研究者詳細 - 牛島　幸一郎

2025/10/23 更新

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ウシジマ　コウイチロウ

牛島　幸一郎

USHIJIMA Koichiro

所属

環境生命自然科学学域教授

外部リンク

学位

博士（理学）（ 2002年3月横浜市立大学）
修士（理学）（ 1999年3月横浜市立大学）
学士（農学）（ 1997年3月東京農工大学）
博士（理学）

研究分野

環境・農学 / 園芸科学

論文

Effect of storage temperature and 1-MCP treatment on fruit ripening in Japanese apricot fruit (Prunus mume)

C. Yano, T. Kashiwamoto, M. Muqadas, K. Ohashi, O.W. Mitalo, T. Akagi, Y. Kubo, T. Kawai, K. Ushijima, F. Fukuda

Acta Horticulturae ( 1404 ) 717 - 724 2024年9月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：International Society for Horticultural Science (ISHS)

DOI： 10.17660/actahortic.2024.1404.98

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Effect of sugar-ester edible coating on postharvest life and development of chilling injury in tomatoes during ambient and cold storage

M. Muqadas, O. W. Mitalo, C. Yano, K. Ohashi, N. Hira, T. Akagi, K. Ushijima, Y. Kubo

Acta Horticulturae 3 ( 1404 ) 437 - 444 2024年9月

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掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）

DOI： 10.17660/ActaHortic.2024.1404.59

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Degenerate oligonucleotide primer MIG-seq: an effective PCR-based method for high-throughput genotyping 国際誌

Kazusa Nishimura, Hiroyuki Kokaji, Ko Motoki, Akira Yamazaki, Kyoka Nagasaka, Rihito Takisawa, Yasuo Yasui, Takashi Kawai, Koichiro Ushijima, Masanori Yamasaki, Hiroki Saito, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

The Plant journal : for cell and molecular biology 118 ( 6 ) 2296 - 2317 2024年5月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Cold Spring Harbor Laboratory

Summary

Multiplexed inter-simple sequence repeats genotyping by sequencing (MIG-seq) is an next-generation sequencing library construction method developed for the analysis of DNA in ecology. Although MIG-seq can generate libraries from low-quality DNA, few polymorphisms can be obtained in species with small genomes. In this study, we developed degenerate oligonucleotide primer MIG-seq (dpMIG-seq) as an effective polymorphism discovery method that allows for variation in the number of polymorphisms while retaining the advantages of MIG-seq, including independence from DNA quality. In dpMIG-seq, a proportion of the simple sequence repeats in the primer sequence of the first PCR in MIG-seq was changed to degenerate oligonucleotides to enable annealing to a wider range of sequences. In tests of several crop species other than wheat, the number of loci that could be sequenced using dpMIG-seq with a data volume of 0.3 gigabases (Gb) was increased compared with that sequenced using MIG-seq. In wheat, the number of polymorphisms obtained via dpMIG-seq was higher than that obtained via MIG-seq when a data volume of about ≥2 Gb was obtained. In dpMIG-seq, different loci could be sequenced by changing the positions of the degenerate oligonucleotides. By applying dpMIG-seq, we constructed a linkage map consisting of 5,142 markers for the rice inter-subspecies F₂ population, and we detected quantitative trait loci for heading date in the regions where known heading-related genes were located. Overall, our results show that dpMIG-seq is a useful tool for the genetic analysis of crop species.

DOI： 10.1101/2022.08.25.504752

PubMed

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Rapid and dynamic evolution of a giant Y chromosome inSilene latifolia

Takashi Akagi, Naoko Fujita, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Kiyotaka Nagaki, Ayano Horiuchi, Eriko Kuwada, Riko Kunou, Koki Nakamura, Yoko Ikeda, Koichiro Ushijima, Deborah Charlesworth

2023年9月

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DOI： 10.1101/2023.09.21.558759

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Application of deep learning diagnosis for multiple traits sorting in peach fruit

Kanae Masuda, Rika Uchida, Naoko Fujita, Yoshiaki Miyamoto, Takahiro Yasue, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Seiichi Uchida, Takashi Akagi

Postharvest Biology and Technology 201 112348 - 112348 2023年7月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier BV

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2023.112348

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Genetic basis of lineage-specific evolution of fruit traits in hexaploid persimmon. 国際誌

Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Ryusuke Matsuzaki, Ryutaro Tao, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 2023年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Frequent polyploidization events in plants have led to the establishment of many lineage-specific traits representing each species. Little is known about the genetic bases for these specific traits in polyploids, presumably due to plant genomic complexity and their difficulties of applying genetic approaches. Hexaploid Oriental persimmon (Diospyros kaki) has evolved specific fruit characters, including wide variations in fruit shapes and astringency. In this study, using whole-genome diploidized/quantitative genotypes from ddRAD-Seq data of 173 persimmon cultivars, we examined their population structures and potential correlations between their structural transitions and variations in nine fruit traits. The population structures of persimmon cultivars were highly randomized and not substantially correlated with the representative fruit traits focused on in this study, except for fruit astringency. With genome-wide association analytic tools considering polyploid alleles, we identified the loci associated with the nine fruit traits; we mainly focused on fruit-shape variations, which have been numerically characterized by principal component analysis of elliptic Fourier descriptors. The genomic regions that putatively underwent selective sweep exhibited no overlap with the loci associated with these persimmon-specific fruit traits. These insights will contribute to understanding of the genetic mechanisms by which fruit traits are independently established, possibly due to polyploidization events.

DOI： 10.1093/dnares/dsad015

PubMed

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Recurrent neo-sex chromosome evolution in kiwifruit

Takashi Akagi, Erika Varkonyi-Gasic, Kenta Shirasawa, Andrew Catanach, Isabelle M. Henry, Daniel Mertten, Paul Datson, Kanae Masuda, Naoko Fujita, Eriko Kuwada, Koichiro Ushijima, Kenji Beppu, Andrew C. Allan, Deborah Charlesworth, Ikuo Kataoka

Nature Plants 2023年3月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

DOI： 10.1038/s41477-023-01361-9

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その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41477-023-01361-9
1-Methylcyclopropene Pretreatment in ‘La France’ Pears to Extend Postharvest Life and Maximize Fruit Quality 査読

Abdul H. Kazimi, Oscar W. Mitalo, Azimullah Azimi, Kanae Masuda, Chikara Yano, Takashi Akagi, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo

2023年1月

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DOI： 10.2503/hortj.QH-012

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ウメの青果流通期間拡大に向けた台湾ウメ，日本ウメの収穫後果実の低温応答と1-MCP処理効果の調査

Tomoaki Kashiwamoto, Takashi Kawai, Takaaki Oe, Yasuhisa Tsuchida, Chikara Yano, Maqsood Muqadas, Takashi Akagi, Fumio Fukuda, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima

Horticultural Research (Japan) 22 ( 4 ) 303 - 311 2023年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Japanese Society for Horticultural Science

DOI： 10.2503/hrj.22.303

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Ongoing rapid evolution of a post-Y region revealed by chromosome-scale genome assembly of a hexaploid monoecious persimmon (Diospyros kaki)

Ayano Horiuchi, Kanae Masuda, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Naoko Fujita, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi

2022年12月

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DOI： 10.1101/2022.12.29.522208

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Genome-wide cis-decoding for expression design in tomato using cistrome data and explainable deep learning. 国際誌

Takashi Akagi, Kanae Masuda, Eriko Kuwada, Kouki Takeshita, Taiji Kawakatsu, Tohru Ariizumi, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Seiichi Uchida

The Plant cell 34 ( 6 ) 2174 - 2187 2022年5月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

In the evolutionary history of plants, variation in cis-regulatory elements (CREs) resulting in diversification of gene expression has played a central role in driving the evolution of lineage-specific traits. However, it is difficult to predict expression behaviors from CRE patterns to properly harness them, mainly because the biological processes are complex. In this study, we used cistrome datasets and explainable convolutional neural network (CNN) frameworks to predict genome-wide expression patterns in tomato (Solanum lycopersicum) fruit from the DNA sequences in gene regulatory regions. By fixing the effects of trans-acting factors using single cell-type spatiotemporal transcriptome data for the response variables, we developed a prediction model for crucial expression patterns in the initiation of tomato fruit ripening. Feature visualization of the CNNs identified nucleotide residues critical to the objective expression pattern in each gene, and their effects were validated experimentally in ripening tomato fruit. This cis-decoding framework will not only contribute to the understanding of the regulatory networks derived from CREs and transcription factor interactions, but also provides a flexible means of designing alleles for optimized expression.

DOI： 10.1093/plcell/koac079

PubMed

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Effect of storage temperature on development of chilling injury and its transcriptome analysis in ‘Fuyu’ persimmon fruit with or without 1-MCP treatment 査読

T. Furuta, O.W. Mitalo, T. Otsuki, R. Okada, K. Ohashi, K. Masuda, T. Akagi, K. Ushijima, R. Nakano, Y. Kubo

Acta Horticulturae ( 1338 ) 343 - 350 2022年4月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：International Society for Horticultural Science (ISHS)

DOI： 10.17660/actahortic.2022.1338.49

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Reinvention of hermaphroditism via activation of a RADIALIS-like gene in hexaploid persimmon. 国際誌

Kanae Masuda, Yoko Ikeda, Takakazu Matsuura, Taiji Kawakatsu, Ryutaro Tao, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Isabelle M Henry, Takashi Akagi

Nature plants 8 ( 3 ) 217 - 224 2022年3月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

In flowering plants, different lineages have independently transitioned from the ancestral hermaphroditic state into and out of various sexual systems1. Polyploidizations are often associated with this plasticity in sexual systems2,3. Persimmons (the genus Diospyros) have evolved dioecy via lineage-specific palaeoploidizations. More recently, hexaploid D. kaki has established monoecy and also exhibits reversions from male to hermaphrodite flowers in response to natural environmental signals (natural hermaphroditism, NH), or to artificial cytokinin treatment (artificial hermaphroditism, AH). We sought to identify the molecular pathways underlying these polyploid-specific reversions to hermaphroditism. Co-expression network analyses identified regulatory pathways specific to NH or AH transitions. Surprisingly, the two pathways appeared to be antagonistic, with abscisic acid and cytokinin signalling for NH and AH, respectively. Among the genes common to both pathways leading to hermaphroditic flowers, we identified a small-Myb RADIALIS-like gene, named DkRAD, which is specifically activated in hexaploid D. kaki. Consistently, ectopic overexpression of DkRAD in two model plants resulted in hypergrowth of the gynoecium. These results suggest that production of hermaphrodite flowers via polyploidization depends on DkRAD activation, which is not associated with a loss-of-function within the existing sex determination pathway, but rather represents a new path to (or reinvention of) hermaphroditism.

DOI： 10.1038/s41477-022-01107-z

PubMed

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The effect of layer-by-layer edible coating on the shelf life and transcriptome of ‘Kosui’ Japanese pear fruit 査読

Natsuki Hira, Oscar W. Mitalo, Rui Okada, Momoka Sangawa, Kanae Masuda, Naoko Fujita, Koichiro Ushijima, Takashi Akagi, Yasutaka Kubo

Postharvest Biology and Technology 185 111787 - 111787 2022年3月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier {BV}

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2021.111787

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MIG-seq is an effective method for high-throughput genotyping in wheat (Triticum spp.)

Kazusa Nishimura, Ko Motoki, Akira Yamazaki, Rihito Takisawa, Yasuo Yasui, Takashi Kawai, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Tetsuya Nakazaki

DNA Research 29 ( 2 ) 2022年2月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)

Abstract

MIG-seq (Multiplexed inter-simple sequence repeats genotyping by sequencing) has been developed as a low cost genotyping technology, although the number of polymorphisms obtained is assumed to be minimal, resulting in the low application of this technique to analyses of agricultural plants. We applied MIG-seq to 12 plant species that include various crops and investigated the relationship between genome size and the number of bases that can be stably sequenced. The genome size and the number of loci, which can be sequenced by MIG-seq, are positively correlated. This is due to the linkage between genome size and the number of simple sequence repeats (SSRs) through the genome. The applicability of MIG-seq to population structure analysis, linkage mapping, and quantitative trait loci (QTL) analysis in wheat, which has a relatively large genome, was further evaluated. The results of population structure analysis for tetraploid wheat showed the differences among collection sites and subspecies, which agreed with previous findings. Additionally, in wheat biparental mapping populations, over 3,000 SNPs/indels with low deficiency were detected using MIG-seq, and the QTL analysis was able to detect recognized flowering-related genes. These results revealed the effectiveness of MIG-seq for genomic analysis of agricultural plants with large genomes, including wheat.

DOI： 10.1093/dnares/dsac011

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その他リンク： https://academic.oup.com/dnaresearch/article-pdf/29/2/dsac011/43439343/dsac011.pdf
Deep Learning Predicts Rapid Over-softening and Shelf Life in Persimmon Fruits

Maria Suzuki, Kanae Masuda, Hideaki Asakuma, Kouki Takeshita, Kohei Baba, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima, Seiichi Uchida, Takashi Akagi

Horticulture Journal 91 ( 3 ) 408 - 415 2022年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.UTD-323

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Examining the Role of Low Temperature in Satsuma Mandarin Fruit Peel Degreening via Comparative Physiological and Transcriptomic Analysis. 国際誌

Oscar W Mitalo, William O Asiche, Seung W Kang, Hiroshi Ezura, Takashi Akagi, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima

Frontiers in plant science 13 918226 - 918226 2022年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Peel degreening is the most conspicuous aspect of fruit ripening in many citrus fruits because of its importance for marketability. In this study, peel degreening in response to propylene (an ethylene analog) and at varying storage temperatures was characterized in Satsuma mandarin (Citrus unshiu Marc.) fruit. Propylene treatment triggered rapid peel degreening (within 4-6 days), indicated by an increase in the citrus color index (CCI) and chlorophyll loss. Peel degreening was also observed in fruit at 10°C and 15°C after 28-42 days, with gradual CCI increase and chlorophyll reduction. However, fruit at 5°C, 20°C, and 25°C remained green, and no substantial changes in peel CCI and chlorophyll content were recorded during the 42-day storage duration. The transcriptomes of peels of fruit treated with propylene for 4 days and those stored at varying temperatures for 28 days were then analyzed by RNA-Seq. We identified three categories of differentially expressed genes that were regulated by (i) propylene (and by analogy, ethylene) alone, (ii) low temperature (5°C, 10°C, or 15°C vs. 25°C) alone, and (iii) either propylene or low temperature. Gene-encoding proteins associated with chlorophyll degradation (such as CuSGR1, CuNOL, CuACD2, CuCAB2, and CuLHCB2) and a transcription factor (CuERF114) were differentially expressed by propylene or low temperature. To further examine temperature-induced pathways, we also monitored gene expression during on-tree fruit maturation vs. postharvest. The onset of on-tree peel degreening coincided with autumnal drops in field temperatures, and it was accompanied by differential expression of low temperature-regulated genes. On the contrary, genes that were exclusively regulated by propylene (such as CuCOPT1 and CuPOX-A2) displayed insignificant expression changes during on-tree peel degreening. These findings indicate that low temperatures could be involved in the fruit ripening-related peel degreening independently of ethylene.

DOI： 10.3389/fpls.2022.918226

PubMed

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Combined signal sequence trap and macroarray analysis identifies genes associated with differential fruit softening characteristics during ripening in European and Chinese pears 査読

Mercy W. Mwaniki, Oscar W. Mitalo, Eric G. Mworia, Willis O. Owino, Kyoko Hiwasa-Tanase, Jocelyn K. C. Rose, Koh Aoki, Tomoya Esumi, Takashi Kawai, Ryohei Nakano, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo

POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY 174 2021年4月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2020.111436

Web of Science

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Association of T2/S-RNase With Self-Incompatibility of Japanese Citrus Accessions Examined by Transcriptomic, Phylogenetic, and Genetic Approaches. 査読国際誌

Chitose Honsho, Koichiro Ushijima, Misa Anraku, Shuji Ishimura, Qibin Yu, Frederick G Gmitter Jr, Takuya Tetsumura

Frontiers in plant science 12 638321 - 638321 2021年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2021.638321

PubMed

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Control of Fruit Softening during Marine Transport Bound for North America in Three Astringent-type Persimmons

Takahiro Furuta, Takumi Otsuki, Rui Okada, Takashi Kawai, Fumio Fukuda, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo, Ryohei Nakano

Horticultural Research (Japan) 20 ( 4 ) 455 - 461 2021年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Japanese Society for Horticultural Science

DOI： 10.2503/hrj.20.455

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Molecular Mechanism Underlying Derepressed Male Production in Hexaploid Persimmon 査読

Kanae Masuda, Naoko Fujita, Ho-Wen Yang, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo, Ryutaro Tao, Takashi Akagi

FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 11 2020年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2020.567249

Web of Science

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Low temperature modulates natural peel degreening in lemon fruit independently of endogenous ethylene 査読

Oscar W Mitalo, Takumi Otsuki, Rui Okada, Saeka Obitsu, Kanae Masuda, Yuko Hojo, Takakazu Matsuura, Izumi C Mori, Daigo Abe, William O Asiche, Takashi Akagi, Yasutaka Kubo, Koichiro Ushijima

Journal of Experimental Botany 71 ( 16 ) 4778 - 4796 2020年8月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/eraa206

Web of Science

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その他リンク： http://academic.oup.com/jxb/article-pdf/71/16/4778/33573305/eraa206.pdf
Genome-wide study on the polysomic genetic factors conferring plasticity of flower sexuality in hexaploid persimmon 査読

Kanae Masuda, Eiji Yamamoto, Kenta Shirasawa, Noriyuki Onoue, Atsushi Kono, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo, Ryutaro Tao, Isabelle M. Henry, Takashi Akagi

DNA RESEARCH 27 ( 3 ) 2020年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/dnares/dsaa012

Web of Science

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モモ‘桃水’のエチレン生成と軟化特性査読

河井崇, 秋田香雅里, 渡邉咲音, 深松陽介, 高田大輔, 佐藤守, 牛島幸一郎, 福田文夫, 中野龍平

園芸学研究 19 ( 1 ) 61 - 67 2020年1月

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記述言語：日本語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：一般社団法人園芸学会

モモ（Prunus persica（L.）Batsch）の肉質は，収穫後の貯蔵および消費者の嗜好性の観点から重要な形質である．溶質モモの果実は典型的なクライマクテリック型の成熟を示し，成熟後期にエチレン生成の急増と果実硬度の急速な低下がみられる．一方で，硬肉モモではエチレンがほとんど生成されず，樹上や収穫後において硬度が高く維持される．本研究では，‘川中島白桃’の放任受粉の実生から選抜されたと言われている‘桃水’が硬肉性を持つことを明らかにした．‘桃水’は棚持ち期間が長く，肉質がサクサクしているが，そのエチレン生成や軟化特性は明らかにされていない．そこで，エチレンのアナログであるプロピレンを外生処理した‘桃水’果実のエチレン生成および果実軟化の様相を調査した．無処理の果実では，収穫時期や栽培地に関わらずエチレンはほとんど検出されず，果実硬度が高く維持された．プロピレン処理により果実硬度は著しく低下したが，その間もエチレン生成はほとんど検出されなかった．モモの硬肉性の原因遺伝子として同定されたPpYUC11遺伝子の遺伝子型調査により，PpYUC11遺伝子の5′隣接領域におけるトランスポゾン様配列の挿入および第1イントロン内のSSRのいずれについても，‘桃水’の遺伝子型は他の硬肉品種の遺伝子型と同じであることが明らかになった．これらの結果から，‘桃水’はエチレン生成および果実軟化が抑制された硬肉モモであることが示唆された．

DOI： 10.2503/hrj.19.61

CiNii Article

CiNii Books

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その他リンク： https://www.jstage.jst.go.jp/article/hrj/19/1/19_61/_pdf
Postharvest Properties of Ultra-Late Maturing Peach Cultivars and Their Attributions to Melting Flesh (M) Locus: Re-evaluation of M Locus in Association With Flesh Texture. 国際誌

Ryohei Nakano, Takashi Kawai, Yosuke Fukamatsu, Kagari Akita, Sakine Watanabe, Takahiro Asano, Daisuke Takata, Mamoru Sato, Fumio Fukuda, Koichiro Ushijima

Frontiers in plant science 11 554158 - 554158 2020年

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2020.554158

PubMed

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‘Passe Crassane’ pear fruit (Pyrus communis L.) ripening: revisiting the role of low temperature via integrated physiological and transcriptome analysis 査読

Oscar Witere MITALO, Yasuaki Tosa, Sumire Tokiwa, Yuki Kondo, Azimullah Azimi, Yuko Hojo, Takakazu Matsuura, Izumi Mori, Ryohei NAKANO, Takashi Akagi, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo

Postharvest Biology and Technology 158 110949 - 110949 2019年12月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2019.110949

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A Sequence Resource of Autosomes and Additional Chromosomes in the Peach Pathotype of Alternaria alternata 査読

Koichiro Ushijima, Mikihiro Yamamoto

MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS 32 ( 10 ) 1273 - 1276 2019年10月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1094/MPMI-04-19-0093-A

Web of Science

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Low temperature storage stimulates fruit softening and sugar accumulation without ethylene and aroma volatile production in kiwifruit 査読

Oscar W. Mitalo, Sumire Tokiwa, Yuki Kondo, Takumi Otsuki, Ivan Galis, Katsuhiko Suezawa, Ikuo Kataoka, Anh T. Doan, Ryohei Nakano, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo

Frontiers in Plant Science 10 1 - 15 2019年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.3389/fpls.2019.00888

Web of Science

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Comparative analysis of fruit ripening and associated genes in two kiwifruit cultivars (‘Sanuki Gold’ and ‘Hayward’) at various storage temperatures 査読

Oscar Witere Mitalo, William Olubero Asiche, Yuka Kasahara, Yasuaki Tosa, Sumire Tokiwa, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

Postharvest Biology and Technology 147 20 - 28 2019年1月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2018.08.017

Web of Science

Scopus

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Aberrant Stamen Development is Associated with Parthenocarpic Fruit Set through Up-regulation of Gibberellin Biosynthesis in Tomato 査読

Okabe, Yoshihiro, Yamaoka, Tatsuya, Ariizumi, Tohru, Ushijima, Koichiro, Kojima, Mikiko, Takebayashi, Yumiko, Sakakibara, Hitoshi, Kusano, Miyako, Shinozaki, Yoshihito, Pulungan, Sri I, Kubo, Yasutaka, Nakano, Ryohei, Ezura, Hiroshi

Plant & Cell Physiology 60 ( 1 ) 38 - 51 2019年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/pcp/pcy184

Web of Science

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Determination of optimum temperature for long-term storage and analysis of ripening-related genes in 'Rainbow Red' kiwifruit 査読

Mitalo, O.W, Tokiwa, S, Kasahara, Y, Tosa, Y, Kondo, Y, Asiche, W.O, Kataoka, I, Suezawa, K, Ushijima, K, Nakano, R, Kubo, Y

Acta Hortic. 1218 517 - 524 2018年10月

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掲載種別：研究論文（国際会議プロシーディングス）

DOI： 10.17660/ActaHortic.2018.1218.71

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Comparative Mapping of the ASTRINGENCY Locus Controlling Fruit Astringency in Hexaploid Persimmon (Diospyros kaki Thunb.) with the Diploid D. lotus Reference Genome 査読

Nishiyama Soichiro, Onoue Noriyuki, Kono Atsushi, Sato Akihiko, Ushijima Koichiro, Yamane Hisayo, Tao Ryutaro, Yonemori Keizo

HORTICULTURE JOURNAL 87 ( 3 ) 315 - 323 2018年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.OKD-140

Web of Science

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Comparative transcriptome analysis reveals distinct ethylene-independent regulation of ripening in response to low temperature in kiwifruit 査読

William O. Asiche, Oscar W. Mitalo, Yuka Kasahara, Yasuaki Tosa, Eric G. Mworia, Willis O. Owino, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Kentaro Yano, Yasutaka Kubo

BMC Plant Biology 18 ( 1 ) 2018年3月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1186/s12870-018-1264-y

Web of Science

Scopus

PubMed

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Nondestructive detection of split pit in peaches using an acoustic vibration method 査読

Ryohei Nakano, Hidemi Akimoto, Fumio Fukuda, Takashi Kawai, Koichiro Ushijima, Yosuke Fukamatsu, Yasutaka Kubo, Yuichiro Fujii, Ken Hirano, Kunihisa Morinaga, Naoki Sakurai

Horticulture Journal 87 ( 2 ) 281 - 287 2018年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.OKD-094

Web of Science

Scopus

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Characterization of ripening-related genes involved in ethylene-independent low temperature-modulated ripening in ‘rainbow red’ kiwifruit during storage and on-vine 査読

Oscar Witere Mitalo, William Olubero Asiche, Yuka Kasahara, Yasuaki Tosa, Willis Omondi Owino, Eric Gituma Mworia, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

Horticulture Journal 87 ( 3 ) 421 - 429 2018年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.OKD-035

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Effect of Storage Temperature on Fruit Ripening in Three Kiwifruit Cultivars 査読

William Olubero Asiche, Oscar Witere Mitalo, Yuka Kasahara, Yasuaki Tosa, Eric Gituma Mworia, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

HORTICULTURE JOURNAL 86 ( 3 ) 403 - 410 2017年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.OKD-028

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Two Members of the Aluminum-Activated Malate Transporter Family, SlALMT4 and SlALMT5, are Expressed during Fruit Development, and the Overexpression of SlALMT5 Alters Organic Acid Contents in Seeds in Tomato (Solanum lycopersicum) 査読

Takayuki Sasaki, Yoshiyuki Tsuchiya, Michiyo Ariyoshi, Ryohei Nakano, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo, Izumi C. Mori, Emi Higashiizumi, Ivan Galis, Yoko Yamamoto

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 57 ( 11 ) 2367 - 2379 2016年11月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/pcp/pcw157

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Extension of Shelf-life by Limited Duration of Propylene and 1-MCP Treatments in Three Kiwifruit Cultivars 査読

William Olubero Asiche, Eric Gituma Mworia, Chisato Oda, Oscar Witere Mitalo, Willis Omondi Owino, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

HORTICULTURE JOURNAL 85 ( 1 ) 76 - 85 2016年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.MI-066

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Effect of postharvest short-term radiation of near infrared light on transpiration of lettuce leaf 査読

Ayako Kozuki, Yutaka Ishida, Kazumasa Kakibuchi, Toshihiro Mishima, Naoki Sakurai, Yoshiyuki Murata, Ryohei Nakano, Koichiro Ushijima, Yasutaka Kubo

POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY 108 78 - 85 2015年10月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2015.05.010

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Genetic Control of Floral Morph and Petal Pigmentation in Linum grandiflorum Desf., a Heterostylous Flax 査読

Koichiro Ushijima, Kazuo Ikeda, Ryohei Nakano, Miyo Matsubara, Yuri Tsuda, Yasutaka Kubo

HORTICULTURE JOURNAL 84 ( 3 ) 261 - 268 2015年7月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hortj.MI-045

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エダマメ‘ふくら’と‘湯あがり娘’における生育中の品質関連因子解析に基づく収穫適期の評価査読

水野寛士, 橋本早紀, 田中仁奈, 山本達也, 中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆

園芸学研究 14 ( 1 ) 61 - 67 2015年1月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/hrj.14.61

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収穫後の貯蔵温度，形態がエダマメ'ふくら'と'湯あがり娘'の品質に及ぼす影響

水野寛士, 田中仁奈, 橋本早紀, 山本達也, 中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆

園芸学研究 14 ( 3 ) 297 - 304 2015年

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記述言語：日本語出版者・発行元：園芸学会

エダマメは主に夏季に栽培，収穫され気温が高いことから，収穫後に品質低下しやすい．本研究では'ふくら'と'湯あがり娘'を用い，種々の貯蔵温度，形態（"枝葉付き"，"枝付き"，"もぎ莢"）が収穫後のエダマメの品質に及ぼす影響を経時的に調査した．いずれの品種でも，15°C以上の貯蔵では糖含量は3時間後に収穫時の約80％以下に，遊離アミノ酸含量は6時間後に収穫時の約80％以下に減少した．常温近くで貯蔵すると3時間という非常に短い間に品質が低下することが明らかになった．しかし，10°C以下の貯蔵条件は，外観保持効果に優れ，糖含量は10時間後でも収穫時の約80％以上，遊離アミノ酸含量は24時間後でも収穫時の約80％以上保持した．低温貯蔵は品質低下抑制に非常に有効であった．枝葉付き貯蔵にも一定の品質保持効果が見られたが，貯蔵温度と時間の影響の方が明らかに大きかった．これらの結果から，エダマメを高品質に保つためには，収穫後3時間以内に10°C以下の温度に管理することが重要と考えられた．

DOI： 10.2503/hrj.14.297

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その他リンク： http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010892824
凍結時の糊化度がエダマメ'味緑'と'湯あがり娘'の物性に及ぼす影響

水野寛士, 田中仁奈, 橋本早紀, 山本達也, 中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆

日本食品工学会誌 16 ( 1 ) 63 - 70 2015年

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本食品工学会

エダマメを凍結すると細胞が損傷し，食感品質が低下する．デンプンを多く含むため，食感に影響する要素として糊化度に注目し，凍結時の糊化度が物性に及ぼす影響を，'味緑'と'湯あがり娘'を用いて調査した．<br>加熱時間を変えて糊化度の異なるエダマメを数種類作成し，凍結した．流水解凍した後，再度加熱し，ほぼ完全に糊化させた．物性を測定した結果，凍結時の糊化度の影響を受けて検体間で異なる値を示した．糊化度55～83％で凍結したエダマメは，解凍後の荷重，CI値が高く，ほぼ完全に糊化させても値は大きく低下せず，他糊化度で凍結したもの比べて高い値を示した．しかし，糊化度41％以下で凍結したエダマメは，解凍後高い荷重，CI値を示すが，加熱によりほぼ完全に糊化されることで値が大きく低下した．また，糊化度92％以上で凍結したエダマメは，解凍後の時点で低い荷重，CI値を示し，ほぼ完全糊化の加熱により値が若干低下した．

DOI： 10.11301/jsfe.16.63

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その他リンク： http://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010891565
Double flower formation induced by silencing of C-class MADS-box genes and its variation among petunia Cultivars 査読

Siti Hajar Noor, Koichiro Ushijima, Ayaka Murata, Kaori Yoshida, Miki Tanabe, Tomoki Tanigawa, Yasutaka Kubo, Ryohei Nakano

SCIENTIA HORTICULTURAE 178 1 - 7 2014年10月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.scienta.2014.07.029

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Isolation of the floral morph-related genes in heterostylous flax (Linum grandiflorum): the genetic polymorphism and the transcriptional and post-transcriptional regulations of the S locus 査読

Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Mayu Bando, Yukari Shigezane, Kazuo Ikeda, Yuko Namba, Saori Kume, Toshiyuki Kitabata, Hitoshi Mori, Yasutaka Kubo

PLANT JOURNAL 69 ( 2 ) 317 - 331 2012年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/j.1365-313X.2011.04792.x

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Low-temperature-modulated fruit ripening is independent of ethylene in 'Sanuki Gold' kiwifruit 査読

Eric G. Mworia, Takashi Yoshikawa, Nadiah Salikon, Chisato Oda, William O. Asiche, Naoki Yokotani, Daigo Abe, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 63 ( 2 ) 963 - 971 2012年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/err324

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The Arabidopsis Na+/H+ Antiporters NHX1 and NHX2 Control Vacuolar pH and K+ Homeostasis to Regulate Growth, Flower Development, and Reproduction (vol 23, pg 3482, 2011) 査読

Elias Bassil, Hiromi Tajima, Yin-Chih Liang, Masa-aki Ohto, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Tomoya Esumi, Ardian Coku, Mark Belmonte, Eduardo Blumwald

PLANT CELL 23 ( 12 ) 4526 - 4526 2011年12月

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記述言語：英語

DOI： 10.1105/tpc.111.231260

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Sequence divergence and loss-of-function phenotypes of S locus F-box brothers genes are consistent with non-self recognition by multiple pollen determinants in self-incompatibility of Japanese pear (Pyrus pyrifolia) 査読

Hiroyuki Kakui, Masaki Kato, Koichiro Ushijima, Miyoko Kitaguchi, Shu Kato, Hidenori Sassa

PLANT JOURNAL 68 ( 6 ) 1028 - 1038 2011年12月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1111/j.1365-313X.2011.04752.x

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Effect of MA Storage and 1-MCP on Storability and Quality of 'Sanuki Gold' Kiwifruit Harvested at Two Different Maturity Stages 査読

Eric Gituma Mworia, Takashi Yoshikawa, Nadiah Salikon, Chisato Oda, Tetsuo Fukuda, Katsuhiko Suezawa, William Olubero Asiche, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

JOURNAL OF THE JAPANESE SOCIETY FOR HORTICULTURAL SCIENCE 80 ( 3 ) 372 - 377 2011年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/jjshs1.80.372

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Characterization of ethylene biosynthesis and its regulation during fruit ripening in kiwifruit, Actinidia chinensis 'Sanuki Gold' 査読

Eric G. Mworia, Takashi Yoshikawa, Naoki Yokotani, Tetsuo Fukuda, Katsuhiko Suezawa, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo

POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY 55 ( 2 ) 108 - 113 2010年2月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2009.08.007

Web of Science

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Identification and functional analysis of pistil self-incompatibility factor HT-B of Petunia 査読

Alejandro Raul Puerta, Koichiro Ushijima, Takato Koba, Hidenori Sassa

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 60 ( 4 ) 1309 - 1318 2009年3月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/erp005

Web of Science

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ナシ果実における二次元電気泳動による細胞壁画分タンパク質の解析

坂東麻由, 牛島幸一郎, 中野龍平, 稲葉昭次, 久保康隆

日本食品保蔵科学会誌 34 ( 3 ) 127 - 132 2008年5月

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本食品保蔵科学会

セイヨウナシ'ラ・フランス'果実は成熟時に爆発的なエチレン生成と急激な果肉軟化を示す典型的なクライマクテリック型果実である。一方, 同じナシ属に属するチュウゴクナシ品種'ヤーリー'果実は成熟中に多量のエチレンを生成するが軟化しない。本研究では果実軟化の制御にかかわる因子を同定するために, これらナシ果実の細胞壁タンパク質のプロテオーム解析を行った。さまざまな成熟ステージの'ラ・フランス'細胞壁タンパク質を二次元電気泳動で分離したところ, 成熟に伴い変化する19個のタンパク質スポットを得た。これらのうち, エチレン作用阻害剤である1-MCP処理による軟化抑制を行うと, 15個のタンパク質の蓄積がプレクライマクテリック期と同等になった。また, 19個のタンパク質のうち8個が'ヤーリー'果実では成熟に伴って変動せず, 果肉硬度と同じ挙動を示す結果となった。このうち1-MCPにより変動し, 'ヤーリー'では変化しなかったのは2個のスポットである。これら2個のタンパク質の蓄積パターンは果肉軟化様相と同じ挙動を示しており, 軟化の鍵因子の有力な候補と考えられた。

DOI： 10.5891/jafps.34.127

CiNii Article

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Differential expression of ethylene biosynthetic genes in climacteric and non-climacteric Chinese pear fruit 査読

Miki Yamane, Daigo Abe, Sayaka Yasui, Naoki Yokotani, Wataru Kimata, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Yasutaka Kubo, Akitsugu Inaba

POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY 44 ( 3 ) 220 - 227 2007年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2006.12.010

Web of Science

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S locus F-Box brothers: Multiple and pollen-specific F-box genes with S haplotype-specific polymorphisms in apple and Japanese pear 査読

Hidenori Sassa, Hiroyuki Kakui, Mayu Miyamoto, Yusuke Suzuki, Toshio Hanada, Koichiro Ushijima, Makoto Kusaba, Hisashi Hirano, Takato Koba

GENETICS 175 ( 4 ) 1869 - 1881 2007年4月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1534/genetics.106.068858

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beta-galactosidase and alpha-L-arabinofuranosidase activities and gene expression in European and Chinese pear fruit during ripening 査読

Mercy W. Mwaniki, Francis M. Mathooko, Kyoko Hiwasa, Akira Tateishi, Naoki Yokotani, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Akitsugu Inaba, Yasutaka Kubo

JOURNAL OF THE JAPANESE SOCIETY FOR HORTICULTURAL SCIENCE 76 ( 1 ) 85 - 90 2007年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.2503/jjshs.76.85

Web of Science

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Ethylene regulation of fruit softening and cell wall disassembly in Charentais melon 査読

Kiyomi Nishiyama, Monique Guis, Jocelyn K. C. Rose, Yasutaka Kubo, Kristen A. Bennett, Wangjin Lu, Kenji Kato, Koichiro Ushijima, Ryohei Nakano, Akitsugu Inaba, Mondher Bouzayen, Alain Latche, Jean-Claude Pech, Alan B. Bennett

JOURNAL OF EXPERIMENTAL BOTANY 58 ( 6 ) 1281 - 1290 2007年

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1093/jxb/erl283

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Expression characteristics of seven members of the beta-galactosidase gene family in 'La France' pear (Pyrus communis L.) fruit during growth and their regulation by 1-methylcyclopropene during postharvest ripening 査読

MW Mwaniki, FM Mathooko, M Matsuzaki, K Hiwasa, A Tateishi, K Ushijima, R Nakano, A Inaba, Y Kubo

POSTHARVEST BIOLOGY AND TECHNOLOGY 36 ( 3 ) 253 - 263 2005年6月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.postharvbio.2005.02.002

Web of Science

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Linkage and physical distances between the S-haplotype S-RNase and SFB genes in sweet cherry 査読

K Ikeda, K Ushijima, H Yamane, R Tao, NR Hauck, AM Sebolt, AF Iezzoni

SEXUAL PLANT REPRODUCTION 17 ( 6 ) 289 - 296 2005年4月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00497-004-0240-x

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Primary structural features of the S haplotype-specific F-box protein, SFB, in Prunus 査読

K Ikeda, B Igic, K Ushijima, H Yamane, NR Hauck, R Nakano, H Sassa, AF Iezzoni, Kohn, JR, R Tao

SEXUAL PLANT REPRODUCTION 16 ( 5 ) 235 - 243 2004年1月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s00497-003-0200-x

Web of Science

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The use of the S haplotype-specific F-box protein gene, SFB, as a molecular marker for S-haplotypes and self-compatibility in Japanese apricot (Prunus mume). 国際誌

Hisayo Yamane, Koichiro Ushijima, Hidenori Sassa, Ryutaro Tao

TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik 107 ( 8 ) 1357 - 61 2003年11月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

Japanese apricot ( Prunus mume) exhibits the S-RNase-based gametophytic self-incompatibility system as do other self-incompatible Prunus species. This report identifies the S haplotype-specific F-box protein gene ( SFB), a candidate gene for pollen- S, of Japanese apricot, which leads to the development of a molecular typing system for S-haplotype in this fruit species. Both 5'- and 3'-RACE (rapid amplification of cDNA ends) were performed with SFB gene-specific oligonucleotide primers to clone Pm-SFB(1) and Pm-SFB(7) of 'Nanko ( S(1) S(7))'. As in the case of SFB of other Prunus species, Pm-SFB(1) and Pm-SFB(7) showed a high level of S-haplotype-specific sequence polymorphism and their expression was specific to pollen. Genomic DNA-blot analyses of 11 Japanese apricot cultivars with the Pm-SFB probes under low stringency conditions yielded RFLP bands specific to the S(1)- to S(8)-haplotypes as well as a self-compatible S(f)-haplotype. A practical usage of SFB as a molecular marker for S-haplotypes and self-compatibility in Japanese apricot is discussed.

PubMed

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A pollen-expressed gene for a novel protein with an F-box motif that is very tightly linked to a gene for S-RNase in two species of cherry, Prunus cerasus and P. avium.

Hisayo Yamane, Kazuo Ikeda, Koichiro Ushijima, Hidenori Sassa, Ryutaro Tao

Plant & cell physiology 44 ( 7 ) 764 - 9 2003年7月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

This study describes a novel F-box protein gene in the S-locus of sour cherry (Prunus cerasus) and sweet cherry (P. avium). The gene showed an S-haplotype-specific sequence polymorphism and the expression was specific to pollen. Genomic DNA blot analysis of eight sweet cherry cultivars with the probe for the F-box protein gene under low stringency conditions yielded RFLP bands specific to the S-haplotypes of each cultivar. We discuss the possibility of the gene for the F-box protein being a candidate for the male determinant of gametophytic self-incompatibility in PRUNUS:

PubMed

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Structural and transcriptional analysis of self-incompatibility (S) locus of almond (Prunus dulcis) : identification of a pollen-expressed F-box gene with haplotype-specific polymorphism

USHIJIMA K.

Plant Cell 15 771 - 781 2003年

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DOI： 10.1105/tpc.009290

CiNii Article

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A pistil-specific thaumatin/PR5-like protein gene of Japanese pear (Pyrus serotina): sequence and promoter activity of the 5' region in transgenic tobacco. 国際誌

Hidenori Sassa, Koichiro Ushijima, Hisashi Hirano

Plant molecular biology 50 ( 3 ) 371 - 7 2002年10月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

The genomic clone encoding the pistil-specific thaumatin/PR5-like protein (PsTL1) was isolated from Japanese pear (Pyrus serotina). Sequence analysis showed that the genomic clone contained the 5'-flanking sequence of 2.4 kb, the 3'-flanking sequence of 648 bp and the coding region interrupted by a intron of 351 bp. A sequence motif conserved in some pistil self-incompatibility gene promoters of solanaceous and brassicaceous species was located in the 5'-flanking region of the PsTL1 gene. The 2.4 kb 5'-flanking region was fused to the GUS coding sequence and transferred to tobacco. Transgenic tobacco showed GUS activity in pistil and, at low level, in anther, but not in other floral organs and leaf. Histochemical analysis localized GUS activity to stigma, transmitting tissue, anther and pollen of transgenic tobacco.

PubMed

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Identification of self-incompatibility genotypes of almond by allele-specific PCR analysis

M. Tamura, K. Ushijima, H. Sassa, H. Hirano, R. Tao, T. M. Gradziel, A. M. Dandekar

Theoretical and Applied Genetics 101 ( 3 ) 344 - 349 2000年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s001220051489

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Characterization of the flanking regions of the S-RNase genes of Japanese pear (Pyrus serotina) and apple (Malus x domestica)

Koichiro Ushijima, Hidenori Sassa, Hisashi Hirano

Gene 211 ( 1 ) 159 - 167 1998年4月

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/S0378-1119(98)00105-X

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Cloning and characterization of cDNAs encoding S-RNases from almond (Prunus dulcis): Primary structural features and sequence diversity of the S-RNases in Rosaceae

K. Ushijima, H. Sassa, R. Tao, H. Yamane, A. M. Dandekar, T. M. Gradziel, H. Hirano

Molecular and General Genetics 260 ( 2-3 ) 261 - 268 1998年

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1007/s004380050894

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MISC

GWASによる六倍体カキ品種群の果実形状多様性機構の解明に向けて

堀内綾乃, 堀内綾乃, 尾上典之, 南川舞, 西村和紗, 白澤健太, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年

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マンテマ属における巨大性染色体の進化動態

赤木剛士, 藤田尚子, 増田佳苗, 白澤健太, 長岐清孝, 堀内綾乃, 桑田恵理子, 久能理子, 中村光希, 池田陽子, 牛島幸一郎, CHARLESWORTH Deborah

育種学研究 26 2024年

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J-GLOBAL

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六倍体栽培ガキ品種群における集団構造解析および果実形状GWAS

堀内綾乃, 堀内綾乃, 尾上典之, 松崎隆介, 南川舞, 西村和紗, 白澤健太, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

育種学研究 26 2024年

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カキ品種‘太秋’の全ゲノム解読から紐解くポストY染色体の急速進化

堀内綾乃, 増田佳苗, 白澤健太, 尾上典之, 藤田尚子, 牛島幸一郎, 赤木剛士

園芸学研究別冊 22 ( 1 ) 2023年

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J-GLOBAL

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マタタビ属におけるネオ性染色体の反復進化(II)

赤木剛士, 赤木剛士, VARKONYI-GASIC Erika, 白澤健太, CATANACH Andrew, HENRY Isabelle M., MERTTEN Daniel, DATSON Paul, 増田佳苗, 藤田尚子, 桑田恵理子, 牛島幸一郎, 別府賢治, ALLAN Andrew C., CHARLESWORTH Deborah, 片岡郁雄

園芸学研究別冊 22 ( 1 ) 2023年

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J-GLOBAL

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Silene属植物の全ゲノム比較解析から性の成立過程を紐解く

藤田尚子, 白澤健太, 牛島幸一郎, 赤木剛士

Plant Morphology 35 ( 1 ) 2023年

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Silene属の全ゲノム比較進化解析から紐解く性染色体と性決定因子群の成立

藤田尚子, 白澤健太, 牛島幸一郎, 赤木剛士

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年

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Silene属植物における性染色体を持つ種と持たない種の比較ゲノム解析

藤田尚子, 白澤健太, 牛島幸一郎, 赤木剛士

園芸学研究別冊 21 ( 2 ) 2022年

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マタタビ属におけるネオ性染色体の反復進化(I)

赤木剛士, 赤木剛士, VARKONYI-GASIC Erika, 白澤健太, CATANACH Andrew, HENRY Isabelle M., DATSON Paul, 増田佳苗, 藤田尚子, 桑田恵理子, 牛島幸一郎, 別府賢治, ALLAN Andrew C., COMAI Luca, CHARLESWORTH Deborah, 片岡郁雄

園芸学研究別冊 21 ( 2 ) 2022年

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六倍体カキ品種群に特異な果実形状多様性に関わる集団遺伝学的解析

堀内綾乃, 増田佳苗, 増田佳苗, 尾上典之, 松崎隆介, 白澤健太, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

園芸学研究別冊 21 ( 2 ) 2022年

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深層学習によるカキ果実の外観に対する嗜好性の特徴化

鈴木茉莉亜, 増田佳苗, 杉浦真由, 鈴木哲也, 新川猛, 久保康隆, 牛島幸一郎, 内田誠一, 赤木剛士, 赤木剛士

園芸学研究別冊 21 ( 2 ) 2022年

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六倍体カキ品種群の分化経路と果実形状多様性の獲得

堀内綾乃, 増田佳苗, 増田佳苗, 尾上典之, 松崎隆介, 白澤健太, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

育種学研究 24 2022年

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体細胞変異系統の比較解析によるカキ果実形状決定機構の解明

堀内綾乃, 増田佳苗, 松崎隆介, 尾上典之, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

育種学研究 24 2022年

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極晩生モモにおける果実肥大および成熟様相

福田文夫, 玉木由佳, 河井崇, 牛島幸一郎, 平野健, 小田賢司, 原美由紀, 深松陽介, 森永邦久, 中野龍平

園芸学研究 = Horticultural research (Japan) 20 ( 1 ) 65 - 71 2021年1月

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記述言語：日本語出版者・発行元：園芸学会

CiNii Article

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メロン軟化遅延系統の遺伝的制御とトランスクリプトーム解析

合田駿平, 池田和生, 小林和真, 赤木剛士, 加藤鎌司, 久保康隆, 中野龍平, 牛島幸一郎

園芸学研究別冊 20 ( 1 ) 2021年

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モモにおける黒斑病菌の宿主特異的毒素の感受性に関与する候補遺伝子の特定

浅野貴洋, 河井崇, 鵜木悠治郎, 日原誠介, 白澤健太, 赤木剛士, 久保康隆, 高田大輔, 中野龍平, 福田文夫, 山本幹博, 牛島幸一郎

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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深層学習による高蓄積small RNA配列パターン予測と園芸作物への実用展開

榎那津美, 増田佳苗, 久保康隆, 牛島幸一郎, 内田誠一, 赤木剛士, 赤木剛士

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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深層学習によるキウイフルーツ果実における成熟応答cisモチーフのゲノムワイド探索

桑田恵理子, 竹下孔喜, 藤田尚子, 牛島幸一郎, 久保康隆, 別府賢治, 片岡郁雄, 内田誠一, 赤木剛士, 赤木剛士

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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深層学習によるトマト果実の遺伝子発現デザインへ向けたゲノムワイドcisデコーディング

赤木剛士, 赤木剛士, 増田佳苗, 桑田恵理子, 竹下孔喜, 川勝泰二, 有泉亨, 久保康隆, 牛島幸一郎, 内田誠一

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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深層学習によるカキ果実の早期軟化予測と初期生理反応の特徴化

鈴木茉莉亜, 増田佳苗, 竹下孔喜, 朝隈英昭, 杉浦真由, 鈴木哲也, 新川猛, 久保康隆, 牛島幸一郎, 内田誠一, 赤木剛士, 赤木剛士

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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六倍体カキにおけるRADIALIS様遺伝子を介した両性花性の再構築

増田佳苗, 池田陽子, 松浦恭和, 川勝泰二, 田尾龍太郎, 久保康隆, 牛島幸一郎, HENRY Isabelle M., 赤木剛士, 赤木剛士

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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カキ‘平核無’と枝変わり系統‘孝子丸’の比較解析による果実形状決定機構の解明

堀内綾乃, 増田佳苗, 松崎隆介, 尾上典之, 久保康隆, 牛島幸一郎, 赤木剛士

園芸学研究別冊 20 ( 2 ) 2021年

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モモ‘冬桃がたり’の極晩生成熟特性のF₁後代における遺伝様式

河井崇, 牛島幸一郎, 三宅春菜, 草加芽依, 深松陽介, 原美由紀, 鵜木悠治郎, 日原誠介, 中野龍平, 小田賢司, 福田文夫

園芸学研究別冊 19 ( 1 ) 2020年

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性の可塑化を規定する遺伝子ネットワーク:六倍体カキにおける両性花派生機構

増田佳苗, 牛島幸一郎, 久保康隆, 赤木剛士

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 84th 2020年

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倍数体カキ特異的なストレス応答遺伝子NGAを介した両性花派生機構

増田佳苗, 牛島幸一郎, 久保康隆, 赤木剛士

育種学研究 22 2020年

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カキ品種の果実生育・成熟に関する倍数体用ゲノムワイドアソシエーション解析

赤木剛士, 増田佳苗, 牛島幸一郎, 久保康隆

園芸学研究別冊 18 ( 2 ) 2019年

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カキの両性花派生に関する共発現ネットワーク解析

増田佳苗, 牛島幸一郎, 久保康隆, 田尾龍太郎, 赤木剛士

園芸学研究別冊 18 ( 2 ) 2019年

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‘香粋’キウイフルーツにおける芳香成分と一次代謝産物のGC/MSによる解析

常盤淑玲, 笠原有加, 土佐康彰, MITALO Witere Oscar, 近藤憂紀, 大槻巧, 大地菜摘, AZIMI Azimullah, DOAN Anh Thu, GALIS Ivan, 中野龍平, 中野龍平, 牛島幸一郎, 牛島幸一郎, 久保康隆, 久保康隆

園芸学研究別冊 17 ( 2 ) 2018年

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棚持ち性の良いメロン系統の交配後代における表現型の調査

岡本健, 上山美穂, 中西諒祐, 牛島幸一郎, 村上賢治, 加藤鎌司, 久保康隆, 中野龍平

園芸学研究別冊 15 ( 1 ) 2016年

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モモ晩生品種の香港中秋節時期に向けた輸出試験に関して

中野龍平, 岡村憲一, 荒木克也, 志水基修, 長谷川圭則, 藤井雄一郎, 荒木有朋, 樋野友之, 牛島幸一郎, 久保康隆, 森永邦久, 福田文夫

園芸学研究別冊 15 ( 1 ) 2016年

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マメガキを用いたカキの甘渋性決定遺伝子座の比較ゲノム解析

西山総一郎, 佐藤明彦, 河野淳, 尾上典之, 牛島幸一郎, 山根久代, 田尾龍太郎, 米森敬三

園芸学研究別冊 14 ( 2 ) 2015年

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ハミウリおよびその交配後代の棚持ち性に関する研究

岡本健, 中村智哉, 上山美穂, 山岡達也, 牛島幸一郎, 久保康隆, 加藤鎌司, 中野龍平

園芸学会中四国支部研究発表要旨 ( 54 ) 2015年

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棚持ち性の良いメロン系統のエチレン応答性に関する研究

岡本健, 中村智哉, 上山美穂, 浜田佳代子, 山岡達也, 牛島幸一郎, 村上賢治, 加藤鎌司, 久保康隆, 中野龍平

園芸学研究別冊 14 ( 2 ) 2015年

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メロン果実成熟過程におけるエチレンシグナル伝達系遺伝子の発現パターン

山岡達也, 中野龍平, 加藤鎌司, 久保康隆, 牛島幸一郎

園芸学研究別冊 11 ( 2 ) 2012年

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ベニバナアマにおける異形花型自家不和合性関連遺伝子の探索

坂東麻由, 久保康隆, 中野龍平, 牛島幸一郎

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 7 ( 1 ) 406 - 406 2008年3月

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記述言語：日本語

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機能的スクリーニングとマクロアレイ解析によるナシ果実の成熟に関係する細胞外因子の網羅的研究

MWANIKI M. W., 中野龍平, 牛島幸一郎, 青木考, ROSE J. K. C., 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 7 ( 1 ) 243 - 243 2008年3月

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記述言語：英語

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トマトマクロアレイを用いた成熟関連遺伝子の発現解析

上高大典, 原野哲治, 横谷尚起, 中野龍平, 牛島幸一郎, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 2 ) 405 - 405 2007年9月

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記述言語：日本語

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キウイフルーツ'さぬきゴールド'の長期貯蔵の試み

吉川尚志, モーリアエリック, 中野龍平, 牛島幸一郎, 福田哲生, 末澤克彦, 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 2 ) 401 - 401 2007年9月

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記述言語：日本語

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キウイフルーツ'さぬきゴールド'の果実成熟におけるエチレン生合成とその制御

モーリアエリック, 吉川尚志, 中野龍平, 牛島幸一郎, 福田哲生, 末澤克彦, 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 2 ) 403 - 403 2007年9月

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記述言語：英語

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'Honey Dew' 果実におけるエチレン応答遺伝子の発現パターン

西山精視, 中野龍平, 加藤鎌司, 稲葉昭次, 久保康隆, 牛島幸一郎

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 2 ) 404 - 404 2007年9月

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記述言語：日本語

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EIN3/EIL抑制形質転換トマトの表現型解析

原野哲治, 上高大典, 横谷尚起, 中野龍平, 牛島幸一郎, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 2 ) 649 - 649 2007年9月

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記述言語：日本語

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セイヨウナシの果実軟化に関連する細胞壁タンパク質の解析

坂東麻由, 牛島幸一郎, 中野龍平, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学研究. 別冊, 園芸学会大会研究発表要旨 6 ( 1 ) 289 - 289 2007年3月

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記述言語：日本語

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β-Galactosidase and α-L-Arabinofuranosidase Activities and Gene Expression in European and Chinese Pear Fruit During Ripening :

Mwaniki Mercy W., Mathooko Francis M., Hiwasa Kyoko, Tateishi Akira, Yokotani Naoki, Ushijima Koichiro, Nakano Ryohei, Inaha Akitsugu, Kubo Yasutaka

園芸学会雑誌 76 ( 1 ) 85 - 90 2007年

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記述言語：英語出版者・発行元：Japanese Society for Horticultural Science

Substantial decreases in cell wall bound galactosyl and arabinosyl residues are two of the most evident cell wall compositional changes that occur during fruit ripening. The roles of β-galactosidase (β-Gal) and α-L-arabinofuranosidase (α-Af), the enzymes responsible for these respective losses, were investigated and compared in European (Pyrus communis L. 'La France') and Chinese (Pyrus bretschneideri Rehd. 'Yali') pear fruits which exhibit different softening characteristics during ripening. The increase in the activities of β-Gal and α-Af during ripening in both types of pear fruit correlated well with an increase in climacteric ethylene production, and a concomitant decrease in flesh firmness in 'La France' fruit. However, there was no noticeable decrease in 'Yali' flesh firmness even after 28 days of storage at room temperature. In both fruit types, enzyme activity and the accumulation of transcripts hybridizing with PpGAL1, PpGAL4, PpARF2, and PcARF1 increased with fruit ripening. Increases in gene expression and enzyme activities in 'Yali' fruit with no detectable softening during ripening indicate that β-Gal and α-Af may not mediate difference in fruit softening between two pears, but that they could play some role(s) in cell wall changes, perhaps in cooperation with other cell wall-modifying enzymes such as polygalacturonase.

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その他リンク： http://dl.ndl.go.jp/info:ndljp/pid/10471864
'Honey Dew' 果実における成熟関連形質のエチレン応答性

西山精視, 牛島幸一郎, 加藤鎌司, 中野龍平, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 75 ( 2 ) 610 - 610 2006年9月

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記述言語：日本語

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'中谷早生'、'刀根早生'、'平核無'カキ果実の発育特性と収穫後の軟化防止

相良洋紀, 播磨真志, 中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆, 稲葉昭次

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 75 ( 2 ) 409 - 409 2006年9月

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記述言語：日本語

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メロン品種における果実成熟特性とエチレン関連遺伝子の発現

西山精視, 牛島幸一郎, 加藤鎌司, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学会雑誌別冊 75 ( 1 ) 2006年

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メロン果実の軟化特性と polygalacturonase 遺伝子発現の系統間差異

西山精視, 宮崎智子, 牛島幸一郎, 加藤鎌司, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 74 ( 2 ) 553 - 553 2005年10月

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記述言語：日本語

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メロン果実の成熟に伴う軟化関連酵素遺伝子の発現解析

西山精視, 宮崎智子, 牛島幸一郎, 加藤鎌司, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 74 ( 1 ) 401 - 401 2005年3月

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記述言語：日本語

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ブドウ果実の成熟関連MADS遺伝子のクローニングとその発現および機能解析

山根美樹, 尾崎正行, 中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆, 稲葉昭次

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 74 ( 1 ) 383 - 383 2005年3月

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記述言語：日本語

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甘果オウトウS遺伝子座における遺伝的組換の抑制

池田和生, 牛島幸一郎, 山根久代, IEZZONI Amy, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 2 ) 557 - 557 2004年9月

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記述言語：日本語

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ウメの自家和合性S^fハプロタイプの解析

筧永子, 牛島幸一郎, 山根久代, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 2 ) 558 - 558 2004年9月

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記述言語：日本語

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3種のナシ果実における β-galactosidase と arabinofuranosidase の酵素活性および遺伝子発現の解析

ムワニキマーシー・W, マソーコフランシス・M, 日和佐京子, 立石亮, 牛島幸一郎, 稲葉昭次, 久保康隆

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 2 ) 517 - 517 2004年9月

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記述言語：日本語

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Molecular markers for the self-compatible S4′-haplotype, a pollen-part Mutant in sweet cherry (Prunus avium L.)

K. Ikeda, A. Watari, K. Ushijima, H. Yamane, N. R. Hauck, A. F. Iezzoni, R. Tao

Journal of the American Society for Horticultural Science 129 ( 5 ) 724 - 728 2004年9月

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記述言語：英語

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Prunus 属果樹のSFBの一次構造の特徴

池田和生, 牛島幸一郎, 山根久代, 佐々英徳, IEZZONI A. F, KOHN J. R, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 1 ) 180 - 180 2004年4月

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記述言語：日本語

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甘果オウトウの自家和合性S^<4'>ハプロタイプ判別のためのdCAPSマーカーの開発

渡晶子, 牛島幸一郎, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 1 ) 369 - 369 2004年4月

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記述言語：日本語

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甘果オウトウ自家和合性S^<4'>ハプロタイプにおけるSFB遺伝子の変異

牛島幸一郎, 池田和生, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 73 ( 1 ) 368 - 368 2004年4月

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記述言語：日本語

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The S haplotype-specific F-box protein gene, SFB, is defective in self-compatible haplotypes of Prunus avium and P. mume

USHIJIMA K

Plant J 39 573 - 586 2004年

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甘果オウトウの自家和合性S^4'ハプロタイプの解析 : (第1報)DNAブロット分析によるSハプロタイプ特異的Fボックスタンパク質遺伝子(SFB)の解析

池田和生, 渡晶子, 牛島幸一郎, 山根久代, IEZZONI A. F, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 72 ( 2 ) 291 - 291 2003年9月

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記述言語：日本語

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Linked to a Gene for S-RNase in Two Species of Cherry, Prununs cerasus and P. avium

Yamane Hisayo, Ikeda Kazuo, Ushijima Koichiro, SASSA Hidenori, TAO Ryutaro

Plant and cell physiology 44 ( 7 ) 764 - 769 2003年7月

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記述言語：英語出版者・発行元：Japanese Society of Plant Physiologists

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Prunus 属のS遺伝子座の構造的特徴

牛島幸一郎, 佐々英徳, 山根久代, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 72 ( 1 ) 155 - 155 2003年4月

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記述言語：日本語

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オウトウの自家不和合性における花粉S候補遺伝子の同定

山根久代, 池田和生, 牛島幸一郎, 佐々英徳, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 72 ( 1 ) 342 - 342 2003年4月

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記述言語：日本語

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ウメ自家不和合性品種における花粉S候補遺伝子の同定

山根久代, 難波梓, 牛島幸一郎, 佐々英徳, 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 72 ( 1 ) 340 - 340 2003年4月

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記述言語：日本語

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アーモンド花粉S候補遺伝子の単離およびその発現パターンの解析

牛島幸一郎, 佐々英徳, GRADZIEL Thomas M., DANDEKAR Abhaya M., 田尾龍太郎

園芸学会雑誌. 別冊, 園芸学会大会研究発表 71 ( 2 ) 489 - 489 2002年10月

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記述言語：日本語

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Characterization of the S-locus region of almond (Prunus dulcis): analysis of a somaclonal mutant and a cosmid contig for an S haplotype

USHIJIMA K.

Genetics 158 379 - 386 2001年

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共同研究・競争的資金等の研究

エチレン合成変異体のtranscriptome/Cistrome解析による果実成熟形質制御機構の解明

研究課題/領域番号：24K01747 2024年04月 - 2029年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

牛島幸一郎, 柏本知晟, 赤木剛士, 中野龍平, 池田和生, 河井崇

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配分額：18590000円（直接経費：14300000円、間接経費：4290000円）

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ヒュウガナツ高精度参照ゲノム構築とそれを利用した枝変わり変異形質の原因遺伝子探索

研究課題/領域番号：23K26898 2023年04月 - 2027年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

本勝千歳, 稲葉丈人, 牛島幸一郎

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配分額：13910000円（直接経費：10700000円、間接経費：3210000円）

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黒毛和種の受胎率低下に関わるロバートソン転座の構造解明と遺伝子診断法の確立

研究課題/領域番号：23K05556 2023年04月 - 2026年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)

辻岳人, 牛島幸一郎

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配分額：4680000円（直接経費：3600000円、間接経費：1080000円）

本年度はA県とB県の黒毛和種繁殖雌牛から採取した血液をもちいて染色体標本を作成し、ロバートソン転座の有無を調査した。合計62頭を調査した結果、ロバートソン転座は認められなかった。黒毛和種におけるロバートソン転座に関する報告としては、30年ほど前のもので近年の調査報告はない。また30年前の報告では、調査された複数の県すべてにおいてロバートソン転座が約5%から15%の個体で認めらたことが示されている。したがって、本年度の我々の結果は、現在の黒毛和種においてロバートソン転座の頻度はかなり低下している可能性を示している。しかし、地域集団ごとにロバートソン転座に頻度に大きな違いがあることも考えられるため、今後さらに調査対象を拡大する必要がある。

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モモのPan-genomeの構築とその利用による主要形質の制御遺伝子の特定

研究課題/領域番号：22H00368 2022年04月 - 2027年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A)

中野龍平, 牛島幸一郎, 山本幹博, 福田文夫, 西村和紗, 高田大輔, 鵜木悠治郎, 森本拓也, 小田賢司

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配分額：41860000円（直接経費：32200000円、間接経費：9660000円）

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果実ポストハーベスト研究のニューフロンティア-低温誘導成熟機構解明とその利用

研究課題/領域番号：20H02977 2020年04月 - 2024年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

久保康隆, 矢野健太郎, 阿部大吾, 加藤雅也, 牛島幸一郎, 赤木剛士, 河井崇

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配分額：17810000円（直接経費：13700000円、間接経費：4110000円）

本研究は、低温誘導成熟機構を、温帯性果実種横断的にゲノム・トランスクリプトーム解析、メタボローム解析、遺伝子組換え技術などを駆使して解析し、その統合的理解を目指す先駆的学術的取り組みである。低温誘導成熟果はエチレン誘導果よりも品質保持期間が長く、低温感受性の品種間差異は成熟の早生・晩生性に密接に関与している。本研究は、収穫後ロス低減に直結する新品質保持技術開発と分子マーカー開発による育種への貢献を目的とする。
本年度は、研究の第２段階として、ウンシュウミカン、カキ、セイヨウナシ、リンゴ果実でのRNAseq解析、LC解析に基づいて成熟制御システムの全体像を把握するとともに、低温応答遺伝子および代謝物を抽出を試みた。今回解析したいずれの果実でもエチレン処理および低温遭遇によって、細胞壁分解系遺伝子、クロロフィル分解系遺伝子発現が刺激されることが明らかになった。さらに、ウンシュウミカンとレモン果実の低温応答に関するRNAseqデータの解析によって、カンキツでは、共通してERF3遺伝子が低温応答に重要な転写因子候補であることが示された。また、 ‘小原紅早生’ミカンではエチレンシグナルと低温シグナルによりCCD4遺伝子が活性化され、アポカロテノイド類が特異的に蓄積して成熟時に紅色に着色することが示された。また、‘富有’カキでは５℃貯蔵によってエチレン生成が刺激され果肉軟化と水浸状化を特徴とする低温障害症状がが進行するが、20℃以上または０℃では果肉軟化が抑制された。ただし、０℃貯蔵では常温に移行すると急激にエチレン生成の誘導と果肉軟化が進行した。１ヶ月程度なら20℃の常温貯蔵が可能であることが示された

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セイヨウナシの周縁キメラ分離カルスを利用した果皮の全面赤着色メカニズムの解明

研究課題/領域番号：20K06030 2020年04月 - 2023年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)

池田和生, 牛島幸一郎

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配分額：4420000円（直接経費：3400000円、間接経費：1020000円）

本年度は、（１）周縁キメラであるセイヨウナシ果実の果皮からL-1層のみを分離したカルスからシュートおよび根を再分化させ個体として独立させること目的として、前年度作成したカルスを材料として、カルスからの発根培養条件の検討（２）周縁キメラ品種の果皮から脱分化させた赤着色カルスと非着色カルスで発現している遺伝子についてトランスクリプトーム解析、を行った。（１）では、セイヨウナシ‘リーガル・レッド・コミス’の果皮培養からカルスを作成し、カルスからの発根に適した培養条件について基本培地およびオーキシン濃度を検討した。基本培地については、MS基本培地もしくは窒素濃度を半減させた１/２MS培地を検討した結果、継代回数が少ない段階ではMS培地と１/２MS培地のカルス生存率に差は認められなかった．しかしながら，継代３回目以降では基本培地はMS培地と比較して1/2MS培地のカルス生存率が高い傾向が見られた。これより，発根培養時のカルスの生存には培地の窒素濃度が低い方がよいと考えられた。一方、（２）では、赤着色（Red）カルスと非着色（Green）カルスからtotal RNAを抽出し、それぞれのカルスについて3サンプルずつ次世代シークエンスに供した結果、平均2000万リードのデータを得た。 ‘バートレット’のゲノム情報（GDR,www.rosaceae.org）を基にマッピングを行い，約3万3000遺伝子について遺伝子発現解析を行った。．赤着色（Red）カルスにおける遺伝子発現量が非着色（Green）カルスの4倍以上の遺伝子が約1700遺伝子，8倍以上の遺伝子が約600遺伝子、16倍以上の遺伝子が270遺伝子であることが明らかとなり、これらの遺伝子が赤着色形質に関与している可能性が高いと考えられた。

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メロン交雑集団を用いた棚持ち性関連遺伝子座の特定

研究課題/領域番号：19H02948 2019年04月 - 2024年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

牛島幸一郎, 門田有希, 中野龍平, 池田和生

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配分額：17160000円（直接経費：13200000円、間接経費：3960000円）

メロンは一般に急激な呼吸量の増加とともにエチレンの生成と果実軟化を示すクライマクテリック型果実であるが，実際にはエチレンを感受しないノンクライマクテリック型果実や，エチレン合成量が少ない，軟化速度が遅いなど，様々な成熟様相を示す品種が存在する.メロン品種のハネデュとB2は共に棚持ち性の良い品種であるが，前者はエチレン生合成，後者は果肉軟化に変異が生じている.R3年度はB2の棚持ち性に関する研究を中心に解析を行った．
B2についてはR2年度に軟化遅延形質がF５世代で分離した．これにより１遺伝子座支配である可能性が示唆されているが，本来の予定であればF6世代で分離する予定であり，想定外の結果であった．この結果がただしいか否かを再度検証するとともにGWAS解析を行うことにした．R2年度と同じF5集団に加えてあらたにF6集団を栽培し，果肉の形質を調査した．F5に関しては前年と同様に軟化遅延形質が1:1で，F6では3:1で分離した．これらの結果から，やはり軟化遅延形質は１遺伝子座支配であると考えられた．そこで，GRAS-di解析を実施しSNPをコールして，GWAS解析を行った．その結果，高い相関を示すSNPは検出されなかった．僅かに相関が観察される遺伝子座もあったが，遺伝子型の分離比が歪んでおり信頼性が低いと考えられ，遺伝子座の特定には至らなかった．
ハネデュのエチレン合成不全については，R2年度までに典型的なクライマクテリック型果実のシャランテとのF2集団でGWAS解析やRNA-seq解析などから制御因子の特定を試みて，8番染色体に相関は見られたが候補遺伝子の特定には至っていない．他の形質と比べると相関が高くないため再度集団を作り解析を試みることにした．R3年度はF1の栽培及びF2世代の種子の回収を行い，次年度の解析のための材料を得た．

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カンキツ属植物の自家不和合性はS-RNaseに支配されているのか？

研究課題/領域番号：19H02949 2019年04月 - 2023年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

本勝千歳, 稲葉丈人, 牛島幸一郎

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配分額：17290000円（直接経費：13300000円、間接経費：3990000円）

近年カンキツ属のいくつかの品種で自家不和合性Sハプロタイプが決定され，またこれまでに行った次世代シークエンス解析の結果から，SハプロタイプとT2RNase型との対応関係が示唆された．このことから，T2RNaseがS遺伝子である可能性が高いと考えられる．そこで本研究では，組換えタンパク質によるT2RNaseの機能解析，T2RNase型とSハプロタイプとの対応関係の調査と新規T2RNase遺伝子の獲得，そしてSハプロタイプとT2RNase遺伝子の遺伝解析を行い，T2RNase遺伝子とカンキツ属植物の自家不和合性の関連性について知見を得ようとするものである．
本年度は，自家不和合性カンキツ属植物のヒュウガナツにおいて，枝変わりによって生じた自家和合性突然変異体の解析を行った．自家和合性ヒュウガナツである’井原日向’の花柱からRNAを抽出し，RNAseqデータを取得して，発現解析を行った．その結果，ヒュウガナツの自家不和合性遺伝子であるS15-RNaseが’井原日向’において，有意に発現が低下する発現変動遺伝子（DEG）に含まれていることが明らかとなった．この遺伝子については，PCRによって’井原日向’内に遺伝子が存在することを確認した．一方でRT-qPCRにより’井原日向’での発現低下が認められた．
昨年度に取得したクレメンティンの花粉より獲得したRNAseqデータの解析を行った．その結果，クレメンティンのS-RNase遺伝子と思われるCiclev10027322m.gの周辺に存在する複数のF-Box遺伝子が花粉特異的に発現しており，これまでに報告されているS-RNase型自家不和合性植物と類似した発現パターンを示すことを明らかにした．

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極晩生モモ‘玄桃’の果実成熟特性およびその制御機構の解明

研究課題/領域番号：19K06033 2019年04月 - 2022年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)

河井崇, 福田文夫, 中野龍平, 牛島幸一郎

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配分額：4420000円（直接経費：3400000円、間接経費：1020000円）

本研究では、モモ‘玄桃’において見出された極晩生の成熟特性の制御機構を明らかにするため、F1後代における形質の遺伝様式および果実発育中の生理学的・組織学的変化について調査した。‘玄桃’の極晩生の成熟特性はF1後代では分離しなかったが、果実の成熟時期が2群に分かれ、その早晩と第4連鎖群のNAC遺伝子における9bpのindelが一致した。‘玄桃’の果肉における細胞径やABA含量の増加時期は、果実発育に対応して一般品種より著しく遅いことが明らかになった。今後はこれらの結果と、トランスクリプトーム解析やF2後代を用いた遺伝解析を組み合わせることで、‘玄桃’の極晩生成熟特性の制御機構の全容解明を目指す。

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モモ民間育成の晩生希少品種を遺伝資源として活用した棚持ち性と果肉障害回避性の解析

研究課題/領域番号：18H02200 2018年04月 - 2023年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

中野龍平, 牛島幸一郎, 福田文夫, 高田大輔, 河井崇

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配分額：17030000円（直接経費：13100000円、間接経費：3930000円）

１）桃水と大寿蜜桃を用いたエチレン生成およびエチレン応答に関する解析：桃水ではエチレン生成能を持たず、大寿蜜桃はエチレンに応答した軟化力を失っている。RNA-seq解析の結果、桃水では他の２品種と比べて、91のDEGが検出され、２遺伝子は転写因子をコードしており、これらの自己触媒的エチレン生成能の欠損性との関連が示唆された。大寿蜜桃では、441のDEGが検出され、16遺伝子は転写因子をコードしていた。本研究で欠損が証明されたPG遺伝子以外にも、軟化へ関与するExpansinなどの軟化関連遺伝子やAATなどの香り成分合成関連遺伝子の発現が抑制されていた。PG遺伝子に加えてエチレン応答性に関わる転写因子の抑制により、軟化や香り成分生成が抑えられていると考えられた。さらなる証明と関連遺伝子の探索のために、大寿蜜桃と川中島白桃の交配後代を育成したところ、大苗育苗などにより開花が促進され、約半数の後代において開花が認められた。
２）紅博桃、枝変わり系統およびあかつきの解析：紅博桃枝変わりに生じたLOH（Loss of heterozygosity）により、熟期以外にも果肉障害、異形果や落下果実の多発など様々な不良形質が現れることが分かった。このLOHによりホモ化すると不良形質を生む染色体領域は本白桃由来であること、本白桃、あかつき、川中島白桃など日本のモモ育種における中心的な品種がヘテロに保持していることが分かり、育種過程において不良形質を示す後代を選抜する有効な遺伝情報を得た。
３）ワッサーなど特徴的な日持ち性や肉質を示すとされる他の民間育成品種：ワッサー、CX、ネクタリン系のサンライズなど、最近、育成された新品種に桃水と同様の硬肉モモ系の品種が存在することが明らかとなった。一方、大寿蜜桃と同様の軟化形質やPGの遺伝子型を持つ品種は、缶モモも含め近年の国内栽培品種には見つからなかった。

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下流制御因子の同定によるノンクライマクテリック型果実の成熟・老化制御機構の解明

研究課題/領域番号：16K14853 2016年04月 - 2019年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究

中野龍平, 牛島幸一郎, 久保康隆

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配分額：3640000円（直接経費：2800000円、間接経費：840000円）

ノンクライマクテリック型果実の成熟老化機構の解明を目指し、成熟シグナル下流領域の候補制御因子について、イチゴ2倍体野生種F. vescaを用いて研究した。EIN3/EIL転写因子では保存領域RNAiによりFv-EIL1,2の発現抑制個体を得たが成熟・老化には影響がなく、Fv-EIL3の成熟への関与が示唆された。NAC転写因子ではmiRNA164のターゲット配列を持つアイソジンの内、NAC-SFが成熟時に100倍以上に発現増大した。VIGSコンストラクトを導入したアグロバクテリウムの種子感染により、高頻度にVIGSが誘導され、Fv-EIL3やNAC-SFなど候補因子の機能解析の可能性が高まった。

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非モデル作物種の完全長cDNA配列の決定とストレス応答性遺伝子の網羅的な発現解析

研究課題/領域番号：16K07557 2016年04月 - 2019年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C)

門田有希, 田淵宏朗, 牛島幸一郎

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配分額：4810000円（直接経費：3700000円、間接経費：1110000円）

サツマイモは高次倍数性（2n=6x=90）や自家不和合成等の特徴をもつため遺伝様式が複雑であり、全ゲノム配列情報や遺伝子アノテーション情報は未だに整備されていない。そこで本研究では、Iso-seqやRNA-seq等のNGS解析を行い、サツマイモの転写産物に関する参照配列を構築するとともに線虫抵抗性に関わる遺伝子の同定を試みた。Iso-seqで得られた54000個のアイソフォーム配列と近年公開されたサツマイモ転写産物データを統合することで100,419配列から成る参照配列を構築した。また、線虫抵抗性・感受性品種を対象にRNA-seqを行い、線虫抵抗性に関わる候補遺伝子を同定した。

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果実発育・成熟関連遺伝子の完全長cDNA配列と選択的スプライシングの網羅的解析

研究課題/領域番号：16K14854 2016年04月 - 2018年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究

牛島幸一郎, 門田有希, 赤木剛士

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配分額：3640000円（直接経費：2800000円、間接経費：840000円）

第３世代の次世代シークエンサーの普及により，ゲノム解読だけではなく転写産物の解読に利用されている．本研究ではメロン果実のIso-seq解析を行い，完全長cDNA配列と選択的スプライシングについて解析を行った．３つの異なる方法で完全長cDNA配列ライブラリーを構築し，PacBioとNanoporeを用いて配列解読を行った．得られたIsoformをメロンゲノムにマッピングして比較した結果，PacBioの解読では約6,500遺伝子座，Nanoporeの解読では12,000の遺伝子座からの転写産物が得られた．そのうち，509遺伝子座が新規の遺伝子座であった．

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メロン遺伝資源を活用した日持ち性に関する分子生物学的解析

研究課題/領域番号：26292018 2014年04月 - 2019年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

中野龍平, 加藤鎌司, 村上賢治, 高居恵愛, 牛島幸一郎, 久保康隆

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配分額：15860000円（直接経費：12200000円、間接経費：3660000円）

日持ち性の良いメロン遺伝資源について生理的特徴を把握し、その形質の遺伝様式や関連遺伝子を調査した。1)B2はエチレン生成能を持つがエチレン依存的軟化が緩慢で、Cm-PG1よびCm-EXP5の発現抑制が関連していた。春系3号との交配後代においてこの形質は優性を示した。2) ハニーデューはエチレン生成能が欠損しており、シャランテとの交配後代においてこの形質と連鎖した領域が見出された。3)ハミウリでは、シャランテとの交配後代においてエチレン生成能の欠損系統とエチレン依存的軟化の欠損系統が見つかった。いずれも劣性であり、シャランテへの戻し交配を繰返しこの形質を持つ系統がBC4F2世代まで選抜された。

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ゲノミクス・トランスクリプトミクス的アプローチによる異形花型不和合性の機構解明

研究課題/領域番号：25292023 2013年04月 - 2017年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

牛島幸一郎, 鈴木孝征, 赤木剛士, 池田和生

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配分額：18980000円（直接経費：14600000円、間接経費：4380000円）

異形花型自家不和合性（HetSI）は自己花粉を排除する自家不和合性形質と花の形（花型）と連鎖した現象である．アマ科植物のHetSIの機構解明のために原因遺伝子であるS遺伝子候補の単離とS遺伝子座領域の解析を行った．トランスクリプトームの解析からは，あらたに４つの候補遺伝子の単離に成功した．ゲノム解析からS遺伝子座領域が1Mbp以上にわたることを明らかとした．すべての候補遺伝子はこの領域に含まれるが，その相対的な配置は明らかになっていない．そこで，ベニバナアマのゲノム配列を明らかにするためにショットガンシークエンシングとde novo assemblyを行い，今後の新たな研究基盤を構築した．

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エチレン－ジャスモン酸クロストークを利用した果実成熟・老化調節技術の開発

研究課題/領域番号：25660028 2013年04月 - 2016年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究

牛島幸一郎, 中野龍平

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配分額：3900000円（直接経費：3000000円、間接経費：900000円）

クライマクテリック型果実の成熟制御は，エチレン合成や信号伝達に着目した形質転換体や薬剤に因るものであったが，非常に高い効果のため果実が十分に可食なレベルにならないなどの問題があった．そこで，この研究ではホルモンのクロストークに着目して，新しい制御技術の開発を試みた．JAZはエチレンとJAのクロストークのhub因子であり，候補として最適と考えられた．そこで，果実作物であるメロンとトマトJAZ遺伝子をデータベースから抽出し，系統樹解析で分類した．JAZ1は果実成熟により急激に発現が低下し，また変異体・形質転換体の発現パターンからもJAZ1が果実成熟に関連している可能性があると考えられた．

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バラ科の異なる自家不和合性機構の比較解析～多因子非自己認識型と単因子自己認識型

研究課題/領域番号：24380004 2012年04月 - 2017年03月

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

佐々英徳, 牛島幸一郎

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配分額：19240000円（直接経費：14800000円、間接経費：4440000円）

リンゴにおいて、花粉で発現するSBP1とSSK1の相同遺伝子を単離し、MdSBP1およびMdSSK1と名付けた。これらと、リンゴSFBBタンパク質との相互作用を解析したところ、どちらのタンパク質もSFBBと結合することが判った。しかしさらなる解析により、MdSSK1の方がSFBBに強く結合し、更に遺伝子発現量も遥かにMdSBP1よりも高いことが示された。SFBBと強く結合し発現量も高いMdSSK1が、SFBBとともに主要な複合体を形成して自家不和合性機能に重要な役割を果たしていることが強く示唆された。

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老化特異的プロモーターによりＩＰＴ遺伝子の発現を誘導した組換え花きの作成と解析

研究課題/領域番号：23780025 2011年 - 2013年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

中野龍平, 久保康隆, 牛島幸一郎

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配分額：3770000円（直接経費：2900000円、間接経費：870000円）

サイトカイニン合成に関連するIPT遺伝子を老化開始時に遺伝子発現を誘導するPSARKプロモーターの制御下で誘導するキメラ遺伝子PSARK-IPTを導入した花き類を育成し、その老化を調査した.その結果、流通中の葉の黄化が問題となるキク‘精興の誠’において、PSARK-IPTを導入個体では黄化が著しく抑制された。さらに、黄化が発生しやすい条件であるエチレン存在下や暗黒下にて調査したところ、いずれの条件でも黄化が著しく抑制された。花持ち期間が長く、低コスト・省エネルギーの流通を可能とする切り花の育成における基礎的知見としての活用が期待される。

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配偶体型自家不和合性の分子機構・起源・多様性の解析

研究課題/領域番号：20380003 2008年 - 2011年

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

佐々英徳, 牛島幸一郎, 古藤田信博, 古藤田信博

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配分額：18980000円（直接経費：14600000円、間接経費：4380000円）

配偶体型自家不和合性を示すバラ科植物、ナシ・リンゴにおいて、花粉側自家不和合性因子の実態解明を試みた。その結果、ナシ・リンゴは同じバラ科のサクラ属と異なり、SFBBと名付けた類似した複数のF-box遺伝子が協調的に「非自己」の雌ずい側因子S-RNaseを無毒化している可能性が示唆された。また、ナス科のペチュニアにおいては、非S因子であるHT-Bを解析し、その極端な発現抑制を行なっても自家不和合性表現型は部分的にしか影響を受けないことを示した。

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果樹作物における一過的RNAサイレンシング法の確立とその成熟制御因子解析への利用

研究課題/領域番号：20780021 2008年 - 2010年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

中野龍平, 久保康隆, 牛島幸一郎

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配分額：3640000円（直接経費：2800000円、間接経費：840000円）

ブドウにおいて一過的RNAサイレンシング手法が機能する可能性を示した。さらに、トマトを用いて成熟関連遺伝子(AP3,TM6,AGL1,GRAS)の絞込みに成功した。これらの遺伝子に関して,ブドウにおけるサイレンシングを実施したが,その成熟への関与は明確ではなかった.今後、本研究の手法を用いてブドウの成熟や品質に関わる遺伝子の解析も進展が期待され、トマトにおいて選抜した遺伝子の成熟制御の証明により、大きな成果が期待できる。

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果実成熟におけるエチレン合成系遺伝子の転写調節機構の解明

研究課題/領域番号：19688003 2007年 - 2009年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A)

牛島幸一郎

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配分額：25740000円（直接経費：19800000円、間接経費：5940000円）

トマトやメロンはエチレンによって成熟が制御されるクライマクテリック型果実に分類される。メロンの変異品種'ハネデュ'ではエチレンが合成されず、長期の貯蔵が可能である。この'ハネデュ'の解析を足がかりとして、本研究ではエチレン合成酵素遺伝子の転写制御因子の特定とエチレン信号伝達や遺伝子発現制御のメカニズムの解明を試みた。現在のところ2 つのタイプの候補遺伝子を単離している。それらは、予備的な段階の実験であるが、遺伝子発現を操作すると果実成熟を抑制する傾向が見られている。

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プロテオーム解析による果実の細胞壁分解機構の解析と形質転換による鍵因子の決定

研究課題/領域番号：17380024 2005年 - 2007年

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B)

久保康隆, 中野龍平, 江面浩, 牛島幸一郎, 稲葉昭次

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配分額：16950000円（直接経費：15600000円、間接経費：1350000円）

細胞壁は、植物の物理的特性の源であり、果実の肉質と微生物侵入(腐敗)への抵抗性を決定している。したがって、細胞壁分解は果実の食味と日持ち性の支配的因子である。これまでの研究で果実の成熟・軟化にエチレンが重要であることは示されたものの、実際の細胞壁分解における鍵因子は未だに解明されていない。そこで、本研究では、成熟に伴って顕著に果実硬度が低下するセイヨウナシおよびメロン果実と多量のエチレンを生成するにもかかわらず軟化しないチュウゴクナシ果実を用いて、ポリガラクチュロネース、アラビノフラノシデースおよびβ-ガラクトシデースの関与を検討するとともに、プロテオーム解析および酵母シグナルシーケンストラップ法(YSST法)によって網羅的に細胞壁タンパク質および関連遺伝子を解析した。
二次元電気泳動によって、セイヨウナシ果実細胞壁で発現する約500個タンパク質の分離を行った。その結果、約200個のタンパク質分離に成功し、さらに1-MCP処理果実及びチュウゴクナシとの比較において、果実軟化と並行的な挙動を示す3種のタンパク質を見いだした。
セイヨウナシ果実からインベルターゼ欠損酵母を利用したYSST法によって、約700個の細胞壁関連遺伝子断片をクローニングした。得られた全ての遺伝子断片の塩基配列を読み取り、アミノ酸配列を推定し、約70のコンティグと100個のシングルトンを得た。これらの情報を遺伝子データベースに送り、Blast検索を行い、アノテーションを行ったところ、約8割のクローンには何らかのアノテーションが得られたが、残りは対応する遺伝子情報が無く新規性の高いクローンと思われた。
得られたクローンを用いてDNAアレイを作成し、遺伝子発現特性を網羅的に解析した。その結果、セイヨウナシの軟化に伴って顕著に発現が増加または減少したクローンが28個得られた。この中には、11種の新規性の高い細胞壁関連因子が含まれており、これらが果実軟化の重要な鍵因子候補である。

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ノンクライマクテリック型果実の成熟制御因子の同定

研究課題/領域番号：17780025 2005年 - 2006年

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B)

牛島幸一郎

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配分額：3600000円（直接経費：3600000円）

果実はその成熟特性により、クライマクテリック型果実とノンクライマクテリック型果実とに分類される。クライマクテリック型果実はその成熟がエチレンによって制御されているタイプの果実であり、トマトやメロン、バナナなどが分類される。これまでに果実成熟の研究はクライマクテリック型果実を中心に行われており、ノンクライマクテリック型果実についての知見はわずかである。
昨年度の研究において、様々なメロン品種の成熟特性の解析を行ったところ、クライマクテリック型果実とノンクライマクテリック型果実の中間のような特性を示す‘ハネデュ'という品種があることを示した。この品種はほとんどエチレンを生成しないため、ほとんど成熟が進行しない。そこで、エチレン生成以外の成熟形質に関して解析を行った。果肉軟化と香気成分生成について解析を行ったところ、空気条件下で保存した‘ハネデュ'果実は高い果肉硬度を維持し、ほとんど香気成分を生成しなかった。しかし、外生エチレンを処理すると果肉軟化、香気成分生成が促進された。これらの結果は、‘ハネデュ'ではエチレン信号の受容と伝達がなされていることを示している。従って、‘ハネデュ'果実ではエチレン信号伝達系のうち成熟エチレン生成を制御する系に何らかの変異があることが示唆された。
‘ハネデュ'の変異がどの程度の因子に影響を及ぼすのか、また変異遺伝子特定を目的として、メロンの転写因子の発現パターンの解析を行った。データベースには100ほどの転写因子が登録されているので、それぞれにプライマーを設計しリアルタイムPCRをおこなった。その結果27のエチレン応答性遺伝子のうち4割の遺伝子の発現パターンが他のメロン品種とは明らかに異なっていた。その中にはエチレンとの関連が報告されているものや他のホルモンとの関連が示唆されているものもあり、エチレン生成を制御する因子の候補となると考えられた。

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担当授業科目

コース演習１（2025年度）１・２学期 - 水3
コース演習２（2025年度）３・４学期 - 水3
コース演習３（2025年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2025年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2025年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2025年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2025年度）第３学期 - 火5～6
基礎分子生物学２（2025年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2025年度）第４学期 - 火5～6
教養生物学（応用植物科学）（2025年度）第３学期 - 火1～2
特別研究（2025年度）その他 - その他
研究科目演習１（2025年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2025年度）３・４学期 - その他
農産物利用・情報処理学（2025年度）前期 - 金3～4
農産物利用・情報処理学特論（2025年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2025年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2025年度）後期 - その他
農産物生理学特別演習（2025年度）後期 - その他
農産物生理学１（2025年度）第１学期 - 木1,木2
農産物生理学２（2025年度）第２学期 - 木1,木2
コース演習３（2024年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2024年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2024年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2024年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2024年度）第３学期 - 火5～6
基礎分子生物学２（2024年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2024年度）第４学期 - 火5～6
植物機能開発学特論（2024年度）夏季集中 - その他
特別研究（2024年度）その他 - その他
研究科目演習１（2024年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2024年度）３・４学期 - その他
農産物利用・情報処理学（2024年度）前期 - 金3～4
農産物利用・情報処理学特論（2024年度）前期 - その他
農産物利用学演習（2024年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2024年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2024年度）後期 - その他
農産物生理学特別演習（2024年度）後期 - その他
農産物生理学１（2024年度）第１学期 - 木1,木2
農産物生理学２（2024年度）第２学期 - 木1,木2
農産食品工学（2024年度）夏季集中 - その他
コース演習３（2023年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2023年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2023年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2023年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2023年度）第３学期 - 火5～6
基礎分子生物学２（2023年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2023年度）第４学期 - 火5～6
特別研究（2023年度）その他 - その他
生物情報処理学特論（2023年度）前期 - 金3,金4
生物生産科学特別研究（2023年度）通年 - その他
研究科目演習１（2023年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2023年度）３・４学期 - その他
農産物分子生物学（2023年度）前期 - その他
農産物利用・情報処理学（2023年度）前期 - 金3～4
農産物利用・情報処理学特論（2023年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2023年度）前期 - その他
農産物生理学特別演習（2023年度）後期 - その他
農産物生理学１（2023年度）第１学期 - 木1,木2
農産物生理学２（2023年度）第２学期 - 木1,木2
コース演習３（2022年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2022年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2022年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2022年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2022年度）第３学期 - 火5～6
基礎分子生物学２（2022年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2022年度）第４学期 - 火5～6
生物情報処理学特論（2022年度）前期 - 金3,金4
生物生産科学特別研究（2022年度）通年 - その他
研究科目演習１（2022年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2022年度）３・４学期 - その他
農産物分子生物学（2022年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2022年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2022年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2022年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2022年度）前期 - その他
コース演習３（2021年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2021年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2021年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2021年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2021年度）第３学期 - 火5～6
基礎分子生物学２（2021年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2021年度）第４学期 - 火5～6
生物情報処理学特論（2021年度）前期 - 金3,金4
生物生産科学特別研究（2021年度）通年 - その他
研究科目演習１（2021年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2021年度）３・４学期 - その他
農産物分子生物学（2021年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2021年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2021年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2021年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2021年度）前期 - その他
コース演習１（2020年度）１・２学期 - 水3
コース演習３（2020年度）１・２学期 - その他
コース演習４（2020年度）３・４学期 - その他
卒業論文（2020年度）１～４学期 - その他
基礎分子生物学１（2020年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学１（2020年度）第３学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2020年度）第４学期 - 火5,火6
基礎分子生物学２（2020年度）第４学期 - 火5,火6
生物情報処理学特論（2020年度）前期 - 金3,金4
生物生産科学特別研究（2020年度）通年 - その他
研究科目演習１（2020年度）１・２学期 - その他
研究科目演習２（2020年度）３・４学期 - その他
農産物分子生物学（2020年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2020年度）前期 - その他
農産物生理学演習（2020年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2020年度）後期 - その他
農産物生理学演習（2020年度）前期 - その他

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