Organization
Faculty of Environmental, Life, Natural Science and Technology Assistant Professor
Position
Assistant Professor
External link
Omori Masafumi
Research Interests
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Regeneration
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genome editing
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Blueberry
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Fruit and fruit tree science
Research History
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Okayama University 学術研究院 環境生命自然科学学域 Assistant Professor
2026.4
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University of Florida IFAS
2025.1 - 2026.1
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Kyoto University Graduate School of Agriculture Assistant Professor
2024.4 - 2026.3
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Kyoto University
2021.4 - 2024.3
Papers
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Anandi Karn, Felix Enciso-Rodriguez, Yaiphabi Kumam, Masafumi Omori, Kevin Begcy, Patricio Munoz
Horticulture Research 2026.6
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Feng Dai, Masafumi Omori, Ryutaro Tao
Plant Biotechnology 2026.3
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Diversity of direct regeneration rate in highbush blueberry cultivars Reviewed
M. Omori, H. Yamane, R. Tao
Acta Horticulturae ( 1440 ) 65 - 70 2025.11
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Masafumi Omori, Hisayo Yamane, Keishi Osakabe, Yuriko Osakabe, Ryutaro Tao
Plant Cell, Tissue and Organ Culture (PCTOC) 162 ( 2 ) 2025.8
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C. Iwami, M. Omori, T.-F. Hsiang, S.S. Sugano, T. Akagi, R. Tao
Acta Horticulturae ( 1404 ) 639 - 644 2024.9
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Masafumi Omori, Hisayo Yamane, Ryutaro Tao
Horticulture Research 2024.4
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M. Omori, H. Yamane, K. Osakabe, Y. Osakabe, R. Tao
Acta Horticulturae ( 1362 ) 49 - 56 2023
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Efficient Transient Expression for Functional Analysis in Fruit Using the Tsukuba System Vector Reviewed
Masafumi Omori, Yosuke Fujiwara, Hisayo Yamane, Kenji Miura, Ryutaro Tao
The Horticulture Journal 92 ( 3 ) 261 - 268 2023
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Off-season flowering and expression of flowering-related genes during floral bud differentiation of rabbiteye blueberry in a subtropical climate Reviewed
Masafumi Omori, Chieh-Chi Cheng, Fu-Chiun Hsu, Shiang-Jiuun Chen, Hisayo Yamane, Ryutaro Tao, Kuo-Tan Li
Scientia Horticulturae 306 111458 - 111458 2022.12
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M. Omori, H. Yamane, K. Osakabe, Y. Osakabe, R. Tao
The Journal of Horticultural Science and Biotechnology 96 ( 2 ) 153 - 161 2021
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M. Omori, H. Yamane, K.-T. Li, R. Matsuzaki, S. Ebihara, T.-S. Li, R. Tao
Acta Horticulturae ( 1280 ) 197 - 202 2020.6
Books
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ゲノム編集によるブルーベリー早期開花系統の作出
大森真史, 山根久代
アグリバイオ2024年11月号 2024.10
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ブルーベリーの形質転換およびゲノム編集 「ひとりではじめる植物バイオテクノロジー入門 : 組織培養からゲノム編集まで」
大森真史, 山根久代（ Role： Contributor）
国際文献社 2022.3 （ ISBN:9784910603032 ）
Awards
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優秀発表賞
2023.3 園芸学会 ゲノム編集によるブルーベリー早期開花系統の作出
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Presentation award
2020.6 Artificial pollination and parthenocarpic fruit set in autumn-bloom rabbiteye blueberry
Research Projects
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ゲノム編集を活用したブルーベリー野生種の育種利用
Grant number：25K18234 2025.04 - 2028.03
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
大森 真史
Grant amount：\4680000 （ Direct expense: \3600000 、 Indirect expense：\1080000 ）
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重複遺伝子の進化の理解に基づく特化代謝デザイン
2025.01 - 2026.01
日本学術振興会 海外特別研究員
Authorship：Principal investigator
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Development of a novel screening method selecting cultivars suitable for genetic transformation and elucidation of genetic mechanism of genetic transformation
Grant number：24K23130 2024.07 - 2026.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
大森 真史
Grant amount：\2730000 （ Direct expense: \2100000 、 Indirect expense：\630000 ）
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Development of high quality blueberry through metabolic engineering utilizing genome editing
2022.01 - 2027.03
グランドグリーン株式会社 Get-Research Grant
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果実成熟におけるエピジェネティック制御システムの解明と検証
Grant number：22KJ1715 2021.04 - 2024.03
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
大森 真史
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\2200000 （ Direct expense: \2200000 ）
ブルーベリーは房内で不均一に成熟が進むため成熟果実を手摘みする必要があり、生産効率を低下させる要因となっている。果実成熟を人為的に制御できれば、収穫作業の効率化につながる。先行研究によりブルーベリー果実成熟時に発生するグローバルなDNA脱メチル化とそれに伴う成熟促進が確認されているが、その詳細なメカニズムは不明である。本研究は着色を制御する遺伝子について、プロモーター領域におけるDNAメチル化レベルの変化とそれに伴うトランスポゾンの挙動に着目する。
第一の実験として、ロングリードシーケンスによる上述の着色遺伝子近傍の配列解読を目指した。果実サンプルからのDNA抽出が困難であったため、葉サンプルを追加しさらにDNA抽出およびシーケンスを外注とした。 今後はメチローム・トランスクリプトームデータと合わせて解析を行い、果実成熟とDNAメチル化との関係を考察する。
第二の実験としては証明実験に用いる遺伝子機能評価系の確立を行った。果実という特殊な環境における遺伝子の機能を調査するため、様々な果実における一過性発現系を確立した。 着色に関係する遺伝子を過剰発現させたところ、アントシアニンの蓄積によると考えられる着色が観察された。さらにブルーベリーにおいて花成抑制遺伝子CENTRORADIALISオーソログのノックアウト系統を獲得した。 本系統は早期開花性を示し、迅速な機能解析を可能とする。また、連続開花性も示したことから、上記果実一過性発現実験を年中行うことができる非常に有用な材料を得ることができた。 -
An attempt to evaluate the applicability of CRISPR/Cas9-mediated genome editing system for fruit tree breeding by utilizing precocious flowering strains
Grant number：15K14650 2015.04 - 2019.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Yamane Hisayo, MIMURA SHOTARO, MATSUZAKI RYUSUKE, OMORI MASAFUMI, LI TAISHAN
Grant amount：\3900000 （ Direct expense: \3000000 、 Indirect expense：\900000 ）
Genetic transformation and genome editing would have possibility to accelerate breeding process for many fruit crops. CRISPR/Cas9 is a genome editing system, which enables us to modify the site-specific genomic region. The objective of this study is to assess the applicability of CRISPR/Cas9 system in fruit trees by using easy-flowering genotypes of two fruit tree species. In this study, we first developed the method to promote early-flowering in citrus and characterized genetic system of easy-flowering in blueberry. Then, we successfully induced mutation in easy-flowering blueberry genotype by using CRISPR/Cas9 through the modification of efficient transformation and regeneration system. Although no phenotype changes have been observed so far in these mutants, future molecular characterization on these mutants will be effectively used to evaluate the genome editing performance in fruit tree species.