研究者詳細 - 澤田　隆介

MISC - 澤田　隆介

分割表示 16 件中 1 - 16 件目／全件表示 >>

肺癌効果予測因子血清エクソソームの最新プロテオミクスによる小細胞肺癌の新規バイオマーカーの探索

山本真, 菅泰彦, 武田吉人, 中坪大亮, 榎本貴俊, 吉村華子, 網屋沙織, 原伶奈, 川崎貴裕, 白山敬之, 三宅浩太郎, 伊藤眞里, 足立淳, 上條陽平, 澤田隆介, 山西芳裕, 熊ノ郷淳

日本呼吸器学会誌 12 ( 増刊 ) 194 - 194 2023年3月

エクソソームのプロテオミクスを用いた小細胞肺癌における新規バイオマーカー探索

菅泰彦, 山本真, 吉村華子, 白山敬之, 三宅浩太郎, 上條陽平, 澤田隆介, 山西芳裕, 伊藤眞里, 足立淳, 武田吉人, 熊ノ郷淳

肺癌 62 ( 6 ) 678 - 678 2022年11月

エクソソームを用いた小細胞肺癌における新規バイオマーカ-探索

菅泰彦, 菅泰彦, 山本真, 吉村華子, 白山敬之, 三宅浩太郎, 武田吉人, 伊藤眞里, 足立淳, 上條陽平, 澤田隆介, 山西芳裕, 熊ノ郷淳

日本癌学会学術総会抄録集(Web) 81回 P - 3298 2022年9月

機械学習による食品の機能性の網羅的な予測と作用機序の解明

柴田友和, 田中由祐, 田口大夢, 澤田隆介, 青柳守紘, 平尾宜司, 山西芳裕

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年

生薬比率を考慮した漢方薬の作用機序や効能のin silico予測

島田祐樹, 江副晃洋, 澤田隆介, 柴田友和, 門脇真, 山西芳裕

和漢医薬学会学術大会要旨集 39th 2022年

AlphaFold2より得られたヒト全タンパク質立体構造との結合親和性に基づく医薬品化合物の副作用予測

澤田隆介, 柴田友和, 坂尻由子, 山西芳裕

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年

AlphaFold2から得られたヒト全タンパク質立体構造への結合親和性を考慮したドラッグリポジショニング

坂尻由子, 柴田友和, 澤田隆介, 山西芳裕

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年

遺伝性脊髄小脳変性症にトピラマートは有効か?

三浦史郎, 澤田隆介, 貴田浩志, 頼田章子, 鎌田崇嗣, 山西芳裕

臨床神経学 60 ( Suppl. ) S433 - S433 2020年11月

インシリコスクリーニングによる新規CFTRコレクターの探索

谷口正伍, 福田亮介, BERENGER Francois, 澤田隆介, 山口美穂, 井上敬太郎, 青木俊介, 山西芳裕, 沖米田司

日本薬学会年会要旨集(Web) 140th 2020年

Tensor‐train分解アルゴリズムによる高次テンソルデータ解析:薬物応答遺伝子発現データへの応用

岩田通夫, YUAN Longhao, ZHAO Qibin, 田部井靖生, BERENGER Francois, 澤田隆介, 秋好紗弥香, 山西芳裕, 山西芳裕

日本計算機統計学会大会論文集 32nd ( 0 ) 76‐77 - 77 2018年5月

漢方薬リポジショニング:ビッグデータと機械学習による漢方薬の効能予測

澤田隆介, 岩田通夫, 梅崎雅人, 臼井義比古, 小林敏一, 窪野孝貴, 林周作, 門脇真, 山西芳裕, 山西芳裕

ケモインフォマティクス討論会予稿集(Web) 41st 2018年

異種オミックスデータに基づく医薬品候補化合物の標的分子や効能の予測

澤田隆介, 山西芳裕

CBI学会大会 2017 2017年

薬物の標的タンパク質プロファイルとオミックス情報に基づくドラッグリポジショニング

澤田隆介, 岩田浩明, 山西芳裕, 山西芳裕

日本生化学会大会(Web) 88th 2015年

化合物応答遺伝子発現プロファイルの大規模解析による生理活性化合物の作用機序推定と創薬への応用

岩田通夫, 澤田隆介, 岩田浩明, 山西芳裕, 山西芳裕

日本生化学会大会(Web) 88th 2015年

Nuclear localization of proteins with a charge periodicity of 28 residues

Noriyuki Sakiyama, Runcong Ke, Ryuusuke Sawada, Masashi Sonoyama, Shigeki Mitaku

Chem-Bio Informatics Journal 7 ( 2 ) 35 - 48 2008年1月

記述言語：英語

Proteins with a charge periodicity of 28 residues (PCP28) were found recently in the human proteome, and many of the annotated PCP28 were located in the nucleus (Ke et al., Jpn. J. Appl. Phys. 2007). The physical properties of the amino acid sequences were analyzed to detect the difference in the physicochemistry between the nuclear and cytoplasmic PCP28 and develop a software system to classify the two types of PCP28. A significant difference in the global parameters from the entire sequence and the local parameters around a segment with the highest positive charge density was found between the nuclear and cytoplasmic PCP28. The global classification score included the densities of proline and cysteine, and the negative charge density, while the local score included the symmetry.of the charge distribution, the density of cysteine, and the positive charge density. A prediction system was developed using the global and local scores, which possessed a sensitivity and specificity of 92% and 88%, respectively. The mechanism of translocation of proteins to the nucleus is discussed using the parameters relevant to the predictive system. Copyright 2007 Chem-Bio Informatics Society.

DOI： 10.1273/cbij.7.35

Scopus

researchmap

Human genome encodes many proteins with charge periodicity of 28 residues

Runcong Ke, Noriyuki Sakiyama, Ryusuke Sawada, Masashi Sonoyama, Shigeki Mitaku

JAPANESE JOURNAL OF APPLIED PHYSICS PART 1-REGULAR PAPERS BRIEF COMMUNICATIONS & REVIEW PAPERS 46 ( 9A ) 6083 - 6086 2007年9月

記述言語：英語出版者・発行元：JAPAN SOC APPLIED PHYSICS

The human genome includes more than 36,000 open reading frames that are translated to amino acid sequences of proteins. When the charge distribution in amino acid sequences from the total human genome was analyzed by the autocorrelation function, a surprisingly sharp periodicity of 28 residues was observed. Every protein with the charge periodicity of 28 residues (PCP28) could be discriminated by a simple algorithm, and the number of PCP28 amounted to about 3% of the total open reading frames of the human genome. The net charge of most PCP28 was highly positive. The possible structural and functional features of this type of protein were discussed in terms of the electric repulsion within molecules.

DOI： 10.1143/JJAP.46.6083

Web of Science

CiNii Article

researchmap

　前のページ - 次のページ　

<澤田 隆介>

MISC - 澤田 隆介

<澤田　隆介>

MISC - 澤田　隆介