Organization
Faculty of Environmental, Life, Natural Science and Technology Associate Professor
Position
Associate Professor
External link
角井 宏行
Degree
-
Ph.D ( 2009.3 Chiba University )
Research Interests
-
Arabidopsis thaliana
-
Genome-editing
-
Self-incompatibility
-
Pollen Biology
-
Plant Molecular Biology
-
Pear
-
Apple
-
Petunia
-
Cryptomeria japonica
-
Wheat
Research History
-
Okayama University Graduate School of Environmental, Life, Natural Science and Technology Associate Professor
2025.10
-
The University of Tokyo Institute for Sustainable Agro-ecosystem Services Assistant Professor
2022.12 - 2025.10
-
Kyoto University Graduate School of Agriculture, Laboratory of Plant Breeding
2022.4 - 2022.11
-
Niigata University 自然科学系 Specially Appointed Assistant Professor
2019.12 - 2022.3
Country：Japan
-
Yokohama City University 生命ナノシステム科学研究科 Specially Appointed Assistant Professor Guest researcher in Zurich University
2016.9 - 2019.11
-
University of Zurich Post-doc researcher
2015.4 - 2016.8
-
University of Zurich JSPS Research Fellowships for Young Scientists (Abroad)
2013.4 - 2015.3
-
Nagoya University JSPS Research Fellowships for Young Scientists (PostDoc)
2010.4 - 2013.3
-
Chiba University JSPS Research Fellowships for Young Scientists (DC2)
2008.4 - 2010.3
Professional Memberships
-
Japanese Society of Forest Genetics and Tree Breeding
2021.10
-
The Molecular Biology Society of Japan
2021.7
-
The Japanese Forest Society
2020.11 - 2022.12
-
THE BOTANICAL SOCIETY OF JAPAN
2011
-
IASPRR (International Association of Sexual Plant Reproduction Research)
2010.4
-
JAPANESE SOCIETY OF BREEDING
2006
Committee Memberships
-
Frontiers in Plant Science Review Editor
2021.6
-
Workshop organizing committee
2017.10 - 2018.2
Committee type：Other
-
Japanese Society of Breeding Young researchers association/Secretary-General
2009 - 2012
Committee type：Academic society
Papers
-
The latest on study and research abroad during mid- and post-COVID-19 periods
Hiroyuki Kakui, Mai Minamikawa, Moeko Okada, Shun Sakuma, Mashiro Okada, Kanae Masuda, Takao Komatsuda
Breeding Research 26 ( 1 ) 85 - 90 2024.6
-
Masahiro Watanabe, Saneyoshi Ueno, Yoichi Hasegawa, Satoko Hirayama, Junji Iwai, Hiroyuki Kakui, Yoshinari Moriguchi
New Forests 55 ( 5 ) 1349 - 1362 2024.3
-
Dominance in self-compatibility between subgenomes of allopolyploid Arabidopsis kamchatica shown by transgenic restoration of self-incompatibility Reviewed International coauthorship
Chow-Lih Yew, Takashi Tsuchimatsu, Rie Shimizu-Inatsugi, Shinsuke Yasuda, Masaomi Hatakeyama, Hiroyuki Kakui, Takuma Ohta, Keita Suwabe, Masao Watanabe, Seiji Takayama, Kentaro K. Shimizu
Nature Communications 14 7618 2023.11
-
Shuhei Nasuda, Kazuki Murata, Hiroyuki Kakui, Koichi Yamamori, Takanori Yoshikawa
CYTOLOGIA 88 ( 3 ) 167 - 168 2023.9
-
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Masaaki Nameta, Shinsuke Shibata, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
PNAS Nexus 2 ( 8 ) 2023.8
-
Localization of TWISTED NEEDLES Locus on Linkage Map of Japanese Cedar (Cryptomeria japonica D. Don) Reviewed International journal
Yoshinari Moriguchi, Ryunosuke Saito, Saneyoshi Ueno, Yoichi Hasegawa, Hiroyuki Kakui, Asako Matsumoto
forests 13 ( 1524 ) 1524 - 1524 2022.9
-
Pollen number studies in Japanese cedar
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Rei Shibata, Hidenori Sassa, Yoshinari Moriguchi
11 ( 2 ) 97 - 103 2022.5
-
PRIMA: a rapid and cost-effective genotyping method with single-nucleotide resolution Invited International coauthorship
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Kentaro K Shimizu
Experimental Medicine 40 ( 4 ) 601 - 608 2022.2
-
Pollen number and ribosome gene expression altered in a genome-editing mutant of REDUCED POLLEN NUMBER1 gene Reviewed International coauthorship International journal
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Masaomi Hatakeyama, Kentaro K Shimizu
Frontiers in Plant Science 12 ( 768584 ) 2022.1
-
PRIMA: a rapid and cost-effective genotyping method to detect single-nucleotide differences using probe-induced heteroduplexes Reviewed International coauthorship International journal
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Kentaro K. Shimizu
Scientific Reports 11 ( 20741 ) 1 - 10 2021.10
-
Factors Affecting the Number of Pollen Grains per Male Strobilus in Japanese Cedar (Cryptomeria japonica) Invited Reviewed
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Rei Shibata, Yoshinari Moriguchi
Plants 10 ( 5 ) 856 2021.4
-
Gene controlling pollen number -Method to identify quantitative gene using genome editing- Invited
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Kentaro K Shimizu
Bioscience & Industry 79 ( 1 ) 32 - 33 2021.1
-
An improved pollen number counting method using a cell counter and mesh columns Reviewed
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Hidenori Sassa, Yoshinari Moriguchi
Plant Methods 16 ( 124 ) 1 - 13 2020.12
-
2020.10
-
Adaptive reduction of male gamete number in the selfing plant Arabidopsis thaliana. Reviewed International journal
Takashi Tsuchimatsu, Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Cindy Marona, Hiroki Tsutsui, Afif Hedhly, Dazhe Meng, Yutaka Sato, Thomas Städler, Ueli Grossniklaus, Masahiro M Kanaoka, Michael Lenhard, Magnus Nordborg, Kentaro K Shimizu
Nature Communications 11 ( 1 ) 2885 2020.6
-
Pollen grain counting using a cell counter
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Naoto-Benjamin Hamaya, Kentaro K. Shimizu
Methods in Molecular Biology 2160 1 - 11 2020
-
Chow-Lih Yew, Hiroyuki Kakui, Kentaro K. Shimizu
Journal of Plant Research 131 ( 2 ) 349 - 358 2018.3
-
次世代の遺伝学と育種 Invited
高橋有, 山内卓樹, 角井宏行, 寺内良平, 大柳一, 小宮怜奈, 宮武宏治, 内藤健
育種学研究 15 ( 3 ) 115 - 121 2013.9
-
Identification of an S-RNase binding protein1 (SBP1) homolog of apple (Malus×domestica) Reviewed
Mai F. Minamikawa, Daisuke Fujii, Hiroyuki Kakui, Nobuhiro Kotoda, Hidenori Sassa
Plant Biotechnology 30 ( 2 ) 119 - 123 2013
-
Interhaplotypic heterogeneity and heterochromatic features may contribute to recombination suppression at the S locus in apple (Malusdomestica) Reviewed
Sanhong Wang, Hiroyuki Kakui, Shinji Kikuchi, Takato Koba, Hidenori Sassa
Journal of Experimental Botany 63 ( 13 ) 4983 - 4990 2012.8
-
Structural Features of the S Locus of Apple Reviewed
Hidenori Sassa, Sanhong Wang, Mai Minamikawa, Hiroyuki Kakui, Shinji Kikuchi, Takato Koba
Acta Horticulturae 967 89 - 94 2012
-
Sequence divergence and loss-of-function phenotypes of S locus F-box brothers genes are consistent with non-self recognition by multiple pollen determinants in self-incompatibility of Japanese pear (Pyrus pyrifolia) Reviewed
Hiroyuki Kakui, Masaki Kato, Koichiro Ushijima, Miyoko Kitaguchi, Shu Kato, Hidenori Sassa
The Plant Journal 68 ( 6 ) 1028 - 1038 2011.12
-
Mai Hayashi, Aya Ujiie, Hiroaki Serizawa, Hidenori Sassa, Hiroyuki Kakui, Tetsuya Oda, Takato Koba
Euphytica 180 ( 3 ) 429 - 436 2011.8
-
Apple S locus region represents a large cluster of related, polymorphic and pollen-specific F-box genes Reviewed
Mai Minamikawa, Hiroyuki Kakui, Sanhong Wang, Nobuhiro Kotoda, Shinji Kikuchi, Takato Koba, Hidenori Sassa
Plant Molecular Biology 74 ( 1-2 ) 143 - 154 2010.9
-
Pollen-expressed F-box gene family and mechanism of S-RNase-based gametophytic self-incompatibility (GSI) in Rosaceae Invited Reviewed
Hidenori Sassa, Hiroyuki Kakui, Mai Minamikawa
Sexual Plant Reproduction 23 ( 1 ) 39 - 43 2010.3
-
Hoytaek Kim, Hiroyuki Kakui, Nobuhiro Kotoda, Yutaka Hirata, Takato Koba, Hidenori Sassa
MOLECULAR BREEDING 23 ( 3 ) 463 - 472 2009.4
-
Polymorphism of SFBB-gamma and its use for S genotyping in Japanese pear (Pyrus pyrifolia) Reviewed
Hiroyuki Kakui, Takeshi Tsuzuki, Takato Koba, Hidenori Sassa
Plant Cell Reports 26 ( 9 ) 1619 - 1625 2007.9
-
Hoytaek Kim, Hiroyuki Kakui, Takato Koba, Yutaka Hirata, Hidenori Sassa
Breeding Science 57 ( 2 ) 159 - 164 2007.6
-
S locus F-Box brothers: Multiple and pollen-specific F-box genes with S haplotype-specific polymorphisms in apple and Japanese pear Reviewed
Hidenori Sassa, Hiroyuki Kakui, Mayu Miyamoto, Yusuke Suzuki, Toshio Hanada, Koichiro Ushijima, Makoto Kusaba, Hisashi Hirano, Takato Koba
Genetics 175 ( 4 ) 1869 - 1881 2007.4
Books
-
食品衛生学雑誌 第66巻 第3号
角井宏行（ Role： Contributor , DNAの1塩基差を判別するPRIMA法の開発と無花粉スギ原因遺伝子の特定）
2025.6
-
全国の大学農場・センターの特色「一農場一アピール」
（ Role： Joint author , 無花粉スギの原因遺伝子の特定に成功〜花粉症フリーな社会に向けて〜）
2024.4
-
The University of Tokyo Agri-Power Vol.11
2023.5
-
2022.8
-
Pollen and Pollen Tube Biology (Methods in Molecular Biology series No. 2160) International journal
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Naoto-Benjamin Hamaya, Kentaro K. Shimizu（ Role： Joint author , Pollen Grain Counting Using a Cell Counter）
Springer 2020.6 （ ISBN:9781071606711 ）
Presentations
-
An improved pollen number counting method using a cell counter and mesh columns
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Hidenori Sassa, Yoshinari Moriguchi
The 138th Meeting of the Japanese Society of Breeding 2020.10.10
-
ゲノムワイド関連解析から探るシロイヌナズナにおける花粉数の進化
土松隆志, 土松隆志, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, 金岡雅浩, GROSSNIKLAUS Ueli, HEDHLY Afif, MARONA Cindy, MENG Dazhe, 佐藤豊, STADLER Thomas, 筒井大貴, 筒井大貴, LENHARD Michael, NORDBORG Magnus, 清水健太郎
日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2016.8.22
-
GWASから量的形質の進化を探る:シロイヌナズナの生殖形質を例に
土松隆志, 土松隆志, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, MARONA Cindy, MENG Dazhe, 筒井大貴, 金岡雅浩, STADLER Thomas, LENHARD Michael, NORDBORG Magnus, 清水健太郎
日本応用動物昆虫学会大会講演要旨 2016.3.10
-
角井宏行, 土松隆志, 土松隆志, 山崎美紗子, MARONA Cindy, MENG Dazhe, MENG Dazhe, 金岡雅浩, STADLER Thomas, LENHARD Michael, NORDBORG Magnus, NORDBORG Magnus, 清水健太郎
日本植物学会大会研究発表記録 2015.9.1
-
ゲノムワイド関連解析から探る量的形質の進化:シロイヌナズナを例に
土松隆志, 土松隆志, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, MARONA Cindy, MENG Dazhe, 金岡雅浩, STADLER Thomas, LENHARD Michael, NORDBORG Magnus, 清水健太郎
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2015.8.20
-
Research on genes controlling pollen “number” and “viability” in plants Invited
Hiroyuki Kakui
2025.11.29
-
Controlling Pollen Number for Agriculture Invited
Hiroyuki Kakui
2025.10.24
-
Analysis of the wheat Gc2 gene using Arabidopsis thaliana
The 19th Triticeae Meeting Japan 2024.12.21
-
DNAの1塩基差を判別するPRIMA法の開発と無花粉スギ原因遺伝子の特定 Invited
角井宏行
第120回 日本食品衛生学会 教育講演 2024.11.7
-
Single-pollen RNA-Seq analysis of male gametophytes with the induced chromosome breakage by a gametocidal gene
Koichi Yamamori, Kazuki Murata, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Shuhei Nasuda
3rd International Wheat Congress 2024.9.25
-
Live cell imaging of pollen mitosis in wheat to reveal chromosome breakage patterns induced by gametocidal genes
The 146th Meeting of the Japanese Society of Breeding 2024.9.19
-
埼玉工業大学 先端科学研究所 産学官交流センター講演会 Invited
角井宏行
2024.8.23
-
花粉の数を決める遺伝子の探索と DNA1塩基差検出法の開発 Invited
角井宏行
東京農工大学セミナー 2024.8.20
-
花粉数を制御して社会貢献を目指す Invited
Hiroyuki Kakui
2024.3.8
-
君たちはスギ花粉とどう生きるか〜無花粉スギ原因遺伝子を特定して花粉症フリーな社会へ〜 Invited
角井宏行
ORIENT 新時代の鼻科学を考える 2024.2.17
-
DNAの1塩基差を判別できるPRIMA法の開発 Invited
2024.1.25
-
Did the domestication change the pollen number in wheat? International coauthorship
Hiroyuki Kakui, Naoto-Benjamin Hamaya, Moeko Okada, Katharina Jung, Jilu Nie, Thomas Wicker, Beat Keller, Shuhei Nasuda, Kentaro K. Shimizu
The 18th Triticeae Meeting of Japan 2023.12.23
-
Single pollen RNA-seq analysis of the male gametophyte with induced chromosome breakage by a gametocidal gene in wheat
Koichi Yamamori, Kazuki Murata, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Shuhei Nasuda
The 18th Triticeae Meeting of Japan 2023.12.23
-
Pollen number studies:from basic to applied research
Hiroyuki Kakui
KEPLR kick-off meeting Zurich 2023.11.22
-
Unravelling the genetic architecture of male reproductive traits in Asian bread wheat (Triticum aestivum L.)
Naoto-Benjamin Hamaya, Hiroyuki Kakui, Moeko Okada, Katharina Jung, Jilu Nie, Thomas Wicker, Beat Keller, Shuhei Nasuda, Kentaro K. Shimizu
KEPLR kick-off meeting Zurich 2023.11.21
-
A high-throughput phenotyping by UAVs of a wheat NAM population and exploration of effective traits for predicting yield components
Shunsuke Yoshioka, Ken Kuroki, Miyuki Nitta, Jilu Nie, Masanori Ishii, Hiroyuki Kakui, Moeko Okada, Shotaro Takenaka, Kentaro K. Shimizu, Hiroyoshi Iwata, Wei Guo, Shuhei Nasuda
KEPLR kick-off meeting Zurich 2023.11.21
-
Genome-wide association study for detection of the genes controlling pollen number in polyploid wheat
Haruki Kojima, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Zhuo Su, Jilu Nie, Ken Kuroki, Wei Guo, Shuhei Nasuda
KEPLR kick-off meeting Zurich 2023.11.21
-
Single-cell RNA-seq analysis of the male gametophyte with induced chromosome breakage by a gametocidal gene in wheat
Koichi Yamamori, Kazuki Murata, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Shuhei Nasuda
KEPLR kick-off meeting Zurich 2023.11.21
-
Unravelling the genetic architecture of male reproductive traits in Asian bread wheat
Symposium University of Tokyo – ETH Zurich – University of Zurich 2023.10.15
-
A high-throughput phenotyping of the hexaploid wheat NAM population during tillering stage by UAVs and their correlation with yield-related traits
The 144th Meeting of the Japanese Society of Breeding 2023.9.17
-
Evolution of Male Gamete Number in Bread Wheat (Triticum aestivum L.)
Naoto-Benjamin Hamaya, Hiroyuki Kakui, Jilu Nie, Moeko Okada, Thomas Wicker, Beat Keller, Shuhei Nasuda, Kentaro K. Shimizu
International Conference Evolution in Action 2023.6.13
-
A High-throughput Phenotyping of Early Growth Patterns of a Hexaploid Wheat NAM Population by a UAV
Shunsuke Yoshioka, Ken Kuroki, Miyuki Nitta, Jilu Nie, Masanori Ishii, Hiroyuki Kakui, Moeko Okada, Shotaro Takenaka, Kentaro K. Shimizu, Hiroyoshi Iwata, Wei Guo, Shuei Nasuda
International Conference Evolution in Action 2023.6.12
-
Misako YAMAZAKI, Hiroyuki Kakui, Kentaro K. Shimizu
The 33rd International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2023) 2023.6.7
-
スギゲノム参照配列を用いた雄性不稔遺伝子 (MS3)候補遺伝子の同定
上野真義, 長谷川陽一, 鶴田燃海, 伊原徳子, 宮澤真一, 角井宏行, 岩井淳治, 平山聡子, 藤野 健, 山口勝司, 鈴木 穣, 豊田 敦, 重信秀治, 笠原雅弘, 森口喜成
第134回日本森林学会大会 2023.3.25
-
Live-cell imaging revealed function of the Gc2 gametocidal system in wheat
Hiroyuki Kakui, Kazuki Murata, Tomoki Uchino, Yoshikatsu Sato, Yoko Mizuta, Shuhei Nasuda
The 143rd Meeting of the Japanese Society of Breeding 2023.3.17
-
PRIMA: a rapid and cost-effective genotyping method with single-nucleotide resolution
Hiroyuki Kakui
Seminar at University of Tokyo 2023.3.7
-
Unravelling the genetic architecture of male reproductive traits in Asian bread wheat (Triticum aestivum L.)
Naoto-Benjamin HamayaHiroyuki KakuiJilu NieMoeko, OkadaThomas WickerBeat KellerShuhei NasudaKentaro, K. Shimizu
Plant & Animal Genome Conference / PAG 30 2023.1.13
-
Analysis of pollen-related traits in tetraploid and hexaploid wheat
Haruki Kojima, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Su Zhuo, Nie Jilu, Ken Kuroki, Wei Guo, Shuhei Nasuda
The 17th Triticeae Meeting of Japan 2022.12.17
-
Analysis of Gc genes in wheat Invited
Hiroyuki Kakui, Kazuki Murata, Yoshikatsu Sato, Yoko Mizuta, Shuhei Nasuda
The 17th Triticeae Meeting of Japan 2022.12.17
-
Identification and analysis of candidate genes regulating pollen number in A. thaliana
Naoto-Benjamin Hamaya, Hiroyuki Kakui, Afif Hedhly, Ana Marcela Florez-Rueda, Masaomi Hatakeyama, Misako Yamazaki, Ueli Grossniklaus, Kentaro K. Shimizu
Symposium of the Zurich-Basel Plant Science Center 2022.12.7
-
Single-nucleic acid substitution determines the male-sterility in Japanese cedar
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
The 45th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2022.11.30
-
Pollen counting with "Ju-o-Mujin" plant species reveal "Ju-o-Mujin" phenomena
Hiroyuki Kakui
The 18th Kyoto University Plant Researchers' Community "Ju-o-Mujin" Workshop 2022.11.22
-
Seminar at Tottori University Invited
Hiroyuki Kakui
2022.11.7
-
Complementation tests and transcriptome analysis of REDUCED POLLEN NUMBER1 in Arabidopsis thaliana
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Kentaro K Shimizu
The 142nd Meeting of the Japanese Society of Breeding 2022.9.24
-
Phenotyping of pollen-related traits and genome-wide association study in the tetraploid wheat core collection
Kojima Haruki, Hiroyuki Kakui, Takanori Yoshikawa, Su Zhuo
The 142nd Meeting of the Japanese Society of Breeding 2022.9.24
-
裸子植物で巨大ゲノムをもつスギにおける，無花粉スギMS4原因遺伝子の同定
Hiroyuki Kakui
86th Annual Meeting of the Botanical Society of Japan 2022.9.19
-
DNAの1塩基差を判別できるPRIMA法の開発と、 花粉数を決定する遺伝子についての研究 Invited
Hiroyuki Kakui
第8回生殖若手の会 2022.9.10
-
Pollen study, development of PRIMA, and observation of wheat pollen.
Hiroyuki Kakui
2022.7.30
-
Single-nucleic acid difference controls the pollen production in Japanese cedar, the largest source for severe pollinosis in Japan International conference
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
2022.6.24
-
Identification and analysis of candidate genes regulating pollen number in A. thaliana International coauthorship International conference
Naoto-Benjamin Hamaya, Hiroyuki Kakui, Afif Hedhly, Ana Marcela Florez-Rueda, Masaomi Hatakeyama, Misako Yamazaki, Ueli Grossniklaus, Kentaro K. Shimizu
26th ICSPR 2022.6.23
-
A novel non-S-specific self-incompatibility factor of Petunia International conference
Hidenori Sassa, Hiroki Azuma, Miwako Shimizu, Mana Komori, Daiki Horigome, Hiroyuki Kakui, Mai F. Minamikawa, Shinji Kikuchi, Takato Koba
26th ICSPR 2022.6.23
-
Pollen number is regulated by REDUCED POLLEN NUMBER1 encoding ribosome assembly factor and is characterized by an enriched selection signal among traits related to selfing syndrome in Arabidopsis thaliana Invited International coauthorship International conference
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Masaomi Hatakeyama, Lucas Mohn, Thomas Städler, Michael Lenhard, Magnus Nordborg, Kentaro K Shimizu
26th ICSPR 2022.6.22
-
Study of pollen number with high-throughput phenotyping and genotyping method Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Kobe University 2022.6.10
-
新規フェノタイピング・ジェノタイピング手法の開発と植物種を超えた花粉数制御への挑戦
Seminar at the University of Tokyo 2022.6.3
-
Cell counter and PRIMA reveal pollen mysteries. Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University 2022.4.8
-
Functional analysis revealed causal gene of MS4 in Japanese cedar Invited
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
The 133rd Annual Meeting of Japanese Forest Society 2022.3.28
-
Identification of MALE STERILITY 4 gene in Japanese cedar
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
The 141st Meeting of the Japanese Society of Breeding 2022.3.21
-
Hiroyuki KakuiMisako, YamazakiKentaro K Shimizu
The 44th Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan 2021.12.2
-
新規ジェノタイピング・フェノタイピング手法が切り拓く花粉数研究 Invited
角井宏行
千葉大学セミナー 2021.11.30
-
電気泳動でDNAの1塩基差を迅速・簡便・安価に判別できるPRIMA法の開発 International coauthorship
角井宏行, 山﨑美紗子, 清水健太郎
北陸植物学会 2021年度大会 2021.10.30
-
PRIMA: a rapid and cost-effective genotyping method to detect single-nucleotide differences of DNA using probe-induced heteroduplexes
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Kentaro K Shimizu
The 140th Meeting of the Japanese Society of Breeding 2021.9.24
-
An improved pollen number counting method and factors affecting the pollen number in Japanese cedar
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Rei Shibata, Hidenori Sassa, Yoshinari Moriguchi
The 85th Annual Meeting of the Botanical Society of Japan 2021.9.20
-
Natural variation of the REDUCED POLLEN NUMBER1 (RDP1) gene studied by the quantitative complementation test using the CRISPR/Cas9 system
Kentaro Shimizu, Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki
31st International Conference on Arabidopsis Research (ICAR2021) 2021.6.24
-
“花粉数”から読みとく、植物種・研究分野を超えた現象の理解
Hiroyuki Kakui
Society of Trans-disciplinary Plant Sciences 2021.6.4
-
“花粉数という形質の復興“による、シロイヌナズナからの花粉数を制御する遺伝子の同定、スギ花粉数への理解、NAMを基盤としたコムギの花粉数を制御する遺伝子の同定への挑戦 Invited
角井 宏行
京都大学 植物縦横無尽の会 2021.5.10
-
Development of efficient pollen number counting method and factors affected to pollen number in Japanese cedar
Hiroyuki Kakui, Eriko Tsurisaki, Rei Shibata, Hidenori Sassa, Yoshinari Moriguchi
132nd Meeting of The Japanese Forest Society 2021.3.23
-
花粉数を変える遺伝子の発見 -ゲノム編集,GWAS,トレードオフ解析などを添えて- Invited
角井宏行
麦学オンラインセミナー 2021.3.1
-
実践！ゲノム編集プロトコル -pKAMAITACHIベクターを用いた遺伝子破壊変異体の作製- Invited
角井宏行
新潟大学 農学部セミナー 2020.6.26
-
GWASとCRISPR/Cas9を用いた 花粉数を制御する遺伝子の同定 Invited
角井宏行
つくば森林総合研究所セミナー 2019.12.16
-
GWASとCRISPR/Cas9を用いた 花粉数を制御する遺伝子の同定 Invited
角井宏行
新潟大学セミナー 2019.12.5
-
Analysis of pollen number controlling genes Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University 2019.11.13
-
Analysis of pollen number controlling genes Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Chiba University 2019.11.11
-
Identification of pollen number controlling gene and trade-off analysis between pollen number and other traits in Arabidopsis thaliana
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Kentaro Shimizu
11th Tri-National Arabidopsis Meeting 2019.4.11
-
Identification of pollen number controlling gene by GWAS and CRISPR/Cas9
Hiroyuki Kakui
Biology 19 2019.2.7
-
Is there a trade-off between pollen number and other traits in Arabidopsis thaliana?
Kakui Hiroyuki, Tsuchimatsu Takashi, Yamazaki Misako, Shimizu Kentaro
PSC Symposium 2018 “Breakthroughs in Plant Sciences” 2018.12.5
-
Pollen number controlling gene revealed by GWAS and CRISPR/Cas9 Invited International conference
Hiroyuki Kakui
25th ICSPR (International Conference on Sexual Plant Reproduction) - Plant Reproduction 2018 2018.6.13
-
GWASとCRISPR/Cas9が明らかにする自殖シンドローム関連遺伝子 Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Chiba University 2018.6.5
-
Identification of pollen number controlling gene by GWAS and CRISPR/Cas9 International conference
Hiroyuki Kakui
Plant Development and Evolution: from molecules to ecosystems 2018.2.20
-
Identification and transcriptome analysis of pollen number controlling gene, RDP1 International conference
Hiroyuki Kakui
Symposium of the Zurich-Basel Plant Science Center 2017.11.30
-
Identification of a gene controlling pollen number by a GWAS and CRISPR mutants International conference
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Cindy Marona, Hiroki Tsutsui, Afif Hedhly, Dazhe Meng, Yutaka Sato, Thomas Stadler, Ueli Grossniklaus, Masahiro Kanaoka, Michael Lenhard, Magnus Nordborg, Kentaro Shimizu
Symposium on “Detecting the Genomic Signal of Polygenic Adaptation and the Role of Epistasis in Evolution” 2017.8.31
-
Identification of plant gamete number controlling gene by Genome wide association study and CRISPR/Cas9 Invited
Hiroyuki Kakui
BEEES seminar 2017.5.16
-
Adaptive Reduction of Male Gamete Number in a Selfing Species International conference
Kakui Hiroyuki, Tsuchimatsu Takashi, Yamazaki Misako, Shimizu Kentaro
LS2 annual meeting 2017 2017.2.2
-
Adaptive reduction of male gamete number in a selfing species
Kakui Hiroyuki, Tsuchimatsu Takashi, Yamazaki Misako, Shimizu Kentaro
Symposium of Zurich-Basel Plant Science Center: Plants for Health– from research to application 2016.12.1
-
Self-incompatibility and evolution of selfing species in plants Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Kihara Institute for Biological Research, Yokohama City University 2016.11.6
-
Adaptive reduction of male gamete number in a selfing species
Hiroyuki Kakui, Takashi Tsuchimatsu, Misako Yamazaki, Cindy Marona, Hiroki Tsutsui, Afif Hedhly, Dazhe Meng, Yutaka Sato, Thomas Städler, Ueli Grossniklaus, Masahiro Kanaoka, Michael Lenhard, Magnus Nordborg, Kentaro K Shimizu
新学術領域「新種誕生の原理」若手の会 2016.11.2
-
Adaptive reduction of male gamete number in a selfing species Invited International conference
Hiroyuki Kakui
2nd Swiss-Kyoto Symposium 2016 2016.10.31
-
REDUCED POLLEN NUMBER1 isolated by genome-wide association mapping showed recent selection on pollen number
Takashi Tsuchimatsu, Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Cindy Marona, Hiroki Tsutsui, Afif Hedhly, Dazhe Meng, Yutaka Sato, Thomas Städler, Ueli Grossniklaus, Masahiro M Kanaoka, Michael Lenhard, Magnus Nordborg, Kentaro K Shimizu
ICAR2016 2016.6.30
-
The genetic basis of pollen number variation revealed by a genome-wide association study in Arabidopsis thaliana. International conference
Hiroyuki Kakui
Symposium of the Zurich-Basel Plant Science Center 2015.12.3
-
Identification of pollen number controlling gene Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Nagoya University 2015.9.18
-
Identification of pollen number controlling gene Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at Okayama University 2015.9.16
-
Identification of pollen number controlling gene Invited
Hiroyuki Kakui
Seminar at the University of Tokyo 2015.9.14
-
自殖シンドローム:シロイヌナズナにおける自殖に関わる花形質の進化
土松隆志, 土松隆志, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, MARONA Cindy, MENG Dazhe, 金岡雅浩, STADLER Thomas, LENHARD Michael, NORDBORG Magnus, 清水健太郎
日本植物学会大会研究発表記録 2015.9.1
-
GWASによる花粉数を制御する遺伝子の同定および解析
角井 宏行
第128回日本育種学会講演会 2015.9
-
The genetic basis of pollen number variation revealed by a genome-wide association study in Arabidopsis thaliana. International conference
Hiroyuki Kakui
International Congress on Sexual Plant Reproduction 2014.7.14
-
シロイヌナズナの自殖の進化:分子遺伝学と進化生物学を組み合わせたアプローチ
清水健太郎, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, YEW Chowlih
日本植物生理学会年会要旨集 2014.3.11
-
佐々英徳, 南川舞, 角井宏行
育種学研究 2013.10.12
-
分子遺伝学とシミュレーションを組み合わせて自殖進化の一般的パターンを探る
清水健太郎, 土松隆志, 角井宏行, 山崎美紗子, YEW Chow‐lih
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2013
-
リンゴS遺伝子座のハプロタイプ間配列多様性とヘテロクロマチン化
WANG S, 角井宏行, 菊池真司, 木庭卓人, 佐々英徳
育種学研究 2012.9.14
-
ニホンナシにおける自家和合性変異ハプロタイプS4smの花粉側認識機能の解析
角井宏行, 加藤雅樹, 牛島幸一郎, 加藤修, 北口美代子, 佐々英徳
日本植物学会大会研究発表記録 2011.9.10
-
ニホンナシにおける雌ずい側自家和合性変異ハプロタイプの花粉側特異性の解析
2011.9
-
Analysis of pollen-part S specificity of S4sm, a stylar-part self-compatible S haplotype in Japanese pear.
角井宏行
2011.9
-
Sequence divergence and loss-of-function phenotypes of SFBB genes are consistent with non-self recognition by multiple pollen determinants in self-incompatibility of Japanese pear.
Hiroyuki Kakui, Masaki Kato, Koichiro Ushijima, Miyoko Kitaguchi, Shu Kato, Hidenori Sassa
Annual meeting of American Society of Plant Biology 2011.8
-
Structural features of the S locus of apple Invited International conference
Hidenori Sassa, Sanhong Wang, Mai Minamikawa, Hiroyuki Kakui
International workshop of Floral biology and S-incompatibility in fruit species 2011.6
-
ニホンナシのRNase を介した自家不和合性機構の解析
角井宏行, 加藤雅樹, 加藤修, 北口美代子, 佐々英徳
2010.12
-
Characterization of S-RNase binding protein1 (SBP1) homolog of apple (Malus × domestica) International conference
Minamikawa MaiFujii DaisukeKoyano, RyotaKakui HiroyukiKotoda NobuhiroSassa Hidenori
10th International Congress on Plant Molecular Biology 2010.10
-
ニホンナシにおける雌ずい側自家和合性変異ハプロタイプS4smの花粉側特異性の解析
角井宏行, 加藤雅樹, 加藤修, 北口美代子, 佐々英徳
第118回日本育種学会講演会 2010.9.24
-
リンゴにおける自家不和合性関連遺伝子SBP1(S‐RNase binding protein1)ホモログの同定と解析
藤井大輔, 角井宏行, 古藤田信博, 牛島幸一郎, 佐々英徳
育種学研究 2010.9.24
-
Characterization of the F-box gene cluster linked to the S-locus of apple International conference
Minamikawa Mai, Kakui Hiroyuki, Wang SH, Kotoda Nobuhiro, Kikuchi Shinji, Koba Takato, Sassa Hidenori
XXI International congress on Sexual Plant Reproduction 2010.8
-
Analysis of pollen-part S specificity of S4sm, a stylar-part self-compatible S haplotype in Japanese pear.
Hiroyuki Kakui, Masaki Kato, Shu Kato, Miyoko Kitaguchi, Hidenori Sassa
XXI International Congress on Sexual Plant Reproduction 2010.8
-
Analysis of S locus-linked F-box gene cluster in apple.
International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction: from pollination to fertilization 2010.3
-
Characterization of the F-box gene cluster linked to the S-locus of apple International conference
Minamikawa M, Kakui H, Kotoda N, Sassa H
Joint meeting of graduate students 2010
-
南川舞, 角井宏行, 古藤田信博, 佐々英徳
育種学研究 2009.9.25
-
リンゴおよびナシにおける花粉S遺伝子候補の同定と解析 Invited
角井宏行
第115回日本育種学会講演会・育種学と農学のこれからを考える17若手会主催研究集会 2009.3
-
Characterization of multiple F-box genes linked to the S locus of apple and Japanese pear International conference
Hidenori Sassa, Hiroyuki Kakui, Mai Minamikawa
Frontiers of sexual plant reproduction III 2008.10
-
S-RNase遺伝子のCAPS分析に よるリンゴ品種 S 対立遺伝子 22 種類の識別
Kim HT, 角井宏行, 古藤田信博, 木庭卓人, 佐々英徳
2008.10
-
ニホンナシ S 遺伝子座 F-box 遺伝子の配列多様 性とその S 遺伝子型判定法への利用
角井宏行, 都筑剛, 木庭卓人, 佐々英徳
日本育種学会 第111回講演会 2007.3
-
ニホンナシの花粉で発現するS ハプロタイプ特異的F-box遺伝子群
角井宏行, 佐々英徳
遺伝研研究集会/特定領域研究 ゲノム障壁 ワークショップ 2006.11
-
ニホンナシ品種‘巾着’、‘大原紅’、‘若光’、 ‘なつひかり’の S 遺伝子型決定と新規 S-RNase の同定
Kim HT, 角井宏行, 佐々英徳, 木庭卓人
日本育種学会 第110会講演会 2006.9
-
ニホンナシの花粉で発現する S ハプロタイプ 特異的 F-box 遺伝子群
角井宏行, 佐々英徳, 平野久, 木庭卓人
日本育種学会 第110回講演会 2006.9
-
リンゴ S 遺伝子座の構造解析
2006.9
-
ニホンナシの花粉で発現する Skp1 様遺伝子の単離
角井宏行, 佐々英徳, 平野久
日本育種学会 第107・108回講演会 2005.8
-
ニホンナシの花粉特異的 F-box 遺伝子
角井宏行, 宮本摩由, 佐々英徳, 平野久
日本育種学会 第107・108回講演会 2005.8
Industrial property rights
-
Probe induced heteroduplex mobility assay (PRIMA)
Hiroyuki KakuiMisako YamazakiKentaro K Shimizu
Awards
-
2022.12
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
-
Presentation award at the 141st meeting of the Japanese Society of Breeding
2022.5
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Masahiro Otani, Masaru Nakano, Saneyoshi Ueno, Yoshinari Moriguchi
-
Presentation award at the 140th meeting of the Japanese Society of Breeding
2021.11
Hiroyuki Kakui, Misako Yamazaki, Kentaro K Shimizu
-
2021.6 Society of Trans-disciplinary Plant Sciences
Hiroyuki Kakui
-
First prize for the poster award at the SPIRITS symposium
2018.2 3rd International Plant Sciences Workshop, “Plant development and evolution: from molecules to Ecosystems”
Hiroyuki Kakui
-
128th Japanese Society of Breeding presentation award
2016.2
Hiroyuki Kakui
-
118th Japanese Society of Breeding presentation award
2010.11
Hiroyuki Kakui
-
Chiba University Ph.D. thesis award
2009.3 Chiba University
Hiroyuki Kakui
Research Projects
-
Research for pollen number gene by using yeast
2023.10 - 2024.09
University of Tokyo Agricultural Science Emergence Fund (Support Project for Young Researchers)
Hiroyuki Kakui
Authorship：Principal investigator
-
Analysis for the pollen number controlling pathway in wheat
Grant number：JP22K19172 2022.07 - 2025.03
Japan Society for the Promotion of Science KAKENHI
Hiroyuki Kakui, Shuhei Nasuda
Authorship：Principal investigator
-
Analysis for the pollen number controlling pathway in wheat
Grant number：22K19172 2022.06 - 2025.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
角井 宏行
Grant amount：\6240000 （ Direct expense: \4800000 、 Indirect expense：\1440000 ）
第二年度であるR5年度は、NBRPコムギ・京都大学育種学研究室が育成したNAM集団1060系統およびその親の24系統の葯長・花粉数・花粉サイズを計測した。計測方法として、第一にコムギの穂から開葯直前の葯を採取し実体顕微鏡で写真撮影を行い、画像解析によって葯長を計算した。続いて、採取した葯をtween-20を含む液体中で切断し花粉を液体中に放出させた。この花粉液をカラムによって洗浄したのち、セルカウンターで花粉数および花粉サイズを計測した。この計測は京都大学および共同研究先であるチューリヒ大学でも行なった。花粉数を比較したところ、興味深いことに花粉数は在来種と比べて近代栽培種で有意に少ないことがわかり、栽培化を通じで花粉数が減少したことが考えられた。花粉数が減少した原因として、栽培化による自殖傾向の増加により花粉数が減少したということや、近代種では半矮性形質の導入により植物体全体のサイズの減少が花粉数の減少を引き起こしたということが考えられた。NAM集団のmultiparental QTL解析により花粉数および葯長から有意なピークが得られた。花粉数から得られたピークのひとつは葯長のピークと同領域であることがわかり、さらにその座には半矮性遺伝子であるRht(Reduced height)遺伝子が含まれることがわかった。これは半矮性遺伝子の導入が葯長・花粉数減少に関与するという説を支持するものである。一方で葯長でのみ検出されたピークが複数存在することがわかり、葯長と花粉数の制御が同一の経路で行われている可能性があることが示唆された。
-
Analyses of reproduction traits in wild wheat Aegilops tauschii
Grant number：JP22H02307 2022.04 - 2027.03
Japan Society for the Promotion of Science KAKENHI
Hiroyuki Kakui, Yoshihiro Matsuoka, Moeko Okada
Authorship：Principal investigator
-
Analyses of reproduction traits in wild wheat Aegilops tauschii.
Grant number：22H02307 2022.04 - 2027.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
角井 宏行, 松岡 由浩, 岡田 萌子
Grant amount：\17550000 （ Direct expense: \13500000 、 Indirect expense：\4050000 ）
-
Analyses of reproduction traits in wild wheat Aegilops tauschii.
Grant number：23K23573 2022.04 - 2027.03
Japan Society for the Promotion of Science Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
角井 宏行, 岡田 萌子, 松岡 由浩
Grant amount：\17550000 （ Direct expense: \13500000 、 Indirect expense：\4050000 ）
植物の栽培化やその自殖化に伴って生じる自殖シンドロームによって花粉数は減少すると考えられており、実際にいくつかの植物種で花粉数や葯長の減少が観察されている。これらの花粉数を制御する遺伝子について現時点で明らかになっているものはごくわずかである。世界三大穀物であるコムギで花粉数を制御する遺伝子を明らかにすることは収量の向上や安定化が期待でき、農業上においても重要である。本研究では栽培種よりも多様な形質特性をもち、四倍体コムギ（パスタコムギ）や六倍体コムギ（パンコムギ）といった栽培コムギと比較してシンプルなゲノム構造をもつ二倍体の野生種タルホコムギを用いて解析を行い、花粉数や葯長、花粉サイズを制御する遺伝子の同定を試みる。第二年度であるR5年度は、タルホコムギのコアコレクションの約200系統についてR4年度で計測した葯長・花粉数・花粉サイズについて形質の解析およびゲノムワイド関連解析（GWAS）を行なった。その結果、花粉数は1小花あたり数百粒から7000粒と系統間で大きな多様性があることがわかり、野生種の多様性の高さを裏付けるような結果が得られた。GWASの結果、有意なピークが得られた一方で、近傍の複数のマーカーが有意に高いスコアを持つような明らかに有望と思われるような領域は得られなかった。この結果に対しては、系統数をさらに増やすことや採取地が多様な系統を用いることでGWASの精度が向上すると考えられた。
-
Platform for Advanced Genome Science
2020.04
Advanced Genomics Center Platform for Advanced Genome Science
Hiroyuki Kakui
Authorship：Principal investigator
-
Analysis for the pollen number controlling pathway and application for the crops
Grant number：19K05976 2019.04 - 2022.03
Japan Society for the Promotion of Science KAKENHI C
Hiroyuki Kakui
Authorship：Principal investigator
Grant amount：\4420000 （ Direct expense: \3400000 、 Indirect expense：\1020000 ）
In this study, we developed high-throughput pollen counting method. We found RDP1 as pollen number controlling gene by using GWAS and genome-editing. Transcriptome analysis revealed DEGs in RDP1 mutant. We developed PRIMA, which is enable to distinguish 1-bp difference by PCR and electrophoresis. Furthermore, we identified the causal gene of MS4 in Japanese cedar.
-
Elucidation of the molecular mechanism for evolution and adaptation in self-incompatibility
2013.04 - 2015.03
Japan Society for the Promotion of Science Research Fellow of the Japan Society for the Promotion of Science (for Abroad)
Hiroyuki Kakui
Authorship：Principal investigator Grant type：Competitive
-
Research Fellow of the Japan Society for the Promotion of Science (for Post-doc)
Grant number：10J05057 2010 - 2012
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(PD) 特別研究員奨励費
角井 宏行
Grant amount：\2800000 （ Direct expense: \2800000 ）
ペチュニアの花粉管を観察する上での最大の障害は花粉管が伸長するめしべの組織が非常に厚く、自家蛍光が強いため観察が非常に困難であることである。花粉管は培地中でもある程度伸長するため、透明な培地の中での観察も有効であると考えられたが、培地には厚さがあるため花粉管が上下に伸長してしまい顕微鏡で観察する際に焦点がずれてしまうという問題があった。そこで東山ERATOナノ工学グループとの話し合いを行ったところ、マイクロチップを用いることでこの培地の厚さの問題を解決できると考えられた。マイクロチップは透明なシリコン樹脂(PDMS)を型に流し込むことで作製することができる。型は縦、横、高さをマイクロメートル単位で精密に設計できるため、高さを花粉管1本が通れる高さに設計することで花粉管の焦点を合わせたまま観察できるようになった。実際に花粉管がこのマイクロチップ内の通路を通過するかどうかを通路内にペチュニア用の培地で満たした状態で観察したところ、通路内を花粉管が伸長する様子が観察された。
本研究の目的はS-RNase型の自家不和合性を制御する花粉側の因子であるSLFとめしべ側因子であるS-RNaseの局在を明らかにすることである。SLFとTagRFPが融合したペチュニア形質転換体に続いて本年度ではS-RNaseとGFPが融合した形質転換体を得た。これらの形質転換体のコンストラクトが正常に機能すれば同じタイプの花粉を拒絶するはずであり、自己のタイプを解毒できるSLFをもつ花粉を受粉すると花粉が伸長するはずである。まず自己のタイプの花粉を人工授粉した。その結果、果実部分が肥大せずに枯れることが確認された。これは受精が失敗した時に特有の形態である。今後例数を増やしこの現象が本当に起きているかを確認する。 -
Research Fellow of the Japan Society for the Promotion of Science (for Ph.D student.)
Grant number：08J06206 2008 - 2009
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費(DC2) 特別研究員奨励費
角井 宏行
Grant amount：\1200000 （ Direct expense: \1200000 ）
<BACクローンを用いたSFBBの単離>
以前の報告では花粉S遺伝子の候補は1ハプロタイプあたりリンゴで2クローン、ナシからは3クローン得られているが、実際には更に多数のSFBB様配列があることがわかってきた。そこでリンゴ'Florina'のBACライブラリーよりSFBB遺伝子をプローブに用いスクリーニングを行い、SFBBを単離したところ、20のSFBBが単離された。Sハプロタイプの帰属を検定したところS3ハプロタイプに帰属するものが10クローン、S9ハプロタイプに帰属するものが9クローン、Sハプロタイプ特異性がないものが1クローンであった。これらのSFBBがS遺伝子座と連鎖しているかどうかをS3-RNaseおよびS9-RNaseを用いて後代検定したところ、239系統の後代で全てのSFBBが完全に連鎖していることが明らかになった。さらにこれらの遺伝子の発現を解析したところ、すべてのSFBBが花粉で特異的に発現していることが明らかになった。これらの配列を基に系統樹を作製したところ、これらの配列はハプロタイプごとにクラスターを形成するのではなく、ある配列には異なるハプロタイプの配列が近くに位置するという傾向が明らかになった。もし、SFBBが認識には関係しないのであれば配列はランダムに変異すると考えられるため、このような系統関係は見られないと考えられた。S-RNaseタイプの自家不和合性では通常1ハプロタイプあたりS-RNase遺伝子と花粉S遺伝子が1クローンずつ存在すると考えられており、今回のように多数のSFBB様遺伝子がS遺伝子座に連鎖し、かつ花粉特異的に発現している例は初めてである。今後はこれらのSFBBが実際に自家不和合性に関わっているのかどうかを明らかにする予定である。これらの内容を投稿し、現在審査中である。 -
Achieving zero food risks by improving crop robustness using cyber-physical systems
Grant number：JPJ009237
The Moonshot Program for agriculture, forestry and fisheries
Authorship：Coinvestigator(s)
Other research activities
-
License agreement for PRIMA (SHIMADZU corporation, University of Zurich, Yokohama City University)
2022.04
Social Activities
-
保谷中学校 職場体験 自生植物の花と花粉のSEM観察
Role(s)：Lecturer, Demonstrator
2023.10.27
-
相模原中等教育学校高校生のオンラインインタビュー(日経STOCKリーグ関連)
Role(s)：Commentator
2023.9.26
-
都立日比谷高校生の研究室訪問による研究紹介
Role(s)：Informant
2023.8.3
-
Guided tour of the Molecular Biology Laboratory and explanation of ongoing research at Kentaro Shimizu Group for Art students in the framework of the SNF Agora project Creative Camps together with the Plant Science Center
Role(s)：Lecturer, Demonstrator
SNF Agora project Creative Camps together with the Plant Science Center 2018.9
-
Guided tour of the Molecular Biology Laboratory and explanation of ongoing research at Kentaro Shimizu Group (30h) for Kantonsschule Wattwil together with the Life Science Learning Center UZH
Role(s)：Lecturer, Demonstrator
Life Science Learning Center UZH 2018.6
Media Coverage
-
牧野富太郎博士が命名した植物を使って ダーウィンの研究した自家受精進化の謎を解明 〜新たな植物種の交配など栽培植物の育種の応用へ〜 Internet
東京大学大学院農学生命科学研究科・農学部 2023.11.29
-
横浜市大など、自家受精する植物が持つ遺伝子の変異を実験的に修復して自家受精を防ぐ祖先植物のメカニズムを回復することに成功 Internet
日本経済新聞 2023.11
-
スギを無花粉にするたった1ヶ所の変異を特定！ Internet
2023.8
-
Creating pollen-free trees to combat hay fever Internet
Phys.org 2023.8
-
無花粉スギの原因遺伝子を新たに特定 ー花粉症対策を加速ー Internet
東京大学 大学院農学生命科学研究科 プレスリリース 2023.8
-
Identification of the causal mutation of pollen-free Japanese cedar Newspaper, magazine
The Yomiuri Shimbun 2022.4.24
-
Identification of causal gene of pollen-free Japanese cedar Promotional material
Press-release at 141st Japanese Society of Breeding 2022.4.7
-
Identification of male-sterility gene in Japanese cedar. Internet
Asahi Shimbun Apital 2022.4.5
-
Identification of male-sterility gene in Japanese cedar Newspaper, magazine
The Asahi Simbun 2022.3.23
-
DNAの1塩基の違いをハイスループットに判別できる新技術「PRIMA」を開発 −ゲノム編集個体を迅速・簡便・安価に選抜− Promotional material
横浜市立大学 2021.10.25
-
Identification of pollen number controlling gene Newspaper, magazine
Nikkei Business daily 2020.7.16
-
Identification of pollen number controlling gene Internet
Niigata Business News 2020.7
-
花粉数を減少させる遺伝子を発見〜進化理論の実証から育種技術へ〜 Internet
Yokohama City University 2020.6.9
-
Forscher identifizieren Gen zur Steuerung der Pollenzahl Newspaper, magazine
Neue Zürcher Zeitung 2020.6.9
-
Gen ontdekt dat pollenproductie van plant reguleert TV or radio program
BNR Nieuwsradio 2020.6
Academic Activities
-
日本育種学会145回講演会 運営委員
Role(s)：Planning, management, etc.
2024.3.16 - 2024.3.17
-
Role(s)：Planning, management, etc., Panel moderator, session chair, etc.
角井宏行 岡田萌子 佐久間俊 南川舞 2023.9.16
-
UJA2022
Role(s)：Panel moderator, session chair, etc.
United Japanese researchers Around the world 2022.11.30
-
Symposium organizer in 79th The Botanical Society Japan
Role(s)：Planning, management, etc.
Hiroyuki Kakui, Daisuke Maruyama 2015.9