2025/06/24 更新

写真a

コンドウ ヒデキ
近藤 秀樹
KONDO Hideki
所属
学術研究院先鋭研究領域(資源植物) 准教授
職名
准教授
外部リンク

学位

  • 博士(農学) ( 岡山大学 )

研究キーワード

  • 植物

  • 水平伝搬

  • ウイルス

  • ベクター

  • 昆虫ウイルス

  • 植物ウイルス

  • 菌類ウイルス

  • 植物病理学

  • 進化

  • RNAサイレンシング

  • 分子進化

  • ラブドウイルス

  • マイナス鎖RNAウイルス

  • ウイルス化石

研究分野

  • 環境・農学 / 植物保護科学

  • ライフサイエンス / 応用分子細胞生物学

学歴

  • 岡山大学   Graduate School, Division of Agriculture  

    - 1993年

      詳細を見る

  • 日本大学   Faculty of Agriculture and Veterinary Medicine  

    - 1991年

      詳細を見る

経歴

  • - 岡山大学資源植物科学研究所 准教授

    2014年 - 現在

      詳細を見る

  • 岡山大学資源植物科学研究所 助教   Institute of Plant Science and Resources

    2007年 - 2014年

      詳細を見る

  • 岡山大学資源生物科学研究所 助手

    1993年 - 2006年

      詳細を見る

所属学協会

委員歴

  • 日本植物病理学会関西部会   事務幹事  

    2023年4月 - 2024年3月   

      詳細を見る

  • 国際ウイルス分類委員会 ICTV Totiviridae Study Group  

    2021年 - 現在   

      詳細を見る

  • 国際ウイルス分類委員会 ICTV Mymonaviridae Study Group  

    2021年 - 現在   

      詳細を見る

  • 日本植物病理学会   原著編集委員  

    2020年1月 - 2021年12月   

      詳細を見る

  • 日本植物病理学会   植物ウイルス分類委員会委員  

    2018年 - 現在   

      詳細を見る

    団体区分:学協会

    researchmap

  • 国際ウイルス分類委員会 ICTV   Hypoviridae Study Group  

    2018年 - 2021年   

      詳細を見る

  • 国際ウイルス分類委員会 ICTV   Rhabdoviridae Study Group  

    2017年 - 現在   

      詳細を見る

    団体区分:学協会

    researchmap

  • Frontiers in Microbiology/ Frontiers in Plant Science   Review Editor  

    2017年 - 現在   

      詳細を見る

  • 植物ウイルス病研究会   幹事(会計)  

    2017年 - 2025年3月   

      詳細を見る

▼全件表示

 

論文

  • Evidence for the replication of a plant rhabdovirus in its arthropod mite vector. 国際誌

    Hideki Kondo, Miki Fujita, Paul Telengech, Kazuyuki Maruyam, Kiwamu Hyodo, Aline Daniele Tassi, Ronald Ochoa, Ida Bagus Andika, Nobuhiro Suzuki

    Virus research   351   199522 - 199522   2025年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Transmission of plant viruses that replicate in the insect vector is known as persistent-propagative manner. However, it remains unclear whether such virus-vector relationships also occur between plant viruses and other biological vectors such as arthropod mites. In this study, we investigated the possible replication of orchid fleck virus (OFV), a segmented plant rhabdovirus, within its mite vector (Brevipalpus californicus s.l.) using quantitative RT-qPCR, western blotting and next-generation sequencing. Time-course RT-qPCR and western blot analyses showed an increasing OFV accumulation pattern in mites after virus acquisition. Since OFV genome expression requires the transcription of polyadenylated mRNAs, polyadenylated RNA fractions extracted from the viruliferous mite samples and OFV-infected plant leaves were used for RNA-seq analysis. In the mite and plant datasets, a large number of sequence reads were aligned to genomic regions of OFV RNA1 and RNA2 corresponding to transcribed viral gene mRNAs. This includes the short polyadenylated transcripts originating from the leader and trailer regions at the ends of the viral genome, which are believed to play a crucial role in viral transcription/replication. In contrast, a low number of reads were mapped to the non-transcribed regions (gene junctions). These results strongly suggested that OFV gene expression occurs both in mites and plants. Additionally, deep sequencing revealed the accumulation of OFV-derived small RNAs in mites, although their size profiles differ from those found in plants. Taken together, our results indicated that OFV replicates within a mite vector and is targeted by the RNA-silencing mechanism.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2024.199522

    PubMed

    researchmap

  • The intriguing phenomenon of cross-kingdom infections of plant and insect viruses to fungi: Can other animal viruses also cross-infect fungi? 査読 国際誌

    Ida Bagus Andika, Xinran Cao, Hideki Kondo, Liying Sun

    PLoS pathogens   19 ( 10 )   e1011726   2023年10月

     詳細を見る

    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Fungi are highly widespread and commonly colonize multicellular organisms that live in natural environments. Notably, studies on viruses infecting plant-associated fungi have revealed the interesting phenomenon of the cross-kingdom transmission of viruses and viroids from plants to fungi. This implies that fungi, in addition to absorbing water, nutrients, and other molecules from the host, can acquire intracellular parasites that reside in the host. These findings further suggest that fungi can serve as suitable alternative hosts for certain plant viruses and viroids. Given the frequent coinfection of fungi and viruses in humans/animals, the question of whether fungi can also acquire animal viruses and serve as their hosts is very intriguing. In fact, the transmission of viruses from insects to fungi has been observed. Furthermore, the common release of animal viruses into the extracellular space (viral shedding) could potentially facilitate their acquisition by fungi. Investigations of the cross-infection of animal viruses in fungi may provide new insights into the epidemiology of viral diseases in humans and animals.

    DOI: 10.1371/journal.ppat.1011726

    PubMed

    researchmap

  • Cross-Kingdom Interactions Between Plant and Fungal Viruses. 査読 国際誌

    Ida Bagus Andika, Mengyuan Tian, Ruiling Bian, Xinran Cao, Ming Luo, Hideki Kondo, Liying Sun

    Annual review of virology   2023年7月

     詳細を見る

    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The large genetic and structural divergences between plants and fungi may hinder the transmission of viruses between these two kingdoms to some extent. However, recent accumulating evidence from virus phylogenetic analyses and the discovery of naturally occurring virus cross-infection suggest the occurrence of past and current transmissions of viruses between plants and plant-associated fungi. Moreover, artificial virus inoculation experiments showed that diverse plant viruses can multiply in fungi and vice versa. Thus, virus cross-infection between plants and fungi may play an important role in the spread, emergence, and evolution of both plant and fungal viruses and facilitate the interaction between them. In this review, we summarize current knowledge related to cross-kingdom virus infection in plants and fungi and further discuss the relevance of this new virological topic in the context of understanding virus spread and transmission in nature as well as developing control strategies for crop plant diseases. Expected final online publication date for the Annual Review of Virology, Volume 10 is September 2023. Please see http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates for revised estimates.

    DOI: 10.1146/annurev-virology-111821-122539

    PubMed

    researchmap

  • Discovery and Genome Characterization of a Closterovirus from Wheat Plants with Yellowing Leaf Symptoms in Japan 査読

    Hideki Kondo, Hitomi Sugahara, Miki Fujita, Kiwamu Hyodo, Ida Bagus Andika, Hiroshi Hisano, Nobuhiro Suzuki

    Pathogens   12 ( 3 )   358 - 358   2023年2月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:MDPI AG  

    Many aphid-borne viruses are important pathogens that affect wheat crops worldwide. An aphid-transmitted closterovirus named wheat yellow leaf virus (WYLV) was found to have infected wheat plants in Japan in the 1970s; however, since then, its viral genome sequence and occurrence in the field have not been investigated. We observed yellowing leaves in the 2018/2019 winter wheat-growing season in an experimental field in Japan where WYLV was detected five decades ago. A virome analysis of those yellow leaf samples lead to the discovery of a closterovirus together with a luteovirus (barley yellow dwarf virus PAV variant IIIa). The complete genomic sequence of this closterovirus, named wheat closterovirus 1 isolate WL19a (WhCV1-WL19a), consisted of 15,452 nucleotides harboring nine open reading frames. Additionally, we identified another WhCV1 isolate, WL20, in a wheat sample from the winter wheat-growing season of 2019/2020. A transmission test indicated that WhCV1-WL20 was able to form typical filamentous particles and transmissible by oat bird-cherry aphid (Rhopalosiphum pad). Sequence and phylogenetic analyses showed that WhCV1 was distantly related to members of the genus Closterovirus (family Closteroviridae), suggesting that the virus represents a novel species in the genus. Furthermore, the characterization of WhCV1-WL19a-derived small RNAs using high-throughput sequencing revealed highly abundant 22-nt-class small RNAs potentially derived from the 3′-terminal end of the WhCV1 negative-strand genomic RNA, indicating that this terminal end of the WhCV1 genome is likely particularly targeted for the synthesis of viral small RNAs in wheat plants. Our results provide further knowledge on closterovirus diversity and pathogenicity and suggest that the impact of WhCV1 on wheat production warrants further investigations.

    DOI: 10.3390/pathogens12030358

    researchmap

  • Mycovirus Diversity and Evolution Revealed/Inferred from Recent Studies. 査読 国際誌

    Hideki Kondo, Leticia Botella, Nobuhiro Suzuki

    Annual review of phytopathology   2022年5月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    High-throughput virome analyses with various fungi, from cultured or uncultured sources, have led to the discovery of diverse viruses with unique genome structures and even neo-lifestyles. Examples in the former category include splipalmiviruses and ambiviruses. Splipalmiviruses, related to yeast narnaviruses, have multiple positive-sense (+) single-stranded (ss) RNA genomic segments that separately encode the RNA-dependent RNA polymerase motifs, the hallmark of RNA viruses (members of the kingdom Orthornavirae). Ambiviruses appear to have an undivided ssRNA genome of 3∼5 kb with two large open reading frames (ORFs) separated by intergenic regions. Another narna-like virus group has two fully overlapping ORFs on both strands of a genomic segment that span more than 90% of the genome size. New virus lifestyles exhibited by mycoviruses include the yado-kari/yado-nushi nature characterized by the partnership between the (+)ssRNA yadokarivirus and an unrelated dsRNA virus (donor of the capsid for the former) and the hadaka nature of capsidless 10-11 segmented (+)ssRNA accessible by RNase in infected mycelial homogenates. Furthermore, dsRNA polymycoviruses with phylogenetic affinity to (+)ssRNA animal caliciviruses have been shown to be infectious as dsRNA-protein complexes or deproteinized naked dsRNA. Many previous phylogenetic gaps have been filled by recently discovered fungal and other viruses, which have provided interesting evolutionary insights. Phylogenetic analyses and the discovery of natural and experimental cross-kingdom infections suggest that horizontal virus transfer may have occurred and continue to occur between fungi and other kingdoms. Expected final online publication date for the Annual Review of Phytopathology, Volume 60 is August 2022. Please see http://www.annualreviews.org/page/journal/pubdates for revised estimates.

    DOI: 10.1146/annurev-phyto-021621-122122

    PubMed

    researchmap

  • Identification of a Novel Quinvirus in the Family Betaflexiviridae That Infects Winter Wheat. 査読 国際誌

    Hideki Kondo, Naoto Yoshida, Miki Fujita, Kazuyuki Maruyama, Kiwamu Hyodo, Hiroshi Hisano, Tetsuo Tamada, Ida Bagus Andika, Nobuhiro Suzuki

    Frontiers in microbiology   12   715545 - 715545   2021年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Yellow mosaic disease in winter wheat is usually attributed to the infection by bymoviruses or furoviruses; however, there is still limited information on whether other viral agents are also associated with this disease. To investigate the wheat viromes associated with yellow mosaic disease, we carried out de novo RNA sequencing (RNA-seq) analyses of symptomatic and asymptomatic wheat-leaf samples obtained from a field in Hokkaido, Japan, in 2018 and 2019. The analyses revealed the infection by a novel betaflexivirus, which tentatively named wheat virus Q (WVQ), together with wheat yellow mosaic virus (WYMV, a bymovirus) and northern cereal mosaic virus (a cytorhabdovirus). Basic local alignment search tool (BLAST) analyses showed that the WVQ strains (of which there are at least three) were related to the members of the genus Foveavirus in the subfamily Quinvirinae (family Betaflexiviridae). In the phylogenetic tree, they form a clade distant from that of the foveaviruses, suggesting that WVQ is a member of a novel genus in the Quinvirinae. Laboratory tests confirmed that WVQ, like WYMV, is potentially transmitted through the soil to wheat plants. WVQ was also found to infect rye plants grown in the same field. Moreover, WVQ-derived small interfering RNAs accumulated in the infected wheat plants, indicating that WVQ infection induces antiviral RNA silencing responses. Given its common coexistence with WYMV, the impact of WVQ infection on yellow mosaic disease in the field warrants detailed investigation.

    DOI: 10.3389/fmicb.2021.715545

    PubMed

    researchmap

  • Virome Analysis of Aphid Populations That Infest the Barley Field: The Discovery of Two Novel Groups of Nege/Kita-Like Viruses and Other Novel RNA Viruses. 査読 国際誌

    Hideki Kondo, Miki Fujita, Hiroshi Hisano, Kiwamu Hyodo, Ida Bagus Andika, Nobuhiro Suzuki

    Frontiers in microbiology   11   509 - 509   2020年

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Aphids (order Hemiptera) are important insect pests of crops and are also vectors of many plant viruses. However, little is known about aphid-infecting viruses, particularly their diversity and relationship to plant viruses. To investigate the aphid viromes, we performed deep sequencing analyses of the aphid transcriptomes from infested barley plants in a field in Japan. We discovered virus-like sequences related to nege/kita-, flavi-, tombus-, phenui-, mononega-, narna-, chryso-, partiti-, and luteoviruses. Using RT-PCR and sequence analyses, we determined almost complete sequences of seven nege/kitavirus-like virus genomes; one of which was a variant of the Wuhan house centipede virus (WHCV-1). The other six seem to belong to four novel viruses distantly related to Wuhan insect virus 9 (WhIV-9) or Hubei nege-like virus 4 (HVLV-4). We designated the four viruses as barley aphid RNA virus 1 to 4 (BARV-1 to -4). Moreover, some nege/kitavirus-like sequences were found by searches on the transcriptome shotgun assembly (TSA) libraries of arthropods and plants. Phylogenetic analyses showed that BARV-1 forms a clade with WHCV-1 and HVLV-4, whereas BARV-2 to -4 clustered with WhIV-9 and an aphid virus, Aphis glycines virus 3. Both virus groups (tentatively designated as Centivirus and Aphiglyvirus, respectively), together with arthropod virus-like TSAs, fill the phylogenetic gaps between the negeviruses and kitaviruses lineages. We also characterized the flavi/jingmen-like and tombus-like virus sequences as well as other RNA viruses, including six putative novel viruses, designated as barley aphid RNA viruses 5 to 10. Interestingly, we also discovered that some aphid-associated viruses, including nege/kita-like viruses, were present in different aphid species, raising a speculation that these viruses might be distributed across different aphid species with plants being the reservoirs. This study provides novel information on the diversity and spread of nege/kitavirus-related viruses and other RNA viruses that are associated with aphids.

    DOI: 10.3389/fmicb.2020.00509

    PubMed

    researchmap

  • Two novel fungal negative-strand RNA viruses related to mymonaviruses and phenuiviruses in the shiitake mushroom (Lentinula edodes). 査読

    Lin YH, Fujita M, Chiba S, Hyodo K, Andika IB, Suzuki N, Kondo H

    Virology   533   125 - 136   2019年7月

     詳細を見る

    担当区分:最終著者, 責任著者   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2019.05.008

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • A novel insect-infecting virga/nege-like virus group and its pervasive endogenization into insect genomes. 査読

    Kondo H, Chiba S, Maruyama K, Andika IB, Suzuki N

    Virus research   262   37 - 47   2019年3月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2017.11.020

    PubMed

    researchmap

  • Annual (2024) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota). 国際誌

    Jens H Kuhn, Scott Adkins, Sergey V Alkhovsky Альховский Сергей Владимирович, Wenxia An 安雯霞, Tatjana Avšič-Županc, María A Ayllón, Katarina Bačnik, Justin Bahl, Anne Balkema-Buschmann, Matthew J Ballinger, Martin Beer, Nicolas Bejerman, Éric Bergeron, Nadine Biedenkopf, Carol D Blair, Kim R Blasdell, Steven B Bradfute, Thomas Briese, Katherine Brown, Paul A Brown, Ursula J Buchholz, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity Burt, Charles H Calisher, Sten Calvelage, Mengji Cao 曹孟籍, Inmaculada Casas, Camila Chabi-Jesus, Kartik Chandran, Rémi N Charrel, Anya Crane, Laura N Cuypers, Elena Dal Bó, Juan Carlos de la Torre, William M de Souza, Rik L de Swart, Humberto J Debat, Nolwenn M Dheilly, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G Dietzgen, Michele Digiaro, J Felix Drexler, W Paul Duprex, Ralf Dürrwald, Andrew J Easton, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Mirette I Y Eshak, Guozhong Feng 冯国忠, Andrew E Firth, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Juliana Freitas-Astúa, Conrad M Freuling, Tuija Gadd, Selma Gago-Zachert, María Laura García, Adolfo García-Sastre, Aura R Garrison, Tony L Goldberg, Jean-Paul J Gonzalez, Joëlle Goüy de Bellocq, Anthony Griffiths, Martin H Groschup, Sophie Gryseels, Ion Gutiérrez-Aguirre, Stephan Günther, John Hammond, Jussi Hepojoki, Masayuki Horie 堀江真行, Adam J Hume, Timothy H Hyndman, Dirk Höper, Dàohóng Jiāng 姜道宏, Sandra Junglen, Boris Klempa, Jonas Klingström, Hideki Kondō 近藤秀樹, Eugene V Koonin, Mart Krupovic, Kenji Kubota 久保田健嗣, Gael Kurath, Denis Kutnjak, Lies Laenen, Amy J Lambert, Benhur Lee, Chengyu Li 李呈宇, Jiànróng Lǐ 李建荣, Jun-Min Li 李俊敏, Igor S Lukashevich, Piet Maes, Marco Marklewitz, Sergio H Marshall, Shin-Yi L Marzano, John W McCauley, Nataša Mehle, Ali Mirazimi, Toshiyuki Morikawa 守川俊幸, Elke Mühlberger, Thomas Müller, Rayapati Naidu, Tomohide Natsuaki 夏秋知英, Beatriz Navarro, José A Navarro, Yutaro Neriya 煉谷裕太朗, Sergey V Netesov Нетёсов Сергей Викторович, Vittorio M Nicoloso, Gabriele Neumann, Tiina Nokireki, Norbert Nowotny, Márcio R T Nunes, Francisco M Ochoa-Corona, Gustavo Palacios, Vicente Pallás, Anna Papa Άννα Παπά, Sofia Paraskevopoulou Σοφία Παρασκευοπούλου, Colin R Parrish, Alex Pauvolid-Corrêa, Anja Pecman, Daniel R Pérez, Florian Pfaff, Richard K Plemper, Thomas S Postler, Sheli R Radoshitzky, Pedro L Ramos-González, Maja Ravnikar, Renato O Resende, Gábor Reuter, Carina A Reyes, Mark Paul Selda Rivarez, Víctor Romanowski, Dennis Rubbenstroth, Luisa Rubino, Jonathan A Runstadler, Ana Ruiz-Padilla, Sead Sabanadzovic, Maria S Salvato, Takahide Sasaya 笹谷孝英 I, Connie S Schmaljohn, Heike Schmidt-Posthaus, Martin Schwemmle, Gabrijel Seljak, Torsten Seuberlich, Mang Shi 施莽, Yoshifumi Shimomoto 下元祥史, Peter Simmonds, Manuela Sironi, Donald B Smith, Sophie Smither, Jin-Won Song 송진원, Kirsten M Spann, Jessica R Spengler, Mark D Stenglein, Ayato Takada 高田礼人, Chika Takemura, Niina Tammiranta, Robert B Tesh, Natalie J Thornburg, Nicole D Tischler, Yasuhiro Tomitaka 冨髙保弘, Keizō Tomonaga 朝長啓造, Noël Tordo, Massimo Turina, Ioannis E Tzanetakis Ιωάννης Ε Τζανετάκης, Anna Maria Vaira, Bernadette van den Hoogen, Bert Vanmechelen, Nikos Vasilakis Νίκος Βασιλάκης, Martin Verbeek, Susanne von Bargen, Ana Vučurović, Jiro Wada 和田治郎, Victoria Wahl, Peter J Walker, Fei Wang 王飞, Anna E Whitfield, John V Williams, Yuri I Wolf, Hironobu Yanagisawa 栁澤広宣, Caixia Yang 杨彩霞, Gongyin Ye 叶恭银, Mei Chun Yu 于美春, F Murilo Zerbini, Song Zhang, Arnfinn Lodden Økland, Holly R Hughes

    The Journal of general virology   106 ( 6 )   2025年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In April 2024, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was expanded by 1 new order, 1 new family, 6 new subfamilies, 34 new genera and 270 new species. One class, two orders and six species were renamed. Seven families and 12 genera were moved; ten species were renamed and moved; and nine species were abolished. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as currently accepted by the ICTV, providing an essential annual update on the classification of members of this phylum that deepen understandings of their evolution, and supports critical public health measures for virus identification and tracking.

    DOI: 10.1099/jgv.0.002077

    PubMed

    researchmap

  • A capsidless (+)RNA yadokarivirus hosted by a dsRNA virus is infectious as particles, cDNA, and dsRNA. 国際誌

    Muhammad Fadli, Sakae Hisano, Guy Novoa, José R Castón, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Journal of virology   99 ( 3 )   e0216624   2025年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Capsidless yadokariviruses (members of the order Yadokarivirales) with (+)RNA genomes divert the capsid of their partner icosahedral double-stranded RNA (dsRNA) viruses in different families of the order Ghabrivirales into the replication site. A yadokarivirus, AfSV2, has been reported from a German strain of the ascomycete fungus Aspergillus foetidus coinfected by two dsRNA viruses, a victorivirus (AfSV1, family Pseudototiviridae) and an alternavirus (AfFV, family Alternaviridae). Here, we identified AfSV1 as the partner of AfSV2 in a Japanese A. foetidus strain after showing the infectiousness of AfSV2 in three forms: virus particles (heterocapsid), transforming full-length complementary DNA (cDNA), and purified replicated form (RF) dsRNA that is believed to be inactive as a translational template. Virion transfection of virus-free A. foetidus protoplasts resulted in the generation of two strains infected either by AfSV1 alone or by both AfSV1 and AfSV2. Transformants with AfSV2 full-length cDNA launched AfSV2 infection only in the presence of AfSV1, but not those with AfSV2 RNA-directed RNA polymerase mutant cDNA. The purified fractions containing AfSV2 RF dsRNA also launched infection when transfected into protoplasts infected by AfSV1. Treatment with dsRNA-specific RNase III, but not with proteinase K, S1 nuclease, or DNase I, abolished the infectivity of AfSV2 RF dsRNA. Furthermore, we confirmed the infectiousness of gel-purified AfSV2 RF dsRNA in the presence of AfSV1. Taken together, our results show the unique infectious entity of AfSV2 and the expansion of yadokarivirus partners in the family Pseudototiviridae and provide interesting evolutionary insights.IMPORTANCEThe viral phylum Pisuviricota accommodates members with both double-stranded RNA (dsRNA) and (+)RNA genomes. Some members of the second group display peculiar virus lifestyles. These include (+)RNA yadkariviruses, which are capsidless and highjack the capsid of their partner dsRNA viruses in the order Ghabrivirales of a different phylum Duplornaviricota. We identified the partner dsRNA virus (AfSV1, a victorivirus) of a yadokarivirus (AfSV2) from the ascomycete Aspergillus foetidus. AfSV2 is infectious in the presence of AfSV1 in three forms: purified particles, transforming full-length complementary DNA, and, surprisingly, the purified replicative form dsRNA. These combined results expand yadokarivirus partner viruses to the family Pseudototiviridae and provide evidence for AfSV2 as a unique infectious entity as well as interesting evolutionary insights.

    DOI: 10.1128/jvi.02166-24

    PubMed

    researchmap

  • New lineages of RNA viruses from clinical isolates of Rhizopus microsporus revealed by fragmented and primer-ligated dsRNA sequencing (FLDS) analysis. 査読 国際誌

    Wasiatus Sa'diyah, Yan-Jie Zhao, Yuto Chiba, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki, Sayaka Ban, Takashi Yaguchi, Syun-Ichi Urayama, Daisuke Hagiwara

    mSphere   e0034524   2024年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Rhizopus microsporus is a species in the order Mucorales that is known to cause mucormycosis, but it is poorly understood as a host of viruses. Here, we examined 25 clinical strains of R. microsporus for viral infection with a conventional double-stranded RNA (dsRNA) assay using agarose gel electrophoresis (AGE) and the recently established fragmented and primer-ligated dsRNA sequencing (FLDS) protocol. By AGE, five virus-infected strains were detected. Then, full-length genomic sequences of 12 novel RNA viruses were revealed by FLDS, which were related to the families Mitoviridae, Narnaviridae, and Endornaviridae, ill-defined groups of single-stranded RNA (ssRNA) viruses with similarity to the established families Virgaviridae and Phasmaviridae, and the proposed family "Ambiguiviridae." All the characterized viruses, except a potential phasmavirid with a negative-sense RNA genome, had positive-sense RNA genomes. One virus belonged to a previously established species within the family Mitoviridae, whereas the other 11 viruses represented new species or even new genera. These results show that the fungal pathogen R. microsporus harbors diverse RNA viruses and extend our understanding of the diversity of RNA viruses in the fungal order Mucorales, division Mucoromycota. Identifying RNA viruses from clinical isolates of R. microsporus may expand the repertoire of natural therapeutic agents for mucormycosis in the future.IMPORTANCEThe diversity of mycoviruses in fungal hosts in the division Mucoromycota has been underestimated, mainly within the species Rhizopus microsporus. Only five positive-sense RNA genomes had previously been discovered in this species. Because current sequencing methods poorly complete the termini of genomes, we used fragmented and primer-ligated double-stranded RNA sequencing to acquire the full-length genomes. Eleven novel mycoviruses were detected in this study, including the first negative-sense RNA genome reported in R. microsporus. Our findings extend the understanding of the viral diversity in clinical strains of Mucoromycota, may provide insights into the pathogenesis and ecology of this fungus, and may offer therapeutic options.

    DOI: 10.1128/msphere.00345-24

    PubMed

    researchmap

  • Metatranscriptomic Sequencing of Sheath Blight-Associated Isolates of Rhizoctonia solani Revealed Multi-Infection by Diverse Groups of RNA Viruses. 査読 国際誌

    Michael Louie R Urzo, Timothy D Guinto, Ana Eusebio-Cope, Bernard O Budot, Mary Jeanie T Yanoria, Gilda B Jonson, Masao Arakawa, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Viruses   16 ( 7 )   2024年7月

     詳細を見る

    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Rice sheath blight, caused by the soil-borne fungus Rhizoctonia solani (teleomorph: Thanatephorus cucumeris, Basidiomycota), is one of the most devastating phytopathogenic fungal diseases and causes yield loss. Here, we report on a very high prevalence (100%) of potential virus-associated double-stranded RNA (dsRNA) elements for a collection of 39 fungal strains of R. solani from the rice sheath blight samples from at least four major rice-growing areas in the Philippines and a reference isolate from the International Rice Research Institute, showing different colony phenotypes. Their dsRNA profiles suggested the presence of multiple viral infections among these Philippine R. solani populations. Using next-generation sequencing, the viral sequences of the three representative R. solani strains (Ilo-Rs-6, Tar-Rs-3, and Tar-Rs-5) from different rice-growing areas revealed the presence of at least 36 viruses or virus-like agents, with the Tar-Rs-3 strain harboring the largest number of viruses (at least 20 in total). These mycoviruses or their candidates are believed to have single-stranded RNA or dsRNA genomes and they belong to or are associated with the orders Martellivirales, Hepelivirales, Durnavirales, Cryppavirales, Ourlivirales, and Ghabrivirales based on their coding-complete RNA-dependent RNA polymerase sequences. The complete genome sequences of two novel RNA viruses belonging to the proposed family Phlegiviridae and family Mitoviridae were determined.

    DOI: 10.3390/v16071152

    PubMed

    researchmap

  • Identification of a novel member of the genus Laulavirus (family Phenuiviridae) from the entomopathogenic ascomycete fungus Cordyceps javanica. 査読 国際誌

    Xinran Cao, Bo Liu, Ziqi Wang, Tianxing Pang, Liying Sun, Hideki Kondo, Junmin Li, Ida Bagus Andika, Shengqi Chi

    Archives of virology   169 ( 8 )   166 - 166   2024年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The virus family Phenuiviridae (order Hareavirales, comprising segmented negative-sense single stranded RNA viruses) has highly diverse members that are known to infect animals, plants, protozoans, and fungi. In this study, we identified a novel phenuivirus infecting a strain of the entomopathogenic fungus Cordyceps javanica isolated from a small brown plant hopper (Laodelphax striatellus), and this virus was tentatively named "Cordyceps javanica negative-strand RNA virus 1" (CjNRSV1). The CjNRSV1 genome consists of three negative-sense single stranded RNA segments (RNA1-3) with lengths of 7252, 2401, and 1117 nt, respectively. The 3'- and 5'-terminal regions of the RNA1, 2, and 3 segments have identical sequences, and the termini of the RNA segments are complementary to each other, reflecting a common characteristic of viruses in the order Hareavirales. RNA1 encodes a large protein (∼274 kDa) containing a conserved domain for the bunyavirus RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) superfamily, with 57-80% identity to the RdRP encoded by phenuiviruses in the genus Laulavirus. RNA2 encodes a protein (∼79 kDa) showing sequence similarity (47-63% identity) to the movement protein (MP, a plant viral cell-to-cell movement protein)-like protein (MP-L) encoded by RNA2 of laulaviruses. RNA3 encodes a protein (∼28 kDa) with a conserved domain of the phenuivirid nucleocapsid protein superfamily. Phylogenetic analysis using the RdRPs of various phenuiviruses and other unclassified phenuiviruses showed CjNRSV1 to be grouped with established members of the genus Laulavirus. Our results suggest that CjNRSV1 is a novel fungus-infecting member of the genus Laulavirus in the family Phenuiviridae.

    DOI: 10.1007/s00705-024-06069-5

    PubMed

    researchmap

  • Argonaute-independent, Dicer-dependent antiviral defense against RNA viruses. 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   121 ( 25 )   e2322765121   2024年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Antiviral RNA interference (RNAi) is conserved from yeasts to mammals. Dicer recognizes and cleaves virus-derived double-stranded RNA (dsRNA) and/or structured single-stranded RNA (ssRNA) into small-interfering RNAs, which guide effector Argonaute to homologous viral RNAs for digestion and inhibit virus replication. Thus, Argonaute is believed to be essential for antiviral RNAi. Here, we show Argonaute-independent, Dicer-dependent antiviral defense against dsRNA viruses using Cryphonectria parasitica (chestnut blight fungus), which is a model filamentous ascomycetous fungus and hosts a variety of viruses. The fungus has two dicer-like genes (dcl1 and dcl2) and four argonaute-like genes (agl1 to agl4). We prepared a suite of single to quadruple agl knockout mutants with or without dcl disruption. We tested these mutants for antiviral activities against diverse dsRNA viruses and ssRNA viruses. Although both DCL2 and AGL2 worked as antiviral players against some RNA viruses, DCL2 without argonaute was sufficient to block the replication of other RNA viruses. Overall, these results indicate the existence of a Dicer-alone defense and different degrees of susceptibility to it among RNA viruses. We discuss what determines the great difference in susceptibility to the Dicer-only defense.

    DOI: 10.1073/pnas.2322765121

    PubMed

    researchmap

  • 菌類,植物および動物の三界にまたがる宿主におけるシングルパルティティウイルス複製 査読 国際誌

    TELENGECH Paul Kipkemboi, HYODO Kiwamu, ICHIKAWA Hiroaki, KONDO Hideki, SUZUKI Nobuhiro

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web)   121 ( 25 )   e2318150121   2024年6月

     詳細を見る

  • Identification of a negative-strand RNA virus with natural plant and fungal hosts. 査読 国際誌

    Ruoyin Dai, Shian Yang, Tianxing Pang, Mengyuan Tian, Hao Wang, Dong Zhang, Yunfeng Wu, Hideki Kondo, Ida Bagus Andika, Zhensheng Kang, Liying Sun

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   121 ( 12 )   e2319582121   2024年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The presence of viruses that spread to both plant and fungal populations in nature has posed intriguingly scientific question. We found a negative-strand RNA virus related to members of the family Phenuiviridae, named Valsa mali negative-strand RNA virus 1 (VmNSRV1), which induced strong hypovirulence and was prevalent in a population of the phytopathogenic fungus of apple Valsa canker (Valsa mali) infecting apple orchards in the Shaanxi Province of China. Intriguingly, VmNSRV1 encodes a protein with a viral cell-to-cell movement function in plant tissue. Mechanical leaf inoculation showed that VmNSRV1 could systemically infect plants. Moreover, VmNSRV1 was detected in 24 out of 139 apple trees tested in orchards in Shaanxi Province. Fungal inoculation experiments showed that VmNSRV1 could be bidirectionally transmitted between apple plants and V. mali, and VmNSRV1 infection in plants reduced the development of fungal lesions on leaves. Additionally, the nucleocapsid protein encoded by VmNSRV1 is associated with and rearranged lipid droplets in both fungal and plant cells. VmNSRV1 represents a virus that has adapted and spread to both plant and fungal hosts and shuttles between these two organisms in nature (phyto-mycovirus) and is potential to be utilized for the biocontrol method against plant fungal diseases. This finding presents further insights into the virus evolution and adaptation encompassing both plant and fungal hosts.

    DOI: 10.1073/pnas.2319582121

    PubMed

    researchmap

  • Decoding the RNA virome of the tree parasite Armillaria provides new insights into the viral community of soil-borne fungi. 査読 国際誌

    Wajeeha Shamsi, Renate Heinzelmann, Sven Ulrich, Hideki Kondo, Carolina Cornejo

    Environmental microbiology   26 ( 2 )   e16583   2024年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The globally distributed basidiomycete genus Armillaria includes wood decomposers that can act as opportunistic parasites, causing deadly root rot on woody plants. To test whether RNA viruses are involved in this opportunistic behaviour, a large isolate collection of five Armillaria species collected over 40 years in Switzerland from trees, dead wood and soil was analysed. De novo assembly of RNA-Seq data revealed 21 viruses, 14 of which belong to putative new species. Two dsRNA viruses and an unclassified Tymovirales are formally described for the first time for Armillaria. One mitovirus occurred with a high prevalence of 71.1%, while all other viruses were much less prevalent (0.6%-16.9%). About half of all viruses were found only in one fungal species, others occurred in 2-6 fungal species. Co-infections of 2-7 viruses per isolate were not uncommon (34.9%), and most viruses persisted circulating within fungal populations for decades. Some viruses were related to viruses associated with other Armillaria species, supporting the hypothesis that virus transmission can occur between different fungal species. Although no specific correlation between viruses and the fungal trophic strategy was found, this study opens new insights into viral diversity hidden in the soil microbiome.

    DOI: 10.1111/1462-2920.16583

    PubMed

    researchmap

  • Possible biological control of ash dieback using the mycoparasite Hymenoscyphus fraxineus mitovirus 2. 査読 国際誌

    Wajeeha Shamsi, Jana Mittelstrass, Sven Ulrich, Hideki Kondo, Daniel Rigling, Simone Prospero

    Phytopathology   114 ( 5 )   1020 - 1027   2023年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Invasive fungal diseases represent a major threat to forest ecosystems worldwide. As the application of fungicides is often unfeasible and not a sustainable solution, only a few other control options are available, including biological control. In this context, the use of parasitic mycoviruses as biocontrol agents of fungal pathogens has recently gained particular attention. Since the 1990s, the Asian fungus Hymenoscyphus fraxineus has been causing lethal ash dieback across Europe. In the present study, we investigated the biocontrol potential of the mitovirus Hymenoscyphus fraxineus mitovirus 2 (HfMV2) previously identified in Japanese populations of the pathogen. HfMV2 could be successfully introduced via co-culturing into 16 out of 105 HfMV2-free isolates. Infection with HfMV2 had contrasting effects on fungal growth in vitro, from cryptic to detrimental or beneficial. Virus-infected H. fraxineus isolates whose growth was reduced by HfMV2 showed overall a lower virulence on ash (Fraxinus excelsior) saplings as compared to their isogenic HfMV2-free lines. The results suggest that mycoviruses exist in the native populations of H. fraxineus in Asia that have the potential for biological control of ash dieback in Europe.

    DOI: 10.1094/PHYTO-09-23-0346-KC

    PubMed

    researchmap

  • Annual (2023) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota). 査読 国際誌

    Jens H Kuhn, Junya Abe, Scott Adkins, Sergey V Alkhovsky, Tatjana Avšič-Županc, María A Ayllón, Justin Bahl, Anne Balkema-Buschmann, Matthew J Ballinger, Virendra Kumar Baranwal, Martin Beer, Nicolas Bejerman, Éric Bergeron, Nadine Biedenkopf, Carol D Blair, Kim R Blasdell, Arnaud G Blouin, Steven B Bradfute, Thomas Briese, Paul A Brown, Ursula J Buchholz, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity Burt, Carmen Büttner, Charles H Calisher, Mengji Cao, Inmaculada Casas, Kartik Chandran, Rémi N Charrel, Krishna Kumar Chaturvedi, Kar Mun Chooi, Anya Crane, Elena Dal Bó, Juan Carlos de la Torre, William M de Souza, Rik L de Swart, Humberto Debat, Nolwenn M Dheilly, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G Dietzgen, Michele Digiaro, J Felix Drexler, W Paul Duprex, Ralf Dürrwald, Andrew J Easton, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Guozhong Feng, Andrew E Firth, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Juliana Freitas-Astúa, Selma Gago-Zachert, María Laura García, Adolfo García-Sastre, Aura R Garrison, Thomas R Gaskin, Wenjie Gong, Jean-Paul J Gonzalez, JoëlleGoüy de Bellocq, Anthony Griffiths, Martin H Groschup, Ines Günther, Stephan Günther, John Hammond, Yusuke Hasegawa, Kazusa Hayashi, Jussi Hepojoki, Colleen M Higgins, Seiji Hongō, Masayuki Horie, Holly R Hughes, Adam J Hume, Timothy H Hyndman, Kenichi Ikeda, Dàohóng Jiāng, Gilda B Jonson, Sandra Junglen, Boris Klempa, Jonas Klingström, Hideki Kondō, Eugene V Koonin, Mart Krupovic, Kenji Kubota, Gael Kurath, Lies Laenen, Amy J Lambert, Jiànróng Lǐ, Jun-Min Li, Ran Liu, Igor S Lukashevich, Robin M MacDiarmid, Piet Maes, Marco Marklewitz, Sergio H Marshall, Shin-Yi L Marzano, John W McCauley, Ali Mirazimi, Elke Mühlberger, Tomoyuki Nabeshima, Rayapati Naidu, Tomohide Natsuaki, Beatriz Navarro, José A Navarro, Yutaro Neriya, Sergey V Netesov, Gabriele Neumann, Norbert Nowotny, Márcio R T Nunes, Francisco M Ochoa-Corona, Tomoyuki Okada, Gustavo Palacios, Vicente Pallás, Anna Papa, Sofia Paraskevopoulou, Colin R Parrish, Alex Pauvolid-Corrêa, Janusz T Pawęska, Daniel R Pérez, Florian Pfaff, Richard K Plemper, Thomas S Postler, Lee O Rabbidge, Sheli R Radoshitzky, Pedro L Ramos-González, Marius Rehanek, Renato O Resende, Carina A Reyes, Thaís C S Rodrigues, Víctor Romanowski, Dennis Rubbenstroth, Luisa Rubino, Jonathan A Runstadler, Sead Sabanadzovic, Sabrina Sadiq, Maria S Salvato, Takahide Sasaya, Martin Schwemmle, Stephen R Sharpe, Mang Shi, Yoshifumi Shimomoto, Venkidusamy Kavi Sidharthan, Manuela Sironi, Sophie Smither, Jin-Won Song, Kirsten M Spann, Jessica R Spengler, Mark D Stenglein, Ayato Takada, Sawana Takeyama, Akio Tatara, Robert B Tesh, Natalie J Thornburg, Xin Tian, Nicole D Tischler, Yasuhiro Tomitaka, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Changchun Tu, Massimo Turina, Ioannis E Tzanetakis, Anna Maria Vaira, Bernadette van den Hoogen, Bert Vanmechelen, Nikos Vasilakis, Martin Verbeek, Susanne von Bargen, Jiro Wada, Victoria Wahl, Peter J Walker, Thomas B Waltzek, Anna E Whitfield, Yuri I Wolf, Han Xia, Evanthia Xylogianni, Hironobu Yanagisawa, Kazutaka Yano, Gongyin Ye, Zhiming Yuan, F Murilo Zerbini, Guilin Zhang, Song Zhang, Yong-Zhen Zhang, Lu Zhao, Arnfinn Lodden Økland

    The Journal of general virology   104 ( 8 )   2023年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In April 2023, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was amended and emended. The phylum was expanded by one new family, 14 new genera, and 140 new species. Two genera and 538 species were renamed. One species was moved, and four were abolished. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as now accepted by the ICTV.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001864

    PubMed

    researchmap

  • Identification of a novel dicistro-like virus associated with the roots of tomato plants. 査読 国際誌

    Xinran Cao, Ziqi Wang, Jianguo Pang, Liying Sun, Hideki Kondo, Ida Bagus Andika

    Archives of virology   168 ( 8 )   214 - 214   2023年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Viruses belonging to the family Dicistroviridae have a monopartite positive-sense single-stranded RNA genome and infect a variety of arthropods. Using high-throughput sequencing, we detected a novel dicistro-like virus, tentatively named "tomato root-associated dicistro-like virus" (TRaDLV), in the roots of tomato plants showing yellow mosaic symptoms on the leaves. The diseased tomato plants were coinfected with multiple plant viruses, and TRaDLV was present in the roots but not in the leaves. The genome of TRaDLV is 8726 nucleotides in length, excluding the poly(A) tail, and contains two open reading frames (ORFs) separated by an intergenic region (IGR). The TRaDLV genome showed characteristics similar to those of dicistroviruses, including the presence of a 3C-like protease domain, repeated amino acid sequences representing multiple copies of viral genome-linked protein (VPg)-like sequences in the ORF1 polyprotein, and a series of stem-loop structures resembling an internal ribosome entry site in the IGR. Phylogenetic analysis revealed that TRaDLV clustered with unclassified dicistro-like viruses from invertebrates or identified in samples of plant-derived material. These findings indicate the existence of a novel dicistro-like virus that may associate with plant roots or a root-inhabiting organism.

    DOI: 10.1007/s00705-023-05843-1

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Hadakaviridae 2023 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Massimo Turina, Sotaro Chiba, Ryo Okada, Muhammad F. Bhatti, Ioly Kotta-Loizou, Robert H. A. Coutts, Hideki Kondo, Sead Sabanadzovic, Nobuhiro Suzuki

    Journal of General Virology   104 ( 1 )   2023年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Microbiology Society  

    The family Hadakaviridae, including the genus Hadakavirus, accommodates capsidless viruses with a 10- or 11-segmented positive-sense (+) RNA genome. Currently known hosts are ascomycetous filamentous fungi. Although phylogenetically related to polymycovirids with a segmented double-stranded RNA genome and certain encapsidated picorna-like viruses, hadakavirids are distinct in their lack of a capsid (‘hadaka’ means naked in Japanese) and their consequent inability to be pelleted by conventional ultracentrifugation; they show ribonuclease susceptibility in host tissue homogenates. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Report on the family Hadakaviridae, which is available at ictv.global/report/hadakaviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001820

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Yadokariviridae 2023. 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Subha Das, Leonardo Velasco, Massimo Turina, Hideki Osaki, Ioly Kotta-Loizou, Robert H A Coutts, Hideki Kondo, Sead Sabanadzovic, Nobuhiro Suzuki, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   104 ( 1 )   2023年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The family Yadokariviridae, with the genera Alphayadokarivirus and Betayadokarivirus, includes capsidless non-segmented positive-sense (+) RNA viruses that hijack capsids from phylogenetically distant double-stranded RNA viruses. Yadokarivirids likely replicate inside the hijacked heterocapsids using their own RNA-directed RNA polymerase, mimicking dsRNA viruses despite their phylogenetic placement in a (+) RNA virus lineage. Yadokarivirids can have negative or positive impacts on their host fungi, through interactions with the capsid donor dsRNA viruses. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) report on the family Yadokariviridae, which is available at ictv.global/report/yadokariviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001826

    PubMed

    researchmap

  • 2022 taxonomic update of phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales. 査読 国際誌

    Jens H Kuhn, Scott Adkins, Sergey V Alkhovsky, Tatjana Avšič-Županc, María A Ayllón, Justin Bahl, Anne Balkema-Buschmann, Matthew J Ballinger, Martina Bandte, Martin Beer, Nicolas Bejerman, Éric Bergeron, Nadine Biedenkopf, Laurent Bigarré, Carol D Blair, Kim R Blasdell, Steven B Bradfute, Thomas Briese, Paul A Brown, Rémy Bruggmann, Ursula J Buchholz, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity Burt, Carmen Büttner, Charles H Calisher, Thierry Candresse, Jeremy Carson, Inmaculada Casas, Kartik Chandran, Rémi N Charrel, Yuya Chiaki, Anya Crane, Mark Crane, Laurent Dacheux, Elena Dal Bó, Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, William M de Souza, Rik L de Swart, Nolwenn M Dheilly, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G Dietzgen, Michele Digiaro, J Felix Drexler, W Paul Duprex, Ralf Dürrwald, Andrew J Easton, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Guozhong Feng, Claudette Feuvrier, Andrew E Firth, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Juliana Freitas-Astúa, Selma Gago-Zachert, María Laura García, Adolfo García-Sastre, Aura R Garrison, Scott E Godwin, Jean-Paul J Gonzalez, Joëlle Goüy de Bellocq, Anthony Griffiths, Martin H Groschup, Stephan Günther, John Hammond, Jussi Hepojoki, Melanie M Hierweger, Seiji Hongō, Masayuki Horie, Hidenori Horikawa, Holly R Hughes, Adam J Hume, Timothy H Hyndman, Dàohóng Jiāng, Gilda B Jonson, Sandra Junglen, Fujio Kadono, David G Karlin, Boris Klempa, Jonas Klingström, Michel C Koch, Hideki Kondō, Eugene V Koonin, Jarmila Krásová, Mart Krupovic, Kenji Kubota, Ivan V Kuzmin, Lies Laenen, Amy J Lambert, Jiànróng Lǐ, Jun-Min Li, François Lieffrig, Igor S Lukashevich, Dongsheng Luo, Piet Maes, Marco Marklewitz, Sergio H Marshall, Shin-Yi L Marzano, John W McCauley, Ali Mirazimi, Peter G Mohr, Nick J G Moody, Yasuaki Morita, Richard N Morrison, Elke Mühlberger, Rayapati Naidu, Tomohide Natsuaki, José A Navarro, Yutaro Neriya, Sergey V Netesov, Gabriele Neumann, Norbert Nowotny, Francisco M Ochoa-Corona, Gustavo Palacios, Laurane Pallandre, Vicente Pallás, Anna Papa, Sofia Paraskevopoulou, Colin R Parrish, Alex Pauvolid-Corrêa, Janusz T Pawęska, Daniel R Pérez, Florian Pfaff, Richard K Plemper, Thomas S Postler, Françoise Pozet, Sheli R Radoshitzky, Pedro L Ramos-González, Marius Rehanek, Renato O Resende, Carina A Reyes, Víctor Romanowski, Dennis Rubbenstroth, Luisa Rubino, Artemis Rumbou, Jonathan A Runstadler, Melanie Rupp, Sead Sabanadzovic, Takahide Sasaya, Heike Schmidt-Posthaus, Martin Schwemmle, Torsten Seuberlich, Stephen R Sharpe, Mang Shi, Manuela Sironi, Sophie Smither, Jin-Won Song, Kirsten M Spann, Jessica R Spengler, Mark D Stenglein, Ayato Takada, Robert B Tesh, Jana Těšíková, Natalie J Thornburg, Nicole D Tischler, Yasuhiro Tomitaka, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Kenta Tsunekawa, Massimo Turina, Ioannis E Tzanetakis, Anna Maria Vaira, Bernadette van den Hoogen, Bert Vanmechelen, Nikos Vasilakis, Martin Verbeek, Susanne von Bargen, Jiro Wada, Victoria Wahl, Peter J Walker, Anna E Whitfield, John V Williams, Yuri I Wolf, Junki Yamasaki, Hironobu Yanagisawa, Gongyin Ye, Yong-Zhen Zhang, Arnfinn Lodden Økland

    Archives of virology   167 ( 12 )   2857 - 2906   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In March 2022, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was amended and emended. The phylum was expanded by two new families (bunyaviral Discoviridae and Tulasviridae), 41 new genera, and 98 new species. Three hundred forty-nine species were renamed and/or moved. The accidentally misspelled names of seven species were corrected. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as now accepted by the ICTV.

    DOI: 10.1007/s00705-022-05546-z

    PubMed

    researchmap

  • Natural Cross-Kingdom Spread of Apple Scar Skin Viroid from Apple Trees to Fungi. 査読 国際誌

    Mengyuan Tian, Shuang Wei, Ruiling Bian, Jingxian Luo, Haris Ahmed Khan, Huanhuan Tai, Hideki Kondo, Ahmed Hadidi, Ida Bagus Andika, Liying Sun

    Cells   11 ( 22 )   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Viroids are the smallest known infectious agents that are thought to only infect plants. Here, we reveal that several species of plant pathogenic fungi that were isolated from apple trees infected with apple scar skin viroid (ASSVd) carried ASSVd naturally. This finding indicates the spread of viroids to fungi under natural conditions and further suggests the possible existence of mycoviroids in nature. A total of 117 fungal isolates were isolated from ASSVd-infected apple trees, with the majority (85.5%) being an ascomycete Alternaria alternata and the remaining isolates being other plant-pathogenic or -endophytic fungi. Out of the examined samples, viroids were detected in 81 isolates (69.2%) including A. alternata as well as other fungal species. The phenotypic comparison of ASSVd-free specimens developed by single-spore isolation and ASSVd-infected fungal isogenic lines showed that ASSVd affected the growth and pathogenicity of certain fungal species. ASSVd confers hypovirulence on ascomycete Epicoccum nigrum. The mycobiome analysis of apple tree-associated fungi showed that ASSVd infection did not generally affect the diversity and structure of fungal communities but specifically increased the abundance of Alternaria species. Taken together, these data reveal the occurrence of the natural spread of viroids to plants; additionally, as an integral component of the ecosystem, viroids may affect the abundance of certain fungal species in plants. Moreover, this study provides further evidence that viroid infection could induce symptoms in certain filamentous fungi.

    DOI: 10.3390/cells11223686

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Mymonaviridae 2022. 査読 国際誌

    Dàohóng Jiāng, María A Ayllón, Shin-Yi L Marzano, Hideki Kondō, Massimo Turina, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   103 ( 11 )   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Typical members of the family Mymonaviridae produce filamentous, enveloped virions containing a single molecule of linear, negative-sense RNA of about about 10 kb, but some may not produce any virions. The family includes several genera, some with multiple species. Mymonavirids usually infect filamentous fungi, but a few have been identified associated with insects, oomycetes or plants. At least one virus, Sclerotinia sclerotiorum negative-stranded RNA virus 1, induces hypovirulence in its fungal host. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Report on the family Mymonaviridae, which is available at ictv.global/report/mymonaviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001787

    PubMed

    researchmap

  • Identification of novel totiviruses from the ascomycetous fungus Geotrichum candidum. 査読 国際誌

    Haris Ahmed Khan, Hideki Kondo, Sabitree Shahi, Muhammad Faraz Bhatti, Nobuhiro Suzuki

    Archives of virology   2022年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Mycoviruses are widely distributed across the kingdom Fungi, including ascomycetous yeast strains of the class Saccharomycetes. Geotrichum candidum is an important fungal pathogen belonging to Saccharomycetes and has a diverse host range. Here, we report the characterization of four new classical totiviruses from two distinct Geotrichum candidum strains from Pakistan. The four identified viruses were tentatively named "Geotrichum candidum totivirus 1, 2, 3a, and 3b" (GcTV1-3b). The complete dsRNA genomes of the identified totiviruses are 4621, 4592, 4576, and 4576 bp in length, respectively. All totivirus genomes have two open reading frames, encoding a capsid protein (CP) and an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP), respectively. The downstream RdRP domain is assumed to be expressed as a CP-RdRP fusion product via -1 frameshifting mediated by a heptameric slippery site. Sequence comparisons and phylogenetic analysis showed that each of the discovered viruses belongs to a new species of the genus Totivirus in the family Totiviridae, with GcTV1 and GcTV3 (a and b strains) clustering in one subgroup and GcTV2 in another subgroup.

    DOI: 10.1007/s00705-022-05611-7

    PubMed

    researchmap

  • Common but Nonpersistent Acquisitions of Plant Viruses by Plant-Associated Fungi. 査読 国際誌

    Xinran Cao, Jie Liu, Jianguo Pang, Hideki Kondo, Shengqi Chi, Jianfeng Zhang, Liying Sun, Ida Bagus Andika

    Viruses   14 ( 10 )   2022年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Investigating a virus's host range and cross-infection is important for better understanding the epidemiology and emergence of viruses. Previously, our research group discovered a natural infection of a plant RNA virus, cumber mosaic virus (genus Cucumovirus, family Bromoviridae), in a plant pathogenic basidiomycetous fungus, Rhizoctonia solani, isolated from a potato plant grown in the field. Here, we further extended the study to investigate whether similar cross-infection of plant viruses occurs widely in plant-associated fungi in natural conditions. Various vegetable plants such as spinach, leaf mustard, radish, celery, and other vegetables that showed typical virus-like diseases were collected from the fields in Shandong Province, China. High-throughput sequencing revealed that at least 11 known RNA viruses belonging to different genera, including Potyvirus, Fabavirus, Polerovirus, Waikavirus, and Cucumovirus, along with novel virus candidates belonging to other virus genera, infected or associated with the collected vegetable plants, and most of the leaf samples contained multiple plant viruses. A large number of filamentous fungal strains were isolated from the vegetable leaf samples and subjected to screening for the presence of plant viruses. RT-PCR and Sanger sequencing of the PCR products revealed that among the 169 fungal strains tested, around 50% were carrying plant viruses, and many of the strains harbored multiple plant viruses. The plant viruses detected in the fungal isolates were diverse (10 virus species) and not limited to particular virus genera. However, after prolonged maintenance of the fungal culture in the laboratory, many of the fungal strains have lost the virus. Sequencing of the fungal DNA indicated that most of the fungal strains harboring plant viruses were related to plant pathogenic and/or endophytic fungi belonging to the genera Alternaria, Lecanicillium, and Sarocladium. These observations suggest that the nonpersistent acquisition of plant viruses by fungi may commonly occur in nature. Our findings highlight a possible role for fungi in the life cycle, spread, and evolution of plant viruses.

    DOI: 10.3390/v14102279

    PubMed

    researchmap

  • Novel RNA viruses from the native range of Hymenoscyphus fraxineus, the causal fungal agent of ash dieback. 査読 国際誌

    Wajeeha Shamsi, Hideki Kondo, Sven Ulrich, Daniel Rigling, Simone Prospero

    Virus research   320   198901 - 198901   2022年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The native Japanese population of the fungus Hymenoscyphus fraxineus, the causal agent of ash dieback in Europe, was screened for viruses using a high-throughput sequencing method. Five RNA viruses were detected in 116 fungal isolates sequenced via Illumina RNA-seq platform, with an overall virus prevalence of 11.2%. The viruses were completely sequenced by RNA ligase mediated rapid amplification of cDNA ends (RLM-RACE) followed by Sanger sequencing. The sequences appear to represent new species from three established families (Mito-, Endorna- and Partitiviridae), one recognized genus (Botybirnavirus) and a negative-sense single-stranded RNA virus in the order Bunyavirales from the proposed family "Mybuviridae". The highest prevalence was found for the mitovirus (7.8%), that had two genomic forms (linear and circular), while the other viruses were detected each in one isolate. Co-infection of a mitovirus and an endornavirus was also observed in one of the infected isolates. Here we describe the molecular characterization of the identified viruses. This study expands the diversity of viruses in H. fraxineus and provides the basis for investigating the virus-mediated control of ash dieback in Europe.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2022.198901

    PubMed

    researchmap

  • Three-Layered Complex Interactions among Capsidless (+)ssRNA Yadokariviruses, dsRNA Viruses, and a Fungus 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Sakae Hisano, Carlos José López-Herrera, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    mBio   13 ( 5 )   e0168522   2022年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:American Society for Microbiology  

    A capsidless (+)ssRNA virus YkV1 (family Yadokariviridae ) highjacks the capsid of an unrelated dsRNA virus YnV1 (proposed family “ Yadonushiviridae ”) in a phytopathogenic ascomycete, while YkV1 trans -enhances YnV1 replication. Herein, we identified the dsRNA virus partners of three yadokariviruses (YkV3, YkV4a, and YkV4b) with genome organization different from YkV1 as being different from YnV1 at the suborder level.

    DOI: 10.1128/mbio.01685-22

    PubMed

    researchmap

  • A Transfectable Fusagravirus from a Japanese Strain of Cryphonectria carpinicola with Spherical Particles. 査読 国際誌

    Subha Das, Sakae Hisano, Ana Eusebio-Cope, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Viruses   14 ( 8 )   2022年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A novel dsRNA virus (Cryphonectria carpinicola fusagravirus 1, CcFGV1), isolated from a Japanese strain (JS13) of Cryphonectria carpinicola, was thoroughly characterized. The biological comparison of a set of isogenic CcFGV1-infected and -free (JS13VF) strains indicated asymptomatic infection by CcFGV1. The sequence analysis showed that the virus has a two open reading frame (ORF) genome of 9.6 kbp with the RNA-directed RNA polymerase domain encoded by ORF2. The N-terminal sequencing and peptide mass fingerprinting showed an N-terminally processed or degraded product (150 kDa) of the 5'-proximal ORF1-encoded protein (1462 amino acids) to make up the CcFGV1 spherical particles of ~40 nm in diameter. Interestingly, a portion of CcFGV1 dsRNA co-fractionated with a host protein of 70 kDa. The purified CcFGV1 particles were used to transfect protoplasts of JS13VF as well as the standard strain of an experimental model filamentous fungal host Cryphonectria parasitica. CcFGV1 was confirmed to be associated with asymptomatic infection of both fungi. RNA silencing was shown to target the virus in C. parasitica, resulting in reduced CcFGV1 accumulation by comparing the CcFGV1 content between RNA silencing-competent and -deficient strains. These results indicate the transfectability of spherical particles of a fusagravirus associated with asymptomatic infection.

    DOI: 10.3390/v14081722

    PubMed

    researchmap

  • Mycovirus Hunting Revealed the Presence of Diverse Viruses in a Single Isolate of the Phytopathogenic Fungus Diplodia seriata From Pakistan 査読

    Haris Ahmed Khan, Paul Telengech, Hideki Kondo, Muhammad Faraz Bhatti, Nobuhiro Suzuki

    Frontiers in Cellular and Infection Microbiology   12   2022年6月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Frontiers Media SA  

    Diplodia seriata in the family Botryosphaeriaceae is a cosmopolitan phytopathogenic fungus and is responsible for causing cankers, fruit rot and leaf spots on economically important plants. In this study, we characterized the virome of a single Pakistani strain (L3) of D. seriata. Several viral-like contig sequences were obtained via a previously conducted next-generation sequencing analysis. Multiple infection of the L3 strain by eight RNA mycoviruses was confirmed through RT-PCR using total RNA samples extracted from this strain; the entire genomes were determined via Sanger sequencing of RT-PCR and RACE clones. A BLAST search and phylogenetic analyses indicated that these eight mycoviruses belong to seven different viral families. Four identified mycoviruses belong to double-stranded RNA viral families, including Polymycoviridae, Chrysoviridae, Totiviridae and Partitiviridae, and the remaining four identified mycoviruses belong to single-stranded RNA viral families, i.e., Botourmiaviridae, and two previously proposed families “Ambiguiviridae” and “Splipalmiviridae”. Of the eight, five mycoviruses appear to represent new virus species. A morphological comparison of L3 and partially cured strain L3ht1 suggested that one or more of the three viruses belonging to Polymycoviridae, “Splipalmiviridae” and “Ambiguiviridae” are involved in the irregular colony phenotype of L3. To our knowledge, this is the first report of diverse virome characterization from D. seriata.

    DOI: 10.3389/fcimb.2022.913619

    researchmap

  • Coat protein of Chinese wheat mosaic virus upregulates and interacts with cytosolic glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, a negative regulator of plant autophagy, to promote virus infection. 査読 国際誌

    Erbo Niu, Chaozheng Ye, Wanying Zhao, Hideki Kondo, Yunfeng Wu, Jianping Chen, Ida Bagus Andika, Liying Sun

    Journal of integrative plant biology   2022年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Autophagy is an intracellular degradation mechanism involved in antiviral defense, but the strategies employed by plant viruses to counteract autophagy-related defense remain unknown for the majority of the viruses. Herein, we describe how the Chinese wheat mosaic virus (CWMV, genus Furovirus) interferes with autophagy and enhances its infection in Nicotiana benthamiana. Yeast two-hybrid screening and in vivo/in vitro assays revealed that the 19 kDa coat protein (CP19K) of CWMV interacts with cytosolic glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenases (GAPCs), negative regulators of autophagy, which bind autophagy-related protein 3 (ATG3), a key factor in autophagy. CP19K also directly interacts with ATG3, possibly leading to the formation of a CP19K-GAPC-ATG3 complex. CP19K-GAPC interaction appeared to intensify CP19K-ATG3 binding. Moreover, CP19K expression upregulated GAPC gene transcripts and reduced autophagic activities. Accordingly, the silencing of GAPC genes in transgenic N. benthamiana reduced CWMV accumulation, whereas CP19K overexpression enhanced it. Overall, our results suggest that CWMV CP19K interferes with autophagy through the promotion and utilization of the GAPC role as a negative regulator of autophagy. This article is protected by copyright. All rights reserved.

    DOI: 10.1111/jipb.13313

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Rhabdoviridae 2022. 査読 国際誌

    Peter J Walker, Juliana Freitas-Astúa, Nicolas Bejerman, Kim R Blasdell, Rachel Breyta, Ralf G Dietzgen, Anthony R Fooks, Hideki Kondo, Gael Kurath, Ivan V Kuzmin, Pedro Luis Ramos-González, Mang Shi, David M Stone, Robert B Tesh, Noël Tordo, Nikos Vasilakis, Anna E Whitfield, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   103 ( 6 )   2022年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The family Rhabdoviridae comprises viruses with negative-sense (-) RNA genomes of 10-16 kb. Virions are typically enveloped with bullet-shaped or bacilliform morphology but can also be non-enveloped filaments. Rhabdoviruses infect plants or animals, including mammals, birds, reptiles, amphibians or fish, as well as arthropods, which serve as single hosts or act as biological vectors for transmission to animals or plants. Rhabdoviruses include important pathogens of humans, livestock, fish or agricultural crops. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Report on the family Rhabdoviridae, which is available at ictv.global/report/rhabdoviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001689

    PubMed

    researchmap

  • A novel deltapartitivirus from red clover. 査読 国際誌

    Paul Telengech, Sabitree Shahi, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Archives of virology   167 ( 4 )   1201 - 1204   2022年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The family Partitiviridae has five genera, among which is the genus Deltapartitivirus. We report here the complete genome sequence of a deltapartitivirus from red clover, termed "red clover cryptic virus 3" (RCCV3). RCCV3 has a bisegmented double-stranded (ds) RNA genome. dsRNA1 and dsRNA2 are 1580 and 1589 nucleotides (nt) in length and are predicted to encode an RNA-directed RNA polymerase (RdRP) and a capsid protein (CP), respectively. The RCCV3 RdRP shares the highest sequence identity with the RdRP of a previously reported deltapartitivirus, Medicago sativa deltapartitivirus 1 (MsDPV1) (76.5%), while the RCCV3 CP shows 50% sequence identity to the CP of MsDPV1. RdRP- and CP-based phylogenetic trees place RCCV3 into a clade of deltapartitiviruses. The sequence and phylogenetic analyses clearly indicate that RCCV3 represents a new species in the genus Deltapartitivirus. RCCV3 was detectable in all three tested cultivars of red clover.

    DOI: 10.1007/s00705-022-05372-3

    PubMed

    researchmap

  • A novel victorivirus from the phytopathogenic fungus Neofusicoccum parvum. 査読 国際誌

    Haris Ahmed Khan, Yukiyo Sato, Hideki Kondo, Atif Jamal, Muhammad Faraz Bhatti, Nobuhiro Suzuki

    Archives of virology   167 ( 3 )   923 - 929   2022年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Neofusicoccum parvum is an important plant-pathogenic ascomycetous fungus that causes trunk diseases in a variety of plants. A limited number of reports on mycoviruses from this fungus are available. Here, we report the characterization of a novel victorivirus, Neofusicoccum parvum victorivirus 3 (NpVV3). An agarose gel dsRNA profile of a Pakistani strain of N. parvum, NFN, showed a band of ~5 kbp that was not detectable in Japanese strains of N. parvum. Taking a high-throughput and Sanger sequencing approach, the complete genome sequence of NpVV3 was determined to be 5226 bp in length with two open reading frames (ORF1 and ORF2) that encode a capsid protein (CP) and an RNA-dependent RNA polymerase (RdRP). The RdRP appears to be translated by a stop/restart mechanism facilitated by the junction sequence AUGucUGA, as is found in some other victoriviruses. BLASTp searches showed that NpVV3 CP and RdRP share the highest amino acid sequence identity (80.5% and 72.4%, respectively) with the corresponding proteins of NpVV1 isolated from a French strain of N. parvum. However, NpVV3 was found to be different from NpVV1 in its terminal sequences and the stop/restart facilitator sequence. NpVV3 particles ~35 nm in diameter were partially purified and used to infect an antiviral-RNA-silencing-deficient strain (∆dcl2) of an experimental ascomycetous fungal host, Cryphonectria parasitica. NpVV3 showed symptomless infection in the new host strain.

    DOI: 10.1007/s00705-021-05304-7

    PubMed

    researchmap

  • Plant viruses and viroids in Japan 査読

    Shin ichi Fuji, Tomofumi Mochizuki, Mitsuru Okuda, Shinya Tsuda, Satoshi Kagiwada, Ken Taro Sekine, Masashi Ugaki, Keiko T. Natsuaki, Masamichi Isogai, Tetsuo Maoka, Minoru Takeshita, Nobuyuki Yoshikawa, Kazuyuki Mise, Takahide Sasaya, Hideki Kondo, Kenji Kubota, Yasuyuki Yamaji, Toru Iwanami, Kazusato Ohshima, Kappei Kobayashi, Tatsuji Hataya, Teruo Sano, Nobuhiro Suzuki

    Journal of General Plant Pathology   88 ( 2 )   105 - 127   2022年3月

  • First Report of Chinese wheat mosaic virus Infecting Barley in Japan. 査読 国際誌

    Hideki Kondo, Hidekazu Masejima, Kazuyuki Maruyama, Miki Fujita, Takehiro Ohki

    Plant disease   2022年1月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Chinese wheat mosaic virus (CWMV), a member of the genus Furovirus in the family Virgaviridae (Adams et al. 2017), has a positive-sense RNA genome and is transmitted by Polymyxa graminis. CWMV is a causal agent of yellow mosaic disease in winter wheat in China (Guo et al. 2019). CWMV has also been detected in wheat plants in limited areas of the northern Japan (Nagano and Iwate Prefectures) (Fuji et al. 2022; Maeshima et al. 2010; Shirako and Maejima 2008). In preliminary tests using Western blotting with an antiserum raised against CWMV capsid protein (by Dr Y. Shirako, Tokyo University), we detected a furovirus in a breeding line of barley, "Tozan Kawa 111" (Hordeum vulgare L.) (collected in April 2012), grown in an experimental field infested with CWMV and wheat yellow mosaic virus (genus Bymovirus) in Nagano Prefecture. To investigate the infection of barley plants with cereal plant-associated soil-borne viruses, we collected leaf samples of "Tozan Kawa 111" plants (ten plants) showing yellow mosaic symptoms, but with not apparent wilting or stunting (Fig. S1A) in April 2016 (2015/16 growing season). Total RNA was extracted from symptomatic leave samples with TaKaRa RNAiso reagent (TaKaRa Bio) and subjected to reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) to detect virus agents. After cDNA synthesis using Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase (Thermo Fisher Scientific) with random hexamers, PCR amplification with QuickTaq HS Dye Mix (Toyobo Co.) was conducted using primer sets specific to two furoviruses and three bymoviruses (Fig. S1B) known to infect wheat and/or barley plants in Japan (Tamada and Kondo 2013). RT-PCR analysis detected infection with CWMV in the leaf samples of "Tozan Kawa 111" plants (Fig. S1B), but not the other soil-borne viruses tested. The amplified PCR products (752 and 718 bp for CWMV RNA1 and RNA2, respectively) were purified by Wizard® SV Gel and PCR Clean-Up System (Promega) and subjected to Sanger sequencing to confirm their nucleotide sequences. The virus sequences from PCR amplicons were deposited in GenBank/DDBJ/ENA with accession numbers LC657081 (RNA1) and LC657082 (RNA2). Nucleotide Basic Local Alignment Search Tool (BLASTn) analysis showed that the sequences have 98.7% and 98.8% nucleotide sequence identity with RNA1 of CWMV Japanese northern isolate (accession No, AB299271) and RNA2 of CWMV Nagano-A isolate (AB935554), respectively. Identical sequences were also found in symptomatic wheat leaf samples ("Fukuho Komugi" cultivar) obtained from the same field (Fig. S1B). Rod-shaped particles were observed by transmission electron microscopy (Hitachi H-7650) in symptomatic "Tozan Kawa 111" leaf samples (Fig. S1C). Using reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (Fukuta et al. 2013), CWMV was detected in "Tozan Kawa 111" plants in the same field in the 2015/16-2017/18 growing seasons, but not in the 2018/19-2020/21 growing seasons (Fig. S1D). In the 2015/16-2017/18 growing seasons, CWMV was detected in the barley plants (pooled five plant samples) cultivar "Kashima-mugi", which showed similar yellow mosaic symptoms (Fig. S1D), but not in most of the other barley variants planted in the field. To our knowledge, this is the first report of CWMV field infection in plants other than wheat (Kuhne 2009). Further extensive virus screening in the fields and virus inoculation experiments are necessary to understand the pathology of CWMV in barley and possibly in other cereal crops.

    DOI: 10.1094/PDIS-12-21-2803-PDN

    PubMed

    researchmap

  • A new tetra-segmented splipalmivirus with divided RdRP domains from Cryphonectria naterciae, a fungus found on chestnut and cork oak trees in Europe. 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Sabitree Shahi, Paul Telengech, Sakae Hisano, Carolina Cornejo, Daniel Rigling, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Virus research   307   198606 - 198606   2022年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Positive-sense (+), single-stranded (ss) RNA viruses with divided RNA-dependent RNA polymerase (RdRP) domains have been reported from diverse filamentous ascomycetes since 2020. These viruses are termed splipalmiviruses or polynarnaviruses and have been characterized largely at the sequence level, but ill-defined biologically. Cryphonectria naterciae, from which only one virus has been reported, is an ascomycetous fungus potentially plant-pathogenic to chestnut and oak trees. We molecularly characterized multiple viruses in a single Portuguese isolate (C0614) of C. naterciae, taking a metatranscriptomic and conventional double-stranded RNA approach. Among them are a novel splipalmivirus (Cryphonectria naterciae splipalmivirus 1, CnSpV1) and a novel fusagravirus (Cryphonectria naterciae fusagravirus 1, CnFGV1). This study focused on the former virus. CnSpV1 has a tetra-segmented, (+)ssRNA genome (RNA1 to RNA4). As observed for other splipalmiviruses reported in 2020 and 2021, the RNA-dependent RNA polymerase domain is separately encoded by RNA1 (motifs F, A and B) and RNA2 (motifs C and D). A hypothetical protein encoded by the 5'-proximal open reading frame of RNA3 shows similarity to a counterpart conserved in some splipalmiviruses. The other RNA3-encoded protein and RNA4-encoded protein show no similarity with known proteins in a blastp search. The tetra-segment nature was confirmed by the conserved terminal sequences of the four CnSpV1 segments (RNA1 to RNA4) and their 100% coexistence in over 100 single conidial isolates tested. The experimental introduction of CnSpV1 along with CnFGV1 into a virus free strain C0754 of C. naterciae vegetatively incompatible with C0614 resulted in no phenotypic alteration, suggesting asymptomatic infection. The protoplast fusion assay indicates a considerably narrow host range of CnSpV1, restricted to the species C. naterciae and C. carpinicola. This study contributes to better understanding of the molecular and biological properties of this unique group of viruses.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2021.198606

    PubMed

    researchmap

  • Distinctive in vitro ATP Hydrolysis Activity of AtVIPP1, a Chloroplastic ESCRT-III Superfamily Protein in Arabidopsis. 査読 国際誌

    Norikazu Ohnishi, Manabu Sugimoto, Hideki Kondo, Ken-Ichi Shioya, Lingang Zhang, Wataru Sakamoto

    Frontiers in plant science   13   949578 - 949578   2022年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Vesicle-inducing protein in plastid 1 (VIPP1), characteristic to oxygenic photosynthetic organisms, is a membrane-remodeling factor that forms homo-oligomers and functions in thylakoid membrane formation and maintenance. The cyanobacterial VIPP1 structure revealed a monomeric folding pattern similar to that of endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III. Characteristic to VIPP1, however, is its own GTP and ATP hydrolytic activity without canonical domains. In this study, we found that histidine-tagged Arabidopsis VIPP1 (AtVIPP1) hydrolyzed GTP and ATP to produce GDP and ADP in vitro, respectively. Unexpectedly, the observed GTPase and ATPase activities were biochemically distinguishable, because the ATPase was optimized for alkaline conditions and dependent on Ca2+ as well as Mg2+, with a higher affinity for ATP than GTP. We found that a version of AtVIPP1 protein with a mutation in its nucleotide-binding site, as deduced from the cyanobacterial structure, retained its hydrolytic activity, suggesting that Arabidopsis and cyanobacterial VIPP1s have different properties. Negative staining particle analysis showed that AtVIPP1 formed particle or rod structures that differed from those of cyanobacteria and Chlamydomonas. These results suggested that the nucleotide hydrolytic activity and oligomer formation of VIPP1 are common in photosynthetic organisms, whereas their properties differ among species.

    DOI: 10.3389/fpls.2022.949578

    PubMed

    researchmap

  • 2021 Taxonomic update of phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales. 査読 国際誌

    Jens H Kuhn, Scott Adkins, Bernard R Agwanda, Rim Al Kubrusli, Sergey V Alkhovsky, Gaya K Amarasinghe, Tatjana Avšič-Županc, María A Ayllón, Justin Bahl, Anne Balkema-Buschmann, Matthew J Ballinger, Christopher F Basler, Sina Bavari, Martin Beer, Nicolas Bejerman, Andrew J Bennett, Dennis A Bente, Éric Bergeron, Brian H Bird, Carol D Blair, Kim R Blasdell, Dag-Ragnar Blystad, Jamie Bojko, Wayne B Borth, Steven Bradfute, Rachel Breyta, Thomas Briese, Paul A Brown, Judith K Brown, Ursula J Buchholz, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity Burt, Carmen Büttner, Charles H Calisher, Mengji Cao, Inmaculada Casas, Kartik Chandran, Rémi N Charrel, Qi Cheng, Yuya Chiaki, Marco Chiapello, Il-Ryong Choi, Marina Ciuffo, J Christopher S Clegg, Ian Crozier, Elena Dal Bó, Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, Rik L de Swart, Humberto Debat, Nolwenn M Dheilly, Emiliano Di Cicco, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G Dietzgen, Michele Digiaro, Olga Dolnik, Michael A Drebot, J Felix Drexler, William G Dundon, W Paul Duprex, Ralf Dürrwald, John M Dye, Andrew J Easton, Hideki Ebihara, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Hugh W Ferguson, Anthony R Fooks, Marco Forgia, Pierre B H Formenty, Jana Fránová, Juliana Freitas-Astúa, Jingjing Fu, Stephanie Fürl, Selma Gago-Zachert, George Fú Gāo, María Laura García, Adolfo García-Sastre, Aura R Garrison, Thomas Gaskin, Jean-Paul J Gonzalez, Anthony Griffiths, Tony L Goldberg, Martin H Groschup, Stephan Günther, Roy A Hall, John Hammond, Tong Han, Jussi Hepojoki, Roger Hewson, Jiang Hong, Ni Hong, Seiji Hongo, Masayuki Horie, John S Hu, Tao Hu, Holly R Hughes, Florian Hüttner, Timothy H Hyndman, M Ilyas, Risto Jalkanen, Dàohóng Jiāng, Gilda B Jonson, Sandra Junglen, Fujio Kadono, Karia H Kaukinen, Michael Kawate, Boris Klempa, Jonas Klingström, Gary Kobinger, Igor Koloniuk, Hideki Kondō, Eugene V Koonin, Mart Krupovic, Kenji Kubota, Gael Kurath, Lies Laenen, Amy J Lambert, Stanley L Langevin, Benhur Lee, Elliot J Lefkowitz, Eric M Leroy, Shaorong Li, Longhui Li, Jiànróng Lǐ, Huazhen Liu, Igor S Lukashevich, Piet Maes, William Marciel de Souza, Marco Marklewitz, Sergio H Marshall, Shin-Yi L Marzano, Sebastien Massart, John W McCauley, Michael Melzer, Nicole Mielke-Ehret, Kristina M Miller, Tobi J Ming, Ali Mirazimi, Gideon J Mordecai, Hans-Peter Mühlbach, Elke Mühlberger, Rayapati Naidu, Tomohide Natsuaki, José A Navarro, Sergey V Netesov, Gabriele Neumann, Norbert Nowotny, Márcio R T Nunes, Alejandro Olmedo-Velarde, Gustavo Palacios, Vicente Pallás, Bernadett Pályi, Anna Papa, Sofia Paraskevopoulou, Adam C Park, Colin R Parrish, David A Patterson, Alex Pauvolid-Corrêa, Janusz T Pawęska, Susan Payne, Carlotta Peracchio, Daniel R Pérez, Thomas S Postler, Liying Qi, Sheli R Radoshitzky, Renato O Resende, Carina A Reyes, Bertus K Rima, Gabriel Robles Luna, Víctor Romanowski, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Luisa Rubino, Jonathan A Runstadler, Sead Sabanadzovic, Amadou Alpha Sall, Maria S Salvato, Rosemary Sang, Takahide Sasaya, Angela D Schulze, Martin Schwemmle, Mang Shi, Xiǎohóng Shí, Zhènglì Shí, Yoshifumi Shimomoto, Yukio Shirako, Stuart G Siddell, Peter Simmonds, Manuela Sironi, Guy Smagghe, Sophie Smither, Jin-Won Song, Kirsten Spann, Jessica R Spengler, Mark D Stenglein, David M Stone, Jari Sugano, Curtis A Suttle, Amy Tabata, Ayato Takada, Shigeharu Takeuchi, David P Tchouassi, Amy Teffer, Robert B Tesh, Natalie J Thornburg, Yasuhiro Tomitaka, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Baldwyn Torto, Jonathan S Towner, Shinya Tsuda, Changchun Tu, Massimo Turina, Ioannis E Tzanetakis, Janice Uchida, Tomio Usugi, Anna Maria Vaira, Marta Vallino, Bernadette van den Hoogen, Arvind Varsani, Nikos Vasilakis, Martin Verbeek, Susanne von Bargen, Jiro Wada, Victoria Wahl, Peter J Walker, Lin-Fa Wang, Guoping Wang, Yanxiang Wang, Yaqin Wang, Muhammad Waqas, Tàiyún Wèi, Shaohua Wen, Anna E Whitfield, John V Williams, Yuri I Wolf, Jiangxiang Wu, Lei Xu, Hironobu Yanagisawa, Caixia Yang, Zuokun Yang, F Murilo Zerbini, Lifeng Zhai, Yong-Zhen Zhang, Song Zhang, Jinguo Zhang, Zhe Zhang, Xueping Zhou

    Archives of virology   166 ( 12 )   3513 - 3566   2021年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In March 2021, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was amended and emended. The phylum was expanded by four families (Aliusviridae, Crepuscuviridae, Myriaviridae, and Natareviridae), three subfamilies (Alpharhabdovirinae, Betarhabdovirinae, and Gammarhabdovirinae), 42 genera, and 200 species. Thirty-nine species were renamed and/or moved and seven species were abolished. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as now accepted by the ICTV.

    DOI: 10.1007/s00705-021-05143-6

    PubMed

    researchmap

  • Assessment of mycoviral diversity in Pakistani fungal isolates revealed infection by 11 novel viruses of a single strain of Fusarium mangiferae isolate SP1. 査読 国際誌

    Haris Ahmed Khan, Wajeeha Shamsi, Atif Jamal, Memoona Javaied, Mashal Sadiq, Tehsin Fatma, Aqeel Ahmed, Maleeha Arshad, Mubashra Waseem, Samra Babar, Midhat Mustafa Dogar, Nasar Virk, Hussnain Ahmed Janjua, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki, Muhammad Faraz Bhatti

    The Journal of general virology   102 ( 12 )   2021年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    An extensive screening survey was conducted on Pakistani filamentous fungal isolates for the identification of viral infections. A total of 396 fungal samples were screened, of which 36 isolates were found double-stranded (ds) RNA positive with an overall frequency of 9% when analysed by a classical dsRNA isolation method. One of 36 dsRNA-positive strains, strain SP1 of a plant pathogenic fungus Fusarium mangiferae, was subjected to virome analysis. Next-generation sequencing and subsequent completion of the entire genome sequencing by a classical Sanger sequencing method showed the SP1 strain to be co-infected by 11 distinct viruses, at least seven of which should be described as new taxa at the species level according to the ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses) species demarcation criteria. The newly identified F. mangiferae viruses (FmVs) include two partitivirids, one betapartitivirus (FmPV1) and one gammapartitivirus (FmPV2); six mitovirids, three unuamitovirus (FmMV2, FmMV4, FmMV6), one duamitovirus (FmMV5), and two unclassified mitovirids (FmMV1, FmMV3); and three botourmiavirids, two magoulivirus (FmBOV1, FmBOV3) and one scleroulivirus (FmBOV2). The number of coinfecting viruses is among the largest ones of fungal coinfections. Their molecular features are thoroughly described here. This represents the first large virus survey in the Indian sub-continent.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001690

    PubMed

    researchmap

  • Omnipresence of Partitiviruses in Rice Aggregate Sheath Spot Symptom-Associated Fungal Isolates from Paddies in Thailand. 査読

    Sokty Neang, Santiti Bincader, Sansern Rangsuwan, Pisut Keawmanee, Soriya Rin, Lakha Salaipeth, Subha Das, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki, Ikuo Sato, Daigo Takemoto, Chainarong Rattanakreetakul, Ratiya Pongpisutta, Masao Arakawa, Sotaro Chiba

    Viruses   13 ( 11 )   2269   2021年11月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/v13112269

    Scopus

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Nyamiviridae 2021. 査読 国際誌

    Ralf G Dietzgen, Andrew E Firth, Dàohóng Jiāng, Sandra Junglen, Hideki Kondo, Jens H Kuhn, Sofia Paraskevopoulou, Nikos Vasilakis, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   102 ( 11 )   2021年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Nyamiviridae is a family of viruses in the order Mononegavirales, with unsegmented (except for members of the genus Tapwovirus), negative-sense RNA genomes of 10-13 kb. Nyamviruses have a genome organisation and content similar to that of other mononegaviruses. Nyamiviridae includes several genera that form monophyletic clades on phylogenetic analysis of the RNA polymerase. Nyamiviruses have been found associated with diverse invertebrates as well as land- and seabirds. Members of the genera Nyavirus and Socyvirus produce enveloped, spherical virions. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Report on the family Nyamiviridae, which is available at ictv.global/report/nyamiviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001681

    PubMed

    researchmap

  • Epidemic progress of beet necrotic yellow vein virus: Evidence from an investigation in Japan spanning half a century 査読

    Ryo Nakagami, Sotaro Chiba, Naoto Yoshida, Yoshiteru Senoo, Minako Iketani-Saito, Satoru Iketani, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada

    PLANT PATHOLOGY   2021年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/ppa.13504

    Web of Science

    researchmap

  • A second capsidless hadakavirus strain with 10 positive-sense single-stranded RNA genomic segments from Fusarium nygamai. 国際誌

    Haris Ahmed Khan, Yukiyo Sato, Hideki Kondo, Atif Jamal, Muhammad Faraz Bhatti, Nobuhiro Suzuki

    Archives of virology   166 ( 10 )   2711 - 2722   2021年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A unique capsidless virus with a positive-sense, single-stranded RNA genome (hadakavirus 1, HadV1), a member of the extended picorna-like supergroup, was isolated previously from the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum. Here, we describe the molecular and biological characterisation of a second hadakavirus strain from Fusarium nygamai, which has not been investigated in detail previously as a virus host. This virus, hadakavirus 1 strain 1NL (HadV1-1NL), has features similar to the first hadakavirus, HadV1-7n, despite having a different number of segments (10 for HadV1-1NL vs. 11 for HadV1-7n). The 10 genomic RNA segments of HadV1-1NL range in size from 0.9 kb to 2.5 kb. All HadV1-1NL segments show 67% to 86% local nucleotide sequence identity to their HadV1-7n counterparts, whereas HadV1-1NL has no homolog of HadV1-7n RNA8, which encodes a zinc-finger motif. Another interesting feature is the possible coding incapability of HadV1-1NL RNA10. HadV1-1NL was predicted to be capsidless based on the RNase A susceptibility of its replicative form dsRNA. Phenotypic comparison of multiple virus-infected and virus-free single-spore isolates indicated asymptomatic infection by HadV1-1NL. Less-efficient vertical transmission via spores was observed as the infected fungal colonies from which the spores were derived became older, as was observed for HadV1-7n. This study shows a second example of a hadakavirus that appears to have unusual features.

    DOI: 10.1007/s00705-021-05176-x

    PubMed

    researchmap

  • Cryphonectria nitschkei chrysovirus 1 with unique molecular features and a very narrow host range. 国際誌

    Sabitree Shahi, Sotaro Chiba, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Virology   554   55 - 65   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Cryphonectria nitschkei chrysovirus 1 (CnCV1), was described earlier from an ascomycetous fungus, Cryphonectria nitschkei strain OB5/11, collected in Japan; its partial sequence was reported a decade ago. Complete sequencing of the four genomic dsRNA segments revealed molecular features similar to but distinct from previously reported members of the family Chrysoviridae. Unique features include the presence of a mini-cistron preceding the major large open reading frame in each genomic segment. Common features include the presence of CAA repeats in the 5'-untranslated regions and conserved terminal sequences. CnCV1-OB5/11 could be laterally transferred to C. nitschkei and its relatives C. radicalis and C. naterciae via coculturing, virion transfection and protoplast fusion, but not to fungal species other than the three species mentioned above, even within the genus Cryphonectria, suggesting a very narrow host range. Phenotypic comparison of a few sets of CnCV1-infected and -free isogenic strains showed symptomless infection in new hosts.

    DOI: 10.1016/j.virol.2020.11.011

    PubMed

    researchmap

  • Identification of an RNA Silencing Suppressor Encoded by a Symptomless Fungal Hypovirus, Cryphonectria Hypovirus 4. 国際誌

    Annisa Aulia, Kiwamu Hyodo, Sakae Hisano, Hideki Kondo, Bradley I Hillman, Nobuhiro Suzuki

    Biology   10 ( 2 )   2021年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Previously, we have reported the ability of a symptomless hypovirus Cryphonectria hypovirus 4 (CHV4) of the chestnut blight fungus to facilitate stable infection by a co-infecting mycoreovirus 2 (MyRV2)-likely through the inhibitory effect of CHV4 on RNA silencing (Aulia et al., Virology, 2019). In this study, the N-terminal portion of the CHV4 polyprotein, termed p24, is identified as an autocatalytic protease capable of suppressing host antiviral RNA silencing. Using a bacterial expression system, CHV4 p24 is shown to cleave autocatalytically at the di-glycine peptide (Gly214-Gly215) of the polyprotein through its protease activity. Transgenic expression of CHV4 p24 in Cryphonectria parasitica suppresses the induction of one of the key genes of the antiviral RNA silencing, dicer-like 2, and stabilizes the infection of RNA silencing-susceptible virus MyRV2. This study shows functional similarity between CHV4 p24 and its homolog p29, encoded by the symptomatic prototype hypovirus CHV1.

    DOI: 10.3390/biology10020100

    PubMed

    researchmap

  • 2020 taxonomic update for phylum Negarnaviricota (Riboviria: Orthornavirae), including the large orders Bunyavirales and Mononegavirales. 国際誌

    Jens H Kuhn, Scott Adkins, Daniela Alioto, Sergey V Alkhovsky, Gaya K Amarasinghe, Simon J Anthony, Tatjana Avšič-Županc, María A Ayllón, Justin Bahl, Anne Balkema-Buschmann, Matthew J Ballinger, Tomáš Bartonička, Christopher Basler, Sina Bavari, Martin Beer, Dennis A Bente, Éric Bergeron, Brian H Bird, Carol Blair, Kim R Blasdell, Steven B Bradfute, Rachel Breyta, Thomas Briese, Paul A Brown, Ursula J Buchholz, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Felicity Burt, Nihal Buzkan, Charles H Calisher, Mengji Cao, Inmaculada Casas, John Chamberlain, Kartik Chandran, Rémi N Charrel, Biao Chen, Michela Chiumenti, Il-Ryong Choi, J Christopher S Clegg, Ian Crozier, John V da Graça, Elena Dal Bó, Alberto M R Dávila, Juan Carlos de la Torre, Xavier de Lamballerie, Rik L de Swart, Patrick L Di Bello, Nicholas Di Paola, Francesco Di Serio, Ralf G Dietzgen, Michele Digiaro, Valerian V Dolja, Olga Dolnik, Michael A Drebot, Jan Felix Drexler, Ralf Dürrwald, Lucie Dufkova, William G Dundon, W Paul Duprex, John M Dye, Andrew J Easton, Hideki Ebihara, Toufic Elbeaino, Koray Ergünay, Jorlan Fernandes, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Leonie F Forth, Ron A M Fouchier, Juliana Freitas-Astúa, Selma Gago-Zachert, George Fú Gāo, María Laura García, Adolfo García-Sastre, Aura R Garrison, Aiah Gbakima, Tracey Goldstein, Jean-Paul J Gonzalez, Anthony Griffiths, Martin H Groschup, Stephan Günther, Alexandro Guterres, Roy A Hall, John Hammond, Mohamed Hassan, Jussi Hepojoki, Satu Hepojoki, Udo Hetzel, Roger Hewson, Bernd Hoffmann, Seiji Hongo, Dirk Höper, Masayuki Horie, Holly R Hughes, Timothy H Hyndman, Amara Jambai, Rodrigo Jardim, Dàohóng Jiāng, Qi Jin, Gilda B Jonson, Sandra Junglen, Serpil Karadağ, Karen E Keller, Boris Klempa, Jonas Klingström, Gary Kobinger, Hideki Kondō, Eugene V Koonin, Mart Krupovic, Gael Kurath, Ivan V Kuzmin, Lies Laenen, Robert A Lamb, Amy J Lambert, Stanley L Langevin, Benhur Lee, Elba R S Lemos, Eric M Leroy, Dexin Li, Jiànróng Lǐ, Mifang Liang, Wénwén Liú, Yàn Liú, Igor S Lukashevich, Piet Maes, William Marciel de Souza, Marco Marklewitz, Sergio H Marshall, Giovanni P Martelli, Robert R Martin, Shin-Yi L Marzano, Sébastien Massart, John W McCauley, Nicole Mielke-Ehret, Angelantonio Minafra, Maria Minutolo, Ali Mirazimi, Hans-Peter Mühlbach, Elke Mühlberger, Rayapati Naidu, Tomohide Natsuaki, Beatriz Navarro, José A Navarro, Sergey V Netesov, Gabriele Neumann, Norbert Nowotny, Márcio R T Nunes, Are Nylund, Arnfinn L Økland, Renata C Oliveira, Gustavo Palacios, Vicente Pallas, Bernadett Pályi, Anna Papa, Colin R Parrish, Alex Pauvolid-Corrêa, Janusz T Pawęska, Susan Payne, Daniel R Pérez, Florian Pfaff, Sheli R Radoshitzky, Aziz-Ul Rahman, Pedro L Ramos-González, Renato O Resende, Carina A Reyes, Bertus K Rima, Víctor Romanowski, Gabriel Robles Luna, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Jonathan A Runstadler, Daniel Ruzek, Sead Sabanadzovic, Jiří Salát, Amadou Alpha Sall, Maria S Salvato, Kamil Sarpkaya, Takahide Sasaya, Martin Schwemmle, Muhammad Z Shabbir, Xiǎohóng Shí, Zhènglì Shí, Yukio Shirako, Peter Simmonds, Jana Širmarová, Manuela Sironi, Sophie Smither, Teemu Smura, Jin-Won Song, Kirsten M Spann, Jessica R Spengler, Mark D Stenglein, David M Stone, Petra Straková, Ayato Takada, Robert B Tesh, Natalie J Thornburg, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Massimo Turina, Ioannis Tzanetakis, Rainer G Ulrich, Anna Maria Vaira, Bernadette van den Hoogen, Arvind Varsani, Nikos Vasilakis, Martin Verbeek, Victoria Wahl, Peter J Walker, Hui Wang, Jianwei Wang, Xifeng Wang, Lin-Fa Wang, Tàiyún Wèi, Heather Wells, Anna E Whitfield, John V Williams, Yuri I Wolf, Zhìqiáng Wú, Xin Yang, Xīnglóu Yáng, Xuejie Yu, Natalya Yutin, F Murilo Zerbini, Tong Zhang, Yong-Zhen Zhang, Guohui Zhou, Xueping Zhou

    Archives of virology   165 ( 12 )   3023 - 3072   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語  

    In March 2020, following the annual International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) ratification vote on newly proposed taxa, the phylum Negarnaviricota was amended and emended. At the genus rank, 20 new genera were added, two were deleted, one was moved, and three were renamed. At the species rank, 160 species were added, four were deleted, ten were moved and renamed, and 30 species were renamed. This article presents the updated taxonomy of Negarnaviricota as now accepted by the ICTV.

    DOI: 10.1007/s00705-020-04731-2

    PubMed

    researchmap

  • Establishment of Neurospora crassa as a model organism for fungal virology. 国際誌

    Shinji Honda, Ana Eusebio-Cope, Shuhei Miyashita, Ayumi Yokoyama, Annisa Aulia, Sabitree Shahi, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Nature communications   11 ( 1 )   5627 - 5627   2020年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The filamentous fungus Neurospora crassa is used as a model organism for genetics, developmental biology and molecular biology. Remarkably, it is not known to host or to be susceptible to infection with any viruses. Here, we identify diverse RNA viruses in N. crassa and other Neurospora species, and show that N. crassa supports the replication of these viruses as well as some viruses from other fungi. Several encapsidated double-stranded RNA viruses and capsid-less positive-sense single-stranded RNA viruses can be experimentally introduced into N. crassa protoplasts or spheroplasts. This allowed us to examine viral replication and RNAi-mediated antiviral responses in this organism. We show that viral infection upregulates the transcription of RNAi components, and that Dicer proteins (DCL-1, DCL-2) and an Argonaute (QDE-2) participate in suppression of viral replication. Our study thus establishes N. crassa as a model system for the study of host-virus interactions.

    DOI: 10.1038/s41467-020-19355-y

    PubMed

    researchmap

  • Pathogenetic roles of beet necrotic yellow vein virus RNA5 in the exacerbation of symptoms and yield reduction, development of scab-like symptoms, andRz1-resistance breaking in sugar beet

    Tetsuo Tamada, Hirokatsu Uchino, Toshimi Kusume, Minako Iketani-Saito, Sotaro Chiba, Ida Bagus Andika, Hideki Kondo

    PLANT PATHOLOGY   70 ( 1 )   219 - 232   2020年9月

     詳細を見る

    担当区分:最終著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/ppa.13266

    Web of Science

    researchmap

  • Hadaka Virus 1: a Capsidless Eleven-Segmented Positive-Sense Single-Stranded RNA Virus from a Phytopathogenic Fungus, Fusarium oxysporum. 査読 国際誌

    Yukiyo Sato, Wajeeha Shamsi, Atif Jamal, Muhammad Faraz Bhatti, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    mBio   11 ( 3 )   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The search for viruses infecting fungi, or mycoviruses, has extended our knowledge about the diversity of RNA viruses, as exemplified by the discovery of polymycoviruses, a phylogenetic group of multisegmented RNA viruses with unusual forms. The genomic RNAs of known polymycoviruses, which show a phylogenetic affinity for animal positive-sense single-stranded RNA [(+)RNA] viruses such as caliciviruses, are comprised of four conserved segments with an additional zero to four segments. The double-stranded form of polymycovirus genomic RNA is assumed to be associated with a virally encoded protein (proline-alanine-serine-rich protein [PASrp]) in either of two manners: a capsidless colloidal form or a filamentous encapsidated form. Detailed molecular characterizations of polymycoviruses, however, have been conducted for only a few strains. Here, a novel polymyco-related virus named Hadaka virus 1 (HadV1), from the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum, was characterized. The genomic RNA of HadV1 consisted of an 11-segmented positive-sense RNA with highly conserved terminal nucleotide sequences. HadV1 shared the three conserved segments with known polymycoviruses but lacked the PASrp-encoding segment. Unlike the known polymycoviruses and encapsidated viruses, HadV1 was not pelleted by conventional ultracentrifugation, possibly due to the lack of PASrp. This result implied that HadV1 exists only as a soluble form with naked RNA. Nevertheless, the 11 genomic segments of HadV1 have been stably maintained through host subculturing and conidiation. Taken together, the results of this study revealed a virus with a potential novel virus lifestyle, carrying many genomic segments without typical capsids or PASrp-associated forms.IMPORTANCE Fungi collectively host various RNA viruses. Examples include encapsidated double-stranded RNA (dsRNA) viruses with diverse numbers of genomic segments (from 1 to 12) and capsidless viruses with nonsegmented (+)RNA genomes. Recently, viruses with unusual intermediate features of an infectious entity between encapsidated dsRNA viruses and capsidless (+)RNA viruses were found. They are called polymycoviruses, which typically have four to eight dsRNA genomic segments associated with one of the virus-encoded proteins and are phylogenetically distantly related to animal (+)RNA caliciviruses. Here, we identified a novel virus phylogenetically related to polymycoviruses, from the phytopathogenic fungus Fusarium oxysporum The virus, termed Hadaka virus 1 (HadV1), has 11 (+)RNA genomic segments, the largest number in known (+)RNA viruses. Nevertheless, HadV1 lacked a typical structural protein of polymycoviruses and was not pelleted by standard ultracentrifugation, implying an unusual capsidless nature of HadV1. This study reveals a potential novel lifestyle of multisegmented RNA viruses.

    DOI: 10.1128/mBio.00450-20

    PubMed

    researchmap

  • Reply to Serra et al.: Nucleotide substitutions in plant viroid genomes that multiply in phytopathogenic fungi. 査読 国際誌

    Shuang Wei, Ruiling Bian, Ida Bagus Andika, Erbo Niu, Qian Liu, Hideki Kondo, Liu Yang, Hongsheng Zhou, Tianxing Pang, Ziqian Lian, Xili Liu, Yunfeng Wu, Liying Sun

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   117 ( 19 )   10129 - 10130   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.2001670117

    PubMed

    researchmap

  • Diversity and epidemiology of plant rhabdoviruses. 国際誌

    Ralf G Dietzgen, Nicolas E Bejerman, Michael M Goodin, Colleen M Higgins, Ordom B Huot, Hideki Kondo, Kathleen M Martin, Anna E Whitfield

    Virus research   281   197942 - 197942   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Plant rhabdoviruses are recognized by their large bacilliform particles and for being able to replicate in both their plant hosts and arthropod vectors. This review highlights selected, better studied examples of plant rhabdoviruses, their genetic diversity, epidemiology and interactions with plant hosts and arthropod vectors: Alfalfa dwarf virus is classified as a cytorhabdovirus, but its multifunctional phosphoprotein is localized to the plant cell nucleus. Lettuce necrotic yellows virus subtypes may differentially interact with their aphid vectors leading to changes in virus population diversity. Interactions of rhabdoviruses that infect rice, maize and other grains are tightly associated with their specific leafhopper and planthopper vectors. Future outbreaks of vector-borne nucleorhabdoviruses may be predicted based on a world distribution map of the insect vectors. The epidemiology of coffee ringspot virus and its Brevipalpus mite vector is illustrated highlighting the symptomatology and biology of a dichorhavirus and potential impacts of climate change on its epidemiology.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2020.197942

    PubMed

    researchmap

  • Facilitative and synergistic interactions between fungal and plant viruses. 査読 国際誌

    Ruiling Bian, Ida Bagus Andika, Tianxing Pang, Ziqian Lian, Shuang Wei, Erbo Niu, Yunfeng Wu, Hideki Kondo, Xili Liu, Liying Sun

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   117 ( 7 )   3779 - 3788   2020年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Plants and fungi are closely associated through parasitic or symbiotic relationships in which bidirectional exchanges of cellular contents occur. Recently, a plant virus was shown to be transmitted from a plant to a fungus, but it is unknown whether fungal viruses can also cross host barriers and spread to plants. In this study, we investigated the infectivity of Cryphonectria hypovirus 1 (CHV1, family Hypoviridae), a capsidless, positive-sense (+), single-stranded RNA (ssRNA) fungal virus in a model plant, Nicotiana tabacum CHV1 replicated in mechanically inoculated leaves but did not spread systemically, but coinoculation with an unrelated plant (+)ssRNA virus, tobacco mosaic virus (TMV, family Virgaviridae), or other plant RNA viruses, enabled CHV1 to systemically infect the plant. Likewise, CHV1 systemically infected transgenic plants expressing the TMV movement protein, and coinfection with TMV further enhanced CHV1 accumulation in these plants. Conversely, CHV1 infection increased TMV accumulation when TMV was introduced into a plant pathogenic fungus, Fusarium graminearum In the in planta F. graminearum inoculation experiment, we demonstrated that TMV infection of either the plant or the fungus enabled the horizontal transfer of CHV1 from the fungus to the plant, whereas CHV1 infection enhanced fungal acquisition of TMV. Our results demonstrate two-way facilitative interactions between the plant and fungal viruses that promote cross-kingdom virus infections and suggest the presence of plant-fungal-mediated routes for dissemination of fungal and plant viruses in nature.

    DOI: 10.1073/pnas.1915996117

    PubMed

    researchmap

  • 植物病原性真菌,Rosellinia necatrix由来の多様なパルティチウイルス【JST・京大機械翻訳】 査読 国際誌

    TELENGECH P., HISANO S., MUGAMBI C., HYODO K., ARJONA LOPEZ J. M., LOPEZ HERRERA C., KANEMATSU S., KONDO H., SUZUKI N.

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集   11   1064 - 1064   2020年

     詳細を見る

  • Molecular Characterization of a Novel Polymycovirus From Penicillium janthinellum With a Focus on Its Genome-Associated PASrp. 国際誌

    Yukiyo Sato, Atif Jamal, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Frontiers in microbiology   11   592789 - 592789   2020年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The genus Polymycovirus of the family Polymycoviridae accommodates fungal RNA viruses with different genomic segment numbers (four, five, or eight). It is suggested that four members form no true capsids and one forms filamentous virus particles enclosing double-stranded RNA (dsRNA). In both cases, viral dsRNA is associated with a viral protein termed "proline-alanine-serine-rich protein" (PASrp). These forms are assumed to be the infectious entity. However, the detailed molecular characteristics of PASrps remain unclear. Here, we identified a novel five-segmented polymycovirus, Penicillium janthinellum polymycovirus 1 (PjPmV1), and characterized its purified fraction form in detail. The PjPmV1 had five dsRNA segments associated with PASrp. Density gradient ultracentrifugation of the PASrp-associated PjPmV1 dsRNA revealed its uneven structure and a broad fractionation profile distinct from that of typical encapsidated viruses. Moreover, PjPmV1-PASrp interacted in vitro with various nucleic acids in a sequence-non-specific manner. These PjPmV1 features are discussed in view of the diversification of genomic segment numbers of the genus Polymycovirus.

    DOI: 10.3389/fmicb.2020.592789

    PubMed

    researchmap

  • A symptomless hypovirus, CHV4, facilitates stable infection of the chestnut blight fungus by a coinfecting reovirus likely through suppression of antiviral RNA silencing. 査読

    Aulia A, Andika IB, Kondo H, Hillman BI, Suzuki N

    Virology   533   99 - 107   2019年7月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2019.05.004

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2019. 国際誌

    Gaya K Amarasinghe, María A Ayllón, Yīmíng Bào, Christopher F Basler, Sina Bavari, Kim R Blasdell, Thomas Briese, Paul A Brown, Alexander Bukreyev, Anne Balkema-Buschmann, Ursula J Buchholz, Camila Chabi-Jesus, Kartik Chandran, Chiara Chiapponi, Ian Crozier, Rik L de Swart, Ralf G Dietzgen, Olga Dolnik, Jan F Drexler, Ralf Dürrwald, William G Dundon, W Paul Duprex, John M Dye, Andrew J Easton, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Ron A M Fouchier, Juliana Freitas-Astúa, Anthony Griffiths, Roger Hewson, Masayuki Horie, Timothy H Hyndman, Dàohóng Jiāng, Elliott W Kitajima, Gary P Kobinger, Hideki Kondō, Gael Kurath, Ivan V Kuzmin, Robert A Lamb, Antonio Lavazza, Benhur Lee, Davide Lelli, Eric M Leroy, Jiànróng Lǐ, Piet Maes, Shin-Yi L Marzano, Ana Moreno, Elke Mühlberger, Sergey V Netesov, Norbert Nowotny, Are Nylund, Arnfinn L Økland, Gustavo Palacios, Bernadett Pályi, Janusz T Pawęska, Susan L Payne, Alice Prosperi, Pedro Luis Ramos-González, Bertus K Rima, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Mǎng Shī, Peter Simmonds, Sophie J Smither, Enrica Sozzi, Kirsten Spann, Mark D Stenglein, David M Stone, Ayato Takada, Robert B Tesh, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Bernadette van den Hoogen, Nikos Vasilakis, Victoria Wahl, Peter J Walker, Lin-Fa Wang, Anna E Whitfield, John V Williams, F Murilo Zerbini, Tāo Zhāng, Yong-Zhen Zhang, Jens H Kuhn

    Archives of virology   164 ( 7 )   1967 - 1980   2019年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In February 2019, following the annual taxon ratification vote, the order Mononegavirales was amended by the addition of four new subfamilies and 12 new genera and the creation of 28 novel species. This article presents the updated taxonomy of the order Mononegavirales as now accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

    DOI: 10.1007/s00705-019-04247-4

    PubMed

    researchmap

  • Novel Victorivirus from a Pakistani Isolate of Alternaria alternata Lacking a Typical Translational Stop/Restart Sequence Signature. 査読 国際誌

    Jamal A, Sato Y, Shahi S, Shamsi W, Kondo H, Suzuki N

    Viruses   11 ( 6 )   2019年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/v11060577

    PubMed

    researchmap

  • Symptomatic plant viroid infections in phytopathogenic fungi. 査読

    Wei S, Bian R, Andika IB, Niu E, Liu Q, Kondo H, Yang L, Zhou H, Pang T, Lian Z, Liu X, Wu Y, Sun L

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   116 ( 26 )   13042 - 13050   2019年6月

  • Isolation and characterization of a novel mycovirus infecting an edible mushroom, Grifola frondosa. 査読

    Akiko Komatsu, Hideki Kondo, Masayuki Sato, Atsushi Kurahashi, Kozo Nishibori, Nobuhiro Suzuki, Fumihiro Fujimori

    Mycoscience   60   211 - 220   2019年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    researchmap

  • Molecular and biological characterization of a novel botybirnavirus identified from a Pakistani isolate of Alternaria alternata. 査読 国際誌

    Shamsi W, Sato Y, Jamal A, Shahi S, Kondo H, Suzuki N, Bhatti MF

    Virus research   263   119 - 128   2019年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2019.01.006

    PubMed

    researchmap

  • Taxonomy of the order Mononegavirales: second update 2018. 国際誌

    Piet Maes, Gaya K Amarasinghe, María A Ayllón, Christopher F Basler, Sina Bavari, Kim R Blasdell, Thomas Briese, Paul A Brown, Alexander Bukreyev, Anne Balkema-Buschmann, Ursula J Buchholz, Kartik Chandran, Ian Crozier, Rik L de Swart, Ralf G Dietzgen, Olga Dolnik, Leslie L Domier, Jan F Drexler, Ralf Dürrwald, William G Dundon, W Paul Duprex, John M Dye, Andrew J Easton, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Ron A M Fouchier, Juliana Freitas-Astúa, Elodie Ghedin, Anthony Griffiths, Roger Hewson, Masayuki Horie, Julia L Hurwitz, Timothy H Hyndman, Dàohóng Jiāng, Gary P Kobinger, Hideki Kondō, Gael Kurath, Ivan V Kuzmin, Robert A Lamb, Benhur Lee, Eric M Leroy, Jiànróng Lǐ, Shin-Yi L Marzano, Elke Mühlberger, Sergey V Netesov, Norbert Nowotny, Gustavo Palacios, Bernadett Pályi, Janusz T Pawęska, Susan L Payne, Bertus K Rima, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Peter Simmonds, Sophie J Smither, Qisheng Song, Timothy Song, Kirsten Spann, Mark D Stenglein, David M Stone, Ayato Takada, Robert B Tesh, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Bernadette van den Hoogen, Nikos Vasilakis, Victoria Wahl, Peter J Walker, David Wang, Lin-Fa Wang, Anna E Whitfield, John V Williams, Gōngyín Yè, F Murilo Zerbini, Yong-Zhen Zhang, Jens H Kuhn

    Archives of virology   164 ( 4 )   1233 - 1244   2019年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In October 2018, the order Mononegavirales was amended by the establishment of three new families and three new genera, abolishment of two genera, and creation of 28 novel species. This article presents the updated taxonomy of the order Mononegavirales as now accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

    DOI: 10.1007/s00705-018-04126-4

    PubMed

    researchmap

  • Horizontal Transfer of a Retrotransposon from the Rice Planthopper to the Genome of an Insect DNA Virus. 査読

    Yang Q, Zhang Y, Andika IB, Liao Z, Kondo H, Lu Y, Cheng Y, Li L, He Y, He Y, Qi Y, Sun Z, Wu Y, Yan F, Chen J, Li J

    Journal of virology   93 ( 6 )   2019年3月

  • Investigation of Host Range of and Host Defense against a Mitochondrially Replicating Mitovirus. 査読

    Shahi S, Eusebio-Cope A, Kondo H, Hillman BI, Suzuki N

    Journal of virology   93 ( 6 )   2019年3月

  • Dicer functions transcriptionally and posttranscriptionally in a multilayer antiviral defense. 査読

    Andika IB, Kondo H, Suzuki N

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   116 ( 6 )   2274 - 2281   2019年2月

  • Identification of a Novel Hypovirulence-Inducing Hypovirus From Alternaria alternata. 査読

    Li H, Bian R, Liu Q, Yang L, Pang T, Salaipeth L, Andika IB, Kondo H, Sun L

    Frontiers in microbiology   10   1076   2019年

  • Plant rhabdoviruses-their origins and vector interactions. 国際誌

    Anna E Whitfield, Ordom Brian Huot, Kathleen M Martin, Hideki Kondo, Ralf G Dietzgen

    Current opinion in virology   33   198 - 207   2018年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Classical plant rhabdoviruses infect monocot and dicot plants, have unsegmented negative-sense RNA genomes and have been taxonomically classified in the genera Cytorhabdovirus and Nucleorhabdovirus. These viruses replicate in their hemipteran vectors and are transmitted in a circulative-propagative mode and virus infection persists for the life of the insect. Based on the discovery of numerous novel rhabdoviruses in arthropods during metagenomic studies and extensive phylogenetic analyses of the family Rhabdoviridae, it is hypothesized that plant-infecting rhabdoviruses are derived from insect viruses. Analyses of viral gene function in plants and insects is beginning to reveal conserved and unique biology for these plant viruses in the two diverse hosts. New tools for insect molecular biology and infectious clones for plant rhabdoviruses are increasing our understanding of the lifestyles of these viruses.

    DOI: 10.1016/j.coviro.2018.11.002

    PubMed

    researchmap

  • Novel Mitoviruses and a Unique Tymo-Like Virus in Hypovirulent and Virulent Strains of the Fusarium Head Blight Fungus, Fusarium boothii. 査読

    Mizutani Y, Abraham A, Uesaka K, Kondo H, Suga H, Suzuki N, Chiba S

    Viruses   10 ( 11 )   2018年10月

  • Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2018. 国際誌

    Gaya K Amarasinghe, Nidia G Aréchiga Ceballos, Ashley C Banyard, Christopher F Basler, Sina Bavari, Andrew J Bennett, Kim R Blasdell, Thomas Briese, Alexander Bukreyev, Yíngyún Caì, Charles H Calisher, Cristine Campos Lawson, Kartik Chandran, Colin A Chapman, Charles Y Chiu, Kang-Seuk Choi, Peter L Collins, Ralf G Dietzgen, Valerian V Dolja, Olga Dolnik, Leslie L Domier, Ralf Dürrwald, John M Dye, Andrew J Easton, Hideki Ebihara, Juan E Echevarría, Anthony R Fooks, Pierre B H Formenty, Ron A M Fouchier, Conrad M Freuling, Elodie Ghedin, Tony L Goldberg, Roger Hewson, Masayuki Horie, Timothy H Hyndman, Dàohóng Jiāng, Robert Kityo, Gary P Kobinger, Hideki Kondō, Eugene V Koonin, Mart Krupovic, Gael Kurath, Robert A Lamb, Benhur Lee, Eric M Leroy, Piet Maes, Andrea Maisner, Denise A Marston, Sunil Kumar Mor, Thomas Müller, Elke Mühlberger, Víctor Manuel Neira Ramírez, Sergey V Netesov, Terry Fei Fan Ng, Norbert Nowotny, Gustavo Palacios, Jean L Patterson, Janusz T Pawęska, Susan L Payne, Karla Prieto, Bertus K Rima, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Martin Schwemmle, Stuart Siddell, Sophie J Smither, Qisheng Song, Timothy Song, Mark D Stenglein, David M Stone, Ayato Takada, Robert B Tesh, Luciano Matsumiya Thomazelli, Keizō Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Nikos Vasilakis, Sonia Vázquez-Morón, Claudio Verdugo, Viktor E Volchkov, Victoria Wahl, Peter J Walker, David Wang, Lin-Fa Wang, James F X Wellehan, Michael R Wiley, Anna E Whitfield, Yuri I Wolf, Gōngyín Yè, Yǒng-Zhèn Zhāng, Jens H Kuhn

    Archives of virology   163 ( 8 )   2283 - 2294   2018年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In 2018, the order Mononegavirales was expanded by inclusion of 1 new genus and 12 novel species. This article presents the updated taxonomy of the order Mononegavirales as now accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) and summarizes additional taxonomic proposals that may affect the order in the near future.

    DOI: 10.1007/s00705-018-3814-x

    PubMed

    researchmap

  • Evidence for a novel negative-stranded RNA mycovirus isolated from the plant pathogenic fungus Fusarium graminearum 査読

    Luan Wang, Hao He, Shuangchao Wang, Xiaoguang Chen, Dewen Qiu, Hideki Kondo, Lihua Guo

    Virology   518   232 - 240   2018年5月

     詳細を見る

    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Academic Press Inc.  

    DOI: 10.1016/j.virol.2018.03.008

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Hypoviridae. 国際誌

    Nobuhiro Suzuki, Said A Ghabrial, Kook-Hyung Kim, Michael Pearson, Shin-Yi L Marzano, Hajime Yaegashi, Jiatao Xie, Lihua Guo, Hideki Kondo, Igor Koloniuk, Bradley I Hillman, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   99 ( 5 )   615 - 616   2018年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The Hypoviridae, comprising one genus, Hypovirus, is a family of capsidless viruses with positive-sense, ssRNA genomes of 9.1-12.7 kb that possess either a single large ORF or two ORFs. The ORFs appear to be translated from genomic RNA by non-canonical mechanisms, i.e. internal ribosome entry site-mediated and stop/restart translation. Hypoviruses have been detected in ascomycetous or basidiomycetous filamentous fungi, and are considered to be replicated in host Golgi-derived, lipid vesicles that contain their dsRNA as a replicative form. Some hypoviruses induce hypovirulence to host fungi, while others do not. This is a summary of the current ICTV report on the taxonomy of the Hypoviridae, which is available at www.ictv.global/report/hypoviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001055

    PubMed

    researchmap

  • Novel, diverse RNA viruses from Mediterranean isolates of the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix: insights into evolutionary biology of fungal viruses 査読

    Juan Manuel Arjona-Lopez, Paul Telengech, Atif Jamal, Sakae Hisano, Hideki Kondo, Mery Dafny Yelin, Isabel Arjona-Girona, Satoko Kanematsu, Carlos José Lopez-Herrera, Nobuhiro Suzuki

    Environmental Microbiology   20 ( 4 )   1464 - 1483   2018年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Blackwell Publishing Ltd  

    DOI: 10.1111/1462-2920.14065

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • ICTV Virus Taxonomy Profile: Rhabdoviridae. 国際誌

    Peter J Walker, Kim R Blasdell, Charles H Calisher, Ralf G Dietzgen, Hideki Kondo, Gael Kurath, Ben Longdon, David M Stone, Robert B Tesh, Noël Tordo, Nikos Vasilakis, Anna E Whitfield, Ictv Report Consortium

    The Journal of general virology   99 ( 4 )   447 - 448   2018年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The family Rhabdoviridae comprises viruses with negative-sense (-) single-stranded RNA genomes of 10.8-16.1 kb. Virions are typically enveloped with bullet-shaped or bacilliform morphology but can also be non-enveloped filaments. Rhabdoviruses infect plants and animals including mammals, birds, reptiles and fish, as well as arthropods which serve as single hosts or act as biological vectors for transmission to animals or plants. Rhabdoviruses include important pathogens of humans, livestock, fish and agricultural crops. This is a summary of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) Report on the taxonomy of Rhabdoviridae, which is available at www.ictv.global/report/rhabdoviridae.

    DOI: 10.1099/jgv.0.001020

    PubMed

    researchmap

  • A neo-virus lifestyle exhibited by a (+)ssRNA virus hosted in an unrelated dsRNA virus: Taxonomic and evolutionary considerations.

    Sakae Hisano, Rui Zhang, Md. Iqbal Faruk, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    Virus research   2017年11月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Recent studies illustrate that fungi as virus hosts provides a unique platform for hunting viruses and exploring virus/virus and virus/host interactions. Such studies have revealed a number of as-yet-unreported viruses and virus/virus interactions. Among them is a unique intimate relationship between a (+)ssRNA virus, yado-kari virus (YkV1) and an unrelated dsRNA virus, yado-nushi virus (YnV1). YkV1 dsRNA, a replicated form of YkV1, and RNA-dependent RNA polymerase, are trans-encapsidated by the capsid protein of YnV1. While YnV1 can complete its replication cycle, YkV1 relies on YnV1 for its viability. We previously proposed a model in which YkV1 diverts YnV1 capsids as the replication sites. YkV1 is neither satellite virus nor satellite RNA, because YkV1 appears to encode functional RdRp and enhances YnV1 accumulation. This represents a unique mutualistic virus/virus interplay and similar relations in other virus/host fungus systems are detectable. We propose to establish the family Yadokariviridae that accommodates YkV1 and recently discovered viruses phylogenetically related to YkV1. This article overviews what is known and unknown about the YkV1/YnV1 interactions. Also discussed are the YnV1 Phytoreo_S7 and YkV1 2A-like domains that may have been captured via horizontal transfer during the course of evolution and are conserved across extant diverse RNA viruses. Lastly, evolutionary scenarios are envisioned for YkV1 and YnV1.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2017.11.006

    PubMed

    researchmap

  • Phytopathogenic fungus hosts a plant virus: A naturally occurring cross-kingdom viral infection 査読

    Ida Bagus Andika, Shuang Wei, Chunmei Cao, Lakha Salaipeth, Hideki Kondo, Liying Sun

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   114 ( 46 )   12267 - 12272   2017年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1714916114

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A possible occurrence of genome reassortment among bipartite rhabdoviruses 査読

    Hideki Kondo, Keisuke Hirota, Kazuyuki Maruyama, Ida Bagus An'dika, Nobuhiro Suzuki

    VIROLOGY   508   18 - 25   2017年8月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2017.04.027

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2017. 国際誌

    Gaya K Amarasinghe, Yīmíng Bào, Christopher F Basler, Sina Bavari, Martin Beer, Nicolás Bejerman, Kim R Blasdell, Alisa Bochnowski, Thomas Briese, Alexander Bukreyev, Charles H Calisher, Kartik Chandran, Peter L Collins, Ralf G Dietzgen, Olga Dolnik, Ralf Dürrwald, John M Dye, Andrew J Easton, Hideki Ebihara, Qi Fang, Pierre Formenty, Ron A M Fouchier, Elodie Ghedin, Robert M Harding, Roger Hewson, Colleen M Higgins, Jian Hong, Masayuki Horie, Anthony P James, Dàohóng Jiāng, Gary P Kobinger, Hideki Kondo, Gael Kurath, Robert A Lamb, Benhur Lee, Eric M Leroy, Ming Li, Andrea Maisner, Elke Mühlberger, Sergey V Netesov, Norbert Nowotny, Jean L Patterson, Susan L Payne, Janusz T Paweska, Michael N Pearson, Rick E Randall, Peter A Revill, Bertus K Rima, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Martin Schwemmle, Sophie J Smither, Qisheng Song, David M Stone, Ayato Takada, Calogero Terregino, Robert B Tesh, Keizo Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Nikos Vasilakis, Viktor E Volchkov, Victoria Wahl-Jensen, Peter J Walker, Beibei Wang, David Wang, Fei Wang, Lin-Fa Wang, John H Werren, Anna E Whitfield, Zhichao Yan, Gongyin Ye, Jens H Kuhn

    Archives of virology   162 ( 8 )   2493 - 2504   2017年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In 2017, the order Mononegavirales was expanded by the inclusion of a total of 69 novel species. Five new rhabdovirus genera and one new nyamivirus genus were established to harbor 41 of these species, whereas the remaining new species were assigned to already established genera. Furthermore, non-Latinized binomial species names replaced all paramyxovirus and pneumovirus species names, thereby accomplishing application of binomial species names throughout the entire order. This article presents the updated taxonomy of the order Mononegavirales as now accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

    DOI: 10.1007/s00705-017-3311-7

    PubMed

    researchmap

  • Possibility and Challenges of Conversion of Current Virus Species Names to Linnaean Binomials. 国際誌

    Thomas S Postler, Anna N Clawson, Gaya K Amarasinghe, Christopher F Basler, Sbina Bavari, Mária Benko, Kim R Blasdell, Thomas Briese, Michael J Buchmeier, Alexander Bukreyev, Charles H Calisher, Kartik Chandran, Rémi Charrel, Christopher S Clegg, Peter L Collins, De La Torre Juan Carlos, Joseph L Derisi, Ralf G Dietzgen, Olga Dolnik, Ralf Dürrwald, John M Dye, Andrew J Easton, Sébastian Emonet, Pierre Formenty, Ron A M Fouchier, Elodie Ghedin, Jean-Paul Gonzalez, Balázs Harrach, Roger Hewson, Masayuki Horie, Dàohóng Jiang, Gary Kobinger, Hideki Kondo, Andrew M Kropinski, Mart Krupovic, Gael Kurath, Robert A Lamb, Eric M Leroy, Igor S Lukashevich, Andrea Maisner, Arcady R Mushegian, Sergey V Netesov, Norbert Nowotny, Jean L Patterson, Susan L Payne, Janusz T PaWeska, Clarence J Peters, Sheli R Radoshitzky, Bertus K Rima, Victor Romanowski, Dennis Rubbenstroth, Sead Sabanadzovic, Hélène Sanfaçon, Maria S Salvato, Martin Schwemmle, Sophie J Smither, Mark D Stenglein, David M Stone, Ayato Takada, Robert B Tesh, Keizo Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Nikos Vasilakis, Viktor E Volchkov, Victoria Wahl-Jensen, Peter J Walker, Lin-Fa Wang, Arvind Varsani, Anna E Whitfield, F Murilo Zerbini, Jens H Kuhn

    Systematic biology   66 ( 3 )   463 - 473   2017年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Botanical, mycological, zoological, and prokaryotic species names follow the Linnaean format, consisting of an italicized Latinized binomen with a capitalized genus name and a lower case species epithet (e.g., Homo sapiens). Virus species names, however, do not follow a uniform format, and, even when binomial, are not Linnaean in style. In this thought exercise, we attempted to convert all currently official names of species included in the virus family Arenaviridae and the virus order Mononegavirales to Linnaean binomials, and to identify and address associated challenges and concerns. Surprisingly, this endeavor was not as complicated or time-consuming as even the authors of this article expected when conceiving the experiment. [Arenaviridae; binomials; ICTV; International Committee on Taxonomy of Viruses; Mononegavirales; virus nomenclature; virus taxonomy.].

    DOI: 10.1093/sysbio/syw096

    PubMed

    researchmap

  • SAGA complex mediates the transcriptional up-regulation of antiviral RNA silencing 査読

    Ida Bagus Andika, Atif Jamal, Hideki Kondo, Nobuhiro Suzuki

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   114 ( 17 )   E3499 - E3506   2017年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1701196114

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The family Rhabdoviridae: mono- and bipartite negative-sense RNA viruses with diverse genome organization and common evolutionary origins. 国際誌

    Ralf G Dietzgen, Hideki Kondo, Michael M Goodin, Gael Kurath, Nikos Vasilakis

    Virus research   227   158 - 170   2017年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The family Rhabdoviridae consists of mostly enveloped, bullet-shaped or bacilliform viruses with a negative-sense, single-stranded RNA genome that infect vertebrates, invertebrates or plants. This ecological diversity is reflected by the diversity and complexity of their genomes. Five canonical structural protein genes are conserved in all rhabdoviruses, but may be overprinted, overlapped or interspersed with several novel and diverse accessory genes. This review gives an overview of the characteristics and diversity of rhabdoviruses, their taxonomic classification, replication mechanism, properties of classical rhabdoviruses such as rabies virus and rhabdoviruses with complex genomes, rhabdoviruses infecting aquatic species, and plant rhabdoviruses with both mono- and bipartite genomes.

    DOI: 10.1016/j.virusres.2016.10.010

    PubMed

    researchmap

  • Barley Yellow Mosaic Virus VPg Is the Determinant Protein for Breaking eIF4E-Mediated Recessive Resistance in Barley Plants 査読

    Huangai Li, Hideki Kondo, Thomas Kuehne, Yukio Shirako

    FRONTIERS IN PLANT SCIENCE   7   1449   2016年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3389/fpls.2016.01449

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2016. 国際誌

    Claudio L Afonso, Gaya K Amarasinghe, Krisztián Bányai, Yīmíng Bào, Christopher F Basler, Sina Bavari, Nicolás Bejerman, Kim R Blasdell, François-Xavier Briand, Thomas Briese, Alexander Bukreyev, Charles H Calisher, Kartik Chandran, Jiāsēn Chéng, Anna N Clawson, Peter L Collins, Ralf G Dietzgen, Olga Dolnik, Leslie L Domier, Ralf Dürrwald, John M Dye, Andrew J Easton, Hideki Ebihara, Szilvia L Farkas, Juliana Freitas-Astúa, Pierre Formenty, Ron A M Fouchier, Yànpíng Fù, Elodie Ghedin, Michael M Goodin, Roger Hewson, Masayuki Horie, Timothy H Hyndman, Dàohóng Jiāng, Elliot W Kitajima, Gary P Kobinger, Hideki Kondo, Gael Kurath, Robert A Lamb, Sergio Lenardon, Eric M Leroy, Ci-Xiu Li, Xian-Dan Lin, Lìjiāng Liú, Ben Longdon, Szilvia Marton, Andrea Maisner, Elke Mühlberger, Sergey V Netesov, Norbert Nowotny, Jean L Patterson, Susan L Payne, Janusz T Paweska, Rick E Randall, Bertus K Rima, Paul Rota, Dennis Rubbenstroth, Martin Schwemmle, Mang Shi, Sophie J Smither, Mark D Stenglein, David M Stone, Ayato Takada, Calogero Terregino, Robert B Tesh, Jun-Hua Tian, Keizo Tomonaga, Noël Tordo, Jonathan S Towner, Nikos Vasilakis, Martin Verbeek, Viktor E Volchkov, Victoria Wahl-Jensen, John A Walsh, Peter J Walker, David Wang, Lin-Fa Wang, Thierry Wetzel, Anna E Whitfield, Ji Tāo Xiè, Kwok-Yung Yuen, Yong-Zhen Zhang, Jens H Kuhn

    Archives of virology   161 ( 8 )   2351 - 60   2016年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In 2016, the order Mononegavirales was emended through the addition of two new families (Mymonaviridae and Sunviridae), the elevation of the paramyxoviral subfamily Pneumovirinae to family status (Pneumoviridae), the addition of five free-floating genera (Anphevirus, Arlivirus, Chengtivirus, Crustavirus, and Wastrivirus), and several other changes at the genus and species levels. This article presents the updated taxonomy of the order Mononegavirales as now accepted by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).

    DOI: 10.1007/s00705-016-2880-1

    PubMed

    researchmap

  • A novel betapartitivirus RnPV6 from Rosellinia necatrix tolerates host RNA silencing but is interfered by its defective RNAs 査読

    Sotaro Chiba, Yu-Hsin Lin, Hideki Kondo, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    VIRUS RESEARCH   219   62 - 72   2016年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2015.10.017

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • VIPP1 Has a Disordered C-Terminal Tail Necessary for Protecting Photosynthetic Membranes against Stress 査読

    Lingang Zhang, Hideki Kondo, Hironari Kamikubo, Mikio Kataoka, Wataru Sakamoto

    PLANT PHYSIOLOGY   171 ( 3 )   1983 - 1995   2016年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.16.00532

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Amyloplast Membrane Protein SUBSTANDARD STARCH GRAIN6 Controls Starch Grain Size in Rice Endosperm 査読

    Ryo Matsushima, Masahiko Maekawa, Miyako Kusano, Katsura Tomita, Hideki Kondo, Hideki Nishimura, Naoko Crofts, Naoko Fujita, Wataru Sakamoto

    PLANT PHYSIOLOGY   170 ( 3 )   1445 - 1459   2016年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.15.01811

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Sequence and phylogenetic analyses of novel totivirus-like double-stranded RNAs from field-collected powdery mildew fungi 査読

    Hideki Kondo, Sakae Hisano, Sotaro Chiba, Kazuyuki Maruyama, Ida Bagus Andika, Kazuhiro Toyoda, Fumihiro Fujimori, Nobuhiro Suzuki

    Virus Research   213   353 - 364   2016年2月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2015.11.015

    Web of Science

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • A capsidless ssRNA virus hosted by an unrelated dsRNA virus 査読

    Rui Zhang, Sakae Hisano, Akio Tani, Hideki Kondo, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    NATURE MICROBIOLOGY   1 ( 1 )   15001   2016年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/NMICROBIOL.2015.1

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • IDENTIFICATION OF GENOME RECOMBINATION AMONG APPLE STEM PITTING VIRUS ISOLATES 査読

    Z. Li, H. Kondo, I. B. Andika, P. Liu, L. Sun, Y. Wu

    JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY   98 ( 3 )   595 - 601   2016年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.4454/JPP.V98I3.028

    Web of Science

    researchmap

  • Interplays between Soil-Borne Plant Viruses and RNA Silencing-Mediated Antiviral Defense in Roots. 国際誌

    Ida Bagus Andika, Hideki Kondo, Liying Sun

    Frontiers in microbiology   7   1458 - 1458   2016年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Although the majority of plant viruses are transmitted by arthropod vectors and invade the host plants through the aerial parts, there is a considerable number of plant viruses that infect roots via soil-inhabiting vectors such as plasmodiophorids, chytrids, and nematodes. These soil-borne viruses belong to diverse families, and many of them cause serious diseases in major crop plants. Thus, roots are important organs for the life cycle of many viruses. Compared to shoots, roots have a distinct metabolism and particular physiological characteristics due to the differences in development, cell composition, gene expression patterns, and surrounding environmental conditions. RNA silencing is an important innate defense mechanism to combat virus infection in plants, but the specific information on the activities and molecular mechanism of RNA silencing-mediated viral defense in root tissue is still limited. In this review, we summarize and discuss the current knowledge regarding RNA silencing aspects of the interactions between soil-borne viruses and host plants. Overall, research evidence suggests that soil-borne viruses have evolved to adapt to the distinct mechanism of antiviral RNA silencing in roots.

    PubMed

    researchmap

  • Cymbidium chlorotic mosaic virus, a new sobemovirus isolated from a spring orchid (Cymbidium goeringii) in Japan 査読

    Hideki Kondo, Shogo Takemoto, Kazuyuki Maruyama, Sotaro Chiba, Ida Bagus Andika, Nobuhiro Suzuki

    ARCHIVES OF VIROLOGY   160 ( 8 )   2099 - 2104   2015年8月

     詳細を見る

    担当区分:筆頭著者, 責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s00705-015-2460-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Differential contributions of plant Dicer-like proteins to antiviral defences against potato virus X in leaves and roots 査読

    Ida Bagus Andika, Kazuyuki Maruyama, Liying Sun, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada, Nobuhiro Suzuki

    PLANT JOURNAL   81 ( 5 )   781 - 793   2015年3月

     詳細を見る

    担当区分:責任著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/tpj.12770

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Different Dicer-like protein components required for intracellular and systemic antiviral silencing in Arabidopsis thaliana. 国際誌

    Ida Bagus Andika, Kazuyuki Maruyama, Liying Sun, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada, Nobuhiro Suzuki

    Plant signaling & behavior   10 ( 8 )   e1039214   2015年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Eukaryotes employ RNA silencing as an innate defense system against invading viruses. Dicer proteins play the most crucial role in initiating this antiviral pathway as they recognize and process incoming viral nucleic acids into small interfering RNAs. Generally, 2 successive infection stages constitute viral infection in plants. First, the virus multiplies in initially infected cells or organs after viral transmission and then the virus subsequently spreads systemically through the vasculature to distal plant tissues or organs. Thus, antiviral silencing in plants must cope with both local and systemic invasion of viruses. In a recent study using 2 sets of different experiments, we clearly demonstrated the differential requirement for Dicer-like 4 (DCL4) and DCL2 proteins in the inhibition of intracellular and systemic infection by potato virus X in Arabidopsis thaliana. Taken together with the results of other studies, here we further discuss the functional specificity of DCL proteins in the antiviral silencing pathway.

    DOI: 10.1080/15592324.2015.1039214

    PubMed

    researchmap

  • A novel single-stranded RNA virus isolated from a phytopathogenic filamentous fungus, Rosellinia necatrix, with similarity to hypo-like viruses 査読

    Rui Zhang, Shengxue Liu, Sotaro Chiba, Hideki Kondo, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    FRONTIERS IN MICROBIOLOGY   5   360   2014年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3389/fmicb.2014.00360

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Transcriptional mapping of the messenger and leader RNAs of orchid fleck virus, a bisegmented negative-strand RNA virus 査読

    Hideki Kondo, Kazuyuki Maruyama, Sotaro Chiba, Ida Bagus Andika, Nobuhiro Suzuki

    VIROLOGY   452   166 - 174   2014年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2014.01.007

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Dichorhavirus: a proposed new genus for Brevipalpus mite-transmitted, nuclear, bacilliform, bipartite, negative-strand RNA plant viruses. 国際誌

    Ralf G Dietzgen, Jens H Kuhn, Anna N Clawson, Juliana Freitas-Astúa, Michael M Goodin, Elliott W Kitajima, Hideki Kondo, Thierry Wetzel, Anna E Whitfield

    Archives of virology   159 ( 3 )   607 - 19   2014年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Orchid fleck virus (OFV) is an unassigned negative-sense, single-stranded (-)ssRNA plant virus that was previously suggested to be included in the family Rhabdoviridae, order Mononegavirales. Although OFV shares some biological characteristics, including nuclear cytopathological effects, gene order, and sequence similarities, with nucleorhabdoviruses, its taxonomic status is unclear because unlike all mononegaviruses, OFV has a segmented genome and its particles are not enveloped. This article analyses the available biological, physico-chemical, and nucleotide sequence evidence that seems to indicate that OFV and several other Brevipalpus mite-transmitted short bacilliform (-)ssRNA viruses are likely related and may be classified taxonomically in novel species in a new free-floating genus Dichorhavirus.

    DOI: 10.1007/s00705-013-1834-0

    PubMed

    researchmap

  • Amyloplast-Localized SUBSTANDARD STARCH GRAIN4 Protein Influences the Size of Starch Grains in Rice Endosperm 査読

    Ryo Matsushima, Masahiko Maekawa, Miyako Kusano, Hideki Kondo, Naoko Fujita, Yasushi Kawagoe, Wataru Sakamoto

    PLANT PHYSIOLOGY   164 ( 2 )   623 - 636   2014年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.113.229591

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Complete genome sequence of Habenaria mosaic virus, a new potyvirus infecting a terrestrial orchid (Habenaria radiata) in Japan 査読

    Hideki Kondo, Takanori Maeda, I. Wayan Gara, Sotaro Chiba, Kazuyuki Maruyama, Tetsuo Tamada, Nobuhiro Suzuki

    ARCHIVES OF VIROLOGY   159 ( 1 )   163 - 166   2014年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s00705-013-1784-6

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Nucleo-cytoplasmic shuttling of VPg encoded by Wheat yellow mosaic virus requires association with the coat protein 査読

    Liying Sun, Bian Jing, Ida Bagus Andika, Yingchun Hu, Bingjian Sun, Rong Xiang, Hideki Kondo, Jianping Chen

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   94 ( Pt 12 )   2790 - 2802   2013年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.055830-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Characterization of burdock mottle virus, a novel member of the genus Benyvirus, and the identification of benyvirus-related sequences in the plant and insect genomes 査読

    Hideki Kondo, Shuichi Hirano, Sotaro Chiba, Ida Bagus Andika, Makoto Hirai, Takanori Maeda, Tetsuo Tamada

    Virus Research   177 ( 1 )   75 - 86   2013年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2013.07.015

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Nyamiviridae: proposal for a new family in the order Mononegavirales. 国際誌

    Jens H Kuhn, Sadia Bekal, Yíngyún Caì, Anna N Clawson, Leslie L Domier, Marieke Herrel, Peter B Jahrling, Hideki Kondo, Kris N Lambert, Kathie A Mihindukulasuriya, Norbert Nowotny, Sheli R Radoshitzky, Urs Schneider, Peter Staeheli, Nobuhiro Suzuki, Robert B Tesh, David Wang, Lin-Fa Wang, Ralf G Dietzgen

    Archives of virology   158 ( 10 )   2209 - 26   2013年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Nyamanini virus (NYMV) and Midway virus (MIDWV) are unclassified tick-borne agents that infect land birds and seabirds, respectively. The recent molecular characterization of both viruses confirmed their already known close serological relationship and revealed them to be nonsegmented, single- and negative-stranded RNA viruses that are clearly related to, but quite distinct from, members of the order Mononegavirales (bornaviruses, filoviruses, paramyxoviruses, and rhabdoviruses). A third agent, soybean cyst nematode virus 1 (SbCNV-1, previously named soybean cyst nematode nyavirus), was recently found to be an additional member of this new virus group. Here, we review the current knowledge about all three viruses and propose classifying them as members of a new mononegaviral family, Nyamiviridae.

    DOI: 10.1007/s00705-013-1674-y

    PubMed

    researchmap

  • Biological and genetic diversity of plasmodiophorid-transmitted viruses and their vectors 査読

    Tetsuo Tamada, Hideki Kondo

    JOURNAL OF GENERAL PLANT PATHOLOGY   79 ( 5 )   307 - 320   2013年9月

     詳細を見る

  • Orchid fleck virus structural proteins N and P form intranuclear viroplasm like structures in the absence of viral infection 査読

    Hideki Kondo, Sotaro Chiba, Ida Bagus Andika, Kazuyuki Maruyama, Tetsuo Tamada, Nobuhiro Suzuki

    Journal of Virology   87 ( 13 )   7423 - 7434   2013年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1128/JVI.00270-13

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • A novel virus in the family Hypoviridae from the plant pathogenic fungus Fusarium graminearum 査読

    Shuangchao Wang, Hideki Kondo, Liang Liu, Lihua Guo, Dewen Qiu

    VIRUS RESEARCH   174 ( 1-2 )   69 - 77   2013年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virusres.2013.03.002

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A Novel Victorivirus from a Phytopathogenic Fungus, Rosellinia necatrix, Is Infectious as Particles and Targeted by RNA Silencing 査読

    Sotaro Chiba, Yu-Hsin Lin, Hideki Kondo, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    JOURNAL OF VIROLOGY   87 ( 12 )   6727 - 6738   2013年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1128/JVI.00557-13

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Identification of a movement protein of Mirafiori lettuce big-vein ophiovirus 査読

    Akihiro Hiraguri, Shoko Ueki, Hideki Kondo, Koji Nomiyama, Takumi Shimizu, Tamaki Ichiki-Uehara, Toshihiro Omura, Nobumitsu Sasaki, Hiroshi Nyunoya, Takahide Sasaya

    Journal of General Virology   94 ( 5 )   1145 - 1150   2013年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.050005-0

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Identification of the amino acid residues and domains in the cysteine-rich protein of Chinese wheat mosaic virus that are important for RNA silencing suppression and subcellular localization 査読

    Liying Sun, Ida Bagus Andika, Hideki Kondo, Jianping Chen

    Molecular Plant Pathology   14 ( 3 )   265 - 278   2013年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/mpp.12002

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Effects of Defective Interfering RNA on Symptom Induction by, and Replication of, a Novel Partitivirus from a Phytopathogenic Fungus, Rosellinia necatrix 査読

    Sotaro Chiba, Yu-Hsin Lin, Hideki Kondo, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    JOURNAL OF VIROLOGY   87 ( 4 )   2330 - 2341   2013年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1128/JVI.02835-12

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Evidence for negative-strand RNA virus infection in fungi 査読

    Hideki Kondo, Sotaro Chiba, Kazuhiro Toyoda, Nobuhiro Suzuki

    Virology   435 ( 2 )   201 - 209   2013年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2012.10.002

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • Endoplasmic reticulum export and vesicle formation of the movement protein of Chinese wheat mosaic virus are regulated by two transmembrane domains and depend on the secretory pathway 査読

    Ida Bagus Andika, Shiling Zheng, Zilong Tan, Liying Sun, Hideki Kondo, Xueping Zhou, Jianping Chen

    VIROLOGY   435 ( 2 )   493 - 503   2013年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.viro1.2012.10.024

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • [Plant rhabdoviruses with bipartite genomes].

    Hideki Kondo

    Uirusu   63 ( 2 )   143 - 54   2013年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Members of the family Rhabdoviridae (order Mononegavirales) have a broad range of hosts, including humans, livestock, fish, plants, and invertebrates. They have a nonsegmented negative-sense RNA as the genome. Orchid fleck virus (OFV) is distributed world-wide on several orchid plants and transmitted by the false spider mite, Brevipalpus californicus. Based on its virions morphology and cytopathic effects in the infected cells, OFV was tentatively placed as unassigned plant rhabdoviruses in the sixth ICTV Report. However, the molecular studies reveled that OFV has a unique two-segmented negative-sense RNA genome that resembles monopartite genomes of plant nucleorhabdoviruses. In this review, we describe the current knowledge on the genome structure and gene expression strategy of OFV, the possible mechanism of nuclear viroplasm formation, and the taxonomical consideration of the virus as well.

    PubMed

    researchmap

  • Viruses of the white root rot fungus, Rosellinia necatrix. 査読

    Kondo H, Kanematsu S, Suzuki N

    Advances in virus research   86   177 - 214   2013年

  • The cysteine-rich proteins of beet necrotic yellow vein virus and tobacco rattle virus contribute to efficient suppression of silencing in roots 査読

    Ida Bagus Andika, Hideki Kondo, Masamichi Nishiguchi, Tetsuo Tamada

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   93 ( Pt 8 )   1841 - 1850   2012年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.043513-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A novel quadripartite dsRNA virus isolated from a phytopathogenic filamentous fungus, Rosellinia necatrix 査読

    Yu-Hsin Lin, Sotaro Chiba, Akio Tani, Hideki Kondo, Atsuko Sasaki, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    VIROLOGY   426 ( 1 )   42 - 50   2012年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.virol.2012.01.013

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The enigmatic genome of Chara australis virus 査読

    Adrian J. Gibbs, Marjo Torronen, Anne M. Mackenzie, Jeffery T. Wood, John S. Armstrong, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada, Paul L. Keese

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   92 ( Pt 11 )   2679 - 2690   2011年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.033852-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Widespread Endogenization of Genome Sequences of Non-Retroviral RNA Viruses into Plant Genomes 査読

    Sotaro Chiba, Hideki Kondo, Akio Tani, Daisuke Saisho, Wataru Sakamoto, Satoko Kanematsu, Nobuhiro Suzuki

    PLOS PATHOGENS   7 ( 7 )   2011年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1371/journal.ppat.1002146

    Web of Science

    researchmap

  • The Evolutionary History of Beet necrotic yellow vein virus Deduced from Genetic Variation, Geographical Origin and Spread, and the Breaking of Host Resistance 査読

    Soutaro Chiba, Hideki Kondo, Masaki Miyanishi, Ida Bagus Andika, Chenggui Han, Tetsuo Tamada

    MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS   24 ( 2 )   207 - 218   2011年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1094/MPMI-10-10-0241

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Identification and characterization of structural proteins of orchid fleck virus 査読

    Hideki Kondo, Takanori Maeda, Tetsuo Tamada

    ARCHIVES OF VIROLOGY   154 ( 1 )   37 - 45   2009年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s00705-008-0268-6

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Role of N-terminal His-rich domain of Oscillatoria brevis Bxa1 in both Ag(I)/Cu(I) and Cd(II)/Zn(II) tolerance. 査読

    Nakakihara E, Kondo H, Nakashima S, Ezaki B

    The open microbiology journal   3   15 - 22   2009年

  • The crucial role of mitochondrial regulation in adaptive aluminium resistance in Rhodotorula glutinis 査読

    Akio Tani, Chiemi Inoue, Yoko Tanaka, Yoko Yamamoto, Hideki Kondo, Syuntaro Hiradate, Kazuhide Kimbara, Fusako Kawai

    MICROBIOLOGY-SGM   154 ( Pt 11 )   3437 - 3446   2008年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/mic.0.2007/016048-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Mitochondrial alterations related to programmed cell death in tobacco cells under aluminium stress 査読

    Sanjib Kumar Panda, Yoko Yamamoto, Hideki Kondo, Hideaki Matsumoto

    COMPTES RENDUS BIOLOGIES   331 ( 8 )   597 - 610   2008年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.crvi.2008.04.008

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Identification of amino acids of the beet necrotic yellow vein virus p25 protein required for induction of the resistance response in leaves of Beta vulgaris plants 査読

    Soutaro Chiba, Masaki Miyanishi, Ida Bagus Andika, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   89 ( Pt 5 )   1314 - 1323   2008年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.83624-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • RNA4-encoded p31 of beet necrotic yellow vein virus is involved in efficient vector transmission, symptom severity and silencing suppression in roots 査読

    Muhammad Danial Rahim, Ida Bagus Andika, Chenggui Han, Hideki Kondo, Tetsuo Tamada

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   88 ( Pt 5 )   1611 - 1619   2007年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.82720-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Orchid fleck virus is a rhabdovirus with an unusual bipartite genome 査読

    Hideki Kondo, Takanori Maeda, Yukio Shirako, Tetsuo Tamada

    JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY   87 ( Pt 8 )   2413 - 2421   2006年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1099/vir.0.81811-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Lower levels of transgene silencing in roots is associated with reduced DNA methylation levels at non-symmetrical sites but not at symmetrical sites 査読

    IB Andika, H Kondo, MD Rahim, T Tamada

    PLANT MOLECULAR BIOLOGY   60 ( 3 )   423 - 435   2006年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11103-005-4429-7

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Evidence that RNA silencing-mediated resistance to Beet necrotic yellow vein virus is less effective in roots than in leaves 査読

    IB Andika, H Kondo, T Tamada

    MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS   18 ( 3 )   194 - 204   2005年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1094/MPMI-18-0194

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A reovirus of the fungus Cryphonectria parasitica that is infectious as particles and related to the Coltivirus genus of animal pathogens 査読

    BI Hillman, S Supyani, H Kondo, N Suzuki

    JOURNAL OF VIROLOGY   78 ( 2 )   892 - 898   2004年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1128/JVI.78.2.892-898.2004

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Orchid fleck virus: Brevipalpus californicus mite transmission, biological properties and genome structure 査読 国際誌

    H Kondo, T Maeda, T Tamada

    EXPERIMENTAL AND APPLIED ACAROLOGY   30 ( 1-3 )   215 - 223   2003年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1023/B:APPA.0000006550.88615.10

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Identification of Orchid fleck virus by reverse transcriptase-polymerase chain reaction and analysis of isolate relationships

    AL Blanchfield, AM Mackenzie, A Gibbs, H Kondo, T Tamada, CR Wilson

    JOURNAL OF PHYTOPATHOLOGY-PHYTOPATHOLOGISCHE ZEITSCHRIFT   149 ( 11-12 )   713 - 718   2001年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1046/j.1439-0434.2001.00702.x

    Web of Science

    J-GLOBAL

    researchmap

  • Comparative cytopathology and immunocytochemistry of Japan, Australian and Brazilian isolates of Orchid fleck virus.(共著)

    Kitajima et al.

    Journal of General Plant Pathology   67 ( 3 )   231 - 237   2001年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:Phytopathological Society of Japan  

    Cytopathic effects in orchid leaf tissues infected with Australian, Japanese and Brazilian isolates of Orchid fleck virus(OFV) were indistinguishable and like those previously described in the literature. Cells had an electron-lucent viroplasm with unenveloped rod-shaped virions in the nucleus and cytoplasm, often associated with the inner membrane of the nuclear envelope and the endoplasmic reticulum. Antiserum raised against a Japanese isolate of OFV reacted with Brazilian and Australian isolates in ELISA, and when used for immuno-gold labelling, also reacted in situ with the rod-shaped virions and the intranuclear viroplasm of all three isolates. These results suggest that the viroplasm is where structural proteins accumulate and virions are formed.

    DOI: 10.1007/PL00013018

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: http://id.nii.ac.jp/1141/00138246/

  • Calanthe mild mosaic virus, a new potyvirus causing a mild mosaic disease of Clanth orchid in Japan(共著)

    Garae t al

    Journal of Phytopathology   146 ( 7 )   357 - 363   1998年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

    researchmap

  • Protective roles of two aluminum (Al)-induced genes, HSP150 and SED1 of Saccharomyces cerevisiae, in Al and oxidative stresses

    B Ezaki, RC Gardner, Y Ezaki, H Kondo, H Matsumoto

    FEMS MICROBIOLOGY LETTERS   159 ( 1 )   99 - 105   1998年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/S0378-1097(97)00554-5

    Web of Science

    J-GLOBAL

    researchmap

  • ラン科植物に発生するシンビジウムモザイクウイルスの血清学的検出

    Gara I Wayan, 近藤 秀樹, 前田 孚憲

    岡山大学資源生物科学研究所報告   5 ( 1 )   39 - 46   1997年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010552409

  • 日本においてCymbidium属植物から分離された生物学的性質の異なるOdontoglossum Ringspot Virus分離株のペプチドマッピングによる比較

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    岡山大学資源生物科学研究所報告   5 ( 1 )   31 - 38   1997年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010552408

  • Stunt disease of Habenaria radiata caused by a strain of watermelon mosaic virus 2(共著)

    Gara et al.

    Annals of the phytopathological society of Japan   63 ( 2 )   113 - 117   1997年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:The Phytopathological Society of Japan  

    1995年,岡山県倉敷市において採集した,激しい萎縮,葉の奇形とモザイクを示したサギソウから分離されたpotyvirusは,ウイルス粒子の形態,感染細胞内所見,アブラムシ伝搬性,宿主範囲,血清学的類縁関係からカボチャモザイクウイルス(WMV 2)と同定された。本ウイルスの宿主範囲および病徴は,数種の植物において,既報の分離株のそれらと異なっていた。外被タンパク質(CP)遺伝子を含むウイルスゲノムの3'末端領域の塩基配列を決定し,既報の5分離株のそれと比較した結果, CPのアミノ酸配列で87-97%, 3'非翻訳領域で94-97%の相同性が認められた。WMV 2のサギソウにおける発生の報告は初めてであり,ウイルス病の和名をサギソウ萎縮病としたい。

    DOI: 10.3186/jjphytopath.63.113

    CiNii Article

    researchmap

  • Altered mitochondrial gene expression in a maternal distorted leaf mutant of Arabidopsis induced by chloroplast mutator

    W Sakamoto, H Kondo, M Murata, F Motoyoshi

    PLANT CELL   8 ( 8 )   1377 - 1390   1996年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1105/tpc.8.8.1377

    Web of Science

    J-GLOBAL

    researchmap

  • Ixiaから分離されたbean yellow mosaic virus

    辻 俊也, 前田 孚憲, 近藤 秀樹

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   201 - 213   1996年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • エビネ(Calanthe spp.)から分離されたCymbidium mosaic virus

    松本 純一, 占部 慎治, 前田 孚憲, 光畑 興二, 近藤 秀樹, 田原 望武, 井上 成信

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   187 - 199   1996年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    Cymbidium mosaic virus(CyMV) was isolated from Calanthe spp. showing mosaic on the leaves, collected in Yamaguchi and Kyoto Prefectures in 1986~1993. CyMV, Cal. 90-1 isolate was transmitted by sapinoculation to 12 out of 37 species in 7 out of 9 families. Sap from diseaded Tetragonia expansa was infective to Chenopodium amaranticolor after dilution to 10-5 but not 10-6, after heating at 65℃ for 10 min but not 70℃, and after 1 month at 20℃ but not 2 months. The virus particles were flexuous rod, about 475 nm long. The virus was purified from diseased T. expansa leaves and contained a single protein species of Mr27,800. The Mr of the capsid proteins(Cal. 90-1) was similar to those of two ohter CyMV isolates(Cal. 90-4, Cal. 93-14).Cal. 90-1 and Cal. 93-14 reacted with antiserum to the Cymbidium isolate (Cy-16), suggesting that Cal. 90-1 was serologically very similar to the other two CyMV isolates. Two species of dsRNA were isolated from plants infected with Cal-1 and they were similar to those of two other CyMv isolates.1986年、1990年および1993年に採集したモザイクを示すエビネからcymbidium mosaic virus(CyMV)を検出して同定し、諸性質を調べた。本ウイルスは汁液接種により供試した9科37種のうち、エビネとゴマに全身感染し、ツルナなど6科11種に局部感染した。しかし、分離株によってキュウリやセンニチコウの接種葉に感染するものと感染しないものがあった。ツルナ病葉粗汁液中での安定性は耐熱性65~70℃、耐希釈性10-5~10-6、耐保存性1~2ヶ月であった。DN法試料の電顕観察では長さ約475nmのウイルス粒子が観察された。ウイルス外被タンパク質の分子量は約27,800であり、既報のCyMVの値とほぼ同じであった。ツルナ感染葉中の感染に特異的な二本鎖RNAの電気泳動ではreplicative form と思われる4.43×106と3.84×106のバンドが認められた。エビネから分離されたCyMV分離株は直接二重酵素結合抗体法(DAS-ELISA)で、Cy-16分離株の抗血清とよく反応するものが多かったが、反応が弱く、抗原性に若干の違いがあるものが存在した。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 東洋ランに発生するウイルスの検索・同定

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 光畑 興二, 井上 成信

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   149 - 162   1996年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    A survey of virus diseases occurring in Oriental Cymbidium collected from a commerical nursery and home garden in Japan was conducted in 1991-1994. Identification of the vurus was based on partcle morphology, symptomatology in indicator plants, ultrastructure of infected cells and serology. Four viruses, odontoglossum ringspot tabamovirus(ORSV), cymbidium mosaic potexvirus(CyMV), orchid fleck virus (ORV) and a previously underscribed spherical virus, were found in 27 out of 37 Cymbidium plants tested. ORSV was detected from 11 plants belinging to Cym. ensifolium, Cym. forrestii, Cym. goeringii, Cym. kanran, Cym. sinense and Cymbidium spp. showing chlorotic streaks and/or mild mosaic. CyMV was isolated from only one plant of Cymbidium sp. showing mosaic and necrotic spots on leaves. In negatibvely stained dip preparations from plants infected with ORSV and CyMV, rod shaped particles of ca. 310 nm and flexuous rod-shaped ca. 475 nm in length were observed, respectively. The viruses were reacted strongly with respective antiserum to each virus in immunosorbent electron microcopy and inderect ELISA. OFV was isolated from four plants of Cym. formosanum, Cym. kanran, Cym. sinense and Cymbidium sp. showing mosaic and necrotic flecks. The virus had non-enveloped, bullet-shaped particles about 40×120~150 nm in dip preparation. The undescribed spherical virus, ca. 28 nm diameter, was isolated from 11 plants of Cym. forrestii, Cym. goeringii and Cymbidium spp. showing stunting and chlorotic streaks on newly developed leaves. The virus was mechanically transmitted only to Cymbidium orchids. Previously, we designated it as cymbidium chlorotic mosaic sobemovirus(CyCMV)(Kondo et al,1994),as the virus was considered to be a new member of the genus Sobemovirsu.1991~1994年にかけ山口県ならびに岡山県下を中心に東洋ラン(シンビジウム属)のウイルス病の発生調査を行った。ウイルス病様の症状を示していた37株の東洋ランを採集し、これらから病原ウイルスの分離、同定を試みた結果、オドントグロッサムリングスポットウイルス(ORSV)、シンビジウムモザイクウイルス(CyMV)、ランえそ斑紋ウイルス(OFV)ならびにソベモウイルス属の新ウイルスであるシュンラン退緑ウイルス(CyCMV)の発生が認められた。ORSVは退緑条斑や軽いモザイク症状を示すスルガラン、カンラン、コラン、ホウサイランなどから分離された。CyMVは明瞭なえそ斑を伴うモザイクを呈した東洋ラン(品種不祥、赤芽素心)から分離された。ORSVならびにCyMVに感染した植物のDN法試料中には電顕観察でそれぞれ長さ約310nmの棒状粒子と約475nmのひも状粒子が観察され、免疫電顕法と間接ELISA法では、これらのウイルスはそれぞれのウイルスに対する抗血清とよく反応した。OFVは退緑斑あるいはえそ斑点を生じているイトラン、カンラン、ホウサイランなどから検出された。その粒子形態は長さ約120~150nm、幅約40nmの被膜のない弾丸状あるいは桿菌状であった。CyCMVは新芽に明瞭な退緑斑や退緑状斑症状を示すシナシュンラン、シュンランなどから分離された。この球状ウイルスは直径約28nmで、シンビジウム属以外の植物には感染が認められなかった。今回の発生調査では、東洋ランからはORSVならびに新ウイルスのCyCMVがもっとも多く分離され、OFVは4株から、CyMVは1株から検出された。またこれらのウイルスによる重複感染は認められなかった。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • エビネ類に発生する黄色斑紋モザイク病の病原,Orchid Fleck Virusについて

    井上 成信, 松本 純一, 前田 孚憲, 光畑 興二, 近藤 秀樹, 田原 望武

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   119 - 135   1996年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    Orchid fleck virus(OFV) was isolated from Calanthe spp.(Cal. discolor,Cal. Bicolor,Cal. Hizen,Cal. triplicata,Cal longicalcarata,Cal Satusma) showing light-green and/or yellowish fleck mosaic on the leaves, which different from previously known viruses of Calanthe. OFV caused systemic infection in Calanthe, Chenopodium quinoa and Beta vulgasis var. cicla, and local infection in C.amaranticolor, C. murale, Spinacia oleracea, Tetragonia expansa, Nicotiana tabacum, N. clevelandii, N. glutinasa, N. rustica, Vigna unguiculata. C quinoa and T expansa are useful as indecator hosts and as a source of virus for inoculation, diagnosis and purification. Sap from C. quinoa was infective after dilution to 10-3 but not 10-4, after 10 min at 45 but not 50℃, and after 1 hr at 20℃ but not 2 hrs. For sap inoculation, it is best to use the homogenate of OFV-onfected leaves within about 7-8 min after homogenization in summer and within about 15 min in winter. The virus particles were bullet-shape or bacilliform, approximately 45-50×105-125 nm in a negatively stained praparations. In ultrathin sections, the viroplasms were observed in the nuclei, and the virus particles and the chracteristic spokewheel structures were found both in the nuclei and the cytoplasm. Antiserum (precipitin tiner:1/512) against the present virus reacted strongly with the isolates of OFV-Cy-50, similar to that of homologous virus. In agar gel diffusion tests, no spur formation occurred among Cal. 94-16 and OFV-Cy-50. In SDS-polyacrylamide gel electrophoresis, one major band of Mr 55,000, probably viral nucleocapsid-protein, and three minor proteins were detected, similar to those of OFV・So from Cymbidium.1988年以来、山口・宮崎・鹿児島県で発生が認められたエビネ類(エビネ、タカネ、ヒゼン、サツマ、ツルラン、オナガエビネ)の葉に淡緑色~黄色斑紋のモザイク病の病原ウイルスを調べたところ、orchid fleck virusと同定された。本ウイルスは11科46種(54品種)の植物に汁液接種を行ったところ、エビネに感染して原株と同様の病班を生じたほか、C.quinoa,フダンソウに全身感染し、C.murale,ホウレンソウ、ツルナ、ササゲ、タバコ、N.clevelandii,N.glutinosa,N.rusticaの5科12種の植物に局部感染が認められた。本ウイルスの粒子はDN法試料で被膜のない弾丸型であり、またときに短桿菌型も存在したが、その大きさは長さが約105~125nm、幅約45~50nmであった。病葉の粗汁液を用いた希釈限度は10-3~10-4、不活性化温度は45~50℃、保存限度は1~2時間であった。ウイルスの汁液接種には、接種源植物としてC.quinoa またはツルナがよく、病葉磨砕後夏期では7分以内、冬期では15分以内の病汁液を供試すると接種検定によい結果が得られることが認められた。純化ウイルスを家兎に注射して、微滴法で力値512倍の抗血清が得られた。本抗血清はCymbidium から分離されたOFV・Cy-50とよく反応し、寒天ゲル内二重拡散法では Cal.94-16およびOFV・Cy-50の沈降帯が完全に融合した。ウイルスの構造蛋白質の分子量は約55Kであった。病細胞の超薄切片の電顕観察像には、閣内にviroplasmが認められ、その内部や周辺に層状に集塊あるいは散在した粒子が認められた。さらに核内や細胞質内に膜に包まれた車輪状の粒子集塊も見られた。OFVによる本病をエビネ類黄色斑紋モザイク病とした。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • バンダから分離されたCymubidium Mosaic Virusの諸性質

    Gara I Wayan, Kondo Hideki, Maeda Takanori, Mitsuhata Koji, Inouye Narinobu

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   164 - 174   1996年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    A virus causing necrotic spots and necrotic flecks on the leaves of Vanda orchids in Japan was identified as cymbidium mosaic virus(Cymv) on the basis of host range,stabilly in crude sap, particle morphology, serological test and physico-chemical properties. The virus was transmitted by sap inoculation to 12 of 57 species in 6 of 12 families tested, but not by aphid Mizus persicae or through seeds. Systemic infection occurred in all Orchidaceae plants tested and only one in non-orchidaceae (Sesamum indicum). In Tetragonia expansa sap, the infective at a dilution of 10-5 but not at 10-6, after heating at 65℃ for 10 min, and was still active after 1 month aging in vitro. Flexuous rod particles, c. 475×13nm,were observed.In ultrahtin sections of leaf tissues from diseased plants, virus particles were found to aggregate in the cytoplasm. The molecular weight of the protein submit and RNA determined by gel electrophoresis, was 27.8×103 and 2.2×106, respectively. Double-stranded RNAs with estimated molecular weight of 5.4×106, 4.0×106, 3.6×106 and 3.0×106 were isolated from infected plants.日本において葉にえそ斑やえそ輪紋を示すバンダから分離されたウイルスは、宿主範囲、病葉汁液中での安定性、粒子長、物理化学的性質、外被タンパク質ならびにウイルスRNAの分子量等からCymbidiummosaic virus(CyMV) と同定された。本ウイルスを12科57種の植物に汁液接種したところ、数種のラン科植物とゴマに全身感染した。また、本ウイルスは汁液接種で容易に伝搬されず、種子伝染も認められなかった。ツルナの病葉汁液中での安定性は不活化温度が65~70℃(10分)、希釈限度が10-5~10-6、保存限度が20℃で1~2ヶ月であった。DN法による電顕観察では屈曲性のある長さ約475×13nmのひも状粒子が多数認められ、感染葉(Cymbidium) の超薄切片にはウイルス粒子がfingerprint状として細胞質内に存在することが確かめられた。ゲル電気泳動により外被タンパク質とウイルスRNAの分子量の解析を行ったところ、それぞれ27.8×103、2.2×106であった。また、本ウイルスに罹病したツルナ葉からは、主に4種の感染に特異的な二本鎖RNA(分子量約5.4×106、4.0×106、3.6×106 3.0×106)が検出された。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • Ixia から分離された bean yellow mosaic virus

    Tsuji Toshiya, Maeda Takanori, Kondo Hideki, Inouye Narinobu

    岡山大学資源生物科学研究所報告   4 ( 2 )   201 - 213   1996年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    A strain (Ixia-B) of bean yellow mosaic virus (BYMV) isolated from Ixia hybrida was characterized and compared with other isolates of BYMV and clover yellow vein virus (CYVV). Ixia-B was transmitted by aphids,Myzus presicae in a non-presistent manner and by sap-inoculation to 11 of 46 species in 5 of 10 families tested, and had a similar host range to that of some BYMV isolates, althrough some defferences were detected. Sap from diseased C. quinoa was infective after 10 min heating at 55℃ but not 60℃, after a dilution to 10-3 but not 10-4, and after 2 days but not 4 days at 20℃.The Virus particles were filamentous rods of about 13×820 nm. Ixia-B contaied a single protein species with a molecular weight of 34,000 and a single viral RNA with approximately 9,000 bases. In ultrahtin sections of leaf tissues from infected plants, the virus particles, cylindrical cytoplasmic inclusions and dense bodies were obsserved in the cytoplasm. The antiserum to Ixia-B produced by immunizing a rabbit had a titer of 1/512. A close serological relationship was revealed between Ixia-B and two strains of BYMV from crocus and gladiolus, but no relationship to clover yellow vein virus was found in agar gel diffusion tests. However,Ixia-B could be distinguished from two strains of BYMV by the formation of spurs among them in agar gel and by the differences in the patterns of peptide mapping of coat proteins. From these findings, Ixia-B was identified as a strain of BYMV.1992年に岡山県倉敷市玉島で、葉に斑入りを生じた球根類花卉植物Ixia hybridaからpotyvirus(Ixia-B)が分離され、その諸性質から bean yellow masaic virus(BYMV)と同定された。本ウイルスを11科47種の植物に接種したとこと、フリージャ、Nicotiana clevelandii、Chenopodium amaranticolar、ソラマメ、クリムソンクローバー、インゲンマメ、ホウレンソウに全身感染し、またC.quinoa、フダンソウ、ツルナ、センニチコウなどに局部感染したが、エンドウ、ササゲ、ダイズなどには感染しなかった。本ウイルスをはモモアカアブラムシにより非永続的伝搬され、C.quinoa の病葉粗汁液中での安定性は耐熱性が55℃~60℃(10分)、耐希釈性10-3~10-4、耐保存性2~4日であった。DN法試料の電顕観察で多くのpotyvirusよりやや長い約820nmのひも状粒子と管状封入体の破片が見られた。感染葉の超薄切片では風車状、層板状の封入体、dence body、細胞質に散在するウイルス粒子が観察された。本ウイルスはfreesia mosaic virusおよびclover yellow vein virusの抗血清と反応せず、また本ウイルス抗血清を用いた寒天ゲル内二重拡散法ではBYMV分離株(Cro-4, BYMV-G)と反応したが、本ウイルスとBYMVのCro-4およびBYMV-G間にspurが形成され、異種抗原の存在が認められた。外被タンパク質の分子量は約34Kで、ssRNAのサイズは約9Kbであった。Papain,chymotrypsin,pepsinを用いた外被タンパク質のぺプタイドマッピングでは、本ウイルス、Cro-4、BYMV-G、Cal-35の部分分解パターンがそれぞれ異なり、外被タンパク質がアミノ酸配列レベルで異なっていることが示唆された。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 東洋ラン(Cymbidium sp.)から分離されたOrchid Fleck Virusの性状について

    近藤 秀樹, 松本 純一, 前田 孚憲, 井上 成信

    岡山大学資源生物科学研究所報告   3 ( 2 )   151 - 161   1995年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    Orchid flck virus (OFV) was isolated from Oriental Cymbidium (Cymbidium sp.),showing chlorotic flecks on leaves. The virus was transmitted mechanically to Chenopodium quinoa,C.murale and Beta vulgaris by sap-inoculation and caused systemic infection. Local lesions were produced on C.amaranticolar, Petunia hybrida, Tetragonia expansa and Vigna sinensis. Sap from infected T.expansa was still infective after 10 mim at 40℃ but not after 10 min at 45℃, at a dilution of 10-3 but not 10-4, and after 30 min at room temperature but not after 60 min. The isolate of OFV had non-enveloped, bullet-shaped patricles measuring about 40×120-150 nm in dip preparations. However, bacilliform particles about 40×120-140 nm were observed in ultrathin sections. In ultrahtin sections of virus-infected tissues, virus patricles were detected both in the nuclei and in the cytoplasm. Moreover, the inclusions of low electron density(viroplasm) were also observed in the nuclei.Virus particles were found to attach at one end to the inner nuclear membrane. A number of particles surrounded by the inner membrane often showed an appearance like a spoked wheel.1992年10月岡山市内で採集した葉に退緑斑点症状を示す東洋ラン(Cymbidium sp.)より分離されたウイルスはランえそ斑紋ウイルス(orchid fleck virus;OFV)と同定された。本ウイルスは汁液接種を行った11科41種の植物のうち、アカザ科のChenopodium murale, C.quinoa, Beta vulgalis の3種に全身感染し、ツルナ、C.amaranticolar,ササゲ、ペチュニア、Nicotiana glutinosa の4科5種に局部感染した。本ウイルスは病葉粗汁液中では安定性が低く、ツルナ粗汁液での安定性は耐熱性40~45℃、耐希釈性10-3~10-4、耐保存性30~45分であった。DN法試料の電顕観察ではウイルス粒子は長さ120~150nm、幅約40nmの被膜のない弾丸状であった。感染葉の超薄切片では約120~140×40nm の短桿状粒子として観察された。感染細胞の超薄切片像ではウイルス粒子が各種細胞に観察された。また感染細胞の核内には封入体(viroplasm)が認められ、その周辺や内部に粒子が集塊あるいは散在して認められた。さらに核膜近傍ではウイルス粒子が核膜内膜に吸着したもの認められ、その細胞質側には車輪状などに配列した膜系に包まれた粒子集団が認められた。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 東洋ラン・Cymbidium属植物から分離されたOdontoglossum ringspot Tobamovirus(ORSV)について

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    岡山大学資源生物科学研究所報告   1 ( 1 )   p21 - 34   1992年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:岡山大学資源生物科学研究所  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010471058

▼全件表示

書籍等出版物

▼全件表示

MISC

  • ランのウイルス病 -最新農業技術 花卉- vol.12

    近藤秀樹 (改訂)

    2020年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:農山漁村文化協会  

    CiNii Books

    researchmap

  • 植物ウイルス大事典. デンドロビウムモザイクウイルス(分担).

    近藤秀樹

    2015年11月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:朝倉書店. 編集 日比, 忠明;大木, 理  

    CiNii Books

    researchmap

  • 宿主ゲノム上に存在するRNAウイルス感染記録を紐解く

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集   ( 50 )   133‐142   2015年8月

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

    researchmap

  • テンサイそう根病の病原ウイルス(BNYVV)の進化と品種抵抗性

    玉田哲男, 近藤秀樹

    植物防疫   68 ( 4 )   168 - 179   2014年4月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本植物防疫協会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    J-GLOBAL

    researchmap

  • 分節型ゲノムを持つラブドウイルス

    近藤秀樹

    ウイルス   63 ( 2 )   143 - 154   2013年12月

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    DOI: 10.2222/jsv.63.143

    J-GLOBAL

    researchmap

  • シュンラン退緑斑病(分担)/インターネット版日本植物病害大事典 病害新情報

    近藤 秀樹

    2013年

     詳細を見る

    出版者・発行元:全農教  

    researchmap

  • サギソウ萎縮病(分担)/インターネット版日本植物病害大事典 病害新情報

    近藤 秀樹

    2013年

     詳細を見る

    出版者・発行元:全農教  

    researchmap

  • 分節型ラブド様ウイルス,ランえそ斑紋ウイルスの分子生物学的および分子系統学的解析

    近藤秀樹, 前田孚憲, 玉田哲男

    植物ウイルス病研究会レポート   9 ( 9 )   27 - 36   2008年4月

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

    researchmap

  • 植物病原糸状菌ウイルスのライフスタイル多様性

    佐藤有希代, 近藤秀樹, 鈴木信弘

    日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集   ( 56 )   2022年9月

     詳細を見る

  • 食用キノコの子実体形成にウイルス感染が果たす役割についての研究(3)

    小松あき子, 佐藤真之, 近藤秀樹, 西堀耕三, 鈴木信弘, 藤森文啓

    東京家政大学生活科学研究所研究報告   39   57‐61 - 61   2016年7月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:東京家政大学生活科学研究所  

    CiNii Article

    CiNii Books

    J-GLOBAL

    researchmap

  • 本邦の稀少ラン科植物に発生するウイルスの性状解明と遺伝子診断技術の開発」

    近藤 秀樹

    八雲環境科学振興財団レポート   2016年

     詳細を見る

  • 食用キノコの子実体形成にウイルス感染が果たす役割についての研究(2) (温故知新プロジェクト)

    小松 あき子, 佐藤 真之, 近藤 秀樹, 佐藤 真之, 角 真理子, 土屋 有紀, 倉橋 敦, 西堀 耕三, 鈴木 信弘, 藤森 文啓

    東京家政大学生活科学研究所研究報告 = Bulletin of Research Institute of Domestic Science, Tokyo Kasei University   38   79 - 84   2015年7月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:東京家政大学生活科学研究所  

    東京家政大学生活科学研究所研究報告は、本研究所の本年度の活動成果を取りまとめたものです。本研究報告の内容の一部は、別途学会誌等に発表されることがありますのでご了承ください。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • マイナス鎖RNAウイルス研究の新展開-ウイルス化石より見出された菌類ウイルスの実態を解き明かす-

    近藤 秀樹

    生物学に関する試験研究論叢   30   86 - 92   2015年

     詳細を見る

  • ゲノム上に存在する非レトロウイルス様配列NRVSの特徴付けと存在意義に関する研究

    近藤秀樹

    山陽放送学術文化財団リポート   ( 58 )   38 - 42   2014年9月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:山陽放送学術文化財団  

    CiNii Article

    CiNii Books

    J-GLOBAL

    researchmap

  • 食用キノコの子実体形成にウイルス感染が果たす役割についての研究 (温故知新プロジェクト)

    小松 あき子, 近藤 秀樹, 佐藤 真之, 近藤 秀樹, 佐藤 真之土屋 有紀, 倉橋 敦, 西堀 耕三, 鈴木 信弘, 藤森 文啓

    東京家政大学生活科学研究所研究報告 = Bulletin of Research Institute of Domestic Science, Tokyo Kasei University   37   109 - 114   2014年7月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:東京家政大学生活科学研究所  

    東京家政大学生活科学研究所研究報告は、本研究所の本年度の活動成果を取りまとめたものです。本研究報告の内容の一部は、別途学会誌等に発表されることがありますのでご了承ください。

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • Discovery of negative-strand RNA virus infection in fungi.

    Kondo, H, Chiba, S, Suzuki, N

    Proc. Symp. 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp.55-57   2014年

     詳細を見る

  • Pattern of systemic movement of soil-borne plant viruses: evidence obtained from GFP-tagged beet necrotic yellow vein virus.

    Tamada, T, Kondo, H, Bouzoubaa, S

    Proc. Symp. 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp. 11-14.   2014年

     詳細を見る

  • Mutational analysis of BNYVV p25 protein for symptom induction in systemic host Beta macrocarpa

    Chiba, S. Kondo, H, Suzuki, N, Tamada, T

    Proc. Symp. 9th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp. 15-17   2014年

     詳細を見る

  • ランのウイルス病とその診断法

    近藤 秀樹

    Orchid Sciences   23   41   2012年

     詳細を見る

  • 温帯性シンビジウム属植物に発生するウイルス.

    近藤秀樹, 丸山和之, 前田孚憲, 井上成信, 鈴木信弘

    名古屋国際ラン会議NIOC2011記録   22 - 27   2011年

     詳細を見る

  • 我が国のラン科植物に発生するポチウイルスの分子系統学的解析

    近藤秀樹, I Wayan Gara, 丸山和之, 前田孚憲, 松本純一, 井上成信, 鈴木信弘

    名古屋国際ラン会議NIOC2010記録   10 - 15   2010年

     詳細を見る

  • ランえそ斑紋ウイルスのダニ伝搬様式,分子系統および診断技術に関する研究

    近藤秀樹, 前田孚憲, 野田瑞紀, 鈴木信弘, 玉田哲男

    名古屋国際ラン会議2009 記録   8 - 13   2009年

     詳細を見る

  • Geographical variation, virulence and short-term evolution of beet necrotic yellow vein virus.

    Tamada, T, Andika, I. B. Chiba, S. Miyanishi, M. Han C. G, Kondo H

    Proc. Symp. 7th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp.22-25.   2009年

     詳細を見る

  • Evidence that beet necrotic yellow vein virus has an enhanced activity of RNA silencing suppression in roots

    Andika, I.B, Rahim, M. D, Kondo, H, Tamada, T

    Proc. Symp. 7th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp.17-21   2009年

     詳細を見る

  • RNAサイレンシングによるテンサイそう根病の抵抗性

    ANDIKA Ida Bagus, 玉掛秀人, 近藤秀樹, 玉田哲男

    植物ウイルス病研究会レポート   ( 8 )   95 - 103   2006年6月

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    J-GLOBAL

    researchmap

  • Introduction to RNA silencing.

    近藤 秀樹

    Proc. 22nd RIB International Symposium“RNA silencing: Principles and practice”. pp.3-5   2005年

     詳細を見る

  • Comparisons of RNA silencing suppressors encoded by two Benyviruses, Beet necrotic yellow vein virus and Burdock mottle virus.

    Kondo, H, Andika, I.B, Kurokawa, E, Bouzoubaa, S, Tamada, T

    Proc. Symp. 6th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp49-52   2005年

     詳細を見る

  • Involvement of Beet necrotic yellow vein virus RNA4 in symptom expression in Nicotiana benthamiana.

    Rahim., M. D., Andika, I.B., Han, C. G., Kondo, H. and Tamada, T

    Proc. Symp. 6th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors.. pp 49-52.   2005年

     詳細を見る

  • Analysis of the vascular movement of Beet necrotic yellow vein virus in Nicotiana benthamiana and Beta vulgaris spp. maritima using GFP-expressing viruses.

    Tamada, T, Kondo, H, Andika, I.B, Rahim., M. D, Bouzoubaa, S

    Proc. Symp. 6th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp 9-12.   2005年

     詳細を見る

  • Virus resistance in transgenic plants expressing Beet necrotic yellow vein virus coat protein readthrough protein domain

    Andika, I. B, Kondo, H, Suzuki, N, Tamada, T

    Proc. Symp. 5th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp. 84-87.   2003年

     詳細を見る

  • Single amino acid changes in the P25 protein gene of Beet necrotic yellow vein virus are involved in resistance responses in Beta vulgaris spp. maritima.

    Chiba, S., Miyanishi, M., Kondo, H. and Tamada, T.

    Proc. Symp. 5th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors. pp.5-8.   2003年

     詳細を見る

  • Pathogenicity and molecular variability of Beet necrotic yellow vein virus isolates from Europe, Japan, China and the United States.

    Tamada, T, Miyanishi, M, Chiba, S, Kondo, H, Han, C. G

    Proc. Symp. 5th Int. Working Group on Plant Viruses with Fungal Vectors pp.13-16.   2003年

     詳細を見る

  • Burdock mottle virus has a high genome similarity to beet necrotic yellow vein virus

    Hirano, S, Kondo, H, Maeda, T, Tamada, T

    Proc. Symp. 4th Int. Work. Group on Plant Viruses with Fungal Vector. pp.33-36.   1999年

     詳細を見る

  • Viruses infecting Oriental Cymbidium in Japan and their serodiagnosis

    Kondo, H, Maeda, T, Inouye, N

    Proc. 5th Asia Pacific Orchid Conference & Show. Fukuoka, Japan.   1995年

     詳細を見る

▼全件表示

講演・口頭発表等

  • Two novel negative-strand RNA mycoviruses related to mymonaviruses and phenuiviruses in the Shiitake mushroom

    Kondo, H, Lin, Y-H, Fujita, M, Hyodo, K, Andika, I.B, Suzuki, N

    Asian Mycology 2019 in Mie, Satellite Meeting: Neo-mycovirology.  2019年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2019年10月4日

    researchmap

  • Mycoviruses in Aspergillus luchuensis Isolated from Fermentation Environments in Japan

    Kondo, H., Nanaji, M., Fujita, M., Sugahara, H., Suzuki, N., Fujimori, F.

    6th International Mycovirus Symposium, Helsink  2025年5月11日 

     詳細を見る

    会議種別:口頭発表(一般)  

    researchmap

  • Evidence for the replication of a bipartite plant rhabdovirus in its arthropod mite vector.

    Kondo, H., Hyodo, K., Suzuki, N.

    The 5th Korea-Japan Joint Symposium on Plant Pathology, Takamatsu  2025年3月25日 

     詳細を見る

    会議種別:ポスター発表  

    researchmap

  • Cross-kingdom viral infection in agroecosystems

    Kondo H

    38th IPSR International Symposium and 14th Symposium on Plant Stress Sciences.  2023年2月27日 

     詳細を見る

    会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • 農業生態系のウイルス叢解明

    近藤秀樹

    オオムギ研究の未来開拓ワークショップ(岡山大・倉敷キャンパス)  2023年2月8日 

     詳細を見る

  • ウイルス

    近藤秀樹

    第15回植物病害診断教育プログラム  2019年9月9日 

     詳細を見る

    会議種別:公開講演,セミナー,チュートリアル,講習,講義等  

    researchmap

  • ウイルスハンティング最前線 -自然界に存在する生物界をまたいだウイルス感染−

    近藤 秀樹

    室内環境学会室内環境学会・微生物分科会  2018年 

     詳細を見る

  • 植物ラブドウイルスの分節化と進化

    近藤秀樹, 鈴木信弘

    日本進化学会大会プログラム・WS『多様なウイルスと進化の世界』  2017年8月24日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ラン植え戻しに際してのウィルス感染の危険性

    近藤 秀樹

    第4回 みんなで守ろう日本の野生ラン シンポジウム「誰もが実践できるサギソウの自生地の保護、復元活動  2011年 

     詳細を見る

  • BNYVV病原性セグメントRNA3を標的としたクロスプロテクションの検討

    近藤花保, 佐藤育男, 竹本大吾, 近藤秀樹, 千葉壮太郎

    日本植物病理学会報  2024年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2024年

    researchmap

  • 黄葉症状を呈するコムギから見出されたクロステロウイルス

    近藤秀樹, 兵頭究, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2024年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2024年

    researchmap

  • Fungal partitiviruses able to replicate across kingdoms

    TELENGECH Paul Kipkemboi, HYODO Kiwamu, ICHIKAWA Hiroaki, KUWATA Ryusei, KONDO Hideki, SUZUKI Nobuhiro

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web)  2024年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2024年

    researchmap

  • A defective RNA-encoded protein and its helper virus FbLFV1 cooperatively reduce growth and virulence of Fusarium boothii.

    ABBHI Vanshika, SATO Y., KANAMORI K., MIZUTANI Y., SATO I., TAKEMOTO D., KONDO H., SUZUKI N., SUGA H., CHIBA S.

    日本植物病理学会報  2024年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2024年

    researchmap

  • A new yadonushi-yadokari interplay in the Japanese strain NBRC 4031 of Aspergillus foetidus

    MUHAMMAD Fadli, KONDO Hideki, HISANO Sakae, SUZUKI Nobuhiro

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web)  2024年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2024年

    researchmap

  • Replication of single partitiviruses in organisms across three kingdoms: Fungi, Plantae and Animalia

    TELENGECH Paul Kipkemboi, HYODO Kiwamu, ICHIKAWA Hiroaki, KONDO Hideki, SUZUKI Nobuhiro

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2023年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2023年

    researchmap

  • Mycoviruses as novel candidates for the biological control of mushroom dry bubble disease

    HATVANI Lorant, HATVANI Lorant, KONDO Hideki, TELENGECH Paul, GROGAN Helen, SUZUKI Nobuhiro

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web)  2023年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2023年

    researchmap

  • A new tetra-segmented (+)ssRNA virus with split RdRP domains from Cryphonectria naterciae, a fungus found on chestnut and cork oak trees

    TELENGECH Paul Kipkemboi, SATO Yukiyo, SHAHI Sabitree, HISANO Sakae, CORNEJO Carolina, RIGLING Daniel, KONDO Hideki, SUZUKI Nobuhiro

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web)  2022年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2022年

    researchmap

  • 糸状菌の新規キャプシドレスRNAウイルス2種(ポリマイコウイルスとハダカウイルス)の性状比較

    佐藤有希代, SHAMSI W., SHAMSI W., JAMAL A., BHATTI M.F., 近藤秀樹, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2021年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年

    researchmap

  • オオムギ圃場に生息するアブラムシのウイルス叢解析

    近藤秀樹, 藤田美貴, 久野裕, 兵頭究, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2021年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年

    researchmap

  • Subcellular localization of carrot temperate virus 1 capsid protein in the nucleus and cytoplasm

    TELENGECH Paul Kipkemboi, HYODO Kiwamu, WANG W-Q, NATSUAKI T., SUZUKI Nobuhiro

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2021年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年

    researchmap

  • 植物病原菌Rosellinia necatrixに由来する多様なパルティティウイルスの特性

    MICHENI C. M., TELENGECH P. K., HISANO S., KONDO H., ARJONA-LOPEZ J. M., LOPEZ-HERRERA C., KANEMATSU S., SUZUKI N.

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2018年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2018年

    researchmap

  • Diverse partitiviruses from the phytopathogenic fungus, Rosellinia necatrix

    TELENGECH P. K., HISANO S., KONDO H., KANEMATSU S., SUZUKI N.

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2016年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2016年

    researchmap

  • Rosellinia necatrix fusarivirus 1:白紋羽病菌から分離された新規RNAウイルス

    ZHANG Rui, LIU Shengxue, 千葉壮太郎, 近藤秀樹, 兼松聡子, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2014年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2014年

    researchmap

  • ビッグベイン症を示すレタスから見いだされる2種ウイルスの細胞間移行タンパク質の同定

    平栗章弘, 植木尚子, 近藤秀樹, 野見山孝司, 一木(植原)珠樹, 佐々木信光, 丹生谷博, 笹谷孝英

    日本植物病理学会報  2013年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2013年

    researchmap

  • Defective interfering(DI)RNAのRosellinia necatrix partitivirus2複製への影響

    LIU Yu-Hsin, 千葉壮太郎, 近藤秀樹, 兼松聡子, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2013年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2013年

    researchmap

  • 植物ゲノムへ水平伝播された太古のパルティティウイルス配列

    千葉壮太郎, 近藤秀樹, 谷明生, 最相大輔, 坂本亘, 兼松聡子, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2012年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2012年

    researchmap

  • 非パラレトロRNAウイルス由来の植物染色体遺伝子

    千葉壮太郎, 近藤秀樹, 谷明生, 最相大輔, 坂本亘, 兼松聡子, 鈴木信弘

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集  2010年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2010年

    researchmap

  • サギソウモザイクウイルスRNAの全塩基配列の決定

    丸山和之, 近藤秀樹, 前田孚憲, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2010年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2010年

    researchmap

  • テッポウユリから分離された新規Carlavirusのゲノム構造の解析

    中村友紀, 伊藤徳臣, 近藤秀樹, 井村喜之, 前田孚憲

    日本植物病理学会報  2010年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2010年

    researchmap

  • Potato virus X(PVX)サブゲノムRNAの蓄積はRNAサイレンシングにより根特異的に抑制される

    ANDIKA I. B., 近藤秀樹, 玉田哲男, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2009年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2009年

    researchmap

  • (286) 土壌伝染性ウイルスのシステインリッチタンパク質は根のRNAサイレンシングを抑制する(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    アンディカ イダ バクス, 近藤 秀樹, 玉田 哲男, 鈴木 信弘

    日本植物病理學會報  2008年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (266) ランえそ斑紋ウイルス(OFV)様粒子の核内での形態形成とViroplasm様構造の関連性(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, 野田 瑞紀, 玉田 哲男, 鈴木 信弘

    日本植物病理學會報  2008年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (32)BNYVV 54 kDA : 読み過ごし領域導入植物のウイルス抵抗性を打破するBNYVV欠失変異株の出現(関西部会講演要旨,平成19年度地域部会講演要旨)

    アンディカ イダ バクス, 近藤 秀樹, 玉田 哲男, 鈴木 信弘

    日本植物病理學會報  2008年2月20日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年2月20日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (31)ランえそ斑紋ウイルス構造タンパク質Mの病原性はヌクレオキャプシドタンパク質Nにより抑制される(関西部会講演要旨,平成19年度地域部会講演要旨)

    近藤 秀樹, 玉田 哲男, 鈴木 信弘

    日本植物病理學會報  2008年2月20日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2008年2月20日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (236) Beet necrotic yellow vein virus p31の根特異的サイレンシング抑制効果(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, Rahim M.D., Andika I.B., 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2007年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (235) 土壌伝染性ウイルスBNYVVおよびTRVは根において特異的にRNAサイレンシングを抑制する(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    Andika I.B., 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2007年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (227) テンサイ接種葉におけるBeet necrotic yellow vein virus抵抗性の病理学的および遺伝学的特性(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    玉田 哲男, 田口 和憲, 千葉 壮太郎, Andika I.B., 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2007年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルス(OFV)がコードするORF3タンパク質の機能解析(関西部会講演要旨,平成18年度地域部会講演要旨)

    近藤 秀樹, 中村 玲子, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2007年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • テンサイ接種葉におけるBeet necrotic yellow vein virus抵抗性の病理学的および遺伝学的特性

    玉田哲男, 田口和憲, 千葉壮太郎, ANDIKA I. B., 近藤秀樹

    日本植物病理学会報  2007年 

     詳細を見る

    開催年月日: 2007年

    researchmap

  • (368) Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV)感染植物の葉と根におけるRNAサイレンシング活性の比較(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    Andika Ida Bagus, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2006年11月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年11月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (367) Beta maritima M8におけるBeet necrotic yellow vein virusの全身移行の特徴(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    玉田 哲男, Andika Ida Bagus, 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2006年11月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年11月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (360) ランえそ斑紋ウイルス(OFV)の粒子形成に関与するウイルスタンパク質の同定(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, 廣門 知紗, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2006年11月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年11月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルス構造タンパク質の核移行とViroplasm様構造との関連性(関西部会講演要旨,平成17年度地域部会講演要旨)

    近藤 秀樹, 廣門 知紗, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2006年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • Beet necrotic yellow vein virusの宿主特異的維管束移行について(関西部会講演要旨,平成17年度地域部会講演要旨)

    玉田 哲男, 千葉 壮太郎, Rahim M. D., Andika I. B., 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2006年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • BNYVV P75遺伝子導入植物に見られるエソモザイク症状の解析(関西部会講演要旨,平成17年度地域部会講演要旨)

    Andika I. B., 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2006年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2006年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (285) ランえそ斑紋ウイルス構造タンパク質のNicotiana benthamianaに対する病原性(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2005年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (287) BNYVV P31の機能解析 : Nicotiana benthamianaに対する病原性(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    Rahim M. D., Andika I. B., 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2005年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (286) ランえそ斑紋ウイルス構造タンパク質の相互作用と核移行性について(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    廣門 知紗, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2005年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (288) BNYVVと抵抗性宿主にみられるHR様およびER様反応について(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    玉田 哲男, 千葉 壮太郎, 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2005年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2005年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (397)BNYVVとTRVの長距離移行と組織内分布の動態観察(平成16年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    玉田 哲男, Rahim M. D., 千葉 壮太郎, Andika I. B., 近藤 秀樹, Bouzoubaa S.

    日本植物病理學會報  2004年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (399)Benyvirusのコードするシステインリッチタンパク質のRNAサイレンシングサプレッサー活性(平成16年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, 黒川 恵美, Andika Ida Bagus, 千葉 壮太郎, 西口 正通, Bouzoubaa Salah, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2004年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (269) A Reovirus of the Fungus Cryphonectria parasitica That Is Infectious as Particles and Related to the Coltivirus Genus of Animal Pathogens(Abstracts of the Papers Presented at the Annual Meeting of the Society, Fukuoka, March 28-30, 2004)

    Hillman B. I., Supyani S., Kondo H., Suzuki N.

    日本植物病理學會報  2004年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年8月25日

    記述言語:英語  

    researchmap

  • (398)RNAサイレンシングによるBNYVV抵抗性 : 葉と根におけるRNA分解能力の差異(平成16年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    Andika I. B., 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2004年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (85)BNYVV P31 (RNA4)のNicotiana benthamianaに対する病原性(関西部会講演要旨)(平成15年度地域部会講演要旨)

    韓 成貴, ラヒム ムハマッド ダニアル, アンディカ イダ バクス, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2004年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (86)BNYVVゲノムの多様性 : RNA3とRNA4の役割と宿主特異性(関西部会講演要旨)(平成15年度地域部会講演要旨)

    玉田 哲男, 千葉 壮太郎, アンディカ イダ バクス, ラヒム ムハマッド ダニアル, 韓 成貴, 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2004年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (84)ウイルス遺伝子導入植物にみられる回復表現型はトランスジーンの転写量とDNAのメチル化が必要である(関西部会講演要旨)(平成15年度地域部会講演要旨)

    アンディカ イダ バクス, ラヒム ムハマッド ダニアル, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2004年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2004年2月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (401)Beet necrotic yellow vein virus P25遺伝子の病原性を担うシステイン残基の同定(平成15年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    千葉 壮太郎, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (400)BNYVVの分子変異と病原性(平成15年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    玉田 哲男, 宮西 征揮, 千葉 壮太郎, 韓 成貴, 近藤 秀樹

    日本植物病理學會報  2003年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (402)RNAサイレンシングによるBNYVV抵抗性 : 汁液接種とPolymyxa betae菌接種による抵抗性の差異(平成15年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    アンディカ イダ バクス, ラヒム ムハマッド ダニエル, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (403)テンサイのそう根症状発現に関与する宿主遺伝子の探索(平成15年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    笹井 隆志, 黒川 恵美, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (66)GFPラベルBeet necrotic yellow vein virusの植物内における挙動

    千葉 壮太郎, 韓 成貴, 近藤 秀樹, Bouzoubaa Salah, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年2月25日

    記述言語:日本語  

    GFP(green fluorescent protein)などのレポーター遺伝子は,ウイルス感染細胞の可視化やウイルス遺伝子産物の細胞内挙動を解析するために広く用いられている.Beet necrotic yellow vein virus(BNYVV)は5種の分節ゲノム(RNA1〜5)をもつが,RNA1とRNA2が感染と増殖のために必要である.RNA2の外被タンパク質読み過ごし領域にGFPを挿入したウイルスは,P75-GFP融合タンパク質をウイルス感染細胞で安定して発現することができる(Erhardt et al.,2001).一方,GFPを導入したRNA3レプリコンは,RNA1とRNA2との共接種によりGFPの発現が確認された.これらを別々に植物へ接種すると,いずれもウイルスの細胞間移行および維菅束移行を可視化して追跡することが出来た.例えば,全身感染植物であるNicotiana benthamianaでは,RNA1とRNA2のみで全身に移行する様子が蛍光により観察された.一方,Beta macrocarpaでの全身移行には,RNA1とRNA2に加えて野生型のRNA3が必要であることが確認された.以上,異なったゲノムセグメントにGFPをタグすることにより,ウイルスゲノムの植物体内における挙動をより詳細に追跡することが可能となった.

    researchmap

  • (67)BNYVVの外被タンパク質遺伝子を導入した形質転換体の解析

    アンディカ イダ バクス, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年2月25日

    記述言語:日本語  

    筆者らは,Beet necrotic yellow vein virus(BNYVV)の外被タンパク質(CP)の読み過ごし領域(54k)を導入したNicotiana benthamianaは,高頻度でBNYVV対して強い抵抗性と回復性を示すこと,そしてこの強度抵抗性は,トランスジーンのRNAサイレンシングでおこり,回復現象はウイルス感染によって誘導されるRNAサイレンシングによっておこることを報告した.今回,CPを導入した形質転換体について解析を行った.形質転換体20系統についてBNYVVを汁液接種した結果,19系統は非形質転換体と同様,2週間以内にモザイク症状を示し,1系統(CP20)のみが抵抗性を示した.CPの蓄積量と抵抗性との間に相関はみられなかった.CP20系統では,非形質転換体と比べて,感染率がやや低く,全身症状の発現が1〜2週間遅れた.ノーザンおよびサザン解析の結果,CP20系統の抵抗性はRNAサイレンシングによると推定された.CP導入植物では,54k導入植物でみられた強度抵抗性及び回復現象を示す植物は得られなかった.以上から,BNYVVのCPおよび54k導入植物における抵抗性の機構を考察する.

    researchmap

  • (68)BNYVV P25タンパク質に相互作用する宿主因子の検索 : 酵母Two-hybridシステムを用いた試み

    近藤 秀樹, 桑名 賢, 黒川 恵美, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2003年2月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2003年2月25日

    記述言語:日本語  

    Beet necrotic yellow vein virus(BNYVV)のP25遺伝子は,テンサイそう根病の病原性因子であるとともに,抵抗性植物では抵抗性反応を引き起こすエリシターとして機能する.このP25タンパク質と相互作用する宿主因子を探索するために酵母Two-hybridシステムを用いた.P25のORF領域をpGBKT7のGAL4 DNA結合ドメイン下流に挿入しpGBKT7-P25を構築した.Beta maritima MR2健全葉から抽出したpoly(A)RNAに対するcDNAはpGADT7-RecベクターのGAL4活性化ドメイン下流に宿主酵母の相互組換を用いクローニングした.このクローニング時にpGBKT7-P25を共に形質転換し,これをGAL4応答性の栄養レポーター遺伝子(HIS3,ADE2)の選択培地上でスクリーニングした.その結果,HIS3レポーターの栄養要求性による選抜で約700個のコロニーが得られ,さらにADE2レポーターにより約80コロニーが選抜された.そのうち40個がMEL1レポーターにより弱い陽性と考えられる淡い青色コロニーであった.現在この40クローンの解析を進めている.

    researchmap

  • (211)BNYVVに対する抵抗性の品種特異性を決定しているP25タンパク質のアミノ酸の同定(平成14年度 日本植物病理学会大会講演要旨)

    千葉 壮太郎, 宮西 征揮, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2002年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2002年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (210)BNYVV 54k領域を導入した植物の抵抗性はRNAサイレンシングによって起こる(平成14年度 日本植物病理学会大会講演要旨)

    Andika I.B., 近藤 秀樹, 鈴木 信弘, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2002年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2002年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 植物‐微生物相互作用研究の現状と将来展望 I ウイルス病 Benyvirusの宿主適応と病徴出現の分子機構

    玉田哲男, 宮西征揮, 千葉壮太郎, ANDIKA I B, 近藤秀樹

    日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集  2002年7月15日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2002年7月15日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • BNYVV外被タンパク質読過ごし領域を導入した植物にみられる回復現象(関西部会講演要旨)

    アンディカ イダ バクス, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2002年4月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2002年4月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (89)BNYVV外被タンパク質読み過ごしタンパク質遺伝子を形質転換した植物のウイルス抵抗性

    イダ バクス アンディカ, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2001年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2001年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (97)BNYVV P25遺伝子はテンサイの接種葉におけるウィルス増殖を抑制する

    千葉 壮太郎, 宮西 征輝, 近藤 秀樹, 西口 正通, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2001年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2001年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (102)ランえそ斑紋ウイルス(OFV)の介在配列とmRNAの転写開始配列および終結配列

    近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2001年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2001年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルスの複製酵素遺伝子の解析(関西部会講演要旨)

    近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  2000年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 2000年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (278) ゴボウ斑紋ウイルス(BdMoV)ゲノムの全塩基配列の解析 (平成11年度 日本植物病理学会大会)

    平野 修一, 近藤 秀樹, 前田 孚憲, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  1999年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1999年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (287) ランえそ斑紋ウイルスの遺伝子構造 : 2分節ゲノム性とラブドウイルスとの類似性

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 玉田 哲男, 白子 幸男

    日本植物病理學會報  1998年8月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1998年8月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (71) ランえそ斑紋ウイルスの構造タンパク質P49遺伝子の同定 (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  1997年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1997年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (72) オンシツヒメハダニによるランえそ斑紋ウイルスの伝搬 (関西部会)

    前田 孚憲, 近藤 秀樹, 光畑 興二, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  1997年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1997年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (329)テッポウユリから分離されたcarlavirusのRNA 3'末端領域の塩基配列(平成9年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    伊藤 佐智夫, 近藤 秀樹, 前田 孚憲, 玉田 哲男, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1997年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1997年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (332)ランえそ斑紋ウイルスの構造蛋白質P20遺伝子の同定(平成9年度日本植物病理学会大会講演要旨)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1997年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1997年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (48) ランえそ斑紋ウイルス (OFV) の構造タンパク質P26遺伝子の解析 (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1996年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1996年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (46) ゴボウ斑紋ウイルスの諸性質 (関西部会)

    前田 孚憲, 平野 修一, 近藤 秀樹, 玉田 哲男

    日本植物病理學會報  1996年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1996年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (299) デンドロビウムモザイクウイルス (DeMV) の外被タンパク質遺伝子の塩基配列 (日本植物病理大会)

    植田 正浩, 近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1996年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1996年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (79) 東洋ランから分離されたランえそ斑紋ウイルス(OFV)の細胞内存在様式 (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1995年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1995年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (75) テッポウユリから分離された Carlavirus (関西部会)

    前田 孚憲, 伊東 佐智夫, 近藤 秀樹, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1995年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1995年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (266) Orchid fleck virus (OFV)の構造タンパク質 (日本植物病理大会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, ガラ イ ワヤン, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1995年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1995年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (265) Dendrobium mosaic virusの精製並びにわが国のラン科植物に発生する他のPotyvirusとの血清学的類縁関係 (日本植物病理大会)

    前田 孚憲, 植田 正浩, 近藤 秀樹, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1995年6月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1995年6月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (72) Vanda から分離された cymbidium mosaic virus の諸性質 (関西部会)

    ガラ イワヤン, 近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1994年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1994年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (74) エビネの新病害,黄色斑紋モザイク病の病原ウイルス (関西部会)

    井上 成信, 松本 純一, 前田 孚憲, 光畑 興二, 近藤 秀樹, 田原 望武

    日本植物病理學會報  1994年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1994年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (73) 東洋ランから分離された orchid fleck virus の理化学的ならびに血清学的性質 (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 光畑 興二, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1994年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1994年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (3) Cymbidium 属植物から分離された ORSV 分離株間での RNase protection assay による性状比較 (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1993年12月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1993年12月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (44) 東洋ランから分離された odontoglossum ringspot virus(ORSV)について (関西部会)

    近藤 秀樹, 前田 孚憲, 井上 成信

    日本植物病理學會報  1992年1月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1992年1月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • (11) ラナンキュラス退緑斑症状株から得られた Potyvirus の2,3の性質 (夏季関東部会)

    藤森 文啓, 近藤 秀樹, 兼平 勉, 篠原 正行, 土居 養二

    日本植物病理學會報  1991年1月25日  日本植物病理学会

     詳細を見る

    開催年月日: 1991年1月25日

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 分節型植物ラブドウイルスは媒介者である節足動物のダニ体内で増殖する

    近藤秀樹, 兵頭 究, 鈴木信弘

    令和6年度日本植物病理学会大会  2025年3月26日 

     詳細を見る

  • Fungal partitiviruses able to replicate across three kingdoms.

    Telengech, P., Hyodo, K., Ichikawa, H., Kondo, H., Suzuki, N.

    38th Annual Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology Society  2024年7月27日 

     詳細を見る

  • A new yadonushi-yadokari interplay in the Japanese strain NBRC 4031 of Aspergillus foetidus.

    Fadli, M., Hisano, S., Kondo, H., Suzuki, N.

    The 38th Annual Meeting of the Chugoku/Shikoku Regional Virology Society.  2024年6月27日 

     詳細を見る

  • Screening for viruses in RNA-Seq data

    Hideki Komdo

    Mini-symposium on Armillaria viruses. at Swiss Federal Research Institute WSL  2023年6月20日 

     詳細を見る

  • コムギに感染するベータフレキシ科の新規RNAウイルス.

    近藤秀樹, 吉田直人, 兵頭 究, 久野 裕, 玉田哲男, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集 2022年 札幌(オンライン)  2022年 

     詳細を見る

  • 分節型ラブドウイルスに見いだされたゲノムリアソートメント

    近藤秀樹, 広田恵介, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2018年3月12日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • アカクローバーうどんこ病菌より見いだされた新規トティウイルス

    近藤秀樹, 久野昌, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2017年4月12日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 分節型ラブドウイルスの感染戦略

    近藤 秀樹

    第39 回 岡山植物病理セミナー  2016年 

     詳細を見る

  • Deep sequencing解析により明らかになったBotrytis tulipaeの9種ウイルスによる混合感染

    近藤秀樹, 久野昌, LIN Y. H, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2015年3月10日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 宿主ゲノム上に存在する RNA ウイルス感染記録を紐解く

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    平成27年度植物感染生理談話会  2015年 

     詳細を見る

  • 2分節マイナス鎖RNAウイルスであるランえそ斑紋ウイルス(OFV)のmRNAおよびleader RNAの特性

    近藤秀樹, 丸山和之, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2014年5月10日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 植物および昆虫の核ゲノム上に見いだされたベニウイルス様配列

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2014年2月25日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 植物ゲノム上のRNA感染記録から紐解くウイルス-宿主相互作用.

    近藤 秀樹

    第6回植物ストレス科学研究シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • 新規benyvirus・burdock mottle virus(BdMoV)と植物・昆虫ゲノム上のbenyvirus類似配列の同定

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, ANDIKA Ida Bagus, 鈴木信弘, 玉田哲男

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集  2013年10月29日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • マイナス鎖RNAウイルスの菌類への感染の可能性

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 豊田和弘, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2013年3月21日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • マイナス鎖RNAウイルスの菌類への感染の可能性

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 鈴木信弘

    日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集  2012年10月31日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 植物の核ゲノム上に見いだされるマイナス鎖RNAウイルス様配列

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 梅林絵里, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2012年3月15日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • 非レトロRNAウイルス由来の植物染色体配列

    近藤秀樹, 千葉壮太郎, 谷明生, 最相大輔, 坂本亘, 兼松聡子, 鈴木信弘

    日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集  2011年3月11日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • Cymbidium chlorotic mosaic virusはソベモウイルス属の新規ウイルス種である

    近藤秀樹, 前田孚憲, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2011年2月25日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルス(OFV)の核内viroplasm形成にはNおよびP蛋白質が必要である

    近藤秀樹, 野田瑞紀, 廣門知紗, 鈴木信弘

    日本植物病理学会 平成22年度大会  2010年3月30日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランのウイルス病

    近藤 秀樹

    第62回ラン談話会大会  2010年 

     詳細を見る

  • 徳島県のシンビジウムから分離されたランえそ斑紋ウイルス(OFV)の塩基配列の解析.

    近藤秀樹, 野田瑞紀, 広田恵介, 前田孚憲, 玉田哲男, 鈴木信弘

    日本植物病理学会 平成21年度大会  2009年8月25日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルス(OFV)のヌクレオキャプシドタンパク質遺伝子(N)を用いた分子系統解析

    近藤秀樹, 野田瑞紀, 前田孚憲, 玉田哲男, 鈴木信弘

    日本植物病理学会報  2009年2月25日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルスの構造タンパク質が誘導する核内viroplasm様領域と粒子形成との関連性.

    近藤秀樹, 廣門知紗, 玉田哲男, 鈴木信弘

    第56回ウイルス学会  2008年10月1日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • ランえそ斑紋ウイルス(OFV)のヌクレオキャプシドタンパク質遺伝子(N)を用いた分子系統解析

    日本植物病理学会・平成20年度関西部会  2008年 

     詳細を見る

  • Beet necrotic yellow vein virus p31の根特異的サイレンシング抑制効果

    近藤秀樹, RAHIM M. D, ANDIKA I. B, 玉田哲男

    日本植物病理学会報  2007年8月25日 

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

▼全件表示

Works(作品等)

  • 「本邦の稀少ラン科植物に発生するウイルスの性状解明と遺伝子診断技術の開発」八雲環境科学振興財団 環境研究助成

    近藤 秀樹

    2015年

     詳細を見る

  • 「ゲノム上に存在する非レトロウイルス様配列NRVSの特徴付けと存在意義に関する研究」山陽放送学術文化財団研究助成

    近藤 秀樹

    2013年

     詳細を見る

  • 「マイナス鎖RNAウイルス研究の新展開-ウイルス化石より見出された菌類ウイルスの実態を解き明かす-」両備檉園記念財団研究助成

    近藤 秀樹

    2013年

     詳細を見る

  • 土壌菌により媒介される植物病原性ウイルスの新規防除戦略の構築:「RNAサイレンシングによるウイルスの制御をめざして」ウエスコ学術振興財団研究助成

    近藤 秀樹

     詳細を見る

受賞

  • NIOC賞

    2010年   名古屋国際蘭会議2010  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • NIOC奨励賞

    2009年   名古屋国際蘭会議 2009  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • Outstanding reviewer

    2017年10月   Virus Research  

     詳細を見る

共同研究・競争的資金等の研究

  • 絶対寄生菌ウイルスの研究プラットフォーム構築と生物防除への挑戦

    研究課題/領域番号:23K18029  2023年06月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的研究(萌芽)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    配分額:6500000円 ( 直接経費:5000000円 、 間接経費:1500000円 )

    researchmap

  • 作物超個体における根圏RNAウイルス叢の実体解明とその生態学的役割

    研究課題/領域番号:23H02214  2023年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    近藤 秀樹, 久野 裕, 兵頭 究, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    配分額:18590000円 ( 直接経費:14300000円 、 間接経費:4290000円 )

    researchmap

  • モデル糸状菌アカパンカビを用いたウイルス研究フロンティア

    研究課題/領域番号:21K19086  2021年07月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的研究(萌芽)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘, 本田 信治

      詳細を見る

    配分額:6500000円 ( 直接経費:5000000円 、 間接経費:1500000円 )

    本課題では、菌類ウイルス学のモデル実験系を構築するため、代表的な実験系糸状菌の一種であるアカパンカビを用いてウイルス学を展開するための基盤整備を進めている。以下に本年度の研究実績を示す。
    柱① アカパンカビの感染性ウイルスを用いたウイルス学:先の報告で見出されたアカパンカビに自然感染する新規ウイルスの性状解析を進を進めている(Hondaら, Nature Comm 2020、未発表)。これまでに、Neurospora crassaのNGSデータでデルタフレキシ及び新奇RNAウイルス(配列断片)が見出された菌株をついて、感染ウイルスのゲノム配列解析を進めている。さらに、Neurospora intermediaのNGS解析で見出されたウイルス様コンテイグ(フザリウイルス、ミトウイルス、デルタフレキシウイルス)について、元菌株のRT-PCRによりその存在確認と部分配列の決定をおこなった。一部ウイルスについては、3'RLM-RACEによる末端配列を進めている。これらのウイルスのRdRP配列に基づく分子系統樹(最尤法)を作成し、系統学的位置付けを検討した。
    柱② ウイルス病徴発現・複製、防御機構/ウイルス反撃に関与する因子の同定と機構解明:N. crassaの抗ウイルスRNAi機構の鍵酵素であるdcl1, dcl2 qde2の単独欠損変異株(dcl1、dcl2, qde2)、二重欠損変異株(dcl1/dcl2, qde2/dcl1, qde2/dcl2)、三重欠損変異体(qde2/dcl1/dcl2)および野生型を用いて、異なるゲノムタイプの二種マイコウイルス(一本鎖RNAウイルスと分節型dsRNAウイルス)の混合感染株をそれぞれ作出した。これらの混合感染株について全RNAを抽出し、小分子RNA分画のRNA-seq解析を行った。現在,得られたRNA-seqの配列データの詳細解析を進めている。

    researchmap

  • 作物根圏におけるウイルス叢の多様性とその感染動態から紐解く生態的意義

    研究課題/領域番号:20H02987  2020年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    近藤 秀樹, 久野 裕, 兵頭 究, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    配分額:17680000円 ( 直接経費:13600000円 、 間接経費:4080000円 )

    本課題では、ムギ類生存圏(特に根系)におけるウイルス叢の多様性・普遍性や動態を紐解き、さらにそれらの未知なる生態学的役割の一端に迫ることを目指している。以下に本年度の研究実績を示す。
    柱①根圏に存在する主要な菌類・昆虫ウイルス群の宿主探索:初年度に引き続き、ムギ類(オオムギ・コムギ)の地上部・根系、さらにアブラムシ、うどんこ病菌などのRNAseqデータを取得した。得られたデータセットはウイルス配列の確認作業や分子系統解析を進めている。さらに、北海道のコムギサンプルより見出された新規フレキシウイルス(WVQ)の解析の結果,当該圃場に三系統が存在し、ライムギにも感染できること、さらに土壌伝染性ウイルスの可能性が高いことを見出している。根系ウイルス叢のリザーバー探索については、本年度はオオムギ根のRNAseqデータに含まれる微生物リードの抽出と配列相同性解析により、微生物叢の概要を調査した。
    柱②根圏ウイルスの生物界を跨ぐ水平伝搬ポテンシャルと宿主への影響:昨年度より継続中のルテオウイルスなど新規植物ウイルスのゲノム解析を進めており、RT-PCRおよびRLM-RACE解析により全長ゲノムRNA配列を確認・決定した。また、圃場のうどんこ病菌のウイルスについては、今年度はdsRNAを鋳型にした全長cDNAのPCR増幅法の検討を進め、そのアンプリコン配列解析により未同定のゲノム末端配列の解析を進めている。
    柱③根圏ウイルス叢の年次変動とムギ類ウイルスの病原性の(再)評価:核酸抽出を伴わない簡易ウイルス診断法(RT-PCRをベースとする)の条件を設定し、一部圃場サンプル(葉)でルテオウイルス等の検出を進めている。現在、圃場オオムギサンプル(保存している過年度のを含む)について網羅的に検定すすめている。また、アブラムシ媒介性新規植物ウイルスについては、チャンバー内試験にて病原性評価を進めている。

    researchmap

  • メタゲノム解析に基づく菌類ウイルス叢の解明と有効利用に関する研究

    研究課題/領域番号:15K07312  2015年04月 - 2018年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    配分額:5070000円 ( 直接経費:3900000円 、 間接経費:1170000円 )

    菌類ウイルスの同定はウイルスの多様性や進化の理解に大きく寄与するが,うどんこ病菌(子嚢菌類)やさび病菌(担子菌類)のような活物寄生菌ではウイルスの存在は長らく不明であった。 本課題では、赤クローバーうどんこ病菌から二本鎖RNAを取得し,次世代シークエンサーによりウイルス叢解析を行った。その結果,赤クローバーうどんこ病菌に9種以上の新規トティウイルスの存在が明らかになった。さらに,類似するトティウイルス様配列をマメ科のさび病菌の転写物ライブラリーに見いだした. これらの成果は,トティウイルスがうどんこ病菌とさび病菌の間を嘗て水平伝搬し,それぞれの宿主と共進化したとことを示唆している.

    researchmap

  • 植物ゲノムに存在する非レトロウイルス様配列の挿入メカニズムと病理学的意義

    研究課題/領域番号:24580064  2012年04月 - 2015年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:5590000円 ( 直接経費:4300000円 、 間接経費:1290000円 )

    近年,哺乳動物などの核ゲノムに非レトロRNAウイルス様配列(NRVS)が発見され,それらは古のウイルス感染記録と考えられている. 本研究では,植物,菌類,昆虫の核ゲノムで新規NRVSを探索し,配列解析を行った.その結果,プラス鎖RNAウイルスであるベニウイルスの感染記録を植物(ヒヨコマメ)と昆虫(サシガメ)の核ゲノムに見出した.加えて,菌類ではじめてとなるマイナス鎖RNAウイルスの感染記録をうどんこ病菌核ゲノムに発見した.これらの成果はRNAウイルスの起源や進化を考える上で興味深い情報を提供する.さらに,本研究ではこれらのNRSVの挿入メカニズムと生物学的な存在意義について議論を加えた.

    researchmap

  • 植物マイナス鎖RNAウイルスが誘導するバイロプラズムの形成機構と感染戦略上の役割

    研究課題/領域番号:21580056  2009年 - 2011年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:4810000円 ( 直接経費:3700000円 、 間接経費:1110000円 )

    ランえそ斑紋ウイルス(OFV)はマイナス鎖RNAをゲノムに持ち,感染植物細胞に核内封入体バイロプラズムを誘導する.本研究では,このバイロプラズムの形成機構,特にその誘導に関わるウイルス側因子の同定を中心に検討した.アグロインフィルトレーション法を用いた一過的遺伝子発現実験を行ったところ,ヌクレオキャプシド蛋白質Nと推定リン酸化蛋白質Pを同時発現することで,ウイルス非感染下でもバイロプラズム様構造が誘導されることが示された.

    researchmap

  • 植物マイナス鎖RNAウイルスのゲノム輸送機構に関する研究

    研究課題/領域番号:19580048  2007年 - 2008年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    近藤 秀樹, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:4420000円 ( 直接経費:3400000円 、 間接経費:1020000円 )

    植物のマイナス鎖RNAウイルスであるOFVをモデルとし、ゲノム輸送に関わると考えられるウイルス因子を解析した。特にウイルスの移行形態とされるvRNP複合体を精製し、構成ウイルス蛋白質を明らかにした。そのうち、ゲノム結合タンパク質であるNの細胞核(複製の場と推定)への輸送にはアクセサリー蛋白質であるPが必要であることを発見した。また、モデル植物における細胞間移行や長距離移行に関する一連の研究も行った。これらの成果は、OFVのゲノム移行輸送機構を理解する上で基礎的な知見となると期待される。

    researchmap

  • 節足動物により媒介される植物ウイルスの伝搬機構の解析

    研究課題/領域番号:14760028  2002年 - 2004年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(B)

    近藤 秀樹

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:2500000円 ( 直接経費:2500000円 )

    本研究は植物病原体であるウイルスと媒介者との相互作用を明らかにすることにより、ウイルス伝搬機構を理解することが目的である。最終年度は、ランえそ斑紋ウイルス(OFV)の遺伝子解析に加え、媒介者であるオンシツヒメハダニ側にも焦点をあて解析した。1.ウイルス構造蛋白質を調べたところ、49KはRNA結合能を持ち、26Kは核移行性を示した。さらに20Kは粒子形成に関わると考えられた。非構造タンパク質の38Kは細胞間移行タンパク質の可能性が示唆された。61K蛋白質はシーケンス解析から、ラブドウイルスのG蛋白質に類似性を示し、N末端にシグナル様配列、C末端には膜貫通ドメイン様配列を持つ推定膜蛋白質であった。61Kは成熟ウイルス粒子表面に提示されるスパイク蛋白質と推定されたが、OFVの成熟粒子は非常に少なく、その粒子からの検出は困難であった。一方、植物個体上で継代したウイルス株は、61Kに1塩基欠失や塩基置換が認められる場合もあり、この遺伝子は伝搬性に関与するウイルス因子である可能性が考えられる。2.媒介者であるオンシツヒメハダニの分類学的位置づけを行うため、ミトコンドリアcytochrome oxidase subunit I(MIT-CO1)の保存領域をクローニングし、その塩基配列解析を行った。さらに、ヒメハダニの組織・細胞内所見を電子顕微鏡レベルで観察したが、ダニ体内でのウイルスの分布様式等の詳細を解明するには至らなかった。ウイルス非伝搬ダニ系統の作出を目指し、媒介者であるヒメハダニに対して一定期間高温処理を施した結果、ウイルス伝搬能を喪失したと考えられるダニ系統が得られた。現在、その詳細を解析中である。今後、本研究を発展させるためには、ウイルスの感染性クローンや人工ミニゲノムの作製が急務であり、ウイルス遺伝子(とくに61K)とハダニとの相互作用について解析を進めていく必要がある。

    researchmap

  • マイナス鎖RNAウイルス遺伝子操作系の確立に関する基礎的研究

    研究課題/領域番号:12760033  2000年 - 2001年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  奨励研究(A)

    近藤 秀樹

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    配分額:500000円 ( 直接経費:500000円 )

    植物マイナス鎖RNAウイルス遺伝子操作系の確立に向けて、ランえそ斑紋ウイルス(ラブドウイルス)の複製酵素を解析するとともに、ゲノムの転写、複製などに関与するシグナルの解析を行った。
    1.ウイルスの複製、転写シグナル配列の解析:RNA1には5種のタンパク質、RNA2には推定複製酵素をコードされるが、それぞれはモノシストロニックなmRNAとして発現していることがわかった。遺伝子の結合領域には転写の終結配列、介在配列、転写の開始配列が高度に保存されていた。ゲノム3'末端部の非コード領域(リーダー配列)も転写されていることが確認され、ウイルスの転写、複製に重要な働きをしているものと推定された。
    2.ウイルス複製酵素の解析:RNA2の212kDaタンパク質はラブドウイルスとの相同性解析により複製酵素であると考えられる。この遺伝子のmRNAは他のウイルス遺伝子のmRNAに比べて発現量は少ないものであった。この推定複製酵素の一部領域を大腸菌で発現させ、ウサギに免疫して得られた抗血清により、本タンパク質が粒子内に微量存在することが確認された。このことから、ウイルスの感染にはこの推定複製酵素の供給が必須であると示唆された。
    3.ウイルスcDNAのクローニング:ゲノムRNA両端を持つ人工ミニゲノムの作製を行い、GFPをマーカー遺伝子として導入した。さらに、RNA1およびRNA2に対応する各ゲノム全長cDNAのクローニングを行った。これらからin vitroで目的サイズの転写産物を得ることができた。
    以上、本研究課題では植物のマイナス鎖RNAウイルス遺伝子操作系の確立に向け、その基礎的データが得られたものと期待される。

    researchmap

  • 作物超個体における根圏RNAウイルス叢の実体解明とその生態学的役割

    研究課題/領域番号:23K26907  2023年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    近藤 秀樹, 久野 裕, 兵頭 究, 鈴木 信弘

      詳細を見る

    配分額:18590000円 ( 直接経費:14300000円 、 間接経費:4290000円 )

    researchmap

  • マイコイミュニティ研究の最前線とその植物病理学への新展開

    研究課題/領域番号:21H05035  2021年07月 - 2026年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(S)  基盤研究(S)

    鈴木 信弘, 近藤 秀樹, 河野 洋治

      詳細を見る

    配分額:188240000円 ( 直接経費:144800000円 、 間接経費:43440000円 )

    researchmap

  • 植物・菌・動物の生物界を跨いだウイルス感染:宿主との攻防と適応戦略

    研究課題/領域番号:21K18222  2021年07月 - 2025年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的研究(開拓)  挑戦的研究(開拓)

    鈴木 信弘, 近藤 秀樹

      詳細を見る

    配分額:25870000円 ( 直接経費:19900000円 、 間接経費:5970000円 )

    researchmap

  • マイコイミュニティ研究の最前線とその植物病理学への新展開

    研究課題/領域番号:21H04727  2021年04月 - 2025年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    鈴木 信弘, 近藤 秀樹, 兵頭 究

      詳細を見る

    配分額:41600000円 ( 直接経費:32000000円 、 間接経費:9600000円 )

    researchmap

  • 菌類ウイルスによる焼酎生産菌の一次・二次代謝産物生産機構に関する研究

    研究課題/領域番号:20K05791  2020年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    藤森 文啓, 近藤 秀樹, 千葉 壮太郎

      詳細を見る

    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

    菌類は二次代謝物として各種の化合物を生産し植物に対して病原性を持つものがいる。さらには日和見感染症の原因となる菌やアレルゲンとなる菌によって、ネガティブな側面も持つものが多数知られている。一方で、キノコ、酒類や醗酵食品の醸造、医薬品等の生産の場で活用される有用菌も多く知られている。これらの菌類には多様なマイコウイルスの感染が明らかになりつつあり、ウイルスの宿主となる菌の病原性を低下させる善玉ウイルスが注目されているが、その分子メカニズムは未解明な部分が多い。一方で、食用有用菌におけるマイコウイルスについては、キノコ等の病原性ウイルスの研究などが中心で、キノコ栽培上のウイルスの負の効果についての研究が多い。他の食用有用菌ではその研究は途についたばかりである。そこで、本課題では、食用(醗酵)に活用されるAspergillus属菌のマイコウイルスに焦点を当て、それらのウイルス学的な特徴付けを進めると共に、宿主菌に対してどのような正負の影響を与えているか理解することを目的としている。
    これまでの本研究から、Aspergillus属菌(主に黒麹菌・Aspergillus luchuensis)には総計11種類のssRNAまたはdsRNAウイルスが存在することが判明している。その多くには論文報告がない新種のウイルスが含まれており、また、食品(飲料など)生産に関わる菌群のウイルスという点でも世界的に報告が少ない。Aspergillus属菌は工業利用も盛んに行われている菌であり、特にクエン酸生産などにおいてはその生産量がわずかに向上するだけでも、最終生成物の価値が大きく変動する。本研究からはウイルス感染によるそれらの代謝物生産性に負の影響が確認されており、ウイルスフリー株を用いた工業利用の推奨を強く示唆するものである。

    researchmap

  • 植物糸状菌の抗ウイルス免疫機構のフロンティア

    研究課題/領域番号:17H01463  2017年04月 - 2021年03月

    日本学術振興会  科研費・基盤研究A  基盤研究(A)

    鈴木信弘, 近藤秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    「RNA干渉機構(RNAi)」による菌類ウイルスに対する自然免疫機構(複製阻害)を植物病原糸状菌で解析し、ウイルス防御機構の研究における植物・動物界に次ぐ第三極の形成を目指した。複数の予想もし得なかった結果を得た。すなわち、ウイルス特異的なDicer依存AGO不要の抗ウイルスRNAiの発見、宿主特異的ウイルス干渉機構の発見、新規ウイルス防御機構としての病徴発現軽減機構の発見、病徴発現軽減に関わる宿主遺伝子のDicerおよびSAGA複合体(ユニバーサル転写コアクティベーター)の同定、に至った。これらはパラダイムシフトをもたらす成果であり、一流専門誌あるいは一般誌に公表に至った。

    researchmap

  • 糸状菌ウイルスのネオ・ライフスタイル

    研究課題/領域番号:16H06436  2016年06月 - 2021年03月

    日本学術振興会  科研費・新学術領域研究(研究領域提案型)  新学術領域研究(研究領域提案型)

    鈴木信弘, 近藤秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    糸状菌ウイルスの2つのネオライフスタイルを確立し、それらの普遍性そして生態学的意義を検討した。まず、宿借・宿主性(ウイルス間の全く新しい相利共生関係)の証明とその分子基盤を紐解いた。ヤドカリウイルスはヤドヌシウイルスのキャプシドをハイジャックし、自身のRNA合成酵素を使って複製する、一方ヤドヌシウイルスの複製を促進することを証明した。さらに、裸性(粒子は作らず、裸のRNAで存在)を示すハダカウイルスはキャプシドレスで感染菌糸破砕液中ではRNase感受性、超遠心で沈降不可の状態で存在することを明らかにした。宿借・宿主性を示す植物ウイルス(他グループによる)も見つかり、その普遍性が示された。

    researchmap

  • 担子菌ウイルスの宿主に及ぼすシグナル経路の解明と子実体形成への機能解析研究

    研究課題/領域番号:26450234  2014年04月 - 2017年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    藤森 文啓, 小松 あき子, 近藤 秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    配分額:5200000円 ( 直接経費:4000000円 、 間接経費:1200000円 )

    マイタケより2種のParititivirus (GfPV1)とRNA Virus (GfRV1)を同定するに至った。GfPV1は外被タンパク質と逆転写酵素を持つ。超遠心分離法によってウイルス粒子の確認を行い、Grifola flondosaにおいて新規のParititivirusであることを同定することができた。一方で、GfRV1は外被タンパク質を持たないcapcidlessウイルスでると推定した。両ウイルスは宿主であるマイタケに対しては顕著な表現型を与えないが、細胞周期阻害剤や低温培養においてウイルス存在によって生育に影響を与えることが判明し、マイクロアレイによる発現解析へと進めている。

    researchmap

  • 植物病原糸状菌の抗ウイルス自然免疫機構

    研究課題/領域番号:25252011  2013年04月 - 2017年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    鈴木 信弘, 中屋敷 均, 近藤 秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    配分額:45760000円 ( 直接経費:35200000円 、 間接経費:10560000円 )

    本研究では、「RNA干渉機構(RNAi)」による菌類ウイルスに対する自然免疫機構(複製阻害)を植物病原糸状菌で解析し、ウイルス防御機構の研究における植物・動物界に次ぐ第三極の形成を目指した。その結果、予想しなかった大きな成果が得られた。AGOを必要としないウイルス防御、AGOは本来細胞レベルウイルス防御に関わるRNAiの鍵因子であるが、RNAiに対して抑制的に働くAGOの発見、ウイルスのパターン認識からRNAi誘導に関与する宿主因子探索のスクリーニング系の構築等、の成果は抗ウイルスRNAiのパラダイムシフトをもたらす可能性が非常に高い。上記の成果は、一流専門誌あるいは一般誌に公表した。

    researchmap

  • Benyvirus属ウイルスの菌伝搬機構の解析

    研究課題/領域番号:18580042  2006年 - 2007年

    日本学術振興会  科研費・基盤研究C (分担)  基盤研究(C)

    玉田 哲男, 近藤 秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    Beet necrotic yellow vein virus(BNYVV;Bnyvirus属)は、5種の分節ゲノムからなり、Polymyxa betaeによって伝搬される。本研究は、この媒介に関与するウイルス遺伝子の機能および伝搬機構を明らかにすることを目的とする。ウイルスの増殖過程を可視的に観察できるGFP標識ウイルスの構築を行った。RNA2外被タンパク質リードスルー領域にGFPを挿入したウイルスは効率よく感染し、安定してGFPの発現が観察された。しかし、GFP標識ウイルスはP.betaeによって伝搬されなかった。当初の目的であるGFPウイルスを用いたP. betaeのウイルス獲得、感染実験は不成功に終わった。このGFP標識ウイルスを用いて、全身感染宿主におけるウイルスの移行様式、組織内分布を観察した。その結果、汁液接種によって葉に接種されたウイルスは、地上部の葉ではウイルスは皮層細胞から維管束組織への侵入が困難であること、また根に接種されたウイルスは、逆に維管束組織から非維管束組織への脱出が困難であることがわかった。このことが、一般に菌伝搬性ウイルスが地下部の根に局在し、地上部に移行できにくい理由と考えられた。P31タンパク質(RNA4)の機能解析を行ったところ、p31はP. betae伝搬性の効率性を高めること、ある特定の宿主では病徴を強めることおよび根特異的にRNAサイレンシングの抑制に貢献していることが明らかにされた。さらにp25タンパク質(RNA3)の機能について解析した結果、抵抗性の品種特異性を決定しているタンパク質が同定された。一方、抵抗性植物の葉では、顕著なウイルスの増殖抑制がみられたが、P. betaeで接種された根では増殖抑制はみられなかった。すなわち、地上部の葉と地下部の根ではウイルスに対する抵抗反応が異なることがわかった

    researchmap

  • 病原性・非病原性遺伝子として機能するBNYVV P25タンパク質の解析

    研究課題/領域番号:12052220  2000年

    日本学術振興会  科研費・特定領域研究A公募 (分担)  特定領域研究(A)

    玉田 哲男, 近藤 秀樹

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    1.判別宿主(Beta maritima)の選抜と遺伝的特性
    BNYVV(分離株O11)をテンサイの葉に汁液接種すると,感受性品種では黄色斑の感受性反応(S)を,抵抗性品種では,壊死斑,小斑点,無病斑などの抵抗性反応(R)を示し,接種葉でも感受性と抵抗性を識別することが可能となった.テンサイ野生種B.maritima 9種について検定した結果,B.maritima系統によって反応が異なり,多くは感受性反応と抵抗性反応を示す個体が混在していた.抵抗反応の異なる2つのラインを選抜し,MR1,MR2と名付けた.抵抗性,感受性集団の後代検定から,BNYVVに対するB.maritimaの抵抗性は優性遺伝子によって支配されていると推定された.
    2.抵抗性反応に関与するP25遺伝子の解析
    各種BNYVV分離株は,B.maritima MR1,MR2に対する抵抗反応の違いから,MB1のみに抵抗性,MR1とMR2の両者に抵抗性,両者に感受性を示すグループに分けられた.抵抗反応を示す宿主では,接種葉におけるウイルスの蓄積がみられないか,または著しく抑制された.この抵抗反応はP25タンパク質(219アミノ酸)の発現によって誘導されることが示された.すなわち,P25遺伝子欠損ウイルスでは,いずれの組み合わせにおいても抵抗反応は起こらずに病斑は退緑斑のまま拡大し,ウイルスの蓄積が認められた.各種野生分離株の比較および感染性クローンを用いた変異導入実験から,P25タンパク質の68-70番目のアミノ酸がB.maritaima MR1に対する抵抗反応を支配していることが証明された.

    researchmap

  • Polymyxa菌によって媒介される植物ウイルスの伝搬機構の解析

    研究課題/領域番号:09460028  1997年 - 1999年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    玉田 哲男, 近藤 秀樹, 前田 孚憲

      詳細を見る

    資金種別:競争的資金

    配分額:11000000円 ( 直接経費:11000000円 )

    本研究は,Polymyxa betae菌によるbeet necrotic yellow vein virus(BNYVV)の伝搬機構について解析したものである.Polymyxa属菌の分化型には,P.graminisとP.betaeがあり,さらにP.betaeには,テンサイやアカザ,スベリヒユ,アオビユなどに寄生する分化型が存在する.各種分化型についてウイルス伝搬性について検討した結果,BNYVVはテンサイに寄生する苗によってのみ特異的に伝搬されることがわかった.P.betae菌とBNYVVの寄生性について調べたところ本菌は多くの植物の根に感染することがわかった.しかし休眠胞子は観察されなかった.P.betae菌の感染に伴いこれまで非寄主とされていた植物にもウイルスが感染した.とくにNicotiana benthamianaは感受性が高いことから,有効なウイルス検定植物として利用できることがわかった.BNYVVのRNA2にコードされている外被タンパク質読み過ごしタンパク質のC末端領域が菌伝搬性に必須であることが証明された.BNYVVのRNA3,RNA4およびRNA5のcDNAからin vitroで感染性のある転写系を確立した.人工的に作成したRNA3,RNA4,RNA5の各種組み合わせをRNA1とRNA2を含むウイルスRNAとともに接種した結果,RNA3とRNA5は病徴発現に関与していることがわかった.RNA5またはRNA3にRNA4が加わると菌による伝搬性が向上し,ウイルスの安定性が高まった.RNA4は菌の伝搬効率を高める機能を持つことが証明された.RNA3およびRNA5にコードするP25およびP26タンパク質遺伝子を大腸菌の系を用いて発現させ,特異的抗体を作製した.感染植物での発現実験から,これらのタンパク質はBNYVVのウイルスの増殖や病徴出現に強く関与していることが示唆された.P25遺伝子の内部欠失変異株もつP.betae菌を用いた接種試験から,P25タンパク質は感受性品種ではそう根症状を起こし,抵抗性品種では,根のウイルスの増殖を抑制する機能をもつと推定された.

    researchmap

  • 野生植物のウイルス病抵抗性遺伝子の探索・評価並びに抵抗性機構の解明

    研究課題/領域番号:09660352  1997年 - 1999年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    前田 孚憲, 近藤 秀樹, 榎本 敬

      詳細を見る

    配分額:3200000円 ( 直接経費:3200000円 )

    1.野生植物に発生するウイルスのデーターベースの構築
    日本において野生植物から分離されたウイルス関するデーベースを構築するために、我が国で発刊されている主要な植物病理学関係の学術雑誌(5誌)の第1巻あるいは第1号から1998年に発行されたものについて、原著論文及び講演要旨からデーターを蒐集した。また、一部の研究報告書も加えた。収録した件数は489件であり、データーベースはウイルス英名・略号・和名・属名、植物名、発生地、記載者、資料名、巻・号、記載ページ、発行年より構成されている。
    2.野生植物に発生するウイルスの検索・同定
    各地でウイルス病様症状を示している野生植物を採集し、ウイルスの分離と同定を行った結果、63個体の植物からウイルスが検出され、それらのうち50個体の植物からのウイルスを同定した。これらの中には、その植物ではこれまでに発生が知られていなかった5種のウイルスが含まれている。
    3.退緑条斑モザイクを示すエビネから分離されたカブモザイクウイルスの性質
    退緑条斑モザイクを示すタカネから分離されたウイルスはカブモザイクウイルス(TuMV)と同定された。本ウイルスは汁液接種により11科33種の植物に感染した。本分離株は他の植物から分離されたTuMVの5分離株とはNicotiana glutinosaやダイコン品種に対する病原性が異なっていた。TuMVのウイルス粒子及び管状封入体に対する抗血清を用いた試験の結果、本分離株は他の分離株と血清学的に非常に近縁であることが明らかになった。
    4.ウイルスの血清学的検出法の開発と評価
    (1)Triple antibody sandwich enzyume-linked immunosorbent assay(TAS-ELISA)の評価
    モノクローナル抗体及びポリクローナル抗体を用いたTAS-ELISAによるトマト黄化えそウイルス(TSWV)及びキュウリモザイクウイルス(CMV)の検出の評価を行った。その結果、本法は非常に高感度であり、TSWVを保毒したアザミウマ1頭からのウイルスの検出も可能であった。また、感染植物からもCHVを高感度で検出することができた。
    (2)Direct tissue-blot immunoassayの開発
    感染植物葉にワイヤーブラシで多数の穴を開け、二トロセルロース膜に汁液をプロットする方法を考案した。本法はTSWV、CMV、TuMVなどに感染した植物の葉全体のウイルスの分布を調べるのに有効な方法であることが明らかになった。

    researchmap

  • マイコウイルスの分子生物学

    生研センター・イノベーション創出基礎的研究推進事業 

    近藤 秀樹

      詳細を見る

    担当区分:研究代表者  資金種別:競争的資金

    researchmap

▼全件表示

 

担当授業科目

  • ウイルス分子生物学演習 (2024年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2024年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2024年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学特別演習 (2024年度) 通年  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2024年度) 後期  - その他

  • 植物ウイルス学 (2024年度) 第1学期  - 木3,木4

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用 (2024年度) 前期  - 木5~8

  • 特別研究 (2024年度) その他  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2023年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学特別演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2023年度) 後期  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2023年度) 後期  - その他

  • 植物ウイルス学 (2023年度) 第1学期  - 木3,木4

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用 (2023年度) 前期  - 木5~8

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用学 (2023年度) 前期  - 木9~12

  • 特別研究 (2023年度) その他  - その他

  • 生物資源科学特別研究 (2023年度) 通年  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2022年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2022年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2022年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2022年度) 前期  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2022年度) 後期  - その他

  • 植物ウイルス学 (2022年度) 第1学期  - 木3,木4

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用学 (2022年度) 前期  - 木9~12

  • 生物資源科学特別研究 (2022年度) 通年  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2021年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2021年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2021年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2021年度) 前期  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2021年度) 後期  - その他

  • 植物ウイルス学 (2021年度) 第1学期  - 木3,木4

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用学 (2021年度) 前期  - 木9~12

  • 生物資源科学特別研究 (2021年度) 通年  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2020年度) 前期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2020年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2020年度) 後期  - その他

  • ウイルス分子生物学演習 (2020年度) 前期  - その他

  • 応用植物ウイルス学 (2020年度) 後期  - その他

  • 植物ウイルス学 (2020年度) 第1学期  - 木3,木4

  • 植物-ウイルス/細菌相互作用 (2020年度) 前期  - その他

  • 生物資源科学特別研究 (2020年度) 通年  - その他

▼全件表示

 

社会貢献活動

  • 悪いヤツだけじゃない!〜植物と関わるウイルスたち〜

    役割:講師

    おかやま高梁川流域 倉敷市大学連携講座  2023年10月28日

     詳細を見る

    種別:講演会

    researchmap

メディア報道

  • サイエンスBOX {知る} ウイルス、生物進化に一役 新聞・雑誌

    読売新聞/ on line関西発  2017年6月

     詳細を見る