Organization
Institute of Plant Science and Resources Special-Appointment Assistant Professor
Position
Special-Appointment Assistant Professor
External link
FUKADA Fumi
Degree
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博士（農学） ( 2017.3 京都府立大学 )
Research Areas
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Life Science / Plant molecular biology and physiology
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Environmental Science/Agriculture Science / Plant protection science
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Life Science / Applied microbiology
Education
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Kyoto Prefectural University 生命環境科学研究科
2012.4 - 2017.3
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Kyoto Prefectural University 生命環境学部
2008.4 - 2012.3
Research History
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Okayama University Institute of Plant Science and Resources WTT assistant professor
2021.4
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Okayama University Institute of Plant Science and Resources
2020.10 - 2021.3
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Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology Organismic Interactions Postdoctoral Fellow
2017.4 - 2020.9
Country：Germany
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Kyoto Prefectural University Graduate School of Life and Environmental Sciences (MC and DC) Division of Applied Life Sciences
2014.4 - 2017.3
Professional Memberships
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日本植物生理学会
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日本植物病理学会
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糸状菌分子生物学研究会
Committee Memberships
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一般社団法人 日本植物生理学会 編集委員補
2023.1
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糸状菌分子生物学研究会若手の会 運営委員
2021.11
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一般社団法人 日本植物病理学会 編集幹事
2021.1 - 2023.3
Committee type：Academic society
Papers
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Morphogenesis and adaptive strategies for infection in plant pathogenic fungi
Fumi Fukada
Journal of General Plant Pathology 2024.8
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An NLR paralog Pit2 generated from tandem duplication of Pit1 fine-tunes Pit1 localization and function. Reviewed International journal
Yuying Li, Qiong Wang, Huimin Jia, Kazuya Ishikawa, Ken-Ichi Kosami, Takahiro Ueba, Atsumi Tsujimoto, Miki Yamanaka, Yasuyuki Yabumoto, Daisuke Miki, Eriko Sasaki, Yoichiro Fukao, Masayuki Fujiwara, Takako Kaneko-Kawano, Li Tan, Chojiro Kojima, Rod A Wing, Alfino Sebastian, Hideki Nishimura, Fumi Fukada, Qingfeng Niu, Motoki Shimizu, Kentaro Yoshida, Ryohei Terauchi, Ko Shimamoto, Yoji Kawano
Nature communications 15 ( 1 ) 4610 - 4610 2024.5
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Mitigating the Trade-Off between Growth and Stress Resistance in Plants by Fungal Volatile Compounds
Fumi Fukada
Plant And Cell Physiology 2024.2
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Niemann-Pick Type C Proteins Are Required for Sterol Transport and Appressorium-Mediated Plant Penetration of Colletotrichum orbiculare. Reviewed International journal
Sayo Kodama, Naoki Kajikawa, Fumi Fukada, Yasuyuki Kubo
mBio 13 ( 5 ) e0223622 2022.10
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Akira Akamatsu, Masayuki Fujiwara, Satoshi Hamada, Megumi Wakabayashi, Ai Yao, Qiong Wang, Ken-ichi Kosami, Thu Thi Dang, Takako Kaneko-Kawano, Fumi Fukada, Ko Shimamoto, Yoji Kawano
Plant and Cell Physiology 62 ( 11 ) 1662 - 1675 2021.12
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NB-LRR-encoding genes conferring susceptibility to organophosphate pesticides in sorghum. Reviewed International journal
Zihuan Jing, Fiona Wacera W, Tsuneaki Takami, Hideki Takanashi, Fumi Fukada, Yoji Kawano, Hiromi Kajiya-Kanegae, Hiroyoshi Iwata, Nobuhiro Tsutsumi, Wataru Sakamoto
Scientific reports 11 ( 1 ) 19828 - 19828 2021.10
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A small Ustilago maydis effector acts as a novel adhesin for hyphal aggregation in plant tumors Reviewed
Fumi Fukada, Nicole Rössel, Karin Münch, Timo Glatter, Regine Kahmann
New Phytologist 231 ( 1 ) 416 - 431 2021.7
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Plant pathogenic fungi Colletotrichum and Magnaporthe share a common G1 phase monitoring strategy for proper appressorium development Reviewed International journal
Fumi Fukada, Sayo Kodama, Takumi Nishiuchi, Naoki Kajikawa, Yasuyuki Kubo
New Phytologist 222 ( 4 ) 1909 - 1923 2019.6
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Neofunctionalization of the secreted Tin2 effector in the fungal pathogen Ustilago maydis International journal
Shigeyuki Tanaka, Gabriel Schweizer, Nicole Rössel, Fumi Fukada, Marco Thines, Regine Kahmann
Nature Microbiology 4 ( 2 ) 251 - 257 2019.2
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Development of the infection strategy of the hemibiotrophic plant pathogen, Colletotrichum orbiculare, and plant immunity Reviewed
Yasuyuki Kubo, Ken Harata, Sayo Kodama, Fumi Fukada
Physiological and Molecular Plant Pathology 95 32 - 36 2016.7
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Fumi Fukada, Yasuyuki Kubo
The Plant Cell 27 ( 9 ) 2530 - 2544 2015.9
MISC
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Morphogenesis and adaptive strategies for infection in plant pathogenic fungi
深田史美
日本植物病理学会報 90 ( 3 ) 2024
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Magnaporthe oryzae induces appressorium formation by recognizing RALF peptide derived from rice
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2024 2024
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Functional analysis on RALF family peptide that regulates rice immunity
深田史美, TING Guo, WANG Wanqing, 西村秀希, 小野奈津子, 水口洋平, 豊田敦, 古田智敬, 河野洋治
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2022 2022
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Intracellular sterol transport system is required for membrane curvature and appressorium-mediated plant penetration of Colletotrichum orbiculare
小玉紗代, 梶河直起, 深田史美, 深田史美, 久保康之
糸状菌分子生物学コンファレンス(Web) 21st 2022
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トウモロコシ黒穂病菌が分泌するエフェクター Lep1 は植物腫瘍組織中で新規アドへシンとして機能する
第62回 日本植物生理学会年会 プログラム集 39 - 39 2021
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トウモロコシ黒穂病菌は植物腫瘍において菌糸接着を促すためにエフェクターを新規のアドへシンとして利用する
深田史美, Nicole Rössel, Karin Münch, Timo Glatter, Regine Kahmann
令和３年度 日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 41 - 41 2021
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Research on lesions formed in jasmonate receptor mutant of rice
稲垣秀生, 湯本絵美, 深田史美, 朝比奈雅志, 朝比奈雅志, 宮本皓司
植物の生長調節 56 ( Supplement ) 2021
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The virulence factors CoNpc1 and CoNpc2 are involved in intracellular sterol transport and penetration peg formation of Colletotrichum orbiculare.
小玉紗代, 梶河直起, 深田史美, 久保康之
日本植物病理学会報 86 ( 1 ) 2020
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ウリ類炭疽病菌のCoNPC2は出芽酵母におけるステロール輸送因子NPC2の機能的オルソログであり病原性に関与する
梶河直起, 深田史美, 久保康之
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2018 2018
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炭疽病菌およびいもち病菌においてRabGAP Bub2は細胞周期および隔壁形成を制御し植物感染に関与する
深田史美, 西内巧, 久保康之
日本植物病理学会報 83 ( 1 ) 2017
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ウリ類炭疽病菌におけるCoPpt1は非選択的オートファジー関連因子CoAtg8と共局在し病原性に関与する
梶河直起, 深田史美, 久保康之
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2017 2017
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ウリ類炭疽病菌のLacO/LacI-GFPシステムを用いた細胞周期およびCoTem1局在解析
深田史美, 久保康之
日本植物病理学会報 82 ( 1 ) 2016
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ウリ類炭疽病菌の感染器官の形態形成と病原性研究
久保康之, 西内巧, 原田賢, 原田賢, 小玉紗代, 深田史美
日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集 ( 51 ) 2016
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酵母ツーハイブリッド法を用いたウリ類炭疽病菌における細胞周期制御因子CoTem1相互作用因子の同定
梶河直起, 深田史美, 久保康之
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2016 2016
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ウリ類炭疽病菌におけるCoBub2-CoBfa1と出芽酵母Bub2-Bfa1のスワッピングはG1/S期進行を遅延させる
深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会報 81 ( 1 ) 2015
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ウリ類炭疽病菌はRab GAPおよびGTPaseを介してG1/S期進行を制御し植物感染を成立させる
深田史美, 久保康之
日本生化学会大会(Web) 88th 2015
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ウリ類炭疽病菌GAP複合体CoBub2/CoBfa1はGTPase CoTem1を介してG1/S期進行制御および病原性に関与する
深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2015 2015
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ウリ類炭疽病菌のCoBub2/CoBfa1は付着器分化過程におけるG1/S期の進行制御および病原性に関与する
深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会報 80 ( 1 ) 2014
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ウリ類炭疽病菌の選択的なオートファジー因子CoATG20は宿主への侵入に必要である
DONG C., 深田史美, 原田賢, 小玉紗代, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会報 80 ( 1 ) 2014
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プロテインホスファターゼ2A制御サブユニットをコードする出芽酵母のRTS1のホモログCoRTS1はウリ類炭疽病菌において病原性,適切な胞子形成に必要である
川端昂, 深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会報 80 ( 1 ) 2014
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ウリ類炭疽病菌における出芽酵母BUB2のホモログ遺伝子CoBUB2は付着器分化過程における適切な細胞周期の進行に関与する
深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会報 79 ( 1 ) 2013
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ウリ類炭疽病菌の出芽酵母BUB2ホモログ遺伝子CoBUB2は形態形成および病原性に関与する
深田史美, 坂口歩, 久保康之
日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2012 2012
Presentations
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イネいもち病菌はイネ由来のRALFペプチドを認識して付着器形成を誘導する
令和6年度 日本植物病理学会大会
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イネの免疫を制御するRALFペプチドの機能解析 Invited
深田史美
第39回資源植物科学シンポジウム及び第15回植物ストレス科学研究シンポジウム
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植物-病原糸状菌相互作用における分泌タンパク質・ペプチドの解析 Invited
深田史美, Ting Guo, Pingyu Wang, 河野洋治
令和4年度植物感染生理談話会 2022.9.6
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A secreted RALF peptide modulates rice immune response upon Magnaporthe oryzae infection Invited
Fukada, F, Guo, T, Wang, W, Nishimura, H, Ono, N, Minakuchi, Y, Toyoda, A, Kawano, Y
12th Japan-US Seminar in Plant Pathology 2022.8.30
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イネ免疫を制御するRALFファミリーペプチドの機能解析
深田史美, Ting Guo, Wanqing Wang, 西村秀希, 小野奈津子, 水口洋平, 豊田敦, 古田智敬, 河野洋治
令和4年度日本植物病理学会大会 2022.3.28
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植物病原糸状菌の形態形成と感染適応戦略 Invited
深田史美
令和6年度 日本植物病理学会大会 2024.3.13
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A secreted virulence effector protein of the biotrophic fungal plant pathogen Ustilago maydis Invited
深田史美, Nicole Rössel, Timo Glatter, Karin Münch, Petra Happel, Regine Kahmann
第96回 日本細菌学会 2023.3.18
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Secreted proteins and peptides used for the interaction between plant cell and plant pathogenic fungi Invited
深田史美
神戸大学第57回インターゲノミクスセミナー 2022.11.11
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植物サイトカインRALFaによる免疫制御と病原菌との相互作用 Invited
深田史美
岩手生工研所内セミナー 2022.9.9
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植物腫瘍内で黒穂病菌の増殖を促進するエフェクター Invited
第41回 日本植物病理学会 関西部会 若手の会 2021.9.17
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Ustilago maydis secretes the novel virulence-promoting Lep1 effector for hyphal aggregation in plant tumors
Fumi Fukada, Nicole Rössel, Karin Münch, Timo Glatter, Regine Kahmann
2021 IS-MPMI Congress: eSymposia Series 2021.9.15
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Ustilago maydis utilizes an effector as a novel adhesin to promote hyphal aggregation in plant tumors
Fukada Fumi, Nicole Rössel, Glatter Timo, Kahmann Regine
2021.3.17
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A secreted Ustilago maydis effector acts as a novel adhesin for hyphal aggregation in plant tumors
Fumi Fukada, Nicole Rössel, Timo Glatter, Karin Münch, Petra Happel, Regine Kahmann
2021.3.14
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A small Ustilago maydis effector acts as a novel adhesin for hyphal aggregation in plant tumors
Fumi Fukada, Nicole Rössel, Timo Glatter, Regine Kahmann
2020.11.13
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A secreted small protein of Ustilago maydis is used as a mediator of hydrophobicity for hyphal aggregates formation after plant colonization Invited
2020 Japan-US Early Career Online Symposium 2020.9.29
Awards
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学術奨励賞
2024.3 日本植物病理学会
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14th European Conference on Fungal Genetics, Best poster award
2019.3
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育志賞
2017.3 日本学術振興会
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平成28年度 京都府公立大学法人理事長賞
2017.3
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28th Fungal Genetics Conference, Best student poster awards
2015.3 Genetics Society of America
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平成24年度 京都府公立大学法人理事長賞
2014.3
Research Projects
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植物由来の細胞外小胞による病原菌感染に対するカウンターアタックの解析
Grant number：24K17890 2024.04 - 2027.03
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
深田 史美
Grant amount：\4680000 （ Direct expense: \3600000 、 Indirect expense：\1080000 ）
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Deciphering activation and evolutionary mechanisms of the paired NLR immune receptors based on paralog suppression and neofunctionalization
Grant number：23H02213 2023.04 - 2027.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
河野 洋治, 深田 史美
Grant amount：\18590000 （ Direct expense: \14300000 、 Indirect expense：\4290000 ）
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植物の免疫シグナル因子を逆手に取った病原菌の宿主認識機構
Grant number：JPMJPR22D8 2022.10 - 2026.03
国立研究開発法人科学技術振興機構 さきがけ
Authorship：Principal investigator
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植物サイトカインによる免疫システムの解明
2021.04 - 2024.03
文部科学省 科学研究費助成事業 若手研究 若手研究
Authorship：Principal investigator
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植物病原糸状菌の侵入器官の形態形成と細胞周期の制御機構に関する研究
Grant number：14J11463 2014.04 - 2017.03
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費 特別研究員奨励費
深田 史美
Grant amount：\3200000 （ Direct expense: \3200000 ）
一般に糸状菌の形態形成は適切な細胞周期進行に基づいて行われるが、植物病原糸状菌において細胞周期制御と感染過程における形態分化の関連性に関する研究事例は極めて限られている。申請者はこれまでに、ウリ科植物を宿主とするウリ類炭疽病菌の植物への病原性にはRab GAP複合体を構成するBub2/Bfa1によるG1/S期の移行抑制が必要であることを明らかにしてきた。一方で、酵母や非植物病原糸状菌におけるこれらの相同遺伝子はG1/S期の進行制御には関与せずM期の進行制御や隔壁形成に関与することから、本シグナルカスケードは生物種によって異なる機能を持つ可能性が示唆される。本年度は、第一にマイクロアレイを用いたトランスクリプトーム解析により、GAP複合体制御下の遺伝子発現変動を検討した。その結果、bub2破壊株ではDNA合成酵素やDNAヘリカーゼといったDNA複製に関与するタンパク質をコードする遺伝子群の顕著な発現上昇が認められた。加えて転写因子、小型分泌タンパク質、糖質関連酵素、膜輸送体に関連する遺伝子に関しても大幅な発現変動が認められ、これらの遺伝子発現の変動が病原性低下の要因となる可能性が強く示唆された。また、ウリ類炭疽病菌と同様に付着器と呼ばれる侵入器官を介した植物感染を行う植物病原菌におけるGAP複合体の機能の保存性を検討した。その結果、アブラナ科炭疽病菌、イネいもち病菌におけるbub2破壊株はG1/S期が異常に早期化した上に、核分裂に伴う隔壁形成の頻度が顕著に低下し、宿主植物への侵入能力が顕著に低下した。以上の結果は、本GAP複合体による制御機構が炭疽病菌といもち病菌に共通して存在し機能することを示しており、付着器を介した植物感染を行う植物病原糸状菌が独自の細胞周期、隔壁形成制御機構を獲得してきた可能性を示唆する。
Class subject in charge
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Special Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2024academic year） Year-round - その他
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Topics in Plant-Pathogen Interactions （2024academic year） Prophase - その他
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Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2024academic year） Prophase - その他
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Special Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2023academic year） Year-round - その他
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Topics in Plant-Pathogen Interactions （2023academic year） Prophase - その他
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Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2023academic year） Prophase - その他
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Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2023academic year） Late - その他
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Topics in Plant-Pathogen Interactions （2023academic year） Prophase - その他
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Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2022academic year） Prophase - その他
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Seminar in Plant-Pathogen Interactions （2022academic year） Late - その他
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Topics in Plant-Pathogen Interactions （2022academic year） Prophase - その他