repeat in cultivated soybean and wild progenitor. 査読国際誌

Ahmet L Tek, Kiyotaka Nagaki, Hümeyra Yıldız Akkamış, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi

Life science alliance 7 ( 12 ) 2024年12月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Wild soybean Glycine soja is the progenitor of cultivated soybean Glycine max Information on soybean functional centromeres is limited despite extensive genome analysis. These species are an ideal model for studying centromere dynamics for domestication and breeding. We performed a detailed chromatin immunoprecipitation analysis using centromere-specific histone H3 protein to delineate two distinct centromeric DNA sequences with unusual repeating units with monomer sizes of 90-92 bp (CentGm-1) and 413-bp (CentGm-4) shorter and longer than standard nucleosomes. These two unrelated DNA sequences with no sequence similarity are part of functional centromeres in both species. Our results provide a comparison of centromere properties between a cultivated and a wild species under the effect of the same kinetochore protein. Possible sequence homogenization specific to each chromosome could highlight the mechanism for evolutionary conservation of centromeric properties independent of domestication and breeding. Moreover, a unique barcode system to track each chromosome is developed using CentGm-4 units. Our results with a unifying centromere composition model using CentGm-1 and CentGm-4 superfamilies could have far-reaching implications for comparative and evolutionary genome research.

DOI： 10.26508/lsa.202402802

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Effectiveness of Create ML in microscopy image classifications: a simple and inexpensive deep learning pipeline for non-data scientists 査読

Kiyotaka Nagaki, Tomoyuki Furuta, Naoki Yamaji, Daichi Kuniyoshi, Megumi Ishihara, Yuji Kishima, Minoru Murata, Atsushi Hoshino, Hirotomo Takatsuka

Chromosome Research 29 ( 3-4 ) 361 - 371 2021年10月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

DOI： 10.1007/s10577-021-09676-z

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その他リンク： https://link.springer.com/article/10.1007/s10577-021-09676-z/fulltext.html
Decrosslinking enables visualization of RNA-guided endonuclease–in situ labeling signals for DNA sequences in plant tissues 査読

K Nagaki, N Yamaji

Journal of Experimental Botany 71 ( 6 ) 1792 - 1800 2020年3月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press ({OUP})

DOI： 10.1093/jxb/erz534

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ePro-ClearSee: a simple immunohistochemical method that does not require sectioning of plant samples 査読

Kiyotaka Nagaki, Naoki Yamaji, Minoru Murata

Scientific Reports 7 42203 - 14 2017年2月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1038/srep42203

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Sunflower centromeres consist of a centromere-specific LINE and a chromosome-specific tandem repeat. 招待査読

Kiyotaka Nagaki, Keisuke Tanaka, Naoki Yamaji, Hisato Kobayashi and Minoru Murata.

Frontiers in Plant Science 6 ( OCTOBER ) 912 2015年10月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2015.00912

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Identification and characterization of functional centromeres of common bean. 査読

Aiko Iwata, Ahmet L. Tek, Manon M.S. Richard, Brian Abernathy, Artur Fonseca, Jeremy Schmutz, Nicolas W.G. Chen, Vincent Thareau, Ghislaine Magdelenat, Yupeng Li, Minoru Murata, Andrea Pedrosa-Harand, Valerie Geffroy, Kiyotaka Nagaki and Scott A. Jackson

Plant Journal 76 ( 1 ) 47 - 60 2013年10月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/tpj.12269

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Chromosome dynamics visualized with an anti-centromeric histone H3 antibody in Allium. 査読

Kiyotaka Nagaki, Maki Yamamoto, Naoki Yamaji, Yasuhiko Mukai and Minoru Murata

PLOS ONE 7 ( 12 ) e51315 2012年12月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1371/journal.pone.0051315

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Nondisjunction in Favor of a Chromosome: The Mechanism of Rye B Chromosome Drive during Pollen Mitosis 査読

Ali M. Banaei-Moghaddam, Veit Schubert, Katrin Kumke, Oda Weiβ, Sonja Klemme, Kiyotaka Nagaki, Jiří Macas, Mónica González-Sánchez, Victoria Heredia, Diana Gómez-Revilla, Miriam González-García, Juan M. Vega, Maria J. Puertas, Andreas Houben

The Plant Cell 24 ( 10 ) 4124 - 4134 2012年10月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1105/tpc.112.105270

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Isolation of centromeric-tandem repetitive DNA sequences by chromatin affinity purification using a HaloTag7-fused centromere-specific histone H3 in tobacco. 査読

Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara and Minoru Murata.

Plant Cell Reports 31 ( 4 ) 771 - 779 2012年4月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00299-011-1198-4

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Functional centromeres in Astragalus sinicus include a compact centromere-specific histone H3 and a 20-bp tandem repeat. 査読

Ahmet L. Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata and Kiyotaka Nagaki.

Chromosome Research 19 ( 8 ) 969 - 978 2011年11月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-011-9247-y

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Coexistence of NtCENH3 and two retrotransposons in tobacco centromeres 査読

Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Go Suzuki, Asaka Kanatani, Souichi Ozaki, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, and Minoru Murata.

Chromosome Research 19 ( 5 ) 591 - 605 2011年7月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-011-9219-2

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Meiosis-specific loading of the centromere-specific histone CENH3 in Arabidopsis thaliana 査読

Maruthachalam Ravi, Fukashi Shibata, Joseph S. Ramahi, *Kiyotaka Nagaki, Changbin Chen, Minoru Murata, and Simon W. L. Chan.

PLOS Genetics 7 ( 6 ) e1002121 2011年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1371/journal.pgen.1002121

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Functional centromeres in soybean include two distinct tandem repeats and a retrotransposon 査読

Ahmet L. Tek, Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Mminoru Murata

Chromosome Research 18 ( 3 ) 337 - 347 2010年4月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-010-9119-x

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Characterization of the two centromeric proteins CENP-C and MIS12 in Nicotiana species 査読

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara and Mminoru Murata

Chromosome Research 17 ( 6 ) 719 - 726 2009年8月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-009-9064-8

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A centromeric DNA sequence colocalized with a centromere-specific histone H3 in tobacco. 査読

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara and Mminoru Murata.

Chromosoma 118 ( 2 ) 249 - 257 2009年4月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00412-008-0193-1

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Characterization of two centromere-specific histone H3 homologues from tobacco 査読

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

CHROMOSOME RESEARCH 15 60 - 61 2007年

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語

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Transcription and histone modifications in the recombination-free region spanning a rice centromere 査読

Huihuang Yan, Weiwei Jin, Kiyotaka Nagaki, Shulan Tian, Shu Ouyang, C. Robin Buell, Paul B. Talbert, Steven Henikoff, and Jiming Jiang

The Plant Cell 17 ( 12 ) 3227 - 3238 2005年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1105/tpc.105.037945

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Visualization of Diffuse Centromeres with Centromere-Specific Histone H3 in the Holocentric Plant Luzula nivea. 査読

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

The Plant Cell 17 ( 7 ) 1886 - 1893 2005年7月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1105/tpc.105.032961

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Structure, divergence, and distribution of the CRR centromeric retrotransposon family in rice 査読

Kiyotaka Nagaki, Pavel Neumann, Dongfen Zhang, Shu Ouyang, C. Robin Buell, Zhukuan Cheng, Jiming Jiang

Molecular Biology and Evolution 22 ( 4 ) 845 - 855 2005年4月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/molbev/msi069

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Characterization of CENH3 and centromere-associated DNA sequences in sugarcane 査読

Kiyotaka Nagaki and Minoru Murata

Chromosome Research 13 ( 2 ) 195 - 203 2005年1月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-005-0847-2

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Maize Centromeres: Organization and Functional Adaptation in the Genetic Background of Oat 査読

Weiwei Jin, Juliana R. Melo, *Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talbert, Steven Henikoff, R. Kelly Dawe, and Jiming Jiang

The Plant Cell 16 ( 3 ) 571 - 581 2004年3月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1105/tpc.018937

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Sequencing of a rice centromere uncovers active genes 査読

Kiyotaka Nagaki, Zhukuan Cheng, Shu Ouyang, Paul B. Talbert, Mary Kim, Kristine M. Jones, Steven Henikoff, C. Robin Buell, and Jiming Jiang

Nature Genetics 36 ( 2 ) 138 - 145 2004年2月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1038/ng1289

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Chromatin immunoprecipitation reveals that the 180-bp satellite repeat is the key functional DNA element of Arabidopsis thaliana centromeres 査読

Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talbert, Cathy Xiaoyan Zhong, R. Kelly Dawe, Steven Henikoff, and Jiming Jiang

Genetics 163 ( 3 ) 1221 - 1225 2003年3月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

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Molecular and cytological analyses of large tracks of centromeric DNA reveal the structure and evolutionary dynamics of maize centromeres

Kiyotaka Nagaki, Junqi Song, Robert M. Stupar, Alexander S. Parokonny, Qiaoping Yuan, Shu Ouyang, Jia Liu, Joseph Hsiao, Kristine M. Jones, R. Kelly Dawe, C. Robin Buell, and Jiming Jiang

Genetics 163 ( 2 ) 759 - 770 2003年2月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

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Centromeric Retroelements and Satellites Interact with Maize Kinetochore Protein CENH3 査読

Cathy Xiaoyan Zhong, Joshua B. Marshall, Christopher Topp, Rebecca Mroczek, Akio Kato, *Kiyotaka Nagaki, James A. Birchler, Jiming Jiang, and R. Kelly Dawe

The Plant Cell 14 ( 11 ) 2825 - 2836 2002年11月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1105/tpc.006106

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Phenotypic effects of Am genomes in nascent synthetic hexaploids derived from interspecific crosses between durum and wild einkorn wheat 査読

Asami Michikawa, Moeko Okada, Tatsuya M. Ikeda, Kiyotaka Nagaki, Kentaro Yoshida, Shigeo Takumi

PLOS ONE 18 ( 4 ) e0284408 - e0284408 2023年4月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Public Library of Science (PLoS)

Allopolyploid speciation is a major evolutionary process in wheat (Triticum spp.) and the related Aegilops species. The generation of synthetic polyploids by interspecific crosses artificially reproduces the allopolyploidization of wheat and its relatives. These synthetic polyploids allow breeders to introduce agriculturally important traits into durum and common wheat cultivars. This study aimed to evaluate the genetic and phenotypic diversity in wild einkorn Triticum monococcum ssp. aegilopoides (Link) Thell., to generate a set of synthetic hexaploid lines containing the various A^m genomes from wild einkorn, and to reveal their trait characteristics. We examined the genetic diversity of 43 wild einkorn accessions using simple sequence repeat markers covering all the chromosomes and revealed two genetically divergent lineages, L1 and L2. The genetic divergence between these lineages was linked to their phenotypic divergence and their habitats. L1 accessions were characterized by early flowering, fewer spikelets, and large spikelets compared to L2 accessions. These trait differences could have resulted from adaptation to their different habitats. We then developed 42 synthetic hexaploids containing the AABBA^mA^m genome through interspecific crosses between T. turgidum cv. Langdon (AABB genome) as the female parent and the wild einkorn accessions (A^mA^m genome) as the male parents. Two of the 42 AABBA^mA^m synthetic hexaploids exhibited hybrid dwarfness. The phenotypic divergence between L1 and L2 accessions of wild einkorn, especially for days to flowering and spikelet-related traits, significantly reflected phenotypic differences in the synthetic hexaploids. The differences in plant height and internodes between the lineages were more distinct in the hexaploid backgrounds. Furthermore, the AABBA^mA^m synthetic hexaploids had longer spikelets and grains, long awns, high plant heights, soft grains, and late flowering, which are distinct from other synthetic hexaploid wheat lines such as AABBDD. Utilization of various A^m genomes of wild einkorn resulted in wide phenotypic diversity in the AABBA^mA^m synthetic hexaploids and provides promising new breeding materials for wheat.

DOI： 10.1371/journal.pone.0284408

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Epigenomic modification in rice controls meiotic recombination and segregation distortion. 査読

Habu Y, Ando T, Ito S, Nagaki K, Kishimoto N, Taguchi-Shiobara F, Numa H, Yamaguchi K, Shigenobu S, Murata M, Meshi T, Yano M.

Molecular Breeding 35 ( 4 ) 644 - 653 2015年4月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s11032-015-0299-0

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Modification of centromere structure: a promising approach for haploid line production in plant breeding 査読

Ahmet L. Tek, Robert M. Stupar, Kiyotaka Nagaki

TURKISH JOURNAL OF AGRICULTURE AND FORESTRY 39 ( 4 ) 557 - 562 2015年

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記述言語：英語

DOI： 10.3906/tar-1405-137

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Identification of the centromere-specific histone H3 variant in Lotus japonicus. 査読

Ahmet L. Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata and Kiyotaka Nagaki.

Gene 538 ( 1 ) 8 - 11 2014年3月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.gene.2014.01.034

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Tobacco karyotyping by accurate centromere identification and novel repetitive DNA localization. 査読

Shibata, F., Nagaki K., Yokota, E. and Murata, M.

Chromosome Research 21 ( 4 ) 375 - 381 2013年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-013-9363-y

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Generation of an artificial ring chromosome in Arabidopsis by the Cre/LoxP-mediated recombination 査読

Murata, M., Shibata, F., Hironaka, A., Kashihara, K., Fujimoto, F., Yokota, E. and Nagaki K.

Plant Journal 74 ( 3 ) 363 - 371 2013年5月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/tpj.12128

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Stability of monocentric and dicentric ring minichromosomes in Arabidopsis. 査読

Etsuko Yokota, Fukashi Shibata, Kiyotaka Nagaki and Minoru Murata.

Chromosome Research 19 ( 8 ) 999 - 1012 2011年11月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-011-9250-3

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CENH3 distribution and differential chromatin modifications during pollen development in rye (Secale cereale L.). 査読

Andreas Houben, Katrin Kumke, Kiyotaka Nagaki, Gerd Hause

Chromosome Research 19 ( 4 ) 471 - 480 2011年5月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-011-9207-6

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Holocentric chromosomes of Luzula elegans are characterized by a longitudinal centromere groove, chromosome bending, and a terminal nucleolus organizer region. 査読

Stefan Heckmann, Elizabeth Schroeder-Reiter, Katrin Kumke, Lu Ma, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata, Gerhard Wanner, and Andreas Houben

Cytogenetic and Genome Research 134 ( 3 ) 220 - 228 2011年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1159/000327713

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Minichromosome stability induced by partial genome duplication in Arabidopsis thaliana 査読

Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki and Minoru Murata

Chromosoma 119 ( 4 ) 361 - 369 2010年8月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00412-010-0259-8

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Centromere targeting of alien CENH3s in Arabidopsis and tobacco cells 査読

Kiyotaka Nagaki, Kaori Terada, Munenori Wakimoto, Kazunari Kashihara and Mminoru Murata

Chromosome Research 18 ( 2 ) 203 - 211 2010年2月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s10577-009-9108-0

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Components and structures of plant centromeres. 招待査読

Kiyotaka Nagaki

Chromosome Science 12 ( 1 ) 5 - 11 2009年

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語出版者・発行元：財団法人染色体学会

Centromeres are functional chromosomal loci involved in an overall process that delivers sister chromatids equally into daughter cells during mitosis and meiosis. A complex of centromeric DNA and proteins is formed at the primary constriction point, and is referred to as the kinetochore. Since this function is essential for all eukaryotes, the process and centromeric proteins involved are conserved among eukaryotes. On the other hand, the DNA components and structures of centromeres are highly variable among eukaryotes. In the last decade, a plethora of investigations concerning plant centromeric components including centromeric DNA and proteins have been conducted which have shed light on these enigmatic chromosomal regions and associated functions. In this review, an overview of plant centromeric components including centromeric proteins (CENP-C, centromere specific histone H3 variants, and MIS12) and centromeric DNA and structures of plant centromeres (Arabidopsis, rice, and Luzula) are presented.

DOI： 10.11352/scr.12.5

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CENH3 interacts with the centromeric retrotransposon cereba and GC-rich satellites and locates to centromeric substructures in barley 査読

Andreas Houben, Elizabeth Schroeder-Reiter, Kiyotaka Nagaki, Shuhei Nasuda, Gerhard Wanner, Minoru Murata and Takashi R. Endo

Chromosoma 116 ( 3 ) 275 - 283 2007年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00412-007-0102-z

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Precise centromere mapping using a combination of repeat junction markers and chromatin immunoprecipitation_polymerase chain reaction 査読

Amy C. Luce, Anupma Sharma, Oliver S. B. Mollere, Thomas K. Wolfgruber, *Kiyotaka Nagaki, Jiming Jiang, Gernot G. Presting, and R. Kelly Dawe

Genetics 174 ( 2 ) 1057 - 1061 2006年10月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1534/genetics.106.060467

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Tetrad-FISH analysis reveals recombination suppression by interstitial heterochromatin sequences in rye (Secale cereale) 査読

N Kagawa, K Nagaki, H Tsujimoto

MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS 267 ( 1 ) 10 - 15 2002年3月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00438-001-0634-5

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Amplification of the Afa-family repetitive sequences in the evolution of the D and A genomes in wheat and its relatives 査読

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

The Botanica 51 18 - 28 2001年

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

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A tandem repetitive sequence located in the centromeric region of common wheat (Triticum aestivum) chromosomes 査読

Masahiro Kishii, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

Chromosome Research 9 ( 5 ) 417 - 428 2001年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1023/A:1016739719421

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Development of an efficient maintenance and screening system for large-insert genomic DNA libraries of hexaploid wheat in a transformation-competent artificial chromosome (TAC) vector 査読

Yao-Guang Liu, Kiyotaka Nagaki, Masako Fujita, Kanako Kawaura, Masahiko Uozumi, Yasunari Ogihara

Plant Journal 23 ( 5 ) 687 - 695 2000年9月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1046/j.1365-313X.2000.00827.x

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Tandem repetitive Afa-family sequences from Leymus racemosus and Psathyrostachys juncea (Poaceae) 査読

Kiyotaka Nagaki, Masahiro Kishii, Hisashi Tsujimoto, and Tetsuo Sasakuma

Genome 42 ( 6 ) 1258 - 1260 1999年12月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

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De novo synthesis of telomere sequences at the healed break points of wheat deletion chromosomes 査読

Hisashi Tsujimoto, Naoya Usami, Keiko Hasegawa, Toyomi Yamada, Kiyotaka Nagaki, and Tetsuo Sasakuma

Molecular and General Genetics 262 ( 4-5 ) 851 - 856 1999年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s004380051150

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Exclusive localization of tandem repetitive sequences in subtelomeric heterochromatin regions of Leymus racemosus (Poaceae, Triticeae) 査読

Masahiro Kishii, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, and Tetsuo Sasakuma

Chromosome Research 7 ( 7 ) 519 - 529 1999年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1023/A:1009285311247

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A novel repetitive sequence of Japanese rye, JNK repeat family, locating on an extra C-band region of the chromosome 2R 査読

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, and Tetsuo Sasakuma

Chromosome Research 7 ( 2 ) 95 - 101 1999年

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1023/A:1009226612818

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Dynamics of tandem repetitive Afa-family sequences in triticeae, wheat-related species 査読

Nagaki K., Tsujimoto H., Sasakuma T.

JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION 47 ( 2 ) 183 - 189 1998年8月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/PL00006375

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H genome specific repetitive sequence, pEt2, of Elymus trachycaulus in part of Afa family of Triticeae 査読

Nagaki K, Tsujimoto H, Sasakuma T

GENOME 41 ( 1 ) 134 - 136 1998年

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1139/gen-41-1-134

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A novel repetitive sequence of sugar cane, SCEN family, locating on centromeric regions 査読

Nagaki K., Tsujimoto H., Sasakuma T.

CHROMOSOME RESEARCH 6 ( 4 ) 295 - 302 1998年

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1023/A:1009270824142

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Identification of individual barley chromosomes based on repetitive sequences: Conservative distribution of Afa-family repetitive sequences on the chromosomes of barley and wheat 査読

Tsujimoto H, Mukai Y, Akagawa K, *Nagaki K, Fujigaki J, Yamamoto M, Sasakuma T

GENES & GENETIC SYSTEMS 72 ( 5 ) 303 - 309 1997年10月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1266/ggs.72.303

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MOLECULAR CHARACTERIZATION OF A TANDEM REPEAT, AFA FAMILY, AND DISTRIBUTION AMONG TRITICEAE 査読

NAGAKI K, TSUJIMOTO H, ISONO K, SASAKUMA T

GENOME 38 ( 3 ) 479 - 486 1995年

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1139/g95-063

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書籍等出版物

Plant cytogenetics and cytogenomics : methods and protocols

Heitkam, Tony, García, Sonia (Editor of Plant cytogenetics and cytogenomics)

Humana Press 2023年（ ISBN:9781071632253 ）

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総ページ数：xviii, 568 p. 記述言語：英語

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Cytogenomics

（担当：共著 , 範囲: 第9章）

Elsevier 2021年5月

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エッセンシャル遺伝学・ゲノム科学［原著第7版］

（担当：共訳 , 範囲: 第５章）

2021年1月

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Chromosome and genomic engineering in plants, Methods in Molecular Biology

Humana Press 2016年

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はじめての染色体-植物染色体写真集&実験マニュアル-

Apple 2014年

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The First Chromosomes

Apple 2012年

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Centromere, Progress in Molecular and Subcellular Biology 48.

Springer-Verlag Berlin Heidelbarg 2009年

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細胞工学別冊・植物細胞工学シリーズ24、植物のエピジェネティクス

秀潤社 2008年

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MISC

南西諸島に自生するゲットウ種の分子同定

鳴坂真理, 長岐清孝, 関根健太郎, 鳴坂義弘

琉球大学農学部学術報告 ( 71 ) 35 - 38 2024年12月

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記述言語：英語出版者・発行元：琉球大学農学部

シマゲットウ(Alpiniazerumbet)およびその近縁種(ショウガ科)であるクマタケラン(Alpiniaformosana),アオノクマタケラン(Alpiniaintermedia),ウライゲットウ(Alpiniauraiensis),Alpiniacf.uraiensis(俗称：タイリンゲットウ)は,南西諸島を含む東アジアの亜熱帯および熱帯地域に自生している.これらの種は形態的に類似しているため,シマゲットウとその近縁種を区別することは困難である.したがって,シマゲットウおよびその近縁種の育種と利用においては,信頼性の高いDNAマーカー技術による分類が必要である.本研究では,Alpinia属の種の同定のためにいくつかの分析手法の開発を試みた.その結果,RAPD解析,HRM解析およびGRAS-Di解析により,南西諸島に自生するシマゲットウおよびその近縁種を分類可能であることを示した.本研究で開発したDNAマーカー技術を使用することで,シマゲットウとその近縁種を簡易かつ正確に区別することが可能となった.

DOI： 10.24564/0002021292

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細胞遺伝学の新潮流-より速く、より広く、より細かく、そして創出へ、古くて新しいゲノムの見える化技術招待

石井孝佳, 長岐清孝, 菊池真司

化学と生物 ( 58 ) 606 - 613 2020年11月

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記述言語：日本語掲載種別：記事・総説・解説・論説等（学術雑誌）

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植物透明化によるエピジェネティック修飾の解析招待

長岐清孝

月刊バイオインダストリー ( 7 ) 1 - 8 2017年7月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：日本語掲載種別：記事・総説・解説・論説等（商業誌、新聞、ウェブメディア）

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受精後雑種障壁研究の育種利用に向けて (2016年第58回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告)

石井孝佳, 岡本龍史, 殿崎薫, 長岐清孝, 木下哲

育種学研究 = Breeding research : 日本育種学会和文誌 19 ( 1 ) 35 - 40 2017年3月

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本育種学会

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Transmission control of plant artificial ring chromosome in Arabidopsis thaliana

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 91 ( 6 ) 342 - 342 2016年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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コムギ花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御に及ぼすミトコンドリアゲノムの効果

村井耕二, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年

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Attempts to generate artificial ring chromosomes in rice

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90 ( 6 ) 402 - 402 2015年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes -from micro to macro-

Kiyotaka Nagaki, Naoki Yamaji, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 90 ( 6 ) 374 - 374 2015年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Development of a novel method for identifying centromeric DNA sequences

Kiyotaka Nagaki, Keisuke Tanaka, Ryo Matsushima, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 89 ( 6 ) 304 - 304 2014年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Generation of a stable 1-Mb-sized artificial ring chromosome in Arabidopsis

Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Akiko Hironaka, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 89 ( 6 ) 304 - 304 2014年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

Web of Science

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Analyses of kinetochore components of legume species

Ahmet Latif Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 88 ( 6 ) 388 - 388 2013年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Stability of artificial ring chromosomes in Arabidopsis thaliana

Fukashi Shibata, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 88 ( 6 ) 388 - 388 2013年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Utilization of centromeric histone H3 for chromosome observation in Allium species

Kiyotaka Nagaki, Maki Yamamoto, Yasuhiko Mukai, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 87 ( 6 ) 409 - 409 2012年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Induction of chromosomal rearrangements and genome stability in Arabidopsis

Minoru Murata, Fukashi Shibata, Satoru Fujimoto, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 87 ( 6 ) 394 - 394 2012年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Mega-base scale chromosomal rearrangements induced by Cre/LoxP-mediated recombinations in Arabidopsis

Minoru Murata, Fukashi Shibata, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 86 ( 6 ) 434 - 434 2011年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Karyotyping of tobacco by immnunolabeling and FISH, and a discovery of mini B-chromosome

Fukashi Shibata, Etsuko Yokota, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 86 ( 6 ) 434 - 434 2011年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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A mosaic structure of centromeric DNA in tobacco

Kiyotaka Nagaki, Fukasi Shibata, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 86 ( 6 ) 434 - 434 2011年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Gene expression on induced partial genome duplications in Arabidopsis thaliana

Minoru Murata, Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 85 ( 6 ) 418 - 418 2010年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Evolutionally close alien CENH3s are able to target centromeres in Arabidopsis and tobacco cells

Kiyotaka Nagaki, Kaori Terada, Munenori Wakimoto, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 85 ( 6 ) 418 - 418 2010年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

Web of Science

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Chromatin modification controls segregation distortion

Yoshiki Habu, Tsuyu Ando, Sachie Ito, Kiyotaka Nagaki, Fumio Taguchi-Shiobara, Masahiro Yano

GENES & GENETIC SYSTEMS 85 ( 6 ) 417 - 417 2010年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Isolation of a tobacco centromeric DNA sequence using chromatin immunoprecipitation

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Go Suzuki, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 84 ( 6 ) 472 - 472 2009年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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人工染色体--植物の染色体を作る--人工染色体研究の最前線—特集1 植物染色体の最前線

村田稔, 長岐清孝

遺伝 : 生物の科学 63 ( 3 ) 61 - 65 2009年5月

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記述言語：日本語出版者・発行元：東京 : エヌ・ティー・エス

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その他リンク： https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I10239264
Structure and evolution of plant centromeres.

Kiyotaka Nagaki, Jason Walling, Cory Hirsch, Jiming Jiang, Minoru Murata

Progress in molecular and subcellular biology 48 153 - 179 2009年

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記述言語：英語掲載種別：書評論文，書評，文献紹介等

DOI： 10.1007/978-3-642-00182-6_6

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A microchromosome derived from the mini ring chromosome delta in Arabidopsis thaliana

Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 83 ( 6 ) 511 - 511 2008年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Epigenetics in centromeres

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Munenori Wakimoto, Kaori Terada, Etsuko Yokota, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 83 ( 6 ) 534 - 534 2008年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Analysis of centromere-specific histone H3 homologues from tobacco

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 82 ( 6 ) 559 - 559 2007年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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O-25. Analysis of CENP-C homologue from tobacco(Abstracts for the oral and the poster presentations,Abstracts of the Joint Meeting: the 58th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research and the 17th Annual Meeting of the Chromosome Colloquium) :

NAGAKI Kiyotaka, KASHIHARA Kazunari, MURATA Minoru

Chromosome science 10 ( 4 ) 120 - 120 2007年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00107766/
Identification and functional analysis of chromosomal passenger proteins in Arabidopsis thaliana

Mauren Jaudal, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

GENES & GENETIC SYSTEMS 81 ( 6 ) 431 - 431 2006年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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イネ第8染色体動原体領域の塩基配列の解析および機能領域の特定

長岐清孝, CHENG Zhukuan, OUYANG Shu, TALBERT Paul B., KIM Mary, M. JONES Kristine, HENIKOFF Steven, BUELL C. Robin, JIANG Jiming

Genes & genetic systems 79 ( 5 ) I 2004年10月

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記述言語：日本語

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Tetrad-FISH analysis reveals recombination suppression by interstitial heterochromatin sequences in rye, Secale cereale

Naoko Kagawa, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

Molecular Genetics Genomics 267 10 - 15 2002年

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記述言語：英語

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O-02. Construction of a transformation-competent artificial chromosome (TAC) library for lettuce molecular cytogenetics research(Abstracts of the oral and poster presentations)(The 53rd Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

MATOBA Hideyuki, UCHIYAMA Hiroshi, KOYAMA Tetsuo, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi, SASAKUMA Tetsuo

Chromosome science 6 ( 4 ) 110 - 110 2002年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

CiNii Article

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00107256/
Naoko Kagawa, *Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

Masahiro Kishii, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

Chromosome Research 9 417 - 428 2001年

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ジュズダマ花粉の交雑によるコムギ半数体の作出

持田恵一, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

育種学研究 = Breeding research 2 ( 1 ) 142 - 142 2000年4月

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記述言語：日本語

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コムギ育種遺伝資源としての四倍生レイムス属の細胞遺伝学多様性

岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

育種学研究 = Breeding research 2 ( 1 ) 263 - 263 2000年4月

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記述言語：日本語

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コムギのゲノム科学III. Transformation-competent artificial chromosome (TAC) ベクターを用いたパンコムギゲノミックライブラリーの構築と解析

長岐清孝, 劉耀光, 魚住政彦, 藤田雅子, 川浦香奈子, 荻原保成

育種学研究 = Breeding research 2 ( 1 ) 26 2000年4月

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記述言語：日本語

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Genome-specific arrangement of Tail-family sequence in Triticeae : localization in either subtelomeric or centromeric region :

KISHII Masahiro, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi

Chromosome science 4 ( 4 ) 131 - 131 2000年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00107088/
Characterization of centromeric regirons of comnron wheat :

Nagaki Kiyotaka, Kishii Masahiro, Tsujimoto Hisashi

Chromosome science 4 ( 4 ) 124 - 124 2000年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

CiNii Article

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00107075/
Development of genomic in situ hybridization method to Technovit 7100 sections of wheat early embryo :

MOCHIDA Keiichi, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi, SASAKUMA Tetsuo

Chromosome science 4 ( 4 ) 131 - 131 2000年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

CiNii Article

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00107089/
オオハマニンニク(Leymus racemosus)の反復配列による添加パンコムギ系統の解析

岸井正浩, 長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

育種学研究 1 1999年

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Leymus racemosusおよびPsathyrostachys junceaにおけるAfaファミリー反復配列の解析

長岐清孝, 岸井正浩, 辻本寿, 笹隈哲夫

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 71st 1999年

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1. De novo initiation of telomere sequences at the healed break points of wheat deletion chromosomes(Abstracts of the 50th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

TSUJIMOTO Hisashi, USAMI N., HASEGAWA K., YAMADA T., NAGAKI K., SASAKUMA T.

Chromosome science 3 ( 3 ) 140 - 140 1999年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

CiNii Article

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00106991/
The JNK repeat family: A novel repetitive sequence located on an extra C-band region of the chromosome 2R of Japanese rye

Nagaki K, Tsujimoto H, Sasakuma T

Proc. 9 Int. Wheat Genet 2 98 - 100 1998年

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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サトウキビ動原体に存在する縦列型反復配列

長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 70th 1998年

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ライムギ2R染色体長腕特異的反復配列の解析

長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 69th 1997年

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Repetitive DNA sequences locating on the polymorphic C-band region found in a novel chromosome of rye, Secale cereale(Abstracts of the 48th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

TSUJIMOTO Hisashi, NAGAKI Kiyotaka, SASAKUMA Tetsuo

Chromosome science 1 ( 2 ) 156 - 156 1997年

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記述言語：英語出版者・発行元：Society of Chromosome Research

CiNii Article

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その他リンク： http://id.nii.ac.jp/1141/00106788/
コムギ連におけるAfaファミリー反復配列の分子進化

長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 68th 1996年

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VARIABILITY OF AFA-FAMILY SEQUENCES IN DGENOME CHROMOSOMES OF COMMON WHEAT

NAGAKI K., TSUJIMOTO H., SASAKUMA T.

The Japanese journal of genetics 70 ( 6 ) 717 - 717 1995年12月

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記述言語：英語

CiNii Article

CiNii Books

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Genome specific amplification of Afa-family sequence in Triticeae

Nagaki K, Tsujimoto H, Sasakuma T

Proc. US-Jpn joint meeting, Modification of gene expression and non-Mendelian inheritance 449 - 454 1995年

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記述言語：英語掲載種別：研究発表ペーパー・要旨（国際会議）

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Afaファミリー配列の構成から見た倍数性コムギの祖先種

長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

育種学雑誌 45 1995年

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J-GLOBAL

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コムギDゲノムの各染色体におけるAfaファミリー反復配列の変異性

長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 67th 1995年

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J-GLOBAL

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講演・口頭発表等

植物染色体の E pur si muove! 〜それでも、それは、動く〜

長岐清孝

日本遺伝学会第96回大会 2024年

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会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等

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植物の「そぞろ歩くセントロメア」

長岐清孝

日本進化学会第26回大会 2024年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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ネギ属植物種のパンセントロメア解析によって明らかになったタマネギの散策するセントロメア

長岐清孝, 牛島幸一郎, 赤木剛士, 田中啓介, 小林久人

日本遺伝学会第96回大会 2024年

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会議種別：口頭発表（一般）

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ネギ属植物種のパンセントロメア解析によって明らかになったセントロメアサイズの多様性

長岐清孝, 牛島幸一郎, 赤木剛士, 田中啓介, 小林久人

染色体学会第75回年会 2024年

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会議種別：口頭発表（一般）

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エピジェネティックに徘徊、逃避するセントロメア

長岐清孝

第65回日本生化学会中国四国支部例会 2024年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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月桃由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物ウイルス剤の開発研究

鳴坂義弘, 関根健太郎, 長岐清孝, 鳴坂真理

第46回日本分子生物学会年会 2023年

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ゲットウ由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物ウイルス剤の開発研究

鳴坂真理, 関根健太郎, 畑中唯史, 長岐清孝, 鳴坂義弘

令和5年度日本植物病理学会大会 2023年

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ショウガセントロメア領域の解析

長岐清孝, 田中啓介, 赤木剛士, 杉山立志, 和久井健司

日本遺伝学会第95回大会 2023年

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会議種別：口頭発表（一般）

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南西諸島に自生するAlpinia属植物のセントロメアDNA配列の解析

長岐清孝, 鳴坂真理, 鳴坂義弘

染色体学会第74回年会 2023年

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会議種別：口頭発表（一般）

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南西諸島に自生するAlpinia属植物の核型解析

長岐清孝, 鳴坂真理, 鳴坂義弘

染色体学会第73回年会 2022年

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新たな農資源ゲットウを利用した新規抗ウイルス剤の開発研究

鳴坂真理, 畑中唯史, 長岐清孝, 鳴坂義弘

令和4年度日本植物病理学会大会 2022年

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「Macで機械学習」のススメ -やすいぞ、はやいぞ、うまいぞ!-

長岐清孝

染色体学会第72回年会 2021年

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会議種別：口頭発表（一般）

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AI による染色体解析 -染色体にも Society 5.0?-

長岐清孝

染色体学会第72回年会 2021年

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会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等

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Characterization of the centromere-specific histone H3 (CENH3) in oil palms.

Minoru Murata, Narayanasamy A/L Dhanendiren, Ling Hann Wong, Kiyotaka Nagaki

日本遺伝学会第92回大会 2020年

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RepeatExplorerを利用したコムギ2倍体野生種の反復配列の解析

田中紗弥夏, 吉田健太郎, 長岐清孝, 宅見薫雄

日本育種学会第137回講演会 2020年

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In-house機械学習した人工知能（AI）による染色体画像解析の半自動化

長岐清孝, 山地直樹

日本遺伝学会第92回大会 2020年

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RGEN-ISL (RNA-guided endonuclease - in situ labelling)を用いた標的DNA配列の可視化による植物組織内動原体解析

長岐清孝, 山地直樹

2019年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Production and phenotypic analysis of synthetic allohexaploid lines having durum wheat and wild diploid relative genomes.

Shigeo Takumi, Asami Michikawa, Miki Yuka, Sayaka Tanaka, Moeko Okada, Kiyotaka Nagaki, Kazuhiro Sato, Tatsuya Ikeda, Kentaro Yoshida, Yoshihiro Matsuoka

1st International Wheat Congress 2019年

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RGEN-ISL (RNA-guided endonuclease - in situ labelling)を用いた標的DNA配列の植物組織内可視化とエピジェネティック修飾の同時検出

長岐清孝, 山地直樹

日本遺伝学会第91回大会 2019年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Identification of genes on the midget chromosome in a common wheat with rye cytoplasm.

Minoru Murata, Kazunari Kashihara, Asaka Kanatani, Kiyotaka Nagaki, Takashi Endo, Kazuhiro Sato

13th International Wheat Genetics Symposium 2017年

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記述言語：英語会議種別：口頭発表（一般）

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６倍性コムギにおける花器官形成クラスＢ MADS-box遺伝子の同祖遺伝子特異的エピジェネティック制御

村井耕二、梅北耕典、桑原翼、田中美久、長岐清孝、村田稔

第57回日本植物生理学会年会 2016年

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花成遅延を誘発する細胞質置換パンコムギ系統および正常細胞質系統おけるVRN1同祖遺伝子のヒストンメチル化修飾パターン変異

梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

一般社団法人日本育種学会第129回講演会 2016年

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パンコムギにおける花器官形成クラス B MADS-box 遺伝子の同祖遺伝子内発現変異はエピジェネティック制御による

桑原翼, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

一般社団法人日本育種学会第130回講演会 2016年

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パンコムギにおける花器官形成クラス B MADS-box 遺伝子の同祖遺伝子内発現変異とヒストンのメチル化パターン

桑原翼、田中美久、梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

一般社団法人日本育種学会第129回講演会 2016年

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パンコムギにおけるtrithorax-group遺伝子の同定と発現解析

梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

一般社団法人日本育種学会第130回講演会 2016年

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倍数性コムギにおける花器官形成MADSボックス遺伝子のエピジェネティック制御

梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

第8回中国地域育種談話会・第11回ムギ類研究会（共催） 2016年

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花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御機構の解明

桑原翼、梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

第8回中国地域育種談話会・第11回ムギ類研究会（共催） 2016年

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動原体改変による半数体作出

長岐清孝

一般社団法人日本育種学会第130回講演会 2016年

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６倍性コムギにおける花器官形成クラスＢ MADS-box遺伝子の同祖遺伝子特異的エピジェネティック制御

村井耕二, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔

第39回日本分子生物学会年会 2016年

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Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes -from micro to macro-

長岐清孝, 山地直樹, 田中啓介, 小林久人, 村田稔

日本遺伝学会第87回大会 2015年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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Chromosome instability in the resynthesized Brassica napus.

Nobuko Ohmido, Kanako Ueda, Kouei Fujii, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

The 5th Asian Chromosome Colloquium 2015年

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Genome organization and chromosome dynamics in an Allium hybrid.

Maki Yamamoto, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata, Yasuhiko Mukai

The 5th Asian Chromosome Colloquium 2015年

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An epigenetic mutation responsible for flower variegation in Japanese morning glory.

Atsushi Hoshino, Yasumasa Morita, Kiyotaka Nagaki

International Symposium "Establishing Next-Generation Genetics" 2015年

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花成遅延を誘発する細胞質置換コムキ系統におけるVRN1遺伝子のヒストンのメチル化解析

梅北耕典, 成田華乃, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

日本育種学会第128回大会 2015年

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会議種別：口頭発表（一般）

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イネにおける人工環状染色体作出の試み

村田稔, 金谷麻加, 柏原壱成, 長岐清孝

日本遺伝学会第87回大会 2015年

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会議種別：口頭発表（一般）

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アブラナ科種間雑種における染色体不安定性

近江戸伸子, 上田加奈子, 藤井宏栄, 長岐清孝, 村田稔

染色体学会第65回年会 2014年

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クロマチン免疫沈降を必要としない動原体DNA配列推定法の開発

長岐清孝, 田中啓介, 松島良, 小林久人, 村田稔

日本遺伝学会第86回大会 2014年

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会議種別：口頭発表（一般）

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シロイヌナズナの1 Mbサイズ人工環状染色体の作出と安定性

村田稔, 金谷麻加, 柏原壱成, 長岐清孝

日本遺伝学会第86回大会 2014年

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会議種別：口頭発表（一般）

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マメ科植物の動原体構成要素の解析

Ahmet Latif Tek, 柏原壱成, 村田稔, 長岐清孝

日本遺伝学会第85回大会 2013年

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会議種別：口頭発表（一般）

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シロイヌナズナにおけるミニ染色体への遺伝子導入

村田稔, 横田悦子, 柴田洋, 金谷麻加, 藤本聡, 柏原壱成, 長岐清孝

財団法人染色体学会第64回大会 2013年

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会議種別：口頭発表（一般）

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タバコ混数性における細胞分裂時の動原体と紡錘糸の挙動

三島阿佐子, 鈴木剛, 長岐清孝, 村田稔, 向井康比己

財団法人染色体学会第64回大会 2013年

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会議種別：口頭発表（一般）

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シロイヌナズナ環状人工染色体の安定性

柴田洋, 長岐清孝, 村田稔

日本遺伝学会第85回大会 2013年

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会議種別：口頭発表（一般）

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植物環状人工染色体の作出とその簡略化

村田稔, 金谷麻加, 柴田洋, 長岐清孝

日本育種学会第124回大会 2013年

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会議種別：口頭発表（一般）

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タマネギ根端を材料に用いた組織免疫染色による分裂細胞の3次元解析

長岐清孝, 山地直樹, 村田稔

バイオイメージング・インフォマティクス2012 2012年

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会議種別：ポスター発表

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動原体特異的ヒストンのネギ属染色体観察への利用〜新教材としての可能性〜

長岐清孝, 山本真紀, 向井康比己, 村田稔

日本遺伝学会第84回大会 2012年

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会議種別：口頭発表（一般）

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染色体観察のための組織免疫染色法の開発

長岐清孝, 山地直樹, 村田稔

染色体学会第63回年会 2012年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Variation and compatibility of CENH3 in plant species

Kiyotaka Nagaki

Japanese-German JSPS and DFG-funded workshop Frontiers of Plant Chromosome Research 2011年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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BAC sequencing revealed two centromeric retrotransposons in tobacco.

Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Go Suzuki, Asaka Kanatani, Souichi Ozaki, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

Joint International Symposium on Japanese Solanaceae/Cucurbitaceae Genomics Initiatives 2011年

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会議種別：ポスター発表

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免疫染色-FISH法によるタバコ核型分析と小型B染色体の発見

柴田洋, 横田悦子, 村田稔, 長岐清孝

日本遺伝学会第83回大会 2011年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Cre/LoxP組み換えによるシロイヌナズナ染色体の大規模再構成

村田稔, 柴田洋, 弘中明子, 柏原壱成, 長岐清孝

日本遺伝学会第83回大会 2011年

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会議種別：口頭発表（一般）

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タバコ動原体のモザイク構造

長岐清孝, 柴田洋, 村田稔

日本遺伝学会第83回大会 2011年

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シロイヌナズナ環状ミニ染色体の構造と安定性

横田悦子, 柴田洋, 長岐清孝, 村田稔

染色体学会第62回年会 2011年

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会議種別：口頭発表（一般）

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ネギ動原体特異的ヒストンH3と動原体DNAの単離

長岐清孝, 山本真紀, 向井康比己, 村田稔

染色体学会第62回年会 2011年

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会議種別：口頭発表（一般）

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抗体作成から免疫染色・クロマチン免疫沈降まで-抗体関連染色体研究a la carte-

長岐清孝

染色体学会第61会年会 2010年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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シロイヌナズナおよびタバコ培養細胞における異種CENH3の動原体局在

長岐清孝, 寺田香里, 脇本宗典, 柏原壱成, 鈴木剛, 村田稔

日本遺伝学会第82回大会 2010年

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会議種別：口頭発表（一般）

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シロイヌナズナに誘発された部分的ゲノム重複と遺伝子発現

村田稔, 横田悦子, 長岐清孝

日本遺伝学会第82回大会 2010年

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会議種別：口頭発表（一般）

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クロマチン修飾変化がイネ亜種間交配系統における減数分裂期組換えと分離ひずみに及ぼす影響の解析

土生芳樹, 安藤露, 伊藤幸恵, 長岐清孝, 田口文緒, 矢野昌裕

日本遺伝学会第82回大会 2010年

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会議種別：口頭発表（一般）

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タバコ動原体由来BACの塩基配列解析によるタバコ動原体特異的反復配列の同定

長岐清孝, 柴田洋, 鈴木剛, 村田稔

染色体学会第61回年会 2010年

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会議種別：口頭発表（一般）

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シロイヌナズナにおいて新規に見出された染色体構造変異とその伝達

横田悦子, 長岐清孝, 村田稔

染色体学会第61回年会 2010年

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会議種別：口頭発表（一般）

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タバコにおける動原体タンパク質MIS12ホモローグの解析

長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

第60回染色体学会 2009年

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会議種別：口頭発表（一般）

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クロマチン免疫沈降によるタバコ動原体DNA配列の単離

長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

日本遺伝学会第８１回大会 2009年

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会議種別：口頭発表（一般）

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CENH3による動原体のエピジェネティクス

長岐清孝, 柏原壱成, 脇本宗徳, 寺田香里, 横田悦子, 村田稔

日本遺伝学会第80回大会 2008年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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シロイヌナズナ環状ミニ染色体δ由来の極小染色体

横田悦子, 長岐清孝, 村田稔

日本遺伝学会第80回大会 2008年

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会議種別：口頭発表（一般）

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植物人工染色体の構築に向けて-動原体とミニクロモソーム-

長岐清孝

日本育種学会第114回講演会 2008年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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Visualization and detection of chromatin status by immunostaining and chromatin immunoprecipitation

Kiyotaka Nagaki

The 3rd Asian Chromosome Colloquium 2008年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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タバコにおける動原体タンパク質Cホモローグの解析

長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

第58回染色体学会・第17回染色体コロキウム2007年合同年会 2007年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Characterization of two centromere-specific histone H3 homologues from tobacco

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara

16th International Chromosome Conference 2007年

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会議種別：ポスター発表

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タバコ動原体特異的ヒストンＨ３の解析

長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

日本遺伝学会第79回大会 2007年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Identification and functional analysis of chromosomal passenger proteins in Arabidopsis thaliana

Mauren Jaudal, 長岐清孝, 村田稔

日本遺伝学会・第78回大会 2006年

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会議種別：口頭発表（一般）

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植物におけるセントロメアの機能解析

長岐清孝

染色体学会・染色体コロキウム合同シンポジウム 2006年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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Dynamic changes of centromere-specific histone H3 amount during mitosis in the holocentric plant Luzula nivea

Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

Plant& Animal Genome XIV 2006年

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会議種別：ポスター発表

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植物の動原体に局在するレトロトランスポゾン

長岐清孝

第２８回日本分子生物学会年会 2005年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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Sequencing of a native rice centromere reveals active genes

Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Steven Henikoff, Jiming Jiang

Plant & animal genome XIII 2005年

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会議種別：ポスター発表

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サトウキビにおける動原体特異的ヒストンの解析および動原体DNAの同定

日本育種学会・第１０７・１０８回講演会 2005年

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セントロメアのパラドックス

長岐清孝

第３４回生物進化・細胞遺伝談話会 2005年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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動原体特異的ヒストンH3を用いたルズラ分散型動原体の分子解析

長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

日本遺伝学会第７７回大会 2005年

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会議種別：口頭発表（一般）

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高等真核生物最後の秘境「動原体」の探検

長岐清孝

コムギ遺伝学シンポジウム・ムギ類分子生物学研究会ムギ類合同研究会 2004年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（公募）

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The functional components of rice centromeres

Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Steven Henikoff, Jiming Jiang

Plant and Animal Genome XII Conference 2004年

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会議種別：シンポジウム・ワークショップパネル（指名）

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The fine structure of maize centromeres

Weiwei Jin, Kiyotaka Nagaki, Jiming Jiang

Plant & Animal Genome XII Conference 2004年

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会議種別：ポスター発表

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イネ第8染色体動原体領域の塩基配列の決定とその領域における遺伝子発現とクロマチン状態の解析

第27回日本分子生物学会年会 2004年

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イネ第８染色体動原体領域の塩基配列の解析および機能領域の特定

長岐清孝, Zhukuan Cheng, Shu Ouyang, Paul B. Talber, Mary Kim, Kristine M. Jones, Steven Henikoff, C. Robin Buell, Jiming Jiang

日本遺伝学会第７６回大会 2004年

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会議種別：口頭発表（一般）

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Chromatin immunoprecipitation analysis of the centromeric repeats in Arabidopsis thaliana

Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Cathy Xiaoyan Zhong, R. Kelly Dawe, Steven Henikoff, Jiming Jiang

Plant and Animal Genome XI Conference 2003年

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会議種別：ポスター発表

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コムギのゲノム科学 VI TACゲノミックライブラリーを用いたパンコムギ遺伝子のスクリーニング

木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光, 荻原保成

第99回日本育種学会 2001年

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会議種別：口頭発表（一般）

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コムギのゲノム科学 V TACゲノミックライブラリーを用いたパンコムギ遺伝子のスクリーニング

荻原保成, 木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光

第23回日本分子生物学会 2000年

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ジュズダマ花粉の交雑によるコムギ半数体の作出

持田恵一、長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

第97回日本育種学会 2000年

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コムギのゲノム科学III. Transformation-competent artificial chromosome (TAC)ベクターを用いたパンコムギゲノミックライブラリーの構築と解析

長岐清孝, 劉耀光, 魚住政彦, 藤田雅子, 河浦香奈子, 荻原保成

第97回日本育種学会 2000年

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Construction of large insert genomic dna libraries of common wheat in a transformation-competent artificial chromosome (TAC) vector

Yasunari Ogihara, Yao Guang Liu, Kiyotaka Nagaki, Masako Fujita, Kanako Kawaura, Masahiko Uozumi

Plant & Animal Genome VIII Conference 2000年

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コムギ育種遺伝資源としての四倍性レイムス属の細胞遺伝学的多様性

岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第97回日本育種学会 2000年

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コムギ連植物におけるTaiI family反復配列のゲノム特異的配置：染色体末端または動原体への局在

岸井正浩、長岐清孝、辻本壽

第51回染色体学会 2000年

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コムギのゲノム科学 IV. ＴＡＣゲノミックライブラリーを用いたコムギ遺伝子のスクリーニング

荻原保成, 木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光

第72回日本遺伝学会 2000年

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コムギ初期胚におけるテクノビット樹脂包埋切片に対するゲノミックin situハイブリダイゼーション法の開発

持田恵一、長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

第51回染色体学会 2000年

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FISHを利用した植物の四分子分析の可能性

香川尚子, 長岐清孝, 辻本壽

第51回染色体学会 2000年

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Tetrad FISH分析によるライムギJNK反復配列の動原体からの距離の推定

香川尚子、長岐清孝、辻本壽

第72回日本遺伝学会 2000年

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パンコムギの動原体領域に局在する縦列型反復配列の解析

岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽

第72回日本遺伝学会 2000年

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Leymus racemosusおよびPsathyrostachys junceaにおけるAfaファミリー反復配列の解析

長岐清孝, 岸井正浩, 辻本壽, 笹隈哲夫

第71回日本遺伝学会 1999年

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Molecular evolution of a tandem repeat, Afa-family sequences, in Triticeae

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

International symposium of the third Yamazaki school "Mobile DNA, telomere and genome evolution" 1999年

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安定化したコムギ染色体切断点におけるテロメア配列の新規合成

辻本壽、宇佐美直也、長谷川恵子、山田豊美、長岐清孝、笹隈哲夫

第50回日本染色体学会 1999年

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オオハマニンニク（Leymus racemosus）の反復配列による添加パンコムギ系統の解析

岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第96回日本育種学会 1999年

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The JNK repeat family; a novel repetitive sequence located on an extra C-band region of the chromosome 2R of Japanese rye,

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

9th international wheat genetics symposium 1998年

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サトウキビ動原体に存在する縦列型反復配列

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第70回日本遺伝学会 1998年

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ライムギ2R染色体長腕特異的反復配列の解析

長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

第69回日本遺伝学会 1997年

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Molecular evolution of tandem repeat, Afa-family sequences, in Triticeae,

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, and Tetsuo Sasakuma.

International workshop on analysis and utility of plant chromosome information 1997年

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Molecular dynamics of a tandem repeated sequence family in wheat related species

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

International symposium plant molecular biology 1997年

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Molecular evolution of tandem repetitive Afa-family sequences in Triticeae, wheat-related species

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

International molecular evolution symposium ”JUNK DNA” 1997年

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Afa ファミリー配列の分子進化

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第68回日本遺伝学会 1996年

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オオムギ・コムギの反復配列の類似性

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第25回コムギ遺伝学シンポジウム 1996年

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Genome specific amplification of Afa-family sequence in Triticeae

Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

Japan-U.S.A. workshop on "Modification of gene expression and non-mendelian inheritance" 1995年

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コムギ D ゲノムの各染色体における Afa ファミリー反復配列の変異性

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第67回日本遺伝学会 1995年

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Discrimination of barley chromosomes by in situ hybridization using Afa-family repetitive sequences

Hisashi Tsujimoto, Kiyotaka Nagaki, Junzo Fujigaki, Tetsuo Sasakuma

12th International chromosome conference 1995年

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Afa ファミリー配列の構成から見た倍数性コムギの祖先種

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第87回日本育種学会 1995年

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ムギ連における反復配列の分布

笹隈哲夫, 根本泰江, 長岐清孝

第67回日本遺伝学会 1995年

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Afa family反復配列のin situ hybridizationによる全オオムギ染色体の識別

辻本壽、長岐清孝

第45回染色体学会 1994年

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ムギ連植物におけるpAs1およびその類似配列の分子構造の解析

長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

第66回日本遺伝学会 1994年

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Works（作品等）

ゲノム編集を用いた半数体作出法の開発

2015年

-

2018年

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動原体機能低下系統を利用した半数体育種法の確立

2011年

-

2014年

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マメ科植物の動原体構成要素の同定

2008年

-

2010年

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タバコ動原体DNA配列の解析および人工染色体形成能の比較

2008年

-

2009年

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分散型動原体形成機構の解明

2008年

-

2009年

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タバコにおける動原体複合体構成要素の解析および人工染色体の構築

2006年

-

2008年

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植物における染色体機能要素の分子的解析と人工染色体の構築

2000年

-

2005年

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植物の倍数体におけるゲノム間相互作用の統合的理解

2000年

-

2001年

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ヘテロクロマチン領域形成に関わるDNA配列の解析

1999年

-

2001年

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受賞

日本遺伝学会奨励賞

2009年

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受賞国：日本国

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染色体学会賞

2008年

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受賞国：日本国

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遺伝学会Best paper賞

2004年

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受賞国：日本国

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共同研究・競争的資金等の研究

半数体育種を加速する培養適性の遺伝要因の解明と効率的半数体誘導株の創出

研究課題/領域番号：22H02313 2022年04月 - 2025年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

久野裕, 長岐清孝

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配分額：17680000円（直接経費：13600000円、間接経費：4080000円）

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植物組織内位置情報を伴う１細胞レベルの核内クロマチン構造大量解析系の開発

研究課題/領域番号：22K06333 2022年04月 - 2025年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)

長岐清孝

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配分額：4290000円（直接経費：3300000円、間接経費：990000円）

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イネ小胞子に潜在する個体分化能と倍数化能を活用した育種基盤の新構築

研究課題/領域番号：19H00937 2019年04月 - 2023年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A)

貴島祐治, 山本敏央, 長岐清孝, 小出陽平, 金鍾明

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配分額：45890000円（直接経費：35300000円、間接経費：10590000円）

本研究は、１）小胞子から個体分化を誘導するメカニズム、２）イネ小胞子から効率的に個体を再生するシステムの構築、３）イネ種間雑種の葯培養個体で誘導される倍数性の発生メカニズムの解明、４）イネ種間雑種の葯培養個体によって雑種不稔性を回避する遺伝機構の解析、５）葯培養個体から生じた倍数体種間雑種による新しい育種材料の開発、の5つの問題から構成されている。2020年度は主に２）と４）について進展があった。２）について本研究では、葯から抽出した小胞子を直接培養することによって効率的に植物体再生を行うことが可能かどうかをキタアケを用いて行った。培地を検討するため、葯より抽出した小胞子に対してN6液体培地とすべての成分を10倍希釈した1/10 N6液体培地を用いて培養を行った。興味深いことに希釈培地でもカルス形成が確認された。誘導されたカルスに対して再分化処理を行い、1/10 N6液体培地に由来するカルスにおいても植物体が再生された。カルス形成率に着目すると培地の濃度によるカルス形成率への影響はなかった。しかし、培養過程にある小胞子生存率は1/10 N6培地中で大きく低下することが確認された。このことから、希釈培地では、カルス形成に関与しない小胞子が死滅したことが考えられる。両培地において葯に由来するカルスは、360葯から280個以上誘導された。これらカルスの再分化実験では、1/10 N6培地に由来するカルスは、N6液体培地に由来するカルスの再分化率を大きく上回った（1/10 N6液体培地:21%、N6液体培地12%）。さらに再分化後の馴化段階での枯死率も1/10 N6培地に由来の個体が低く安定的だった（1/10N6液体培地: 6%、 N6液体培地:22%）。したがって、カルス誘導培地の違いにより、再分化の効率が異なることが示された。

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植物のDNA倍加誘導におけるエピジェネティック制御メカニズムの解明

研究課題/領域番号：17K15415 2017年04月 - 2019年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

高塚大知, 梅田正明, 長岐清孝

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配分額：4290000円（直接経費：3300000円、間接経費：990000円）

研究代表者は、G2期にクロマチン緩和することが「有糸分裂」から「DNA倍加」への移行に必須であることを見出している。本研究で、研究代表者は、G2期進行の中心的因子であるCDKB1がヘテロクロマチンを凝縮する働きを持つことを見出した。更に、CDKB1に制御され、ヘテロクロマチン化を促進する因子の同定を進めた結果、当初予想していたATXR6でなく、CAF-1複合体の構成因子であるFAS1とFAS2がCDKB1によってリン酸化されることを見出した。これらの結果より、CDKB1-CAF-1経路が存在し、ヘテロクロマチン化を促進することで分裂からDNA倍加への移行を阻害する可能性が示唆された。

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植物のエピジェネティクス：遺伝子発現制御と経世代伝達の分子機構

研究課題/領域番号：15K07118 2015年10月 - 2019年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(Ｃ)

星野敦, 榊原康文, 長岐清孝, 森田裕将, 仁田坂英二, 伊藤多世, 中村涼子, 竹内友世

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配分額：4680000円（直接経費：3600000円、間接経費：1080000円）

花の模様は、花の色を決める遺伝子のはたらきが花弁の一部で抑制されることにより現れることがある。この抑制にかかわる仕組みの１つに「エピジェネティクス」がある。ソライロアサガオの刷毛目絞（はけめしぼり）という模様をつくり出す遺伝子のエピジェネティックな抑制は、DNAのメチル化によるDNAとタンパク質の結合阻害が実体であった。さらにDNAのメチル化は、アサガオの刷毛目絞が世代を超えて遺伝することにも関わることが示唆された。

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マメ科植物の動原体構成要素の同定

研究課題/領域番号：08F08113 2008年 - 2009年

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費

長岐清孝, TEK A.L., TEK A. L.

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配分額：1600000円（直接経費：1600000円）

本研究では、「人工染色体構築のためのマメ科植物動原体DNAおよびタンパク質の同定」を目的としている。マメ科植物人工染色体は、マメ科植物の育種のための有用なツールとなる。これまでの他の植物での解析結果から、動原体領域は種特異的な反復配列で構成されていることがわかっている。このため、マメ科人工染色体を作るためには、マメ科植物の動原体DNA配列の情報が不可欠である。しかし、これまでにマメ科植物の動原体DNA配列に関する研究はまったく行われていなかったので、本研究でマメ科植物の動原体構成要素の同定を計画した。
本年度は、昨年度に作成した抗ダイズCENH3(GmCENH3)抗体を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP)によりダイズの動原体DNA配列を単離した。この研究により、2種類の縦列型反復配列(GmCent-1およびGmCent-4)と1種類のレトロトランスポゾン(GmCR)がダイズ動原体DNA配列であることがわかった。これらのDNA配列は、ダイズ人工染色体を造るための有用な材料となる。この結果を論文にまとめ、Chromosome researchに受理された。
続いて、この抗GmCRNH3抗体がゲンゲのCENH3を認識することを染色体に対する免疫染色法により新たに発見し、この抗体を用いたChIPによりゲンゲ動原体DNA配列を単離した。現在、これらの配列を解析するとともに、論文を準備中である。

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Analyses of kinetochore/centromere in plants

2001年

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資金種別：競争的資金

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担当授業科目

分子から生命体へ（2024年度）第３学期 - 金5～6
分子細胞遺伝解析学（2024年度）後期 - その他
特別研究（2024年度）その他 - その他
統合ゲノム育種学（2024年度）後期 - 木5～8
統合ゲノム育種学演習（2024年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2024年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学特別演習（2024年度）通年 - その他
資源植物学ラボマニュアル（2024年度）前期 - 火5～8
分子細胞遺伝解析学（2023年度）後期 - その他
分子細胞遺伝解析学（2023年度）後期 - その他
植物分子細胞遺伝学（2023年度）後期 - 木5～8
特別研究（2023年度）その他 - その他
生物資源科学特別研究（2023年度）通年 - その他
統合ゲノム育種学（2023年度）後期 - 木5～8
統合ゲノム育種学演習（2023年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2023年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2023年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2023年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2023年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2023年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学特別演習（2023年度）通年 - その他
資源植物学ラボマニュアル（2023年度）前期 - 火5～8
資源植物学ラボマニュアル（2023年度）前期 - 火5～8
分子細胞遺伝解析学（2022年度）後期 - その他
植物分子細胞遺伝学（2022年度）後期 - 木5～8
生物資源科学特別研究（2022年度）通年 - その他
統合ゲノム育種学演習（2022年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2022年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2022年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2022年度）前期 - その他
資源植物学ラボマニュアル（2022年度）前期 - 火5～8
分子細胞遺伝解析学（2021年度）後期 - その他
植物分子細胞遺伝学（2021年度）後期 - 木5～8
生物資源科学特別研究（2021年度）通年 - その他
統合ゲノム育種学演習（2021年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2021年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2021年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2021年度）前期 - その他
資源植物学ラボマニュアル（2021年度）前期 - 火5～8
分子細胞遺伝解析学（2020年度）後期 - その他
植物分子細胞遺伝学（2020年度）後期 - その他
生物資源科学特別研究（2020年度）通年 - その他
細胞核機能解析学演習（2020年度）前期 - その他
細胞核機能解析学演習（2020年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2020年度）前期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2020年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2020年度）後期 - その他
統合ゲノム育種学演習（2020年度）前期 - その他
資源植物学ラボマニュアル（2020年度）前期 - その他

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