2025/12/20 更新

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タニグチ ヨウスケ
谷口 陽祐
Taniguchi Yosuke
所属
医歯薬学域 教授
職名
教授
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学位

  • 博士(薬学) ( 九州大学 )

研究キーワード

  • triplex

  • WNA

  • nucleoside analogue

  • antigene

  • Triplex

研究分野

  • ライフサイエンス / 薬系化学、創薬科学

 

論文

  • Synthesis of a Pseudocytidine Nucleoside to Form a Stable and Selective Base Pair with Iso-guanosine in RNA. 査読 国際誌

    Ryo Miyahara, Yosuke Taniguchi

    Organic letters   27 ( 35 )   9749 - 9752   2025年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Non-natural base pair formation provides insight into new functions of nucleic acids. Therefore, various artificial base pairs have been developed in both DNA and RNA. In this work, we successfully synthesized pseudocytidine from commercially available pseudouridine to form base pairs with isoguanine, also known as 2-OH-adenine, in RNA. Measurement of the melting temperature with the base pair incorporated at the center of a 13-mer RNA showed the highest value for the ψ-rC and iso-rG (2-OH-rA) base pair. This base pair formation exhibited a high melting temperature regardless of whether it was incorporated into the pyrimidine or purine strand, indicating that it can form a stable and selective duplex RNA.

    DOI: 10.1021/acs.orglett.5c03060

    PubMed

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  • Recent Progress of Triplex DNA Formation and Its Applications. 査読 国際誌

    Lei Wang, Dongliang Ji, Xiao Liu, Wenzhuo Lei, Yosuke Taniguchi, Yong Ling

    Journal of medicinal chemistry   68 ( 5 )   5055 - 5074   2025年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Recently, much attention has been focused on oligonucleotide drugs that precisely control the gene expression. Among these, triplex-forming oligonucleotides (TFOs) represent common antigene strategies because they bind specifically to the major groove position of genomic DNA to form a triplex DNA structure. Thus far, this promising triplex formation technique represents a successful strategy with strong application prospects for gene manipulation applications (e.g., cancer, Huntington's disease, inflammatory disease, etc.), analytical detection (e.g., nucleic acid, small molecules, etc.), and nanotechnology (e.g., molecular machines, etc.). This review summarizes in detail the full range of potential applications described above, particularly the various chemical modification strategies that have facilitated the stepwise advancement of TFO-based oligonucleotide drugs in recent years to improve the effectiveness, specificity, and applicability of triplex DNA and synergistically promote the effectiveness of triplex DNA.

    DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c02518

    PubMed

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  • Synthesis of Oligodeoxynucleotide Containing Pseudo-Deoxycytidine and Its Triphosphate Derivative. 査読 国際誌

    Ryo Miyahara, Yosuke Taniguchi

    Current protocols   5 ( 3 )   e70101   2025年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    This article describes a detailed synthetic protocol for the preparation of oligodeoxynucleotide (ODN) containing pseudo-deoxycytidine (ψdC) and its triphosphate derivative (ψdCTP). These molecules were synthesized as novel compounds that recognize iso-2'-deoxyguanosine (iso-dG) in DNA. Iso-dG is one of the tautomers of 2-hydroxy-2'-deoxyadenosine (2-OH-dA), which is known as an oxidatively damaged nucleobase, and its selective recognition in DNA is expected to play a very important role in the diagnosis and pathogenesis of diseases. The hydroxyl groups of the known glycal compound were protected with silyl groups, and then coupled with 5-iodouracil under Mizorogi-Heck reaction conditions, yielding ψdU after desilylation and diastereoselective reduction. The endocyclic amino group of ψdU was protected by the benzyl group. Subsequently, the carbonyl group at the 6-position of the nucleobase was activated and converted to an amino group through treatment with aqueous ammonia. The benzyl group was removed, and the exocyclic amino group was protected with a benzoyl group. On one hand, the silyl groups at the 3' and 5' positions were deprotected, converted into a phosphoramidite unit, and incorporated into an ODN. On the other hand, the hydroxyl group at the 5' position was selectively deprotected and then directly converted into the triphosphate using Van Boom's reagent under acidic conditions. © 2025 The Author(s). Current Protocols published by Wiley Periodicals LLC. Basic Protocol 1: Synthesis of ODNs having ψdC and ψdCTP Basic Protocol 2: Melting temperature of duplex formation between ODNs containing ψdC unit and 2-OH-dA Basic Protocol 3: A single nucleotide primer extension reaction of ψdCTP for a template strand containing 2-OH-dA.

    DOI: 10.1002/cpz1.70101

    PubMed

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  • Sequence-Selective 2'-O-Acetyl Modification of RNA Mediated by Duplex Formation with a Reactive Oligonucleotide Probe Incorporating 4-Thio-dT. 査読

    Hirotaka Murase, Mio Eto, Jeongsu Lee, Yosuke Taniguchi, Shuhei Imoto, Shigeki Sasaki

    Chemical & pharmaceutical bulletin   73 ( 12 )   1122 - 1125   2025年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We designed and synthesized an oligonucleotide acetylating reagent (Ac-probe) that selectively acetylates the 2'-OH groups of RNA upon forming a duplex with the target RNA. The Ac-probe can be readily prepared via a post-synthetic modification method using an oligodeoxynucleotide probe containing 4-thio-dT. During the acetylation reaction, 4-thio-dT is regenerated as the reaction proceeds. Notably, an efficient modification was observed when the complementary base of RNA to 4-thio-dT was cytosine or uracil, indicating the selectivity for the pyrimidine base.

    DOI: 10.1248/cpb.c25-00525

    PubMed

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  • New Nucleoside Derivatives for Hybridization-Assisted Catalysis of Site-Selective Acetylation of 2'-OH of RNA. 査読

    Hayate Takasaki, Kentaro Kitazaki, Yurie Hadano, Hirotaka Murase, Jeongsu Lee, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Chemical & pharmaceutical bulletin   73 ( 5 )   457 - 466   2025年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    New nucleoside derivatives containing the imidazole (Imd), pyridine or pyrimidine catalytic group were designed for site-specific acetylation of 2'-OH of the RNA ribose moiety. When the RNA substrate was acetylated in the presence of acetic anhydride under alkaline conditions, Probe (Imd) containing the imidazole catalytic group acetylated with a high selectivity to the 2'-OH of the uridine opposite the catalytic nucleotide. Probe (Py-4N) containing the pyridine group showed a higher catalytic activity under neutral conditions with a high selectivity for the 2'-OH group of the 5' side of the uridine opposite the catalytic nucleotide in about 80% modification yield within 10 min. This study has shown that the oligodeoxynucleotide incorporating the new nucleotide derivative with the catalytic group can be a useful tool for site-selective acetylation of RNA 2'-OH.

    DOI: 10.1248/cpb.c25-00068

    PubMed

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  • Site-specific acetyl modification of 2'-OH of RNA by an oligonucleotide acetylating reagent. 査読 国際誌

    Hirotaka Murase, Mio Eto, Jeongsu Lee, Yosuke Taniguchi, Shuhei Imoto, Shigeki Sasaki

    Chemical communications (Cambridge, England)   60 ( 91 )   13440 - 13442   2024年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The method for a site-specific RNA acetylation using a novel oligonucleotide acetylating probe (Ac-probe) has been developed. It was confirmed that the acetyl group was site-specifically introduced to a 2'-OH of the sugar part of the target RNA via the formation of the RNA-probe duplex.

    DOI: 10.1039/d4cc04672b

    PubMed

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  • Design and synthesis of an environment-sensitive 3-methyleneisoindolin-1-one fluorophore for labeling DNA-interacting proteins. 査読 国際誌

    Mariko Aso, Chiyoe Ohta, Yixuan Liu, Kaori Sasaki-Tabata, Yukiko Abe-Sadamatsu, Chiemi Gatanaga, Yichun Wang, Yang Pei, Guosheng Gao, Tsutomu Katayama, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Organic & biomolecular chemistry   22 ( 35 )   7231 - 7239   2024年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We designed 6-dimethylamino 3-methyleneisoindolin-1-one as an environment-sensitive fluorophore, examining its applications for protein labeling. Synthesized 3-methyleneisoindolin-1-one exhibits solvatochromic fluorescence (λemmax; 472 nm in 2-PrOH, 512 nm in H2O). A positive linear dependence between λemmax and solvent dielectric constant (DC), as well as between Stokes shift and DC, and a negative correlation between fluorescence quantum yield and DC are observed in protic solvents. These properties are similar to those of the oxygen isosteric fluorophore, 4-dimethylaminophthalimide, a slovatochromic fluorophore utilized for labeling oligodeoxynucleotides (ODNs) and peptides. Notably, fluorescence intensity of 3-methyleneisoindolin-1-one is higher than the phthalimide in protic solvents used in this study. The 3-methyleneisoindolin-1-one demonstrated the higher stability in pH 8 solution than in pH 6 solution in contrast to the stability profile of the phthalimide, which was stable at pH 6 but was hydrolyzed at pH 8. We also synthesized an o-keto benzaldehyde derivative that converts a primary amine to 6-dimethylamino 3-methyleneisoindolin-1-one under biocompatible conditions and introduced it into ODNs for turn-on fluorescent protein labeling. The synthesized ODN with a protein-binding sequence of Escherichia coli DnaA was employed to modify the DNA-binding domain of DnaA, and the fluorescent properties of the modified protein were investigated.

    DOI: 10.1039/d4ob01036a

    PubMed

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  • The selective chemical modification of the 6-amino group of adenosine of the premature termination codon induces readthrough to produce full-length peptide in the reconstituted E. Coli translation system 査読

    Hirotaka Murase, Jeongsu Lee, Norihiro Togo, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Bioorganic & Medicinal Chemistry   111   117868 - 117868   2024年9月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2024.117868

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  • Novel strategy for activating gene expression through triplex DNA formation targeting epigenetically suppressed genes. 査読 国際誌

    Ryotaro Notomi, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    RSC chemical biology   5 ( 9 )   884 - 890   2024年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Triplex DNA formation is a useful genomic targeting tool that is expected to have a wide range of applications, including the antigene method; however, there are fundamental limitations in its forming sequence. We recently extended the triplex DNA-forming sequence to methylated DNA sequences containing 5mCG base pairs by developing guanidino-dN, which is capable of recognizing a 5mCG base pair with high affinity. We herein investigated the effect of triplex DNA formation using TFOs with guanidino-dN on methylated DNA sequences at the promoter of the RASSF1A gene, whose expression is epigenetically suppressed by DNA methylation in MCF-7 cells, on gene expression. Interestingly, triplex DNA formation increased the expression of the RASSF1A gene at the transcript and protein levels. Furthermore, RASSF1A-activated MCF-7 cells exhibited cell growth suppressing activity. Changes in the expression of various genes associated with the promotion of apoptosis and breast cancer survival accompanied the activation of RASSF1A in cells exhibited antiproliferative activity. These results suggest the potential of increases in gene expression through triplex DNA formation as a new genomic targeting tool.

    DOI: 10.1039/d4cb00134f

    PubMed

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  • Trigonometric Bundling Disulfide Unit Starship Synergizes More Effectively to Promote Cellular Uptake 査読

    Lei Wang, Dezhi Wang, Wenzhuo Lei, Tiantian Sun, Bei Gu, Han Dong, Yosuke Taniguchi, Yichang Liu, Yong Ling

    INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES   25 ( 14 )   2024年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/ijms25147518

    Web of Science

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  • Precise immunofluorescence canceling for highly multiplexed imaging to capture specific cell states 査読

    Kosuke Tomimatsu, Takeru Fujii, Ryoma Bise, Kazufumi Hosoda, Yosuke Taniguchi, Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Kanta Ando, Ryoma Minami, Kaori Tanaka, Taro Tachibana, Seiichi Mori, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Masao Nagasaki, Seiichi Uchida, Hiroshi Kimura, Masashi Narita, Yasuyuki Ohkawa

    Nature Communications   15 ( 1 )   2024年5月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Cell states are regulated by the response of signaling pathways to receptor ligand-binding and intercellular interactions. High-resolution imaging has been attempted to explore the dynamics of these processes and, recently, multiplexed imaging has profiled cell states by achieving a comprehensive acquisition of spatial protein information from cells. However, the specificity of antibodies is still compromised when visualizing activated signals. Here, we develop Precise Emission Canceling Antibodies (PECAbs) that have cleavable fluorescent labeling. PECAbs enable high-specificity sequential imaging using hundreds of antibodies, allowing for reconstruction of the spatiotemporal dynamics of signaling pathways. Additionally, combining this approach with seq-smFISH can effectively classify cells and identify their signal activation states in human tissue. Overall, the PECAb system can serve as a comprehensive platform for analyzing complex cell processes.

    DOI: 10.1038/s41467-024-47989-9

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    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41467-024-47989-9

  • Recognition of 8-Oxo-2′-deoxyguanosine in DNA Using the Triphosphate of 2′-Deoxycytidine Connecting the 1,3-Diazaphenoxazine Unit, dCdapTP 査読 国際誌

    Takato Sakurada, Yuta Chikada, Ryo Miyahara, Yosuke Taniguchi

    MOLECULES   29 ( 10 )   2024年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/molecules29102270

    Web of Science

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  • Development of an Artificial Nucleic Acid Skeleton Allowing for Unnatural-Type Triplex DNA Formation with Duplex DNA Having a TA Inversion Site 査読

    Akihiro Ito, Lei Wang, Ryotaro Notomi, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   72 ( 1 )   16 - 20   2024年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

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  • The Development of Non-natural Type Nucleoside to Stabilize Triplex DNA Formation against CG and TA Inversion Site 査読

    Lei Wang, Yong Ling, Yan Tian, Xiao Wang, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY   31 ( 19 )   2663 - 2686   2024年

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  • Post-Synthetic Modification of Triplex-Forming Oligonucleotides Containing 2-Aminoethyl-2′-Deoxynebularine Derivatives 査読

    Ryotaro Notomi, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CURRENT PROTOCOLS   3 ( 10 )   2023年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cpz1.893

    Web of Science

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  • Inhibition of transcription and antiproliferative effects in a cancer cell line using antigene oligonucleotides containing artificial nucleoside analogues. 査読 国際誌

    Lei Wang, Ryotaro Notomi, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    RSC medicinal chemistry   14 ( 8 )   1482 - 1491   2023年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Antigene methods are promising novel therapeutic approaches to suppress abnormal gene expression. One of these methods inhibits transcription by forming triplex DNA against duplex DNA. However, by using natural-type triplex-forming oligonucleotides (TFOs), stable triplex formation is limited to homopurine and homopyrimidine strands in targeted duplex DNA. We recently developed artificial nucleoside analogues with the ability to recognize CG and TA inversion sites. We successfully formed stable unnatural-type triplex DNA for duplex DNA containing a CG base pair and extended the target sequence using TFOs containing 2-amino-3-methylpyridinyl pseudo-dC (3MeAP-ΨdC). Therefore, this present study investigated triplex-forming regions and synthesized antigene TFOs containing 3MeAP-ΨdC. Some of the synthesized antigene TFOs reduced transcription products and inhibited cell proliferation in several types of cultured cancer cells. The antigene effects of antigene TFOs containing artificial nucleic acids were markedly stronger than those of natural-type TFOs, and these results clearly demonstrated the usefulness of incorporating artificial nucleic acids within TFOs.

    DOI: 10.1039/d3md00139c

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  • Site-Specific Tritium Labeling at the Predefined Internal Position of the Chemically-Modified RNA 査読

    Hirotaka Murase, Jeongsu Lee, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Chemical and Pharmaceutical Bulletin   71 ( 1 )   64 - 69   2023年1月

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Pharmaceutical Society of Japan  

    DOI: 10.1248/cpb.c22-00738

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  • Recognition of 5-methyl-CG and CG base pairs in duplex DNA with high stability using antiparallel-type triplex-forming oligonucleotides with 2-guanidinoethyl-2'-deoxynebularine. 査読 国際誌

    Ryotaro Notomi, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    Nucleic acids research   2022年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The formation of triplex DNA is a site-specific recognition method that directly targets duplex DNA. However, triplex DNA formation is generally formed for the GC and AT base pairs of duplex DNA, and there are no natural nucleotides that recognize the CG and TA base pairs, or even the 5-methyl-CG (5mCG) base pair. Moreover, duplex DNA, including 5mCG base pairs, epigenetically regulates gene expression in vivo, and thus targeting strategies are of biological importance. Therefore, the development of triplex-forming oligonucleotides (TFOs) with artificial nucleosides that selectively recognize these base pairs with high affinity is needed. We recently reported that 2'-deoxy-2-aminonebularine derivatives exhibited the ability to recognize 5mCG and CG base pairs in triplex formation; however, this ability was dependent on sequences. Therefore, we designed and synthesized new nucleoside derivatives based on the 2'-deoxy-nebularine (dN) skeleton to shorten the linker length connecting to the hydrogen-bonding unit in formation of the antiparallel motif triplex. We successfully demonstrated that TFOs with 2-guanidinoethyl-2'-deoxynebularine (guanidino-dN) recognized 5mCG and CG base pairs with very high affinity in all four DNA sequences with different adjacent nucleobases of guanidino-dN as well as in the promoter sequences of human genes containing 5mCG base pairs with a high DNA methylation frequency.

    DOI: 10.1093/nar/gkac1110

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  • Implications of N7-hydrogen and C8-keto on the base pairing, mutagenic potential and repair of 8-oxo-2'-deoxy-adenosine: Investigation by nucleotide analogues 査読

    Junjie Wu, Mengmeng Zhang, Lulu Song, Yahong Tan, Yosuke Taniguchi, Christopher John Hipolito, Youming Zhang, Yizhen Yin

    BIOORGANIC CHEMISTRY   127   2022年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bioorg.2022.106029

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  • Selective Unnatural Base Pairing and Recognition of 2-Hydroxy-2'-deoxyadenosine in DNA Using Pseudo-dC Derivatives. 査読 国際誌

    Ryo Miyahara, Yosuke Taniguchi

    Journal of the American Chemical Society   144 ( 35 )   16150 - 16156   2022年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/jacs.2c07000

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  • Application of the Functionality Transfer Oligodeoxynucleotide for the Site-Selective Modification of RNA with a Divers Molecule 査読

    Norihiro Togo, Hirotaka Murase, Jeongsu Lee, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   70 ( 7 )   498 - 504   2022年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Multiple-turnover single nucleotide primer extension reactions to detect 8-oxo-2'-deoxyguanosine in DNA. 査読 国際誌

    Yoshiya Kikukawa, Ryoji Kawazoe, Ryo Miyahara, Takato Sakurada, Yusuke Nagata, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    Chemical communications (Cambridge, England)   58 ( 35 )   5399 - 5402   2022年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d2cc01372j

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  • Development of Artificial Nucleoside Analogues for the Recognition and Detection of Damaged Nucleoside in DNA 査読

    Yosuke Taniguchi

    JOURNAL OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY JAPAN   80 ( 1 )   46 - 54   2022年1月

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    記述言語:日本語  

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  • Detection and structural analysis of pyrimidine-derived radicals generated on DNA using a profluorescent nitroxide probe

    Kosho Yamauchi, Yuta Matsuoka, Masatomo Takahashi, Yoshihiro Izumi, Hideto Naka, Yosuke Taniguchi, Kazuaki Kawai, Takeshi Bamba, Ken-ichi Yamada

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   58 ( 1 )   56 - 59   2021年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d1cc04998d

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  • Development of MTH1-Binding Nucleotide Analogs Based on 7,8-Dihalogenated 7-Deaza-dG Derivatives. 国際誌

    Hui Shi, Ren Ishikawa, Choon Han Heh, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    International journal of molecular sciences   22 ( 3 )   2021年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.3390/ijms22031274

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  • Simple and Easy Synthesis of γ-Amido-dNTPs in Water and Their Polymerase Reaction Properties.

    Takato Sakurada, Ryo Miyahara, Ryoji Kawazoe, Yusuke Nagata, Yoshiya Kikukawa, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    Chemical & pharmaceutical bulletin   69 ( 11 )   1061 - 1066   2021年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    γ-Amido-modified 2'-deoxynucleoside triphosphates (dNTPs) and nucleoside triphosphates (NTPs) are becoming increasingly important as biological tools. We herein describe the simple and easy synthesis of γ-amido-dNTPs and -NTPs from commercially available corresponding dNTPs and NTPs in a one-pot reaction using water-soluble carbodiimide and ammonia solution. We examined the effects of synthesized γ-amido-dNTPs on the DNA polymerase reaction. The results obtained showed the incorporation of these derivatives into the DNA primer while maintaining nucleobase selectivity; however, their incorporation efficiency by DNA polymerase was lower than that of dNTP. This is the first study to demonstrate the successful synthesis of four sets of γ-amido-dNTPs and clarify their properties.

    DOI: 10.1248/cpb.c21-00497

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  • Design and synthesis of purine nucleoside analogues for the formation of stable anti-parallel-type triplex DNA with duplex DNA bearing the 5mCG base pair

    Ryotaro Notomi, Lei Wang, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    RSC Advances   11 ( 35 )   21390 - 21396   2021年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d1ra02831f

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  • Synthesis of C-nucleoside analogues based on the pyrimidine skeleton for the formation of anti-parallel-type triplex DNA with a CG mismatch site. 国際誌

    Ryotaro Notomi, Lei Wang, Takayuki Osuki, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    Bioorganic & medicinal chemistry   28 ( 23 )   115782 - 115782   2020年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2020.115782

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  • Enhancements in the utilization of antigene oligonucleotides in the nucleus by booster oligonucleotides

    Lei Wang, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   56 ( 67 )   9731 - 9734   2020年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d0cc04240d

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  • Effect of Transcatheter Aortic Valve Implantation on the Immune Response Associated With Surgical Aortic Valve Replacement

    Naoyuki Kimura, Yohei Nomura, Akinori Aomatsu, Akio Matsuda, Yusuke Imamura, Yosuke Taniguchi, Daijiro Hori, Yoshiyuki Morishita, Hideo Fujita, Koichi Yuri, Kenji Matsumoto, Atsushi Yamaguchi

    AMERICAN JOURNAL OF CARDIOLOGY   128   35 - 44   2020年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.amjcard.2020.04.037

    Web of Science

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  • Development of novel C-nucleoside analogues for the formation of antiparallel-type triplex DNA with duplex DNA that includes TA and dUA base pairs

    Yosuke Taniguchi, Yuya Magata, Takayuki Osuki, Ryotaro Notomi, Lei Wang, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY   18 ( 15 )   2845 - 2851   2020年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/d0ob00420k

    Web of Science

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  • Oxidative-stress-driven mutagenesis in the small intestine of the gpt delta mouse induced by oral administration of potassium bromate. 国際誌

    Yasunobu Aoki, Yosuke Taniguchi, Michiyo Matsumoto, Michi Matsumoto, Mizuki Ohno, Kenichi Masumura, Shigeki Sasaki, Teruhisa Tsuzuki, Masayuki Yamamoto, Takehiko Nohmi

    Mutation research. Genetic toxicology and environmental mutagenesis   850-851   503136 - 503136   2020年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.mrgentox.2020.503136

    Web of Science

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  • Synthesis of Nucleoside Derivatives of N-Acetyl-7-nitroindoline, Their Incorporation into the DNA Oligomer, and Evaluation of Their Photoreactivity in the DNA/RNA Duplex.

    Kenji Kikuta, Jan Barta, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Chemical & pharmaceutical bulletin   68 ( 12 )   1210 - 1219   2020年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c20-00594

    Web of Science

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  • Synthesis of the deuterated thymidine-d(9) and deuterated oligonucleotides

    Yosuke Taniguchi, Xiuming Cao, Shigeki Sasaki

    TETRAHEDRON LETTERS   60 ( 38 )   2019年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tetlet.2019.151037

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  • Synthesis of gamma-N-modified 8-oxo-2'-deoxyguanosine triphosphate and its characterization

    Ninticha Thavoncharoensub, Kento Maruyama, Choon Han Heh, Kok Hoong Leong, Hui Shi, Yoshiharu Shigematsu, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   38 ( 8 )   578 - 589   2019年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/15257770.2019.1586919

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  • Synthesis of 2′-deoxy-4-aminopyridinylpseudocytidine Derivatives for Incorporation Into Triplex Forming Oligonucleotides

    Yosuke Taniguchi, Lei Wang, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry   77 ( 1 )   2019年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Blackwell Publishing Inc.  

    DOI: 10.1002/cpnc.80

    Scopus

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  • Effects of the 2-Substituted Adenosine-1,3-diazaphenoxazine 5'-Triphosphate Derivatives on the Single Nucleotide Primer Extension Reaction by DNA Polymerase.

    Yosuke Taniguchi, Ikuko Sagara, Yusuke Nagata, Yoshiya Kikukawa, Shigeki Sasaki

    Chemical & pharmaceutical bulletin   67 ( 10 )   1123 - 1130   2019年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c19-00453

    Web of Science

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  • Study of the Inducible Cross-Linking Reaction to mRNA and the Effect on the Translation.

    Kenji Kikuta, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Chemical & pharmaceutical bulletin   67 ( 8 )   877 - 883   2019年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c19-00337

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  • Development of triplex forming oligonucleotide including artificial nucleoside analogues for the antigene strategy

    Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Synthesis of Therapeutic Oligonucleotides   253 - 269   2018年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer Singapore  

    DOI: 10.1007/978-981-13-1912-9_15

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  • Modification of the aminopyridine unit of 2 '-deoxyaminopyridinyl-pseudocytidine allowing triplex formation at CG interruptions in homopurine sequences

    Lei Wang, Yosuke Taniguchi, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   46 ( 17 )   8679 - 8688   2018年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gky704

    Web of Science

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  • Stable and Selective Antiparallel Type Triplex DNA Formation by Targeting a GC Base Pair with the TFO Containing One N-2-Phenyl-2 '-deoxyguanosine

    Yosuke Taniguchi, Mei Miyazaki, Nozomu Matsueda, Lei Wang, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   66 ( 6 )   624 - 631   2018年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c18-00043

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  • Chemistry of Artificial Nucleic Acid and Oligonucleotide Therapeutics Based on Natural Nucleic Acids

    Yosuke Taniguchi

    JOURNAL OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY JAPAN   76 ( 5 )   482 - 485   2018年5月

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    記述言語:日本語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.5059/yukigoseikyokaishi.76.482

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  • Effect of the 3-halo substitution of the 2 '-deoxy aminopyridinyl-pseudocytidine derivatives on the selectivity and stability of antiparallel triplex DNA with a CG inversion site

    Lei Wang, Yosuke Taniguchi, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   25 ( 14 )   3853 - 3860   2017年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2017.05.035

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  • Development of Damaged Nucleoside Mimics for Inhibition of Their Repair Enzymes

    Yosuke Taniguchi

    YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN   137 ( 3 )   293 - 300   2017年3月

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  • Synchronized Chiral Induction between [5]Helicene-Spermine Ligand and B-Z DNA Transition

    Kensuke Kawara, Genichiro Tsuji, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL   23 ( 8 )   1763 - 1769   2017年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.201605276

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  • Efficient Thymidine-Selective DNA Interstrand Photo-activated Crosslinking by the 6-Thioguanine Connected via an Ethylene-Linker to the 2 '-Deoxyribose Unit 査読

    Nishioka Takamasa, Oshiro Ikuya, Onizuka Kazumitsu, Taniguchi Yosuke, Sasaki Shigeki

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   64 ( 9 )   1315 - 1320   2016年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c16-00310

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  • Aminopyridinyl-Pseudodeoxycytidine Derivatives Selectively Stabilize Antiparallel Triplex DNA with Multiple CG Inversion Sites

    Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   55 ( 40 )   12445 - 12449   2016年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.201606136

    Web of Science

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  • Effects of 8-halo-7-deaza-2 '-deoxyguanosine triphosphate on DNA synthesis by DNA polymerases and cell proliferation

    Yizhen Yin, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   24 ( 16 )   3856 - 3861   2016年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2016.06.030

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  • Inhibitory Effect of 8-Halogenated 7-Deaza-2-deoxyguanosine Triphosphates on Human 8-Oxo-2-deoxyguanosine Triphosphatase, hMTH1, Activities

    Yizhen Yin, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CHEMBIOCHEM   17 ( 7 )   566 - 569   2016年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201500589

    Web of Science

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  • Recognition and detection of 8-oxo-rG in RNA using the DNA/OMeRNA chimera probes containing fluorescent adenosine-diazaphenoxazine analog

    Yohei Koga, Yosuke Taniguchi, Yoshiya Kikukawa, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   24 ( 6 )   1308 - 1313   2016年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2016.02.001

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  • Enhancement of TFO Triplex Formation by Conjugation with Pyrene via Click Chemistry

    Yosuke Taniguchi, Akira Tomizaki, Nozomu Matsueda, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    CHEMICAL & PHARMACEUTICAL BULLETIN   63 ( 11 )   920 - 926   2015年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1248/cpb.c15-00570

    Web of Science

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  • Stabilization of the i-motif structure by the intra-strand cross-link formation 査読

    Kikuta Kenji, Piao Haishun, Brazier John, Taniguchi Yosuke, Onizuka Kazumitsu, Nagatsugi Fumi, Sasaki Shigeki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   25 ( 16 )   3307 - 3310   2015年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2015.05.064

    Web of Science

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  • Recognition and Excision Properties of 8-Halogenated-7-Deaza-2-Deoxyguanosine as 8-Oxo-2-Deoxyguanosine Analogues and Fpg and hOGG1 Inhibitors

    Yizhen Yin, Shigeki Sasaki, Yosuke Taniguchi

    CHEMBIOCHEM   16 ( 8 )   1190 - 1198   2015年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201402690

    Web of Science

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  • Site-Specific Modification of the 6-Amino Group of Adenosine in RNA by an Interstrand Functionality-Transfer Reaction With an S-Functionalized 4-Thiothymidine

    Ikuya Oshiro, Daichi Jitsuzaki, Kazumitsu Onizuka, Atsushi Nishimoto, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMBIOCHEM   16 ( 8 )   1199 - 1204   2015年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201500084

    Web of Science

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  • Discrimination Between 8-Oxo-2 '-Deoxyguanosine and 2 '-Deoxyguanosine in DNA by the Single Nucleotide Primer Extension Reaction with Adap Triphosphate

    Yosuke Taniguchi, Yoshiya Kikukawa, Shigeki Sasaki

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   54 ( 17 )   5147 - 5151   2015年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.201412086

    Web of Science

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  • An Isocytidine Derivative with a 2-Amino-6-methylpyridine Unit for Selective Recognition of the CG Interrupting Site in an Antiparallel Triplex DNA

    Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMBIOCHEM   15 ( 16 )   2374 - 2378   2014年11月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201402328

    Web of Science

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  • A nanocarrier system for the delivery of nucleic acids targeted to a pancreatic beta cell line

    Yuma Yamada, Mai Tabata, Yukari Yasuzaki, Masatoshi Nomura, Atsushi Shibata, Yuta Ibayashi, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki, Hideyoshi Harashima

    BIOMATERIALS   35 ( 24 )   6430 - 6438   2014年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.biomaterials.2014.04.017

    Web of Science

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  • Activation and Alteration of Base Selectivity by Metal Cations in the Functionality-Transfer Reaction for RNA Modification (vol 21, pg 1508, 2010) 査読

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    BIOCONJUGATE CHEMISTRY   25 ( 5 )   1023 - 1023   2014年5月

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  • 2,6-Diaminopurine nucleoside derivative of 9-ethyloxy-2-oxo-1,3-diazaphenoxazine (2-amino-Adap) for recognition of 8-oxo-dG in DNA

    Yosuke Taniguchi, Keitaro Fukabori, Yoshiya Kikukawa, Yohei Koga, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   22 ( 5 )   1634 - 1641   2014年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2014.01.024

    Web of Science

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  • Synthesis of 8-halogenated-7-deaza-2 '-deoxyguanosine as an 8-oxo-2 '-deoxyguanosine analogue and evaluation of its base pairing properties

    Yizhen Yin, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    TETRAHEDRON   70 ( 11 )   2040 - 2047   2014年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tet.2014.01.047

    Web of Science

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  • Remarkable acceleration of a DNA/RNA inter-strand functionality transfer reaction to modify a cytosine residue: the proximity effect via complexation with a metal cation

    Daichi Jitsuzaki, Kazumitsu Onizuka, Atsushi Nishimoto, Ikuya Oshiro, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   42 ( 13 )   8808 - 8815   2014年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gku538

    Web of Science

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  • 4-vinyl-substituted pyrimidine nucleosides exhibit the efficient and selective formation of interstrand cross-links with RNA and duplex DNA

    Atsushi Nishimoto, Daichi Jitsuzaki, Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   41 ( 13 )   6774 - 6781   2013年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gkt197

    Web of Science

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  • alpha-Lipoic acid protects against arsenic trioxide-induced acute QT prolongation in anesthetized guinea pigs

    Masafumi Kumazaki, Hitoshi Ando, Masafumi Kakei, Kentarou Ushijima, Yosuke Taniguchi, Masashi Yoshida, Shiho Yamato, Satoshi Washino, Taka-aki Koshimizu, Akio Fujimura

    EUROPEAN JOURNAL OF PHARMACOLOGY   705 ( 1-3 )   1 - 10   2013年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ejphar.2013.02.027

    Web of Science

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  • Synthesis of 1 '-phenyl-2 '-OMe ribose analogues connecting the thymine base at the 1 ' position through a flexible linker for the formation of a stable anti-parallel triplex DNA

    Yosuke Taniguchi, Hidenori Okamura, Norihiko Fujino, Shigeki Sasaki

    TETRAHEDRON   69 ( 2 )   600 - 606   2013年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tet.2012.11.016

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  • Synthesis of the Oligoribonucleotides Incorporating 8-Oxo-Guanosine and Evaluation of their Base Pairing Properties

    Yohei Koga, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   32 ( 3 )   124 - 136   2013年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/15257770.2013.767461

    Web of Science

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  • N-(Guanidinoethyl)-2 '-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of a CG interrupting site for the formation of anti-parallel triplexes

    Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY   11 ( 23 )   3918 - 3924   2013年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c3ob40472b

    Web of Science

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  • Properties of Oligonucleotide with Phenyl-Substituted Carbocyclic Nucleoside Analogs for the Formation of Duplex and Triplex DNA

    Tamer Nasr, Yosuke Taniguchi, Tomoko Takaki, Hidenori Okamura, Shigeki Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   31 ( 12 )   841 - 860   2012年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/15257770.2012.737970

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  • Efficient DNA Strand Displacement by a W-Shaped Nucleoside Analogue (WNA-ss T) Containing an ortho-Methyl-Substituted Phenyl Ring

    Eriko Aoki, Yosuke Taniguchi, Yasumasa Wada, Shigeki Sasaki

    CHEMBIOCHEM   13 ( 8 )   1152 - 1160   2012年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/cbic.201200066

    Web of Science

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  • Surprising Repair Activities of Nonpolar Analogs of 8-oxoG Expose Features of Recognition and Catalysis by BaSe Excision Repair Glycosylases

    Paige L. McKibbin, Akio Kobori, Yosuke Taniguchi, Eric T. Kool, Sheila S. David

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   134 ( 3 )   1653 - 1661   2012年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja208510m

    Web of Science

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  • OFF-to-ON type fluorescent probe for the detection of 8-oxo-dG in DNA by the Adap-masked ODN probe

    Yosuke Taniguchi, Yohei Koga, Keitaro Fukabori, Ryota Kawaguchi, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   22 ( 1 )   543 - 546   2012年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2011.10.093

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  • Oligodeoxynucleotide containing s-functionalized 2'-deoxy-6-thioguanosine: Facile tools for base-selective and site-specific internal modification of RNA 査読

    Shigeki Sasaki, Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi

    Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry   1 ( 48 )   4.49.16   2012年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Blackwell Publishing Inc.  

    DOI: 10.1002/0471142700.nc0449s48

    Scopus

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  • An efficient antigene activity and antiproliferative effect by targeting the Bcl-2 or survivin gene with triplex forming oligonucleotides containing a W-shaped nucleoside analogue (WNA-beta T)

    Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY   10 ( 41 )   8336 - 8341   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c2ob26431e

    Web of Science

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  • An efficient and simple method for site-selective modification of O-6-methyl-2 '-deoxyguanosine in DNA 査読

    Kazumitsu Onizuka, Takamasa Nishioka, Zhichun Li, Daichi Jitsuzaki, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   48 ( 33 )   3969 - 3971   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c2cc17621a

    Web of Science

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  • A NEW TOOL FOR SITE-SPECIFIC CHEMICAL MODIFICATION OF RNA

    Shigeki Sasaki, Atsushi Shibata, Natsuki Inaba, Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi

    NUCLEIC ACID THERAPEUTICS   21 ( 5 )   A24 - A25   2011年10月

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    記述言語:英語  

    Web of Science

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  • Adenosine-1,3-diazaphenoxazine Derivative for Selective Base Pair Formation with 8-Oxo-2 '-deoxyguanosine in DNA (vol 133, pg 7272, 2011)

    Yosuke Taniguchi, Ryota Kawaguchi, Shigeki Sasaki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   133 ( 26 )   10322 - 10322   2011年7月

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  • Adenosine-1,3-diazaphenoxazine Derivative for Selective Base Pair Formation with 8-Oxo-2 '-deoxyguanosine in DNA

    Yosuke Taniguchi, Ryota Kawaguchi, Shigeki Sasaki

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   133 ( 19 )   7272 - 7275   2011年5月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja200327u

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  • The oligodeoxynucleotide probes for the site-specific modification of RNA

    Shigeki Sasaki, Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi

    CHEMICAL SOCIETY REVIEWS   40 ( 12 )   5698 - 5706   2011年

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  • Pin-point chemical modification of RNA with diverse molecules through the functionality transfer reaction and the copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition reaction 査読

    Kazumitsu Onizuka, Atsushi Shibata, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   47 ( 17 )   5004 - 5006   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c1cc10582e

    Web of Science

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  • The ODN probes conjugating the Cu(II) complex enhance the luminol chemiluminescence by assembling on the DNA template

    Yosuke Taniguchi, Akiko Nitta, Sun Min Park, Akiko Kohara, Takahiro Uzu, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   18 ( 24 )   8614 - 8617   2010年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2010.10.007

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  • Alteration of cross-linking selectivity with the 2 '-OMe analogue of 2-amino-6-vinylpurine and evaluation of antisense effects

    Shuhei Imoto, Tsuneaki Hori, Shinya Hagihara, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki, Fumi Nagatsugi

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   20 ( 20 )   6121 - 6124   2010年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2010.08.027

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  • Nonpolar isosteres of 8-OxoG expose recognition and catalysis of DNA repair glycosylases

    Paige L. McKibbin, Akio Kobori, Yosuke Taniguchi, Eric T. Kool, Sheila S. David

    ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   240   2010年8月

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    記述言語:英語  

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  • Activation and Alteration of Base Selectivity by Metal Cations in the Functionality-Transfer Reaction for RNA Modification 査読

    Onizuka Kazumitsu, Taniguchi Yosuke, Sasaki Shigeki

    BIOCONJUGATE CHEMISTRY   21 ( 8 )   1508 - 1512   2010年8月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bc100131j

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  • Synthesis of new derivatives of 8-oxoG-Clamp for better understanding the recognition mode and improvement of selective affinity

    Li Zhichun, Nakagawa Osamu, Koga Yohei, Taniguchi Yosuke, Sasaki Shigeki

    Bioorganic and Medicinal Chemistry   18 ( 11 )   3992 - 3998   2010年6月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2010.04.025

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    CiNii Article

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  • The alkyl-connected 2-amino-6-vinylpurine (AVP) crosslinking agent for improved selectivity to the cytosine base in RNA

    Yosuke Taniguchi, Yusuke Kurose, Takamasa Nishioka, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   18 ( 8 )   2894 - 2901   2010年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2010.03.008

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  • A new usage of functionalized oligodeoxynucleotide probe for site-specific modification of a guanine base within RNA

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    NUCLEIC ACIDS RESEARCH   38 ( 5 )   1760 - 1766   2010年3月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nar/gkp930

    Web of Science

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  • The Spermine-Bisaryl Conjugate as a Potent Inducer of B- to Z-DNA Transition

    Issei Doi, Genichiro Tsuji, Kyoko Kawakami, Osamu Nakagawa, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMISTRY-A EUROPEAN JOURNAL   16 ( 39 )   11993 - 11999   2010年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/chem.201000947

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  • Recognition of CG interrupting site by W-shaped nucleoside analogs (WNA) having the pyrazole ring in an anti-parallel triplex DNA

    Yosuke Taniguchi, Yuko Uchida, Tomoko Takaki, Eriko Aoki, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY   17 ( 19 )   6803 - 6810   2009年10月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmc.2009.08.040

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  • Site-Specific Covalent Modification of RNA Guided by Functionality-Transfer Oligodeoxynucleotides

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    BIOCONJUGATE CHEMISTRY   20 ( 4 )   799 - 803   2009年4月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bc900009p

    Web of Science

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  • Selective fluorescence quenching of the 8-oxoG-clamp by 8-oxodeoxyguanosine in ODN

    Tamer Nasr, Zhichun Li, Osamu Nakagawa, Yosuke Taniguchi, Sayaka Ono, Shigeki Sasaki

    BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS   19 ( 3 )   727 - 730   2009年2月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bmcl.2008.12.036

    Web of Science

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  • Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODN probes.

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Takamasa Nishioka, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 53 )   67 - 68   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Evaluation of the antisense effect of PEGylated oligodeoxynucleotides containing intelligent nucleoside analogues.

    Yosuke Taniguchi, Yusuke Kurose, Takamasa Nishioka, Fumi Nagatsugi, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 53 )   167 - 168   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/nrp084

    Scopus

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  • A NEW ODORLESS PROCEDURE FOR THE SYNTHESIS OF 2 '-DEOXY-6-THIOGUANOSINE AND ITS INCORPORATION INTO OLIGODEOXYNUCLEOTIDES

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   28 ( 8 )   752 - 760   2009年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/15257770903155576

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  • Synthesis of p-amino-WNA derivatives to enhance the stability of the anti-parallel triplex

    Yosuke Taniguchi, Mieko Togo, Eriko Aoki, Yuko Uchida, Shigeki Sasaki

    TETRAHEDRON   64 ( 30-31 )   7164 - 7170   2008年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tet.2008.05.096

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  • Design of S-vinylated 6-thioguanosine as a specific modifier of cytidine

    Kazumitsu Onizuka, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    CHEMISTRY OF NUCLEIC ACID COMPONENTS   10   159 - 163   2008年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

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  • Site-specific modification by functionality-transfer oligonucleotide with the photo-inducible reactivity.

    Onizuka, K., Taniguchi, Y., Nishioka, T., Sasaki, S.

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 52 )   2008年

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Synthesis of 1'-phenyl substituted nucleoside analogs

    Tamer Nasr, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    HETEROCYCLES   71 ( 12 )   2659 - 2668   2007年12月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/S0385-5414(07)81201-9

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  • Nonpolar isosteres of damaged DNA bases: Effective mimicry of mutagenic properties of 8-oxopurines

    Yosuke Taniguchi, Eric T. Kool

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   129 ( 28 )   8836 - 8844   2007年7月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja071970q

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  • Effective strand invasion ODN incorporating a new bicyclic nucleoside analogue (WNA).

    Eriko Aoki, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 51 )   255 - 256   2007年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/nrm128

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  • Development of novel thioguanosine analogs with the ability to specifically modify cytidine.

    Onizuka, K., Taniguchi, Y., Sasaki, S.

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 51 )   2007年

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    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Effects of the modified aromatic ring of WNA on stability of triplex DNA.

    Eriko Aoki, Yosuke Taniguchi, Mieko Togo, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 50 )   185 - 186   2006年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/nrl092

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  • Modification of the aromatic ring of the WNA analogues for expansion of the triplex recognition codes.

    Yosuke Taniguchi, Ayako Nakamura, Eriko Aoki, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 49 )   173 - 174   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/49.1.173

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  • Expansion of triplex recognition codes by the use of novel bicyclic nucleoside derivatives (WNA) 査読

    Y Taniguchi, A Nakamura, Y Senko, K Kodama, F Nagatsugi, S Sasaki

    NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES & NUCLEIC ACIDS   24 ( 5-7 )   823 - 827   2005年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1081/NCN-200060309

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  • Selective formation of stable triplexes including a TA or a CG interrupting site with new bicyclic nucleoside analogues (WNA) 査読

    S Sasaki, Y Taniguchi, R Takahashi, Y Senko, K Kodama, F Nagatsugi, M Maeda

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   126 ( 2 )   516 - 528   2004年1月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja037211z

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  • Effects of 5-substituted pyrimidine nucleoside bases of WNA on stability of triplex DNA.

    Yosuke Taniguchi, Ayako Nakamura, Yusuke Senko, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids symposium series (2004)   ( 48 )   69 - 70   2004年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • Selective formation of non-natural type triplexes containing TA interrupting sites with the TFO incorporating W-shape nucleic acid (WNA) analogs.

    Yosuke Taniguchi, Ryo Takahashi, Keiichi Kodama, Yusuke Senko, Minoru Maeda, Shigeki Sasaki

    Nucleic acids research. Supplement (2001)   ( 2 )   35 - 36   2002年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/2.1.35

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  • W-shape nucleic acid (WNA) for selective formation of non-natural anti-parallel triplex including a TA interrupting site 査読

    S Sasaki, H Yamauchi, F Nagatsugi, R Takahashi, Y Taniguchi, M Maeda

    TETRAHEDRON LETTERS   42 ( 39 )   6915 - 6918   2001年9月

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

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  • New base analogs for the formation of non-natural triplexes.

    S. Sasaki, H. Yamauchi, R. Takahasi, Y. Taniguchi, M. Maeda

    Nucleic acids research. Supplement (2001)   ( 1 )   23 - 24   2001年

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    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/nass/1.1.23

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MISC

  • Effects of halogenated WNA derivatives on sequence dependency for expansion of recognition sequences in non-natural-type triplexes

    Y Taniguchi, A Nakamura, Y Senko, F Nagatsugi, S Sasaki

    JOURNAL OF ORGANIC CHEMISTRY   71 ( 5 )   2115 - 2122   2006年3月

  • Development of novel artificial nucleosides for expansion of triplex-recognition codes

    Y Taniguchi, S Sasaki

    JOURNAL OF SYNTHETIC ORGANIC CHEMISTRY JAPAN   62 ( 10 )   1026 - 1037   2004年10月

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    記述言語:日本語   掲載種別:書評論文,書評,文献紹介等  

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共同研究・競争的資金等の研究

  • ウイルス性皮膚疾患に対する短鎖二本鎖RNAを用いた外用核酸医薬の開発

    研究課題/領域番号:25K11605  2025年04月 - 2028年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    梶田 藍, 谷口 陽祐, 森実 真

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    配分額:4680000円 ( 直接経費:3600000円 、 間接経費:1080000円 )

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  • 3本鎖DNA形成を基軸とした人工核酸の開発と遺伝子発現コントロール技術への新展開

    研究課題/領域番号:23K27301  2023年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    谷口 陽祐

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    配分額:18850000円 ( 直接経費:14500000円 、 間接経費:4350000円 )

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  • 非天然核酸による損傷DNAシーケンシング技術の創成

    2021年 - 2027年

    科学技術振興機構  戦略的な研究開発の推進 創発的研究支援事業 

    谷口 陽祐

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    担当区分:研究代表者 

    これまでの技術では成し得ない遺伝子のキズである損傷核酸を含むDNAを直接正確に読み取るため、「損傷核酸を認識可能な人工核酸の創成」と「リン酸修飾体を用いたDNAシーケンシング技術」の開発に挑戦します。具体的には、損傷核酸やDNA合成酵素の性質を軸に化学修飾を施した人工核酸、DNA合成の材料となるトリリン酸体に化学修飾を施した人工核酸の化学合成を行い、ポリメラーゼ伸長反応への効果を詳細に検証します。

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  • 脳疾患部位を標的とする先端的核酸デリバリー技術の確立と脳疾患治療への挑戦

    研究課題/領域番号:20H00658  2020年04月 - 2024年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(A)  基盤研究(A)

    宮田 完二郎, 谷口 陽祐, 藤 加珠子, 林 光太朗

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    配分額:44850000円 ( 直接経費:34500000円 、 間接経費:10350000円 )

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  • 革新的アンチジーン核酸の構築を目指した2本鎖DNAに結合可能な核酸誘導体の創製

    研究課題/領域番号:19H03351  2019年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    谷口 陽祐

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    配分額:17290000円 ( 直接経費:13300000円 、 間接経費:3990000円 )

    本研究ではこれまで申請者が検討を行ってきた内容である、3本鎖DNA形成可能な独自の人工核酸の開発という天然の核酸では相互作用できない2本鎖DNA中のCG塩基対の特異的な認識、さらには培養細胞内の特定の遺伝子の発現抑制法技術をさらに発展させる。そこで、これまでに検討されていない2本鎖DNA領域を標的とした新規遺伝子発現制御法の構築を目指して、人工核酸を核内に送達する技術として機能性補助核酸であるガード核酸の創製を行う。さらに、遺伝子発現のエピジェネティック制御に関与しているCpGアイランドを標的とした新規アンチジーン核酸の構築法の確立へと展開する。
    本年度は化学修飾を施した機能性補助核酸の創製について、オリゴ核酸の効果的な末端化学修飾法の達成に成功した。その機能性補助核酸とアンチジーン核酸の2本鎖DNAを細胞に作用させる事により、そのまま細胞内に入っていく事を明らかにした。2本鎖DNAを用いた細胞内導入可能な性質の付与の報告は始めての例である。以上のように、細胞膜通過能、核膜通過能を有し、効率的にアンチジーン核酸を核内に導入可能な機能性補助核酸開発の予備的な知見が得られた。
    さらにこれまで標的にできなかった2本鎖DNAの配列を、データベースを用いて明らかにし、申請者の人工核酸を用いる事により、天然のアンチジーン核酸よりも安定な3本鎖DNAを形成できる事を明らかにした。数種類明らかにしているが、その一部の標的遺伝子配列において実際に転写阻害活性であるアンチジーン効果を確認しており、新規標的配列の探索に成功した。
    これまでの成果をさらに発展させて、新たに分子設計したプリン骨格を有する人工核酸より、5メチルCG塩基対認識可能な予備的な知見が得られた。さらにPNA骨格を有する人工核酸も効率的にPNAオリゴマーに導入することに成功した。

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  • DNA中の酸化損傷塩基認識可能な人工核酸を基軸とした新規遺伝子検出法の開発

    研究課題/領域番号:17K19494  2017年06月 - 2020年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽)  挑戦的研究(萌芽)

    谷口 陽祐

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    配分額:4550000円 ( 直接経費:3500000円 、 間接経費:1050000円 )

    ストレスや活性酸素種によりDNA中に発生する酸化損傷塩基の量は、様々な疾患の発症との関連性が示唆されている。しかしながら、DNA中の酸化損傷塩基を配列特異的に検出する手法は存在しない。そこで、本研究期間内に独自の人工核酸を設計し化学合成を行い、DNA合成酵素を用いる事で、配列特異的に酸化損傷塩基を認識し増幅反応による検出研究に着手しその技術開発に成功した。さらに、発ガンへの関与が示唆される遺伝子の変異に酸化損傷塩基の存在が関与している可能性を示す研究成果も得られた。

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  • 人工核酸修飾オリゴヌクレオチドによる3本鎖DNA形成を基盤とした核酸医薬への検討

    研究課題/領域番号:16H05100  2016年04月 - 2019年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    谷口 陽祐

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    配分額:18070000円 ( 直接経費:13900000円 、 間接経費:4170000円 )

    本研究課題では、異常遺伝子に直接作用しその発現を特異的に阻害する核酸医薬であるアンチジーン核酸の創製を目的として行った。天然の核酸では結合不可能な遺伝子領域に対して結合可能な人工核酸の化学合成に成功し、安定かつ選択的な3本鎖DNA形成可能であることを明らかにした。さらには、新規核送達技術の開発にも成功し、この人工核酸を組み込んだアンチジーン核酸により効果的な遺伝子発現阻害に成功した。

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  • 化学反応性人工核酸を用いたRNAの特異的化学修飾と人工的編集の研究

    研究課題/領域番号:15H04633  2015年04月 - 2018年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

    佐々木 茂貴, 谷口 陽祐, 渕 靖史

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    配分額:17160000円 ( 直接経費:13200000円 、 間接経費:3960000円 )

    本研究では、RNAとハイブリッド錯体を形成することにより官能基を転移させ、部位特異的および塩基特異的に化学修飾する人工核酸を展開し、RNAレベルで遺伝子制御を行う斬新なバイオツールへの展開を目指した。
    その結果、RNAリボース水酸基の化学修飾法を新たに確立し、光アシル化のためインドリン誘導体を合成した。さらに、これらの人工核酸によるmRNAの部位特異的な化学修飾の翻訳に与える効果を調べるため、短鎖ペプチドをコードするmRNAを用いて非細胞系翻訳システムによるペプチド合成系を確立した。本研究の成果は、さらにRNAを標的とする遺伝子発現制御法開発の基盤となる重要な成果である。

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  • 人工ジヌクレオチドユニットによるCpGアイランド結合分子の創製

    研究課題/領域番号:26670056  2014年04月 - 2017年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

    谷口 陽祐

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    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    本研究では、遺伝子発現のエピジェネティック制御機構に関与するCpGアイランドに対して結合可能な新規人工分子の創製を目的とした。天然型3本鎖DNA形成のG/GC塩基対構造に着目して、グアノシンの2位に芳香環を有する人工核酸を分子設計した。化学合成に成功し、オリゴヌクレオチドに導入後、2本鎖DNAに対する相互作用を調べた結果、芳香環としてベンゼン環を含む人工核酸でGC塩基対を認識できる事を見いだした。天然型のグアノシンと錯体形成定数を比べることにより、安定かつ選択的に認識できる事を明らかにした。しかも、1つであればオリゴヌクレオチドのどの位置に組み込んでも認識能を有する事を見いだす事に成功した。

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  • 3本鎖DNA形成可能な人工核酸を基盤とした遺伝子標的アンチジーン核酸医薬創製研究

    研究課題/領域番号:24689006  2012年04月 - 2016年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(A)  若手研究(A)

    谷口 陽祐

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    配分額:26910000円 ( 直接経費:20700000円 、 間接経費:6210000円 )

    本研究課題では、次世代の医薬品として注目を集めている、核酸医薬の開発を目的として、これまで殆ど研究がなされていない3本鎖DNA形成による遺伝子発現制御法に関する検討を行った。天然の核酸では安定な3本鎖DNAを形成する事ができない領域に対して安定な3本鎖DNAを形成可能な人工核酸を創成し、その3本鎖形成能の評価を行った。本研究課題で開発した人工核酸は安定な3本鎖DNAを形成可能で、なおかつ細胞内の特定の遺伝子発現を効果的に抑えうる事に成功した。本成果は、人工核酸による3本鎖DNA形成を利用した画期的な遺伝子発現制御技術であり、次世代の核酸医薬開発に向けた基盤となる成果である。

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  • RNA中のピンポイント酸化損傷に基づく疾患の新規診断法、治療法の創製研究

    研究課題/領域番号:24659047  2012年04月 - 2014年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究  挑戦的萌芽研究

    谷口 陽祐

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    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    本研究では、ストレスなどによる核酸の損傷に基づく疾患の新規診断法、治療薬の創製に向けて、これまでに未達成な1本鎖RNA中のグアニン(G)の酸化損傷塩基である8-オキソグアニン(8-oxoG)の配列特異的検出法を開発を目的とした。研究期間内に、RNA型8-oxoGの新しい合成法を見いだし、また、人工的に合成した核酸誘導体を用いて、特異的に認識、検出する事に成功した。

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  • 生体内分子機能の融合活用を目指した2本鎖DNA標的人工核酸の開発研究

    研究課題/領域番号:20790013  2008年 - 2009年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(B)  若手研究(B)

    谷口 陽祐

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    配分額:4290000円 ( 直接経費:3300000円 、 間接経費:990000円 )

    本研究では、生命の設計図といわれている遺伝子情報に直接作用する人工核酸の設計と合成を行い、その人工核酸を用いて遺伝子情報伝達を人工的に制御する手法の基盤技術の確立を目指した。天然の核酸では相互作用が不可能な2本鎖DNAに対して、特異的に相互作用が可能な人工核酸の開発に成功した。さらに、遺伝子情報を保有している2本鎖DNAを標的とし、この人工核酸を導入した分子を創製し遺伝子情報の伝達阻害をする事にも成功した。

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  • タンパク質との機能融合を目指したゲノム標的機能性人工核酸の開発

    研究課題/領域番号:19890147  2007年 - 2008年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 若手研究(スタートアップ)  若手研究(スタートアップ)

    谷口 陽祐

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    配分額:3075000円 ( 直接経費:2670000円 、 間接経費:405000円 )

    ヒトゲノムの全遺伝子配列の解読終了が公表され、本格的にポストゲノムシーケンス時代に突入し、ゲノム配列情報を利用した病気の診断や治療など、様々な研究への展開が盛んに行われている。本研究では、機能性人工分子を用いることによって生体内に内在するたんぱく質本来の機能を活性化し、人工分子と生体内分子の機能を融合活用する革新的な遺伝子発現制御法の開発を目指している。その方法の一つとして、3本鎖DNA形成に着目した。3本鎖DNA形成を利用した遺伝子発現阻害、変異や修復などの生体内反応を惹起する3本鎖DNA形成分子の探索を行うために、本研究室で開発した人工核酸(WNA:W-shaped Nucleoside Analogues)を基本骨格にその誘導体の合成・評価を行った。WNAは認識塩基部位であるヘテロ環と安定化部位である芳香環をビシクロ骨格に別々に結合させた人工核酸である。
    これまで合成し評価した種々のWNA誘導体の結果をもとに、新たに設計を行った。その結果、WNAの変換部位の一つであるベンゼン環部分にアミノ基を有する誘導体を含んだ3本鎖形成オリゴヌクレオチドにより、非選択的な3本鎖DNA形成に成功した。さらに結果に基づく誘導体の設計・合成を行っており、認識構造の最適化を行っている。
    さらに、これまでに見いだしていたc-myc遺伝子に対するRaji細胞を用いた細胞増殖阻害研究に加えて、本研究ではbcl-2遺伝子に対する3本鎖形成オリゴヌクレオチドの設計・合成を行った。3本鎖形成能の評価の結果、このオリゴヌクレオチドは3本鎖DNAを形成することが明らかとなった。さらに、肺ガン細胞を用いて細胞増殖阻害能を確認したところ、まだ予備的な結果ではあるが、効果的に細胞増殖阻害活性があることを明らかにした。

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  • 化学反応性ゲノム標的分子の展開とインテリジェント・ナノ医薬としての基礎検討

    研究課題/領域番号:17209001  2005年 - 2008年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(A)  基盤研究(A)

    佐々木 茂貴, 中川 治, 谷口 陽祐, 續 輝久, 永次 史

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    配分額:51220000円 ( 直接経費:39400000円 、 間接経費:11820000円 )

    本研究では、インテリジェント機能性分子をナノ医薬に発展させるための基礎検討行い、(1)ハイブリッド内において、中性条件下ではシトシン特異的でありアルカリ条件下でグアニン特異的な官能基転移反応、(2)新規ヌクレオシドアナログの合成に成功し、非天然型3本鎖DNAの形成、(3)DNA 中の酸化損傷塩基、8-oxodG の検出プローブの開発、(4)クロスリンク反応によるアンチセンス阻害の効率向上、を達成した。

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  • 3本鎖認識コードの拡張を目的とする人工ヌクレオシドの創製

    研究課題/領域番号:05J06059  2005年 - 2006年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業 特別研究員奨励費  特別研究員奨励費

    谷口 陽祐

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    配分額:1800000円 ( 直接経費:1800000円 )

    非天然型3本鎖DNAの形成を目指して、ビシクロ型人工核酸(WNA:W-shaped nucleoside analogues)の芳香環部分を種々に変換した新規WNA誘導体の合成を行った。これまでの結果を踏まえて、芳香環部分の大きさはベンゼン環くらいか、ベンゼン環に置換基を有するぐらいの大きさが適当であることを考慮して、新規WNA誘導体の分子設計を行った。設計した人工核酸を有機合成して、3本鎖形成オリゴヌクレオチドに導入し、3本鎖形成能の評価をゲルシフトアッセイにより評価した。合成した化合物の中で、芳香環部分にピリジン環を有するWNA-βT誘導体が、親和性は弱いものの全ての配列でミスマッチサイトであるTA塩基対を比較的選択的に認識した。このことにより、完全では無いが認識の一般性を有するWNA誘導体を見いだすことに成功した。また、メチル基を有するWNA誘導体を含んだオリゴヌクレオチドが3本鎖DNA形成能と、2本鎖DNAへのクロスインベージョン能を有することが明らかとなった。この鎖交換反応は非常に早く起こり、WNA誘導体を含むオリゴヌクレオチド(3本目の鎖)が2本鎖DNAに作用すると、2本鎖DNAがはがれ、それと同時に3本目の鎖とピリミジン鎖とがパラレル型2本鎖DNAを形成する。その後、プリン鎖と相互作用して3本鎖DNAを形成していることが明らかとなった。また、渡米先の研究室において、新規認識塩基の分子設計および合成を行い、人工的に合成した核酸誘導体をオリゴヌクレオチドに組み込むことにより、グアニンあるいはアデニンを選択的に認識する人工塩基の開発に成功した。

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  • Synthesis of the W-shaped nucleoside analogues

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    資金種別:競争的資金

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  • 3本鎖DNA形成を可能にする人工核酸の開発

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担当授業科目

  • 先端薬学研究 (2025年度) 夏季集中  - その他

  • 創薬・育薬特別演習(核酸創薬化学) (2025年度) 特別  - その他

  • 基礎生物学 (2025年度) 第1学期  - 水1~3

  • 基礎生物学 (2025年度) 第1学期  - 水1~3

  • 基礎生物学 (2025年度) 第1学期  - 水1~3

  • 基礎生物学 (2025年度) 第1学期  - 水1~3

  • 核酸創薬化学 (2025年度) 特別  - その他

  • 核酸創薬化学特論 (2025年度) 特別  - その他

  • 次世代の医薬品 (2025年度) 第3学期  - 月7~8

  • 生命科学・分子生物学 (2025年度) 特別  - その他

  • 生物化学2 (2025年度) 第3学期  - 金3~4

  • 生物化学2 (2025年度) 第3学期  - 金3~4

  • 生物化学B (2025年度) 第3学期  - 金3~4

  • 生物化学B (2025年度) 第3学期  - 金3~4

  • 生物系基礎実習 (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 生物系基礎実習 (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 知の探研 (2025年度) 1・3学期  - [第1学期]その他, [第2学期]不開講, [第3学期]木5~8

  • 薬学ガイダンス (2025年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]火2

  • 薬学ガイダンス (2025年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]火2

  • 薬学ガイダンス (2025年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]火2

  • 薬学ガイダンス (2025年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]火2

  • 薬学基礎実習Ⅲ (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 薬学基礎実習Ⅲ (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 薬学基礎実習Ⅲ (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 薬学基礎実習Ⅲ (2025年度) 第2学期  - その他5~9

  • 先端薬学研究 (2024年度) 夏季集中  - その他

  • 次世代の医薬品 (2024年度) 第3学期  - 木1~2

  • 生物化学B (2024年度) 第3学期  - 金3~4

  • 生物化学B (2024年度) 第3学期  - 金3~4

  • 薬学ガイダンス (2024年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]月1

  • 薬学ガイダンス (2024年度) 1・2学期  - [第1学期]水4, [第2学期]月1

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