Updated on 2025/08/23

写真a

 
NAGAKI Kiyotaka
 
Organization
Scheduled update Associate Professor
Position
Associate Professor
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Degree

  • 博士(理学) ( 横浜市立大学 )

Research Interests

  • Chromosome

  • repetitive DNA sequences

  • epigenetics

  • centromere

  • heterochromatin

  • 動原体

  • ヘテロクロマチン

  • 染色体

  • エピジェネティクス

  • 反復配列

  • セントロメア

Research Areas

  • Life Science / Genetics

Professional Memberships

Committee Memberships

  • 日本遺伝学会   評議員  

    2023 - 2024   

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    Committee type:Academic society

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  • 日本遺伝学会   評議員  

    2017 - 2020   

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    Committee type:Academic society

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  • 財団法人染色体学会   理事  

    2016   

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    Committee type:Academic society

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  • 染色体学会   評議員  

    2007 - 2016   

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    Committee type:Academic society

    染色体学会

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Papers

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Books

  • Plant cytogenetics and cytogenomics : methods and protocols

    Heitkam, Tony, García, Sonia (Editor of Plant cytogenetics and cytogenomics)

    Humana Press  2023  ( ISBN:9781071632253

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    Total pages:xviii, 568 p.   Language:English

    CiNii Books

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  • Cytogenomics

    ( Role: Joint author)

    Elsevier  2021.5 

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  • Essential Genetics and Genomics 7th Eddition

    ( Role: Joint translator)

    2021.1 

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  • Chromosome and genomic engineering in plants, Methods in Molecular Biology

    Humana Press  2016 

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  • はじめての染色体-植物染色体写真集&実験マニュアル-

    Apple  2014 

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  • The First Chromosomes

    Apple  2012 

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  • Centromere, Progress in Molecular and Subcellular Biology 48.

    Springer-Verlag Berlin Heidelbarg  2009 

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  • 細胞工学別冊・植物細胞工学シリーズ24、植物のエピジェネティクス

    秀潤社  2008 

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MISC

  • Molecular identification of Alpinia species native to the Nansei Islands

    Narusaka Mari, Nagaki Kiyotaka, Sekine Ken-Taro, Narusaka Yoshihiro

    ( 71 )   35 - 38   2024.12

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    Language:English  

    Alpinia zerumbet and its related taxa (Zingiberaceae), such as Alpinia formosana, Alpinia intermedia, Alpinia uraiensis, and Alpinia sp., are native to the subtropical and tropical regions in East Asia, including the Nansei Islands. Owing to their morphological similarities, it is difficult to distinguish A. zerumbet from the related taxa. Therefore, a reliable DNA characterization method is required for the breeding and utilization of A. zerumbet and related taxa. Herein, several analytical methodologies have been proposed for the identification of Alpinia species. We showed that a set of random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, high-resolution melting (HRM) analysis, and genotyping by random amplicon sequencing-direct (GRAS-Di) are important tools for understanding the genetic diversity and variation of the Alpinia species growing in the Nansei Islands. The RAPD markers effectively distinguished A. zerumbet from the related taxa. Furthermore, the HRM analysis of nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer 1 revealed clear differences between the species. The phylogenetic analysis using GRAS-Di revealed that each Alpinia species formed independent species-specific subclusters on the phylogenetic tree. Using the molecular markers presented in this study, A. zerumbet and related taxa can be easily and accurately distinguished from each other without morphological characterisation.

    DOI: 10.24564/0002021292

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  • 細胞遺伝学の新潮流-より速く、より広く、より細かく、そして創出へ、古くて新しいゲノムの見える化技術 Invited

    石井孝佳, 長岐清孝, 菊池真司

    化学と生物   ( 58 )   606 - 613   2020.11

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    Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (scientific journal)  

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  • 植物透明化によるエピジェネティック修飾の解析 Invited

    長岐清孝

    月刊バイオインダストリー   ( 7 )   1 - 8   2017.7

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    Authorship:Lead author, Corresponding author   Language:Japanese   Publishing type:Article, review, commentary, editorial, etc. (trade magazine, newspaper, online media)  

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  • Research on post-fertilization barriers in the context of plant breeding

    19 ( 1 )   35 - 40   2017.3

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  • Transmission control of plant artificial ring chromosome in Arabidopsis thaliana

    Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   91 ( 6 )   342 - 342   2016.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • コムギ花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御に及ぼすミトコンドリアゲノムの効果

    村井耕二, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th   2016

  • Attempts to generate artificial ring chromosomes in rice

    Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   90 ( 6 )   402 - 402   2015.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes -from micro to macro-

    Kiyotaka Nagaki, Naoki Yamaji, Keisuke Tanaka, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   90 ( 6 )   374 - 374   2015.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Development of a novel method for identifying centromeric DNA sequences

    Kiyotaka Nagaki, Keisuke Tanaka, Ryo Matsushima, Hisato Kobayashi, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   89 ( 6 )   304 - 304   2014.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Generation of a stable 1-Mb-sized artificial ring chromosome in Arabidopsis

    Minoru Murata, Asaka Kanatani, Kazunari Kashihara, Akiko Hironaka, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   89 ( 6 )   304 - 304   2014.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Analyses of kinetochore components of legume species

    Ahmet Latif Tek, Kazunari Kashihara, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   88 ( 6 )   388 - 388   2013.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Stability of artificial ring chromosomes in Arabidopsis thaliana

    Fukashi Shibata, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   88 ( 6 )   388 - 388   2013.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Utilization of centromeric histone H3 for chromosome observation in Allium species

    Kiyotaka Nagaki, Maki Yamamoto, Yasuhiko Mukai, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   87 ( 6 )   409 - 409   2012.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Induction of chromosomal rearrangements and genome stability in Arabidopsis

    Minoru Murata, Fukashi Shibata, Satoru Fujimoto, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   87 ( 6 )   394 - 394   2012.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Mega-base scale chromosomal rearrangements induced by Cre/LoxP-mediated recombinations in Arabidopsis

    Minoru Murata, Fukashi Shibata, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   86 ( 6 )   434 - 434   2011.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Karyotyping of tobacco by immnunolabeling and FISH, and a discovery of mini B-chromosome

    Fukashi Shibata, Etsuko Yokota, Minoru Murata, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   86 ( 6 )   434 - 434   2011.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • A mosaic structure of centromeric DNA in tobacco

    Kiyotaka Nagaki, Fukasi Shibata, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   86 ( 6 )   434 - 434   2011.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Gene expression on induced partial genome duplications in Arabidopsis thaliana

    Minoru Murata, Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki

    GENES & GENETIC SYSTEMS   85 ( 6 )   418 - 418   2010.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Evolutionally close alien CENH3s are able to target centromeres in Arabidopsis and tobacco cells

    Kiyotaka Nagaki, Kaori Terada, Munenori Wakimoto, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   85 ( 6 )   418 - 418   2010.12

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    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Chromatin modification controls segregation distortion

    Yoshiki Habu, Tsuyu Ando, Sachie Ito, Kiyotaka Nagaki, Fumio Taguchi-Shiobara, Masahiro Yano

    GENES & GENETIC SYSTEMS   85 ( 6 )   417 - 417   2010.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Isolation of a tobacco centromeric DNA sequence using chromatin immunoprecipitation

    Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Go Suzuki, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   84 ( 6 )   472 - 472   2009.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • 人工染色体--植物の染色体を作る--人工染色体研究の最前線—特集1 植物染色体の最前線

    村田 稔, 長岐 清孝

    遺伝 : 生物の科学   63 ( 3 )   61 - 65   2009.5

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    Language:Japanese   Publisher:東京 : エヌ・ティー・エス  

    CiNii Article

    CiNii Books

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    Other Link: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I10239264

  • Structure and evolution of plant centromeres.

    Kiyotaka Nagaki, Jason Walling, Cory Hirsch, Jiming Jiang, Minoru Murata

    Progress in molecular and subcellular biology   48   153 - 179   2009

     More details

    Language:English   Publishing type:Book review, literature introduction, etc.  

    DOI: 10.1007/978-3-642-00182-6_6

    Scopus

    PubMed

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  • A microchromosome derived from the mini ring chromosome delta in Arabidopsis thaliana

    Etsuko Yokota, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   83 ( 6 )   511 - 511   2008.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Epigenetics in centromeres

    Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Munenori Wakimoto, Kaori Terada, Etsuko Yokota, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   83 ( 6 )   534 - 534   2008.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • Analysis of centromere-specific histone H3 homologues from tobacco

    Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   82 ( 6 )   559 - 559   2007.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • O-25. Analysis of CENP-C homologue from tobacco(Abstracts for the oral and the poster presentations,Abstracts of the Joint Meeting: the 58th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research and the 17th Annual Meeting of the Chromosome Colloquium) :

    NAGAKI Kiyotaka, KASHIHARA Kazunari, MURATA Minoru

    Chromosome science   10 ( 4 )   120 - 120   2007

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

    CiNii Books

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00107766/

  • Identification and functional analysis of chromosomal passenger proteins in Arabidopsis thaliana

    Mauren Jaudal, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

    GENES & GENETIC SYSTEMS   81 ( 6 )   431 - 431   2006.12

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

    Web of Science

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  • The rice centromere 8 contains active genes

    NAGAKI Kiyotaka, CHENG Zhukuan, OUYANG Shu, TALBERT Paul B., KIM Mary, M. JONES Kristine, HENIKOFF Steven, BUELL C. Robin, JIANG Jiming

    79 ( 5 )   I   2004.10

     More details

  • Cathy Xiaoyan Zhong, Joshua B. Marshall, Christopher Topp, Rebecca Mroczek, Akio Kato, *Kiyotaka Nagaki, James A. Birchler, Jiming Jiang, and R. Kelly Dawe

    Naoko Kagawa, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

    Molecular Genetics Genomics   267   10 - 15   2002

     More details

    Language:English  

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  • O-02. Construction of a transformation-competent artificial chromosome (TAC) library for lettuce molecular cytogenetics research(Abstracts of the oral and poster presentations)(The 53rd Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

    MATOBA Hideyuki, UCHIYAMA Hiroshi, KOYAMA Tetsuo, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi, SASAKUMA Tetsuo

    Chromosome science   6 ( 4 )   110 - 110   2002

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

    CiNii Books

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00107256/

  • Naoko Kagawa, *Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

    Masahiro Kishii, Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto

    Chromosome Research   9   417 - 428   2001

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  • Production of wheat haploids by pollination of Job's tears (Coix lachrima-jobi L.)

    MOCHIDA K, NAGAKI K, TSUJIMOTO H, SASAKUMA T

    育種学研究 = Breeding research   2 ( 1 )   142 - 142   2000.4

     More details

  • Cytogenetic variation of tetraploid Leymus species for genetic resource of wheat

    KISHII M, NAGAKI K, TSUJIMOTO H, SASAKUMA T

    育種学研究 = Breeding research   2 ( 1 )   263 - 263   2000.4

     More details

  • Construction and characterization of genomic library from common wheat with the transformation-competent artificial chromosome (TAC) vector.

    NAGAKI K., LIU Y. G., UOZUMI M., FUJITA M., KAWAURA K., OGIHARA Y.

    2 ( 1 )   26   2000.4

     More details

  • Genome-specific arrangement of Tail-family sequence in Triticeae : localization in either subtelomeric or centromeric region :

    KISHII Masahiro, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi

    Chromosome science   4 ( 4 )   131 - 131   2000

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00107088/

  • Characterization of centromeric regirons of comnron wheat :

    Nagaki Kiyotaka, Kishii Masahiro, Tsujimoto Hisashi

    Chromosome science   4 ( 4 )   124 - 124   2000

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00107075/

  • Development of genomic in situ hybridization method to Technovit 7100 sections of wheat early embryo :

    MOCHIDA Keiichi, NAGAKI Kiyotaka, TSUJIMOTO Hisashi, SASAKUMA Tetsuo

    Chromosome science   4 ( 4 )   131 - 131   2000

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

    CiNii Books

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00107089/

  • Analysis on wheat-Leymus racemosus addition lines by tandem repetitive sequences.

    岸井正浩, 長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    育種学研究   1   1999

  • Leymus racemosusおよびPsathyrostachys junceaにおけるAfaファミリー反復配列の解析

    長岐清孝, 岸井正浩, 辻本寿, 笹隈哲夫

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   71st   1999

  • 1. De novo initiation of telomere sequences at the healed break points of wheat deletion chromosomes(Abstracts of the 50th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

    TSUJIMOTO Hisashi, USAMI N., HASEGAWA K., YAMADA T., NAGAKI K., SASAKUMA T.

    Chromosome science   3 ( 3 )   140 - 140   1999

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00106991/

  • The JNK repeat family: A novel repetitive sequence located on an extra C-band region of the chromosome 2R of Japanese rye

    Nagaki K, Tsujimoto H, Sasakuma T

    Proc. 9 Int. Wheat Genet   2   98 - 100   1998

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Tandem type repetition arrangement existing in the sugar cane centromere.

    長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   70th   1998

  • Analysis of rye 2R chromosome long arm peculiar repeat sequence.

    長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   69th   1997

  • Repetitive DNA sequences locating on the polymorphic C-band region found in a novel chromosome of rye, Secale cereale(Abstracts of the 48th Annual Meeting of the Society of Chromosome Research) :

    TSUJIMOTO Hisashi, NAGAKI Kiyotaka, SASAKUMA Tetsuo

    Chromosome science   1 ( 2 )   156 - 156   1997

     More details

    Language:English   Publisher:Society of Chromosome Research  

    CiNii Article

    CiNii Books

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    Other Link: http://id.nii.ac.jp/1141/00106788/

  • Molecular evolution of Afa family repeat sequence at the wheat run.

    長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   68th   1996

  • VARIABILITY OF AFA-FAMILY SEQUENCES IN DGENOME CHROMOSOMES OF COMMON WHEAT

    NAGAKI K., TSUJIMOTO H., SASAKUMA T.

    70 ( 6 )   717 - 717   1995.12

     More details

  • Genome specific amplification of Afa-family sequence in Triticeae

    Nagaki K, Tsujimoto H, Sasakuma T

    Proc. US-Jpn joint meeting, Modification of gene expression and non-Mendelian inheritance   449 - 454   1995

     More details

    Language:English   Publishing type:Research paper, summary (international conference)  

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  • Identification of progenitor genomes for polyploid species in Triticeae revealed from PCR analysis with Afa-family sequences.

    長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    育種学雑誌   45   1995

  • Variability of Afa family repeated sequence in the wheat D genome in each chromosome.

    長岐清孝, 辻本寿, 笹隈哲夫

    日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   67th   1995

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Presentations

  • 植物染色体の E pur si muove! 〜それでも、それは、動く〜

    長岐清孝

    日本遺伝学会第96回大会  2024 

     More details

    Presentation type:Public lecture, seminar, tutorial, course, or other speech  

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  • 植物の「そぞろ歩くセントロメア」

    長岐清孝

    日本進化学会第26回大会  2024 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • ネギ属植物種のパンセントロメア解析によって明らかになったタマネギの散策するセントロメア

    長岐清孝, 牛島幸一郎, 赤木剛士, 田中啓介, 小林久人

    日本遺伝学会第96回大会  2024 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • ネギ属植物種のパンセントロメア解析によって明らかになったセントロメアサイズの多様性

    長岐清孝, 牛島幸一郎, 赤木剛士, 田中啓介, 小林久人

    染色体学会第75回年会  2024 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • エピジェネティックに徘徊、逃避するセントロメア

    長岐清孝

    第65回日本生化学会中国四国支部例会  2024 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • 月桃由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物ウイルス剤の開発研究

    鳴坂義弘, 関根健太郎, 長岐清孝, 鳴坂真理

    第46回日本分子生物学会年会  2023 

     More details

  • ゲットウ由来プロアントシアニジンを利用した新規抗植物ウイルス剤の開発研究

    鳴坂真理, 関根健太郎, 畑中唯史, 長岐清孝, 鳴坂義弘

    令和5年度日本植物病理学会大会  2023 

     More details

  • ショウガセントロメア領域の解析

    長岐清孝, 田中啓介, 赤木剛士, 杉山立志, 和久井健司

    日本遺伝学会第95回大会  2023 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 南西諸島に自生するAlpinia属植物のセントロメアDNA配列の解析

    長岐清孝, 鳴坂真理, 鳴坂義弘

    染色体学会第74回年会  2023 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 南西諸島に自生するAlpinia属植物の核型解析

    長岐清孝, 鳴坂真理, 鳴坂義弘

    染色体学会第73回年会  2022 

     More details

  • 新たな農資源ゲットウを利用した新規抗ウイルス剤の開発研究

    鳴坂真理, 畑中唯史, 長岐清孝, 鳴坂義弘

    令和4年度日本植物病理学会大会  2022 

     More details

  • 「Macで機械学習」のススメ -やすいぞ、はやいぞ、うまいぞ!-

    長岐清孝

    染色体学会第72回年会  2021 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • AI による染色体解析 -染色体にも Society 5.0?-

    長岐清孝

    染色体学会第72回年会  2021 

     More details

    Presentation type:Public lecture, seminar, tutorial, course, or other speech  

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  • Characterization of the centromere-specific histone H3 (CENH3) in oil palms.

    Minoru Murata, Narayanasamy A/L Dhanendiren, Ling Hann Wong, Kiyotaka Nagaki

    日本遺伝学会第92回大会  2020 

     More details

  • RepeatExplorerを利用したコムギ2倍体野生種の反復配列の解析

    田中紗弥夏, 吉田健太郎, 長岐清孝, 宅見薫雄

    日本育種学会第137回講演会  2020 

     More details

  • In-house機械学習した人工知能(AI)による染色体画像解析の半自動化

    長岐清孝, 山地直樹

    日本遺伝学会第92回大会  2020 

     More details

  • RGEN-ISL (RNA-guided endonuclease - in situ labelling)を用いた標的DNA配列の可視化による植物組織内動原体解析

    長岐清孝, 山地直樹

    2019 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Production and phenotypic analysis of synthetic allohexaploid lines having durum wheat and wild diploid relative genomes.

    Shigeo Takumi, Asami Michikawa, Miki Yuka, Sayaka Tanaka, Moeko Okada, Kiyotaka Nagaki, Kazuhiro Sato, Tatsuya Ikeda, Kentaro Yoshida, Yoshihiro Matsuoka

    1st International Wheat Congress  2019 

     More details

  • RGEN-ISL (RNA-guided endonuclease - in situ labelling)を用いた標的DNA配列の植物組織内可視化とエピジェネティック修飾の同時検出

    長岐清孝, 山地直樹

    日本遺伝学会第91回大会  2019 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Identification of genes on the midget chromosome in a common wheat with rye cytoplasm.

    Minoru Murata, Kazunari Kashihara, Asaka Kanatani, Kiyotaka Nagaki, Takashi Endo, Kazuhiro Sato

    13th International Wheat Genetics Symposium  2017 

     More details

    Language:English   Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 6倍性コムギにおける花器官形成クラスB MADS-box遺伝子の同祖遺伝子特異的エピジェネティック制御

    村井耕二、梅北耕典、桑原 翼、田中美久、長岐清孝、村田 稔

    第57回日本植物生理学会年会  2016 

     More details

  • 花成遅延を誘発する細胞質置換パンコムギ系統および正常細胞質系統おけるVRN1同祖遺伝子のヒストンメチル化修飾パターン変異

    梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

    一般社団法人日本育種学会 第129回講演会  2016 

     More details

  • パンコムギにおける花器官形成クラス B MADS-box 遺伝子の同祖遺伝子内発現変異はエピジェネティック制御による

    桑原 翼, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

    一般社団法人日本育種学会 第130回講演会  2016 

     More details

  • パンコムギにおける花器官形成クラス B MADS-box 遺伝子の同祖遺伝子内発現変異とヒストンのメチル化パターン

    桑原 翼、田中 美久、梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

    一般社団法人日本育種学会 第129回講演会  2016 

     More details

  • パンコムギにおけるtrithorax-group遺伝子の同定と発現解析

    梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

    一般社団法人日本育種学会 第130回講演会  2016 

     More details

  • 倍数性コムギにおける花器官形成MADSボックス遺伝子のエピジェネティック制御

    梅北耕典, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

    第8回中国地域育種談話会・第11回ムギ類研究会(共催)  2016 

     More details

  • 花成促進遺伝子VRN1のエピジェネティック制御機構の解明

    桑原 翼、梅北耕典、長岐清孝、村田稔、村井耕二

    第8回中国地域育種談話会・第11回ムギ類研究会(共催)  2016 

     More details

  • 動原体改変による半数体作出

    長岐清孝

    一般社団法人日本育種学会 第130回講演会  2016 

     More details

  • 6倍性コムギにおける花器官形成クラスB MADS-box遺伝子の同祖遺伝子特異的エピジェネティック制御

    村井耕二, 梅北耕典, 長岐清孝, 村田 稔

    第39回日本分子生物学会年会  2016 

     More details

  • Analysis of epigenetic marks on plant chromosomes -from micro to macro-

    長岐清孝, 山地直樹, 田中啓介, 小林久人, 村田稔

    日本遺伝学会第87回大会  2015 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • Chromosome instability in the resynthesized Brassica napus.

    Nobuko Ohmido, Kanako Ueda, Kouei Fujii, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata

    The 5th Asian Chromosome Colloquium  2015 

     More details

  • Genome organization and chromosome dynamics in an Allium hybrid.

    Maki Yamamoto, Kiyotaka Nagaki, Minoru Murata, Yasuhiko Mukai

    The 5th Asian Chromosome Colloquium  2015 

     More details

  • An epigenetic mutation responsible for flower variegation in Japanese morning glory.

    Atsushi Hoshino, Yasumasa Morita, Kiyotaka Nagaki

    International Symposium "Establishing Next-Generation Genetics"  2015 

     More details

  • 花成遅延を誘発する細胞質置換コムキ系統におけるVRN1遺伝子のヒストンのメチル化解析

    梅北耕典, 成田華乃, 長岐清孝, 村田稔, 村井耕二

    日本育種学会第128回大会  2015 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • イネにおける人工環状染色体作出の試み

    村田稔, 金谷麻加, 柏原壱成, 長岐清孝

    日本遺伝学会第87回大会  2015 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • アブラナ科種間雑種における染色体不安定性

    近江戸伸子, 上田加奈子, 藤井宏栄, 長岐清孝, 村田稔

    染色体学会第65回年会  2014 

     More details

  • クロマチン免疫沈降を必要としない動原体DNA配列推定法の開発

    長岐清孝, 田中啓介, 松島良, 小林久人, 村田稔

    日本遺伝学会第86回大会  2014 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • シロイヌナズナの1 Mbサイズ人工環状染色体の作出と安定性

    村田稔, 金谷麻加, 柏原壱成, 長岐清孝

    日本遺伝学会第86回大会  2014 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • マメ科植物の動原体構成要素の解析

    Ahmet Latif Tek, 柏原壱成, 村田稔, 長岐清孝

    日本遺伝学会第85回大会  2013 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • シロイヌナズナにおけるミニ染色体への遺伝子導入

    村田稔, 横田悦子, 柴田洋, 金谷麻加, 藤本聡, 柏原壱成, 長岐清孝

    財団法人染色体学会第64回大会  2013 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • タバコ混数性における細胞分裂時の動原体と紡錘糸の挙動

    三島阿佐子, 鈴木剛, 長岐清孝, 村田稔, 向井康比己

    財団法人染色体学会第64回大会  2013 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • シロイヌナズナ環状人工染色体の安定性

    柴田洋, 長岐清孝, 村田稔

    日本遺伝学会第85回大会  2013 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 植物環状人工染色体の作出とその簡略化

    村田稔, 金谷麻加, 柴田洋, 長岐清孝

    日本育種学会第124回大会  2013 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • タマネギ根端を材料に用いた組織免疫染色による分裂細胞の3次元解析

    長岐清孝, 山地直樹, 村田稔

    バイオイメージング・インフォマティクス2012  2012 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • 動原体特異的ヒストンのネギ属染色体観察への利用〜新教材としての可能性〜

    長岐清孝, 山本真紀, 向井康比己, 村田稔

    日本遺伝学会第84回大会  2012 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 染色体観察のための組織免疫染色法の開発

    長岐清孝, 山地直樹, 村田稔

    染色体学会第63回年会  2012 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Variation and compatibility of CENH3 in plant species

    Kiyotaka Nagaki

    2011 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • BAC sequencing revealed two centromeric retrotransposons in tobacco.

    Kiyotaka Nagaki, Fukashi Shibata, Go Suzuki, Asaka Kanatani, Souichi Ozaki, Akiko Hironaka, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

    Joint International Symposium on Japanese Solanaceae/Cucurbitaceae Genomics Initiatives  2011 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • 免疫染色-FISH法によるタバコ核型分析と小型B染色体の発見

    柴田洋, 横田悦子, 村田稔, 長岐清孝

    日本遺伝学会第83回大会  2011 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Cre/LoxP組み換えによるシロイヌナズナ染色体の大規模再構成

    村田稔, 柴田洋, 弘中明子, 柏原壱成, 長岐清孝

    日本遺伝学会第83回大会  2011 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • タバコ動原体のモザイク構造

    長岐清孝, 柴田洋, 村田稔

    日本遺伝学会第83回大会  2011 

     More details

  • シロイヌナズナ環状ミニ染色体の構造と安定性

    横田悦子, 柴田洋, 長岐清孝, 村田稔

    染色体学会第62回年会  2011 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • ネギ動原体特異的ヒストンH3と動原体DNAの単離

    長岐清孝, 山本真紀, 向井康比己, 村田稔

    染色体学会第62回年会  2011 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 抗体作成から免疫染色・クロマチン免疫沈降まで-抗体関連染色体研究a la carte-

    長岐清孝

    染色体学会第61会年会  2010 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • シロイヌナズナおよびタバコ培養細胞における異種CENH3の動原体局在

    長岐清孝, 寺田香里, 脇本宗典, 柏原壱成, 鈴木剛, 村田稔

    日本遺伝学会第82回大会  2010 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • シロイヌナズナに誘発された部分的ゲノム重複と遺伝子発現

    村田稔, 横田悦子, 長岐清孝

    日本遺伝学会第82回大会  2010 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • クロマチン修飾変化がイネ亜種間交配系統における減数分裂期組換えと分離ひずみに及ぼす影響の解析

    土生芳樹, 安藤露, 伊藤幸恵, 長岐清孝, 田口文緒, 矢野昌裕

    日本遺伝学会第82回大会  2010 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • タバコ動原体由来BACの塩基配列解析によるタバコ動原体特異的反復配列の同定

    長岐清孝, 柴田洋, 鈴木剛, 村田稔

    染色体学会第61回年会  2010 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • シロイヌナズナにおいて新規に見出された染色体構造変異とその伝達

    横田悦子, 長岐清孝, 村田稔

    染色体学会第61回年会  2010 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • タバコにおける動原体タンパク質MIS12ホモローグの解析

    長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

    第60回染色体学会  2009 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • クロマチン免疫沈降によるタバコ動原体DNA配列の単離

    長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

    日本遺伝学会第81回大会  2009 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • CENH3による動原体のエピジェネティクス

    長岐清孝, 柏原壱成, 脇本宗徳, 寺田香里, 横田悦子, 村田稔

    日本遺伝学会第80回大会  2008 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • シロイヌナズナ環状ミニ染色体δ由来の極小染色体

    横田悦子, 長岐清孝, 村田稔

    日本遺伝学会第80回大会  2008 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 植物人工染色体の構築に向けて-動原体とミニクロモソーム-

    長岐清孝

    日本育種学会第114回講演会  2008 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • Visualization and detection of chromatin status by immunostaining and chromatin immunoprecipitation

    Kiyotaka Nagaki

    The 3rd Asian Chromosome Colloquium  2008 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • タバコにおける動原体タンパク質Cホモローグの解析

    長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

    第58回染色体学会・第17回染色体コロキウム2007年合同年会  2007 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Characterization of two centromere-specific histone H3 homologues from tobacco

    Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara

    2007 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • タバコ動原体特異的ヒストンH3の解析

    長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

    日本遺伝学会第79回大会  2007 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Identification and functional analysis of chromosomal passenger proteins in Arabidopsis thaliana

    Mauren Jaudal, 長岐清孝, 村田稔

    日本遺伝学会・第78回大会  2006 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 植物におけるセントロメアの機能解析

    長岐清孝

    染色体学会・染色体コロキウム 合同シンポジウム  2006 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • Dynamic changes of centromere-specific histone H3 amount during mitosis in the holocentric plant Luzula nivea

    Kiyotaka Nagaki, Kazunari Kashihara, Minoru Murata

    2006 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • 植物の動原体に局在するレトロトランスポゾン

    長岐清孝

    第28回日本分子生物学会年会  2005 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • Sequencing of a native rice centromere reveals active genes

    Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Steven Henikoff, Jiming Jiang

    Plant & animal genome XIII  2005 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • サトウキビにおける動原体特異的ヒストンの解析および動原体DNAの同定

    日本育種学会・第107・108回講演会  2005 

     More details

  • セントロメアのパラドックス

    長岐清孝

    第34回生物進化・細胞遺伝談話会  2005 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • 動原体特異的ヒストンH3を用いたルズラ分散型動原体の分子解析

    長岐清孝, 柏原壱成, 村田稔

    日本遺伝学会第77回大会  2005 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • 高等真核生物最後の秘境「動原体」の探検

    長岐清孝

    コムギ遺伝学シンポジウム・ムギ類分子生物学研究会 ムギ類合同研究会  2004 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (public)  

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  • The functional components of rice centromeres

    Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Steven Henikoff, Jiming Jiang

    2004 

     More details

    Presentation type:Symposium, workshop panel (nominated)  

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  • The fine structure of maize centromeres

    Weiwei Jin, Kiyotaka Nagaki, Jiming Jiang

    2004 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • イネ第8染色体動原体領域の塩基配列の決定とその領域における遺伝子発現とクロマチン状態の解析

    第27回日本分子生物学会年会  2004 

     More details

  • イネ第8染色体動原体領域の塩基配列の解析および機能領域の特定

    長岐清孝, Zhukuan Cheng, Shu Ouyang, Paul B. Talber, Mary Kim, Kristine M. Jones, Steven Henikoff, C. Robin Buell, Jiming Jiang

    日本遺伝学会第76回大会  2004 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • Chromatin immunoprecipitation analysis of the centromeric repeats in Arabidopsis thaliana

    Kiyotaka Nagaki, Paul B. Talber, Cathy Xiaoyan Zhong, R. Kelly Dawe, Steven Henikoff, Jiming Jiang

    2003 

     More details

    Presentation type:Poster presentation  

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  • コムギのゲノム科学 VI TACゲノミックライブラリーを用いたパンコムギ遺伝子のスクリーニング

    木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光, 荻原保成

    第99回 日本育種学会  2001 

     More details

    Presentation type:Oral presentation (general)  

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  • コムギのゲノム科学 V TACゲノミックライブラリーを用いたパンコムギ遺伝子のスクリーニング

    荻原保成, 木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光

    第23回 日本分子生物学会  2000 

     More details

  • ジュズダマ花粉の交雑によるコムギ半数体の作出

    持田恵一、長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

    第97回 日本育種学会  2000 

     More details

  • コムギのゲノム科学III. Transformation-competent artificial chromosome (TAC)ベクターを用いたパンコムギゲノミックライブラリーの構築と解析

    長岐清孝, 劉耀光, 魚住政彦, 藤田雅子, 河浦香奈子, 荻原保成

    第97回 日本育種学会  2000 

     More details

  • Construction of large insert genomic dna libraries of common wheat in a transformation-competent artificial chromosome (TAC) vector

    Yasunari Ogihara, Yao Guang Liu, Kiyotaka Nagaki, Masako Fujita, Kanako Kawaura, Masahiko Uozumi

    2000 

     More details

  • コムギ育種遺伝資源としての四倍性レイムス属の細胞遺伝学的多様性

    岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第97回 日本育種学会  2000 

     More details

  • コムギ連植物におけるTaiI family反復配列のゲノム特異的配置:染色体末端または動原体への局在

    岸井正浩、長岐清孝、辻本壽

    第51回 染色体学会  2000 

     More details

  • コムギのゲノム科学 IV. TACゲノミックライブラリーを用いたコムギ遺伝子のスクリーニング

    荻原保成, 木坂真由美, 根本泰江, 長岐清孝, 劉耀光

    第72回 日本遺伝学会  2000 

     More details

  • コムギ初期胚におけるテクノビット樹脂包埋切片に対するゲノミックin situハイブリダイゼーション法の開発

    持田恵一、長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

    第51回 染色体学会  2000 

     More details

  • FISHを利用した植物の四分子分析の可能性

    香川尚子, 長岐清孝, 辻本壽

    第51回 染色体学会  2000 

     More details

  • Tetrad FISH分析によるライムギJNK反復配列の動原体からの距離の推定

    香川尚子、長岐清孝、辻本壽

    第72回 日本遺伝学会  2000 

     More details

  • パンコムギの動原体領域に局在する縦列型反復配列の解析

    岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽

    第72回 日本遺伝学会  2000 

     More details

  • Leymus racemosusおよびPsathyrostachys junceaにおけるAfaファミリー反復配列の解析

    長岐清孝, 岸井正浩, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第71回 日本遺伝学会  1999 

     More details

  • Molecular evolution of a tandem repeat, Afa-family sequences, in Triticeae

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

    1999 

     More details

  • 安定化したコムギ染色体切断点におけるテロメア配列の新規合成

    辻本壽、宇佐美直也、長谷川恵子、山田豊美、長岐清孝、笹隈哲夫

    第50回 日本染色体学会  1999 

     More details

  • オオハマニンニク(Leymus racemosus)の反復配列による添加パンコムギ系統の解析

    岸井正浩, 長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第96回 日本育種学会  1999 

     More details

  • The JNK repeat family; a novel repetitive sequence located on an extra C-band region of the chromosome 2R of Japanese rye,

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

    1998 

     More details

  • サトウキビ動原体に存在する縦列型反復配列

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第70回 日本遺伝学会  1998 

     More details

  • ライムギ2R染色体長腕特異的反復配列の解析

    長岐清孝、辻本壽、笹隈哲夫

    第69回 日本遺伝学会  1997 

     More details

  • Molecular evolution of tandem repeat, Afa-family sequences, in Triticeae,

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, and Tetsuo Sasakuma.

    International workshop on analysis and utility of plant chromosome information  1997 

     More details

  • Molecular dynamics of a tandem repeated sequence family in wheat related species

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

    1997 

     More details

  • Molecular evolution of tandem repetitive Afa-family sequences in Triticeae, wheat-related species

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

    International molecular evolution symposium ”JUNK DNA”  1997 

     More details

  • Afa ファミリー配列の分子進化

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第68回 日本遺伝学会  1996 

     More details

  • オオムギ・コムギの反復配列の類似性

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第25回 コムギ遺伝学シンポジウム  1996 

     More details

  • Genome specific amplification of Afa-family sequence in Triticeae

    Kiyotaka Nagaki, Hisashi Tsujimoto, Tetsuo Sasakuma

    1995 

     More details

  • コムギ D ゲノムの各染色体における Afa ファミリー反復配列の変異性

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第67回 日本遺伝学会  1995 

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  • Discrimination of barley chromosomes by in situ hybridization using Afa-family repetitive sequences

    Hisashi Tsujimoto, Kiyotaka Nagaki, Junzo Fujigaki, Tetsuo Sasakuma

    1995 

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  • Afa ファミリー配列の構成から見た倍数性コムギの祖先種

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第87回 日本育種学会  1995 

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  • ムギ連における反復配列の分布

    笹隈哲夫, 根本泰江, 長岐清孝

    第67回日本遺伝学会  1995 

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  • Afa family反復配列のin situ hybridizationによる全オオムギ染色体の識別

    辻本壽、長岐清孝

    第45回 染色体学会  1994 

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  • ムギ連植物におけるpAs1およびその類似配列の分子構造の解析

    長岐清孝, 辻本壽, 笹隈哲夫

    第66回 日本遺伝学会  1994 

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Works

  • ゲノム編集を用いた半数体作出法の開発

    2015
    -
    2018

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  • 動原体機能低下系統を利用した半数体育種法の確立

    2011
    -
    2014

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  • マメ科植物の動原体構成要素の同定

    2008
    -
    2010

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  • タバコ動原体DNA配列の解析および人工染色体形成能の比較

    2008
    -
    2009

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  • 分散型動原体形成機構の解明

    2008
    -
    2009

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  • タバコにおける動原体複合体構成要素の解析および人工染色体の構築

    2006
    -
    2008

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  • 植物における染色体機能要素の分子的解析と人工染色体の構築

    2000
    -
    2005

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  • 植物の倍数体におけるゲノム間相互作用の統合的理解

    2000
    -
    2001

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  • ヘテロクロマチン領域形成に関わるDNA配列の解析

    1999
    -
    2001

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Awards

  • 日本遺伝学会奨励賞

    2009  

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    Country:Japan

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  • 染色体学会賞

    2008  

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    Country:Japan

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  • 遺伝学会Best paper賞

    2004  

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    Country:Japan

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Research Projects

  • Investigation of genetic factors for culture amenability and development of efficient haploid inducers to accelerate haploid breeding

    Grant number:22H02313  2022.04 - 2025.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

    久野 裕, 長岐 清孝

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    Grant amount:\17680000 ( Direct expense: \13600000 、 Indirect expense:\4080000 )

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  • Development of a system for the mass analysis of nuclear chromatin structure at the one-cell level with positional information in plant tissues

    Grant number:22K06333  2022.04 - 2025.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    長岐 清孝

      More details

    Grant amount:\4290000 ( Direct expense: \3300000 、 Indirect expense:\990000 )

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  • イネ小胞子に潜在する個体分化能と倍数化能を活用した育種基盤の新構築

    Grant number:19H00937  2019.04 - 2023.03

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    貴島 祐治, 山本 敏央, 長岐 清孝, 小出 陽平, 金 鍾明

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    Grant amount:\45890000 ( Direct expense: \35300000 、 Indirect expense:\10590000 )

    本研究は、1)小胞子から個体分化を誘導するメカニズム、2)イネ小胞子から効率的に個体を再生するシステムの構築、3)イネ種間雑種の葯培養個体で誘導される倍数性の発生メカニズムの解明、4)イネ種間雑種の葯培養個体によって雑種不稔性を回避する遺伝機構の解析、5)葯培養個体から生じた倍数体種間雑種による新しい育種材料の開発、の5つの問題から構成されている。2020年度は主に2)と4)について進展があった。2)について本研究では、葯から抽出した小胞子を直接培養することによって効率的に植物体再生を行うことが可能かどうかをキタアケを用いて行った。培地を検討するため、葯より抽出した小胞子に対してN6液体培地とすべての成分を10倍希釈した1/10 N6液体培地を用いて培養を行った。興味深いことに希釈培地でもカルス形成が確認された。誘導されたカルスに対して再分化処理を行い、1/10 N6液体培地に由来するカルスにおいても植物体が再生された。カルス形成率に着目すると培地の濃度によるカルス形成率への影響はなかった。しかし、培養過程にある小胞子生存率は1/10 N6培地中で大きく低下することが確認された。このことから、希釈培地では、カルス形成に関与しない小胞子が死滅したことが考えられる。両培地において葯に由来するカルスは、360葯から280個以上誘導された。これらカルスの再分化実験では、1/10 N6培地に由来するカルスは、N6液体培地に由来するカルスの再分化率を大きく上回った(1/10 N6液体培地:21%、N6液体培地12%)。さらに再分化後の馴化段階での枯死率も1/10 N6培地に由来の個体が低く安定的だった(1/10N6液体培地: 6%、 N6液体培地:22%)。したがって、カルス誘導培地の違いにより、再分化の効率が異なることが示された。

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  • Role of epigenetic regulation in inducing endoreplication in plants

    Grant number:17K15415  2017.04 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

    Takatsuka Hirotomo, Umeda Masaaki, Nagaki Kiyotaka

      More details

    Grant amount:\4290000 ( Direct expense: \3300000 、 Indirect expense:\990000 )

    Chromatin condensation during G2 phaseis crucial for the transition from mitotic cycle to endoreplication. In this study, I found that CDKB1, a central regulator of G2 progression, have a promotive function in chromatin codensation. Moreover, my biochemical analyses revealed that CDKB1 directly phosphorylates FAS1 and FAS2, both of which are components of CAF-1 complex which plays an important role in heterochromatin formation. These results suggest the possibility that CDKB1-CAF-1 pathway promotes heterochromatin formation, thereby inhibiting the transition from mitotic cycle to endoreplication.

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  • Plant epigenetics: molecular mechanisms controlling gene expression and transgenerational inheritance

    Grant number:15K07118  2015.10 - 2019.03

    Japan Society for the Promotion of Science  Grants-in-Aid for Scientific Research  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

    Hoshino Atsushi, SAKAKIBARA YASUBUMI, Jayakumar Vasanthan, NAGAKI KIYOTAKA, MORITA YASUMASA, NITASAKA EIJI, ITO KAZUYO, NAKAMURA RYOKO, TAKEUCHI TOMOYO

      More details

    Grant amount:\4680000 ( Direct expense: \3600000 、 Indirect expense:\1080000 )

    Floral pigmentation patterns are often caused by partial suppression of genes affecting flower petal coloration. We call one of the mechanisms for such gene suppression "epigenetics." Some morning glory cultivars show flowers with particular stripes. From molecular analyses of the striped flowers, we found that DNA methylation that is a key player of epigenetics suppresses the expression of the genes for flower coloration by inhibition of interaction between DNA and a protein. In addition, it was suggested that DNA methylation is involved in transgenerational inheritance of flower pigmentation.

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  • マメ科植物の動原体構成要素の同定

    Grant number:08F08113  2008 - 2009

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別研究員奨励費

    長岐 清孝, TEK A.L., TEK A. L.

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    Grant amount:\1600000 ( Direct expense: \1600000 )

    本研究では、「人工染色体構築のためのマメ科植物動原体DNAおよびタンパク質の同定」を目的としている。マメ科植物人工染色体は、マメ科植物の育種のための有用なツールとなる。これまでの他の植物での解析結果から、動原体領域は種特異的な反復配列で構成されていることがわかっている。このため、マメ科人工染色体を作るためには、マメ科植物の動原体DNA配列の情報が不可欠である。しかし、これまでにマメ科植物の動原体DNA配列に関する研究はまったく行われていなかったので、本研究でマメ科植物の動原体構成要素の同定を計画した。
    本年度は、昨年度に作成した抗ダイズCENH3(GmCENH3)抗体を用いたクロマチン免疫沈降法(ChIP)によりダイズの動原体DNA配列を単離した。この研究により、2種類の縦列型反復配列(GmCent-1およびGmCent-4)と1種類のレトロトランスポゾン(GmCR)がダイズ動原体DNA配列であることがわかった。これらのDNA配列は、ダイズ人工染色体を造るための有用な材料となる。この結果を論文にまとめ、Chromosome researchに受理された。
    続いて、この抗GmCRNH3抗体がゲンゲのCENH3を認識することを染色体に対する免疫染色法により新たに発見し、この抗体を用いたChIPによりゲンゲ動原体DNA配列を単離した。現在、これらの配列を解析するとともに、論文を準備中である。

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  • Analyses of kinetochore/centromere in plants

    2001

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    Grant type:Competitive

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Class subject in charge

  • From molecules to organisms (2024academic year) Third semester  - 金5~6

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2024academic year) Late  - その他

  • Advanced Study (2024academic year) Other  - その他

  • Integrated Genomic Breeding (2024academic year) Late  - 木5~8

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2024academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2024academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2024academic year) Year-round  - その他

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2024academic year) Prophase  - 火5~8

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2023academic year) Late  - その他

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2023academic year) Late  - その他

  • Plant Molecular Cytogenetics (2023academic year) Late  - 木5~8

  • Advanced Study (2023academic year) Other  - その他

  • Specific Research of Bioresources Science (2023academic year) Year-round  - その他

  • Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Late  - 木5~8

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2023academic year) Year-round  - その他

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2023academic year) Prophase  - 火5~8

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2023academic year) Prophase  - 火5~8

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2022academic year) Late  - その他

  • Plant Molecular Cytogenetics (2022academic year) Late  - 木5~8

  • Specific Research of Bioresources Science (2022academic year) Year-round  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2022academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2022academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2022academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2022academic year) Prophase  - その他

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2022academic year) Prophase  - 火5~8

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2021academic year) Late  - その他

  • Plant Molecular Cytogenetics (2021academic year) Late  - 木5~8

  • Specific Research of Bioresources Science (2021academic year) Year-round  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2021academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2021academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2021academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2021academic year) Prophase  - その他

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2021academic year) Prophase  - 火5~8

  • Analytical Molecular Cytogenetics (2020academic year) Late  - その他

  • Plant Molecular Cytogenetics (2020academic year) Late  - その他

  • Specific Research of Bioresources Science (2020academic year) Year-round  - その他

  • Seminar in Molecular Biology of the Nucleus (2020academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Molecular Biology of the Nucleus (2020academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2020academic year) Prophase  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2020academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2020academic year) Late  - その他

  • Seminar in Integrated Genomic Breeding (2020academic year) Prophase  - その他

  • Laboratory manuals for plant bioresources research (2020academic year) Prophase  - その他

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