Cornell University   Division of Nutritional Sciences   Visiting Fellow

1994年5月 - 1995年3月

岡山大学   医学部   助手

1989年4月 - 2001年3月

日本バイオインフォマティクス学会

情報処理学会バイオ情報学研究会

日本ゲノム微生物学会

日本菌学会関東支部

CBI(シービーアイ）学会

A new metabolite of propargylglycine, gamma-glutamylpropargylglycylglycine, in liver of D,L-propargylglycine-administered rats 査読

J Ohta, T Ubuka, H Kodama, K Sugahara, N Nagamine

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS   1334 ( 2-3 )   240 - 246   1997年3月

INCREASE IN CYSTATHIONINE CONTENT IN RAT-LIVER MITOCHONDRIA AFTER D,L-PROPARGYLGLYCINE ADMINISTRATION 査読

J OHTA, T UBUKA, H KODAMA, K SUGAHARA, K YAO, N MASUOKA, M KINUTA

AMINO ACIDS   9 ( 2 )   111 - 122   1995年

対称性のある代謝産物を含む代謝ネットワークにおけるsingle-atom tracing

太田 潤

情報処理学会研究報告   2025-BIO-81 ( 2 )   1 - 3   2025年2月

糖質代謝モデルネットワークにおけるsingle-atom tracingにより算出される原子レベル経路の活性比率

太田 潤

情報処理学会研究報告   2024-BIO-80 ( 10 )   1 - 4   2024年11月

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造の原子レベルマッピング

太田 潤

情報処理学会研究報告   2024-BIO-79 ( 4 )   1 - 4   2024年8月

代謝ネットワークにおける原子レベル経路の活性比率：定量的活性比率の一般計算法と可能な3つの型の半定量的活性比率

太田 潤

情報処理学会研究報告   2024-BIO-78 ( 39 )   1 - 7   2024年6月

代謝ネットワークにおける原子レベル経路の活性比率：半定量的活性比率と定量的活性比率

太田 潤

情報処理学会研究報告   2024-BIO-77 ( 30 )   1 - 5   2024年2月

Single-atom tracingにより算出される代謝経路の活性比率

太田 潤

情報処理学会研究報告   2023-BIO-76 ( 9 )   1 - 3   2023年11月

Single-atom tracingにより算出される代謝経路の収支の計算

太田 潤

情報処理学会研究報告   2023-BIO-75 ( 2 )   1 - 3   2023年8月

化学量論に基づく代謝経路の探索

太田 潤

情報処理学会研究報告   2022-BIO-70 ( 59 )   1 - 3   2022年6月

Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造における非分岐直鎖部分構造

太田 潤

情報処理学会研究報告   2022-BIO-69 ( 10 )   1 - 4   2022年3月

Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造variantの対称性の数

太田 潤

情報処理学会研究報告   2021-BIO-68 ( 4 )   1 - 3   2021年11月

Elementary flux mode型経路における代謝産物分子の生成・利用状態のスナップショットとしての化学量論的な代謝ネットワーク構造

太田 潤

情報処理学会研究報告   2021-BIO-66 ( 22 )   1 - 7   2021年6月

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造の算出: 算出されたネットワーク構造間の異同判定のためのアルゴリズムの最適化

太田 潤

情報処理学会研究報告   2021-BIO-65 ( 4 )   1 - 8   2021年3月

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造の算出: 算出されたネットワーク構造間の異同判定の高速化

太田 潤

情報処理学会研究報告   2020-BIO-64 ( 5 )   1 - 7   2020年11月

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的に釣り合った代謝産物レベルネットワーク構造算出の高速化

太田 潤

情報処理学会研究報告   2020-BIO-63 ( 1 )   1 - 7   2020年8月

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的に釣り合った代謝産物レベルネットワーク構造の算出

太田 潤

情報処理学会研究報告   2020-BIO-62 ( 3 )   1 - 6   2020年6月

対称性のある代謝産物を通るelementary flux mode型代謝経路の完全原子レベルマッピング

太田 潤

情報処理学会研究報告   2020-BIO-61 ( 9 )   1 - 8   2020年3月

Elementary flux mode型代謝経路の完全原子レベルマッピングの高速化

太田 潤

情報処理学会研究報告   2019-BIO-60 ( 6 )   1 - 7   2019年11月

代謝ネットワークにおけるelementary flux mode型経路の完全原子レベルマッピング

太田 潤

情報処理学会研究報告   2019-BIO-59 ( 2 )   1 - 6   2019年9月

代謝ネットワークにおける原子レベル完全生合成経路の算出

太田 潤

情報処理学会研究報告   2019-BIO-58 ( 59 )   1 - 6   2019年6月

代謝ネットワークにおけるisotopomer分布シミュレーションの収束性

太田 潤

情報処理学会研究報告   2019-BIO-57 ( 1 )   1 - 6   2019年3月

代謝ネットワークにおける同位体分布の経時変化シミュレーション

太田 潤

情報処理学会研究報告   2018-BIO-56 ( 5 )   1 - 6   2018年12月

EMU tracing: 与えられた代謝ネットワークにより原料elementary metabolite unit (EMU)から生成し得る代謝産物EMUの列挙

太田 潤

情報処理学会研究報告   2018-BIO-55 ( 6 )   1 - 7   2018年9月

Isotopomer tracing:与えられた代謝ネットワークにより原料isotopomerから生成し得るisotopomerの列挙

太田 潤

情報処理学会研究報告   2018-BIO-54 ( 48 )   1 - 6   2018年6月

Different effect of diastereoisomers of L-cystathionine sulfoxide on the stimulus coupled responses of human neutrophils 査読

Yosei Shimazaki, Jianying Zhang, Hiroshi Wakiguchi, Takanobu Kurashige, Yasuhiro Sagara, Noriyoshi Masuoka, Jun Ohta, Toshihiko Ubuka, Hiroyuki Kodama

Biochemical and Biophysical Research Communications   247 ( 2 )   387 - 391   1998年6月

Characterization of hydrogen peroxide removal activities in mouse hemolysates: catalase activity and hydrogen peroxide removal activity by hemoglobin 査読

N Masuoka, M Wakimoto, J Ohta, K Ishii, T Nakano

BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR BASIS OF DISEASE   1361 ( 2 )   131 - 137   1997年8月

Identification of S-[2-carboxy-1-(1H-imidazol-4-yl)ethyl]-3-mercaptopyruvic acid with a metabolic intermediate between S-[2-carboxy-1-(1H-imidazol-4-yl)ethyl]-L-cysteine and S-[2-carboxy-1-(1H-imidazol-4-yl)ethyl]-3-mercaptolactic acid 査読

M Kinuta, H Shimizu, N Masuoka, J Ohta, WB Yao, T Ubuka

AMINO ACIDS   13 ( 2 )   163 - 169   1997年

INCREASE IN TISSUE CYSTEINE LEVEL AND EXCRETION OF SULFATE AND TAURINE AFTER INTRAGASTRIC ADMINISTRATION OF L-2-OXOTHIAZOLIDINE-4-CARBOXYLATE IN RATS 査読

S YAMADA, T ABE, J OHTA, N MASUOKA, T UBUKA

AMINO ACIDS   8 ( 1 )   37 - 45   1995年

HIGH-PERFORMANCE LIQUID-CHROMATOGRAPHIC DETERMINATION OF TAURINE AND HYPOTAURINE USING 3,5-DINITROBENZOYL CHLORIDE AS DERIVATIZING REAGENT 査読

N MASUOKA, K YAO, M KINUTA, J OHTA, M WAKIMOTO, T UBUKA

JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY B-BIOMEDICAL APPLICATIONS   660 ( 1 )   31 - 35   1994年10月

Inhibition of sulfate-forming activity in rat liver mitochondria by (aminooxy)acetate 査読

T. Teraoka, J. Ohta, T. Abe, H. Inoue, T. Ubuka

Amino Acids   5 ( 2 )   245 - 251   1993年6月

ASSAY OF SIALIDASE ACTIVITY USING ION-EXCHANGE CHROMATOGRAPHY AND ACIDIC NINHYDRIN REACTION 査読

K YAO, T UBUKA, N MASUOKA, M KINUTA, J OHTA, T TERAOKA, S FUTANI

JOURNAL OF CHROMATOGRAPHY-BIOMEDICAL APPLICATIONS   581 ( 1 )   11 - 15   1992年10月

l-Cysteine metabolism via 3-mercaptopyruvate pathway and sulfate formation in rat liver mitochondria 査読

T. Ubuka, J. Ohta, W. B. Yao, T. Abe, T. Teraoka, Y. Kurozumi

Amino Acids   2 ( 1-2 )   143 - 155   1992年2月

CHEMICAL S-THIOLATION OF REDUCED RIBONUCLEASE-A WITH GLUTATHIONE AND CYSTEINE 査読

T UBUKA, J OHTA, N MASUOKA, T ABE, T TERAOKA, WB YAO, YQ CHAO

FRONTIERS AND NEW HORIZONS IN AMINO ACID RESEARCH   595 - 598   1992年

S-[2-Carboxy-1-(1 H-imidazol-4-yl)ethyl]cysteine in normal human urine 査読

M. Kinuta, N. Masuoka, K. Yao, J. Ohta, S. Yoshida, S. Futani, T. Ubuka

Amino Acids   1 ( 2 )   259 - 262   1991年6月

ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF 3-[(CARBOXYMETHYL)THIO]-3-(1H-IMIDAZOL-4-YL)PROPANOIC ACID FROM HUMAN URINE AND PREPARATION OF ITS PROPOSED PRECURSOR, S-[2-CARBOXY-1-(1H-IMIDAZOL-4-YL)ETHYL]CYSTEINE 査読

M KINUTA, K YAO, N MASUOKA, J OHTA, T TERAOKA, T UBUKA

BIOCHEMICAL JOURNAL   275   617 - 621   1991年5月

FORMATION OF SULFATE FROM L-CYSTEINE IN RAT-LIVER MITOCHONDRIA 査読

T UBUKA, S YUASA, J OHTA, N MASUOKA, K YAO, M KINUTA

ACTA MEDICA OKAYAMA   44 ( 2 )   55 - 64   1990年4月

VISUALIZATION OF SIALOGLYCOPROTEINS IN POLYACRYLAMIDE GELS BY ACIDIC NINHYDRIN REACTION 査読

K YAO, T UBUKA, N MASUOKA, M KINUTA, J OHTA, K ISHINO

ACTA MEDICA OKAYAMA   44 ( 2 )   65 - 70   1990年4月

REDUCTION OF 3-MERCAPTOPYRUVATE IN RAT-LIVER IS CATALYZED BY LACTATE-DEHYDROGENASE 査読

J OHTA, T UBUKA

ACTA MEDICA OKAYAMA   43 ( 2 )   89 - 95   1989年4月

Toward Complete Structural Analyses of Metabolic Networks: Prototype Data Format for Describing Both Inter- and Intra-Metabolite Atom-level Connectivities

Ohta J

Proceedings for 5th International Conference on Systems Biology   141-141   2004年

Data Format for Computational Analysis of Intermetabolite Atom-level Connectivity in Metabolic Networks

Ohta J

Molecular & Cellular Proteomics   2,9,830-830   2003年

タンパク質の立体構造情報の活用：複雑な条件を満たすタンパク質構成原子の列挙

太田 潤

情報処理学会研究報告   2023-BIO-73 ( 23 )   1 - 1   2023年3月

Single-atom tracingにより算出される原子レベル経路を与える代謝フラックスについて

太田 潤

情報処理学会研究報告   2022-BIO-72 ( 9 )   1 - 1   2022年11月

代謝マップと代謝経路図が表現するもの

太田 潤

情報処理学会研究報告   2022-BIO-71 ( 4 )   1 - 1   2022年9月

COVID-19感染者間の関係のPajekによる可視化

太田 潤

情報処理学会研究報告   2021-BIO-67 ( 5 )   1 - 1   2021年9月

糖質代謝モデルネットワーク上のsingle-atom tracingによる経路計算と経路選択

太田 潤

情報処理学会研究報告   2018-BIO-53 ( 6 )   1 - 6   2018年3月

Strategy for Exploring Metabolic Pathways: Generation of Hypothetical Metabolic Network. 査読

Ohta J

J Comput Sci Syst Biol   8 ( 1 )   55 - 58   2015年

Attempt of stoichiometric extension of amino acid metabolism-related model metabolic network

Jun Ohta

AMINO ACIDS   37 ( 1 )   95 - 95   2009年7月

IMAC, Inter- And Intra-Metabolite Atom-Level Connectivity Database

Jun Ohta

IFMBE (ISSN 1727-1983, ISBN 3-540-36839-6 Springer Berlin Heidelberg New York)   Volume 14, 4131-4131   2006年

A new dipeptide, O-phosphoserylethanolamine isolated from Agkistroden blomhoffi (mamushi) 査読

N Masuoka, JY Zhang, L Partoo, J Ohta, K Sasaki, H Ebinuma, H Kodama

ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS   407 ( 2 )   184 - 188   2002年11月

Cdk5/p35 regulates neurotransmitter release through phosphorylation and downregulation of P/Q-type voltage-dependent calcium channel activity 査読

K Tomizawa, J Ohta, M Matsushita, A Moriwaki, ST Li, K Takei, H Matsui

JOURNAL OF NEUROSCIENCE   22 ( 7 )   2590 - 2597   2002年4月

Determination of S-[2-carboxy-1-(1H-imidazol-4-yl)ethyl]glutathione, a novel metabolite of L-histidine, in tissue extracts from sunlight-irradiated rat by capillary electrophoresis 査読

M Kinuta, J Ohta, H Yamada, K Kinuta, T Abe, SA Li, A Otsuka, A Nakanishi, K Takei

ELECTROPHORESIS   22 ( 16 )   3365 - 3370   2001年10月

Reciprocal regulation of cysteine dioxygenase (CDO) and gamma-glutamylcysteine synthetase (gamma GCS) in rat hepatocytes.

YH Kwon, DL Bella, J Ohta, MH Stipanuk

FASEB JOURNAL   10 ( 3 )   2724 - 2724   1996年3月

Calvin-Benson回路の"transaldolase variant"によるglyceraldehyde 3-phosphate生成の原子レベル経路

太田 潤

第44回日本分子生物学会年会  2021年12月2日 

Calvin-Benson回路の反応によるCO2からのリブロース1,5-ビスリン酸新規生成の原子レベル経路

太田 潤

第15回日本ゲノム微生物学会年会  2021年3月4日 

対称性のある代謝産物を含む代謝ネットワークにおけるsingle-atom tracing

太田 潤

情報処理学会「第81回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2025年3月6日 

糖質代謝モデルネットワークにおけるsingle-atom tracingにより算出される原子レベル経路の活性比率

太田 潤

情報処理学会「第80回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2024年12月4日 

代謝ネットワークにおける原子レベル経路の活性比率：半定量的活性比率と定量的活性比率

太田 潤

情報処理学会「第77回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2024年3月8日 

Single-atom tracingにより算出される代謝経路の活性比率

太田 潤

情報処理学会「第76回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2023年11月29日 

Single-atom tracingにより算出される代謝経路の収支の計算

太田 潤

情報処理学会「第75回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2023年9月6日 

タンパク質の立体構造情報の活用：複数の座標条件のそれぞれを満たすタンパク質構成原子の列挙

太田 潤

第27回オープンバイオ研究会  2023年3月11日 

タンパク質の立体構造情報の活用：複雑な条件を満たすタンパク質構成原子の列挙

太田 潤

情報処理学会「第73回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2023年3月9日 

Single-atom tracingにより算出される原子レベル経路を与える代謝フラックスについて

太田 潤

情報処理学会「第72回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2022年11月29日 

Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造における非分岐直鎖部分構造

太田 潤

情報処理学会「第69回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2022年3月10日 

Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造variantの対称性の数

太田 潤

情報処理学会「第68回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2021年11月30日 

原子レベル情報を用いることなく、解糖系とペントースリン酸経路の非酸化的反応によりグルコースからリボース5-リン酸が生成する経路を列挙する

太田 潤

第94回日本生化学会大会 

COVID-19感染者間の関係のPajekによる可視化

太田 潤

情報処理学会「第67回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2021年9月30日 

Elementary flux mode型経路における代謝産物分子の生成・利用状態のスナップショットとしての化学量論的な代謝ネットワーク構造

太田 潤

情報処理学会「第66回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2021年6月30日 

Pajekを使う

太田 潤

第25回オープンバイオ研究会  2021年3月13日 

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造の算出: 算出されたネットワーク構造間の異同判定のためのアルゴリズムの最適化

太田 潤

情報処理学会「第65回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2021年3月11日 

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造の算出: 算出されたネットワーク構造間の異同判定の高速化

太田 潤

情報処理学会「第64回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2020年12月7日 

ペントースリン酸経路の非酸化的反応による解糖系代謝産物からのリボース5-リン酸生成経路の複雑性

太田 潤

第43回日本分子生物学会年会  2020年12月2日 

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的に釣り合った代謝産物レベルネットワーク構造算出の高速化

太田 潤

情報処理学会「第63回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2020年9月4日 

Elementary flux mode型代謝経路の化学量論的に釣り合った代謝産物レベルネットワーク構造の算出

太田 潤

情報処理学会「第62回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2020年6月29日 

原子レベル情報を用いる化学量論的に釣り合った生合成代謝経路算出

太田 潤

第61回日本生化学会中国・四国支部例会  2020年6月10日 

生命科学系公共データベースによる実習を立案した経験

太田 潤

第24回オープンバイオ研究会  2020年3月14日 

合流する生合成代謝経路の算出

太田 潤

第７０回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）  2020年3月13日 

対称性のある代謝産物を通るelementary flux mode型代謝経路の完全原子レベルマッピング

太田 潤

情報処理学会「第61回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2020年3月13日 

化学量論的に釣り合った生合成代謝経路の原子レベルマッピング：その応用

太田 潤

第14回日本ゲノム微生物学会年会  2020年3月7日 

原子レベル情報を用いる、解糖系とペントースリン酸経路の非酸化的反応によりグルコースからリボース5-リン酸を生成する経路の列挙

太田 潤

第93回日本生化学会大会  2020年9月16日 

Elementary flux mode型代謝経路の完全原子レベルマッピングの高速化

太田 潤

情報処理学会「第60回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2019年12月2日 

ペントースリン酸経路反応による非酸化的リボース5-リン酸生成のための原子レベル経路

太田 潤

第42回日本分子生物学会年会  2019年12月 

代謝ネットワークにおけるelementary flux mode型経路の完全原子レベルマッピング

太田 潤

情報処理学会「第59回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2019年9月8日 

Acetyl-CoAのacetyl部分の炭素原子のin silicoモデル糖質代謝ネットワーク内の代謝産物への取込

太田 潤

第92回日本生化学会大会  2019年9月 

糖質代謝モデルネットワークにおけるグルコースの酸素原子の二酸化炭素への経路

澤江誠吾, 太田潤

第8回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2019）  2019年9月 

Transketolase-like protein 1の代謝機能に関する13C代謝フラックス解析によるエビデンスの検討

太田 潤

第7回がんと代謝研究会  2019年8月2日 

代謝ネットワークにおける原子レベル完全生合成経路の算出

太田 潤

情報処理学会「第58回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2019年6月19日 

In silico 糖質代謝モデルネットワークにおける acetyl-CoA の acetyl部分の炭素のグルコースへのグルコース非産生的取込

太田 潤

第60回日本生化学会 中国・四国支部例会  2019年5月18日 

ノードの二項関係リストから所属ネットワーク別のノードリストを作成する

太田 潤

第23回オープンバイオ研究会  2019年3月10日 

“原子＝人”とみてみることから垣間見える代謝ネットワークと社会的ネットワークの比喩的類似性

太田 潤

第６８回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）  2019年3月9日 

代謝ネットワークにおけるisotopomer分布シミュレーションの収束性

太田 潤

情報処理学会「第57回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2019年3月8日 

メタノール利用反応を含む 糖質代謝モデルネットワークにおける メタノールからのグルコース完全合成

太田 潤

第13回日本ゲノム微生物学会年会  2019年3月6日 

代謝ネットワーク：特定原料代謝産物からの目的代謝産物完全合成の可能性

太田 潤

JSBi九州地域部会セミナー@福岡市  2018年12月17日 

代謝ネットワークにおける同位体分布の経時変化シミュレーション

太田 潤

情報処理学会「第56回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2018年12月14日 

糖質代謝モデルネットワークにおけるアセチルCoAのアセチル部分の炭素のグルコースへの取込について

太田 潤

第41回日本分子生物学会年会  2018年11月 

EMU tracing: 与えられた代謝ネットワークにより原料elementary metabolite unit (EMU)から生成し得る代謝産物EMUの列挙

太田 潤

情報処理学会「第55回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2018年9月18日 

Isotopomer tracingによる、メタノール利用反応を含む糖質代謝モデルネットワークにおけるメタノールからのグルコース完全合成の経路の検討

太田 潤

第91回日本生化学会大会  2018年9月 

Octave/Matlab上での生化学反応のbrute force生成の試み－4本の結合が切断される場合について

大槻和平, 太田潤

第7回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2018）  2018年9月 

Isotopomer tracing: 与えられた代謝ネットワークにより原料isotopomerから生成し得るisotopomerの列挙

太田 潤

情報処理学会「第54回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2018年6月 

代謝ネットワークのsingle-atom tracingにより計算される経路の働きの指標について

太田 潤

JSBi九州地域部会セミナー鹿児島2018  2018年5月25日 

糖質代謝のモデルネットワークにおける原子レベルの経路の算出と化学量論収支計算

太田 潤

第72回日本栄養・食糧学会大会  2018年5月 

生物ネットワーク情報の行列表現について

太田 潤

第22回オープンバイオ研究会  2018年3月9日 

新代謝経路発見のための仮想代謝ネットワーク生成について

太田 潤

第６５回 人工知能学会 分子生物情報研究会（SIG-MBI）  2018年3月8日 

メタノール利用反応を含む糖質代謝モデルネットワークにおけるメタノールからグルコースへの経路の検討

太田 潤

第12回日本ゲノム微生物学会年会  2018年3月 

糖質代謝モデルネットワーク上のsingle-atom tracingによる経路計算と経路選択

太田 潤

情報処理学会「第53回バイオ情報学研究会(SIGBIO)」  2018年3月 

Generation of hypothetical reactions from a set of metabolites based on stoichiometry

太田 潤

APBC 2018（The Sixteenth Asia Pacific Bioinformatics Conference）  2018年1月 

Atom Mapping MatrixとConnectivity matrixの相互変換

太田 潤

ConBio2017 2017年度生命科学系学会合同年次大会（第40回日本分子生物学会年会・第90回日本生化学会大会）  2017年12月 

代謝ネットワークのsingle-atom tracingにより計算される経路の生化学的意味について

太田 潤

日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)九州地域部会セミナー @宮崎  2017年10月 

代謝ネットワーク：原子ネットワーク構造と化学結合間のつながりによるネットワーク構造

太田 潤

JSBi 九州地域部会セミナー2017  2017年3月 

酵母においてプロパルギルグリシンから生成するγ-グルタミルプロパルギルグリシンのプロパルギルグリシン部分の立体配置

太田 潤

第39回日本分子生物学会年会  2016年11月 

仮想代謝ネットワークの分類

太田 潤

第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会  2015年12月 

糖質代謝のモデルネットワーク中のグルコースの炭素原子間のatomic tracing

太田 潤

第37回日本分子生物学会年会  2014年11月 

Toward Manipulating Biochemical Reactions on Octave/Matlab

HYODO Yuki, OHTA Jun

Metabolomics 2014: The 10th International Conference of the Metabolomics Society  2014年6月 

IMAC, Inter- And Intra-Metabolite Atom-Level Connectivity Database

太田 潤

第85回日本生化学会大会  2012年12月 

未知代謝経路予測のための仮想代謝ネットワーク生成に関する研究

太田 潤

第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会  2010年12月 

Attempt of stoichiometric extension of amino acid metabolism-related model metabolic network

太田 潤

11th International Congress on Amino Acids, Peptides and Proteins  2009年8月 

代謝ネットワークを原子ネットワークとみる考え方から“合成的”代謝ネットワーク研究へ

太田 潤

第9回日本蛋白質科学会年会  2009年5月 

新代謝経路探索のための化学量論的代謝ネットワーク拡張

太田 潤

第3回日本ゲノム微生物学会年会  2009年3月 

コンピュータ上での生化学反応生成から代謝ネットワーク研究へ

太田 潤

JSBi システムバイオロジー研究会  2009年1月 

Manipulating Biochemical Reactions on Octave/Matlab

HYODO Yuki, OHTA Jun

The 19th International Conference on Genome Informatics (GIW2008)  2008年12月 

メタボローム情報とstoichiometryに基づく仮想代謝ネットワーク生成法

太田 潤

第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会  2008年12月 

Generation of hypothetical metabolic networks for pathway prediction

OHTA Jun

2008年CBI学会, Chem-Bio Informatics Society  2008年10月 

代謝ネットワークを原子ネットワークとみる考え方とそのポテンシャルについて

太田 潤

高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト第7回連携研究会  2008年9月 

Strategy for exploring new metabolic pathways: Generation of hypothetical metabolic networks

OHTA Jun

IECA2008 (International E. Coli allianace)  2008年9月 

Concept of metabolic networks as atom networks and generation of metabolic networks by network expansion

OHTA Jun

ICSB2008 (International Conference on Systems Biology)  2008年8月 

代謝ネットワークにおけるノードの「機能」とネットワーク内での「位置」の関係に関する研究

太田 潤

第2回日本ゲノム微生物学会年会  2008年3月 

Metabolic networks as atom networks and balanced reaction pattern

太田 潤

第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会  2007年12月 

Concept of metabolic networks as atom networks

OHTA Jun

Nishinomiya-Yukawa International & Interdisciplinary Symposium 2007, What is Life? Yukawa Institute for Theoretical Physics, Kyoto University  2007年10月 

Visualization of atom network structure of metabolic networks by Pajek

OHTA Jun

CBI2007 Proceedings, Quantum Chemistry & Computational Chemistry to Life, Chem-Bio Informatics Society  2007年10月 

A Strategy for Metabolic Pathway Prediction: Generation of Metabolic Networks Using Balanced Reaction Pattern

OHTA Jun

The Seventh International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology  2007年7月 

Connectivity matrix method and atom mapping matrices

OHTA Jun

Second FEBS Advanced Course on Systems Biology: From Molecules To Life  2007年3月 

生物ネットワーク情報の行列表現とその代謝ネットワークへの応用

太田 潤

第1回日本ゲノム微生物学会年会  2007年3月 

Visualization of Metabolic Networks as Networks of Atoms by Pajek: An Application of Connectivity Matrix Method

OHTA Jun

The 17th International Conference on Genome Informatics (GIW2006)  2006年12月 

Metabolic Networks: Connectivity Matrix-Based Isotopomer Analysis on Matlab/Octave

OHTA Jun

The 7th International Conference on Systems Biology  2006年10月 

Attempt to express topological position of individual metabolites in the whole metabolic network of Escherichia coli.

OHTA Jun

IECA2006, 3rd International E.Coli Alliance Conference on Systems Biology  2006年10月 

原子のネットワークとしての代謝ネットワークと社会的ネットワークの類似性について 自分が原子になったと考えてみる

太田 潤

日本ソフトウェア科学会 ネットワークが創発する知能研究会 第2回国内ワークショップ  2006年9月 

Connectivity matrix method for analyses of biological networks and its application to atom-level analysis of a model network of carbohydrate metabolism

OHTA Jun

12th BTK meeting, Systems Biology: Redefining Biothermokinetics, International Study Group on Systems Biology  2006年9月 

ネットワークを構成するノードの「機能」とネットワーク内での「位置」の関係の研究に向けて

太田 潤

日本バイオインフォマティクス学会 システムバイオロジー研究会サテライトミーティング In 秋田  2006年8月31日 

IMAC, Inter- And Intra-Metabolite Atom-Level Connectivity Database

OHTA Jun

World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering 2006  2006年8月 

Connectivity Matrix 法によるネットワーク解析 - 原子レベル代謝ネットワーク解析への応用 -

太田 潤

日本バイオインフォマティクス学会・夏の学校  2006年8月 

Application of Connectivity Matrix Method to Atom-level Analysis of Metabolic Networks: Calculation of Paths Connecting Two Metabolites

OHTA Jun

CBI2006, Integration of Chem-Bio-Pharma Informatics for Rational Drug Development and e-ADMET, Chem-Bio Informatics Society  2006年7月 

Atom-level and Metabolite-level Analyses of Metabolic Networks using Matlab and Octave

OHTA Jun

20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress  2006年6月 

化学構造を含む原子レベル代謝ネットワーク全構造の記述と解析

太田 潤

文部科学省研究費補助金・特定領域研究ゲノム「４領域」第８回ワークショップ 微生物ゲノム研究のフロンティア  2006年3月 

Octave, Matlabを用いる代謝ネットワークの研究

太田 潤

日本バイオインフォマティクス学会 第９回システムバイオロジー研究会  2006年1月18日 

Theoretical Analysis of Metabolic Networks: Attempt to Express Topological Position of Individual Atoms in a Given Network

OHTA Jun

The 16th International Conference on Genome Informatics (GIW2005)  2005年12月 

Development of "connectivity matrix" method for theoretical analyses of metabolic networks

OHTA Jun

第78回日本生化学会大会  2005年10月 

数値計算ソフトOctave/Matlabを用いる原子レベルでの代謝ネットワークの研究

太田 潤

第一回 プロテイン・インフォマティクスワークショップ in 九州  2005年10月 

"Connectivity Matrix" Method: Analysis of Metabolic Networks on GNU Octave/Matlab

OHTA Jun

SYMBIONIC COURSE 2005: Methods, Data Handling and Standards in Neuronal Systems Biology  2005年8月 

ネットワーク構造の記述法の開発

太田 潤

日本バイオインフォマティクス学会・夏の学校  2005年8月 

Matlab/GNU Octave as a Platform for Analyses of Metabolic Networks

OHTA Jun

CBI学会2005年大会, Chem-Bio Informatics in the Post-Genome Era, Chem-Bio Informatics Society  2005年8月 

"Connectivity matrix" method for theoretical analyses of metabolic networks

OHTA Jun

Metabolomics 2005, The First Annual Meeting of the Metabolomics Society  2005年6月 

Connectivity matrix for describing all the atom-level connectivities in a given metabolic network and its use for analysis of the network structure

OHTA Jun

First FEBS Advanced Course on Systems Biology: From Molecules & Modeling To Cells  2005年3月 

Metabolic Networks: Use of Matrix Expression for Structural Analyses

OHTA Jun

第27回日本分子生物学会年会  2004年12月 

Atom-level Analysis of Metabolic Networks Consisting of Multiple Compartments

OHTA Jun

第77回日本生化学会大会  2004年10月 

Toward Complete Structural Analyses of Metabolic Networks: Prototype Data Format for Describing Both Inter- and Intra-Metabolite Atom-level Connectivities

OHTA Jun

5th International Conference on Systems Biology  2004年10月 

Structural analyses of metabolic networks using GNU Octave

OHTA Jun

CBI学会2004年大会, New Technologies for Drug Design and Discovery in the Post-Genome Era, Chem-Bio Informatics Society  2004年7月 

Atom-level Analysis of Metabolic Networks using GNU Octave and IMAC, A Database of Inter-Metabolite Atom-level Connectivity 招待

OHTA Jun

IECA2004, 2nd International E.Coli Alliance Conference on Systems Biology  2004年6月 

Intermetabolite atom-level connectivity in metabolic network Pathways from 6 carbon atoms of D-Glucose to CO2 in a model network of carbohydrate metabolism

OHTA Jun

第76回日本生化学会大会  2003年10月 

Data Format for Computational Analysis of Intermetabolite Atom-level Connectivity in Metabolic Networks

OHTA Jun

HUPO 2nd Annual & IUBMB XIX World Congress  2003年10月 

A Role of Gamma-Glutamylcysteine Synthetase in Propargylglycine Metabolism

OHTA Jun

HUPO 2nd Annual & IUBMB XIX World Congress  2003年10月 

代謝ネットワークの構造解析：Intermetabolite atom-level connectivityを表現するformat

太田 潤

CBI2003 情報計算化学生物学会2003年大会  2003年9月 

Intermetabolite atom-level connectivity in a model metabolic network of carbohydrate metabolism

OHTA Jun

IECA2003, First IECA Conference on Systems Biology of E. Coli  2003年6月 

ラット初代培養肝細胞によるシステイン代謝調節に関する研究

太田 潤, Young Hye Kwon, Martha, H. Stipanuk

第44回日本生化学会中国・四国支部例会  2003年5月 

プロパルギルグリシン投与ラット肝臓ミトコンドリア内のγ―グルタミルプロパルギルグリシルグリシン

太田 潤

第75回日本生化学会大会  2002年10月 

赤血球による過酸化水素の分解について ８．ヘモグロビンによる分解

益岡典芳, 太田潤, 汪達紘, 竹居孝二, 中野琢, 児玉裕敬

第74回日本生化学会大会  2001年10月 

酵母におけるプロパルギルグリシンのγ－グルタミルプロパルギルグリシンへの代謝

太田 潤

第74回日本生化学会大会  2001年10月 

Amanita pseudoporphyriaおよびAmanita abruptaに含まれる非タンパク性アミノ酸、プロパルギルグリシンの哺乳動物におけるグルタチオン類似体への代謝

太田 潤

平成13年度日本菌学会関東支部年次大会（日本大学薬学部）  2001年4月21日 

生化学Ｉ（演習・実習） （2024年度） 特別  - その他

生化学Ｉ（講義・演習） （2024年度） 特別  - その他

生化学ＩＩ（演習・実習） （2024年度） 特別  - その他

生化学ＩＩ（講義・演習） （2024年度） 特別  - その他

生化学 （2023年度） 特別  - その他

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生化学実習 （2023年度） 特別  - その他

生化学実習 （2023年度） 特別  - その他

生化学演習 （2023年度） 特別  - その他

生化学Ｉ（演習・実習） （2023年度） 特別  - その他

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基礎病態演習 （2022年度） 特別  - その他

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生化学・分子医化学実習 （2022年度） 特別  - その他

生化学実習 （2022年度） 特別  - その他

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基礎病態演習 （2021年度） 特別  - その他

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生化学・分子医化学実習 （2021年度） 特別  - その他

生化学実習 （2021年度） 特別  - その他

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基礎病態演習 （2020年度） 特別  - その他

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生化学・分子医化学実習 （2020年度） 特別  - その他

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