2025/06/12 更新

写真a

シン ケンジン
沈 建仁
SHEN Jian-Ren
所属
学術研究院先鋭研究領域(異分野基礎) 教授
職名
教授
外部リンク

学位

  • 理学博士 ( 東京大学 )

研究キーワード

  • 結晶構造解析

  • 光化学系II

  • 構造生物学

  • 膜蛋白質

  • 光合成

  • Crystal structure analysis

  • Photosystem II

  • Membrane proteins

  • Photosynthesis

研究分野

  • ライフサイエンス / 生物物理学

  • ライフサイエンス / 植物分子、生理科学

  • ライフサイエンス / 構造生物化学

学歴

  • 東京大学   Graduate School, Division of Natural Science   Department of Pure and Applied Sciences

    - 1990年

      詳細を見る

  • 東京大学    

    - 1990年

      詳細を見る

    国名: 日本国

    researchmap

  • 中国浙江農業大学   農学部   環境保護専攻

    - 1982年

      詳細を見る

    国名: 中華人民共和国

    researchmap

  • Zhejiang Agriculture University, China   Faculty of Agriculture   Department of Environmental Science,

    - 1982年

      詳細を見る

経歴

  • 岡山大学   異分野基礎科学研究所   所長

    2022年4月 - 現在

      詳細を見る

  • 岡山大学   The Research Institute for Interdisciplinary Science

    2016年 - 現在

      詳細を見る

  • 岡山大学自然科学研究科光合成研究センター センター長

    2013年 - 2016年

      詳細を見る

  • - PRESTO Advisor,Japan Science and Technology Agency

    2011年

      詳細を見る

  • - 科学技術振興機構 さきがけ研究 領域アドバイザー

    2011年

      詳細を見る

  • - 理科学研究所放射光総合科学研究センター 客員研究員

    2011年

      詳細を見る

  • - Adjunct Researcher,RIKEN

    2011年

      詳細を見る

  • - 兵庫県立大学 客員教授 教授

    2007年

      詳細を見る

  • - Professor,Hyogo University

    2007年

      詳細を見る

  • 岡山大学自然科学研究科 教授

    2004年 - 2016年

      詳細を見る

  • Researcher,2003: Visiting researcher, RIKEN

    2003年 - 2008年

      詳細を見る

  • 2003: 理化学研究所客員研究員 研究員

    2003年 - 2008年

      詳細を見る

  • 岡山大学   Faculty of Science, Department of Biology

    2003年 - 2004年

      詳細を見る

  • Researcher, PRESTO,Japan Science and Technology Agency

    2002年 - 2006年

      詳細を見る

  • 科学技術振興機構 さきがけ研究員

    2002年 - 2006年

      詳細を見る

  • 1999年:理化学研究所先任研究員 研究員

    1997年 - 2003年

      詳細を見る

  • 1993年:理化学研究所研究員 研究員

    1993年 - 1997年

      詳細を見る

  • 1990年:理化学研究所基礎科学特別研究員 研究員

    1990年 - 1993年

      詳細を見る

▼全件表示

所属学協会

▼全件表示

委員歴

  • Photosynthesis Research   Editorial Board Member  

    2021年5月 - 現在   

      詳細を見る

  • 日本光合成学会   常任幹事  

    2020年1月 - 現在   

      詳細を見る

  • 日本量子生命科学会   運営委員会  

    2019年7月 - 現在   

      詳細を見る

    団体区分:学協会

    researchmap

  • カーボン・エネルギーコントロール社会協議会   共同代表  

    2017年7月 - 現在   

      詳細を見る

  • International Society of Photosynthesis Research   Geographical Area Representative  

    2016年1月 - 現在   

      詳細を見る

  • 光合成学会   常任幹事  

    2008年 - 2011年   

      詳細を見る

    団体区分:学協会

    光合成学会

    researchmap

▼全件表示

 

論文

  • Aggregation-Induced Excitation-Energy Quenching in Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Proteins from the Diatom Phaeodactylum tricornutum 査読

    Yoshifumi Ueno, Ou-Yang Li, Jian-Ren Shen, Tatsuya Tomo, Seiji Akimoto, Ryo Nagao

    The Journal of Physical Chemistry B   2025年3月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:American Chemical Society (ACS)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.4c06894

    researchmap

  • Structural study of the chlorophyll between Lhca8 and PsaJ in an Antarctica green algal photosystem I-LHCI supercomplex revealed by its atomic structure 査読

    Pi-Cheng Tsai, Koji Kato, Jian-Ren Shen, Fusamichi Akita

    Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics   149543 - 149543   2025年2月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier BV  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2025.149543

    researchmap

  • Biochemical evidence for the diversity of LHCI proteins in PSI-LHCI from the red alga Galdieria sulphuraria NIES-3638. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Haruya Ogawa, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis research   163 ( 1 )   14 - 14   2025年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Red algae are photosynthetic eukaryotes whose light-harvesting complexes (LHCs) associate with photosystem I (PSI). In this study, we examined characteristics of PSI-LHCI, PSI, and LHCI isolated from the red alga Galdieria sulphuraria NIES-3638. The PSI-LHCI supercomplexes were purified using anion-exchange chromatography followed by hydrophobic-interaction chromatography, and finally by trehalose density gradient centrifugation. PSI and LHCI were similarly prepared following the dissociation of PSI-LHCI with Anzergent 3-16. Polypeptide analysis of PSI-LHCI revealed the presence of PSI and LHC proteins, along with red-lineage chlorophyll a/b-binding-like protein (RedCAP), which is distinct from LHC proteins within the LHC protein superfamily. RedCAP, rather than LHC proteins, exhibited tight binding to PSI. Carotenoid analysis of LHCI identified zeaxanthin, β-cryptoxanthin, and β-carotene, with zeaxanthin particularly enriched, which is consistent with other red algal LHCIs. A Qy peak of chlorophyll a in the LHCI absorption spectrum was blue-shifted compared with those of PSI-LHCI and PSI, and a fluorescence emission peak was similarly shifted to shorter wavelengths. Based on these results, we discuss the diversity of LHC proteins and RedCAP in red algal PSI-LHCI supercomplexes.

    DOI: 10.1007/s11120-024-01134-1

    PubMed

    researchmap

  • Conformational Flexibility of D1-Glu189: A Crucial Determinant in Substrate Water Selection, Positioning, and Stabilization within the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II 査読

    Hiroshi Isobe, Takayoshi Suzuki, Michihiro Suga, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    ACS OMEGA   9 ( 50 )   50041 - 50048   2024年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acsomega.4c09981

    Web of Science

    researchmap

  • Structural basis for molecular assembly of fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins in a diatom photosystem I supercomplex 査読

    Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Jian Xing, Minoru Kumazawa, Haruya Ogawa, Jian-Ren Shen, Kentaro Ifuku, Ryo Nagao

    eLife   13   2024年10月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:eLife Sciences Publications, Ltd  

    Photosynthetic organisms exhibit remarkable diversity in their light-harvesting complexes (LHCs). LHCs are associated with photosystem I (PSI), forming a PSI-LHCI supercomplex. The number of LHCI subunits, along with their protein sequences and pigment compositions, has been found to differ greatly among the PSI-LHCI structures. However, the mechanisms by which LHCIs recognize their specific binding sites within the PSI core remain unclear. In this study, we determined the cryo-electron microscopy structure of a PSI supercomplex incorporating fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins (FCPs), designated as PSI-FCPI, isolated from the diatom Thalassiosira pseudonana CCMP1335. Structural analysis of PSI-FCPI revealed five FCPI subunits associated with a PSI monomer; these subunits were identified as RedCAP, Lhcr3, Lhcq10, Lhcf10, and Lhcq8. Through structural and sequence analyses, we identified specific protein–protein interactions at the interfaces between FCPI and PSI subunits, as well as among FCPI subunits themselves. Comparative structural analyses of PSI-FCPI supercomplexes, combined with phylogenetic analysis of FCPs from T. pseudonana and the diatom Chaetoceros gracilis, underscore the evolutionary conservation of protein motifs crucial for the selective binding of individual FCPI subunits. These findings provide significant insights into the molecular mechanisms underlying the assembly and selective binding of FCPIs in diatoms.

    DOI: 10.7554/elife.99858.3

    researchmap

    その他リンク: https://cdn.elifesciences.org/articles/99858/elife-99858-v1.xml

  • Presence of low-energy chlorophylls d in photosystem I trimer and monomer cores isolated from Acaryochloris sp. NBRC 102871. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Haruki Yamamoto, Haruya Ogawa, Hibiki Ito, Yuma Yamamoto, Takehiro Suzuki, Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis research   161 ( 3 )   203 - 212   2024年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Acaryochloris species belong to a special category of cyanobacteria possessing chlorophyll (Chl) d. One of the photosynthetic characteristics of Acaryochloris marina MBIC11017 is that the absorption spectra of photosystem I (PSI) showed almost no bands and shoulders of low-energy Chls d over 740 nm. In contrast, the absorption spectra of other Acaryochloris species showed a shoulder around 740 nm, suggesting that low-energy Chls d within PSI are diversified among Acaryochloris species. In this study, we purified PSI trimer and monomer cores from Acaryochloris sp. NBRC 102871 and examined their protein and pigment compositions and spectral properties. The protein bands and pigment compositions of the PSI trimer and monomer of NBRC102871 were virtually identical to those of MBIC11017. The absorption spectra of the NBRC102871 PSIs exhibited a shoulder around 740 nm, whereas the fluorescence spectra of PSI trimer and monomer displayed maximum peaks at 754 and 767 nm, respectively. These spectral properties were different from those of MBIC11017, indicating the presence of low-energy Chls d within the NBRC102871 PSIs. Moreover, we analyzed the NBRC102871 genome to identify amino acid sequences of PSI proteins and compared them with those of the A. marina MBIC11017 and MBIC10699 strains whose genomes are available. The results showed that some of the sequences in NBRC102871 were distinct from those in MBIC11017 and MBIC10699. These findings provide insights into the variety of low-energy Chls d with respect to the protein environments of PSI cores among the three Acaryochloris strains.

    DOI: 10.1007/s11120-024-01108-3

    PubMed

    researchmap

  • Structural and spectroscopic insights into fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins of diatoms in diverse oligomeric states. 査読 国際誌

    Cuicui Zhou, Yue Feng, Zhenhua Li, Lili Shen, Xiaoyi Li, Yumei Wang, Guangye Han, Tingyun Kuang, Cheng Liu, Jian-Ren Shen, Wenda Wang

    Plant communications   101041 - 101041   2024年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Diatoms, a group of prevalent marine algae, contribute significantly to global primary productivity. Their substantial biomass is linked to enhanced absorption of blue-green light underwater, facilitated by fucoxanthin chlorophyll (Chl) a/c-binding proteins (FCPs), which exhibit oligomeric diversity across diatom species. Using mild clear native PAGE analysis of solubilized thylakoid membranes, we displayed monomeric, dimeric, trimeric, tetrameric, and pentameric FCPs in diatoms. Mass spectrometry analysis revealed that each oligomeric FCP has a specific protein composition, and together they constitute a large Lhcf family of FCP antennas. In addition, we resolved the structures of the Thalassiosira pseudonana FCP (Tp-FCP) homotrimer and the Chaetoceros gracilis FCP (Cg-FCP) pentamer by cryoelectron microscopy at 2.73-Å and 2.65-Å resolution, respectively. The distinct pigment compositions and organizations of various oligomeric FCPs affect their blue-green light-harvesting, excitation energy transfer pathways. Compared with dimeric and trimeric FCPs, the Cg-FCP tetramer and Cg-FCP pentamer exhibit stronger absorption by Chl c, redshifted and broader Chl a fluorescence emission, and more robust circular dichroism signals originating from Chl a-carotenoid dimers. These spectroscopic characteristics indicate that Chl a molecules in the Cg-FCP tetramer and Cg-FCP pentamer are more heterogeneous than in both dimers and the Tp-FCP trimer. The structural and spectroscopic insights provided by this study contribute to a better understanding of the mechanisms that empower diatoms to adapt to fluctuating light environments.

    DOI: 10.1016/j.xplc.2024.101041

    PubMed

    researchmap

  • Strong interaction of CpcL with photosystem I cores induced in heterocysts of Anabaena sp. PCC 7120 査読

    Takehiro Suzuki, Haruya Ogawa, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Shigeki Ehira, Ryo Nagao

    microPublication Biology   2024年5月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.17912/micropub.biology.001183

    researchmap

  • Structure of a unique PSII-Pcb tetrameric megacomplex in a chlorophyll d-containing cyanobacterium. 査読 国際誌

    Liangliang Shen, Yuanzhu Gao, Kailu Tang, Ruxi Qi, Lutang Fu, Jing-Hua Chen, Wenda Wang, Xiaomin Ma, Peiyao Li, Min Chen, Tingyun Kuang, Xing Zhang, Jian-Ren Shen, Peiyi Wang, Guangye Han

    Science advances   10 ( 8 )   eadk7140   2024年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Acaryochloris marina is a unique cyanobacterium using chlorophyll d (Chl d) as its major pigment and thus can use far-red light for photosynthesis. Photosystem II (PSII) of A. marina associates with a number of prochlorophyte Chl-binding (Pcb) proteins to act as the light-harvesting system. We report here the cryo-electron microscopic structure of a PSII-Pcb megacomplex from A. marina at a 3.6-angstrom overall resolution and a 3.3-angstrom local resolution. The megacomplex is organized as a tetramer consisting of two PSII core dimers flanked by sixteen symmetrically related Pcb proteins, with a total molecular weight of 1.9 megadaltons. The structure reveals the detailed organization of PSII core consisting of 15 known protein subunits and an unknown subunit, the assembly of 4 Pcb antennas within each PSII monomer, and possible pathways of energy transfer within the megacomplex, providing deep insights into energy transfer and dissipation mechanisms within the PSII-Pcb megacomplex involved in far-red light utilization.

    DOI: 10.1126/sciadv.adk7140

    PubMed

    researchmap

  • Structures and organizations of PSI-AcpPCI supercomplexes from red tidal and coral symbiotic photosynthetic dinoflagellates. 査読 国際誌

    Xiaoyi Li, Zhenhua Li, Fangfang Wang, Songhao Zhao, Caizhe Xu, Zhiyuan Mao, Jialin Duan, Yue Feng, Yang Yang, Lili Shen, Guanglei Wang, Yanyan Yang, Long-Jiang Yu, Min Sang, Guangye Han, Xuchu Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Wenda Wang

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   121 ( 7 )   e2315476121   2024年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Marine photosynthetic dinoflagellates are a group of successful phytoplankton that can form red tides in the ocean and also symbiosis with corals. These features are closely related to the photosynthetic properties of dinoflagellates. We report here three structures of photosystem I (PSI)-chlorophylls (Chls) a/c-peridinin protein complex (PSI-AcpPCI) from two species of dinoflagellates by single-particle cryoelectron microscopy. The crucial PsaA/B subunits of a red tidal dinoflagellate Amphidinium carterae are remarkably smaller and hence losing over 20 pigment-binding sites, whereas its PsaD/F/I/J/L/M/R subunits are larger and coordinate some additional pigment sites compared to other eukaryotic photosynthetic organisms, which may compensate for the smaller PsaA/B subunits. Similar modifications are observed in a coral symbiotic dinoflagellate Symbiodinium species, where two additional core proteins and fewer AcpPCIs are identified in the PSI-AcpPCI supercomplex. The antenna proteins AcpPCIs in dinoflagellates developed some loops and pigment sites as a result to accommodate the changed PSI core, therefore the structures of PSI-AcpPCI supercomplex of dinoflagellates reveal an unusual protein assembly pattern. A huge pigment network comprising Chls a and c and various carotenoids is revealed from the structural analysis, which provides the basis for our deeper understanding of the energy transfer and dissipation within the PSI-AcpPCI supercomplex, as well as the evolution of photosynthetic organisms.

    DOI: 10.1073/pnas.2315476121

    PubMed

    researchmap

  • Oxygen-evolving photosystem II structures during S1-S2-S3 transitions. 査読 国際誌

    Hongjie Li, Yoshiki Nakajima, Eriko Nango, Shigeki Owada, Daichi Yamada, Kana Hashimoto, Fangjia Luo, Rie Tanaka, Fusamichi Akita, Koji Kato, Jungmin Kang, Yasunori Saitoh, Shunpei Kishi, Huaxin Yu, Naoki Matsubara, Hajime Fujii, Michihiro Sugahara, Mamoru Suzuki, Tetsuya Masuda, Tetsunari Kimura, Tran Nguyen Thao, Shinichiro Yonekura, Long-Jiang Yu, Takehiko Tosha, Kensuke Tono, Yasumasa Joti, Takaki Hatsui, Makina Yabashi, Minoru Kubo, So Iwata, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Michihiro Suga, Jian-Ren Shen

    Nature   2024年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) catalyses the oxidation of water through a four-step cycle of Si states (i = 0-4) at the Mn4CaO5 cluster1-3, during which an extra oxygen (O6) is incorporated at the S3 state to form a possible dioxygen4-7. Structural changes of the metal cluster and its environment during the S-state transitions have been studied on the microsecond timescale. Here we use pump-probe serial femtosecond crystallography to reveal the structural dynamics of PSII from nanoseconds to milliseconds after illumination with one flash (1F) or two flashes (2F). YZ, a tyrosine residue that connects the reaction centre P680 and the Mn4CaO5 cluster, showed structural changes on a nanosecond timescale, as did its surrounding amino acid residues and water molecules, reflecting the fast transfer of electrons and protons after flash illumination. Notably, one water molecule emerged in the vicinity of Glu189 of the D1 subunit of PSII (D1-E189), and was bound to the Ca2+ ion on a sub-microsecond timescale after 2F illumination. This water molecule disappeared later with the concomitant increase of O6, suggesting that it is the origin of O6. We also observed concerted movements of water molecules in the O1, O4 and Cl-1 channels and their surrounding amino acid residues to complete the sequence of electron transfer, proton release and substrate water delivery. These results provide crucial insights into the structural dynamics of PSII during S-state transitions as well as O-O bond formation.

    DOI: 10.1038/s41586-023-06987-5

    PubMed

    researchmap

  • Quantifying the Energy Spillover between Photosystems II and I in Cyanobacterial Thylakoid Membranes and Cells. 査読

    Parveen Akhtar, Fanny Balog-Vig, Wenhui Han, Xingyue Li, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Petar H Lambrev

    Plant & cell physiology   65 ( 1 )   95 - 106   2024年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The spatial separation of photosystems I and II (PSI and PSII) is thought to be essential for efficient photosynthesis by maintaining a balanced flow of excitation energy between them. Unlike the thylakoid membranes of plant chloroplasts, cyanobacterial thylakoids do not form tightly appressed grana stacks that enforce strict lateral separation. The coexistence of the two photosystems provides a ground for spillover-excitation energy transfer from PSII to PSI. Spillover has been considered as a pathway of energy transfer from the phycobilisomes to PSI and may also play a role in state transitions as means to avoid overexcitation of PSII. Here, we demonstrate a significant degree of energy spillover from PSII to PSI in reconstituted membranes and isolated thylakoid membranes of Thermosynechococcus (Thermostichus) vulcanus and Synechocystis sp. PCC 6803 by steady-state and time-resolved fluorescence spectroscopy. The quantum yield of spillover in these systems was determined to be up to 40%. Spillover was also found in intact cells but to a considerably lower degree (20%) than in isolated thylakoid membranes. The findings support a model of coexistence of laterally separated microdomains of PSI and PSII in the cyanobacterial cells as well as domains where the two photosystems are energetically connected. The methodology presented here can be applied to probe spillover in other photosynthetic organisms.

    DOI: 10.1093/pcp/pcad127

    PubMed

    researchmap

  • Structural insights into photosystem II supercomplex and trimeric FCP antennae of a centric diatom Cyclotella meneghiniana. 査読 国際誌

    Songhao Zhao, Lili Shen, Xiaoyi Li, Qiushuang Tao, Zhenhua Li, Caizhe Xu, Cuicui Zhou, Yanyan Yang, Min Sang, Guangye Han, Long-Jiang Yu, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Wenda Wang

    Nature communications   14 ( 1 )   8164 - 8164   2023年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Diatoms are dominant marine algae and contribute around a quarter of global primary productivity, the success of which is largely attributed to their photosynthetic capacity aided by specific fucoxanthin chlorophyll-binding proteins (FCPs) to enhance the blue-green light absorption under water. We purified a photosystem II (PSII)-FCPII supercomplex and a trimeric FCP from Cyclotella meneghiniana (Cm) and solved their structures by cryo-electron microscopy (cryo-EM). The structures reveal detailed organizations of monomeric, dimeric and trimeric FCP antennae, as well as distinct assemblies of Lhcx6_1 and dimeric FCPII-H in PSII core. Each Cm-PSII-FCPII monomer contains an Lhcx6_1, an FCP heterodimer and other three FCP monomers, which form an efficient pigment network for harvesting energy. More diadinoxanthins and diatoxanthins are found in FCPs, which may function to quench excess energy. The trimeric FCP contains more chlorophylls c and fucoxanthins. These diversified FCPs and PSII-FCPII provide a structural basis for efficient light energy harvesting, transfer, and dissipation in C. meneghiniana.

    DOI: 10.1038/s41467-023-44055-8

    PubMed

    researchmap

  • Structure of PSI-LHCI fromCyanidium caldariumprovides evolutionary insights into conservation and diversity of red-lineage LHCs

    Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Minoru Kumazawa, Yoshiki Nakajima, Kentaro Ifuku, Shunsuke Hirooka, Yuu Hirose, Shin-ya Miyagishima, Takehiro Suzuki, Keisuke Kawakami, Naoshi Dohmae, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao

    2023年10月

     詳細を見る

    出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Light-harvesting complexes (LHCs) are diversified among photosynthetic organisms, and their structural variety in photosystem I-LHC (PSI-LHCI) supercomplexes has been shown. However, structural and evolutionary correlations of red-lineage LHCs are unknown. Here we determined a 1.92-Å resolution cryo-electron microscopic structure of a PSI-LHCI supercomplex isolated from the red algaCyanidium caldariumRK-1 (NIES-2137) which is an important taxon in the Cyanidiophyceae, and subsequently investigated these correlations through structural comparisons and phylogenetic analysis. The PSI-LHCI structure shows five LHCI subunits together with a PSI-monomer core. The five LHCIs are composed of two Lhcr1s, two Lhcr2s, and one Lhcr3. Phylogenetic analysis of LHCs bound to PSI in red-lineage algae showed clear orthology of LHCs betweenC. caldariumandCyanidioschyzon merolae, whereas no orthologous relationships were found betweenC. caldariumLhcr1–3 and LHCs in other red-lineage PSI-LHCI structures. These findings provide evolutionary insights into conservation and diversity of red-lineage LHCs associated with PSI.

    DOI: 10.1101/2023.10.25.563911

    researchmap

  • Structure of a diatom photosystem II supercomplex containing a member of Lhcx family and dimeric FCPII. 査読 国際誌

    Yue Feng, Zhenhua Li, Xiaoyi Li, Lili Shen, Xueyang Liu, Cuicui Zhou, Jinyang Zhang, Min Sang, Guangye Han, Wenqiang Yang, Tingyun Kuang, Wenda Wang, Jian-Ren Shen

    Science advances   9 ( 43 )   eadi8446   2023年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Diatoms rely on fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins (FCPs) for their great success in oceans, which have a great diversity in their pigment, protein compositions, and subunit organizations. We report a unique structure of photosystem II (PSII)-FCPII supercomplex from Thalassiosira pseudonana at 2.68-Å resolution by cryo-electron microscopy. FCPIIs within this PSII-FCPII supercomplex exist in dimers and monomers, and a homodimer and a heterodimer were found to bind to a PSII core. The FCPII homodimer is formed by Lhcf7 and associates with PSII through an Lhcx family antenna Lhcx6_1, whereas the heterodimer is formed by Lhcf6 and Lhcf11 and connects to the core together with an Lhcf5 monomer through Lhca2 monomer. An extended pigment network consisting of diatoxanthins, diadinoxanthins, fucoxanthins, and chlorophylls a/c is revealed, which functions in efficient light harvesting, energy transfer, and dissipation. These results provide a structural basis for revealing the energy transfer and dissipation mechanisms and also for the structural diversity of FCP antennas in diatoms.

    DOI: 10.1126/sciadv.adi8446

    PubMed

    researchmap

  • Structural and functional properties of different types of siphonous LHCII trimers from an intertidal green alga Bryopsis corticulans. 査読 国際誌

    Zhenhua Li, Cuicui Zhou, Songhao Zhao, Jinyang Zhang, Xueyang Liu, Min Sang, Xiaochun Qin, Yanyan Yang, Guangye Han, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Wenda Wang

    Structure (London, England : 1993)   31 ( 10 )   1247 - 1258   2023年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Light-harvesting complexes of photosystem II (LHCIIs) in green algae and plants are vital antenna apparatus for light harvesting, energy transfer, and photoprotection. Here we determined the structure of a siphonous-type LHCII trimer from the intertidal green alga Bryopsis corticulans by X-ray crystallography and cryo-electron microscopy (cryo-EM), and analyzed its functional properties by spectral analysis. The Bryopsis LHCII (Bry-LHCII) structures in both homotrimeric and heterotrimeric form show that green light-absorbing siphonaxanthin and siphonein occupied the sites of lutein and violaxanthin in plant LHCII, and two extra chlorophylls (Chls) b replaced Chls a. Binding of these pigments expands the blue-green light absorption of B. corticulans in the tidal zone. We observed differences between the Bry-LHCII homotrimer crystal and cryo-EM structures, and also between Bry-LHCII homotrimer and heterotrimer cryo-EM structures. These conformational changes may reflect the flexibility of Bry-LHCII, which may be required to adapt to light fluctuations from tidal rhythms.

    DOI: 10.1016/j.str.2023.08.001

    PubMed

    researchmap

  • Tight association of CpcL with photosystem I in Anabaena sp. PCC 7120 grown under iron-deficient conditions. 査読 国際誌

    Shota Shimizu, Haruya Ogawa, Naoki Tsuboshita, Takehiro Suzuki, Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao

    Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics   148993 - 148993   2023年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Phycobilisomes (PBSs), which are huge pigment-protein complexes displaying distinctive color variations, bind to photosystem cores for excitation-energy transfer. It is known that the isolation of supercomplexes consisting of PBSs and photosystem I (PSI) or PBSs and photosystem II (PSII) is challenging due to weak interactions between PBSs and the photosystem cores. In this study, we succeeded in purifying PSI-monomer-PBS and PSI-dimer-PBS supercomplexes from the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120 grown under iron-deficient conditions by anion-exchange chromatography, followed by trehalose density gradient centrifugation. The absorption spectra of the two types of supercomplexes showed apparent bands originating from PBSs, and their fluorescence-emission spectra exhibited characteristic peaks of PBSs. Two-dimensional blue-native (BN)/SDS-PAGE of the two samples showed a band of CpcL, which is a linker protein of PBS, in addition to PsaA/B subunits. Since interactions of PBSs with PSI are easily dissociated during BN-PAGE using thylakoids from this cyanobacterium grown under iron-replete conditions, it is suggested that iron deficiency for Anabaena induces tight associations of CpcL with PSI, resulting in the formation of PSI-monomer-PBS and PSI-dimer-PBS supercomplexes. Based on these findings, we discuss interactions of PBSs with PSI in Anabaena in response to growth conditions.

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2023.148993

    PubMed

    researchmap

  • Structural insights into the action mechanisms of artificial electron acceptors in photosystem II. 査読 国際誌

    Shinji Kamada, Yoshiki Nakajima, Jian-Ren Shen

    The Journal of biological chemistry   299 ( 7 )   104839 - 104839   2023年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) utilizes light energy to split water, and the electrons extracted from water are transferred to QB, a plastoquinone molecule bound to the D1 subunit of PSII. Many artificial electron acceptors (AEAs) with molecular structures similar to that of plastoquinone can accept electrons from PSII. However, the molecular mechanism by which AEAs act on PSII is unclear. Here, we solved the crystal structure of PSII treated with three different AEAs, 2,5-dibromo-1,4-benzoquinone, 2,6-dichloro-1,4-benzoquinone, and 2-phenyl-1,4-benzoquinone, at 1.95 to 2.10 Å resolution. Our results show that all AEAs substitute for QB and are bound to the QB-binding site (QB site) to receive electrons, but their binding strengths are different, resulting in differences in their efficiencies to accept electrons. The acceptor 2-phenyl-1,4-benzoquinone binds most weakly to the QB site and showed the highest oxygen-evolving activity, implying a reverse relationship between the binding strength and oxygen-evolving activity. In addition, a novel quinone-binding site, designated the QD site, was discovered, which is located in the vicinity of QB site and close to QC site, a binding site reported previously. This QD site is expected to play a role as a channel or a storage site for quinones to be transported to the QB site. These results provide the structural basis for elucidating the actions of AEAs and exchange mechanism of QB in PSII and also provide information for the design of more efficient electron acceptors.

    DOI: 10.1016/j.jbc.2023.104839

    PubMed

    researchmap

  • Isolation and characterization of trimeric and monomeric PSI cores from Acaryochloris marina MBIC11017 査読

    Ryo Nagao, Haruya Ogawa, Naoki Tsuboshita, Koji Kato, Reona Toyofuku, Tatsuya Tomo, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis Research   2023年5月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1007/s11120-023-01025-x

    researchmap

    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s11120-023-01025-x/fulltext.html

  • Structural insights into a unique PSI-LHCI-LHCII-Lhcb9 supercomplex from moss Physcomitrium patens. 査読 国際誌

    Song Zhang, Kailu Tang, Qiujing Yan, Xingyue Li, Liangliang Shen, Wenda Wang, Yi-Kun He, Tingyun Kuang, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Xing Zhang

    Nature plants   9 ( 5 )   832 - 846   2023年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem I (PSI) possesses a variable supramolecular organization among different photosynthetic organisms to adapt to different light environments. Mosses are evolutionary intermediates that diverged from aquatic green algae and evolved into land plants. The moss Physcomitrium patens (P. patens) has a light-harvesting complex (LHC) superfamily more diverse than those of green algae and higher plants. Here, we solved the structure of a PSI-LHCI-LHCII-Lhcb9 supercomplex from P. patens at 2.68 Å resolution using cryo-electron microscopy. This supercomplex contains one PSI-LHCI, one phosphorylated LHCII trimer, one moss-specific LHC protein, Lhcb9, and one additional LHCI belt with four Lhca subunits. The complete structure of PsaO was observed in the PSI core. One Lhcbm2 in the LHCII trimer interacts with PSI core through its phosphorylated N terminus, and Lhcb9 mediates assembly of the whole supercomplex. The complicated pigment arrangement provided important information for possible energy-transfer pathways from the peripheral antennae to the PSI core.

    DOI: 10.1038/s41477-023-01401-4

    PubMed

    researchmap

  • Development of serial X-ray fluorescence holography for radiation-sensitive protein crystals. 査読 国際誌

    Artoni Kevin R Ang, Yasufumi Umena, Ayana Sato-Tomita, Naoya Shibayama, Naohisa Happo, Riho Marumi, Yuta Yamamoto, Koji Kimura, Naomi Kawamura, Yu Takano, Tomohiro Matsushita, Yuji C Sasaki, Jian Ren Shen, Kouichi Hayashi

    Journal of synchrotron radiation   30 ( Pt 2 )   368 - 378   2023年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    X-ray fluorescence holography (XFH) is a powerful atomic resolution technique capable of directly imaging the local atomic structure around atoms of a target element within a material. Although it is theoretically possible to use XFH to study the local structures of metal clusters in large protein crystals, the experiment has proven difficult to perform, especially on radiation-sensitive proteins. Here, the development of serial X-ray fluorescence holography to allow the direct recording of hologram patterns before the onset of radiation damage is reported. By combining a 2D hybrid detector and the serial data collection used in serial protein crystallography, the X-ray fluorescence hologram can be directly recorded in a fraction of the measurement time needed for conventional XFH measurements. This approach was demonstrated by obtaining the Mn Kα hologram pattern from the protein crystal Photosystem II without any X-ray-induced reduction of the Mn clusters. Furthermore, a method to interpret the fluorescence patterns as real-space projections of the atoms surrounding the Mn emitters has been developed, where the surrounding atoms produce large dark dips along the emitter-scatterer bond directions. This new technique paves the way for future experiments on protein crystals that aim to clarify the local atomic structures of their functional metal clusters, and for other related XFH experiments such as valence-selective XFH or time-resolved XFH.

    DOI: 10.1107/S1600577522011833

    PubMed

    researchmap

  • Structure of a monomeric photosystem I core associated with iron-stress-induced-A proteins from Anabaena sp. PCC 7120. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Yoshifumi Ueno, Naoki Tsuboshita, Shota Shimizu, Miyu Furutani, Shigeki Ehira, Yoshiki Nakajima, Keisuke Kawakami, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    Nature communications   14 ( 1 )   920 - 920   2023年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Iron-stress-induced-A proteins (IsiAs) are expressed in cyanobacteria under iron-deficient conditions. The cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120 has four isiA genes; however, their binding property and functional roles in PSI are still missing. We analyzed a cryo-electron microscopy structure of a PSI-IsiA supercomplex isolated from Anabaena grown under an iron-deficient condition. The PSI-IsiA structure contains six IsiA subunits associated with the PsaA side of a PSI core monomer. Three of the six IsiA subunits were identified as IsiA1 and IsiA2. The PSI-IsiA structure lacks a PsaL subunit; instead, a C-terminal domain of IsiA2 occupies the position of PsaL, which inhibits the oligomerization of PSI, leading to the formation of a PSI monomer. Furthermore, excitation-energy transfer from IsiAs to PSI appeared with a time constant of 55 ps. These findings provide insights into both the molecular assembly of the Anabaena IsiA family and the functional roles of IsiAs.

    DOI: 10.1038/s41467-023-36504-1

    PubMed

    researchmap

  • Biochemical and spectroscopic characterization of PSI-LHCI from the red alga Cyanidium caldarium. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Miyu Furutani, Koji Kato, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    Photosynthesis research   2023年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Light-harvesting complexes (LHCs) have been diversified in oxygenic photosynthetic organisms, and play an essential role in capturing light energy which is transferred to two types of photosystem cores to promote charge-separation reactions. Red algae are one of the groups of photosynthetic eukaryotes, and their chlorophyll (Chl) a-binding LHCs are specifically associated with photosystem I (PSI). In this study, we purified three types of preparations, PSI-LHCI supercomplexes, PSI cores, and isolated LHCIs, from the red alga Cyanidium caldarium, and examined their properties. The polypeptide bands of PSI-LHCI showed characteristic PSI and LHCI components without contamination by other proteins. The carotenoid composition of LHCI displayed zeaxanthins, β-cryptoxanthins, and β-carotenes. Among the carotenoids, zeaxanthins were enriched in LHCI. On the contrary, both zeaxanthins and β-cryptoxanthins could not be detected from PSI, suggesting that zeaxanthins and β-cryptoxanthins are bound to LHCI but not PSI. A Qy peak of Chl a in the absorption spectrum of LHCI was shifted to a shorter wavelength than those in PSI and PSI-LHCI. This tendency is in line with the result of fluorescence-emission spectra, in which the emission maxima of PSI-LHCI, PSI, and LHCI appeared at 727, 719, and 677 nm, respectively. Time-resolved fluorescence spectra of LHCI represented no 719 and 727-nm fluorescence bands from picoseconds to nanoseconds. These results indicate that energy levels of Chls around/within LHCIs and within PSI are changed by binding LHCIs to PSI. Based on these findings, we discuss the expression, function, and structure of red algal PSI-LHCI supercomplexes.

    DOI: 10.1007/s11120-023-00999-y

    PubMed

    researchmap

  • Photoinduced chlorophyll charge transfer state identified in the light-harvesting complex II from a marine green alga Bryopsis corticulans. 査読 国際誌

    Dan-Hong Li, Wenda Wang, Cuicui Zhou, Yan Zhang, Songhao Zhao, Yi-Ming Zhou, Rong-Yao Gao, Hai-Dan Yao, Li-Min Fu, Peng Wang, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang, Jian-Ping Zhang

    iScience   26 ( 1 )   105761 - 105761   2023年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The light-harvesting complex II of Bryopsis corticulans (B-LHCII), a green alga, differs from that of spinach (S-LHCII) in chlorophyll (Chl) and carotenoid (Car) compositions. We investigated ultrafast excitation dynamics of B-LHCII with visible-to-near infrared time-resolved absorption spectroscopy. Absolute fluorescence quantum yield (Φ FL) of LHCII and spectroelectrochemical (SEC) spectra of Chl a and b were measured to assist the spectral analysis. Red-light excitation at Chl Qy-band, but not Car-band, induced transient features resembling the characteristic SEC spectra of Chl a ⋅+ and Chl b ⋅-, indicating ultrafast photogeneration of Chl-Chl charge transfer (CT) species; Φ FL and 3Car∗ declined whereas CT species increased upon prolonging excitation wavelength, showing positive correlation of 1Chl∗ deactivation with Chl-Chl CT formation. Moreover, ultrafast Chl b-to-Chl a and Car-to-Chl singlet excitation transfer were illustrated. The red-light induction of Chl-Chl CT species, as also observed for S-LHCII, is considered a general occurrence for LHCIIs in light-harvesting form.

    DOI: 10.1016/j.isci.2022.105761

    PubMed

    researchmap

  • Cryo-electron microscopy structure of the intact photosynthetic light-harvesting antenna-reaction center complex from a green sulfur bacterium. 査読 国際誌

    Jing-Hua Chen, Weiwei Wang, Chen Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Xing Zhang

    Journal of integrative plant biology   65 ( 1 )   223 - 234   2023年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The photosynthetic reaction center complex (RCC) of green sulfur bacteria (GSB) consists of the membrane-imbedded RC core and the peripheric energy transmitting proteins called Fenna-Matthews-Olson (FMO). Functionally, FMO transfers the absorbed energy from a huge peripheral light-harvesting antenna named chlorosome to the RC core where charge separation occurs. In vivo, one RC was found to bind two FMOs, however, the intact structure of RCC as well as the energy transfer mechanism within RCC remain to be clarified. Here we report a structure of intact RCC which contains a RC core and two FMO trimers from a thermophilic green sulfur bacterium Chlorobaculum tepidum at 2.9 Å resolution by cryo-electron microscopy. The second FMO trimer is attached at the cytoplasmic side asymmetrically relative to the first FMO trimer reported previously. We also observed two new subunits (PscE and PscF) and the N-terminal transmembrane domain of a cytochrome-containing subunit (PscC) in the structure. These two novel subunits possibly function to facilitate the binding of FMOs to RC core and to stabilize the whole complex. A new bacteriochlorophyll (numbered as 816) was identified at the interspace between PscF and PscA-1, causing an asymmetrical energy transfer from the two FMO trimers to RC core. Based on the structure, we propose an energy transfer network within this photosynthetic apparatus.

    DOI: 10.1111/jipb.13367

    PubMed

    researchmap

  • Characterization of the Rate-Limiting Steps in the Dark-To-Light Transitions of Closed Photosystem II: Temperature Dependence and Invariance of Waiting Times during Multiple Light Reactions. 査読 国際誌

    Melinda Magyar, Gábor Sipka, Wenhui Han, Xingyue Li, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Petar H Lambrev, Győző Garab

    International journal of molecular sciences   24 ( 1 )   2022年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Rate-limiting steps in the dark-to-light transition of Photosystem II (PSII) were discovered by measuring the variable chlorophyll-a fluorescence transients elicited by single-turnover saturating flashes (STSFs). It was shown that in diuron-treated samples: (i) the first STSF, despite fully reducing the QA quinone acceptor molecule, generated only an F1(<Fm) fluorescence level; (ii) to produce the maximum (Fm) level, additional excitations were required, which, however, (iii) were effective only with sufficiently long Δτ waiting times between consecutive STSFs. Detailed studies revealed the gradual formation of the light-adapted charge-separated state, PSIIL. The data presented here substantiate this assignment: (i) the Δτ1/2 half-increment rise (or half-waiting) times of the diuron-treated isolated PSII core complexes (CCs) of Thermostichus vulcanus and spinach thylakoid membranes displayed similar temperature dependences between 5 and −80 °C, with substantially increased values at low temperatures; (ii) the Δτ1/2 values in PSII CC were essentially invariant on the Fk−to-Fk+1 (k = 1−4) increments both at 5 and at −80 °C, indicating the involvement of the same physical mechanism during the light-adaptation process of PSIIL. These data are in harmony with the earlier proposed role of dielectric relaxation processes in the formation of the light-adapted charge-separated state and in the variable chlorophyll-a fluorescence of PSII.

    DOI: 10.3390/ijms24010094

    PubMed

    researchmap

  • Structure of a tetrameric photosystem I from a glaucophyte alga Cyanophora paradoxa 査読

    Koji Kato, Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Takehiro Suzuki, Tian-Yi Jiang, Naoshi Dohmae, Fusamichi Akita, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Jian-Ren Shen

    Nature Communications   13 ( 1 )   2022年12月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Photosystem I (PSI) is one of the two photosystems functioning in light-energy harvesting, transfer, and electron transfer in photosynthesis. However, the oligomerization state of PSI is variable among photosynthetic organisms. We present a 3.8-Å resolution cryo-electron microscopic structure of tetrameric PSI isolated from the glaucophyte alga Cyanophora paradoxa, which reveals differences with PSI from other organisms in subunit composition and organization. The PSI tetramer is organized in a dimer of dimers with a C2 symmetry. Unlike cyanobacterial PSI tetramers, two of the four monomers are rotated around 90°, resulting in a completely different pattern of monomer-monomer interactions. Excitation-energy transfer among chlorophylls differs significantly between Cyanophora and cyanobacterial PSI tetramers. These structural and spectroscopic features reveal characteristic interactions and excitation-energy transfer in the Cyanophora PSI tetramer, suggesting that the Cyanophora PSI could represent a turning point in the evolution of PSI from prokaryotes to eukaryotes.

    DOI: 10.1038/s41467-022-29303-7

    researchmap

    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41467-022-29303-7

  • Structural basis for different types of hetero-tetrameric light-harvesting complexes in a diatom PSII-FCPII supercomplex 査読

    Ryo Nagao, Koji Kato, Minoru Kumazawa, Kentaro Ifuku, Makio Yokono, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Fusamichi Akita, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Jian-Ren Shen

    Nature Communications   13 ( 1 )   2022年12月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    Abstract

    Fucoxanthin chlorophyll (Chl) a/c-binding proteins (FCPs) function as light harvesters in diatoms. The structure of a diatom photosystem II-FCPII (PSII-FCPII) supercomplex have been solved by cryo-electron microscopy (cryo-EM) previously; however, the FCPII subunits that constitute the FCPII tetramers and monomers are not identified individually due to their low resolutions. Here, we report a 2.5 Å resolution structure of the PSII-FCPII supercomplex using cryo-EM. Two types of tetrameric FCPs, S-tetramer, and M-tetramer, are identified as different types of hetero-tetrameric complexes. In addition, three FCP monomers, m1, m2, and m3, are assigned to different gene products of FCP. The present structure also identifies the positions of most Chls c and diadinoxanthins, which form a complicated pigment network. Excitation-energy transfer from FCPII to PSII is revealed by time-resolved fluorescence spectroscopy. These structural and spectroscopic findings provide insights into an assembly model of FCPII and its excitation-energy transfer and quenching processes.

    DOI: 10.1038/s41467-022-29294-5

    researchmap

    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41467-022-29294-5

  • Natural and artificial photosynthesis: fundamentals, progress, and challenges. 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Jian-Ren Shen, Suleyman I Allakhverdiev

    Photosynthesis research   154 ( 3 )   229 - 231   2022年12月

     詳細を見る

  • A Possible Mechanism for Aggregation-Induced Chlorophyll Fluorescence Quenching in Light-Harvesting Complex II from the Marine Green Alga Bryopsis corticulans. 査読 国際誌

    Hai-Dan Yao, Dan-Hong Li, Rong-Yao Gao, Cuicui Zhou, Wenda Wang, Peng Wang, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang, Jian-Ping Zhang

    The journal of physical chemistry. B   126 ( 46 )   9580 - 9590   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The light-harvesting complex II of a green alga Bryopsis corticulans (B-LHCII) is peculiar in that it contains siphonein and siphonaxathin as carotenoid (Car). Since the S1 state of siphonein and siphonaxathin lies substantially higher than the Qy state of chlorophyll a (Chl a), the Chl a(Qy)-to-Car(S1) excitation energy transfer is unfeasible. To understand the photoprotective mechanism of algal photosynthesis, we investigated the influence of temperature on the excitation dynamics of B-LHCII in trimeric and aggregated forms. At room temperature, the aggregated form showed a 10-fold decrease in fluorescence intensity and lifetime than the trimeric form. Upon lowering the temperature, the characteristic 680 nm fluorescence (F-680) of B-LHCII in both forms exhibited systematic intensity enhancement and spectral narrowing; however, only the aggregated form showed a red emission extending over 690-780 nm (F-RE) with pronounced blueshift, lifetime prolongation, and intensity boost. The remarkable T-dependence of F-RE is ascribed to the Chl-Chl charge transfer (CT) species involved directly in the aggregation-induced Chl deactivation. The CT-quenching mechanism, which is considered to be crucial for B. corticulans photoprotection, draws strong support from the positive correlation of the Chl deactivation rate with the CT state population, as revealed by comparing the fluorescence dynamics of B-LHCII with that of the plant LHCII.

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c05823

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structures of photosystem II from a cyanobacterium expressing psbA2 in comparison to psbA3 reveal differences in the D1 subunit. 査読 国際誌

    Yoshiki Nakajima, Natsumi Ugai-Amo, Naoki Tone, Akiko Nakagawa, Masako Iwai, Masahiko Ikeuchi, Miwa Sugiura, Michihiro Suga, Jian-Ren Shen

    The Journal of biological chemistry   298 ( 12 )   102668 - 102668   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Three psbA genes (psbA1, psbA2, and psbA3) encoding the D1 subunit of photosystem II (PSII) are present in the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus and are expressed differently in response to changes in the growth environment. To clarify the functional differences of the D1 protein expressed from these psbA genes, PSII dimers from two strains, each expressing only one psbA gene (psbA2 or psbA3), were crystallized, and we analyzed their structures at resolutions comparable to previously studied PsbA1-PSII. Our results showed that the hydrogen bond between pheophytin/D1 (PheoD1) and D1-130 became stronger in PsbA2- and PsbA3-PSII due to change of Gln to Glu, which partially explains the increase in the redox potential of PheoD1 observed in PsbA3. In PsbA2, one hydrogen bond was lost in PheoD1 due to the change of D1-Y147F, which may explain the decrease in stability of PheoD1 in PsbA2. Two water molecules in the Cl-1 channel were lost in PsbA2 due to the change of D1-P173M, leading to the narrowing of the channel, which may explain the lower efficiency of the S-state transition beyond S2 in PsbA2-PSII. In PsbA3-PSII, a hydrogen bond between D1-Ser270 and a sulfoquinovosyl-diacylglycerol molecule near QB disappeared due to the change of D1-Ser270 in PsbA1 and PsbA2 to D1-Ala270. This may result in an easier exchange of bound QB with free plastoquinone, hence an enhancement of oxygen evolution in PsbA3-PSII due to its high QB exchange efficiency. These results provide a structural basis for further functional examination of the three PsbA variants.

    DOI: 10.1016/j.jbc.2022.102668

    PubMed

    researchmap

  • Roles of the Flexible Primary Coordination Sphere of the Mn4CaOx Cluster: What Are the Immediate Decay Products of the S3 State? 査読 国際誌

    Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    The journal of physical chemistry. B   126 ( 38 )   7212 - 7228   2022年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The primary coordination sphere of the multinuclear cofactor (Mn4CaOx) in the oxygen-evolving complex (OEC) of photosystem II is absolutely conserved to maintain its structure and function. Recent time-resolved serial femtosecond crystallography identified large reorganization of the primary coordination sphere in the S2 to S3 transition, which elicits a cascade of events involving Mn oxidation and water molecule binding to a putative catalytic Mn site. We examined how the crystallographic fields, created by transient conformational states of the OEC at various time points, affect the thermodynamics of various isomers of the Mn cluster using DFT calculations, with an aim of comprehending the functional roles of the flexible primary coordination sphere in the S2 to S3 transition and in the recovery of the S2 state. The results show that the relative movements of surrounding residues change the size and shape of the cavity of the cluster and thereby affect the thermodynamics of various catalytic intermediates as well as the ability to capture a new water molecule at a coordinatively unsaturated site. The implication of these findings is that the protein dynamics may serve to gate the catalytic reaction efficiently by controlling the sequence of Mn oxidation/reduction and water binding/release. This interpretation is consistent with EPR experiments; g ∼ 5 and g ∼ 3 signals obtained after near-infrared (NIR) excitation of the S3 state at 4 K and a g ∼ 5 only signal produced after prolonged incubation of the S3 state at 77 K can be best explained as originating from water-bound S2 clusters (Stotal = 7/2) under a S3 ligand field, i.e., the immediate one-electron reduction products of the oxyl-oxo (Stotal = 6) and hydroxo-oxo (Stotal = 3) species in the S3 state.

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.2c02596

    PubMed

    researchmap

  • Simulating the low-temperature, metastable electrochromism of Photosystem I: Applications to Thermosynechococcus vulcanus and Chroococcidiopsis thermalis. 査読 国際誌

    J Langley, R Purchase, S Viola, A Fantuzzi, G A Davis, Jian-Ren Shen, A W Rutherford, E Krausz, N Cox

    The Journal of chemical physics   157 ( 12 )   125103 - 125103   2022年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Low-temperature, metastable electrochromism has been used as a tool to assign pigments in Photosystem I (PS I) from Thermosynechococcus vulcanus and both the white light and far-red light (FRL) forms of Chroococcidiopsis thermalis. We find that a minimum of seven pigments is required to satisfactorily model the electrochromism of PS I. Using our model, we provide a short list of candidates for the chlorophyll f pigment in FRL C. thermalis that absorbs at 756 nm, whose identity, to date, has proven to be controversial. Specifically, we propose the linker pigments A40 and B39 and two antenna pigments A26 and B24 as defined by crystal structure 1JB0. The pros and cons of these assignments are discussed, and we propose further experiments to better understand the functioning of FRL C. thermalis.

    DOI: 10.1063/5.0100431

    PubMed

    researchmap

  • Excited-state intermediates in a designer protein encoding a phototrigger caught by an X-ray free-electron laser. 査読 国際誌

    Xiaohong Liu, Pengcheng Liu, Hongjie Li, Zhen Xu, Lu Jia, Yan Xia, Minling Yu, Wenqin Tang, Xiaolei Zhu, Chao Chen, Yuanlin Zhang, Eriko Nango, Rie Tanaka, Fangjia Luo, Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Shunpei Kishi, Huaxin Yu, Naoki Matsubara, Shigeki Owada, Kensuke Tono, So Iwata, Long-Jiang Yu, Jian-Ren Shen, Jiangyun Wang

    Nature chemistry   14 ( 9 )   1054 - 1060   2022年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    One of the primary objectives in chemistry research is to observe atomic motions during reactions in real time. Although X-ray free-electron lasers (XFELs) have facilitated the capture of reaction intermediates using time-resolved serial femtosecond crystallography (TR-SFX), only a few natural photoactive proteins have been investigated using this method, mostly due to the lack of suitable phototriggers. Here we report the genetic encoding of a xanthone amino acid (FXO), as an efficient phototrigger, into a rationally designed human liver fatty-acid binding protein mutant (termed XOM), which undergoes photo-induced C-H bond transformation with high selectivity and quantum efficiency. We solved the structures of XOM before and 10-300 ns after flash illumination, at 1.55-1.70 Å resolutions, and captured the elusive excited-state intermediates responsible for precise C-H bond activation. We expect that most redox enzymes can now be investigated by TR-SFX, using our method, to reveal reaction intermediates key for their efficiency and selectivity.

    DOI: 10.1038/s41557-022-00992-3

    PubMed

    researchmap

  • Exciton quenching by oxidized chlorophyll Z across the two adjacent monomers in a photosystem II core dimer 査読

    Ahmed Mohamed, Shunsuke Nishi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Shigeru Itoh, Hiroshi Fukumura, Yutaka Shibata

    Photosynthesis Research   2022年8月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1007/s11120-022-00948-1

    researchmap

    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s11120-022-00948-1/fulltext.html

  • Excitation relaxation dynamics of carotenoids constituting the diadinoxanthin cycle 査読

    Kohei Kagatani, Ryo Nagao, Jian-Ren Shen, Yumiko Yamano, Shinichi Takaichi, Seiji Akimoto

    Photosynthesis Research   2022年8月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    DOI: 10.1007/s11120-022-00944-5

    researchmap

    その他リンク: https://link.springer.com/article/10.1007/s11120-022-00944-5/fulltext.html

  • Effects of mutations of D1-R323, D1-N322, D1-D319, D1-H304 on the functioning of photosystem II in Thermosynechococcus vulcanus. 査読 国際誌

    Qingjun Zhu, Yanyan Yang, Yanan Xiao, Wenhui Han, Xingyue Li, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Guangye Han

    Photosynthesis research   152 ( 2 )   193 - 206   2022年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) has a number of hydrogen-bonding networks connecting the manganese cluster with the lumenal bulk solution. The structure of PSII from Thermosynechococcus vulcanus (T. vulcanus) showed that D1-R323, D1-N322, D1-D319 and D1-H304 are involved in one of these hydrogen-bonding networks located in the interfaces between the D1, CP43 and PsbV subunits. In order to investigate the functions of these residues in PSII, we generated seven site-directed mutants D1-R323A, D1-R323E, D1-N322R, D1-D319L, D1-D319R, D1-D319Y and D1-H304D of T. vulcanus and examined the effects of these mutations on the growth and functions of the oxygen-evolving complex. The photoautotrophic growth rates of these mutants were similar to that of the wild type, whereas the oxygen-evolving activities of the mutant cells were decreased differently to 63-91% of that of the wild type at pH 6.5. The mutant cells showed a higher relative activity at higher pH region than the wild type cells, suggesting that higher pH facilitated proton egress in the mutants. In addition, oxygen evolution of thylakoid membranes isolated from these mutants showed an apparent decrease compared to that of the cells. This is due to the loss of PsbU during purification of the thylakoid membranes. Moreover, PsbV was also lost in the PSII core complexes purified from the mutants. Taken together, D1-R323, D1-N322, D1-D319 and D1-H304 are vital for the optimal function of oxygen evolution and functional binding of extrinsic proteins to PSII core, and may be involved in the proton egress pathway mediated by YZ.

    DOI: 10.1007/s11120-022-00920-z

    PubMed

    researchmap

  • Ultrafast excitation quenching by the oxidized photosystem II reaction center. 査読 国際誌

    Parveen Akhtar, Gábor Sipka, Wenhui Han, Xingyue Li, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Győző Garab, Howe-Siang Tan, Petar H Lambrev

    The Journal of chemical physics   156 ( 14 )   145101 - 145101   2022年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) is the pigment-protein complex driving the photoinduced oxidation of water and reduction of plastoquinone in all oxygenic photosynthetic organisms. Excitations in the antenna chlorophylls are photochemically trapped in the reaction center (RC) producing the chlorophyll-pheophytin radical ion pair P+ Pheo-. When electron donation from water is inhibited, the oxidized RC chlorophyll P+ acts as an excitation quencher, but knowledge on the kinetics of quenching is limited. Here, we used femtosecond transient absorption spectroscopy to compare the excitation dynamics of PSII with neutral and oxidized RC (P+). We find that equilibration in the core antenna has a major lifetime of about 300 fs, irrespective of the RC redox state. Two-dimensional electronic spectroscopy revealed additional slower energy equilibration occurring on timescales of 3-5 ps, concurrent with excitation trapping. The kinetics of PSII with open RC can be described well with previously proposed models according to which the radical pair P+ Pheo- is populated with a main lifetime of about 40 ps, which is primarily determined by energy transfer between the core antenna and the RC chlorophylls. Yet, in PSII with oxidized RC (P+), fast excitation quenching was observed with decay lifetimes as short as 3 ps and an average decay lifetime of about 90 ps, which is shorter than the excited-state lifetime of PSII with open RC. The underlying mechanism of this extremely fast quenching prompts further investigation.

    DOI: 10.1063/5.0086046

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls in a photosystem I trimer from Gloeobacter violaceus 査読

    Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Ryo Nagao, Keisuke Kawakami, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Hiroko Uchida, Akio Murakami, Yoshiki Nakajima, Makio Yokono, Seiji Akimoto, Naoshi Dohmae, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    eLife   11   2022年4月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:eLife Sciences Publications, Ltd  

    Photosystem I (PSI) is a multi-subunit pigment-protein complex that functions in light-harvesting and photochemical charge-separation reactions, followed by reduction of NADP to NADPH required for CO2 fixation in photosynthetic organisms. PSI from different photosynthetic organisms has a variety of chlorophylls (Chls), some of which are at lower-energy levels than its reaction center P700, a special pair of Chls, and are called low-energy Chls. However, the sites of low-energy Chls are still under debate. Here, we solved a 2.04-Å resolution structure of a PSI trimer by cryo-electron microscopy from a primordial cyanobacterium Gloeobacter violaceus PCC 7421, which has no low-energy Chls. The structure shows the absence of some subunits commonly found in other cyanobacteria, confirming the primordial nature of this cyanobacterium. Comparison with the known structures of PSI from other cyanobacteria and eukaryotic organisms reveals that one dimeric and one trimeric Chls are lacking in the Gloeobacter PSI. The dimeric and trimeric Chls are named Low1 and Low2, respectively. Low2 is missing in some cyanobacterial and eukaryotic PSIs, whereas Low1 is absent only in Gloeobacter. These findings provide insights into not only the identity of low-energy Chls in PSI, but also the evolutionary changes of low-energy Chls in oxyphototrophs.

    DOI: 10.7554/elife.73990

    researchmap

    その他リンク: https://cdn.elifesciences.org/articles/73990/elife-73990-v1.xml

  • Structure, Function, and Variations of the Photosystem I-Antenna Supercomplex from Different Photosynthetic Organisms. 査読 国際誌

    Jian-Ren Shen

    Sub-cellular biochemistry   99   351 - 377   2022年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem I (PSI) is a protein complex functioning in light-induced charge separation, electron transfer, and reduction reactions of ferredoxin in photosynthesis, which finally results in the reduction of NAD(P)- to NAD(P)H required for the fixation of carbon dioxide. In eukaryotic algae, PSI is associated with light-harvesting complex I (LHCI) subunits, forming a PSI-LHCI supercomplex. LHCI harvests and transfers light energy to the PSI core, where charge separation and electron transfer reactions occur. During the course of evolution, the number and sequences of protein subunits and the pigments they bind in LHCI change dramatically depending on the species of organisms, which is a result of adaptation of organisms to various light environments. In this chapter, I will describe the structure of various PSI-LHCI supercomplexes from different organisms solved so far either by X-ray crystallography or by cryo-electron microscopy, with emphasis on the differences in the number, structures, and association patterns of LHCI subunits associated with the PSI core found in different organisms.

    DOI: 10.1007/978-3-031-00793-4_11

    PubMed

    researchmap

  • Architecture of the chloroplast PSI-NDH supercomplex in Hordeum vulgare. 査読 国際誌

    Liangliang Shen, Kailu Tang, Wenda Wang, Chen Wang, Hangjun Wu, Zhiyuan Mao, Shaoya An, Shenghai Chang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Guangye Han, Xing Zhang

    Nature   2021年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The chloroplast NADH dehydrogenase-like (NDH) complex is composed of at least 29 subunits and has an important role in mediating photosystem I (PSI) cyclic electron transport (CET)1-3. The NDH complex associates with PSI to form the PSI-NDH supercomplex and fulfil its function. Here, we report cryo-electron microscopy structures of a PSI-NDH supercomplex from barley (Hordeum vulgare). The structures reveal that PSI-NDH is composed of two copies of the PSI-light-harvesting complex I (LHCI) subcomplex and one NDH complex. Two monomeric LHCI proteins, Lhca5 and Lhca6, mediate the binding of two PSI complexes to NDH. Ten plant chloroplast-specific NDH subunits are presented and their exact positions as well as their interactions with other subunits in NDH are elucidated. In all, this study provides a structural basis for further investigations on the functions and regulation of PSI-NDH-dependent CET.

    DOI: 10.1038/s41586-021-04277-6

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for high selectivity of a rice silicon channel Lsi1 査読

    Yasunori Saitoh, Namiki Mitani-Ueno, Keisuke Saito, Kengo Matsuki, Sheng Huang, Lingli Yang, Naoki Yamaji, Hiroshi Ishikita, Jian-Ren Shen, Jian Feng Ma, Michihiro Suga

    Nature Communications   12 ( 1 )   2021年12月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Springer Science and Business Media LLC  

    <title>Abstract</title>Silicon (Si), the most abundant mineral element in the earth’s crust, is taken up by plant roots in the form of silicic acid through Low silicon rice 1 (Lsi1). Lsi1 belongs to the Nodulin 26-like intrinsic protein subfamily in aquaporin and shows high selectivity for silicic acid. To uncover the structural basis for this high selectivity, here we show the crystal structure of the rice Lsi1 at a resolution of 1.8 Å. The structure reveals transmembrane helical orientations different from other aquaporins, characterized by a unique, widely opened, and hydrophilic selectivity filter (SF) composed of five residues. Our structural, functional, and theoretical investigations provide a solid structural basis for the Si uptake mechanism in plants, which will contribute to secure and sustainable rice production by manipulating Lsi1 selectivity for different metalloids.

    DOI: 10.1038/s41467-021-26535-x

    researchmap

    その他リンク: https://www.nature.com/articles/s41467-021-26535-x

  • Molecular phylogeny of fucoxanthin‐chlorophyll a / c proteins from Chaetoceros gracilis and Lhcq/Lhcf diversity 査読

    Minoru Kumazawa, Hiroyo Nishide, Ryo Nagao, Natsuko Inoue‐Kashino, Jian‐Ren Shen, Takeshi Nakano, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Kentaro Ifuku

    Physiologia Plantarum   174 ( 1 )   2021年11月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Wiley  

    DOI: 10.1111/ppl.13598

    researchmap

  • Excitation-energy transfer in heterocysts isolated from the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120 as studied by time-resolved fluorescence spectroscopy. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Yoshiki Nakajima, Takehiro Suzuki, Ka-Ho Kato, Naoki Tsuboshita, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Shigeki Ehira, Seiji Akimoto

    Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics   1863 ( 1 )   148509 - 148509   2021年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Heterocysts are formed in filamentous heterocystous cyanobacteria under nitrogen-starvation conditions, and possess a very low amount of photosystem II (PSII) complexes than vegetative cells. Molecular, morphological, and biochemical characterizations of heterocysts have been investigated; however, excitation-energy dynamics in heterocysts are still unknown. In this study, we examined excitation-energy-relaxation processes of pigment-protein complexes in heterocysts isolated from the cyanobacterium Anabaena sp. PCC 7120. Thylakoid membranes from the heterocysts showed no oxygen-evolving activity under our experimental conditions and no thermoluminescence-glow curve originating from charge recombination of S2QA-. Two dimensional blue-native/SDS-PAGE analysis exhibits tetrameric, dimeric, and monomeric photosystem I (PSI) complexes but almost no dimeric and monomeric PSII complexes in the heterocyst thylakoids. The steady-state fluorescence spectrum of the heterocyst thylakoids at 77 K displays both characteristic PSI fluorescence and unusual PSII fluorescence different from the fluorescence of PSII dimer and monomer complexes. Time-resolved fluorescence spectra at 77 K, followed by fluorescence decay-associated spectra, showed different PSII and PSI fluorescence bands between heterocysts and vegetative thylakoids. Based on these findings, we discuss excitation-energy-transfer mechanisms in the heterocysts.

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2021.148509

    PubMed

    researchmap

  • The importance of identifying the true catalyst when using Randles-Sevcik equation to calculate turnover frequency 査読

    Zahra Abdi, Matthias Vandichel, Alla S. Sologubenko, Marc-Georg Willinger, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev, Mohammad Mahdi Najafpour

    International Journal of Hydrogen Energy   46 ( 76 )   37774 - 37781   2021年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Elsevier Ltd  

    DOI: 10.1016/j.ijhydene.2021.09.039

    Scopus

    researchmap

  • Cryo-EM structure of monomeric photosystem II at 2.78 Å resolution reveals factors important for the formation of dimer. 査読 国際誌

    Huaxin Yu, Tasuku Hamaguchi, Yoshiki Nakajima, Koji Kato, Keisuke Kawakami, Fusamichi Akita, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics   1862 ( 10 )   148471 - 148471   2021年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) functions mainly as a dimer to catalyze the light energy conversion and water oxidation reactions. However, monomeric PSII also exists and functions in vivo in some cases. The crystal structure of monomeric PSII has been solved at 3.6 Å resolution, but it is still not clear which factors contribute to the formation of the dimer. Here, we solved the structure of PSII monomer at a resolution of 2.78 Å using cryo-electron microscopy (cryo-EM). From our cryo-EM density map, we observed apparent differences in pigments and lipids in the monomer-monomer interface between the PSII monomer and dimer. One β-carotene and two sulfoquinovosyl diacylglycerol (SQDG) molecules are found in the monomer-monomer interface of the dimer structure but not in the present monomer structure, although some SQDG and other lipid molecules are found in the analogous region of the low-resolution crystal structure of the monomer, or cryo-EM structure of an apo-PSII monomer lacking the extrinsic proteins from Synechocystis sp. PCC 6803. In the current monomer structure, a large part of the PsbO subunit was also found to be disordered. These results indicate the importance of the β-carotene, SQDG and PsbO in formation of the PSII dimer.

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2021.148471

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls responsible for photoprotection from a primitive cyanobacterial PSI

    Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Ryo Nagao, Keisuke Kawakami, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Hiroko Uchida, Akio Murakami, Yoshiki Nakajima, Makio Yokono, Seiji Akimoto, Naoshi Dohmae, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    2021年10月

     詳細を見る

    出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Photosystem I (PSI) of photosynthetic organisms is a multi-subunit pigment-protein complex and functions in light harvesting and photochemical charge-separation reactions, followed by reduction of NADP to NADPH required for CO2 fixation. PSI from different photosynthetic organisms has a variety of chlorophylls (Chls), some of which are at lower-energy levels than its reaction center P700, a special pair of Chls, and are called low-energy Chls. However, the site of low-energy Chls is still under debate. Here, we solved a 2.04-Å resolution structure of a PSI trimer by cryo-electron microscopy from a primitive cyanobacterium Gloeobacter violaceus PCC 7421, which has no low-energy Chls. The structure showed absence of some subunits commonly found in other cyanobacteria, confirming the primitive nature of this cyanobacterium. Comparison with the known structures of PSI from other cyanobacteria and eukaryotic organisms reveals that one dimeric and one trimeric Chls are lacking in the Gloeobacter PSI. The dimeric and trimeric Chls are named Low1 and Low2, respectively. Low2 does not exist in some cyanobacterial and eukaryotic PSIs, whereas Low1 is absent only in Gloeobacter. Since Gloeobacter is susceptible to light, this indicates that Low1 serves as a main photoprotection site in most oxyphototrophs, whereas Low2 is involved in either energy transfer or energy quenching in some of the oxyphototrophs. Thus, these findings provide insights into not only the functional significance of low-energy Chls in PSI, but also the evolutionary changes of low-energy Chls responsible for the photoprotection machinery from photosynthetic prokaryotes to eukaryotes.

    DOI: 10.1101/2021.09.29.462462

    researchmap

  • Structural implications for a phycobilisome complex from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus. 査読 国際誌

    Keisuke Kawakami, Ryo Nagao, Yuhei O Tahara, Tasuku Hamaguchi, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Daisuke Kosumi, Jian-Ren Shen, Makoto Miyata, Koji Yonekura, Nobuo Kamiya

    Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics   1862 ( 9 )   148458 - 148458   2021年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Phycobilisomes (PBSs) are huge, water-soluble light-harvesting complexes used by oxygenic photosynthetic organisms. The structures of some subunits of the PBSs, including allophycocyanin (APC) and phycocyanin (PC), have been solved by X-ray crystallography previously. However, there are few reports on the overall structures of PBS complexes in photosynthetic organisms. Here, we report the overall structure of the PBS complex isolated from the cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus, determined by negative-staining electron microscopy (EM). Intact PBS complexes were purified by trehalose density gradient centrifugation with a high-concentration phosphate buffer and then subjected to a gradient-fixation preparation using glutaraldehyde. The final map constructed by the single-particle analysis of EM images showed a hemidiscoidal structure of the PBS, consisting of APC cores and peripheral PC rods. The APC cores are composed of five cylinders: A1, A2, B, C1, and C2. Each of the cylinders is composed of three (A1 and A2), four (B), or two (C1 and C2) APC trimers. In addition, there are eight PC rods in the PBS: one bottom pair (Rb and Rb'), one top pair (Rt and Rt'), and two side pairs (Rs1/Rs1' and Rs2/Rs2'). Comparison with the overall structures of PBSs from other organisms revealed structural characteristics of T. vulcanus PBS.

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2021.148458

    PubMed

    researchmap

  • Structural insights into cyanobacterial photosystem II intermediates associated with Psb28 and Tsl0063. 査読 国際誌

    Yanan Xiao, Guoqiang Huang, Xin You, Qingjun Zhu, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Guangye Han, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    Nature plants   7 ( 8 )   1132 - 1142   2021年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) is a multisubunit pigment-protein complex and catalyses light-induced water oxidation, leading to the conversion of light energy into chemical energy and the release of dioxygen. We analysed the structures of two Psb28-bound PSII intermediates, Psb28-RC47 and Psb28-PSII, purified from a psbV-deletion strain of the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus, using cryo-electron microscopy. Both Psb28-RC47 and Psb28-PSII bind one Psb28, one Tsl0063 and an unknown subunit. Psb28 is located at the cytoplasmic surface of PSII and interacts with D1, D2 and CP47, whereas Tsl0063 is a transmembrane subunit and binds at the side of CP47/PsbH. Substantial structural perturbations are observed at the acceptor side, which result in conformational changes of the quinone (QB) and non-haem iron binding sites and thus may protect PSII from photodamage during assembly. These results provide a solid structural basis for understanding the assembly process of native PSII.

    DOI: 10.1038/s41477-021-00961-7

    PubMed

    researchmap

  • High-light modification of excitation-energy-relaxation processes in the green flagellate Euglena gracilis. 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Ka-Ho Kato, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    Photosynthesis research   149 ( 3 )   303 - 311   2021年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosynthetic organisms finely tune their photosynthetic machinery including pigment compositions and antenna systems to adapt to various light environments. However, it is poorly understood how the photosynthetic machinery in the green flagellate Euglena gracilis is modified under high-light conditions. In this study, we examined high-light modification of excitation-energy-relaxation processes in Euglena cells. Oxygen-evolving activity in the cells incubated at 300 µmol photons m-2 s-1 (HL cells) cannot be detected, reflecting severe photodamage to photosystem II (PSII) in vivo. Pigment compositions in the HL cells showed relative increases in 9'-cis-neoxanthin, diadinoxanthin, and chlorophyll b compared with the cells incubated at 30 µmol photons m-2 s-1 (LL cells). Absolute fluorescence spectra at 77 K exhibit smaller intensities of the PSII and photosystem I (PSI) fluorescence in the HL cells than in the LL cells. Absolute fluorescence decay-associated spectra at 77 K of the HL cells indicate suppression of excitation-energy transfer from light-harvesting complexes (LHCs) to both PSI and PSII with the time constant of 40 ps. Rapid energy quenching in LHCs and PSII in the HL cells is distinctly observed by averaged Chl-fluorescence lifetimes. These findings suggest that Euglena modifies excitation-energy-relaxation processes in addition to pigment compositions to deal with excess energy. These results provide insights into the photoprotection strategies of this alga under high-light conditions.

    DOI: 10.1007/s11120-021-00849-9

    PubMed

    researchmap

  • A unique photosystem I reaction center from a chlorophyll d-containing cyanobacterium Acaryochloris marina. 査読 国際誌

    Caihuang Xu, Qingjun Zhu, Jing-Hua Chen, Liangliang Shen, Xiaohan Yi, Zihui Huang, Wenda Wang, Min Chen, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Xing Zhang, Guangye Han

    Journal of integrative plant biology   2021年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem I (PSI) is a large protein supercomplex that catalyzes the light-dependent oxidation of plastocyanin (or cytochrome c6 ) and the reduction of ferredoxin. This catalytic reaction is realized by a transmembrane electron transfer chain consisting of primary electron donor (a special chlorophyll (Chl) pair) and electron acceptors A0 , A1 , and three Fe4 S4 clusters, FX , FA , and FB . Here we report the PSI structure from a Chl d-dominated cyanobacterium Acaryochloris marina at 3.3 Å resolution obtained by single-particle cryo-electron microscopy. The A. marina PSI exists as a trimer with three identical monomers. Surprisingly, the structure reveals a unique composition of electron transfer chain in which the primary electron acceptor A0 is composed of two pheophytin a rather than Chl a found in any other well-known PSI structures. A novel subunit Psa27 is observed in the A. marina PSI structure. In addition, 77 Chls, 13 α-carotenes, two phylloquinones, three Fe-S clusters, two phosphatidyl glycerols, and one monogalactosyl-diglyceride were identified in each PSI monomer. Our results provide a structural basis for deciphering the mechanism of photosynthesis in a PSI complex with Chl d as the dominating pigments and absorbing far-red light.

    DOI: 10.1111/jipb.13113

    PubMed

    researchmap

  • Capturing structural changes of the S1 to S2 transition of photosystem II using time-resolved serial femtosecond crystallography. 査読 国際誌

    Hongjie Li, Yoshiki Nakajima, Takashi Nomura, Michihiro Sugahara, Shinichiro Yonekura, Siu Kit Chan, Takanori Nakane, Takahiro Yamane, Yasufumi Umena, Mamoru Suzuki, Tetsuya Masuda, Taiki Motomura, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Tetsunari Kimura, Kensuke Tono, Shigeki Owada, Yasumasa Joti, Rie Tanaka, Eriko Nango, Fusamichi Akita, Minoru Kubo, So Iwata, Jian-Ren Shen, Michihiro Suga

    IUCrJ   8 ( Pt 3 )   431 - 443   2021年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) catalyzes light-induced water oxidation through an S
    i
    -state cycle, leading to the generation of di-oxygen, protons and electrons. Pump-probe time-resolved serial femtosecond crystallography (TR-SFX) has been used to capture structural dynamics of light-sensitive proteins. In this approach, it is crucial to avoid light contamination in the samples when analyzing a particular reaction intermediate. Here, a method for determining a condition that avoids light contamination of the PSII microcrystals while minimizing sample consumption in TR-SFX is described. By swapping the pump and probe pulses with a very short delay between them, the structural changes that occur during the S1-to-S2 transition were examined and a boundary of the excitation region was accurately determined. With the sample flow rate and concomitant illumination conditions determined, the S2-state structure of PSII could be analyzed at room temperature, revealing the structural changes that occur during the S1-to-S2 transition at ambient temperature. Though the structure of the manganese cluster was similar to previous studies, the behaviors of the water molecules in the two channels (O1 and O4 channels) were found to be different. By comparing with the previous studies performed at low temperature or with a different delay time, the possible channels for water inlet and structural changes important for the water-splitting reaction were revealed.

    DOI: 10.1107/S2052252521002177

    PubMed

    researchmap

  • Structure of plant photosystem I-light harvesting complex I supercomplex at 2.4 Å resolution. 査読 国際誌

    Jie Wang, Long-Jiang Yu, Wenda Wang, Qiujing Yan, Tingyun Kuang, Xiaochun Qin, Jian-Ren Shen

    Journal of integrative plant biology   2021年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem I (PSI) is one of the two photosystems in photosynthesis, and performs a series of electron transfer reactions leading to the reduction of ferredoxin. In higher plants, PSI is surrounded by four light-harvesting complex I (LHCI) subunits, which harvest and transfer energy efficiently to the PSI core. The crystal structure of PSI-LHCI supercomplex has been analyzed up to 2.6 Å resolution, providing much information on the arrangement of proteins and cofactors in this complicated supercomplex. Here we have optimized crystallization conditions, and analyzed the crystal structure of PSI-LHCI at 2.4 Å resolution. Our structure showed some shift of the LHCI, especially the Lhca4 subunit, away from the PSI core, suggesting the indirect connection and inefficiency of energy transfer from this Lhca subunit to the PSI core. We identified five new lipids in the structure, most of them are located in the gap region between the Lhca subunits and the PSI core. These lipid molecules may play important roles in binding of the Lhca subunits to the core, as well as in the assembly of the supercomplex. The present results thus provide novel information for the elucidation of the mechanisms for the light-energy harvesting, transfer and assembly of this supercomplex. This article is protected by copyright. All rights reserved.

    DOI: 10.1111/jipb.13095

    PubMed

    researchmap

  • High-resolution cryo-EM structure of photosystem II reveals damage from high-dose electron beams 査読 国際誌

    Koji Kato, Naoyuki Miyazaki, Tasuku Hamaguchi, Yoshiki Nakajima, Fusamichi Akita, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    COMMUNICATIONS BIOLOGY   4 ( 1 )   382 - 382   2021年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s42003-021-01919-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of photosystem I-LHCI-LHCII from the green alga Chlamydomonas reinhardtii in State 2 査読 国際誌

    Zihui Huang, Liangliang Shen, Wenda Wang, Zhiyuan Mao, Xiaohan Yi, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Xing Zhang, Guangye Han

    NATURE COMMUNICATIONS   12 ( 1 )   1100 - 1100   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-021-21362-6

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural insights into a dimeric Psb27-photosystem II complex from a cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus 査読 国際誌

    Guoqiang Huang, Yanan Xiao, Xiong Pi, Liang Zhao, Qingjun Zhu, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Guangye Han, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   118 ( 5 )   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.2018053118

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Antenna arrangement and energy-transfer pathways of PSI-LHCI from the moss Physcomitrella patens 査読 国際誌

    Qiujing Yan, Liang Zhao, Wenda Wang, Xiong Pi, Guangye Han, Jie Wang, Lingpeng Cheng, Yi-Kun He, Tingyun Kuang, Xiaochun Qin, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    CELL DISCOVERY   7 ( 1 )   10 - 10   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41421-021-00242-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Enhancement of excitation-energy quenching in fucoxanthin chlorophyll alpha/c-binding proteins isolated from a diatom Phaeodactylum tricornutum upon excess-light illumination 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Minoru Kumazawa, Ka-Ho Kato, Naoki Tsuboshita, Naoshi Dohmae, Kentaro Ifuku, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1862 ( 2 )   148350 - 148350   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148350

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • An Exciton Dynamics Model of Bryopsis corticulans Light-Harvesting Complex II 査読 国際誌

    Hoang Long Nguyen, Thanh Nhut Do, Parveen Akhtar, Thomas L. C. Jansen, Jasper Knoester, Wenda Wang, Jian-Ren Shen, Petar H. Lambrev, Howe-Siang Tan

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   125 ( 4 )   1134 - 1143   2021年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c10634

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Light-Adapted Charge-Separated State of Photosystem II: Structural and Functional Dynamics of the Closed Reaction Center. 査読 国際誌

    Gábor Sipka, Melinda Magyar, Alberto Mezzetti, Parveen Akhtar, Qingjun Zhu, Yanan Xiao, Guangye Han, Stefano Santabarbara, Jian-Ren Shen, Petar H Lambrev, Győző Garab

    The Plant cell   2021年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) uses solar energy to oxidize water and delivers electrons for life on Earth. The photochemical reaction center of PSII is known to possess two stationary states. In the open state (PSIIO), the absorption of a single photon triggers electron-transfer steps, which convert PSII into the charge-separated closed state (PSIIC). Here, by using steady-state and time-resolved spectroscopic techniques on Spinacia oleracea and Thermosynechococcus vulcanus preparations, we show that additional illumination gradually transforms PSIIC into a light-adapted charge-separated state (PSIIL). The PSIIC-to-PSIIL transition, observed at all temperatures between 80 and 308 K, is responsible for a large part of the variable chlorophyll-a fluorescence (Fv) and is associated with subtle, dark-reversible reorganizations in the core complexes, protein conformational changes at non-cryogenic temperatures and marked variations in the rates of photochemical and photophysical reactions. The build-up of PSIIL requires a series of light-induced events generating rapidly recombining primary radical pairs, spaced by sufficient waiting times between these events - pointing to the roles of local electric-field transients and dielectric relaxation processes. We show that the maximum fluorescence level, Fm, is associated with PSIIL rather than with PSIIC, and thus the Fv/Fm parameter cannot be equated with the quantum efficiency of PSII photochemistry. Our findings resolve the controversies and explain the peculiar features of chlorophyll-a fluorescence kinetics, a tool to monitor the functional activity and the structural-functional plasticity of PSII in different wild-type and mutant organisms and under stress conditions.

    DOI: 10.1093/plcell/koab008

    PubMed

    researchmap

  • Exploring reaction pathways for the structural rearrangements of the Mn cluster induced by water binding in the S-3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II 査読

    Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY A-CHEMISTRY   405   2021年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.jphotochem.2020.112905

    Web of Science

    researchmap

  • Molecular organizations and function of iron-stress-induced-A protein family in Anabaena sp. PCC 7120 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Koji Kato, Ka-Ho Kato, Naoki Tsuboshita, Tian-Yi Jiang, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Shigeki Ehira, Seiji Akimoto

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1862 ( 1 )   148327 - 148327   2021年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148327

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Basic pH-induced modification of excitation-energy dynamics in fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins isolated from a pinguiophyte, Glossomastix chrysoplasta 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Ka-Ho Kato, Naoki Tsuboshita, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1862 ( 1 )   148306 - 148306   2021年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148306

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural elucidation of vascular plant photosystem I and its functional implications 査読 国際誌

    Xiuxiu Li, Gongxian Yang, Xinyi Yuan, Fenghua Wu, Wenda Wang, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang, Xiaochun Qin

    Functional Plant Biology   2021年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:CSIRO Publishing  

    In vascular plants, bryophytes and algae, the photosynthetic light reaction takes place in the thylakoid membrane where two transmembrane supercomplexes PSII and PSI work together with cytochrome b6f and ATP synthase to harvest the light energy and produce ATP and NADPH. Vascular plant PSI is a 600-kDa protein-pigment supercomplex, the core complex of which is partly surrounded by peripheral light-harvesting complex I (LHCI) that captures sunlight and transfers the excitation energy to the core to be used for charge separation. PSI is unique mainly in absorption of longer-wavelengths than PSII, fast excitation energy transfer including uphill energy transfer, and an extremely high quantum efficiency. From the early 1980s, a lot of effort has been dedicated to structural and functional studies of PSI-LHCI, leading to the current understanding of how more than 200 cofactors are kept at the correct distance and geometry to facilitate fast energy transfer in this supercomplex at an atomic level. In this review, we review the history of studies on vascular plant PSI-LHCI, summarise the present research progress on its structure, and present some new and further questions to be answered in future studies.

    DOI: 10.1071/fp21077

    PubMed

    researchmap

  • Adaptation of light-harvesting and energy-transfer processes of a diatomPhaeodactylum tricornutumto different light qualities 査読 国際誌

    Kumiko Oka, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao, Seiji Akimoto

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   227 - 234   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00714-1

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Adaptation of light-harvesting and energy-transfer processes of a diatom Chaetoceros gracilis to different light qualities 査読 国際誌

    Seiji Akimoto, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   87 - 93   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00713-2

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Effects of CO2 and temperature on photosynthetic performance in the diatom Chaetoceros gracilis 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Seiji Akimoto, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   189 - 195   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00729-8

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Changes in excitation relaxation of diatoms in response to fluctuating light, probed by fluorescence spectroscopies 査読 国際誌

    Miyuki Tanabe, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Jian-Ren Shen, Ryo Nagao, Seiji Akimoto

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   143 - 150   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00720-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Regulation of photosystem I-light-harvesting complex I from a red algaCyanidioschyzon merolaein response to light intensities 査読 国際誌

    Lijing Chang, Lirong Tian, Fei Ma, Zhiyuan Mao, Xiaochi Liu, Guangye Han, Wenda Wang, Yanyan Yang, Tingyun Kuang, Jie Pan, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   287 - 297   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00778-z

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Function of PsbO-Asp158 in photosystem II: effects of mutation of this residue on the binding of PsbO and function of PSII in Thermosynechococcus vulcanus 査読 国際誌

    Qingjun Zhu, Yanyan Yang, Yanan Xiao, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Guangye Han

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   29 - 40   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00715-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Role of PsbV-Tyr137 in photosystem II studied by site-directed mutagenesis in the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus 査読 国際誌

    Yanan Xiao, Qingjun Zhu, Yanyan Yang, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Guangye Han

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   146 ( 1-3 )   41 - 54   2020年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-020-00753-8

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Architecture of the photosynthetic complex from a green sulfur bacterium 査読 国際誌

    Jing-Hua Chen, Hangjun Wu, Caihuang Xu, Xiao-Chi Liu, Zihui Huang, Shenghai Chang, Wenda Wang, Guangye Han, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Xing Zhang

    SCIENCE   370 ( 6519 )   931 - +   2020年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.abb6350

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Reply to "Comment on 'Acidic pH-Induced Modification of Energy Transfer in Diatom Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Proteins'" 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   124 ( 46 )   10588 - 10589   2020年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c09575

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • High-resolution cryo-EM structure of photosystem II: Effects of electron beam damage

    Koji Kato, Naoyuki Miyazaki, Tasuku Hamaguchi, Yoshiki Nakajima, Fusamichi Akita, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

    2020年10月

     詳細を見る

    出版者・発行元:Cold Spring Harbor Laboratory  

    Abstract

    Photosystem II (PSII) plays a key role in water-splitting and oxygen evolution. X-ray crystallography has revealed its atomic structure and some intermediate structures. However, these structures are in the crystalline state, and its final state structure has not been solved because of the low efficiencies of the S-state transitions in the crystals. Here we analyzed the structure of PSII in solution at 1.95 Å resolution by single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM). The structure obtained is similar to the crystal structure, but a PsbY subunit was visible in the cryo-EM structure, indicating that it represents its physiological state more closely. Electron beam damage was observed at a high-dose in the regions that were easily affected by redox states, which was reduced by reducing the electron dose. This study will serve as a good indicator for determining damage-free cryo-EM structures of not only PSII but also all biological samples, especially redox-active metalloproteins.

    DOI: 10.1101/2020.10.18.344648

    researchmap

  • Formation of the High-Spin S-2 State Related to the Extrinsic Proteins in the Oxygen Evolving Complex of Photosystem II 査読 国際誌

    Shota Taguchi, Liangliang Shen, Guangye Han, Yasufumi Umena, Jian-Ren Shen, Takumi Noguchi, Hiroyuki Mino

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS   11 ( 20 )   8908 - 8913   2020年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.0c02411

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for energy transfer in a huge diatom PSI-FCPI supercomplex 査読 国際誌

    Caizhe Xu, Xiong Pi, Yawen Huang, Guangye Han, Xiaobo Chen, Xiaochun Qin, Guoqiang Huang, Songhao Zhao, Yanyan Yang, Tingyun Kuang, Wenda Wang, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    NATURE COMMUNICATIONS   11 ( 1 )   5081 - 5081   2020年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-020-18867-x

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural variations of photosystem I-antenna supercomplex in response to adaptations to different light environments 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Jian-Ren Shen

    CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY   63   10 - 17   2020年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.sbi.2020.02.005

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Spectral tuning of light-harvesting complex II in the siphonous alga Bryopsis corticulans and its effect on energy transfer dynamics 査読 国際誌

    Parveen Akhtar, Pawel J. Nowakowski, Wenda Wang, Thanh Nhut Do, Songhao Zhao, Giuliano Siligardi, Gyozo Garab, Jian-Ren Shen, Howe-Siang Tan, Petar H. Lambrev

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1861 ( 7 )   148191 - 148191   2020年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148191

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Acidic pH-Induced Modification of Energy Transfer in Diatom Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Proteins 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   124 ( 24 )   4919 - 4923   2020年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c04231

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural features of the diatom photosystem II-light-harvesting antenna complex 査読 国際誌

    Wenda Wang, Songhao Zhao, Xiong Pi, Tingyun Kuang, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    FEBS JOURNAL   287 ( 11 )   2191 - 2200   2020年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/febs.15183

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Excitation dynamics and relaxation in the major antenna of a marine green alga Bryopsis corticulans 査読 国際誌

    Dan-Hong Li, Wenda Wang, Cuicui Zhou, Yan Zhang, Peng Wang, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang, Jian-Ping Zhang

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1861 ( 5-6 )   148186 - 148186   2020年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2020.148186

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Water-oxidizing complex in Photosystem II: Its structure and relation to Manganese-oxide based catalysts 査読

    Mohammad Mandi Najafpour, Ivelina Zaharieva, Zahra Zand, Seyedeh Maedeh Hosseini, Margarita Kouzmanova, Malgorzata Holynska, Ionut Tranca, Anthony W. Larkum, Jian-Ren Shen, Suleyman Allakhverdiev

    COORDINATION CHEMISTRY REVIEWS   409   213183 - 213183   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ccr.2020.213183

    Web of Science

    researchmap

  • Structure of a cyanobacterial photosystem I surrounded by octadecameric IsiA antenna proteins 査読 国際誌

    Fusamichi Akita, Ryo Nagao, Koji Kato, Yoshiki Nakajima, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki

    COMMUNICATIONS BIOLOGY   3 ( 1 )   232 - 232   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s42003-020-0949-6

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for assembly and function of a diatom photosystem I-light-harvesting supercomplex 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Koji Kato, Kentaro Ifuku, Takehiro Suzuki, Minoru Kumazawa, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Jian-Ren Shen, Naoyuki Miyazaki, Fusamichi Akita

    NATURE COMMUNICATIONS   11 ( 1 )   2481 - 2481   2020年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-020-16324-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Liquid-Liquid Phase Transition Drives Intra-chloroplast Cargo Sorting. 査読 国際誌

    Min Ouyang, Xiaoyi Li, Jing Zhang, Peiqiang Feng, Hua Pu, Lingxi Kong, Zechen Bai, Liwei Rong, Xiumei Xu, Wei Chi, Qiang Wang, Fan Chen, Congming Lu, Jianren Shen, Lixin Zhang

    Cell   180 ( 6 )   1144 - 1159   2020年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In eukaryotic cells, organelle biogenesis is pivotal for cellular function and cell survival. Chloroplasts are unique organelles with a complex internal membrane network. The mechanisms of the migration of imported nuclear-encoded chloroplast proteins across the crowded stroma to thylakoid membranes are less understood. Here, we identified two Arabidopsis ankyrin-repeat proteins, STT1 and STT2, that specifically mediate sorting of chloroplast twin arginine translocation (cpTat) pathway proteins to thylakoid membranes. STT1 and STT2 form a unique hetero-dimer through interaction of their C-terminal ankyrin domains. Binding of cpTat substrate by N-terminal intrinsically disordered regions of STT complex induces liquid-liquid phase separation. The multivalent nature of STT oligomer is critical for phase separation. STT-Hcf106 interactions reverse phase separation and facilitate cargo targeting and translocation across thylakoid membranes. Thus, the formation of phase-separated droplets emerges as a novel mechanism of intra-chloroplast cargo sorting. Our findings highlight a conserved mechanism of phase separation in regulating organelle biogenesis.

    DOI: 10.1016/j.cell.2020.02.045

    PubMed

    researchmap

  • pH-Induced Regulation of Excitation Energy Transfer in the Cyanobacterial Photosystem I Tetramer 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Tian-Yi Jiang, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   124 ( 10 )   1949 - 1954   2020年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c01136

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Excitation-Energy Transfer and Quenching in Diatom PSI-FCPI upon P700 Cation Formation 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   124 ( 8 )   1481 - 1486   2020年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.0c00715

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Time-resolved studies of metalloproteins using X-ray free electron laser radiation at SACLA 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Atsuhiro Shimada, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Takehiko Tosha, Hiroshi Sugimoto

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS   1864 ( 2 )   129466 - 129466   2020年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbagen.2019.129466

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • FTIR Microspectroscopic Analysis of the Water Oxidation Reaction in a Single Photosystem II Microcrystal 査読 国際誌

    Yuki Kato, Satoshi Haniu, Yoshiki Nakajima, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Takumi Noguchi

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   124 ( 1 )   121 - 127   2020年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.9b10154

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for the adaptation and function of chlorophyll f in photosystem I 査読 国際誌

    Koji Kato, Toshiyuki Shinoda, Ryo Nagao, Seiji Akimoto, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Min Chen, Suleyman I. Allakhverdiev, Jian-Ren Shen, Fusamichi Akita, Naoyuki Miyazaki, Tatsuya Tomo

    NATURE COMMUNICATIONS   11 ( 1 )   238 - 238   2020年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-019-13898-5

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Influence of osmolytes on the stability of thylakoid-based dye-sensitized solar cells 査読

    Roman A. Voloshin, Nathan G. Brad, Sergey K. Zharmukhamedov, Yashar M. Feyziyev, Irada M. Huseynova, Mohammad Mandi Najafpour, Jian-Ren Shen, T. Nejat Veziroglu, Barry D. Bruce, Suleyman Allakhverdiev

    INTERNATIONAL JOURNAL OF ENERGY RESEARCH   43 ( 14 )   8878 - 8889   2019年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/er.4866

    Web of Science

    researchmap

  • An alternative plant-like cyanobacterial ferredoxin with unprecedented structural and functional properties 査読 国際誌

    Taiki Motomura, Lidia Zuccarello, Pierre Setif, Alain Boussac, Yasufumi Umena, David Lemaire, Jatindra N. Tripathy, Miwa Sugiura, Rainer Hienerwadel, Jian-Ren Shen, Catherine Berthomieu

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1860 ( 11 )   148084 - 148084   2019年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2019.148084

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • An oxyl/oxo mechanism for oxygen-oxygen coupling in PSII revealed by an x-ray free-electron laser 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Keitaro Yamashita, Yoshiki Nakajima, Go Ueno, Hongjie Li, Takahiro Yamane, Kunio Hirata, Yasufumi Umena, Shinichiro Yonekura, Long-Jiang Yu, Hironori Murakami, Takashi Nomura, Tetsunari Kimura, Minoru Kubo, Seiki Baba, Takashi Kumasaka, Kensuke Tono, Makina Yabashi, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi, Masaki Yamamoto, Hideo Ago, Jian-Ren Shen

    SCIENCE   366 ( 6463 )   334 - +   2019年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.aax6998

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of a cyanobacterial photosystem I tetramer revealed by cryo-electron microscopy 査読 国際誌

    Koji Kato, Ryo Nagao, Tian-Yi Jiang, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Siu Kit Chan, Mai Watanabe, Masahiko Ikeuchi, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto, Naoyuki Miyazaki, Fusamichi Akita

    NATURE COMMUNICATIONS   10 ( 1 )   4929 - 4929   2019年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41467-019-12942-8

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of a C2S2M2N2 type PSII-LHCII supercomplex from the green alga Chlamydomonas reinhardtii 査読 国際誌

    Liangliang Shen, Zihui Huang, Shenghai Chang, Wenda Wang, Jingfen Wang, Tingyun Kuang, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Xing Zhang

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   116 ( 42 )   21246 - 21255   2019年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1912462116

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Spectral Properties and Excitation Relaxation of Novel Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Protein Complexes 査読 国際誌

    Yoshifumi Ueno, Ryo Nagao, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS   10 ( 17 )   5148 - 5152   2019年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b02093

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Elucidation of the entire Kok cycle for photosynthetic water oxidation by the large-scale quantum mechanics/molecular mechanics calculations: Comparison with the experimental results by the recent serial femtosecond crystallography 査読

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Koichi Miyagawa, Yasuteru Shigeta, Kizashi Yamaguchi

    CHEMICAL PHYSICS LETTERS   730   416 - 425   2019年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.cplett.2019.06.026

    Web of Science

    researchmap

  • Effects of excess light energy on excitation-energy dynamics in a pennate diatom Phaeodactylum tricornutum 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   141 ( 3 )   355 - 365   2019年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-019-00639-4

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Novel Mechanism of Cl-Dependent Proton Dislocation in Photosystem II (PSII): Hybrid Ab initio Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Molecular Dynamics Simulation 査読

    Atsushi Nakamura, Jiyoung Kang, Ryu-ichiro Terada, Hiori Kino, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Masaru Tateno

    JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN   88 ( 8 )   2019年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.7566/JPSJ.88.084802

    Web of Science

    researchmap

  • Structural basis for energy harvesting and dissipation in a diatom PSII-FCPII supercomplex 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Koji Kato, Takehiro Suzuki, Kentaro Ifuku, Ikuo Uchiyama, Yasuhiro Kashino, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Jian-Ren Shen, Naoyuki Miyazaki, Fusamichi Akita

    NATURE PLANTS   5 ( 8 )   890 - 901   2019年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41477-019-0477-x

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A manganese(ii) phthalocyanine under water-oxidation reaction: new findings 査読 国際誌

    Younes Mousazade, Mohammad Mahdi Najafpour, Robabeh Bagheri, Zvonko Jaglicic, Jitendra Pal Singh, Keun Hwa Chae, Zhenlun Song, Margarita V. Rodionova, Roman A. Voloshin, Jian-Ren Shen, Seeram Ramakrishna, Suleyman I. Allakhverdiev

    DALTON TRANSACTIONS   48 ( 32 )   12147 - 12158   2019年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c9dt01790a

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The pigment-protein network of a diatom photosystem II-light-harvesting antenna supercomplex 査読 国際誌

    Xiong Pi, Songhao Zhao, Wenda Wang, Desheng Liu, Caizhe Xu, Guangye Han, Tingyun Kuang, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    SCIENCE   365 ( 6452 )   463 - +   2019年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.aax4406

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • pH-Sensing Machinery of Excitation Energy Transfer in Diatom PSI-FCPI Complexes 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS   10 ( 13 )   3531 - 3535   2019年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b01314

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Proton-Coupled Electron Transfer of Plastoquinone Redox Reactions in Photosystem II: A Pump-Probe Ultraviolet Resonance Raman Study 査読 国際誌

    Jun Chen, Jinfan Chen, Ying Liu, Yang Zheng, Qingjun Zhu, Guangye Han, Jian-Ren Shen

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS   10 ( 12 )   3240 - 3247   2019年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.9b00959

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Biochemical characterization of photosystem I complexes having different subunit compositions of fucoxanthin chlorophyll a/c-binding proteins in the diatom Chaetoceros gracilis 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Fusamichi Akita, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Seiji Akimoto, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   140 ( 2 )   141 - 149   2019年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-018-0576-y

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Redox transients of P680 associated with the incremental chlorophyll-a fluorescence yield rises elicited by a series of saturating flashes in diuron-treated photosystem II core complex of Thermosynechococcus vulcanus 査読 国際誌

    Gabor Sipka, Pavel Mueller, Klaus Brettel, Melinda Magyar, Laszlo Kovacs, Qingjun Zhu, Yanan Xiao, Guangye Han, Petar H. Lambrev, Jian-Ren Shen, Gyozo Garab

    PHYSIOLOGIA PLANTARUM   166 ( 1 )   22 - 32   2019年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/ppl.12945

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Blocking backward reaction on hydrogen evolution cocatalyst in a photosystem II hybrid Z-scheme water splitting system 査読

    Zhen Li, Yu Qi, Wangyin Wang, Deng Li, Zheng Li, Yanan Xiao, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Can Li

    CHINESE JOURNAL OF CATALYSIS   40 ( 4 )   486 - 494   2019年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/S1872-2067(19)63311-5

    Web of Science

    researchmap

  • Phospholipid distributions in purple phototrophic bacteria and LH1-RC core complexes 査読

    S. Nagatsuma, K. Gotou, T. Yamashita, L.-J. Yu, J.-R. Shen, M.T. Madigan, Y. Kimura, Z.-Y. Wang-Otomo

    Biochimica Biophysica Acta   1860   461 - 468   2019年4月

     詳細を見る

  • Spin, Valence, and Structural Isomerism in the S-3 State of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II as a Manifestation of Multimetallic Cooperativity 査読 国際誌

    Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Takayoshi Suzuki, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION   15 ( 4 )   2375 - 2391   2019年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jctc.8b01055

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Cobalt/Cobalt Oxide Surface for Water Oxidation 査読

    Hadi Feizi, Robabeh Bagheri, Zhenlun Song, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev, Mohammad Mahdi Najafpour

    ACS SUSTAINABLE CHEMISTRY & ENGINEERING   7 ( 6 )   6093 - 6105   2019年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acssuschemeng.8b06269

    Web of Science

    researchmap

  • Site-directed mutagenesis of two amino acid residues in cytochrome b559 α subunit that interact with a phosphatidylglycerol molecule (PG772) induces quinone-dependent inhibition of photosystem II activity. 査読 国際誌

    Endo K, Kobayashi K, Wang HT, Chu HA, Shen JR, Wada H

    Photosynthesis research   139 ( 1-3 )   267 - 279   2019年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-018-0555-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Ultrafast Excitation Energy Dynamics in a Diatom Photosystem I-Antenna Complex: A Femtosecond Fluorescence Upconversion Study 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Kohei Kagatani, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   123 ( 12 )   2673 - 2678   2019年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b12086

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of a green algal photosystem I in complex with a large number of light-harvesting complex I subunits 査読 国際誌

    Xiaochun Qin, Xiong Pi, Wenda Wang, Guangye Hang, Lixia Zhu, Mingmei Liu, Linpeng Cheng, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang, Sen-Fang Sui

    NATURE PLANTS   5 ( 3 )   263 - 272   2019年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41477-019-0379-y

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Properties and structure of a low-potential, penta-heme cytochrome c(552) from a thermophilic purple sulfur photosynthetic bacterium Thermochromatium tepidum 査読 国際誌

    Jing-Hua Chen, Long-Jiang Yu, Alain Boussac, Zheng-Yu Wang-Otomo, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   139 ( 1-3 )   281 - 293   2019年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-018-0507-y

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural basis for blue-green light harvesting and energy dissipation in diatoms 査読 国際誌

    Wenda Wang, Long-Jiang Yu, Caizhe Xu, Takashi Tomizaki, Songhao Zhao, Yasufumi Umena, Xiaobo Chen, Xiaochun Qin, Yueyong Xin, Michihiro Suga, Guangye Han, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen

    SCIENCE   363 ( 6427 )   598 - +   2019年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.aav0365

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Low-Energy Chlorophylls in Fucoxanthin Chlorophyll a/c-Binding Protein Conduct Excitation Energy Transfer to Photosystem I in Diatoms 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Makio Yokono, Yoshifumi Ueno, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   123 ( 1 )   66 - 70   2019年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b09253

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A transparent electrode with water-oxidizing activity 査読

    Gouhar Azadi, Robabeh Bagheri, Rahman Bikas, Younes Mousazade, Junfeng Cui, Zhenlun Song, Vasyl Kinzhybalo, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev, Mohammad Mahdi Najafpour

    INTERNATIONAL JOURNAL OF HYDROGEN ENERGY   43 ( 51 )   22896 - 22904   2018年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ijhydene.2018.10.146

    Web of Science

    researchmap

  • Novel features of LH1-RC from Thermochromatium tepidum revealed from its atomic resolution structure 査読 国際誌

    Long-Jiang Yu, Michihiro Suga, Zheng-Yu Wang-Otomo, Jian-Ren Shen

    FEBS JOURNAL   285 ( 23 )   4359 - 4366   2018年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1111/febs.14679

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Thylakoid membrane lipid sulfoquinovosyl-diacylglycerol (SQDG) is required for full functioning of photosystem II in Thermosynechococcus elongatus 査読 国際誌

    Yoshiki Nakajima, Yasufumi Umena, Ryo Nagao, Kaichiro Endo, Koichi Kobayashi, Fusamichi Akita, Michihiro Suga, Hajime Wada, Takumi Noguchi, Jian-Ren Shen

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   293 ( 38 )   14786 - 14797   2018年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.RA118.004304

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Alterations of pigment composition and their interactions in response to different light conditions in the diatom Chaetoceros gracilis probed by time-resolved fluorescence spectroscopy 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Yoshifumi Ueno, Makio Yokono, Jian-Ren Shen, Seiji Akimoto

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1859 ( 7 )   524 - 530   2018年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2018.04.003

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A siphonous morphology affects light-harvesting modulation in the intertidal green macroalga Bryopsis corticulans (Ulvophyceae) 査読 国際誌

    Vasco Giovagnetti, Guangye Han, Maxwell A. Ware, Petra Ungerer, Xiaochun Qin, Wen-Da Wang, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen, Alexander V. Ruban

    PLANTA   247 ( 6 )   1293 - 1306   2018年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s00425-018-2854-5

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Fourier Transform Infrared Analysis of the S-State Cycle of Water Oxidation in the Microcrystals of Photosystem II 査読 国際誌

    Yuki Kato, Fusamichi Akita, Yoshiki Nakajima, Michihiro Suga, Yasufumi Umena, Jian-Ren Shen, Takumi Noguchi

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY LETTERS   9 ( 9 )   2121 - 2126   2018年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpclett.8b00638

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of photosynthetic LH1-RC supercomplex at 1.9 angstrom resolution 査読 国際誌

    Long-Jiang Yu, Michihiro Suga, Zheng-Yu Wang-Otomo, Jian-Ren Shen

    NATURE   556 ( 7700 )   209 - +   2018年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41586-018-0002-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Vyacheslav (Slava) Klimov (1945-2017): A scientist par excellence, a great human being, a friend, and a Renaissance man 査読 国際誌

    Photosynth. Res.   136 ( 1 )   1 - 16   2018年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-017-0440-5

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Unique organization of photosystem I-light-harvesting supercomplex revealed by cryo-EM from a red alga 査読 国際誌

    Xiong Pi, Lirong Tian, Huai-En Dai, Xiaochun Qin, Lingpeng Cheng, Tingyun Kuang, Sen-Fang Sui, Jian-Ren Shen

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   115 ( 17 )   4423 - 4428   2018年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1722482115

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Rate-limiting steps in the dark-to-light transition of Photosystem II - revealed by chlorophyll-a fluorescence induction 査読 国際誌

    Melinda Magyar, Gabor Sipka, Laszlo Kovacs, Bettina Ughy, Qingjun Zhu, Guangye Han, Vladimir Spunda, Petar H. Lambrev, Jian-Ren Shen, Gyozo Garab

    SCIENTIFIC REPORTS   8 ( 1 )   2755 - 2755   2018年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/s41598-018-21195-2

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structured near-infrared Magnetic Circular Dichroism spectra of the Mn4CaO5 cluster of PSII in T. vulcanus are dominated by Mn(IV) d-d 'spin-flip' transitions 査読 国際誌

    Jennifer Morton, Maria Chrysina, Vincent S. J. Craig, Fusamichi Akita, Yoshiki Nakajima, Wolfgang Lubitz, Nicholas Cox, Jian-Ren Shen, Elmars Krausz

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1859 ( 2 )   88 - 98   2018年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2017.10.004

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Purification of fully active and crystallizable photosystem II from thermophilic cyanobacteria 査読

    Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen

    Methods in Enzymology   613   1 - 16   2018年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Academic Press Inc.  

    DOI: 10.1016/bs.mie.2018.10.002

    Scopus

    PubMed

    researchmap

  • An aluminum/cobalt/iron/nickel alloy as a precatalyst for water oxidation 査読

    Mohammad Mandi Najafpour, Somayeh Mehrabani, Robabeh Bagheri, Zhenlun Song, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    INTERNATIONAL JOURNAL OF HYDROGEN ENERGY   43 ( 4 )   2083 - 2090   2018年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ijhydene.2017.12.025

    Web of Science

    researchmap

  • Probing structure-function relationships in early events in photosynthesis using a chimeric photocomplex 査読 国際誌

    Kenji V. P. Nagashima, Mai Sasaki, Kanako Hashimoto, Shinichi Takaichi, Sakiko Nagashima, Long-Jiang Yu, Yuto Abe, Kenta Gotou, Tomoaki Kawakami, Mizuki Takenouchi, Yuuta Shibuya, Akira Yamaguchi, Takashi Ohno, Jian-Ren Shen, Kazuhito Inoue, Michael T. Madigan, Yukihiro Kimura, Zheng-Yu Wang-Otomo

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   114 ( 41 )   10906 - 10911   2017年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1703584114

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Functional role of Lys residues of Psb31 in electrostatic interactions with diatom photosystem II 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Jian-Ren Shen, Tatsuya Tomo

    FEBS LETTERS   591 ( 20 )   3259 - 3264   2017年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/1873-3468.12830

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Isolation and characterization of PSI-LHCI super-complex and their sub-complexes from a red alga Cyanidioschyzon merolae 査読 国際誌

    Lirong Tian, Zheyi Liu, Fangjun Wang, Liangliang Shen, Jinghua Chen, Lijing Chang, Songhao Zhao, Guangye Han, Wenda Wang, Tingyun Kuang, Xiaochun Qin, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   133 ( 1-3 )   201 - 214   2017年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-017-0384-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the S-3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Comparison between water-inserted and no water-inserted structures 査読 国際誌

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Takahito Nakajima, Yasuteru Shigeta, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    FARADAY DISCUSSIONS   198   83 - 106   2017年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c6fd00230g

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Biological approaches to artificial photosynthesis, fundamental processes and theoretical approaches: general discussion 査読 国際誌

    Vincent Artero, Leif Hammarstrom, Fengtao Fan, Dong Ryeol Whang, Jose Martinez, Anthony Harriman, Takumi Noguchi, Joshua Karlsson, Peter Summers, Shigeru Itoh, Richard Cogdell, Alexander Kibler, Johannes Ehrmaier, Hitoshi Tamiaki, Etsuko Fujita, Seigo Shima, Shunya Yoshino, Haruo Inoue, Michael Wasielewski, Thomas Corry, Devens Gust, Flavia Cassiola, Hitoshi Ishida, Katsuhiko Takagi, Sang Ook Kang, Can Li, Licheng Sun, Hyunwoong Park, Hideki Hashimoto, Yutaka Amao, Eun Jin Son, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    FARADAY DISCUSSIONS   198   147 - 168   2017年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c7fd90016c

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Molecular catalysts for artificial photosynthesis: general discussion 査読 国際誌

    Mei Wang, Vincent Artero, Leif Hammarstrom, Jose Martinez, Joshua Karlsson, Devens Gust, Peter Summers, Charles Machan, Peter Brueggeller, Christopher D. Windle, Yosuke Kageshima, Richard Cogdell, Kristine Rodulfo Tolod, Alexander Kibler, Dogukan Hazar Apaydin, Etsuko Fujita, Johannes Ehrmaier, Seigo Shima, Elizabeth Gibson, Ferdi Karadas, Anthony Harriman, Haruo Inoue, Akihiko Kudo, Tomoaki Takayama, Michael Wasielewski, Flavia Cassiola, Masayuki Yagi, Hitoshi Ishida, Federico Franco, Sang Ook Kang, Daniel Nocera, Can Li, Fabio Di Fonzo, Hyunwoong Park, Licheng Sun, Tohru Setoyama, Young Soo Kang, Osamu Ishitani, Jian-Ren Shen, Ho-Jin Son, Shigeyuki Masaoka

    FARADAY DISCUSSIONS   198   353 - 395   2017年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c7fd90017a

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure and redox properties of a novel cyanobacterial heme protein with a His/Cys heme axial ligation and a Per-Arnt-Sim (PAS)-like domain 査読 国際誌

    Taiki Motomura, Michihiro Suga, Rainer Hienerwadel, Akiko Nakagawa, Thanh-Lan Lai, Wolfgang Nitschke, Takahiro Kuma, Miwa Sugiura, Alain Boussac, Jian-Ren Shen

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   292 ( 23 )   9599 - 9612   2017年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M116.746263

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Ultrafast energy transfer within the photosystem II core complex 査読 国際誌

    Jie Pan, Andrius Gelzinis, Vladimir Chorosajev, Mikas Vengris, S. Seckin Senlik, Jian-Ren Shen, Leonas Valkunas, Darius Abramavicius, Jennifer P. Ogilvie

    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS   19 ( 23 )   15356 - 15367   2017年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c7cp01673e

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Light-induced structural changes and the site of O=O bond formation in PSII caught by XFEL 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Michihiro Sugahara, Minoru Kubo, Yoshiki Nakajima, Takanori Nakane, Keitaro Yamashita, Yasufumi Umena, Makoto Nakabayashi, Takahiro Yamane, Takamitsu Nakano, Mamoru Suzuki, Tetsuya Masuda, Shigeyuki Inoue, Tetsunari Kimura, Takashi Nomura, Shinichiro Yonekura, Long-Jiang Yu, Tomohiro Sakamoto, Taiki Motomura, Jing-Hua Chen, Yuki Kato, Takumi Noguchi, Kensuke Tono, Yasumasa Joti, Takashi Kameshima, Takaki Hatsui, Eriko Nango, Rie Tanaka, Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Ayumi Yamashita, Masaki Yamamoto, Osamu Nureki, Makina Yabashi, Tetsuya Ishikawa, So Iwata, Jian-Ren Shen

    NATURE   543 ( 7643 )   131 - +   2017年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/nature21400

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • RESOLUTION BEYOND THE DIFFRACTION LIMIT 査読

    Jian-Ren Shen, Stephen D. Bartlett, Amro Zayed, Abigail C. Allwood, Barbara Mazzolai, Virgilio Mattoli, Matthias Minderer, Christopher D. Harvey, Flavio Donato, Edvard I. Moser, M. Coleman Miller, Susan L. Williams

    NATURE   540 ( 7634 )   536 - 537   2016年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/540536a

    Web of Science

    researchmap

  • Probing the Lysine Proximal Microenvironments within Membrane Protein Complexes by Active Dimethyl Labeling and Mass Spectrometry 査読 国際誌

    Ye Zhou, Yue Wu, Mingdong Yao, Zheyi Liu, Jin Chen, Jun Chen, Lirong Tian, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Fangjun Wang

    ANALYTICAL CHEMISTRY   88 ( 24 )   12060 - 12065   2016年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.analchem.6b02502

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Spatially Separated Photosystem II and a Silicon Photoelectrochemical Cell for Overall Water Splitting: A Natural-Artificial Photosynthetic Hybrid 査読 国際誌

    Wangyin Wang, Hong Wang, Qingjun Zhu, Wei Qin, Guangye Han, Jian-Ren Shen, Xu Zong, Can Li

    ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION   55 ( 32 )   9229 - 9233   2016年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1002/anie.201604091

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure and energy transfer pathways of the plant photosystem I-LHCI supercomplex 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Xiaochun Qin, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen

    CURRENT OPINION IN STRUCTURAL BIOLOGY   39   46 - 53   2016年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.sbi.2016.04.004

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Oxygen-Evolving Porous Glass Plates Containing the Photosynthetic Photosystem II Pigment-Protein Complex 査読 国際誌

    Tomoyasu Noji, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Takehisa Dewa, Mamoru Nango, Nobuo Kamiya, Shigeru Itoh, Tetsuro Jin

    LANGMUIR   32 ( 31 )   7796 - 7805   2016年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.langmuir.6b02106

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure of plant PSI-LHCI supercomplex and its energy transfer mechanism

    Xiaochun Qin, Michihiro Suga, Tingyun Kuang, Jianren Shen

    Kexue Tongbao/Chinese Science Bulletin   61 ( 19 )   2163 - 2175   2016年7月

     詳細を見る

    記述言語:中国語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Chinese Academy of Sciences  

    DOI: 10.1360/N972016-00217

    Scopus

    researchmap

  • Current Insights to Enhance Hydrogen Production by Photosynthetic Organisms

    Roshan Sharma Poudyal, Indira Tiwari, Mohammad Mahdi Najafpour, Dmitry A. Los, Robert Carpentier, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    Hydrogen Science and Engineering: Materials, Processes, Systems and Technology   1   461 - 487   2016年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Wiley-VCH Verlag  

    DOI: 10.1002/9783527674268.ch20

    Scopus

    researchmap

  • Polypeptide and Mn-Ca oxide: Toward a biomimetic catalyst for water-splitting systems 査読

    Mohammad Mahdi Najafpour, Mohadeseh Zarei Ghobadi, Bahram Sarvi, Sepideh Madadkhani, Davood Jafarian Sedigh, Parvin Rafighi, Mojtaba Tavahodi, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    INTERNATIONAL JOURNAL OF HYDROGEN ENERGY   41 ( 12 )   5504 - 5512   2016年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.ijhydene.2016.01.131

    Web of Science

    researchmap

  • Geometric and electronic structures of the synthetic Mn4CaO4 model compound mimicking the photosynthetic oxygen-evolving complex 査読 国際誌

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS   18 ( 16 )   11330 - 11340   2016年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c5cp07226c

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Manganese Compounds as Water-Oxidizing Catalysts: From the Natural Water-Oxidizing Complex to Nanosized Manganese Oxide Structures 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Gernot Renger, Malgorzata Holynska, Atefeh Nemati Moghaddam, Eva-Mari Aro, Robert Carpentier, Hiroshi Nishihara, Julian J. Eaton-Rye, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    CHEMICAL REVIEWS   116 ( 5 )   2886 - 2936   2016年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.chemrev.5b00340

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Novel Features of Eukaryotic Photosystem II Revealed by Its Crystal Structure Analysis from a Red Alga 査読 国際誌

    Hideo Ago, Hideyuki Adachi, Yasufumi Umena, Takayoshi Tashiro, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Lirong Tian, Guangye Han, Tingyun Kuang, Zheyi Liu, Fangjun Wang, Hanfa Zou, Isao Enami, Masashi Miyano, Jian-Ren Shen

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   291 ( 11 )   5676 - 5687   2016年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M115.711689

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • CRYSTALLOGRAPHY Resolution beyond the diffraction limit 査読 国際誌

    Jian-Ren Shen

    NATURE   530 ( 7589 )   168 - 169   2016年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/530168a

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Chemical Equilibrium Models for the S-3 State of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II 査読 国際誌

    Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    INORGANIC CHEMISTRY   55 ( 2 )   502 - 511   2016年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.inorgchem.5b02471

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The effect of lanthanum(III) and cerium(III) ions between layers of manganese oxide on water oxidation 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Mohsen Abbasi Isaloo, Malgorzata Holynska, Jian-Ren Shen, Suleyman Allakhverdiev

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   126 ( 2-3 )   489 - 498   2015年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-015-0098-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Special issue on Regulation of the Photosynthetic Systems in honor of Tingyun Kuang 国際誌

    Congming Lu, Jian-Ren Shen, Lixin Zhang

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   126 ( 2-3 )   185 - 188   2015年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-015-0191-0

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The effect of lanthanum(III) and cerium(III) ions between layers of manganese oxide on water oxidation (vol 126, pg 489, 2015) 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Mohsen Abbasi Isaloo, Malgorzata Holynska, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   126 ( 2-3 )   499 - 499   2015年12月

     詳細を見る

  • Site-directed mutagenesis of amino acid residues of D1 protein interacting with phosphatidylglycerol affects the function of plastoquinone Q(B) in photosystem II 査読 国際誌

    Kaichiro Endo, Naoki Mizusawa, Jian-Ren Shen, Masato Yamada, Tatsuya Tomo, Hirohisa Komatsu, Masami Kobayashi, Koichi Kobayashi, Hajime Wada

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   126 ( 2-3 )   385 - 397   2015年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-015-0150-9

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Proton Matrix ENDOR Studies on Ca2+-depleted and Sr2+-substituted Manganese Cluster in Photosystem II 査読 国際誌

    Hiroki Nagashinna, Yoshiki Nakajima, Jian-Ren Shen, Hiroyuki Mino

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   290 ( 47 )   28166 - 28174   2015年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M115.675496

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Strong Coupling between the Hydrogen Bonding Environment and Redox Chemistry during the S-2 to S-3 Transition in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II 査読 国際誌

    Hiroshi Isobe, Mitsuo Shoji, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   119 ( 43 )   13922 - 13933   2015年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/acs.jpcb.5b05740

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The biological water-oxidizing complex at the nano-bio interface 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Mohadeseh Zarei Ghobadi, Anthony W. Larkum, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Alliakhverdiev

    TRENDS IN PLANT SCIENCE   20 ( 9 )   559 - 568   2015年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.tplants.2015.06.005

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • High-resolution native structure analyses of supramacromolecular complexes susceptible to radiation damage 査読

    Hideo Ago, Kunio Hirata, Go Ueno, Masaki Yamamoto, Kyoko Shinzawa-Itoh, Tomitake Tsukihara, Shinya Yoshikawa, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen

    Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances   71 ( a1 )   s15 - s15   2015年8月

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:International Union of Crystallography ({IUCr})  

    DOI: 10.1107/s2053273315099751

    researchmap

  • On the guiding principles for lucid understanding of the damage-free S-1 structure of the CaMn4O5 cluster in the oxygen evolving complex of photosystem II 査読

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    CHEMICAL PHYSICS LETTERS   627   44 - 52   2015年5月

     詳細を見る

  • Structural basis for energy transfer pathways in the plant PSI-LHCI supercomplex 査読 国際誌

    Xiaochun Qin, Michihiro Suga, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen

    SCIENCE   348 ( 6238 )   989 - 995   2015年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.aab0214

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • A synthetic Mn4Ca-cluster mimicking the oxygen-evolving center of photosynthesis 査読 国際誌

    Chunxi Zhang, Changhui Chen, Hongxing Dong, Jian-Ren Shen, Holger Dau, Jingquan Zhao

    SCIENCE   348 ( 6235 )   690 - 693   2015年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1126/science.aaa6550

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Damage Management in Water-Oxidizing Catalysts: From Photosystem II to Nanosized Metal Oxides 査読

    Mohammad Mahdi Najafpour, Monika Fekete, Davood Jafarian Sedigh, Eva-Mari Aro, Robert Carpentier, Julian J. Eaton-Rye, Hiroshi Nishihara, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev, Leone Spiccia

    ACS CATALYSIS   5 ( 3 )   1499 - 1512   2015年3月

     詳細を見る

  • Theoretical studies of the damage- free S-1 structure of the CaMn4O5 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II 査読

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    CHEMICAL PHYSICS LETTERS   623   1 - 7   2015年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.cplett.2015.01.030

    Web of Science

    researchmap

  • Theoretical modelling of biomolecular systems I. Large-scale QM/MM calculations of hydrogen-bonding networks of the oxygen evolving complex of photosystem II 査読

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

    MOLECULAR PHYSICS   113 ( 3-4 )   359 - 384   2015年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1080/00268976.2014.960021

    Web of Science

    researchmap

  • Biochemical and structural study of Arabidopsis hexokinase 1 査読 国際誌

    Juan Feng, Shun Zhao, Xuemin Chen, Wenda Wang, Wei Dong, Jinghua Chen, Jian-Ren Shen, Lin Liu, Tingyun Kuang

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY   71 ( Pt 2 )   367 - 375   2015年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S1399004714026091

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Comparison of nano-sized Mn oxides with the Mn cluster of photosystem II as catalysts for water oxidation 査読 国際誌

    Mohammad Mandi Najafpour, Mohadeseh Zarei Ghobadi, Behzad Haghighi, Tatsuya Tomo, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiey

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1847 ( 2 )   294 - 306   2015年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2014.11.006

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Optical identification of the long-wavelength (700-1700 nm) electronic excitations of the native reaction centre, Mn4CaO5 cluster and cytochromes of photosystem II in plants and cyanobacteria 査読 国際誌

    Jennifer Morton, Fusamichi Akita, Yoshild Nakajima, Jian-Ren Shen, Elmars Krausz

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1847 ( 2 )   153 - 161   2015年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2014.11.003

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Native structure of photosystem II at 1.95 angstrom resolution viewed by femtosecond X-ray pulses 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Kunio Hirata, Go Ueno, Hironori Murakami, Yoshiki Nakajima, Tetsuya Shimizu, Keitaro Yamashita, Masaki Yamamoto, Hideo Ago, Jian-Ren Shen

    NATURE   517 ( 7532 )   99 - U265   2015年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/nature13991

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Isolation and characterization of a PSI-LHCI super-complex and its sub-complexes from a siphonaceous marine green alga, Bryopsis Corticulans 査読 国際誌

    Xiaochun Qin, Wenda Wang, Lijing Chang, Jinghua Chen, Peng Wang, Jianping Zhang, Yikun He, Tingyun Kuang, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   123 ( 1 )   61 - 76   2015年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-014-0039-z

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Direct electron transfer from photosystem II to hematite in a hybrid photoelectrochemical cell 査読 国際誌

    Wangyin Wang, Zhiliang Wang, Qingjun Zhu, Guangye Han, Chunmei Ding, Jun Chen, Jian-Ren Shen, Can Li

    CHEMICAL COMMUNICATIONS   51 ( 95 )   16952 - 16955   2015年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c5cc06900a

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The Structure of Photosystem II and the Mechanism of Water Oxidation in Photosynthesis 査読 国際誌

    Jian-Ren Shen

    ANNUAL REVIEW OF PLANT BIOLOGY, VOL 66   66   23 - 48   2015年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文  

    DOI: 10.1146/annurev-arplant-050312-120129

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Durability of oxygen evolution of photosystem II incorporated into lipid bilayers 査読

    Tomoyasu Noji, Masaharu Kondo, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Mamoru Nango, Takehisa Dewa

    RESEARCH ON CHEMICAL INTERMEDIATES   40 ( 9 )   3231 - 3241   2014年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11164-014-1829-9

    Web of Science

    researchmap

  • Water exchange in manganese-based water-oxidizing catalysts in photosynthetic systems: From the water-oxidizing complex in photosystem II to nano-sized manganese oxides 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Mohsen Abbasi Isaloo, Julian J. Eaton-Rye, Tatsuya Tomo, Hiroshi Nishihara, Kimiyuki Satoh, Robert Carpentier, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1837 ( 9 )   1395 - 1410   2014年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2014.03.008

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Photosynthesis research for sustainability: Keys to produce clean energy 査読 国際誌

    Suleyman I. Allakhverdiev, Jian-Ren Shen

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1837 ( 9 )   1377 - 1383   2014年9月

     詳細を見る

  • Two new C-type cytochromes found in cyanobacteria: Tll0287 and PsbV2 査読

    Thanh-Lan Lai, Miwa Sugiura, Michihiro Suga, Jian-Ren Shen, Alain Boussac

    JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY   19   S838 - S838   2014年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語  

    Web of Science

    researchmap

  • A nano-sized manganese oxide in a protein matrix as a natural water-oxidizing site 査読 国際誌

    Mohammad Mandi Najafpour, Mohadeseh Zarei Ghobadi, Behzad Haghighi, Tatsuya Tomo, Robert Carpentier, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    PLANT PHYSIOLOGY AND BIOCHEMISTRY   81   3 - 15   2014年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.plaphy.2014.01.020

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Unraveling the Molecular Dynamics of Thylakoids Under Light Stress 査読

    Yasusi Yamamoto, Jian-Ren Shen, Yuichiro Takahashi

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   55 ( 7 )   1203 - 1205   2014年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcu085

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Determination of damage-free crystal structure of an X-ray-sensitive protein using an XFEL 査読 国際誌

    Kunio Hirata, Kyoko Shinzawa-Itoh, Naomine Yano, Shuhei Takemura, Koji Kato, Miki Hatanaka, Kazumasa Muramoto, Takako Kawahara, Tomitake Tsukihara, Eiki Yamashita, Kensuke Tono, Go Ueno, Takaaki Hikima, Hironori Murakami, Yuichi Inubushi, Makina Yabashi, Tetsuya Ishikawa, Masaki Yamamoto, Takashi Ogura, Hiroshi Sugimoto, Jian-Ren Shen, Shinya Yoshikawa, Hideo Ago

    NATURE METHODS   11 ( 7 )   734 - U174   2014年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/NMETH.2962

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Water Oxidation Chemistry of a Synthetic Dinuclear Ruthenium Complex Containing Redox-Active Quinone Ligands 査読 国際誌

    Hiroshi Isobe, Koji Tanaka, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi

    INORGANIC CHEMISTRY   53 ( 8 )   3973 - 3984   2014年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ic402340d

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Determination of the PS I content of PS II core preparations using selective emission: A new emission of PS II at 780 nm 査読 国際誌

    Jennifer Morton, Jeremy Hall, Paul Smith, Fusamichi Akita, Faisal Hammad Mekky Koua, Jian-Ren Shen, Elmars Krausz

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1837 ( 1 )   167 - 177   2014年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2013.09.008

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The structure and activation of substrate water molecules in Sr2+-substituted photosystem II 査読 国際誌

    Ruchira Chatterjee, Sergey Milikisiyants, Christopher S. Coates, Faisal H. M. Koua, Jian-Ren Shen, K. V. Lakshmi

    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS   16 ( 38 )   20834 - 20843   2014年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c4cp03082f

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Hydration of the oxygen-evolving complex of photosystem II probed in the dark-stable S-1 state using proton NMR dispersion profiles 査読 国際誌

    Guangye Han, Yang Huang, Faisal Hammad Mekky Koua, Jian-Ren Shen, Per-Olof Westlund, Johannes Messinger

    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS   16 ( 24 )   11924 - 11935   2014年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c3cp55232b

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Photosynthesis: from natural to artificial 国際誌

    Johannes Messinger, Wolfgang Lubitz, Jian-Ren Shen

    PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS   16 ( 24 )   11810 - 11811   2014年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c4cp90053g

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • 2P257 光合成酸素発生中心(PSII-OEC)の立体構造と電荷状態変化についての理論的研究(18B. 光生物:光合成,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

    Shoji Mitsuo, Isobe Hiroshi, Yamanaka Shusuke, Shen Jian-Ren, Yamaguchi Kizashi

    生物物理   54 ( 1 )   S237   2014年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.54.S237_5

    CiNii Article

    researchmap

  • 2P258 Ca除去とSr置換をしたMnクラスターのENDOR法による研究(18B. 光生物:光合成,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

    Nagashima Hiroki, Nakajima Yoshiki, Shen Jian-Ren, Mino Hiroyuki

    生物物理   54 ( 1 )   S237   2014年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.54.S237_6

    CiNii Article

    researchmap

  • Generalized approximate spin projection calculations of effective exchange integrals of the CaMn4O5 cluster in the S1 and S3 states of the oxygen evolving complex of photosystem II 査読

    H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, H. Mino, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

    Phys. Chem. Chem. Phys.   16 ( 24 )   11911 - 11923   2014年

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Royal Society of Chemistry (RSC)  

    <p>Broken-symmetry UB3LYP calculations have elucidated structural symmetry-breaking in the S1 and S3 states of the oxygen evolution complex (OEC) of photosystem II (PSII), providing the right (RO)- and left (LO)-opened structures.</p>

    DOI: 10.1039/c4cp00282b

    researchmap

  • Evidence for an Unprecedented Histidine Hydroxyl Modification on D2-His336 in Photosystem II of Thermosynechoccocus vulcanus and Thermosynechoccocus elongatus 査読 国際誌

    Miwa Sugiura, Kazumi Koyama, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Alain Boussac

    BIOCHEMISTRY   52 ( 52 )   9426 - 9431   2013年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi401213m

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Spectral and functional studies on siphonaxanthin-type light-harvesting complex of photosystem II from Bryopsis corticulans 査読 国際誌

    Wenda Wang, Xiaochun Qin, Min Sang, Dongqin Chen, Kebin Wang, Rongchen Lin, Congming Lu, Jian-Ren Shen, Tingyun Kuang

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   117 ( 1-3 )   267 - 279   2013年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-013-9808-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Gold or silver deposited on layered manganese oxide: a functional model for the water-oxidizing complex in photosystem II 査読 国際誌

    Mohammad Mahdi Najafpour, Fahimeh Rahimi, Davood Jafarian Sedigh, Robert Carpentier, Julian J. Eaton-Rye, Jian-Ren Shen, Suleyman I. Allakhverdiev

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   117 ( 1-3 )   423 - 429   2013年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-013-9899-x

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure at 1.5 angstrom resolution of the PsbV2 cytochrome from the cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus 査読 国際誌

    Michihiro Suga, Thanh-Lan Lai, Miwa Sugiura, Jian-Ren Shen, Alain Boussac

    FEBS LETTERS   587 ( 19 )   3267 - 3272   2013年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.febslet.2013.08.023

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Special issues on Photosynthesis Education honoring Govindjee 国際誌

    Suleyman I. Allakhverdiev, Jian-Ren Shen, Gerald E. Edwards

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   116 ( 2-3 )   107 - 110   2013年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-013-9913-3

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal Structure of Psb31, a Novel Extrinsic Protein of Photosystem II from a Marine Centric Diatom and Implications for Its Binding and Function 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Michihiro Suga, Ayako Niikura, Akinori Okumura, Faisal Hammad Mekky Koua, Takehiro Suzuki, Tatsuya Tomo, Isao Enami, Jian-Ren Shen

    BIOCHEMISTRY   52 ( 38 )   6646 - 6652   2013年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi400770d

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Application of Peptide Gemini Surfactants as Novel Solubilization Surfactants for Photosystems I and II of Cyanobacteria 査読 国際誌

    Shuhei Koeda, Katsunari Umezaki, Tomoyasu Noji, Atsushi Ikeda, Keisuke Kawakami, Masaharu Kondo, Yasushi Yamamoto, Jian-Ren Shen, Keijiro Taga, Takehisa Dewa, Shigeru Ito, Mamoru Nango, Toshiki Tanaka, Toshihisa Mizuno

    LANGMUIR   29 ( 37 )   11667 - 11680   2013年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/la402167v

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Photosystem II Does Not Possess a Simple Excitation Energy Funnel: Time-Resolved Fluorescence Spectroscopy Meets Theory 査読 国際誌

    Yutaka Shibata, Shunsuke Nishi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Thomas Renger

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   135 ( 18 )   6903 - 6914   2013年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja312586p

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Electronic structure of S-2 state of the oxygen-evolving complex of photosystem II studied by PELDOR 査読 国際誌

    Mizue Asada, Hiroki Nagashima, Faisal Hammad Mekky Koua, Jian-Ren Shen, Asako Kawamori, Hiroyuki Mino

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1827 ( 3 )   438 - 445   2013年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2012.12.011

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of Sr-substituted photosystem II at 2.1 angstrom resolution and its implications in the mechanism of water oxidation 査読 国際誌

    Faisal Hammad Mekky Koua, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   110 ( 10 )   3889 - 3894   2013年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.1219922110

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Water oxidation and water-oxidizing complex in cyanobacteria 査読

    Mohammad Mahdi Najafpour, Atefeh Nemati Moghaddam, Jian-Ren Shen, Govindjee

    Stress Biology of Cyanobacteria: Molecular Mechanisms to Cellular Responses   41 - 60   2013年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:CRC Press  

    DOI: 10.1201/b13853

    Scopus

    researchmap

  • Structural Basis of Photosynthetic Water-Splitting

    Jian-Ren Shen, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya

    SOLAR CHEMICAL ENERGY STORAGE (SOLCHES)   1568   31 - 34   2013年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

    DOI: 10.1063/1.4848085

    Web of Science

    researchmap

  • 1SAA-03 QM/MM法による光合成酸素発生中心S1状態の電子状態解析(1SAA 新学術領域「人工光合成による太陽光エネルギーの物質変換 : 実用化に向けての異分野融合」共催,光駆動水分解の分子機構 : 光化学系IIと人工光合成,シンポジウム,日本生物物理学会第51回年会(2013年度))

    庄司 光男, 礒部 寛, 山中 秀介, 神谷 信夫, 沈 建仁, 山口 兆

    生物物理   53 ( 1 )   S82   2013年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.53.S82_4

    CiNii Article

    researchmap

  • The position and orientation of active carotenoid in photosystem II

    Asako Kawamori, Hiroyuki Mino, Jianren Shen

    Advanced Topics in Science and Technology in China   64 - 66   2013年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer  

    DOI: 10.1007/978-3-642-32034-7_13

    Scopus

    researchmap

  • Electronic structure of the CaMn4O5 cluster in the PSII system refined to the 1.9 Å X-ray resolution. Possible mechanisms of photosynthetic water splitting

    S. Yamanaka, K. Kanda, H. Isobe, K. Nakata, Y. Umena, K. Kawakami, J. R. Shen, N. Kamiya, M. Okumura, T. Takada, H. Nakamura, K. Yamaguchi

    Advanced Topics in Science and Technology in China   250 - 254   2013年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Springer  

    DOI: 10.1007/978-3-642-32034-7_52

    Scopus

    researchmap

  • Photosystem II and the unique role of bicarbonate: A historical perspective 査読 国際誌

    Dmitriy Shevela, Julian J. Eaton-Rye, Jian-Ren Shen, Govindjee

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1817 ( 8 )   1134 - 1151   2012年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2012.04.003

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Cationic state distribution over the chlorophyll d-containing P-D1/P-D2 Pair in photosystem II 査読 国際誌

    Keisuke Saito, Jian-Ren Shen, Hiroshi Ishikita

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1817 ( 8 )   1191 - 1195   2012年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2011.12.003

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • The structure and activation of substrate water molecules in the S-2 state of photosystem II studied by hyperfine sublevel correlation spectroscopy 査読

    Sergey Milikisiyants, Ruchira Chatterjee, Christopher S. Coates, Faisal H. M. Koua, Jian-Ren Shen, K. V. Lakshmi

    ENERGY & ENVIRONMENTAL SCIENCE   5 ( 7 )   7747 - 7756   2012年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1039/c2ee21210b

    Web of Science

    researchmap

  • Influence of the Axial Ligand on the Cationic Properties of the Chlorophyll Pair in Photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus 査読 国際誌

    Keisuke Saito, Jian-Ren Shen, Hiroshi Ishikita

    BIOPHYSICAL JOURNAL   102 ( 11 )   2634 - 2640   2012年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bpj.2012.04.016

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Deformation of Chlorin Rings in the Photosystem II Crystal Structure 査読 国際誌

    Keisuke Saito, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Hiroshi Ishikita

    BIOCHEMISTRY   51 ( 21 )   4290 - 4299   2012年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi300428s

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • 3D1022 光化学系II酸素発生系S_2状態におけるMn間磁気的相互作用の解明(光生物-光合成,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

    Asada Mizue, Nagashima Hiroki, Koua Faisal Hammad Mekky, Shen Jian-Ren, Mino Hiroyuki

    生物物理   52   S63   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.52.S63_1

    CiNii Article

    researchmap

  • 3D0948 光化学系IIコア複合体での非光化学的消光の可能性(光生物-光合成,口頭発表,日本生物物理学会第50回年会(2012年度))

    Shibata Yutaka, Nishi Shunsuke, Kawakami Keisuke, Shen Jian-Ren, Renger Thomas

    生物物理   52   S62   2012年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.52.S62_4

    CiNii Article

    researchmap

  • Theoretical illumination of water-inserted structures of the CaMn4O5 cluster in the S2 and S3 states of oxygen-evolving complex of photosystem II: full geometry optimizations by B3LYP hybrid density functional 査読

    H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

    Dalton Transactions   41 ( 44 )   13727 - 13727   2012年

     詳細を見る

    掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:Royal Society of Chemistry (RSC)  

    DOI: 10.1039/c2dt31420g

    researchmap

  • Short Hydrogen Bond between Redox-Active Tyrosine Y-z and D1-His190 in the Photosystem II Crystal Structure 査読 国際誌

    Keisuke Saito, Jian-Ren Shen, Toyokazu Ishida, Hiroshi Ishikita

    BIOCHEMISTRY   50 ( 45 )   9836 - 9844   2011年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi201366j

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Distribution of the Cationic State over the Chlorophyll Pair of the Photosystem II Reaction Center 査読 国際誌

    Keisuke Saito, Toyokazu Ishida, Miwa Sugiura, Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Hiroshi Ishikita

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   133 ( 36 )   14379 - 14388   2011年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja203947k

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structure of the catalytic, inorganic core of oxygen-evolving photosystem II at 1.9 angstrom resolution 査読

    Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY B-BIOLOGY   104 ( 1-2 )   9 - 18   2011年7月

     詳細を見る

  • S-1-State Model of the O-2-Evolving Complex of Photosystem II 査読 国際誌

    Sandra Luber, Ivan Rivalta, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Gary W. Brudvig, Victor S. Batista

    BIOCHEMISTRY   50 ( 29 )   6308 - 6311   2011年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi200681q

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural-Functional Role of Chloride in Photosystem II 査読 国際誌

    Ivan Rivalta, Muhamed Amin, Sandra Luber, Serguei Vassiliev, Ravi Pokhrel, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Doug Bruce, Gary W. Brudvig, M. R. Gunner, Victor S. Batista

    BIOCHEMISTRY   50 ( 29 )   6312 - 6315   2011年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bi200685w

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure of oxygen-evolving photosystem II at a resolution of 1.9 angstrom 査読 国際誌

    Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya

    NATURE   473 ( 7345 )   55 - U65   2011年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1038/nature09913

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Labile electronic and spin states of the CaMn4O5 cluster in the PSII system refined to the 1.9 angstrom X-ray resolution. UB3LYP computational results 査読

    Keita Kanda, Shusuke Yamanaka, Tohru Saito, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Mitsutaka Okumura, Haruki Nakamura, Kizashi Yamaguchi

    CHEMICAL PHYSICS LETTERS   506 ( 1-3 )   98 - 103   2011年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.cplett.2011.02.030

    Web of Science

    researchmap

  • Proton-Coupled Electron-Transfer Processes in Photosystem II Probed by Highly Resolved g-Anisotropy of Redox-Active Tyrosine Y-Z 査読 国際誌

    Hideto Matsuoka, Jian-Ren Shen, Asako Kawamori, Kei Nishiyama, Yasunori Ohba, Seigo Yamauchi

    JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY   133 ( 12 )   4655 - 4660   2011年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/ja2000566

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Roles of PsbI and PsbM in photosystem II dimer formation and stability studied by deletion mutagenesis and X-ray crystallography 査読 国際誌

    Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Masako Iwai, Yousuke Kawabata, Masahiko Ikeuchi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1807 ( 3 )   319 - 325   2011年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2010.12.013

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Photosynthetic Oxygen Evolution in Mesoporous Silica Material: Adsorption of Photosystem II Reaction Center Complex into 23 nm Nanopores in SBA 査読 国際誌

    Tomoyasu Noji, Chihiro Kamidaki, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Tsutomu Kajino, Yoshiaki Fukushima, Takeshi Sekitoh, Shigeru Itoh

    LANGMUIR   27 ( 2 )   705 - 713   2011年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/la1032916

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Isolation of photosystem II-enriched membranes and the oxygen-evolving complex subunit proteins from higher plants. 査読 国際誌

    Yasusi Yamamoto, Jing Leng, Jian-Ren Shen

    Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   684   1 - 10   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    We describe methods to isolate highly active oxygen-evolving photosystem II (PSII) membranes and core complexes from higher plants, and to purify subunits of the oxygen-evolving complex (OEC). The membrane samples used as the material for various in vitro studies of PSII are prepared by solubilizing thylakoid membranes with the nonionic detergent Triton X-100, and the core complexes are prepared by further solubilization of the PSII membranes with n-dodecyl-β-D-maltoside (β-DDM). The OEC subunit proteins are dissociated from the PSII-enriched membranes by alkaline or salt treatment, and are then purified by ion-exchange chromatography using an automated high performance liquid chromatography system.

    DOI: 10.1007/978-1-60761-925-3_1

    PubMed

    researchmap

  • Purification and crystallization of oxygen-evolving photosystem II core complex from thermophilic cyanobacteria. 査読 国際誌

    Jian-Ren Shen, Keisuke Kawakami, Hiroyuki Koike

    Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   684   41 - 51   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    This chapter describes the purification and crystallization of oxygen-evolving photosystem II core dimer complex from a thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus. Procedures used for purification of photosystem II from the cyanobacterium involves cultivation of cells, isolation of thylakoid membranes, purification of crude and pure photosystem II core complexes by detergent solubilization, followed by differential centrifugation and column chromatography. The purified core dimer particles were successfully used for crystallization, and the methods and conditions used for crystallization are presented. These purification and crystallization procedures can be applied for another thermophilic cyanobacterium T. elongatus.

    DOI: 10.1007/978-1-60761-925-3_5

    PubMed

    researchmap

  • 2L1412 光化学系II複合体の原子レベル分解能での結晶構造解析(光生物_光合成,第49回日本生物物理学会年会)

    Umena Yasufumi, Kawakami Keisuke, Kamiya Nobuo, Shen Jian-Ren

    生物物理   51   S95   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.51.S95_2

    CiNii Article

    researchmap

  • 1SL-02 光合成水分解を可能にする光化学系IIの原子構造(1SL 光合成研究で何が明らかにされ、これから何をできるか?~光合成研究の最先端とエネルギー創製研究の現状~,日本生物物理学会第49回年会(2011年度))

    沈 建仁, Umena Yasufumi, Kawakami Keisuke, Kamiya Nobuo

    生物物理   51   S10   2011年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.51.S10_1

    CiNii Article

    researchmap

  • Binding and Functional Properties of Five Extrinsic Proteins in Oxygen-evolving Photosystem II from a Marine Centric Diatom, Chaetoceros gracilis 査読 国際誌

    Ryo Nagao, Akira Moriguchi, Tatsuya Tomo, Ayako Niikura, Saori Nakajima, Takehiro Suzuki, Akinori Okumura, Masako Iwai, Jian-Ren Shen, Masahiko Ikeuchi, Isao Enami

    JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY   285 ( 38 )   29191 - 29199   2010年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1074/jbc.M110.146092

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Topological Analysis of the Extrinsic PsbO, PsbP and PsbQ Proteins in a Green Algal PSII Complex by Cross-Linking with a Water-Soluble Carbodiimide 査読

    Ryo Nagao, Takehiro Suzuki, Akinori Okumura, Ayako Niikura, Masako Iwai, Naoshi Dohmae, Tatsuya Tomo, Jian-Ren Shen, Masahiko Ikeuchi, Isao Enami

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   51 ( 5 )   718 - 727   2010年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/pcp/pcq042

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Structural and functional studies on Ycf12 (Psb30) and PsbZ-deletion mutants from a thermophilic cyanobacterium 査読 国際誌

    Kenji Takasaka, Masako Iwai, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Yukari Ohmori, Masahiko Ikeuchi, Yuichiro Takahashi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1797 ( 2 )   278 - 284   2010年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2009.11.001

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure of oxygen evolving Photosystem II at atomic resolution. 査読

    Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya

    ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES   66   S124 - S125   2010年

     詳細を見る

  • Mechanisms of Acido-Tolerance and Characteristics of Photosystems in an Acidophilic and Thermophilic Red Alga, Cyanidium Caldarium 査読

    Enami Isao, Adachi Hideyuki, Shen Jian-Ren

    Red Algae in the Genomic Age   13   373 - 389   2010年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:Springer  

    In this chapter, we describe the mechanisms of acido-tolerance in an acidophilic- and thermophilic red alga, Cyanidium caldarium. In spite of the extremely acidic environments it inhabits, the intracellular pH of Cyanidium cells is kept neutral by pumping out the protons previously leaked into the cells according to the steep pH gradient. The H+ pump is driven by the plasma membrane ATPase, utilizing intracellular ATP produced by both oxidative phosphorylation and cyclic photophosphorylation via photosystem I. We also describe the characteristics and function of the two photosystems, Photosystem I (PSI) and II (PSII), in Cyanidium caldarium in comparison with those of cyanobacteria, other eukaryotic algae, and higher plants, based on the crystal structures of the two complexes reported so far.

    DOI: 10.1007/978-90-481-3795-4_20

    CiNii Article

    researchmap

  • Location of chloride and its possible functions in oxygen-evolving photosystem II revealed by X-ray crystallography 査読 国際誌

    Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA   106 ( 21 )   8567 - 8572   2009年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1073/pnas.0812797106

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Probing tyrosine Z oxidation in Photosystem II core complex isolated from spinach by EPR at liquid helium temperatures. 査読 国際誌

    Yanan Ren, Chunxi Zhang, Han Bao, Jianren Shen, Jingquan Zhao

    Photosynthesis research   99 ( 2 )   127 - 38   2009年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Tyrosine Z (Tyr(Z)) oxidation observed at liquid helium temperatures provides new insights into the structure and function of Tyr(Z) in active Photosystem II (PSII). However, it has not been reported in PSII core complex from higher plants. Here, we report Tyr(Z) oxidation in the S(1) and S(2) states in PSII core complex from spinach for the first time. Moreover, we identified a 500 G-wide symmetric EPR signal (peak position g = 2.18, trough position g = 1.85) together with the g = 2.03 signal induced by visible light at 10 K in the S(1) state in the PSII core complex. These two signals decay with a similar rate in the dark and both disappear in the presence of 6% methanol. We tentatively assign this new feature to the hyperfine structure of the S(1)Tyr(Z)(*) EPR signal. Furthermore, EPR signals of the S(2) state of the Mn-cluster, the oxidation of the non-heme iron, and the S(1)Tyr(Z)(*) in PSII core complexes and PSII-enriched membranes from spinach are compared, which clearly indicate that both the donor and acceptor sides of the reaction center are undisturbed after the removal of LHCII. These results suggest that the new spinach PSII core complex is suitable for the electron transfer study of PSII at cryogenic temperatures.

    DOI: 10.1007/s11120-009-9410-x

    PubMed

    researchmap

  • Towards structural elucidation of eukaryotic photosystem II: Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of photosystem II from a red alga 査読 国際誌

    Hideyuki Adachi, Yasufumi Umena, Isao Enami, Takahiro Henmi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1787 ( 2 )   121 - 128   2009年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2008.11.004

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • 2P-223 極低温時間分解蛍光測定によるThermosynechococcus vulucanusの光化学系2の二量体と単量体のエネルギー移動の比較(光生物-光合成,第47回日本生物物理学会年会)

    Nishi Shunsuke, Komura Masayuki, Noji Tomoyasu, Kawakami Keisuke, Shen Jian-Ren, Shibata Yutaka, Itoh Shigeru

    生物物理   49   S142   2009年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.49.S142_2

    CiNii Article

    researchmap

  • 3TP2-03 シリカメソ多孔体細孔中に導入した好熱性シアノバクテリア光化学系IIコア複合体の機能(光生物-光合成,第47回日本生物物理学会年会)

    Noji Tomoyasu, Kamidaki Chihiro, Kawakami Keisuke, Shen Jian-Ren, Kajino Tsutomu, Fukushima Yoshiaki, Sekitoh Takeshi, Itoh Shigeru

    生物物理   49   S60   2009年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.49.S60_6

    CiNii Article

    researchmap

  • Effects of phospholipase and lipase treatments on photosystem II core dimer from a thermophilic cyanobacterium 査読

    Jing Leng, Isamu Sakurai, Hajime Wada, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   98 ( 1-3 )   469 - 478   2008年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1007/s11120-008-9335-9

    Web of Science

    researchmap

  • Structures and functions of the extrinsic proteins of photosystem II from different species 査読

    Isao Enami, Akinori Okumura, Ryo Nagao, Takehiro Suzuki, Masako Iwai, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   98 ( 1-3 )   349 - 363   2008年10月

     詳細を見る

  • Structure and Function of Photosystem II 査読

    Jian-Ren Shen, Takahiro Henmi, Nobuo Kamiya

    Photosynthetic Protein Complexes: A Structural Approach   83 - 106   2008年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:論文集(書籍)内論文   出版者・発行元:Wiley-VCH Verlag GmbH &amp; Co. KGaA  

    DOI: 10.1002/9783527623464.ch4

    Scopus

    researchmap

  • Acceptor side effects on the electron transfer at cryogenic temperatures in intact photosystem II 査読 国際誌

    Han Bao, Chunxi Zhang, Keisuke Kawakami, Yanan Ren, Jian-Ren Shen, Jingquan Zhao

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1777 ( 9 )   1109 - 1115   2008年9月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2008.04.044

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • X-ray crystallographic and biochemical characterizations of a mutant photosystem II complex from Thermosynechococcus vulcanus with the psbTc gene inactivated by an insertion mutation 査読 国際誌

    Takahiro Henmi, Masako Iwai, Masahiko Ikeuchi, Keisuke Kawakami, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya

    JOURNAL OF SYNCHROTRON RADIATION   15 ( Pt 3 )   304 - 307   2008年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1107/S0909049508002458

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Identification of functional domains of PsbU in red algal PSII by site-directed mutagenesis 査読

    Sano M, Okumura A, Suzuki T, Iwai M, Adachi H, Shen JR, Enami I

    Photosynthesis. Energy from the Sun   487 - 490   2008年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)   出版者・発行元:Springer Science $\mathplus$ Business Media  

    DOI: 10.1007/978-1-4020-6709-9_110

    researchmap

  • 3S4-3 立体構造から探る光化学系II酸素発生反応の機構(3S4 光合成の新たなる潮流=光合成で新エネルギー創製を達成できるか=,第46回日本生物物理学会年会)

    沈 建仁

    生物物理   48   S18   2008年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.48.S18_1

    CiNii Article

    researchmap

  • Aromatic structure of Tyrosine-92 in the extrinsic PsbU protein of red algal Photosystem II is important for its functioning 査読 国際誌

    Akinori Okumura, Masanori Sano, Takehiro Suzuki, Hiroyasu Tanaka, Ryo Nagao, Katsuyoshi Nakazato, Masako Iwai, Hideyuki Adachi, Jian-Ren Shen, Isao Enami

    FEBS LETTERS   581 ( 27 )   5255 - 5258   2007年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.febslet.2007.10.015

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Location of PsbY in oxygen-evolving photosystem II revealed by mutagenesis and X-ray crystallography. 査読 国際誌

    Keisuke Kawakami, Masako Iwai, Masahiko Ikeuchi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    FEBS letters   581 ( 25 )   4983 - 7   2007年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1016/j.febslet.2007.09.036

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Self-assembling peptide inspired by a barnacle underwater adhesive protein 査読 国際誌

    Masahiro Nakano, Jian-Ren Shen, Kei Kamino

    BIOMACROMOLECULES   8 ( 6 )   1830 - 1835   2007年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/bm0612236

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • 2P330 シリカメソ多孔体への光合成反応中心光化学系II複合体の導入(光生物(光合成),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)

    野地 智康, 川上 恵典, 沈 建仁, 梶野 勉, 福嶋 喜章, 関藤 武士, 伊藤 繁

    生物物理   47   S195   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.47.S195_3

    CiNii Article

    researchmap

  • Lipids in oxygen-evolving photosystem II complexes of cyanobacteria and higher plants 査読 国際誌

    Isamu Sakurai, Jian-Ren Shen, Jing Leng, Shunsuke Ohashi, Masami Kobayashi, Hajime Wada

    JOURNAL OF BIOCHEMISTRY   140 ( 2 )   201 - 209   2006年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1093/jb/mvj141

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Anisotropy of the S-2-state manganese cluster in single crystals of cyanobacterial photosystem II studied by W-band electron paramagnetic resonance spectroscopy 査読 国際誌

    Hideto Matsuoka, Ko Furukawa, Tatsuhisa Kato, Hiroyuki Mino, Jian-Ren Shen, Asako Kawamori

    JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B   110 ( 26 )   13242 - 13247   2006年7月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1021/jp055008f

    Web of Science

    PubMed

    researchmap

  • Quality control of Photosystem II: an FtsH protease plays an essential role in the turnover of the reaction center D1 protein in Synechocystis PCC 6803 under heat stress as well as light stress conditions. 査読 国際誌

    Takashi Kamata, Hideki Hiramoto, Noriko Morita, Jian-Ren Shen, Nicholas H Mann, Yasusi Yamamoto

    Photochemical & photobiological sciences : Official journal of the European Photochemistry Association and the European Society for Photobiology   4 ( 12 )   983 - 90   2005年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The role of an AAA protease FtsH (slr0228) in the turnover of the D1 protein was studied under moderate heat stress conditions using wild-type cells of the cyanobacterium Synechocystis PCC 6803 and the mutant cells lacking a homologue of FtsH (slr0228). When the growth temperature of the wild-type was shifted from 30 degrees C to 40 degrees C, growth and oxygen-evolving activity were partially inhibited. Under the same heat stress, growth of the mutant was inhibited more significantly (63% inhibition after 5 days heat stress, compared with 26% inhibition with the wild-type cells) and the oxygen-evolving activity was also impaired in parallel. With heat stress at 42 degrees C, the level of the D1 protein of wild type cells was decreased, whereas that in mutant cells was not. The responses of cyanobacterial cells to heat stress observed here are quite similar to those to light stress that were reported previously. From these results, we suggest that the FtsH protease (slr0228) is responsible for both the heat-induced and light-induced degradation of the D1 protein. Notably, the amount of FtsH increased when the wild-type cells were exposed to heat stress or light stress, indicating that the up-regulation of the FtsH protease in the thylakoids is crucial for the cyanobacterial cells to cope with these abiotic stresses.

    PubMed

    researchmap

  • Distribution of the extrinsic proteins as a potential marker for the evolution of photosynthetic oxygen-evolving photosystem II. 査読 国際誌

    Isao Enami, Takehiro Suzuki, Osamu Tada, Yoshiko Nakada, Kumi Nakamura, Akihiko Tohri, Hisataka Ohta, Isao Inoue, Jian-Ren Shen

    The FEBS journal   272 ( 19 )   5020 - 30   2005年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Distribution of photosystem II (PSII) extrinsic proteins was examined using antibodies raised against various extrinsic proteins from different sources. The results showed that a glaucophyte (Cyanophora paradoxa) having the most primitive plastids contained the cyanobacterial-type extrinsic proteins (PsbO, PsbV, PsbU), and the primitive red algae (Cyanidium caldarium) contained the red algal-type extrinsic proteins (PsO, PsbQ', PsbV, PsbU), whereas a prasinophyte (Pyraminonas parkeae), which is one of the most primitive green algae, contained the green algal-type ones (PsbO, PsbP, PsbQ). These suggest that the extrinsic proteins had been diverged into cyanobacterial-, red algal- and green algal-types during early phases of evolution after a primary endosymbiosis. This study also showed that a haptophyte, diatoms and brown algae, which resulted from red algal secondary endosymbiosis, contained the red algal-type, whereas Euglena gracilis resulted from green algal secondary endosymbiosis contained the green algal-type extrinsic proteins, suggesting that the red algal- and green algal-type extrinsic proteins have been retained unchanged in the different lines of organisms following the secondary endosymbiosis. Based on these immunological analyses, together with the current genome data, the evolution of photosynthetic oxygen-evolving PSII was discussed from a view of distribution of the extrinsic proteins, and a new model for the evolution of the PSII extrinsic proteins was proposed.

    PubMed

    researchmap

  • Key cofactors of photosystem II cores from four organisms identified by 1.7-K absorption, CD and MCD. 査読 国際誌

    Sindra Peterson Arsköld, Paul J Smith, Jian-Ren Shen, Ron J Pace, Elmars Krausz

    Photosynthesis research   84 ( 1-3 )   309 - 16   2005年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Active Photosystem II (PS II) cores were prepared from spinach, pea, Synechocystis PCC 6803, and Thermosynechococcus vulcanus, the latter of which has been structurally determined [Kamiya and Shen (2003) Proc Natl Acad Sci USA 100: 98-103]. Electrochromic shifts resulting from QA reduction by 1.7-K illumination were recorded, and the Qx and Qy absorption bands of the redox-active pheophytin a thus identified in the different organisms. The Qx transition is approximately 3 nm (100 cm-1) to higher energy in cyanobacteria than in the plants. The predominant Qy shift appears in the range 683-686 nm depending on species, and does not appear to have a systematic shift. Low-temperature absorption, circular dichroism (CD) and magnetic circular dichroism (MCD) spectra of the chlorophyll Qy region are very similar in spinach and pea, but vary in cyanobacteria. We assigned CP43 and CP47 trap-chlorophyll absorption features in all species, as well as a P680 transition. Each absorption identified has an area of one chlorophyll a. The MCD deficit, introduced previously for spinach as an indicator of P680 activity, occurs in the same spectral region and has the same area in all species, pointing to a robustness of this as a signature for P680. MCD and CD characteristics point towards a significant variance in P680 structure between cyanobacteria, thermophilic cyanobacteria, and higher plants.

    PubMed

    researchmap

  • Pressure equilibrium and jump study on unfolding of 23-kDa protein from spinach photosystem II. 査読 国際誌

    Cui-Yan Tan, Chun-He Xu, Jun Wong, Jian-Ren Shen, Shinsuke Sakuma, Yasusi Yamamoto, Reinhard Lange, Claude Balny, Kang-Cheng Ruan

    Biophysical journal   88 ( 2 )   1264 - 75   2005年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Pressure-induced unfolding of 23-kDa protein from spinach photosystem II has been systematically investigated at various experimental conditions. Thermodynamic equilibrium studies indicate that the protein is very sensitive to pressure. At 20 degrees C and pH 5.5, 23-kDa protein shows a reversible two-state unfolding transition under pressure with a midpoint near 160 MPa, which is much lower than most natural proteins studied to date. The free energy (DeltaG(u)) and volume change (DeltaV(u)) for the unfolding are 5.9 kcal/mol and -160 ml/mol, respectively. It was found that NaCl and sucrose significantly stabilize the protein from unfolding and the stabilization is associated not only with an increase in DeltaG(u) but also with a decrease in DeltaV(u). The pressure-jump studies of 23-kDa protein reveal a negative activation volume for unfolding (-66.2 ml/mol) and a positive activation volume for refolding (84.1 ml/mol), indicating that, in terms of system volume, the protein transition state lies between the folded and unfolded states. Examination of the temperature effect on the unfolding kinetics indicates that the thermal expansibility of the transition state and the unfolded state of 23-kDa protein are closer to each other and they are larger than that of the native state. The diverse pressure-refolding pathways of 23-kDa protein in some conditions were revealed in pressure-jump kinetics.

    PubMed

    researchmap

  • High frequency EPR of the Mn-cluster in single crystals of cyanobacterial photosystem II 査読

    Asako Kawamori, Jian-Ren Shen, Hiroyuki Mino, Ko Furukawa, Hideto Matsuoka, Tatsuhisa Kato

    Photosynthesis: Fundamental Aspects to Global Perspectives   406 - 408   2005年

     詳細を見る

  • An icosahedral assembly of the light-harvesting chlorophyll a/b protein complex from pea chloroplast thylakoid membranes. 査読 国際誌

    Tomoya Hino, Eiji Kanamori, Jian-Ren Shen, Tsutomu Kouyama

    Acta crystallographica. Section D, Biological crystallography   60 ( Pt 5 )   803 - 9   2004年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    When the light-harvesting chlorophyll a/b protein complex (LHC-II) from pea thylakoid membranes is co-crystallized with native lipids, an octahedral crystal that exhibits no birefringence is obtained. Cryogenic electron micrographs of a crystal edge showed the crystal to be made up of hollow spherical assemblies with a diameter of 250 A. X-ray diffraction data at 9.5 A resolution revealed the spherical shell of LHC-II to have icosahedral symmetry. A T = 1 icosahedral model of LHC-II, in which the stromal surface of the protein faces outward, was constructed using the previously reported structure of the LHC-II trimer [Kühlbrandt et al. (1994), Nature (London), 367, 614-621]. The present result shows the first example of a well ordered three-dimensional crystal of icosahedral proteoliposomes.

    PubMed

    researchmap

  • pH-induced conformational changes in the soluble manganese-stabilizing protein of photosystem II. 査読 国際誌

    Jun Weng, Cuiyan Tan, Jian-Ren Shen, Yong Yu, Xiaomei Zeng, Chunhe Xu, Kangcheng Ruan

    Biochemistry   43 ( 16 )   4855 - 61   2004年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In this paper, we analyzed the pH-induced changes in the conformational states of the manganese-stabilizing protein (MSP) of photosystem II. Distinct conformational states of MSP were identified using fluorescence spectra, far-UV circular dichroism, and pressure-induced unfolding at varying suspension pH values, and four different conformational states of MSP were clearly distinguished using the center of fluorescence spectra mass when suspension pH was altered from 2 to 12. MSP was completely unfolded at a suspension pH above 11 and partly unfolded below a pH of 3. Analysis of the center of fluorescence spectral mass showed that the MSP structure appears stably folded around pH 6 and 4. The conformational state of MSP at pH 4 seems more stable than that at pH 6. Studies of peak positions of tryptophan fluorescence and MSP-bound 1-anilinonaphthalene-8-sulfonic acid fluorescence spectra supported this observation. A decrease in the suspension pH to 2 resulted in significant alterations in the MSP structure possibly because of protonation of unprotonated residues at lower pH, suggesting the existence of a large number of unprotonated amino acid residues at neutral pH possibly useful for proton transport in oxygen evolution. The acidic pH-induced conformational changes of MSP were reversible upon increase of pH to neutral pH; however, N-bromosuccinimide modification of tryptophan (Trp241) blocks the recovery of pH-induced conformational changes in MSP, implying that Trp241 is a key residue for the unfolded protein to form a functional structure. Thus, pH-induced structural changes of stable MSP (pH 6-4) may be utilized to analyze its functionality as a cofactor for oxygen evolution.

    PubMed

    researchmap

  • The orientations of core antenna chlorophylls in photosystem II are optimized to maximize the quantum yield of photosynthesis. 査読 国際誌

    Sergei Vasil'ev, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Doug Bruce

    FEBS letters   561 ( 1-3 )   111 - 6   2004年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    In photosystem II (PSII) the probability that energy absorbed by core antenna chlorophyll (Chl) is transferred to the reaction center (RC) is extremely high. Although close proximity between antenna Chl ensures a high transfer efficiency, relative pigment orientation can fractionally modify it. This level of refinement has often been assumed to be superfluous as so many subsequent processes limit the overall efficiency of photosynthesis. Nevertheless, did natural selection act on the most efficient step of energy conversion in PSII by optimizing the orientation of antenna Chl? Our Monte Carlo simulations sampled the orientation space of Chls in kinetic models for excitation energy transfer based on the X-ray structures of PSII from Thermosynechococcus vulcanus and Synechocystis elongatus. Our results revealed that the orientations of key antenna Chls are optimized to maximize photosynthesis while the orientations of the two peripheral RC Chls (Chl(Z)) are not.

    PubMed

    researchmap

  • Isolation of photosystem II-enriched membranes and the oxygen-evolving complex subunit proteins from higher plants. 査読 国際誌

    Yasusi Yamamoto, Shinsuke Sakuma, Jian-Ren Shen

    Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)   274   29 - 36   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Methods for the isolation of highly active oxygen-evolving photosystem (PS)II membranes from higher plants and the purification of the oxygen-evolving complex (OEC) subunits are described. Membrane samples used as the material for various in vitro studies of PSII are prepared by solubilization of thylakoid membranes with the non-ionic detergent Triton X-100. The OEC subunit proteins are dissociated from the PSII-enriched membranes by alkaline treatment or salt treatment, and then purified by ion-exchange chromatography using an automated high-performance liquid chromatography system.

    PubMed

    researchmap

  • 1SD52 立体構造に基づく光化学系II機能研究の新展開(新たに解かれた構造を基に光合成の新展開を探る)

    沈 建仁, 神谷 信夫

    生物物理   44   S12   2004年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.44.S12_3

    CiNii Article

    researchmap

  • Extrinsic proteins of photosystem II: an intermediate member of PsbQ protein family in red algal PS II. 査読 国際誌

    Hisataka Ohta, Takehiro Suzuki, Masaji Ueno, Akinori Okumura, Shizue Yoshihara, Jian-Ren Shen, Isao Enami

    European journal of biochemistry   270 ( 20 )   4156 - 63   2003年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The oxygen-evolving photosystem II (PS II) complex of red algae contains four extrinsic proteins of 12 kDa, 20 kDa, 33 kDa and cyt c-550, among which the 20 kDa protein is unique in that it is not found in other organisms. We cloned the gene for the 20-kDa protein from a red alga Cyanidium caldarium. The gene consists of a leader sequence which can be divided into two parts: one for transfer across the plastid envelope and the other for transfer into thylakoid lumen, indicating that the gene is encoded by the nuclear genome. The sequence of the mature 20-kDa protein has low but significant homology with the extrinsic 17-kDa (PsbQ) protein of PS II from green algae Volvox Carteri and Chlamydomonas reinhardtii, as well as the PsbQ protein of higher plants and PsbQ-like protein from cyanobacteria. Cross-reconstitution experiments with combinations of the extrinsic proteins and PS IIs from the red alga Cy. caldarium and green alga Ch. reinhardtii showed that the extrinsic 20-kDa protein was functional in place of the green algal 17-kDa protein on binding to the green algal PS II and restoration of oxygen evolution. From these results, we conclude that the 20-kDa protein is the ancestral form of the extrinsic 17-kDa protein in green algal and higher plant PS IIs. This provides an important clue to the evolution of the oxygen-evolving complex from prokaryotic cyanobacteria to eukaryotic higher plants. The gene coding for the extrinsic 20-kDa protein was named psbQ' (prime).

    PubMed

    researchmap

  • Comparison of binding and functional properties of two extrinsic components, Cyt c550 and a 12 kDa protein, in cyanobacterial PSII with those in red algal PSII. 査読

    Isao Enami, Masako Iwai, Ai Akiyama, Takehiro Suzuki, Akinori Okumura, Takara Katoh, Osamu Tada, Hisataka Ohta, Jian-Ren Shen

    Plant & cell physiology   44 ( 8 )   820 - 7   2003年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Cyt c550 and 12 kDa protein are two extrinsic proteins of photosystem II (PSII) found in cyanobacteria and some eukaryotic algae. The binding patterns of these two extrinsic proteins are different between cyanobacterial (Thermosynechococcus vulcanus) and red algal (Cyanidium caldarium) PSIIs [Shen and Inoue (1993) Biochemistry 32: 1825; Enami et al. (1998) Biochemistry 39: 2787]. In order to elucidate the possible causes responsible for these differences, we first cloned the psbV gene encoding Cyt c550 from a red alga, Cyanidium caldarium, which was compared with the homologous sequences from other organisms. Cross-reconstitution experiments were then performed with different combinations of the extrinsic proteins and the cyanobacterial or red algal PSII. (1). Both the cyanobacterial and red algal Cyt c550 bound directly to the cyanobacterial PSII, whereas none of them bound directly to the red algal PSII, indicating that direct binding of Cyt c550 to PSII principally depends on the structure of PSII intrinsic proteins but not that of Cyt c550 itself. (2). Cyt c550 was functionally exchangeable between the red algal and the cyanobacterial PSII, and the red algal 12 kDa protein functionally bound to the cyanobacterial PSII, whereas the cyanobacterial 12 kDa protein did not bind to the red algal PSII. (3). The antibody against the cyanobacterial or red algal 12 kDa protein reacted with its original one but not with the homologous protein from the other organism, whereas the antibody against the red algal Cyt c550 reacted with both cyanobacterial and red algal Cyt c550. These results imply that the structure and function of Cyt c550 have been largely conserved, whereas those of the 12 kDa protein have been changed, in the two organisms studied here.

    PubMed

    researchmap

  • Dynamic Interaction between the D1 protein, CP43 and OEC33 at the lumenal side of photosystem II in spinach chloroplasts: evidence from light-induced cross-Linking of the proteins in the donor-side photoinhibition. 査読

    Takahiro Henmi, Hitoshi Yamasaki, Shinsuke Sakuma, Yuka Tomokawa, Noriaki Tamura, Jian-Ren Shen, Yasusi Yamamoto

    Plant & cell physiology   44 ( 4 )   451 - 6   2003年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    During the donor-side photoinhibition of spinach photosystem II, the reaction center D1 protein cross-linked with the antenna chlorophyll binding protein CP43 of photosystem II lacking the oxygen-evolving complex (OEC) subunit proteins. The cross-linking did not occur upon illumination of photosystem II samples that retained the OEC33, nor when OEC33-depleted photosystem II samples were reconstituted with the OEC33 prior to illumination. These results suggest that the D1 protein, CP43 and the OEC33 are located in close proximity at the lumenal side of photosystem II, and that the OEC33 suppresses the unnecessary contact between the D1 protein and CP43. Previously we presented data showing the D1 protein located adjacent to CP43 on the stromal side of photosystem II [Ishikawa et al. (1999) BIOCHIM: Biophys. Acta 1413: 147]. The present data suggest that the spatial arrangement of the D1 protein and CP43 at the lumenal side of photosystem II in spinach chloroplasts is similar to that at the stromal side of photosystem II and is consistent with the assignment of these proteins recently proposed on the crystal structures of the photosystem II complexes from cyanobacteria [Zouni et al. (2001) Nature 409: 739, Kamiya and Shen 2003 PROC: Natl. Acad. Sci. USA, 100: 98]. Moreover, the data suggest that the binding condition and positioning of the OEC33 in the photosystem II complex from higher plants may be different from those in cyanobacteria.

    PubMed

    researchmap

  • Near-IR irradiation of the S2 state of the water oxidizing complex of photosystem II at liquid helium temperatures produces the metalloradical intermediate attributed to S1Y(Z*). 査読 国際誌

    Dionysios Koulougliotis, Jian-Ren Shen, Nikolaos Ioannidis, Vasili Petrouleas

    Biochemistry   42 ( 10 )   3045 - 53   2003年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Near-IR (NIR) excitation at liquid He temperatures of photosystem II (PSII) membranes from the cyanobacterium Synechococcus vulcanus or from spinach poised in the S2 state results in the production of a g = 2.035 EPR resonance, reminiscent of metalloradical signals. The signal is smaller in the spinach preparations, but it is significantly enhanced by the addition of exogenous quinones. Ethanol (2-3%, v/v) eliminates the ability to trap the signal. The g = 2.035 signal is identical to the one recently obtained by Nugent et al. by visible-light illumination of the S1 state, and preferably assigned to S1Y(Z*) [Nugent, J. H. A., Muhiuddin, I. P., and Evans, M. C. W. (2002) Biochemistry 41, 4117-4126]. The production of the g = 2.035 signal by liquid He temperature NIR excitation of the S2 state is paralleled by a significant reduction (typically 40-45% in S. vulcanus) of the S2 state multiline signal. This is in part due to the conversion of the Mn cluster to higher spin states, an effect documented by Boussac et al. [Boussac, A., Un, S., Horner, O., and Rutherford, A. W. (1998) Biochemistry 37, 4001-4007], and in part due to the conversion to the g = 2.035 configuration. Following the decay of the g = 2.035 signal at liquid helium temperatures (decay halftimes in the time range of a few to tens of minutes depending on the preparation), annealing at elevated temperatures (-80 degrees C) results in only partial restoration of the S2 state multiline signal. The full size of the signal can be restored by visible-light illumination at -80 degrees C, implying that during the near-IR excitation and subsequent storage at liquid helium temperatures recombination with Q(A-) (and therefore decay of the S2 state to the S1 state) occurred in a fraction of centers. In support of this conclusion, the g = 2.035 signal remains stable for several hours (at 11 K) in centers poised in the S2...Q(A) configuration before the NIR excitation. The extended stability of the signal under these conditions has allowed the measurement of the microwave power saturation and the temperature dependence in the temperature range of 3.8-11 K. The signal intensity follows Curie law temperature dependence, which suggests that it arises from a ground spin state, or a very low-lying excited spin state. The P1/2 (microwave power at half-saturation) value is 1.7 mW at 3.8 K and increases to 96 mW at 11 K. The large width of the g = 2.035 signal and its relatively fast relaxation support the assignment to a radical species in the proximity of the Mn cluster. The whole phenomenology of the g = 2.035 signal production is analogous to the effects of NIR excitation on the S3 state [Ioannidis, N., Nugent, J. H. A., and Petrouleas, V. (2002) Biochemistry 41, 9589-9600] producing an S2'Y(Z*) intermediate. In the present case, the intermediate is assigned to S1Y(Z*). The NIR-induced increase in the oxidative capability of the Mn cluster is discussed in relation to the photochemical properties of a Mn(III) ion that exists in both S2 and S3 states. The EPR properties of the S1Y(Z*) intermediate cannot be reconciled easily with our current understanding of the magnetic properties of the S1 state. It is suggested that oxidation of tyr Z alters the magnetic properties of the Mn cluster via exchange of a proton.

    PubMed

    researchmap

  • ATP-induced hexameric ring structure of the cyanobacterial circadian clock protein KaiC. 査読 国際誌

    Fumio Hayashi, Hirofumi Suzuki, Ryo Iwase, Tatsuya Uzumaki, Asako Miyake, Jian-Ren Shen, Katsumi Imada, Yukio Furukawa, Koji Yonekura, Keiichi Namba, Masahiro Ishiura

    Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms   8 ( 3 )   287 - 96   2003年3月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    BACKGROUND: KaiA, KaiB and KaiC are cyanobacterial circadian clock proteins. KaiC contains two ATP/GTP-binding Walker's motif As, and mutations in these regions affect the clock oscillations. RESULTS: ATP induced the hexamerization of KaiC. The Km value for the ATP for the hexamerization was 1.9 micro m. Triphosphate nucleotides bound to the two Walker's motif As, and their binding functioned cooperatively for the hexamerization. An unhydrolysable substrate, 5'-adenylylimidodiphosphate (AMPPNP), also induced the hexamerization, indicating that nucleotide binding, but not its hydrolysis, is essential for the hexamerization. Mutations in each of the two Walker's motif As that affect the clock phenotype increased the Km value for ATP and inhibited the hexamerization. Thus, the KaiC hexamerization seems to be necessary for its clock function. The KaiC hexamer has the shape of a hexagonal pot with a diameter and height of approximately 100 A and with a relatively large cavity (73 A deep and 18-34 A wide) inside. This pot-shaped structure suggests that KaiC functions in a similar manner to F1-ATPase, helicase or ATP-dependent protease/chaperon, all of which have dynamic activities inside the central cavity of their hexameric rings. CONCLUSION: ATP-induced KaiC hexamerization is necessary for the clock function of KaiC.

    PubMed

    researchmap

  • Crystal structure of oxygen-evolving photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus at 3.7-A resolution. 査読 国際誌

    Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America   100 ( 1 )   98 - 103   2003年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Photosystem II (PSII) is a multisubunit membrane protein complex performing light-induced electron transfer and water-splitting reactions, leading to the formation of molecular oxygen. The first crystal structure of PSII from a thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus was reported recently [Zouni, A., Witt, H. T., Kern, J., Fromme, P., Krauss, N., Saenger, W. & Orth, P. (2001) Nature 409, 739-743)] at 3.8-A resolution. To analyze the PSII structure in more detail, we have obtained the crystal structure of PSII from another thermophilic cyanobacterium, Thermosynechococcus vulcanus, at 3.7-A resolution. The present structure was built on the basis of the sequences of PSII large subunits D1, D2, CP47, and CP43; extrinsic 33- and 12-kDa proteins and cytochrome c550; and several low molecular mass subunits, among which the structure of the 12-kDa protein was not reported previously. This yielded much information concerning the molecular interactions within this large protein complex. We also show the arrangement of chlorophylls and cofactors, including two beta-carotenes recently identified in a region close to the reaction center, which provided important clues to the secondary electron transfer pathways around the reaction center. Furthermore, possible ligands for the Mn-cluster were determined. In particular, the C terminus of D1 polypeptide was shown to be connected to the Mn cluster directly. The structural information obtained here provides important insights into the mechanism of PSII reactions.

    PubMed

    researchmap

  • Comparison of the structure of the extrinsic 33 kDa protein from different organisms. 査読

    Akihiko Tohri, Takehiro Suzuki, Satoshi Okuyama, Kei Kamino, Akihiro Motoki, Masahiko Hirano, Hisataka Ohta, Jian-Ren Shen, Yasushi Yamamoto, Isao Enami

    Plant & cell physiology   43 ( 4 )   429 - 39   2002年4月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The psbO gene encoding the extrinsic 33 kDa protein of oxygen-evolving photosystem II (PSII) complex was cloned and sequenced from a red alga, Cyanidium caldarium. The gene encodes a polypeptide of 333 residues, of which the first 76 residues served as transit peptides for transfer across the chloroplast envelope and thylakoid membrane. The mature protein consists of 257 amino acids with a calculated molecular mass of 28,290 Da. The sequence homology of the mature 33 kDa protein was 42.9-50.8% between the red alga and cyanobacteria, and 44.7-48.6% between the red alga and higher plants. The cloned gene was expressed in Escherichia coli, and the recombinant protein was purified, subjected to protease-treatments. The cleavage sites of the 33 kDa protein by chymotrypsin or V8 protease were determined and compared among a cyanobacterium (Synechococcus elongatus), a euglena (Euglena gracilis), a green alga (Chlamydomonas reinhardtii) and two higher plants (Spinacia oleracea and Oryza sativa). The cleavage sites by chymotrypsin were at 156F and 190F for the cyanobacterium, 159M, 160F and 192L for red alga, 11Y and 151F for euglena, 10Yand 150F for green alga, and 16Y for spinach, respectively. The cleavage sites by V8 protease were at 181E (cyanobacterium), 182E and 195E (red alga), 13E, 67E, 69E, 153D and 181E (euglena), 176E and 180E (green alga), and 18E or 19E (higher plants). Since most of the residues at these cleavage sites were conserved among the six organisms, the results indicate that the structure of the 33 kDa protein, at least the structure based on the accessibility by proteases, is different among these organisms. In terms of the cleavage sites, the structure of the 33 kDa protein can be divided into three major groups: cyanobacterial and red algal-type has cleavage sites at residues around 156-195, higher plant-type at residues 16-19, and euglena and green algal-type at residues of both cyanobacterial and higher plant-types.

    PubMed

    researchmap

  • 3H1330 光捕集クロロフィルa/b蛋白質複合体が形成する正二十面体のX線結晶構造解析(1.蛋白質(A)構造,一般講演,日本生物物理学会第40回年会)

    日野 智也, 沈 建仁, 神山 勉

    生物物理   42 ( 2 )   S170   2002年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.42.S170_1

    CiNii Article

    researchmap

  • 1P158PSにおける酸素発生系の偶数酸化状態のEPRによる研究

    荒尾 幸子, 山田 修嗣, 河盛 阿佐子, 沈 建仁, Ionnidis Nikolaos, Petrouleas Vasili

    生物物理   41   S72   2001年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.41.S72_2

    CiNii Article

    researchmap

  • 2M1545 光捕集クロロフィルa/b蛋白質複合体が作る正二十面体の形成機構

    日野 智也, 金森 英司, 奥村 英夫, 松井 耕宏, 沈 建仁, 井上 頼直, 神山 勉

    生物物理   40   S158   2000年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.40.S158_3

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 2PA023 酸素発生光化学系II複合体の結晶化

    沈 建仁, 神谷 信夫

    生物物理   39   S106   1999年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.39.S106_3

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 2PA022 光捕集クロロフィル蛋白質複合体がつくる球殻構造体のX線結晶構造解析

    金森 英司, 日野 智也, 奥村 英夫, 松井 耕宏, 沈 建仁, 井上 頼直, 神山 勉

    生物物理   39   S106   1999年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    DOI: 10.2142/biophys.39.S106_2

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • Cloning and expression of genes encoding a 12 kDa protein and cytochrome c(550), two extrinsic proteins of PSII, from a red alga Cyanidium caldarium 査読

    H Ohta, A Okumura, T Katoh, Shen, JR, M Kamo, Enami, I

    PHOTOSYNTHESIS: MECHANISMS AND EFFECTS, VOLS I-V   2979 - 2982   1998年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

    Web of Science

    researchmap

  • Possible functional differences between dimer and monomer of photosystem II complex 査読

    Shen, JR

    PHOTOSYNTHESIS: MECHANISMS AND EFFECTS, VOLS I-V   941 - 944   1998年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(国際会議プロシーディングス)  

    Web of Science

    researchmap

  • Topological analysis of PS II reaction center using monoclonal antibodies 査読

    Tatsuya Tomo, Kenji Ogawa, Yorinao Inoue, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis: Mechanisms and Effects   2   993 - 996   1998年

     詳細を見る

    記述言語:英語  

    researchmap

  • Functional characterization of Synechocystis sp. PCC 6803 delta psbU and delta psbV mutants reveals important roles of cytochrome c-550 in cyanobacterial oxygen evolution 査読

    SHEN J. -R.

    Biochemistry   37   1551 - 1558   1998年

  • Identification of domains on the 43KDa chlorophyll-carring protein(CP43)that are shielded from tryptic attack by binding of the extrinsic 33KDa protein with photosystem II complex 査読

    Enami, I, Tohri, A, Kamo, M, Ohta, H, Shen, J. R

    Biochim Biophys Acta   1320   17 - 26   1997年5月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The structural association of the spinach 33 kDa extrinsic protein with the 43 kDa chlorophyll-carrying protein (CP43) in oxygen-evolving photosystem II (PS II) complexes was investigated by comparing the peptide mappings and N-terminal sequences of the trypsin-digested products of NaCl-washed PS II membranes, which bind the 33 kDa protein, with those of CaCl2-washed PS II membranes, which lack the 33 kDa protein. (1) Peptide from N-terminus to Arg26 of CP43, which is exposed to stromal side, was digested in both PS II membranes, independent of binding of the 33 kDa protein. (2) Peptide bond of Arg357-Phe358 located in the large extrinsic loop E of CP43, which is exposed to lumenal side, was cleaved by trypsin in CaCl2-washed PS II membranes but not in NaCl-washed PS II membranes. This indicates that the region around Arg357-Phe358 in loop E of CP43 is shielded from tryptic attack by binding of the 33 kDa protein to PS II. (3) Trypsin treatment of CaCl2-washed PS II membranes also cleaved peptide bond between Lys457 and Gly458 in C-terminal region of CP43, while no cleavage of this region was detected by trypsin treatment of NaCl-washed PS II membranes. This implies that a conformational change of the C-terminal region of CP43 which is exposed to stromal side occurred upon removal of the 33 kDa protein, which makes the C-terminal region accessible to trypsin. (4) Release of peptide from Gln60 to C-terminus of the alpha-subunit of cytochrome b-559 was detected only in trypsin treatment of CaCl2-washed PS II membranes, indicating that the C-terminal region of this subunit is shielded from tryptic attack by binding of the 33 kDa protein. (5) The PS II membranes, in which Arg357-Phe358, Lys457-Gly458 of CP43 and the C-terminal part of the cytochrome b-559 alpha-subunit had been cleaved by trypsin, was no longer able to bind the 33 kDa protein. This strongly suggests that a domain in loop E of CP43 and/or the C-terminal region of the cytochrome b-559 alpha-subunit are necessary for binding of the extrinsic 33 kDa protein to PS II.

    DOI: 10.1016/S0005-2728(97)00005-4

    PubMed

    CiNii Article

    researchmap

  • Identification of domains on the extrinsic 33KDa protein possibly involved in electrostatic interaction with photosystem II complex by means of chemical modification 査読

    Miura, T, Shen, J. R, Takahashi, S, Kamo, M, Nakamura, E, Ohta, H, Kamei, A, Inoue, Y, Domae, N, Takio, K, Nakazato, K, Enami, I

    J Biol Chem   272 ( 6 )   3788 - 3798   1997年2月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    The extrinsic 33-kDa protein of photosystem II (PSII) was modified with various reagents, and the resulting proteins were checked for the ability to rebind to PSII and to reactivate oxygen evolution. While modification of more than eight carboxyl groups of aspartyl and glutamyl residues with glycine methyl ester did not affect the rebinding and reactivating capabilities, modification of amino groups of lysyl residues with either N-succinimidyl propionate or 2, 4,6-trinitrobenzene sulfonic acid or modification of guanidino groups of arginyl residues with 2,3-butanedione resulted in a loss of rebinding and reactivating capabilities of the 33-kDa protein. Moreover, the number of lysyl and arginyl residues susceptible to modification was significantly decreased when the protein was bound to PSII as compared with when it was free in solution, whereas the number of carboxyl groups modified was little affected. These results suggested that positive charges are important for the electrostatic interaction between the extrinsic 33-kDa protein and PSII intrinsic proteins, whereas negative charges on the protein do not contribute to such interaction. By a combination of protease digestion and mass spectroscopic analysis, the domains of lysyl residues accessible to N-succinimidyl propionate or 2,4, 6-trinitrobenzene sulfonic acid modification only when the 33-kDa protein is free in solution were determined to be Lys4, Lys20, Lys66-Lys76, Lys101, Lys105, Lys130, Lys159, Lys186, and Lys230-Lys236. These domains include those previously reported accessible to N-hydroxysuccinimidobiotin only in solution (Frankel and Bricker (1995) Biochemistry 34, 7492-7497), and may be important for the interaction of the 33-kDa protein with PSII intrinsic proteins.

    DOI: 10.1074/jbc.272.6.3788

    PubMed

    CiNii Article

    researchmap

  • Isolation and characterization of photosystem II core complex from the red alga Cyanidium caldarium : association of cytochrome c-550 and 12kDa protein with the complex 査読

    Enami, I, Murayama, H, Ohta, H, Kamo, M, Nakazato, K, Shen, J. R

    Biochim Biophys Acta   1232   208 - 216   1995年12月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    A Photosystem II (PS II) complex was purified from an acidophilic as well as a thermophilic red alga, Cyanidium caldarium. The purified PS II complex was essentially devoid of phycobiliproteins and other contaminating components, and showed a high oxygen-evolving activity of 2375 mumol O2/mg Chl per h using phenyl-p-benzoquinone as the electron acceptor. The expression of this high activity did not require addition of exogenous Ca2+, although EDTA reduced the activity by 40%. This effect of EDTA can be reversed not only by Ca2+ but also by Mg2+; a similar Mg2+ effect has been observed in purified cyanobacterial PS II but not in higher plant PS II. Immunoblotting analysis indicated the presence of major intrinsic polypeptides commonly found in PS II from cyanobacteria and higher plants as well as the extrinsic 33 kDa protein. Antibodies against the extrinsic 23 and 17 kDa proteins of higher plant PS II, however, did not crossreact with any polypeptides in the purified PS II, indicating the absence of these proteins in the red alga. In contrast, two other extrinsic proteins of 17 and 12 kDa were present in the red algal PS II; they were released by 1 M Tris or Urea/NaCl treatment but not by 1 M NaCl. The 17 kDa polypeptide was identified to be cytochrome c-550 from heme-staining, immunoblot analysis and N-terminal amino acid sequencing, and the 12 kDa protein was found to be homologous to the 12 kDa extrinsic protein of cyanobacterial PS II from its N-terminal sequence. These results indicate that PS II from the red alga is closely related to PS II from cyanobacteria rather than to that from higher plants, and that the replacement of PS II extrinsic cytochrome c-550 and the 12 kDa protein by the extrinsic 23 and 17 kDa proteins occurred during evolution from red algae to green algae and higher plants.

    DOI: 10.1016/0005-2728(95)00122-0

    PubMed

    CiNii Article

    researchmap

  • An independent role of cytochrome c-550 in cyanobacterial photosystem II as revealed by double-deletion mutagenesis of the psbO and psbV genes in Synechocystis sp. PCC 6803 査読

    SHEN J.-R.

    Biochemistry   34   12661 - 12668   1995年

  • CAUSE FOR DARK, CHILLING-INDUCED INACTIVATION OF PHOTOSYNTHETIC OXYGEN-EVOLVING SYSTEM IN CUCUMBER LEAVES 査読

    SHEN, JR, TERASHIMA, I, S KATOH

    PLANT PHYSIOLOGY   93 ( 4 )   1354 - 1357   1990年8月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    DOI: 10.1104/pp.93.4.1354

    Web of Science

    researchmap

  • ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF PHOTOSYSTEM-II COMPLEXES WHICH LACK LIGHT-HARVESTING CHLOROPHYLL-A/B PROTEINS BUT RETAIN 3 EXTRINSIC PROTEINS RELATED TO OXYGEN EVOLUTION FROM SPINACH 査読

    ENAMI, I, K KAMINO, SHEN, JR, K SATOH, S KATOH

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA   977 ( 1 )   33 - 39   1989年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

    researchmap

  • NEAREST NEIGHBOR RELATIONSHIPS AMONG CONSTITUENT PROTEINS OF OXYGEN-EVOLVING PHOTOSYSTEM-II MEMBRANES - BINDING AND FUNCTION OF THE EXTRINSIC 33 KDA PROTEIN 査読

    ENAMI, I, T MIYAOKA, Y MOCHIZUKI, SHEN, JR, K SATOH, S KATOH

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA   973 ( 1 )   35 - 40   1989年1月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

    Web of Science

    researchmap

▼全件表示

書籍等出版物

  • 光合成

    日本光合成学会編( 担当: 共著 ,  範囲: 沈 建仁 : 構造解析の新展開, pp. 179-186)

    朝倉書店  2021年11月 

     詳細を見る

  • Photosynthesis: Molecular Approaches to Solar Energy Conversion, Advances in Photosynthesis and Respiration, Vol. 47

    ( 担当: 共編者(共編著者))

    Springer, Switzerland  2021年10月 

     詳細を見る

  • Photosynthesis: Molecular Approaches to Solar Energy Conversion, Advances in Photosynthesis and Respiration, Vol. 47

    ( 担当: 共著 ,  範囲: Wenda Wang, Jian-Ren Shen, Structure, Organization and Function of Light-harvesting Complexes Associated with Photosystem II. pp. 163-194)

    Springer, Switzerland  2021年10月 

     詳細を見る

  • Encyclopedia of Biological Chemistry, 3rd Edition

    ( 担当: 共著 ,  範囲: Jian-Ren Shen: Photosystem II: Protein Components, Structure and Electron Transfer. vol. 2, pp. 215–228)

    Oxford, Elsevier  2021年2月 

     詳細を見る

  • CSJカレントレビュー38 光エネルギー変換における分子触媒の新展開

    日本化学会編( 担当: 分担執筆 ,  範囲: 菅 倫寛、沈 建仁: 光合成光化学系IIの構造と触媒機能, pp 26-31)

    化学同人  2020年5月 

     詳細を見る

  • Methods in Enzymology – 613, Enzymes of Energy Technology

    ( 担当: 分担執筆 ,  範囲: Keisuke Kawakamia; Jian-Ren Shen: Purification of fully active and crystallizable photosystem II from thermophilic cyanobacteria. pp 1-16.)

    Academic Press  2018年3月 

     詳細を見る

  • 光化学系II

    株式会社エヌ・ティー・エス  2017年 

     詳細を見る

  • Photosystem II

    2017年 

     詳細を見る

  • Current Insights to Enhance Hydrogen Production by Photosynthetic Organisms

    Wiley-VCH  2016年 

     詳細を見る

  • 第8章 光化学系IIの分子構造と電子移動

    化学同人  2015年 

     詳細を見る

  • Large-Scale QM/MM Calculations of Hydrogen Bonding Networks for Proton Transfer and Water Inlet Channels for Water Oxidation—Theoretical System Models of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II

    2014年 

     詳細を見る

  • Structure-Function Relationships in the Mn4CaO5 Water Splitting Cluster,

    Springer  2014年 

     詳細を見る

  • Stress Biology of Cyanobacteria

    Taylor & Francis Group, LCC  2013年 

     詳細を見る

  • Methods in Molecular Biology: Photosynthesis Protocols

    Humana Press  2010年 

     詳細を見る

  • Red Algae in The Genomics Age

    Springer  2010年 

     詳細を見る

  • Photosynthetic Protein Complexes, A Structural Approach

    WILEY-VCH, Germany  2008年 

     詳細を見る

  • Photosystem II: The Light-Driven Water:Plastoquinone Oxidoreductase

    Springer, The Netherlands.  2005年 

     詳細を見る

  • Methods in Molecular Biology: Photosynthesis Protocols

    Humana Press.  2004年 

     詳細を見る

  • 光合成事典

    学会出版センター  2003年 

     詳細を見る

  • EPR in the 21th Century: Basics and Applications to Material, Life and Earth Sciences

    Elsevier Science B.V.  2002年 

     詳細を見る

▼全件表示

MISC

  • Geometric, electronic and spin structures of the CaMn4O5 catalyst for water oxidation in oxygen-evolving photosystem II. Interplay between experiments and theoretical computations

    Kizashi Yamaguchi, Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Takashi Kawakami, Koichi Miyagawa, Michihiro Suga, Fusamichi Akita, Jian-Ren Shen

    COORDINATION CHEMISTRY REVIEWS   471   2022年11月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:書評論文,書評,文献紹介等  

    DOI: 10.1016/j.ccr.2022.214742

    Web of Science

    researchmap

  • イネ由来ケイ酸チャネルによるケイ酸透過機構の構造基盤

    齊藤恭紀, 三谷(上野)奈見季, 斉藤圭亮, 斉藤圭亮, 松木謙悟, HUANG Sheng, YANG Lingli, 山地直樹, 石北央, 石北央, SHEN Jian-Ren, SHEN Jian-Ren, MA Jian Feng, 菅倫寛, 菅倫寛, 菅倫寛

    日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   44th   2021年

     詳細を見る

  • クライオ電子顕微鏡単粒子解析による光合成超分子複合体の構造解析 査読

    宮崎直幸, 長尾遼, 加藤公児, 沈 建仁, 秋田総理

    光合成研究   28   112 - 118   2018年

     詳細を見る

    記述言語:日本語  

    researchmap

  • The crystal structure of Deg9 reveals a novel octameric-type HtrA protease. 国際誌

    Min Ouyang, Xiaoyi Li, Shun Zhao, Hua Pu, Jianren Shen, Zach Adam, Tim Clausen, Lixin Zhang

    Nature plants   3 ( 12 )   973 - 982   2017年12月

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of photosynthetic water-splitting reaction

    262   400 - 406   2017年

     詳細を見る

  • X線自由電子レーザーを利用した光化学系IIの原子構造と水分解反応機構の解明

    菅 倫寛, 秋田 総理, 沈 建仁

    レーザー学会誌「レーザー研究」   45 ( 8 )   475 - 479   2017年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:レーザー学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 植物光化学系I-集光性アンテナI 超複合体におけるエネルギー伝達の構造基盤

    菅 倫寛, 沈 建仁

    SPring-8/SACLA利用者情報   22 ( 3 )   233 - 237   2017年

     詳細を見る

  • 光合成水分解・酸素発生反応の構造基盤

    秋田総理, 菅倫寛, 沈建仁

    日本生化学会誌   89 ( 5 )   699 - 709   2017年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   掲載種別:書評論文,書評,文献紹介等  

    DOI: 10.14952/SEIKAGAKU.2017.890699

    Scopus

    researchmap

  • シリアルフェムト秒結晶解析により明らかにした光化学系IIの反応中間体の構造と酸素発生機構

    菅 倫寛, 秋田 総理, 菅原 道泰, 久保 稔, 岩田 想, 沈 建仁

    日本放射光学会誌   30 ( 5 )   228 - 234   2017年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本放射光学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 光合成水分解反応の分子機構

    沈 建仁

    医学のあゆみ   262   400 - 406   2017年

     詳細を見る

  • 放射光X 線結晶構造解析による光合成・光化学系IIの水分解・酸素発生機構の解明

    神谷 信夫, 沈 建仁

    日本結晶学会誌   59 ( 2 )   1 - 8   2017年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本結晶学会  

    DOI: 10.5940/jcrsj.59.64

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • Elucidation of the water-splitting and oxygen evolution mechanism of photosynthetic photosystem II by synchrotron radiation X-ray crystallography

    Journal of the Japanese Crystallography Society   59   1 - 8   2017年

     詳細を見る

  • Structural basis for the photosynthetic water-splitting/oxygen-evolving reaction

    Journal of the Japanese Biochemical Society   89   699 - 709   2017年

     詳細を見る

  • Toward artificial photosynthesis -- Synthesis of model compounds of photosynthetic water-splitting catalyst

    Chemistry   72   46 - 50   2016年

     詳細を見る

  • フェムト秒X線レーザーを用いて決定した光化学系II複合体の無損傷構造

    菅 倫寛, 秋田 総理, 沈 建仁, 山本 雅貴, 吾郷 日出夫

    日本結晶学会誌   58 ( 3 )   126 - 132   2016年

     詳細を見る

  • Structural biology of photosynthesis

    Biophysics   56 ( 2 )   79 - 86   2016年

     詳細を見る

  • 光合成の構造生物学

    沈 建仁, 秋田 総理, 菅 倫寛

    生物物理   56 ( 2 )   79 - 86   2016年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人 日本生物物理学会  

    Oxygenic photosynthesis synthesizes sugars from water and carbon dioxide using light energy from the sun, thereby converts light energy into chemical energy and provides oxygen for aerobic life on the earth. The light-harvesting, electron transfer, and water-splitting reactions of photosynthesis are catalyzed by two large membrane-protein complexes photosystem II (PSII) and photosystem I (PSI). Through high-resolution crystal structural analysis by synchrotron X-rays as well as femtosecond X-ray free electron lasers, the mechanisms of these reactions have become understandable at the atomic level. Here we review the recent progresses in analyzing the structures of PSII and PSI as well as their functional implications.

    DOI: 10.2142/biophys.56.079

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: https://jlc.jst.go.jp/DN/JLC/20021928091?from=CiNii

  • SACLAが解き明かす光合成の仕組み

    沈 建仁

    月刊 OPTRONICS   409   31 - 35   2016年

     詳細を見る

  • 光合成水分解触媒のモデル化合物の合成ー人工光合成の実現に向けて

    沈 建仁

    化学   72   46 - 50   2016年

     詳細を見る

  • Damage-free structure of photosystem II determined by femtosecond X-ray free electron laser

    Journal of the Japanese Crystallography Society   58 ( 3 )   126 - 132   2016年

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting revealed by SACLA

    OPTRONICS   409   31 - 35   2016年

     詳細を見る

  • X線自由電子レーザーで決定した光化学系II複合体の無損傷結晶構造と水分解反応機構

    放射光学会誌   28   177 - 181   2015年

     詳細を見る

  • Damage-free structure of photosystem determined by X-ray free electron laser and the mechanism of water-splitting

    28   177 - 181   2015年

     詳細を見る

  • PsbA3-D1 タンパク質を発現する光化学系II 複合体の結晶構造

    鵜飼 奈津美, 菅 倫寛, 杉浦 美羽

    光合成研究   25 ( 1 )   22 - 27   2015年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本光合成研究会  

    CiNii Article

    researchmap

  • 高等植物の光化学系I-光捕集アンテナI超複合体におけるエネルギー伝達経路の構造基盤

    ライフサイエンス新着論文レビュー   2015年

     詳細を見る

  • Protein 3D structures -- Photosystem II complex

    55   226   2015年

     詳細を見る

  • Crystal structure of Photosystem II with the D1 protein encoded by the psbA3 gene

    Photosynthesis Research   25   22 - 27   2015年

     詳細を見る

  • タンパク質立体構造散歩 光化学系II複合体

    生物物理   55   226   2015年

     詳細を見る

  • Large-scale QM/MM calculations of hydrogen bonding networks for proton transfer and water inlet channels for water oxidation—Theoretical system models of the oxygen-evolving complex of Photosystem II

    Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

    Advances in Quantum Chemistry   70   325 - 413   2015年

  • The mystery of photosynthesis revealed by crystal structural analysis

    7   22 - 25   2014年

     詳細を見る

  • 結晶構造解析が解き明かす光合成の謎

    ミルシル   7   22 - 25   2014年

     詳細を見る

  • フェムト秒X線レーザーにより明らかにされた1.95Å分解能における光化学系II複合体の天然状態の構造

    ライフサイエンス新着論文レビュー   2014年

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の高分解能構造と水分解反応の機構

    実験医学増刊号「構造生命科学で何がわかるのか,何ができるのか」   32   142 - 147   2014年

     詳細を見る

  • Native structure of photosystem II at 1.95 A resolution revealed by femtosecond X-ray laser

    2014年

     詳細を見る

  • Crystal structure of Extrinsic protein in photosystem II 査読

    R. Nagao, M. Suga, A. Niikura, A. Okumura, F.H.M. Koua, T. Suzuki, T. Tomo, I. Enami, J.R. Shen

    2013年9月

     詳細を見る

    出版者・発行元:Protein Data Bank, Rutgers University  

    DOI: 10.2210/pdb4k7b/pdb

    researchmap

  • 26aXC-1 植物型光合成反応中心の光捕集過程 : 構造情報に基づく理解2(26aXC 化学物理1,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    柴田 穣, 西 俊輔, 川上 恵典, 沈 建仁, Renger Thomas

    日本物理学会講演概要集   68 ( 1 )   414 - 414   2013年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 光合成の水分解・酸素発生機構の解明に向けて

    神谷信夫, 川上恵典, 梅名泰史, 沈 建仁

    放射光学会誌   26   3 - 10   2013年

     詳細を見る

  • High resolution structure of photosystem II and the mechanism of water-splitting

    Jian-Ren Shen, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya

    BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS   1817   S2 - S3   2012年10月

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    DOI: 10.1016/j.bbabio.2012.06.016

    Web of Science

    researchmap

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting and oxygen evolution based on high resolution structure of photosystem II

    Jian-Ren Shen

    67   15 - 19   2012年

     詳細を見る

  • 光合成 最大の謎を解明

    沈 建仁

    教科研究理科   195   12 - 16   2012年

     詳細を見る

  • 高分解能結晶構造に基づく光合成水分解・酸素発生の分子機構

    沈 建仁

    酵素工学ニュース   67   15 - 19   2012年

     詳細を見る

  • 高分解能構造から見えてきた光合成水分解の仕組み

    沈 建仁, 梅名泰史, 川上恵典, 神谷信夫

    生物物理   52 ( 3 )   140 - 143   2012年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association  

    Photosystem II (PSII) is a membrane-protein complex consisting of 17 trans-membrane subunits and 3 peripheral, extrinsic subunits with a total molecular mass of 350 kDa for a monomer. PSII performs a series of light-induced electron transfer reactions, leading to the conversion of light energy into biologically useful chemical energy, coupled with this is the splitting of water and generation of molecular oxygen. Both the chemical energy converted and molecular oxygen generated by PSII are indispensible for sustaining life on the earth; thus PSII is an extremely important protein complex. We have succeeded in crystallizing the PSII complex at a resolution of 1.9 Å, and analyzed its structure. Here we describe the structure of PSII, in particular the Mn4CaO5-cluster, which is the catalytic center of water-splitting, analyzed at the atomic resolution. Based on these, we discuss the possible mechanisms of light-induced water-splitting and its implications in artificial photosynthesis.<br>

    DOI: 10.2142/biophys.52.140

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: https://jlc.jst.go.jp/DN/JALC/10000488562?from=CiNii

  • Running on sun

    M. M, Najafpour, J. Barber, J-R. Shen, G. F. Moore, Govindjee

    Chemistry World   2012 ( November )   43   2012年

     詳細を見る

  • 高分解能構造から見えてきた光合成水分解の仕組み

    沈 健仁, 梅名 泰史, 川上 恵典, 神谷 信夫

    生物物理   52 ( 3 )   140 - 143   2012年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association  

    Photosystem II (PSII) is a membrane-protein complex consisting of 17 trans-membrane subunits and 3 peripheral, extrinsic subunits with a total molecular mass of 350 kDa for a monomer. PSII performs a series of light-induced electron transfer reactions, leading to the conversion of light energy into biologically useful chemical energy, coupled with this is the splitting of water and generation of molecular oxygen. Both the chemical energy converted and molecular oxygen generated by PSII are indispensible for sustaining life on the earth; thus PSII is an extremely important protein complex. We have succeeded in crystallizing the PSII complex at a resolution of 1.9 Å, and analyzed its structure. Here we describe the structure of PSII, in particular the Mn4CaO5-cluster, which is the catalytic center of water-splitting, analyzed at the atomic resolution. Based on these, we discuss the possible mechanisms of light-induced water-splitting and its implications in artificial photosynthesis.<br>

    DOI: 10.2142/biophys.52.140

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: https://jlc.jst.go.jp/DN/JALC/10000488562?from=CiNii

  • Elucidating the largest mystery of photosynthesis

    Jian-Ren Shen

    195   12 - 16   2012年

     詳細を見る

  • 光化学系IIにおける酸素発生中心Mnクラスターの多周波EPR研究

    松岡秀人, SHEN Jian-Ren, 伊東信哉, 古川貢, 中村敏和, 山内清語

    電子スピンサイエンス学会年会講演要旨集   51st   2012年

     詳細を見る

  • 25pGP-7 光化学系IIマンガンクラスターの電子構造の密度汎関数理論による研究(25pGP 領域12シンポジウム:光化学系IIにおける酸素発生中心,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    山中 秀介, 神田 慧太, 梅名 泰史, 川上 恵典, 沈 建仁, 神谷 信夫, 奥村 光隆, 中村 春木, 山口 兆

    日本物理学会講演概要集   66 ( 1 )   378 - 378   2011年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 25pGP-2 光合成酸素発生を支える光化学系IIの原子構造(25pGP 領域12シンポジウム:光化学系IIにおける酸素発生中心,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

    沈 建仁, 梅名 泰史, 川上 恵典, 神谷 信夫

    日本物理学会講演概要集   66 ( 1 )   376 - 376   2011年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 27pHC-12 結晶構造情報に基づくシミュレーションによる光化学系II反応中心の時間分解蛍光スペクトルの解析(27pHC 非線形光学/超高速現象,領域5(光物性))

    柴田 穣, 西 俊輔, 野地 智康, 川上 恵典, 沈 建仁, Renaer Thomas

    日本物理学会講演概要集   66 ( 1 )   794 - 794   2011年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 光合成水分解・酸素発生を可能にする光化学系IIの原子構造

    沈 建仁

    光合成研究   21   72 - 79   2011年

     詳細を見る

  • Location and function of chloride ions in oxygen-evolving photosystem II revealed by X-Ray crystallography

    Jian-Ren Shen

    SPring-8 Research Frontiers   2009   22 - 23   2010年

     詳細を見る

  • 系II複合体の精製法

    沈 建仁, 榎並 勲

    低温科学   67   275 - 283   2009年

     詳細を見る

  • 電子伝達活性

    沈 建仁

    低温科学   67   551 - 560   2009年

     詳細を見る

  • 光化学系IIの例から見る膜タンパク質複合体の結晶化と構造解析

    沈建仁, 川上恵典

    光合成研究   19   19 - 25   2009年

     詳細を見る

  • 単結晶光化学系II複合体の高周波CW/パルスESR研究

    松岡秀人, SHEN Jian-Ren, 西山圭, 大庭裕範, 山内清語, 古川貢, 中村敏和, 河盛阿佐子

    電子スピンサイエンス学会年会講演要旨集   48th   2009年

     詳細を見る

  • A brief introduction of Kimiyuki Satoh TRIBUTE

    Isao Enami, Jian-Ren Shen

    PHOTOSYNTHESIS RESEARCH   98 ( 1-3 )   7 - 11   2008年10月

     詳細を見る

  • Purification and crystallization of photosystem II dimmer complex

    Hideyuki Adachi, Isao Enami, Takahiro Henmi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis. Energy from the Sun   1   351 - 356   2008年

     詳細を見る

  • 光化学系II反応中心の多周波EPR研究

    松岡秀人, SHEN Jian-Ren, 西山圭, 古川貢, 中村敏和, 山内清語, 河盛阿佐子

    電子スピンサイエンス学会年会講演要旨集   47th   2008年

     詳細を見る

  • Purification and crystallization of photosystem II complex from a red alga Cyanidium Caldarium.

    Hideyuki Adachi, Isao Enami, Takahiro Henmi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   48   S98 - S98   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • Crystal structure analysis of a mutant photosystemII complex lacking PsbM from Thermosynechococcus vulcanus.

    Yosuke Kawabata, Takahiro Henmi, Masako Iwai, Takashi Suemasu, Keisuke Kawakami, Chika Aoyama, Masahiko Ikeuchi, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   48   S97 - S97   2007年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • Roles of lipids in photosystem II from cyanobacteria

    J Leng, Sakurai, I, H Wada, Shen, JR

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   47   S162 - S162   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • Current status and prospects of PSII structure analysis

    Shen, JR, H Naitow, M Furuse, S Saijo, A Ohkuma, K Kawakami, T Henmi, N Kamiya

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   47   S9 - S9   2006年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • 光化学系2複合体の構造と機能 (生命秩序を担う生体超分子) -- (超分子による生体エネルギー・物質変換とその制御)

    神谷 信夫, 沈 建仁

    蛋白質核酸酵素   50 ( 10 )   1174 - 1179   2005年8月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:共立出版  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 光化学系II複合体の構造と機能

    神谷 信夫, 沈 建仁

    蛋白質 核酸 酵素   50, 1174-1179.   2005年

     詳細を見る

  • W-band EPR studies of Mn-cluster in the S-0 and S-2 states of Cyanobacterial single crystals.

    A Kawamori, Shen, JR, K Furukawa, E Matsuoka, T Kato

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   45   S81 - S81   2004年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • Thermodynamic and kinetic analysis of unfolding of P23k protein isolated from spinach photosystem II

    CY Tan, CH Xu, Shen, JR, S Sukuma, Y Yamamoto, C Balny, KC Ruan

    ACTA BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA SINICA   35 ( 7 )   677 - 681   2003年7月

     詳細を見る

    記述言語:中国語  

    Web of Science

    researchmap

  • Crystal structure analysis of photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

    Kamiya N, Shen J.-R

    PS2001 Proceedings, 12th International Congress on Photosynthesis   2002年

     詳細を見る

  • Cross-reconstitution of cytochrome c550 and 12 kDa protein between cyanobacterial and red algal PSII.

    Enami I, Iwai M, Akiyama A, Nakata Y, Ohta H, Shen J.-R

    PS2001 Proceedings, 12th International Congress on Photosynthesis   2002年

     詳細を見る

  • Distribution of extrinsic proteins among various organisms as an index of evolution of oxygen-evolving PSII.

    Nakata Y, Satoh A, Nakamura K, Okumura A, Ohta H, Shen J.-R, Enami I

    PS2001 Proceedings, 12th International Congress on Photosynthesis   2002年

     詳細を見る

  • Reconstitution of the 23 and 17 kDa proteins with spinach PSII which had been exchanged for the 33 kDa protein from different plant species.

    Suzuki T, Akiyama A, Iwai M, Tohri A, Tomo T, Ohta H, Shen J.-R, Enami I

    PS2001 Proceedings, 12th International Congress on Photosynthesis   2002年

     詳細を見る

  • Evolution of oxygen-evolving PSII in view of extrinsic proteins among various organisms. II

    Y Nakada, H Ohta, Shen, JR, Enami, I

    PLANT AND CELL PHYSIOLOGY   43   S63 - S63   2002年

     詳細を見る

    記述言語:英語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(国際会議)  

    Web of Science

    researchmap

  • Functional Analysis of psbV and a Novel c-type Cytochrome Gene psbV2 of the Thermophilic Cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus Strain BP-1

    Katoh Hiroshi, Itoh Suwako, Shen Jian-Ren, IKEUCHI Masahiko

    Plant and cell physiology   42 ( 6 )   599 - 607   2001年6月

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 紅藻チアニジウムの酸素発生標品に存在する表在性20kDa蛋白のクローニングと発現

    太田尚孝, 上野匡司, 沈建仁, 加茂政晴, 榎並勲

    日本植物生理学会年会要旨集   40th   218   2000年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(全国大会,その他学術会議)  

    J-GLOBAL

    researchmap

  • Crystallization and the crystal properties of the oxygen-evolving photosystem II from Synechococcus vulcanus.

    Shen J.-R, Kamiya N

    Biochemistry   2000年

     詳細を見る

  • 27aN-1 光捕集クロロフィルa/b蛋白質複合体が正八面体結晶中で形成する高次構造

    日野 智也, 金森 英司, 五藤 俊昭, 竹田 一旗, 佐藤 英憲, 沈 建仁, 井上 頼直, 神山 勉

    日本物理学会講演概要集   54 ( 2 )   318 - 318   1999年9月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • CLONING OF THE GENES FOR CYTOCHROME C550 AND A C550-LIKE PROTEIN FROM THE THERMOPHILIC CYANOBACTERIUM Synechococcus elongatus.

    KATOH Hiroshi, ITOH Suwako, SHEN Jian-Ren, IKEUCHI Masahiko

    Plant and cell physiology   40   s34 - s34   1999年3月

     詳細を見る

  • COMPARISON OF BINDING AND FUNCTIONAL PROPERTIES OF Cyt c550 FROM CYANOBCTERIAL PSII WITH THOSE OF Cyt c550 FROM RED ALGAL PSII

    IWAI Masako, AKIYAMA Ai, OHTA Hisataka, SHEN Jian-Ren, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   40   s33 - s33   1999年3月

     詳細を見る

  • CLONING OF THE GENE ENCODING THE PSII EXTRINSIC 33 kDa PROTEIN FROM A RED ALGA

    OKUYAMA Satoshi, OHTA Hisataka, SHEN Jian-Ren, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   40   s30 - s30   1999年3月

     詳細を見る

  • THE STRUCTURE OF PHOTOSYSTEM II IN THYLAKOID MEMBRANES IMPLICATED FROM THE FUNCTIONAL DIFFERENCES OF ISOLATED PSII MONOMER AND DIMER

    SHEN Jian-Ren

    Plant and cell physiology   40   s33 - s33   1999年3月

     詳細を見る

  • COMPARISON OF PSII CRYSTALS BETWEEN HIGHER PLANTS AND CYANOBACTERIA

    SHEN Jian-Ren, AOYAMA Hiroshi, INOUE Yorinao, NOBUO Kamiya

    Plant and cell physiology   40   s33 - s33   1999年3月

     詳細を見る

  • CROSS-RECONSTITUTION OF FOUR EXTRINSIC PROTEINS FROM A RED ALGA WITH HIGHER PLANT AND CYANOBACTERIAL PSII

    Isao Enami, Shizue Yoshihara, Hisataka Ohta, Jian-Ren Shen

    Photosynthesis:Mechanisms and Effects   Vol 2   1435 - 1438   1999年

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリアSynechococcuselongatusのチトクロムc550およびc550類似タンパク質の遺伝子のクローニング

    加藤浩, 伊藤須和子, 沈建仁, 池内昌彦

    日本植物生理学会年会要旨集   39th   1999年

     詳細を見る

  • 光捕集クロロフィル蛋白複合体のX線構造解析

    日野 智也, 佐藤 英憲, 岩永 誠之, 沈 建仁, 井上 頼直, 神山 勉

    生物物理   38 ( 2 )   S15   1998年9月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本生物物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • 高等植物, 紅藻, ラン色細菌の系II表在性蛋白のCross-Reconstitution

    榎並 勲, 吉原 静恵, 岩井 雅子, 秋山 愛, 太田 尚孝, 沈 建仁

    日本植物学会大会研究発表記録 = Proceedings of the annual meeting of the Botanical Society of Japan   62   118 - 118   1998年9月

     詳細を見る

  • 紅藻チアニジウムの酸素発生標品に存在する表在性蛋白チトクロームc‐550のクローニングと発現

    太田尚孝, 加藤宝, 奥村彰槻, 沈建仁, 加茂政晴, 榎並勲

    日本植物生理学会年会要旨集   38th(1998)   75   1998年5月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   掲載種別:研究発表ペーパー・要旨(全国大会,その他学術会議)  

    J-GLOBAL

    researchmap

  • CROSS-RECONSTITUTION OF FOUR EXTRINSIC PROTEINS FROMA RED ALGA TO HIGHER PLANT PSII

    YOSHIHARA Shizue, OHTA Hisataka, SHEN Jian-Ren, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   39   S15 - S15   1998年5月

     詳細を見る

  • CONSTRUCTION OF MONOCLONAL ANTIBODIES AGAINST PSII REACTION CENTER PROTEINS AND THE USE OF THEM TO ANALYZE THE TOPOLOGY OF PSII REACTION CENTER

    TOMO Tatsuya, SHEN Jian-Ren, OGAWA Kenji, INOUE Yorinao

    Plant and cell physiology   39   S12 - S12   1998年5月

     詳細を見る

  • 31a-YB-2 膜蛋白質の球殻構造体

    日野 智也, 竹田 一旗, 佐藤 英憲, 櫻井 郁子, 沈 建仁, 井上 頼直, 岡田 哲二, 神山 勉

    日本物理学会講演概要集   53 ( 1 )   731 - 731   1998年3月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • LHC-IIの結晶とbRの結晶の構造上の類似性

    日野 智也, 竹田 一旗, 沈 建仁, 井上 頼直, 櫻井 郁子, 岡田 哲二, 神山 勉

    生物物理   37   S126   1997年10月

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:一般社団法人日本生物物理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

  • CLONING AND EXPRESSION OF A cDNA ENCODING THE EXTRINSIC 12 KDA PROTEIN INVOLVED IN OXYGEN-EVOLVING PS II COMPLEX FROM A RED ALGA Cyanidium caldarium

    OKUMURA Akinori, OHTA Hisataka, SHEN Jian-Ren, KAMO Masaharu, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   38   s25   1997年3月

     詳細を見る

  • CRYSTALLIZATION OF OXYGEN-EVOLVING PSII COMPLEX : EFFECTS OF DETERGENTS

    SHEN Jian-Ren, AOYAMA Hiroshi, INOUE Yorinao, KAMIYA Nobuo

    Plant and cell physiology   38   s22   1997年3月

     詳細を見る

  • IDENTIFICATION OF LYS RESIDUES ON THE EXTRINSIC 33KDA PROTEIN INVOLVED IN ELECTROSTATIC INTERACTION WITH PSII COMPLEX BY CHEMICAL MODIFICATION WITH NSP

    KAMEI Ayako, SHEN Jian-Ren, OHTA Hisataka, DOMAE Naoshi, TAKIO Koji, INOUE Yorinao, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   38   s25   1997年3月

     詳細を見る

  • RECONSTITUTION OF THREE EXTRINSIC PROTEINS, THE 20KDA-, 12KDA- PROTEINS AND CYTC-550, IN OXYGEN-EVOLVING PSII COMPLEX FROM A RED ALGA, Cyanidium caldarium

    KIKUCHI Sanae, FUKUDA Tetuya, OHTA Hisataka, SHEN Jian-Ren, ENAMI Isao

    Plant and cell physiology   38   s25   1997年3月

     詳細を見る

  • Analysis of the psbU gene encoding the 12-kDa extrinsic protein of Photosystem II and studies on its role by deletion mutagenesis in Synechocystis sp. PCC 6803

    SHEN J.-R.

    J. Biol. Chem.   272   17821 - 17826   1997年

  • CLONING AND DIRECTED MUTAGENESIS OF THE GENE CODING FOR A 12 kDa PHOTOSYSTEM II EXTRINSIC PROTEIN FROM Synechocystis sp. PCC 6803

    SHEN Jian-Ren, INOUE Yorinao

    Plant and cell physiology   37   36 - 36   1996年3月

     詳細を見る

  • Chemical crosslinking studies ofextrinsic proteins in cyanobacterial photosystem II

    HAN Kab-Cho, SHEN Jian-Ren, IKEUCHI Masahiko, INOUE Yorinao

    Plant and cell physiology   36   S92   1995年3月

     詳細を見る

  • The role of cytochrome c-550 as studied through reverse genetics and mutant characterization in Synechocystis sp. PCC 6803

    SHEN J. R.

    J. Biol. Chem.   270   6901 - 6907   1995年

  • Binding and functional properties of two new extrinsic components, cytchrome c-550 and 12 kDa protein, in cyanobacterial photosystem II

    SHEN J. -R.

    Biochemistry   32   1925 - 1932   1993年

  • Cellular localization of cytochrome c550. Its specific_association with cyanobacterial photosystem II

    SHEN J. -R.

    J. Biol. Chem.   268   20408 - 20413   1993年

  • Stoichiometric association of extrinsic cytochrome c_<550> and 12 kDa protein with a highly purified oxygen-evolving photosystem II core complex from Synechococcus vulcanus

    SHEN J. -R.

    FEBS Lett.   301   145 - 149   1992年

  • Low pH-Induced Dissociation of Three Extrinsic Proteins from O_2-Evolving Photosystem II :

    Shen Jian-Ren, Inoue Yorinao

    Plant and cell physiology   32 ( 3 )   453 - 457   1991年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    Three extrinsic proteins involved in oxygen evolution reversibly dissociated from Photo-system II (PS II) membranes at acidic pHS showing distinctly different pH dependencies. The pHS for half dissociation of 17, 23 and 33 kDa extrinsic proteins were determined to be 5.0, 4.1 and 3.6, respectively. The half dissociation pHS Of 17 and 23 kDa proteins were much lower than their respective isoelectric points, while that for 33 kDa protein was close to its isoelectric point. It was suggested that protonation of the negatively charged binding domain on membrane proteins causes dissociation of the former two extrinsic proteins, whereas protonation of the extrinsic protein itself is responsible for the dissociation of 33 kDa protein. Based on these, features of low pH-induced dissociation of extrinsic proteins and Mn from PS II were discussed.

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=181397

  • Inactivation and Calcium-Dependent Reactivation of Oxygen Evolution in Photosystem II Preparations Treated at pH 3.0 or with High Concentrations of NaCl :

    Shen Jian-Ren, Katoh Sakae

    Plant and cell physiology   32 ( 3 )   439 - 446   1991年

     詳細を見る

    記述言語:英語   出版者・発行元:Japanese Society of Plant Physiologists  

    A brief treatment at pH 3.0 of Photosystem II (PS II) membranes containing two bound Ca^<2+> from rice resulted in strong suppression of oxygen evolution concomiiant with extraction of one Ca^<2+> and the lost activity was restored on addition of 50 mM Ca^<2+>. However, inactivation of oxygen evolution by low pH-treatment of oxygen-evolving PS II complexes containing only one Ca^<2+> from a rice chlorophyll b-deficient mutant was not associated with extraction of the bound Ca^<2+>, although oxygen evolution was markedly enhanced by the addition of Ca^<2+> to the treated complexes. Thus, the acid-inactivation of oxygen evolution cannot be related to extraction of Ca^<2+>. On the other hand, low pH-treatment was found to share the following common features with NaCl-treatment which also causes a Ca^<2+>-reversible inactivation of oxygen evolution. (1) Exposure of PS II membranes to pH 3.0 resulted in solubilization of the 23 and 17 kDa extrinsic proteins, although the released proteins rebound to the membranes when pH was raised to 6.5. (2) There was an apparent heterogeneity in the binding affinity of Ca^<2+> effective in restoration of the oxygen-evolving activity. (3) Low pH-treated preparations required a higher concentration of Ca^<2+> for the maximum reactivation of oxygen evolution than did NaCl-washed preparations. This was also the case with Sr^<2+>, which stimulated oxygen evolution of both low pH-treated and NaCl-washed PS II membranes to smaller extents. When the extrinsic 23 and 17 kDa proteins had been removed, however, Ca^<2+> concentration dependence of oxygen evolution in low pH-treated membranes became similar to that in NaCl-washed PS 11 preparations and the changes were largely reversed by rebinding of the two proteins. These results strongly suggest that low pH-treatment and NaCl-wash involve similar mechanisms of Ca^<2+>-dependent reactivation.

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

    その他リンク: https://projects.repo.nii.ac.jp/?action=repository_uri&item_id=181395

  • Isolation and characterization of Photosystem II complexes which lack light-harvesting chlorophyll a/b proteins but retain three extrinsic proteins related to oxygen evolution from spinach

    Isao Enami, Kei Kamino, Jian-Ren Shen, Kazuhiko Satoh, Sakae Katoh

    BBA - Bioenergetics   977 ( 1 )   33 - 39   1989年10月

     詳細を見る

  • Nearest neighbor relationships among constituent proteins of oxygen-evolving Photosystem II membranes: binding and function of the extrinsic 33 kDa protein

    Isao Enami, Takeshi Miyaoka, Yasuki Mochizuki, Jian-Ren Shen, Kazuhiko Satoh, Sakae Katoh

    BBA - Bioenergetics   973 ( 1 )   35 - 40   1989年

     詳細を見る

  • Calcium content of oxygen-evolving photosystem II preparations from higher plants. Effects of NaCl treatment.

    SHEN J. R.

    Biochim. Biophys. Acta   993   358 - 364   1988年

  • Isolation of an oxygen-evolving photosystem II preparation containing only one tightly bound calcium atom a chlorophyII b-deficient mutant of rice.

    SHEN J. -R.

    Biochim. Biophys. Acta   936   386 - 394   1988年

  • 1Ca07 LHCPのない酸素発生系II標品の調整と諸性質

    榎並 勲, 紙野 圭, 沈 建仁, 佐藤 和彦, 加藤 栄

    日本植物生理学会年会およびシンポジウム : 講演要旨集   28   55 - 55   1988年

     詳細を見る

    記述言語:日本語   出版者・発行元:日本植物生理学会  

    CiNii Article

    CiNii Books

    researchmap

▼全件表示

講演・口頭発表等

  • Mechanism of photosynthetic water-oxidation studied by pump-probe time-revolved crystallography with X-ray free electron lasers 招待

    沈 建仁

    Pacifichem 2021  2021年12月18日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年12月16日 - 2021年12月21日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • 光誘導水分解反応の機構とそのシミュレーションへの期待 招待

    沈 建仁

    第35回分子シミュレーション討論会  2021年12月1日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年11月29日 - 2021年12月1日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • Mechanism of natural photosynthetic water oxidation and its implications on artificial photosynthesis 招待

    沈 建仁

    11st Asian Photochemistry Conference (APC 2021)  2021年11月2日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年11月1日 - 2021年11月4日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(基調)  

    researchmap

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation and implications in artificial photosynthesis 招待

    沈 建仁

    Chemical Science Symposium 2021: Biohybrid Approaches to Sustainable Energy Conversion. Royal Society of Chemistry  2021年9月14日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年9月13日 - 2021年9月15日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • 天然光合成における水分解・酸素発生反応機構 招待

    沈 建仁

    日本化学会第 101 春季年会シンポジウム「革新的触媒の創製:光や電場などを用いた触媒反応」  2021年3月21日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年3月19日 - 2021年3月22日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • 光合成における水分解反応機構の解明 招待

    沈 建仁

    第62回日本植物生理学会年会  2021年3月15日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年3月14日 - 2021年3月16日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • 光合成水分解反応の分子機構 招待

    沈 建仁

    第36回資源植物科学シンポジウム及び第12回植物ストレス科学研究シンポジウム  2021年3月5日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年3月5日

    記述言語:日本語   会議種別:口頭発表(招待・特別)  

    researchmap

  • Strategy of light-harvesting and energy transfer in diatoms and green algae 招待

    沈 建仁

    1st International Bioenergy & Environment Congress, From Photosynthesis to Biotechnologies. Bioscience and biotechnology  2021年2月17日 

     詳細を見る

    開催年月日: 2021年2月16日 - 2021年2月18日

    記述言語:英語   会議種別:口頭発表(基調)  

    researchmap

  • Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the S3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Comparison between water-inserted and no water-inserted structures

    Faraday Discussions  2017年 

     詳細を見る

  • Structures of PSII with herbicides bound

    Japan-France Joint Workshop on the Structure and Function of Photosystem II  2017年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on the structural analysis of photosystem II

    The Second International Symposium on Biofunctional Chemistry  2017年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応の機構解明と革新的光物質変換

    植物科学シンポジウム2017  2017年 

     詳細を見る

  • 光合成の仕組みに迫る

    JSTサイエンスアゴラ2017 越境する光科学  2017年 

     詳細を見る

  • Mechanism of light-induced water-splitting in natural photosynthesis

    2nd International RINS Symposium  2017年 

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of photosynthetic water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    15th Chinese and International Biophysics Congress  2017年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解の仕組み 〜光と水からエネルギーと酸素へ

    東京都中央区区民カレッジに「科学技術の最前線」  2017年 

     詳細を見る

  • 錯体化学会貢献賞受賞講演ー光合成における光水分解反応の機構解明

    錯体化学第67回討論会  2017年 

     詳細を見る

  • XFELによって明らかになった光化学系II水分解触媒の中間体構造と反応機構

    第55回日本生物物理学会年会  2017年 

     詳細を見る

  • 植物に学ぶ太陽光エネルギーの高効率利用ー岡山県三木記念賞受賞について

    岡山ロータリークラブ例会  2017年 

     詳細を見る

  • 植物学会学術賞受賞講演ー光合成光化学系IIと光化学系I複合体の構造と機能に関する研究

    日本植物学会第81回大会  2017年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    The XIX International Botanical Congress (IBC2017)  2017年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応の仕組み-植物に学ぶ 光エネルギーの高効率利用

    みどりの賞受賞記念講演  2017年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting from a structural point of view

    Gordon Research Conference on Photosynthesis: Photosynthetic Plasticity: From the Environment to Synthetic Systems  2017年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIによる可視光を利用した水分解の反応機構

    日本化学会 2017年春季大会 人工光合成フォーラム  2017年 

     詳細を見る

  • Structural basis for the mechanism of water-splitting in photosystem II of oxygenic photosynthesis

    IGER International Symposium on Physics of Life  2017年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    International Conference on Artificial Photosynthesis 2017 (ICARP2017)  2017年 

     詳細を見る

  • 光合成光化学系IIにおける可視光を利用した水分解の仕組み

    東京大学物性研究所短期研究会「新世代光源で切り拓く物質科学と生命科学の融合領域」  2017年 

     詳細を見る

  • Radiation damage-free structure of photosystem II and the mechanism of water-splitting

    IPR International Workshop "Bridging the gap: from structure to functional dynamics of photosynthesis related protein complexes"  2016年 

     詳細を見る

  • Structural biology of photosynthetic membrane-protein complexes

    Symposium on Photosynthesis in honor of Professor Yungang Shen for his 90 years birthday  2016年 

     詳細を見る

  • 放射光X線結晶構造解析による光化学系IIの水分解・酸素発生機構の解明

    日本結晶学会平成28年度年会および会員総会  2016年 

     詳細を見る

  • フェムト秒X線自由電子レーザーを用いた光化学系IIによる水分解反応の機構解明

    第39回日本分子生物学会年会  2016年 

     詳細を見る

  • Structure and function of Photosystem II studied by a combination of synchrotron X-rays and XFEL at SACLA

    The 10th Asia Oceania Forum for Synchrotron Radiation Research (AOFSRR 2016)  2016年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    The 42nd Naito Conference on“In the Vanguard of Structural Biology: Revolutionizing Life Sciences”  2016年 

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of photosynthetic water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    5th International Symposium on Solar Fuels and Solar Cells (5th SFSC)  2016年 

     詳細を見る

  • High resolution structure of photosystem II and the mechanism of photosynthetic water-splitting

    The 12th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation (BSR 2016)  2016年 

     詳細を見る

  • High resolution structure of Photosystem II and the mechanism of water-splitting

    Joint Spring-8 - Max IV Laboratory Workshop on New Light Sources and Biological Applications  2016年 

     詳細を見る

  • 光合成光エネルギー変換系の構造生物学

    第19回日本光生物学協会年会  2016年 

     詳細を見る

  • Structural biology of photosynthetic systems

    The 17th International Congress on Photosynthesis Research  2016年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIにおける可視光を利用した水分解の仕組み

    日本生体エネルギー研究会 第43回討論会  2016年 

     詳細を見る

  • 可視光による水分解の仕組みと人工光合成システムに向けて

    生物・光源・物性の若手を含む合同合宿勉強会  2016年 

     詳細を見る

  • Mechanism of Photosynthetic Water‐Splitting Based on the Atomic Structure of Photosystem II

    UK-Japan Solar Driven Fuel Synthesis Workshop: Materials, Understanding and Reactor Design  2016年 

     詳細を見る

  • High resolution structure of photosystem II and the mechanism of water-splitting

    79th Harden Conference: Oxygen Evolution and Reduction - Common Principles  2016年 

     詳細を見る

  • How does photosystem II split water ― a structural point of view

    Gordon Research Conference on Metallocofactors  2016年 

     詳細を見る

  • 光合成エネルギー変換系膜タンパク質複合体の構造生物学

    茨城大学大学院理工学研究科 ミニシンポジウム ~量子生命科学を切り拓く~  2016年 

     詳細を見る

  • 生物機能を理解する

    第6回「フォーラム:人工光合成」―人工光合成研究の課題と展望―  2016年 

     詳細を見る

  • タンパク質の原子構造に基づく光合成の機能解明

    植物科学シンポジウム2015  2015年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    9th Asian Biophysics Association Symposium (ABA2015)  2015年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    Cold Spring Harbor Asia Conference on Membrane Protein Structure and Function  2015年 

     詳細を見る

  • SACLAが拓く人工光合成実現への道

    SACLAシンポジウム2015「SACLA最前線 ~ SACLAを使う。未来を創る。~」  2015年 

     詳細を見る

  • 植物が光と水からエネルギーと酸素を取りだす仕組み -人工光合成開発への糸口-

    SPring-8公開講演会  2015年 

     詳細を見る

  • Purification, Crystallization And Crystal Structural Analysis Of PsbA3-only Photosystem II

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of the tll0287 protein that binds to photosystem II with the D1 subunit encoded by the psbA2 gene at 2.0 Å resolution

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • ENDOR studies on the role of the Ca ion in the water splitting

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • PsabA3のみを発現させたPsbA3-PSIIの1.9 Å分解能での結晶構造

    第6回日本光合成学会年会および公開シンポジウム  2015年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの酸素発生中心Mn4CaO5クラスターの吸収端波長X線結晶構造解析

    第6回日本光合成学会年会および公開シンポジウム  2015年 

     詳細を見る

  • Radiation damage free structure of oxygen evolving photosystem II at 1.95Å resolution revealed by X-ray Free Electron Laser

    第6回日本光合成学会年会および公開シンポジウム  2015年 

     詳細を見る

  • Inhibition mechanism of the water-splitting reaction of photosystem II by iodine ions

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • Native structure of photosystem II at 1.95Å resolution viewed by femtosecond X-ray pulses

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • PSIIのプラストキノン結合部位の 近傍に存在するホスファチジルグ リセロール分子の役割

    第56回日本植物生理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • 光合成光化学系複合体の構造生物学

    日本生体エネルギー研究会 第41回討論会  2015年 

     詳細を見る

  • Structural biology of photosystem II and photosystem I

    The 7th Asia and Oceania Conference on Photobiology  2015年 

     詳細を見る

  • 巨大タンパク質の高分解能・無損傷結晶構造解析が可能なフェムト秒X線結晶構造解析法の開発

    第53回日本生物物理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • Structural biology of photosystem II and photosystem I

    Yamada Conference "International Symposium on Dynamics and Regulation of Photosynthesis"  2015年 

     詳細を見る

  • The engine of life driven by light -- Structure and function of Photosystem II

    International Symposium "Light and Life" in memory of the "International Year of Light"  2015年 

     詳細を見る

  • ヨウ素イオンによるシアノバクテリア由来光化学系IIの酸素発生阻害機構

    日本結晶学会2015年度年会  2015年 

     詳細を見る

  • 光化学系II のMn4CaO5クラスターにおけるX線還元と吸収端波長X線結晶構造解析

    日本結晶学会2015年度年会  2015年 

     詳細を見る

  • SACLAを利用したタンパク質の構造解析

    SACLA一般公開in福岡  2015年 

     詳細を見る

  • 高等植物光化学系I-集捕集アンテナI 超複合体におけるエネルギー伝達経路の構造基盤

    日本結晶学会2015年度年会  2015年 

     詳細を見る

  • Structural basis for energy transfer pathways in the plant PSI-LHCI supercomplex

    International Conference “Photosynthesis Research for Sustainability - 2015”  2015年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on high resolution, damage-free structure of photosystem II revealed by XFEL

    LCLS User’s meeting 2015, SLAC  2015年 

     詳細を見る

  • Structural biology of Photosystem II and Photosystem I

    Workshop “Crystallography, Spectroscopy and Microscopy of Photosynthetic Protein Complexes”  2015年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    International Conference “Photosynthesis Research for Sustainability - 2015”  2015年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus vulcanus psbI欠損株由来光化学系II単量体の結晶化及びX線結晶構造解析

    日本結晶学会2015年度年会  2015年 

     詳細を見る

  • Proton transfer mechanisms of photosystem II: Hybrid ab inito quantum mechanics study

    第53回日本生物物理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • Radiation damage free structure of photosystem II in the S1 state at 1.95 Å resolution

    Gordon Research Conference on Photosynthesis  2015年 

     詳細を見る

  • High-resolution native structure analyses of supramacromolecular complexes susceptible to radiation damage

    The 29th European Crystallographic Meeting  2015年 

     詳細を見る

  • Radiation Damage-Free Structure of Photosystem II and the Mechanism of Water Oxidation

    Gordon Research Conference on Photosynthesis  2015年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of plant PSILHCI super-complex at 2. 8 Å resolution

    Gordon Research Conference on Photosynthesis  2015年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of the tll0287 protein that binds to photosystem II with the D1 subunit encoded by the psbA2 gene at 2.0 Å resolution

    Symposium "Metals in Biology"  2015年 

     詳細を見る

  • Crystallographic study for estimation of the valence of four Mn atoms in Photosystem II using anomalous absorption techniques

    Symposium "Metals in Biology"  2015年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of the tll0287 protein that binds to photosystem II with the D1 subunit encoded by the psbA2 gene at 2.0 Å resolution

    第6回日本光合成学会年会および公開シンポジウム  2015年 

     詳細を見る

  • Thermosynechococcus elongatus由来の特徴のあるPsbA2-PSIIの分子構造解析の試み

    第6回日本光合成学会年会および公開シンポジウム  2015年 

     詳細を見る

  • 立体構造解析から探る可視光を利用した水分解反応の仕組み

    第53回日本生物物理学会年会  2015年 

     詳細を見る

  • 大規模QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態

    日本化学会第94春季年会  2014年 

     詳細を見る

  • 放射光X線を利用した可視光による水分解反応の仕組みの解明

    東北放射光 雨宮シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • ENDOR studies on structural effects induced by Ca2+-depletion and Sr2+-substitution of the Mn cluster in photosystem II

    2nd Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications” (2nd AWEST 2014)  2014年 

     詳細を見る

  • 植物に学ぶ 太陽光エネルギーの高効率利用

    岡山県白陵高校 進路講演会  2014年 

     詳細を見る

  • Possible mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    International Conference on“Photosynthesis Research for Sustainability”  2014年 

     詳細を見る

  • 光捕集システムの理解のための周辺部サブユニット欠損光化学系II複合体のX結晶構造解析への試み

    第5回日本光合成学会年会及び公開シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • ホスファチジルグリセロール結合部位の改変が光化学系IIに及ぼす影響

    第5回日本光合成学会年会及び公開シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • PsbA3-D1タンパク質を発現する光化学系II複合体の精製・結晶化と構造解析

    第5回日本光合成学会年会及び公開シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • Crystal structure at 1.5 Å resolution of the PsbV2 cytochrome from the cyanobacterium Thermosynechococcus elongatus

    第5回日本光合成学会年会及び公開シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • ヨウ素イオンによる光化学系II複合体の酸素発生阻害機構

    第5回日本光合成学会年会及び公開シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • Determination of damage-free crystal structure of X-ray sensitive proteins using SACLA

    American Crystallographic Association Annual Meeting  2014年 

     詳細を見る

  • Structural Analysis of the Tll0287 Protein that Binds to PSII Containing PsbA2 Core Protein by X-ray Crystallography

    Enzyme Microbial Technology Research Center & University Of Hyogo Joint Colloquium 2014  2014年 

     詳細を見る

  • ホスファチジルグリセロール結合部位の改変が光化学系II に及ぼす影響

    第55回日本植物生理学会年会  2014年 

     詳細を見る

  • Proton matrix ENDOR studies on the role of Ca ion in the Mn cluster in photosystem II

    The 56th Annual Rocky Mountain Conference on Magnetic Resonance  2014年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of the tll0287 protein that binds to photosystem II with the D1 subunit encoded by the psbA2 gene at 2.0 Å resolution

    The 8th Internal Symposium on Nanomedicine  2014年 

     詳細を見る

  • Purification, crystallization and crystal structural analysis of PsbA3-only photosystem II

    The 8th Internal Symposium on Nanomedicine  2014年 

     詳細を見る

  • Native structure of photosystem II at 1.95 Å resolution revealed by a femtosecond X-ray laser

    2014 International Conference on Artificial Photosynthesis (ICARP2014)  2014年 

     詳細を見る

  • Structural basis for the mechanism of photosynthetic water oxidation

    The 8th Internal Symposium on Nanomedicine  2014年 

     詳細を見る

  • Inhibition mechanism of the water-splitting reaction of photosystem II by iodine ions

    2014 International Conference on Artificial Photosynthesis (ICARP2014)  2014年 

     詳細を見る

  • Crystallographic studies on the valence of Mn atoms in oxygen-evolving Photosystem II using X-ray absorption techniques

    2014 International Conference on Artificial Photosynthesis (ICARP2014)  2014年 

     詳細を見る

  • Inhibition mechanism of the water-splitting reaction of photosystem II by iodine ions

    The 8th Internal Symposium on Nanomedicine  2014年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリアThermosynechococcus elongatus 由来PsbV2 の1.5Å 分解能結晶構造

    第55回日本植物生理学会年会  2014年 

     詳細を見る

  • PsbA3-D1タンパク質を発現する光化学系II 複合体の精製・結晶化

    第55回日本植物生理学会年会  2014年 

     詳細を見る

  • QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態と構造

    異分野融合による新材料開発のための計算科学-光合成マンガンクラスターの理論計算  2014年 

     詳細を見る

  • 水分解複合体PSIIと水

    青山学院大学シンポジウム「水に関すること」  2014年 

     詳細を見る

  • 光合成マンガンクラスターの構造ー実験の立場から

    異分野融合による新材料開発のための計算科学-光合成マンガンクラスターの理論計算  2014年 

     詳細を見る

  • The structure of photosynthetic Mn-cluster from the experimental point of view

    2014年 

     詳細を見る

  • Water-splitting complex PSII and water

    2014年 

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of photosynthetic water-splitting

    The 38th Naito Conference on "Molecular-based Biological Systems"  2014年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生中心(PSII-OEC)の立体構造と電荷状態変化についての理論的研究

    第52回日本生物物理学会年会  2014年 

     詳細を見る

  • Ca除去とSr置換をしたMnクラスターのENDOR法による研究

    第52回日本生物物理学会年会  2014年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    International Symposium on Green/Life Innovation  2014年 

     詳細を見る

  • 光合成における水分解反応の分子機構

    第8回バイオ関連化学シンポジウム  2014年 

     詳細を見る

  • Spectral and functional studies on siphonaxanthin type light-harvesting complex of photosystem II from Bryopsis corticulans

    International Symposium on the Regulation of Photosynthetic Function  2014年 

     詳細を見る

  • Mechanism of light-induced water-splitting in natural photosynthesis

    I2CNER Seminar, Kyushyu University  2014年 

     詳細を見る

  • Crystallographic studies on the oxidation states of Mn atoms in Photosystem II using Mn K-edge anomalous scattering

    Twenty-Third Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr 2014)  2014年 

     詳細を見る

  • Possible mechanism of photosynthetic water oxidation based on atomic structure of photosystem II

    International Symposium on the Regulation of Photosynthetic Function  2014年 

     詳細を見る

  • Possible mechanism of photosynthetic water-splitting based on atomic structure of photosystem II

    18th International Biophysics Congress  2014年 

     詳細を見る

  • 光合成における可視光を利用した水分解の分子機構

    第49回天然物化学談話会  2014年 

     詳細を見る

  • XFEL を用いた光化学系 II 複合体の無損傷結晶構造解析

    平成26年度日本結晶学会年会及び総会  2014年 

     詳細を見る

  • Large-Scale QM/MM study on the oxygen-evolving complex in the S1 state of photosystem II

    CRC-SU Joint Symposium on Chemical Theory for Complex Systems "Interplay between Theory and Experiments: New Trends in Catalysis"  2014年 

     詳細を見る

  • Magneto-structural correlation on the CaMn4O5 cluster in the oxygen-evolving complex of photosystem II

    CRC-SU Joint Symposium on Chemical Theory for Complex Systems "Interplay between Theory and Experiments: New Trends in Catalysis"  2014年 

     詳細を見る

  • Structural basis for the mechanism of photosynthetic water oxidation

    The 4th International Symposium on Solar Fuels and Solar Cells (The 4th SFSC)  2014年 

     詳細を見る

  • Structural basis for the mechanism of photosynthetic water oxidation

    CRC-SU Joint Symposium on Chemical Theory for Complex Systems "Interplay between Theory and Experiments: New Trends in Catalysis"  2014年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on atomic structure of photosystem II

    Japan-Finnish Seminar 2014 "Design of Superior Machinery of Light Energy Conversion in Photosynthetic Organisms"  2014年 

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of light-induced water oxidation in photosynthesis based on the atomic structure of photosystem II

    2014 International Conference on Artificial Photosynthesis (ICARP2014)  2014年 

     詳細を見る

  • An approach to Clean, Renewable Energy Source -- Water Oxidation by a Natural Catalyst Photosystem II

    The Irago Conference 2014 (The Interdisciplinary Research And Global Outlook)  2014年 

     詳細を見る

  • ENDOR Studies on Relationship between the Hydrogen Bonding Network and Ca2+ of the Mn Cluster in Photosystem II

    Joint Conference of APES2014-IES-SEST2014  2014年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIにおける酸素発生中心Mn4CaO5クラスターの吸収端波長X線結晶構造解析

    平成26年度日本結晶学会年会及び総会  2014年 

     詳細を見る

  • 除草剤:光化学系IIの電子伝達阻害剤の機能解析

    第13回日本蛋白質科学会年会  2013年 

     詳細を見る

  • 光合成における可視光を利用した水分解の分子機構

    豊田理化学研究所 平成25年特定課題研究 第2回研究会 「水素を新しいエネルギー源とする新領域の構築」  2013年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen evolving photosystem ii at 1.95å resolution with reduced radiation damage

    The 12th Conference of the Asian Crystallographic Association  2013年 

     詳細を見る

  • 水から酸素を生み出す仕組み

    第13回 RIBSバイオサイエンスシンポジウム&日本光合成学会公開講座「光と水、空気、土からはじまるエネルギー生産」  2013年 

     詳細を見る

  • Hydrogen-bond networks and water channels revealed in the 1.9 Å structure of Photosystem II

    Intentional Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion 2013 Osaka(iSEC2013)  2013年 

     詳細を見る

  • 生物による可視光を利用した水分解の仕組み

    文部科学省 「革新的ハイパフォーマンス・コンピューティング・インフラ(HPCI)の構築」計算分子科学研究拠点 TCCI第3回実験化学との交流シンポジウム  2013年 

     詳細を見る

  • Structural basis of photosynthetic water-splitting

    The 6th Asia and Oceania Conference on Photobiology  2013年 

     詳細を見る

  • Principles of biological light-energy conversion and perspectives of its utilization for clean energy production

    中国植物学会80周年記念大会  2013年 

     詳細を見る

  • 光合成・光化学系II の酸素発生中心に見られる構造の違い

    新学術領域研究「人工光合成による太陽光エネルギーの物質変換:実用化に向けて異分野融合」第2回公開シンポジウム  2013年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II membrane-protein complex and the mechanism of photosynthetic water-splitting

    The Fourth Symposium of the Chinese Protein Society  2013年 

     詳細を見る

  • Spectral and functional studies on siphonaxanthin type light-harvesting complex of photosystem II from Bryopsis corticulans

    International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors from Photosynthetic Organisms (ICTPPO 2013)  2013年 

     詳細を見る

  • 酸素を作り出す植物の仕組み ー生体光エネルギー変換の仕組みー

    豊橋技術科学大学 エレクトロニクス先端融合研究所 セミナー  2013年 

     詳細を見る

  • High-resolution femtosecond crystallography at SACLA, a challenge of reducing the X-ray radiation damage on super molecular assemblies

    11th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation (BSR)  2013年 

     詳細を見る

  • Characteristics of pigment organization and their implications in the energy and electron transfer in photosystem II revealed by its high resolution structure

    International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors from Photosynthetic Organisms (ICTPPO 2013)  2013年 

     詳細を見る

  • Magneto-structural correlations II. Full geometry optimizations of eight spin configurations of CaMn4O5 cluster and calculations of magneti interaction parameters in the s1 and s3 states of oxygen evolving complex of photosystem II

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • The function and mechanism of TyrZ in Photosystem II

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • How iodine ions inhibit the oxygen evolution of photosystem II?

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • The mechanism of solar water oxidation: a high-resolution molecular and electronic structure of the oxygen-evolving complex of photosystem II

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Durability of oxygen evolution of photosystem II incorporated into lipid bilayers

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Magneto–Structural Correlations. I. Magnetic Interaction Parameters in the S2 state of the Oxygen-Evolving Complex in Photosystem II

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Emission from the Deep Red State in PS II core complexes

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of Psb31, a novel extrinsic protein of photosystem II from a marine centric diatom Chaetoceros gracilis

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Structural basis of photosynthetic water oxidation

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • Light-harvesting dynamics in photosystem II: a combination of time-resolved fluorescence spectroscopy and microscopic theory

    The 16th International Congress on Photosynthesis Research  2013年 

     詳細を見る

  • ゆがんだ椅子ー酸素を作り出す植物の仕組み

    岡山大学エクスペリメンタルイベント 科学と芸術 第一回 「山水の思考」  2013年 

     詳細を見る

  • 酸素を作り出す植物の仕組み

    SPring-8, サマー・サイエンスキャンプ2013  2013年 

     詳細を見る

  • Theoretical Study of Artificial and Natural Water Oxidation

    AWEST2013 (The 1st Awaji International Workshop on Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications)  2013年 

     詳細を見る

  • Theoretical investigation on the electronic structures of photosystem II oxygen evolving complex at the S2 state

    AWEST2013 (The 1st Awaji International Workshop on Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications)  2013年 

     詳細を見る

  • Inhibition of electron transfer in photosystem II studied by crystal structure analysis and quantum chemical calculation

    4th International Symposium on Diffraction Structural Biology  2013年 

     詳細を見る

  • 酸素発生光化学系II複合体におけるβ-クリプトキサンチンの同定

    第4回日本光合成学会年会  2013年 

     詳細を見る

  • Comparison of Structure of Cyanobacteria and Spinach Photosystem II Studied by PELDOR

    18th International Society Conference of Magnetic Resonance (ISMAR)  2013年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on high resolution structural analysis of photosystem II

    8th Asian Biophysics Association (ABA) Symposium  2013年 

     詳細を見る

  • Structural study on the Mn atoms in the oxygen-evolving complex of Photosystem II by X-ray absorption techniques

    日本化学会第93春季年会  2013年 

     詳細を見る

  • 植物型光合成反応中心の光捕集過程: 構造情報に基づく理解

    日本物理学会第68回年次大会  2013年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリアとほうれん草PSIIの構造の比較カロテノイドとクロロフィル

    第54回日本植物生理学会年会  2013年 

     詳細を見る

  • 脂質二重膜への再構成系における光化学系I, II複合体の光化学活性と脂質の電荷との関連性

    第54回日本植物生理学会年会  2013年 

     詳細を見る

  • Relationship of charge of heads group of lipid and photochemical activity of photosystem II in reconstituted lipid bilayer

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • 光化学系Ⅱの高分解能X線構造と水分解機構

    第54回日本植物生理学会年会  2013年 

     詳細を見る

  • How iodine ions inhibit oxygen evolution of photosystem II?

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • Computational analysis of the electron-transfer inhibitors in photosystem II

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • Structure of photosystem II and the mechanism of light-induced water-oxidation

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • Mutual relationships between structural and functional changes in the PsbM-deletion mutant of photosystem II

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応の構造基盤

    分子研研究会  2013年 

     詳細を見る

  • 高分解能構造から探る光合成水分解反応の分子機構

    第26回放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム  2013年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on high resolution structure of photosystem II

    4-th France-Japan Joint Seminar "Imaging of spatiotemporal hierarchies in living cells – an overview of dynamics from molecules to cells "  2013年 

     詳細を見る

  • Structural study on the Mn atoms in the oxygen-evolving complex of Photosystem II by X-ray absorption techniques

    2012 OCARINA Annual International Meeting  2013年 

     詳細を見る

  • High resolution structure of photosystem II and the mechanism of water-splitting

    The 17th European Bioenergetics Conference  2012年 

     詳細を見る

  • 植物の光合成から学ぶ 光エネルギーの高効率人工利用

    Breakthrough of the Year 2011特別講演会  2012年 

     詳細を見る

  • 生物による可視光を利用した水分解の仕組み

    新学術領域「配位プログラミング」第3回公開シンポジウム  2012年 

     詳細を見る

  • 酸素発生光化学系II複合体におけるβ-クリプトキサンチンの同定

    第25回カロテノイド研究談話会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜タンパク質複合体の結晶化まで

    JST Breakthrough of the Year 2011 特別シンポジウム  2012年 

     詳細を見る

  • The Electronic Structure of S2 state Oxygen Evolving Complex studied by PELDOR

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • Electron Paramagnetic Resonance Studies of Oxygen-Evolving Center and Tyrosine Radical Yz

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体(PSII)における水分子・水素結合ネットワークの役割と中性子構造解析への期待

    平成24年度第1回生物構造学研究会  2012年 

     詳細を見る

  • Mechanism of water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系II酸素発生系S2状態におけるMn間磁気的相互作用の解明

    第50回日本生物物理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIコア複合体での非光化学的消光の可能性

    第50回日本生物物理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • X-ray diffraction analyses on Sr2+-substituted PSII revealed some clues for Ca2+ role(s) in PSII oxygen-evolution

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • X-ray crystal structure analysis of a PsbM-deletion mutant of photosystem II at 2.25 Å resolution

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • Short hydrogen-bond between redox-active tyrosine TyrZ and D1-His190 in the photosystem II crystal structure

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • How do iodine ions inhibit oxygen evolution of photosystem II?

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • Mechanism of Water-Splitting in Natural Photosynthesis and Its Relevance to Artificial Photosynthesis

    The 3rd International Symposium on Solar Cells and Solar Fuels  2012年 

     詳細を見る

  • Mechanism of photosynthetic water-splitting based on the atomic structure of photosystem II

    11th Nordic Photosynthesis Congress  2012年 

     詳細を見る

  • Comparison between Molecular and Magnetic Structure of S2 state Mn-cluster in Photosystem II revealed by Pulsed ELDOR

    International Workshop on Solar-Chemical Energy Storage 2012  2012年 

     詳細を見る

  • SPring-8のX線を利用して解析された光化学系IIの高分解能結晶構造

    SPring-8シンポジウム2012  2012年 

     詳細を見る

  • Atomic Structure of Photosystem II That Enables Photosynthetic Water-Splitting

    International Workshop on Solar-Chemical Energy Storage 2012  2012年 

     詳細を見る

  • Photosynthetic Oxygen-Evolving System as Studied by Electron Paramagnetic Resonance

    International Workshop on Solar-Chemical Energy Storage 2012  2012年 

     詳細を見る

  • The Electronic Structure of S2 state Oxygen Evolving Complex: PELDOR Measurement of Oriented Photosystem II Membranes

    The 2nd International Symposium on Electron Spin Science (ISESS2012)  2012年 

     詳細を見る

  • The magnetic structure of Mn cluster and surroundings in the oriented PS II membranes studied by PELDOR and proton matrix ENDOR

    The 2nd International Symposium on Electron Spin Science (ISESS2012)  2012年 

     詳細を見る

  • Multi-Frequency EPR studies of Mn4CaO5 and Mn4SrO5 clusters

    The 2nd International Symposium on Electron Spin Science (ISESS2012)  2012年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II and the Mn4CaO5-cluster that enables photosynthetic water-splitting

    The 2nd International Symposium on Electron Spin Science (ISESS2012)  2012年 

     詳細を見る

  • Comparison of the structure of Photosystem II in spinach and cyanobacterium studied by PELDOR.

    The 2nd International Symposium on Electron Spin Science (ISESS2012)  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの高分解能構造から考える光合成水分解反応の機構

    CREST有機太陽電池シンポジウム  2012年 

     詳細を見る

  • X-ray protein crystallography free from radiation damage at SACLA

    The 17th Sagamore Conference (Sagamore XVII)  2012年 

     詳細を見る

  • 量子化学計算による光合成水分解反応機構の解明への期待

    「生命科学に取り組む異分野の融合と交流の推進:スーパーコンピューター「京」と生命科学」シンポジウム  2012年 

     詳細を見る

  • High Resolution Structure of Photosystem II and its Implications for the Mechanism of Water-Splitting

    Swedish Structural Biology Network 2012  2012年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生を可能にする光化学系IIの原子構造

    生化学会中国・四国支部2012年度支部会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの高分解構造から見えてきた水分解の反応機構

    第59回日本生化学会近畿支部例会  2012年 

     詳細を見る

  • 酸酸素発生型光化学系I, II色素-タンパク質複合体の脂質二重膜への再構成と光化学活性

    日本化学会2012年春年会  2012年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリアとホウレンソウPSIIの構造の比較

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 酸素発生型光化学系I, II複合体の脂質二重膜への再構成と光化学活性

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の酸素発生反応における陰イオンの役割

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系II MnクラスターS2状態における価数の解明

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • PSII-電子伝達阻害剤複合体の結晶構造

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系Ⅱ・PsbM欠損変異体の2.0 Å分解能のX線結晶構造解析

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium由来光化学系II膜タンパク質複合体の結晶構造解析

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • どのようにしてヨウ素イオンは光化学系II複合体の酸素発生反応を阻害するのか

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解を可能にする光化学系IIの構造

    大阪大学蛋白質研究所セミナー「結晶学でみるタンパク質の化学と物理」  2012年 

     詳細を見る

  • Structure of Sr2+ substituted PSII at a resolution of 2.1 Å

    第53回日本植物生理学会年会  2012年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解を可能にする光化学系IIの原子構造

    大阪市立大学 複合先端研究機構平成23年度年次総会  2012年 

     詳細を見る

  • High resolution structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    International Symposium on Picobiology  2012年 

     詳細を見る

  • PELDOR/ENDOR法で見る光合成光化学系Ⅱ酸素発生系の磁気構造と分子構造

    第85回日本生化学会大会  2012年 

     詳細を見る

  • 高分解能結晶構造に基づく光合成水分解反応の分子機構

    日本生体エネルギー研究会第38回討論会  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの高分解能構造から探る水分解反応の分子機構

    理研細胞システムコロキウム  2012年 

     詳細を見る

  • What does happen to oxygen-evolving photosystem II in the absence of PsbM subunit?

    AsCA12, Asian Crystallography Association Annual Meeting 2012  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの高分解能構造と水分解の反応機構

    基礎生物学研究所 セミナー  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの高分解能構造から探る水分解の反応機構

    名古屋大学博士リーディングプログラム講演会  2012年 

     詳細を見る

  • Redox Properties of Ruthenium Complexes Containing Quinone Ligands: A Hybrid Density Functional Study

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • Relationship of charge of heads group of lipid and photochemical activity of photosystem I and II in reconstituted lipid bilayer

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • Ground spin state of the oxygen-evolving complex at the S2 state

    Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの立体構造から探る光合成水分解の反応機構

    新学術領域研究「人工光合成」第1回公開シンポジウム  2012年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの原子構造から探る光合成水分解の反応機構

    第85回日本生化学会大会  2012年 

     詳細を見る

  • Crystal structures of photosystem II complexed with electron-transfer inhibitors

    XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2011)  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解を可能にする光化学系Ⅱ膜タンパク質複合体の高分解能結晶構造

    理研シンポジウム「第3回 生体分子の分離・解析法の進展 - 膜タンパク質への応用 -」  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    International Workshop on Photosystem II  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生反応におけるプロトン共役電子移動の高周波 ESR 研究

    第5回分子科学討論会  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応を可能にする光化学系IIの原子構造

    さきがけ「光エネルギーと物質変換」領域会議  2011年 

     詳細を見る

  • 極低温超高速蛍光測定と理論計算の融合で見えてきた光化学系II の光捕集ダイナミクス

    第5回分子科学討論会  2011年 

     詳細を見る

  • Structure and Function of Mn4CaO5 cluster of oxygen-evolving photosystem II

    錯体科学会第61回討論会  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    Botanikertagung 2011, International Botanical Congress of the Germany Botanical Society  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    日本生物物理学会第49回年会  2011年 

     詳細を見る

  • 光化学系II 複合体の原子レベル分解能での結晶構造解析

    日本生物物理学会第49回年会  2011年 

     詳細を見る

  • How iodide ions inhibit the oxygen evolution of photosystem II?

    XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2011)  2011年 

     詳細を見る

  • 1.9 Å分解能の光化学系II構造から見た光合成酸素発生の分子基盤

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • Mechanism of PSII oxygen evolution predicted from its 1.9 Å resolution structure

    XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2011)  2011年 

     詳細を見る

  • Hydrogen-bond networks and channels in oxygen-evolving Photosystem II revealed in its 1.9 Å resolution structure

    XXII Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2011)  2011年 

     詳細を見る

  • Purification, crystallization and X-ray diffraction Analysis of Sr-substituted photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

    5th Asia Oceania Conference on Photobiology (AOCP2011)  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応を可能にする光化学系IIの原子構造

    第23回配位化合物の光化学討論会  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem ii that enables photosynthetic water-splitting

    5th Asia Oceania Conference on Photobiology (AOCP2011)  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of PSII that enables photosynthetic water-splitting

    International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability"  2011年 

     詳細を見る

  • Photosystem II: Unique role of bicarbonate

    International Conference "Photosynthesis Research for Sustainability"  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of PSII that enables photosynthetic water-splitting

    Cordon Research Conference on Photosynthesis  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    International Symposium on Activation of Dioxygen and Homogeneous Catalytic Oxidation  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成水分解反応を可能にする光化学系IIの原子構造

    第2回日本光合成学会および公開シンポジウム「光合成の光エネルギー変換と物質生産」  2011年 

     詳細を見る

  • Purification, crystallization and X-ray diffraction analysis of Sr-substituted photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

    第2回日本光合成学会および公開シンポジウム「光合成の光エネルギー変換と物質生産」  2011年 

     詳細を見る

  • 水分子酸化を可能とする光化学系II反応中心クロロフィルの酸化力

    日本生物物理学会第3回中国四国支部大会  2011年 

     詳細を見る

  • Crystal Structure of Oxygen-Evolving Photosystem II at 1.9 Å Resolution

    Annual Meeting of the Biophysical Society of Taiwan  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生を可能にする光化学系IIの原子分解能構造

    日本生物物理学会第3回中国四国支部大会  2011年 

     詳細を見る

  • Atomic structure of photosystem II that enables photosynthetic water-splitting

    The Annual Review Conference of the Global COE program of University of Hyogo, "Picobiology: Life Science at the Atomic Level"  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生を可能にするMnクラスターの原子構造

    理研シンポジウム「生物を律する揺らぎのメカニズムを追い求めて〜光合成と生体信号〜」  2011年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生を支える光化学系IIの原子構造

    日本物理学会第66回年次大会  2011年 

     詳細を見る

  • 酸素発生光化学系II 複合体の1.9Å 分解能における結晶構造解析

    日本化学会第91春季年会  2011年 

     詳細を見る

  • シリカナノ細孔内での光合成酸素発生と光反応

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • 結晶構造情報に基づくシミュレーションによる光化学系II反応中心の時間分解蛍光スペクトルの解析

    日本物理学会第66回年次大会  2011年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analyses of oxygen-evolving photosystem II-electron transfer inhibitor complexes

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • 緑藻クラミドモナスの光化学系1複合体の迅速な精製法

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • Characteristics of channels and arrangement of cofactors in the 1.9 Å resolution structure of photosystem II

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • Cyanidium caldariumに存在する光化学系II表在性タンパク質PsbQ′の架橋反応とESRを用いたトポロジー解析

    第52回日本植物生理学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen evolving photosystem II at an atomic resolution

    JAPANESE-FINNISH Information-exchange Seminar 2011 "Future prospects of photosynthetic organisms: from genomes to environment"  2011年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen-evolving photosystem II at 1.9 Å resolution

    Umeå Renewable Energy Meeting 2011  2011年 

     詳細を見る

  • 酸素発生光化学系II複合体の1.9Å分解能におけるX線結晶構造解析

    第24回日本放射光学会年会  2011年 

     詳細を見る

  • Electronic and spin structures of CaMnO5 cluster revealed at 1.9 Å resolution (Kawakami, Umena, Kamiya, Shen 2010 structure): B3LYP and related computations

    The 51st Sanibel Symposium  2011年 

     詳細を見る

  • Photosynthetic Oxygen Evolution from PSII Reaction Centers in Nanopores inside Silica Mesoporous Material

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • 1.9 Å分解能の光化学系II膜蛋白質複合体の結晶構造解析

    日本結晶学会2010年度年会  2010年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen evolving photosystem II at an atomic resolution

    The 70th Okazaki International Conference on Molecular mechanism of photosynthetic energy conversion: the present research and future prospects  2010年 

     詳細を見る

  • Mechanism of Photosynthetic Solar Energy-Conversion and Water-Splitting in Biological Systems

    4th International Symposium on Commemoration of Exchange Agreement between National Taiwan University and Okayama University  2010年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体結晶の分解能向上

    日本結晶学会2010年度年会  2010年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen evolving Photosystem II at atomic resolution

    26th European Crystallographic Meeting  2010年 

     詳細を見る

  • Charactarization of photosystem II from extrinsic protein-deleted mutants of a thermophilic cyanobacterium

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • Purification and characterization of oxygen-evolving Photosystem II complex from a moderate thermophilic diatom,Chaetoceros neogracile

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of oxygen evolving Photosystem II at an atomic resolution

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • Improvement of the quality of photosystem II crystals for its structural analysis at an atomic resolution

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • Mechanism of Photosynthetic water-splitting based on the structural analysis of photosystem II

    Inaugural Conference on Molecular & Functional Catalysis (ICMFC-1)  2010年 

     詳細を見る

  • 紅藻由来光化学系II複合体の精製と結晶の分解能の改善と構造解析の現状

    第16回日本光生物学協会年会  2010年 

     詳細を見る

  • Structural and functional studies on native and various mutant photosystem II complexes

    GCOE Program: Picobiology: Life Sciences at the Atomic Level; Annual Review Conference for the Fiscal Year of 2009  2010年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体結晶の分解能向上

    第10回日本蛋白質科学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • The Position and Orientation of Active Carotenoid in Photosystem II

    15th International Congress Of Photosynthesis (PS2010)  2010年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体結晶の分解能向上

    第51回日本植物生理学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIのカロテノイドラジカルの位置と方向

    第51回日本植物生理学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • 板状シリカメソ多孔体細孔中での好熱性シアノバクテリア光化学系IIコア複合体の機能

    第51回日本植物生理学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • 光化学系II単量体と二量体でのエネルギー移動の比較:シアノバクテリアと原始紅藻の光化学系IIでの共通機構

    第51回日本植物生理学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • 紅藻由来光化学系II複合体の精製と結晶の分解能の改善

    第51回日本植物生理学会年会  2010年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium 由来光化学系Ⅱ複合体の精製・結晶化とX線による分析

    第15回日本光生物学協会年会  2009年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium光化学系Ⅱ結晶分解能の改善とX線による分析

    第50回日本植物生理学会年会  2009年 

     詳細を見る

  • 真核生物珪藻由来PSIIの結晶化のための精製

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回ワークショップ  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系II 複合体の酸素発生反応に関わるCl の結合部位の同定

    第15回日本光生物学協会年会  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系Ⅱ膜蛋白質複合体の構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回ワークショップ  2009年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリア表在性欠損変異株より精製したPSIIの性質

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回ワークショップ  2009年 

     詳細を見る

  • Structural and functional studies on native and various mutant photosystem II complexes

    GCOE Program: Picobiology, Annual Review Conference for the Fiscal Year of 2008  2009年 

     詳細を見る

  • Structure and function of oxygen-evolving photosystem II

    Pre-RCE Workshop on Catalysis for Efficient and Sustainable Energy  2009年 

     詳細を見る

  • Ycf12、PsbZ欠失変異体由来光化学系IIのX線結晶構造解析

    第50回日本植物生理学会年会  2009年 

     詳細を見る

  • シリカ多孔体細孔中に導入した好熱性シアノバクテリア光化学系II反応中心複合体の機能

    第50回日本植物生理学会年会  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系II二量体の形成・安定化におけるPsbM, PsbIサブユニットの役割

    第50回日本植物生理学会年会  2009年 

     詳細を見る

  • 酸素発生光化学系II複合体のCW/パルスEPR研究

    第3回分子科学討論会  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系II 複合体結晶の分解能向上

    特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜蛋白質複合体の酸素発生中心の構造研究

    日本結晶学会2009年年会  2009年 

     詳細を見る

  • 紅藻由来光化学系II 複合体結晶の分解能の改善

    特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム  2009年 

     詳細を見る

  • 光化学系II 膜蛋白質複合体の酸素発生中心の構造研究

    特定領域研究「生体超分子構造」第6回公開シンポジウム  2009年 

     詳細を見る

  • Crystal structural analysis of photosystem II complex with the novel method to reduce X-ray radiation damage

    IUCr2008  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体のサブ構造

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム  2008年 

     詳細を見る

  • PsbM, PsbI欠失変異株における光化学系II複合体の構造・機能解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム  2008年 

     詳細を見る

  • 変異株を用いた光化学系II低分子量サブユニットYcf12の位置決定

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系II反応中心の多周波ESR研究

    特定領域研究「100テスラ領域の強磁場スピン科学」第5回シンポジウム  2008年 

     詳細を見る

  • X線損傷低減データに基づく光化学系 Ⅱ膜蛋白質複合体の構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系II反応中心の多周波EPR研究

    第47回電子スピンサイエンス学会年会(SEST2008)  2008年 

     詳細を見る

  • 立体構造から探る光化学系 II 酸素発生反応の機構

    日本生物物理学会2008年度年会  2008年 

     詳細を見る

  • Coordination structure and functional implications of two Cl--binding sites in oxygen-evolving photosystem II

    IUCr2008  2008年 

     詳細を見る

  • 膜タンパク質を見る

    日本植物学会第72回大会  2008年 

     詳細を見る

  • Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of photosystem II dimer from a red alga

    IUCr2008  2008年 

     詳細を見る

  • The Yz Tyrosine Radical in Photosystem II Studied by Q- and W-band EPR Spectroscopy

    Asia Pacific EPR Society - EPR Symposium 2008  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系II酸素発生複合体の構造と機能

    分子研研究会「分子の視点から見る光合成」  2008年 

     詳細を見る

  • XPsbI欠失変異株における光化学系IIの構造・機能解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ  2008年 

     詳細を見る

  • g-Anisotropy of the S2-state Manganese Cluster in Cyanobacterial Photosystem II derived by W-band Electron Paramagnetic Resonance

    Asia Pacific EPR Society - EPR Symposium 2008  2008年 

     詳細を見る

  • 脱水処理による紅藻光化学系II複合体結晶の分解能の向上

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ  2008年 

     詳細を見る

  • X線損傷低減データに基づく光化学系Ⅱ膜蛋白質複合体の構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ  2008年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus elongatus BP-1のPsbY、PsbZ欠損株の機能解析

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • シリカメソ多孔体内23nm細孔への好熱性シアノバクテリア光化学系II反応中心複合体の導入

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium由来光化学系Ⅱ複合体結晶のX線回折分解能の改善

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • 変異体結晶構造解析による光化学系II複合体におけるPsbYサブユニットの同定

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • PsbK・PsbZ サブユニットを欠失した光化学系II複合体の精製と結晶化

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • Structural and functional studies on native and various mutant photosystem II complexes

    University of Hyogo GCOE International Symposium on Picobiology  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系II酸素発生反応にかかわるCl-の結合部位と機能

    第49回日本植物生理学会年会  2008年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIにおける脂質の役割:ラン色細菌と高等植物PSIIとの違い

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • Effects of lipase and phospholipase-treatments on PSII: Differences between thermophilic cyanobacterial and higher plant PSII

    14th International Congress on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • 緑藻クラミドモナスのPSI-LHCI supercomplexの精製と結晶化の試み

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • psbTc遺伝子を破壊した好熱性ラン藻変異株光化学系II複合体の結晶構造解析

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium由来光化学系Ⅱ複合体の精製・結晶化

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • 光化学系2複合体の形成

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • PsbMサブユニットを欠失した光化学系II複合体の結晶構造解析

    第48回日本植物生理学会年会  2007年 

     詳細を見る

  • PsbIサブユニットを欠失した光化学系II複合体の結晶構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第3回ワークショップ  2007年 

     詳細を見る

  • シリカメソ多孔体への光合成反応中心光化学系II 複合体の導入

    日本生物物理学会第45回年会  2007年 

     詳細を見る

  • X線損傷低減データに基づく酸素発生光化学系II粒子の構造精密化

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜タンパク質複合体の結晶のアニーリングによる回折分解能の改善

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium由来光化学系Ⅱ複合体の精製・結晶化

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • 好熱性ラン藻PsbK, PsbZ欠失変異株からの光化学系II複合体の精製と結晶化

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • 変異体の結晶構造解析による光化学系II複合体におけるPsbYサブユニットの同定

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • X線損傷低減データに基づく酸素発生光化学系II粒子の構造精密化

    日本結晶学会平成19年度年会  2007年 

     詳細を見る

  • 光化学系II酸素発生反応におけるClイオンの機能と各種変異体の構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回公開シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • psbTc遺伝子を破壊した好熱性ラン藻変異株の光化学系II複合体の結晶構造解析

    第11回SPring-8シンポジウム  2007年 

     詳細を見る

  • Functional implications from the structural studies of Photosystem II oxygen-evolving complex

    Nagoya International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems  2007年 

     詳細を見る

  • Location of Cl- in photosystem II and structural analysis of PSII mutants of Thermosynechococcus vulcanus

    Chinese symposium on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • Roles of chloride and small subunits in PSII function and assembly studied by X-ray crystal structural analysis

    Japan-Finland Seminar: Genomics and Molecular Mechanisms of Regulation in Photosynthetic Organisms  2007年 

     詳細を見る

  • Purification and crystallization of photosystem II complex from a red alga Cyanidium caldarium

    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007年 

     詳細を見る

  • X-ray crystallographic and biochemical characterizations of a mutant Photosystem II complex from Thermosynechococcus vulcanus with the psbTc gene inactivated by an insertion mutation

    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007年 

     詳細を見る

  • Structural analysis of mutant Photosystem II complexes from Thermosynechococcus vulcanus

    2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology  2007年 

     詳細を見る

  • Identification of functional domain of PsbU in red algal PSII by site-directed mutagenesis

    14th International Congress on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • Purification and biochemical characterization of PSI-LHCI supercomplex in Chlamydomonas reinhardtii

    14th International Congress on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • Crystallization and crystal structure analysis of a mutant photosystem II complex lacking PsbI from Thermosynechococcus vulcanus

    14th International Congress on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • Purification and crystallization of photosystem II dimer complex from a red alga Cyanidium caldarium

    14th International Congress on Photosynthesis  2007年 

     詳細を見る

  • Structural basis of photosystem II oxygen evolution

    The 3rd Asian and Oceanian Conference on Photobiology  2006年 

     詳細を見る

  • ミクロ透析結晶化装置を用いた課飽和度制御下での光化学系IIの結晶化

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第3回公開シンポジウム  2006年 

     詳細を見る

  • PsbMサブユニットを欠失した光化学系II複合体の結晶構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第3回公開シンポジウム  2006年 

     詳細を見る

  • PsbTcサブユニットを欠失した光化学系II複合体の結晶構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第3回公開シンポジウム  2006年 

     詳細を見る

  • Improvement of the resolution of photosystem II crystals from a thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus

    The 3rd Asian and Oceanian Conference on Photobiology  2006年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリア Thermosynechococcus vulcanus 由来PS II の結晶分解能の改良、

    第47回日本植物生理学会年会  2006年 

     詳細を見る

  • 紅藻Cyanidium caldarium由来光化学系Ⅱ複合体の精製・結晶化

    大阪大学蛋白質研究所セミナー「光合成研究の新たな潮流:構造とゲノム そして 未来」  2006年 

     詳細を見る

  • Functions of photosystem II in relation to its structure

    Japanese-Finnish Joint Seminar on "Molecular mechanisms for regulation of photosynthetic organisms under stressed conditions"  2006年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリア由来光化学系II複合体結晶の分解能の向上

    大阪大学蛋白質研究所セミナー「光合成研究の新たな潮流:構造とゲノム そして 未来」  2006年 

     詳細を見る

  • The functions and structure of photosystem II studied by pulsed EPR

    International Meeting “Photosynthesis in the post-genomic era: Structure and function of photosystems”  2006年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生反応の構造的基盤

    大阪大学蛋白質研究所セミナー「光合成研究の新たな潮流:構造とゲノム そして 未来」  2006年 

     詳細を見る

  • 二光束干渉計を用いた膜タンパク質結晶の溶解度測定

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回ワークショップ  2006年 

     詳細を見る

  • X線損傷低減法による光化学系IIマンガンクラスターの構造解析

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回ワークショップ  2006年 

     詳細を見る

  • 生物水中接着タンパク質からのペプチド性材料開発

    第9回マリンバイオテクノロジー学会大会  2006年 

     詳細を見る

  • 好熱性ラン藻変異株の光化学系 II の結晶化および抗体と光化学系 II の共結晶化の試み

    特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第2回ワークショップ  2006年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の構造解析の現状と展望

    第47回日本植物生理学会年会  2006年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリア由来光化学系II複合体の単結晶EPR研究:チロシンラジカル

    日本化学会第86春季年会(千葉)2006年3月27日-30日  2006年 

     詳細を見る

  • Roles of lipids in cyanobacterial photosystem II

    第47回日本植物生理学会年会  2006年 

     詳細を見る

  • 光合成光化学系II反応中心の多波長EPR研究

    第44回電子スピンサイエンス学会年会  2005年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリア由来光化学系II複合体の多周波EPR研究

    分子構造総合討論会  2005年 

     詳細を見る

  • Crystal Structure of Photosystem II Complex from Thermosynechococcus vulcanus

    第78回日本生化学会大会  2005年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜タンパク質複合体結晶のX線回折能改良の試みと構造精密化

    文部科学省特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構  2005年 

     詳細を見る

  • Roles of phospholipids in photosystem II.

    文部科学省特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構  2005年 

     詳細を見る

  • Roles of phospholipids in photosystem II

    生物系三学会中国四国支部大会  2005年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの立体構造に基づく機能解明

    日本光合成研究会公開講演会「光合成研究入門:地球の未来を語ろう!」  2005年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus vulcanus由来PSIIの結晶分解能の改良

    生物系三学会中国四国支部大会  2005年 

     詳細を見る

  • Thermosynechococcus vulcanus由来光化学系II膜蛋白質複合体の結晶構造解析

    第17回日本放射光学会年会  2004年 

     詳細を見る

  • 光化学系II反応中心複合体―X線結晶構造解析が明らかにする構造

    第45回日本植物生理学会年会  2004年 

     詳細を見る

  • シアノバクテリア単結晶のS0とS1状態のMnクラスターのW-バンドEPR

    第45回日本植物生理学会年会  2004年 

     詳細を見る

  • Functional analysis of photosystem II based on its three-dimensional structure.

    7th Nordic Photosynthesis Congress.  2004年 

     詳細を見る

  • 立体構造に基づく光化学系II 機能研究の新展開

    日本生物物理学会第42回年回  2004年 

     詳細を見る

  • Crystal Structure Refinement of Photosystem II Complex from Thermosynechococcus vulcanus at 3.5 &Aring; Resolution.

    日本結晶学会平成16年度年会  2004年 

     詳細を見る

  • Crystal Structure analysis of photosystem II complex from Thermosynechococcus vulcanus.

    BSR2004, The 8th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation.  2004年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体に結合している脂質分子

    日本植物学会第68回大会  2004年 

     詳細を見る

  • High frequency EPR of the Mn-cluster in single crystals of cyanobacterial photosystem II.

    13th International Congress on Photosynthesis.  2004年 

     詳細を見る

  • Identifying spectral signatures from key cofactors of photosystem II and the cytochrome b6f complex using low-temperature polarization spectroscopies.

    13th International Congress on Photosynthesis.  2004年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus and its functional implications.

    “Photosynthesis and Post-Genomic Era”, An International Satellite Meeting in honour of Professor Norio Murata, in conjunction with the 13th International Congress on Photosynthesis  2004年 

     詳細を見る

  • Identifying spectral signatures from key cofactors of photosystem II using low-temperature polarization spectroscopies.

    “Photosynthesis and Post-Genomic Era”, An International Satellite Meeting in honour of Professor Norio Murata, in conjunction with the 13th International Congress on Photosynthesis.  2004年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の精製・結晶化

    大阪大学蛋白質研究所セミナー 結晶になる蛋白質標品かどうかを判定する方法及び膜蛋白質を精製結晶化する方法  2004年 

     詳細を見る

  • 光合成光化学系IIの進化

    日本進化学会第6回大会  2004年 

     詳細を見る

  • 膜タンパク質複合体の結晶化と結晶構造:光化学系II酸素発生複合体

    日本学術振興会産学協力研究委員会・回折構造生物 第169委員会、第14回研究会  2004年 

     詳細を見る

  • Mechanisms of light-induced electron transfer and water oxidation in photosystem II based on its three-dimensional structure

    RIKEN Symposium: Structural Biology(VIII)  2003年 

     詳細を見る

  • 紅藻の表在性33 kDa タンパクのPSIIへの結合部位の化学修飾による同定

    日本植物学会第67回大会  2003年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of Photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

    Japan-Swiss Joint Seminar “Biogenesis, Function and Acclimation of the Photosynthetic Apparatus”  2003年 

     詳細を見る

  • フジツボ水中接着蛋白質を基にした自己集合性ペプチドの開発

    第25回バイオマテリアル学会  2003年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of PSII from Thermosynechococcus vulcanus

    314th WE-Heraeus-Seminar: Water Oxidation in Photosynthesis  2003年 

     詳細を見る

  • Thermosynechococcus vulcanus 由来光化学系II膜蛋白質複合体の結晶構造解析

    日本結晶学会平成15年度年会  2003年 

     詳細を見る

  • Barnacle underwater adhesive protein complex; significance to supramolecular chemistry and peptide-based material design

    International Symposium on New Horizons in Molecular Sciences and Systems: An Integrated Approach  2003年 

     詳細を見る

  • 結晶構造から見たラン藻光化学系IIの分子機能

    東京大学海洋科学研究所シンポジウム「藻類に見る陸上植物の基本的性質と藻類の活用による機構解明へのアプローチ」 -連続的形質を解剖する  2003年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analysis of photosystem II complex from Thermosynechococcus vulcanus

    Japan-UK Membrane Protein Structure Biology Symposium - Towards high-throughput membrane protein crystallography and related technology  2003年 

     詳細を見る

  • Crystal structure of photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus (Plenary Lecture)

    11th International Symposium on Phototrophic Prokaryotes  2003年 

     詳細を見る

  • Functions of carotenoids and other pigments in photosystem II from a structural point of view

    10th Congress of the European Society for Photobiology  2003年 

     詳細を見る

  • 光合成光化学系II中のシトクロムb-559量について

    日本植物生理学会2003年度年会  2003年 

     詳細を見る

  • Molecular mechanism of photosystem II based on its crystal structure analysis

    Annual Meeting and the 40th Anniversary Meeting of the Chinese Society for Plant Physiology  2003年 

     詳細を見る

  • 結晶構造に基づく光化学系II複合体の分子機構

    日本植物生理学会2003年度年会  2003年 

     詳細を見る

  • 光合成酸素発生系膜表在性タンパク質の結晶化

    日本植物生理学会2003年度年会  2003年 

     詳細を見る

  • 結晶構造解析による光化学系II複合体の電子伝達・水分解反応機構の解明

    理研シンポジウム「構造生物学VII」  2002年 

     詳細を見る

  • 光捕集クロロフィルa/b蛋白質複合体が形成する正二十面体のX線結晶構造解析

    日本生物物理学会第40回年会  2002年 

     詳細を見る

  • SPring-8のBL41を利用したSynecjpcpccis Vulcanus由来化学系Ⅱ膜蛋白質複合体の結晶構造解析

    日本結晶学会平成14年度年会  2002年 

     詳細を見る

  • 立体構造に基づく光化学系II複合体の機能解明

    日本植物学会第66回大会  2002年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analysis of photosystem II from Synechococcus vulcanus at BL41XU of SPring-8

    SRRC Eighth Users Meeting and Workshop  2002年 

     詳細を見る

  • PSⅡStructure Overview

    Gordon Research Conference on Biochemical Aspects of Photosynatheses  2002年 

     詳細を見る

  • SPring-8におけるビームライン操作環境の整備,Heクライオ装置,結晶化ロボット,光化学系II研究

    文科省科研費補助金特定領域研究「生物マシーナリー」第5回ワークショップ  2002年 

     詳細を見る

  • ラン藻光化学系IIの3次元立体構造

    日本植物生理学会2002年度年会及び第42回シンポジウム  2002年 

     詳細を見る

  • 表在性タンパクを指標とした酸素発生系の進化II

    日本植物生理学会2002年度年会及び第42回シンポジウム  2002年 

     詳細を見る

  • プロテアーゼを用いたラン色細菌、紅藻、高等植物の33 kDaタンパク質の構造変化の解析

    日本植物生理学会2001年度年会  2001年 

     詳細を見る

  • ラン藻光化学系II複合体の3次元立体構造

    基礎生物学研究所研究会「ラン藻の分子生物学」  2001年 

     詳細を見る

  • PSIIにおける酸素発生系の偶数酸化状態のEPRによる研究

    日本生物物理学会第39回年会  2001年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analysis of photosytem II from Synechococcus vulcanus.

    Symposium on Photosynthesis, Photobiology and Molecular Biology  2001年 

     詳細を見る

  • 表在性33 kDaタンパクの構造は植物種間で異なる-2:33 kDaタンパクを相互置き換えしたPSIIへの表在性23, 17 kDaタンパクの機能的結合

    日本植物学会第65回大会  2001年 

     詳細を見る

  • Reconstitution of the extrinsic 23 and 17 kDa proteins with spinach PSII which had been exchanged for the 33 kDa protein from different plant species.

    12th International Congress on Photosynthesis  2001年 

     詳細を見る

  • Cross-reconstitution of cytochrome c550 and 12 kDa protein between cyanobacterial and red algal PSII.

    12th International Congress on Photosynthesis  2001年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analysis of photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

    12th International Congress on Photosynthesis  2001年 

     詳細を見る

  • Distribution of extrinsic proteins among various organisms as an index of evolution of oxygen-evolving PSII.

    12th International Congress on Photosynthesis  2001年 

     詳細を見る

  • Crystallographic analysis of light-harvesting chlorophyll a/b protein complex.

    4th International Conference on Biological Physics  2001年 

     詳細を見る

  • Crystal structure analysis of photosystem II from Synechococcus vulcanus at BL41XU of SPring-8.

    7th International Conference on Biology & Synchrotron Radiation.  2001年 

     詳細を見る

  • Icosahedral assembly of light-harvesting chlorophyll a/b protein complex.

    ICBP Satellite Meeting: Physical Aspects of Photobiological Processes: Photobiology and Energy Conversion.  2001年 

     詳細を見る

  • EPR studies of spin centers in the even-number oxidation states of water oxidizing center in photosytem II.

    4th International Conference on Biological Physics  2001年 

     詳細を見る

  • 光捕集クロロフィルa/bタンパク質複合体が作る正二十面体の形成機構

    第1回タンパク質科学会年会  2001年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の結晶構造解析

    日本植物生理学会2001年度年会  2001年 

     詳細を見る

  • 酸素発生標品に存在する表在性タンパクの分子進化

    日本植物生理学会2001年度年会  2001年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体の結晶化と結晶構造解析

    理研シンポジウム「構造生物学VI」  2001年 

     詳細を見る

  • SPring-8を利用した光化学系II複合体のX線結晶構造解析

    第14回日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム  2001年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体結晶の性質

    日本植物生理学会2000年度年会  2000年 

     詳細を見る

  • Studies on the structure and function of photosytem II oxygen-evolving complex

    8the National Meeting of the Chinese Society of Plant Physiology  2000年 

     詳細を見る

  • 光捕集クロロフィルa/bタンパク質複合体が作る正二十面体の形成機構

    日本生物物理学会第38回年会  2000年 

     詳細を見る

  • 光化学系IIの結晶化と結晶構造解析

    ユーグレナ研究会第16回研究集会  2000年 

     詳細を見る

  • クロロフィルdを持つ酸素発生型原核生物Acaryochloris marina: 光化学系IIの反応中心

    日本植物生理学会2000年度年会  2000年 

     詳細を見る

  • 光化学系II複合体のX線結晶構造解析

    文部省特定領域研究(A)「生物マシーナリー」第3回ワークショップ  2000年 

     詳細を見る

  • 紅藻チアニジウムの酸素発生標品に存在する表在性20 kDaタンパクのクローニングと発現

    日本植物生理学会2000年度年会  2000年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜タンパク質複合体の結晶化と結晶の性質

    理研シンポジウム 構造生物学(V)  2000年 

     詳細を見る

  • 紅藻PSIIの表在性33 kDaタンパク遺伝子のクローニング

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

     詳細を見る

  • 光化学系II膜タンパク質複合体の結晶化と結晶の性質

    第6回日本光生物学協会講演会  1999年 

     詳細を見る

  • Crystallization and the crystal properties of oxygen-evolving photosystem II complex

    US-Japan Information Exchange Seminar on Photoconversion and Photosynthesis  1999年 

     詳細を見る

  • 高等植物とラン藻の光化学系II結晶の比較

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

     詳細を見る

  • 好熱性シアノバクテリアSynechococcus elongatusのチトクロムc550及びc550類似タンパク質のクローニング

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

     詳細を見る

  • ラン色細菌と紅藻の表在性cyt c550のPSIIへの結合能と再活性化能の比較

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

     詳細を見る

  • 単量体と二量体の機能的違いから見たチラコイド膜での光化学系IIの存在状態

    日本植物生理学会1999年度年会  1999年 

     詳細を見る

▼全件表示

受賞

  • 小林賞

    2025年2月   公益財団法人 小林財団  

     詳細を見る

  • 第64回(令和5年度)東レ科学技術賞

    2024年3月   東レ科学振興会   光合成における水分解反応及び光エネルギーの高効率利用機構

     詳細を見る

  • 岡山大学 金光功労賞

    2022年11月   岡山大学  

     詳細を見る

  • 高被引用論文著者

    2021年11月   Clarivate Analytics社  

     詳細を見る

  • 学会賞

    2021年3月   日本植物生理学会   光合成における水分解反応機構の解明

     詳細を見る

  • 紫綬褒章

    2020年11月   生化学・植物生理学研究功績

     詳細を見る

  • グレゴリー・アミノフ賞

    2020年3月   スウェーデン王立科学アカデミー  

     詳細を見る

  • The First Jalal Aliyev Lecture Scholarship Award

    2018年12月   International Society of Photosynthesis Research  

     詳細を見る

  • 第50回岡山県三木記念賞

    2017年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 日本植物学会第14回学術賞

    2017年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 日本錯体化学会貢献賞

    2017年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 第11回みどりの学術賞

    2017年   内閣府  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 日本結晶学会 西川賞

    2016年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 日本光生物学協会 第2回協会賞

    2016年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 第71回山陽新聞賞

    2013年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 2012年度 朝日賞

    2013年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 日本光合成学会 特別賞 「光と緑の賞」

    2012年  

     詳細を見る

    受賞国:日本国

    researchmap

  • 学長賞

    2012年   岡山大学  

     詳細を見る

  • 優秀ポスター賞

    2010年  

     詳細を見る

  • 優秀ポスター賞

    2007年  

     詳細を見る

▼全件表示

共同研究・競争的資金等の研究

  • 光合成における光誘導水分解反応機構及び光エネルギー利用機構の解明

    研究課題/領域番号:22H04916  2022年04月 - 2027年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別推進研究

    沈 建仁, 庄司 光男, 秋田 総理, 菅 倫寛, 山口 兆

      詳細を見る

    配分額:627640000円 ( 直接経費:482800000円 、 間接経費:144840000円 )

    researchmap

  • 光化学系II水分解能機構の解明

    研究課題/領域番号:22H00410  2022年04月 - 2025年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:42900000円 ( 直接経費:33000000円 、 間接経費:9900000円 )

    researchmap

  • 光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光ー物質変換系の創製(総括班)

    研究課題/領域番号:22H04905  2022年04月 - 2023年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    沈 建仁, 民秋 均

      詳細を見る

    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    researchmap

  • 光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光ー物質変換系の創製(総括班)

    研究課題/領域番号:17H06433  2017年06月 - 2022年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    沈 建仁, 民秋 均, 野澤 俊介, 橋本 秀樹, 工藤 昭彦, 野口 巧, 阿部 竜

      詳細を見る

    配分額:198250000円 ( 直接経費:152500000円 、 間接経費:45750000円 )

    本研究領域は、天然光合成の機構解明と人工光合成系の開発を目指した異分野融合研究で、物理、化学、生物等の研究者が結集して行われたものである。本総括班は、その研究計画・方針の策定、毎年度に行われる領域会議や公開シンポジウムの組織・実行、総括班による領域内異分野融合研究のサポート、領域外研究者との交流(招へい、領域内研究者の領域外(国内外)への派遣)、若手研究者への研究サポート・育成、領域研究成果の普及やニュースレターの定期的発行、等の活動を行ってきた。その結果、本領域の研究を順調に推進させることができ、天然光合成と人工光合成、さらに両者を繋ぐ先端計測分野で多大な成果を輩出した。

    researchmap

  • 高分解能・時間分解構造解析による水分解反応の機構解明

    研究課題/領域番号:17H06434  2017年06月 - 2022年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    沈 建仁, 神谷 信夫, 山口 兆

      詳細を見る

    配分額:310960000円 ( 直接経費:239200000円 、 間接経費:71760000円 )

    X線自由電子レーザー(XFEL)を用いて、1閃光照射によりS2状態が作り出されるまでのMn4CaO5クラスター及びその周辺の構造変化を、ポンプ-プローブ法によりナノ秒からミリ秒までの時間帯で時間分割構造変化のデータを測定し、得られた構造をS3状態が作りだされるまでの時間変化と比較した。その結果、1閃光照射により誘導される、電子伝達や水素結合ネットワークでの構造変化を検出することができ、S3状態までの時間分割構造変化と異なる点を見出した。同様の手法を用いて3閃光照射によりS3→(S4)→S0の遷移に伴う構造変化も測定したが、明らかな変化は見られず、結晶中でS状態の遷移がS3まで限定されることが示唆された。また、pHを5-8の範囲で変化させた結晶のX線構造解析を完了させ、pHに依存したMn4CaO5クラスターの構造変化が非対称単位中の2個のモノマーで互いに異なることを見出した。
    理論計算の研究では、CaMn4XYZ(H2O)3 (X=O(5), Y=W2, Z=O(4))クラスターのS0状態で可能な中間体にDFT法とDLPNO-CCSD(T)法を適用し、DFT法では(3433)の原子価をもったS0bbb (X = Y = Z = OH-)の安定性が判明した。一方、CC 法では(3433)の原子価をもつ二重項S0bbbの構造と(3442)の原子価をもつS0acb (X = O2-, Y = H2O, Z = OH-) の構造の2構造がエネルギー的に近似縮退しうることが判明した。
    上記の研究と並行して、シアノバクテリア由来光化学系I(PSI)四量体やクロロフィルfを有するシアノバクテリアのPSI、珪藻由来PSI-光捕集アンテナFCPIの超分子複合体、緑色硫黄細菌由来反応中心複合体、等の構造を、クライオ電子顕微鏡法を用いて解明した。

    researchmap

  • 光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光ー物質変換系の創製

    研究課題/領域番号:4906  2017年06月 - 2022年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  新学術領域研究(研究領域提案型)

    沈 建仁

      詳細を見る

  • 高分解能・時間分解構造解析による光化学系II水分解反応機構の解明

    研究課題/領域番号:17H06163  2017年05月 - 2018年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(S)

    沈 建仁, 山口 兆

      詳細を見る

    配分額:204620000円 ( 直接経費:157400000円 、 間接経費:47220000円 )

    本研究は、光化学系II(PSII)の水分解反応の詳細な機構を解明することを目的として、主に①水分解反応の各中間体の構造をレーザー照射とX線自由電子レーザーを組み合わせたポンプープローブ法で解析し、得られた構造をもとに理論解析を行い、反応に伴う各中間体の構造変化から基質水分子の特定、産物である酸素分子の生成部位、プロトンの排出チャンネル等の特定;②PSIIの各サブユニットやアミノ酸の変異体を作成し、その構造・機能解析を行い、各構成サブユニットの機能、及び水分解の産物であるプロトンの排出チャンネルに関わるアミノ酸の機能解明、を中心に研究を進める予定であった。採択されてから上記の研究を進めるための準備に着手し、好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus vulcanus細胞の大量培養、PSII二量体の大量精製、良質なの結晶の作成、理論計算用コンピューターの整備等を行った。しかし、その後研究代表者が代表として申請していた新学術領域研究(研究領域提案型)「光合成分子機構の学理解明と時空間制御による革新的光ー物質変換系の創製」が採択され、これを実施するため、本基盤研究(S)は廃止となった。このため、本基盤研究の実質的な実施期間は約1ヶ月であった。

    researchmap

  • X線自由電子レーザーを用いた光化学系IIの反応中間体の構造解析

    研究課題/領域番号:16H06162  2016年04月 - 2019年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  若手研究(A)

    菅 倫寛, 沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:24570000円 ( 直接経費:18900000円 、 間接経費:5670000円 )

    光化学系II(PSII)の酸素発生複合体(OEC)の構造は高分解能で解析されている。しかし、 水分解反応の中間体状態に相当する構造は原子分解能では解析されておらず、反応機構への理解は限定的である。研究代表者らはPSIIの微小結晶を用いて、二閃光照射により励起させたPSIIの反応中間体S3状態を調製し、XFELを用いて構造を2.35A分解能で決定した。S1状態との差の電子密度より光励起によって起こる構造変化を確認した。OECの周辺では、これまで基質の候補とされていたオキソ酸素の一つであるO5近辺への新しい水分子O6の挿入が確認されたことからO5とO6がO=O結合を形成する反応機構を提唱した。

    researchmap

  • 高周波ESRによる光合成水分解-酸素発生過程の構造研究

    研究課題/領域番号:26410021  2014年04月 - 2017年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    松岡 秀人, 沈 建仁, 佐藤 和信, 工位 武治, Schiemann Olav

      詳細を見る

    配分額:5070000円 ( 直接経費:3900000円 、 間接経費:1170000円 )

    光合成タンパク質内に存在するMnクラスターは、光合成の最も重要な水を分解し、酸素を発生するプロセスに欠かすことができない。本研究では、そのMnクラスターのみを選択的かつ高感度に観測できる高周波電子スピン共鳴(ESR)装置の改良を行った。それにより、効率的に、希望するMnクラスターの状態を生成することができるようになり、水分解-酸素発生に重要な電子状態の変化を観測することができた。

    researchmap

  • 光合成水分解・酸素発生反応の分子機構の解明

    研究課題/領域番号:24247009  2012年04月 - 2013年03月

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(A)

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:19630000円 ( 直接経費:15100000円 、 間接経費:4530000円 )

    researchmap

  • 光合成系Ⅱにおける水分解反応の学理解明

    研究課題/領域番号:24000018  2012年 - 2017年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特別推進研究

    沈 建仁, 野口 巧, 山口 兆, 庄司 光男, 菅 倫寛, 秋田 総理, 三野 広幸, 加藤 祐樹, 磯部 寛

      詳細を見る

    配分額:519350000円 ( 直接経費:399500000円 、 間接経費:119850000円 )

    光合成光化学系II(PSII)による水分解反応の機構を解明するため、フェムト秒X 線自由電子レーザー(XEFL)を用いてPSIIのX 線無損傷構造を高分解能で解析し、天然状態のMn_4CaO_5クラスターの構造を解明した。さらにXFEL を利用して反応中間体のひとつS_3状態の構造を解明し、反応機構の解明に重要なO=O 結合の形成部位を明らかにした。得られた構造を元に理論計算を行い、可能な反応経路を明らかにした。そして赤外分光を中心とする分光法により、反応に伴う配位場や水素結合ネットワークの変化を追跡し、プロトン移動経路を特定した。

    researchmap

  • 紅藻由来光化学系II複合体の結晶化と構造解析

    研究課題/領域番号:23657037  2011年 - 2012年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  挑戦的萌芽研究

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:3900000円 ( 直接経費:3000000円 、 間接経費:900000円 )

    本研究の目的は、好酸・好熱性紅藻Cyanidium caldariumから高い酸素発生能を持つ光化学系II複合体(PSII)を高純度に単離精製し、その結晶化を行い、X線結晶構造を解明することである。これまですでに同紅藻PSIIの結晶化に成功しており、SPring-8の放射光X線を用いて分解能3-5AのX線回折データを収集した。本研究では、結晶の質と分解能を向上させるため、結晶化条件の改善、結晶の抗凍結剤置換条件の改善、および結晶の脱水処理条件の最適化により、2.75A分解能を与える結晶の析出に成功し、SPring-8のX線を利用して同分解能でX線回折データを収集した。さらにさまざまな重原子化合物を用いて、重原子同型誘導体を作成し、X線回折データを収集した。得られたデータを解析した結果、3種類の重原子同型誘導体から位相情報を取得した。これらの位相情報を用いて、重原子同型置換法によって分析した結果、紅藻PSIIの初期電子密度図を得た。この電子密度図に基づき、初期のPSII構造を構築した。その結果、現在高分解能で構造が解析されている好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus vulcaflus由来PSIIでは存在しない酸素発生系の表在性サブユニット、PsbQ'の結合部位を同定することができた。さらに膜貫通領域でもシアノバクテリアPSIIでは存在しない新たなヘリックスの存在が示唆され、紅藻PSIIの構造がシアノバクテリアPSIIの構造と明らかに異なる点があることが示唆された。現在紅藻PSII構造の精密化を行っているが、本申請者が他の科研費課題の実施に専念するため、本課題は本来の研究期間より短縮して終了することになった。

    researchmap

  • 生体内多核遷移金属錯体の電子構造、化学反応性および機能発現に関する理論的研究

    研究課題/領域番号:21550014  2009年 - 2011年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    山口 兆, 神谷 信夫, 沈 建仁, 中村 春木, 奥村 光隆, 山中 秀介, 川上 貴資, 北河 康隆

      詳細を見る

    配分額:4940000円 ( 直接経費:3800000円 、 間接経費:1140000円 )

    本研究では光合成水分解反応の触媒サイトであるCaMn4O5クラスターなどの生体内多核遷移金属錯体の電子構造の理論的解析法を提案しその有効性を検証した。さらに、これらクラスターの電子構造に基づいて水分解反応機構などの化学反応性の解明、混合原子価状態での電子移動現象などの機能発現の理論的解明を実行した。研究成果は種々の論文、国際会議での講演などにより公表した。

    researchmap

  • 変異体構造解析による光化学系?複合体の構造制御機構の解明

    研究課題/領域番号:20570038  2008年 - 2010年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    沈 建仁, 神谷 信夫, 梅名 泰史, 川上 恵典, 高坂 賢之, 岩井 雅子, 池内 昌彦

      詳細を見る

    配分額:4940000円 ( 直接経費:3800000円 、 間接経費:1140000円 )

    光化学系II複合体(PSII)の構造制御機構を解明するため、各種低分子量サブユニット欠損株由来PSIIの構造・機能解析を行った。Ycf12(Psb30)欠損株由来PSIIの結晶構造解析によりその存在位置を確認し、PsbZ欠損株を用いた研究では、PsbZがPsbKとYcf12のPSIIへの結合に必要であることを示した。また、PsbMはPSII二量体の安定性を維持するのに必要であるが、PsbIは二量体の形成に必要であることを示した。

    researchmap

  • 光合成・光エネルギー変換装置のダイナミクスとその分子基盤の解明

    研究課題/領域番号:18GS0318  2006年 - 2010年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  学術創成研究費

    高橋 裕一郎, 沈 建仁, 皆川 純, 坂本 亘, 菓子野 康浩, 山本 泰

      詳細を見る

    配分額:331760000円 ( 直接経費:255200000円 、 間接経費:76560000円 )

    酸素発生型光合成電子伝達系で機能する光エネルギー変換装置を高度に精製し、そのサブユニットとコファクター組成の詳細を明らかにし、結晶化を進めた。その結果、構成サブユニットの役割を明らかにし、立体構造解析を進展させた。また、複雑な構造をもつ光エネルギー変換装置生合成の分子機構を明らかにし、分子集合モデルを提出した。さらに、異なる光環境下で光エネルギー変換装置の構造と機能の再構築の分子機構を解明した。

    researchmap

  • X線結晶構造解析法による光合成系II膜蛋白質複合体の機能制御機構の研究

    研究課題/領域番号:16087102  2004年 - 2009年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究

    神谷 信夫, 沈 建仁, 池内 昌彦, 中里 勝芳, 梅名 泰史, 宮原 郁子, 逸見 隆博, 内藤 久志, 古瀬 宗則

      詳細を見る

    配分額:82800000円 ( 直接経費:82800000円 )

    光化学系II膜蛋白質複合体(PSII)は,光合成で,太陽光エネルギーを利用して水から酸素を発生させている.我々はPSIIの全体構造はもとより,酸素発生中心となるMn4Caクラスターの詳細な構造を世界で初めて決定することに成功した.PSIIは酸素発生と同時に,炭酸同化に利用される化学エネルギーも発生させており,本研究は,それを有効利用するグリーンケミストリーに確固たる構造的基盤を提供するものである.

    researchmap

  • 結晶構造解析による光化学系II複合体の分子機構の解明

    研究課題/領域番号:14340257  2002年 - 2004年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    沈 建仁, 神谷 信夫, 池内 昌彦, 榎並 勲, 吾郷 日出夫

      詳細を見る

    配分額:14900000円 ( 直接経費:14900000円 )

    本研究の目的は光化学系II複合体(PSII)の立体構造を解析し、それに基づきPSIIにおける電子伝達反応、水分解・酸素発生反応の機構を解明することである。PSIIは14-17種の膜貫通サブユニットと3種の膜表在性サブユニットを含む分子量350kDaの超分子複合体であり、その結晶化は困難であったが、我々は好熱性ラン色細菌Thermosynechococcus vulcanus由来PSIIの結晶化に成功し、その結晶構造を3.7Å分解能で解析・報告した(Kamiya and Shen,2003,PNAS,100,98-103)。我々はPSIIの大サブユニットCP47,CP43,D1,D2の70-80%アミノ酸残基を一部の大きい側鎖を持つ残基の電子密度から特定し、立体構造においてチェーントレースをした。また、膜表在性サブユニットの一つである12kDaタンパク質の構造を始めて特定し、それにより酸素発生反応に関与している3つの膜表在性サブユニットの構造をすべて同定した。PSII反応中心を構成している四量体クロロフィルのうち、PD_1-PD_2の距離がそれぞれのアクセサリークロロフィルとの距離よりも短く、したがってPD_1-PD_2の間の相互作用が相対的により強いことを示した。反応中心付近において、D2の外側に2つのβ-カロチン分子を見つけ、これによりPSIIにおける2次電子伝達経路はチトクロムb_<559>あるいはChlZD_2→β-カロチン1→β-カロチン2→ChlD_2→PD_2→PD_1であることを明らかにした。水分解を直接触媒している4原子Mnを含むMnクラスターについては、Y字型あるいは3+1モデルと言う従来提唱されたモデルと一致する結果を得た。我々はさらに結晶の分解能を3.5Åに上げ、PSII構造モデルの修正・精密化を行い、PSIIの立体構造からその機能をより詳細に考察した。

    researchmap

  • 光化学系(II)立体構造解析のための遺伝子解析

    研究課題/領域番号:12640641  2000年 - 2001年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(C)

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:3100000円 ( 直接経費:3100000円 )

    本研究の目的は、光化学系II複合体の立体構造を解明するため、好熱性らん藻Thermosynechococcus vulcanus (旧名Synechococcus vulcanus)より単離・精製し、結晶化した光化学系II複合体の全構成成分を同定し、そのうち、遺伝子配列が未知のものについては、その遺伝子をクローニングし、配列決定することである。電気泳動、酸素発生活性及びTOF-MASS測定により、結晶化された光化学系II複合体は少なくとも13種の膜蛋白質と3種の膜表在性蛋白質を含むことが分かった。この内、数種のサブユニットについてはその遺伝子配列が未定であるが、かずさDNA研究所により近縁の好熱性らん藻Thermosynechococcus elongatusの全ゲノム配列決定が行われ、その結果がまもなく公開されることとなったため、T.vulcanusの構造解析に利用可能となった。従って、本研究の後半では、個々のサブユニットの配列決定よりも、光化学系II複合体の結晶構造解析に重点を置いて研究を進めた。位相を決定するため、多数の重原子誘導体を作製・解析し、そのうち有効な位相情報を与える誘導体を数種見つけ、光化学系II複合体の構造を3.7Å分解能で解析した。その結果、ドイツのWittらにより報告されたT.elongatus8の3.8Å分解能での光化学系IIの構造と比べ、表在性12kDa蛋白質の位置が新たに同定された。
    また、酸素発生反応を直接触媒しているMnクラスターについて、そのリガンドが3つ以上あり、そのうちの一つが反応中心D1蛋白質のC末端であることが示唆された。これ以外にも、各電子伝達成分間の相対距離や、ルーメン側に突出していることが示唆されているCP47,CP43のループ構造の一部について、より詳細な情報を得ることができた。

    researchmap

  • 好熱性シアノバクテリアの遺伝子操作技術の確立と光合成生産への応用

    研究課題/領域番号:11554035  1999年 - 2001年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  基盤研究(B)

    池内 昌彦, 杉浦 美羽, 平野 昌彦, 沈 建仁, 井上 頼直

      詳細を見る

    配分額:14200000円 ( 直接経費:14200000円 )

    好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus elogatus strain BP-1のクローン株を確立し、かずさDNA研究所の田畑らとの共同で、その全ゲノム情報を決定した。その遺伝子解析から、多数の有用遺伝子を見いだした。
    新規フラビンタンパク質の遺伝子をクローニングし、大腸菌で発現・精製し、その耐熱性を確認し、構造解析の端緒を付けた。フィコシアニンタンパク質を結晶化し、2.0Åの解像度のX線回折データを得た。
    光化学系IIの遺伝子(psbl, psbT, psbK)の破壊株を作成し、それぞれの遺伝子産物を含まない光化学系II複合体を単離解析した。これによって、psblとpsbT遺伝子産物は、光化学系II複合体の二量体化に必須であることを示した。
    光化学系II表在性タンパク質の部位特異変異体を多数作成し、大腸菌で発現させ、その機能部位を特定した。
    好熱性シアノバクテリアの野生株を用いて、単離した光化学系II複合体を結晶化し、その3次元構造を3.7Åの解像度で明らかにした。

    researchmap

  • 光化学系II酸素発生複合体の結晶化と構造解析

    研究課題/領域番号:11169245  1999年 - 2000年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  特定領域研究(A)

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:2500000円 ( 直接経費:2500000円 )

    光化学系II複合体は、14種の膜貫通サブユニットと3種の膜表在性サブユニットを含む、分子量320kDaの超分子複合体である。系II複合体の結晶構造解析を行うため、約35種の重原子同型誘導体を作製し、SPring-8のBL41XU,BL45PXにて、100K,X線波長1.0Åにてデータ収集・分析を行った。その結果、Ta_6Br_<14>の誘導体と母結晶の差パターソン関数から有意な差が得られ、分解能6.0Åでの初期位相を得ることができ、それに基づき光化学系II複合体の初期電子密度図を得た。しかし、多くの誘導体については、母結晶との差パターソン関数において、ノイズレベルが高いため重原子位置を決定することができなかった。これは、重原子ソーキング操作による結晶の同型性の変化が原因と考え、同型性保持に適したソーキング条件(それぞれの重原子の濃度、ソーキング時間)を検討し、その確立を行った。一方、光化学系II複合体には、4原子マンガンからなるクラスターと、3原子以上の鉄が含まれているので、マンガンと鉄のMADデータを収集した。マンガンのMADデータから有意なピークが得られ、それを用いた位相改良を試みている。鉄については、解析可能なデータを得ることができなかった。
    構造解析と並行して、より分解能の高い結晶作成を試み、サンプルバッチ・結晶化条件の違いにより、最高3.1Åの回折点を与える結晶を得ることができた。

    researchmap

  • 光合成系II酸素発生膜蛋白質複合体の三次元結晶化

    研究課題/領域番号:07780587  1995年

    日本学術振興会  科学研究費助成事業  奨励研究(A)

    沈 建仁

      詳細を見る

    配分額:900000円 ( 直接経費:900000円 )

    本研究の目的は、申請者がこれまでに得た、光化学系II膜蛋白質複合体の低分解能三次元結晶を、種々の結晶化条件を詳細に検討することにより改良し、X線構造解析ができるような高分解能結晶を作製することである。今年度には次のような研究を行い、結果を得た。
    温度--4℃から30℃の間で結晶化を行い、10℃-30℃で結晶を得たが、15℃において一番よい結晶ができた。
    標品の純度と均一性--従来のイネ光化学系II標品を再度ドデシルマルトシドで可溶化し、ゲル濾過により精製し、結晶化を行ったが、結晶性の向上は見られなかった。また、同様な方法を用いてホウレンソウとえんどう豆からも系II複合体を精製し、結晶を得たが、分解能はイネの結晶より低かった。
    界面活性剤--各種界面活性剤を検討した結果、従来のドデシルマルトシドとヘプチルチオグルコシド以外に、デシルマルトシドとMega-9が同様な結晶を与えた。
    以上により、結晶の分解能が著しく向上したことは見られなかったが、これは、結晶をハンゲングドロップからX線回折用キャピラリーチューブに装填する時の溶媒組成や温度の変化による可能性もあるので、今後、このような変化を軽減するよう工夫し、高分解能の構造解析を目指したい。

    researchmap

▼全件表示

 

担当授業科目

  • 構造生物学特別演習 (2024年度) その他  - その他

  • 構造生物学特別演習 (2024年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特論 (2024年度) 前期  - その他

  • 生体高分子構造学 (2024年度) 後期  - 火3~4

  • 生化学I (2024年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学I (2024年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学IA (2024年度) 第1学期  - 月3~4

  • 生化学IB (2024年度) 第2学期  - 月3~4

  • 生物物理学I (2024年度) 第1学期  - 火1~2

  • 生物物理学I (2024年度) 第1学期  - 火1~2

  • X線及びクライオ電子顕微鏡構造生物学演習 (2024年度) その他  - その他

  • X線及びクライオ電子顕微鏡構造生物学演習 (2024年度) 通年  - その他

  • 構造生物学演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特別演習 (2023年度) その他  - その他

  • 構造生物学特別演習 (2023年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特論 (2023年度) 前期  - その他

  • 構造生物学特論 (2023年度) 前期  - その他

  • 特別課題研究 (2023年度) 特別  - その他

  • 生体高分子構造学 (2023年度) 後期  - 火3~4

  • 生体高分子構造学 (2023年度) 後期  - 火3~4

  • 生化学I (2023年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学I (2023年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学IA (2023年度) 第1学期  - 月3~4

  • 生化学IB (2023年度) 第2学期  - 月3~4

  • 生物物理学I (2023年度) 第1学期  - 火1~2

  • 生物物理学I (2023年度) 第1学期  - 火1~2

  • X線及びクライオ電子顕微鏡構造生物学演習 (2023年度) その他  - その他

  • 構造生物学演習 (2022年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特論 (2022年度) 前期  - その他

  • 生体高分子構造学 (2022年度) 後期  - 火3~4

  • 生化学I (2022年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学I (2022年度) 1・2学期  - 月3~4

  • 生化学IA (2022年度) 第1学期  - 月3~4

  • 生化学IB (2022年度) 第2学期  - 月3~4

  • 生物物理学I (2022年度) 第1学期  - 火1~2

  • 生物物理学I (2022年度) 第1学期  - 火1~2

  • 構造生物学演習 (2021年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特論 (2021年度) 前期  - その他

  • 生体高分子構造学 (2021年度) 後期  - 火3,火4

  • 生化学I (2021年度) 1・2学期  - 月3,月4

  • 生化学IA (2021年度) 第1学期  - 月3,月4

  • 生化学IB (2021年度) 第2学期  - 月3,月4

  • 生化学IA (2021年度) 第1学期  - 月3~4

  • 生化学IB (2021年度) 第2学期  - 月3~4

  • 生物物理学 (2021年度) 1・2学期  - 火1,火2

  • 生物物理学 (2021年度) 1・2学期  - 火1~2

  • 生物物理学I (2021年度) 第1学期  - 火1,火2

  • 構造生物学演習 (2020年度) 前期

  • 構造生物学演習 (2020年度) 通年  - その他

  • 構造生物学特論 (2020年度) 前期  - その他

  • 生体高分子構造学 (2020年度) 後期  - 火3,火4

  • 生化学I (2020年度) 1・2学期  - 月3,月4

  • 生化学IA (2020年度) 第1学期  - 月3,月4

  • 生化学IB (2020年度) 第2学期  - 月3,月4

  • 生化学IA (2020年度) 第1学期  - 月3,月4

  • 生化学IB (2020年度) 第2学期  - 月3,月4

  • 生物物理学 (2020年度) 1・2学期  - 火1,火2

  • 生物物理学 (2020年度) 1・2学期  - 火1,火2

  • 生物物理学I (2020年度) 第1学期  - 火1,火2

▼全件表示

 

メディア報道

  • テクノロジストの時代 人工光合成 植物にヒント 岡山大学教授 沈 建仁氏 新聞・雑誌

    日経新聞  朝刊 12面  2021年5月

     詳細を見る

    執筆者:本人以外 

    researchmap